Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0335
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0335, 914 aa
1>>>pF1KE0335 914 - 914 aa - 914 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7075+/-0.00114; mu= 18.3453+/- 0.068
mean_var=61.0705+/-12.508, 0's: 0 Z-trim(101.6): 30 B-trim: 46 in 1/44
Lambda= 0.164119
statistics sampled from 6584 (6601) to 6584 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.56), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16
Scan time: 3.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10084.1 GANC gene_id:2595|Hs108|chr15 ( 914) 6197 1476.5 0
CCDS60818.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 ( 852) 2902 696.4 6e-200
CCDS41656.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 ( 966) 2902 696.4 6.8e-200
CCDS60817.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 ( 847) 2901 696.1 7e-200
CCDS8026.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 ( 944) 2901 696.1 7.8e-200
CCDS76738.1 GANC gene_id:2595|Hs108|chr15 ( 357) 2295 552.6 4.9e-157
CCDS47727.1 MGAM gene_id:8972|Hs108|chr7 (1857) 673 168.7 9.3e-41
CCDS3196.1 SI gene_id:6476|Hs108|chr3 (1827) 672 168.4 1.1e-40
CCDS78281.1 MGAM2 gene_id:93432|Hs108|chr7 (2515) 644 161.8 1.4e-38
CCDS32760.1 GAA gene_id:2548|Hs108|chr17 ( 952) 605 152.5 3.5e-36
CCDS76737.1 GANC gene_id:2595|Hs108|chr15 ( 282) 419 108.4 2e-23
>>CCDS10084.1 GANC gene_id:2595|Hs108|chr15 (914 aa)
initn: 6197 init1: 6197 opt: 6197 Z-score: 7919.0 bits: 1476.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6197; 99.8% identity (100.0% similar) in 914 aa overlap (1-914:1-914)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEAAVKEEISVEDEAVDKNIFRDCNKIAFYRRQKQWLSKKSTYRALLDSVTTDEDSTRFQ
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CCDS10 MEAAVKEEISLEDEAVDKNIFRDCNKIAFYRRQKQWLSKKSTYQALLDSVTTDEDSTRFQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IINEASKVPLLAEIYGIEGNIFRLKINEETPLKPRFEVPDVLTSKPSTVRLISCSGDTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IINEASKVPLLAEIYGIEGNIFRLKINEETPLKPRFEVPDVLTSKPSTVRLISCSGDTGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LILADGKGDLKCHITANPFKVDLVSEEEVVISINSLGQLYFEHLQILHKQRAAKENEEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LILADGKGDLKCHITANPFKVDLVSEEEVVISINSLGQLYFEHLQILHKQRAAKENEEET
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SVDTSQENQEDLGLWEEKFGKFVDIKANGPSSIGLDFSLHGFEHLYGIPQHAESHQLKNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SVDTSQENQEDLGLWEEKFGKFVDIKANGPSSIGLDFSLHGFEHLYGIPQHAESHQLKNT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GDGDAYRLYNLDVYGYQIYDKMGIYGSVPYLLAHKLGRTIGIFWLNASETLVEINTEPAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GDGDAYRLYNLDVYGYQIYDKMGIYGSVPYLLAHKLGRTIGIFWLNASETLVEINTEPAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EYTLTQMGPVAAKQKVRSRTHVHWMSESGIIDVFLLTGPTPSDVFKQYSHLTGTQAMPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EYTLTQMGPVAAKQKVRSRTHVHWMSESGIIDVFLLTGPTPSDVFKQYSHLTGTQAMPPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 FSLGYHQCRWNYEDEQDVKAVDAGFDEHDIPYDAMWLDIEHTEGKRYFTWDKNRFPNPKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FSLGYHQCRWNYEDEQDVKAVDAGFDEHDIPYDAMWLDIEHTEGKRYFTWDKNRFPNPKR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 MQELLRSKKRKLVVISDPHIKIDPDYSVYVKAKDQGFFVKNQEGEDFEGVCWPGLSSYLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MQELLRSKKRKLVVISDPHIKIDPDYSVYVKAKDQGFFVKNQEGEDFEGVCWPGLSSYLD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 FTNPKVREWYSSLFAFPVYQGSTDILFLWNDMNEPSVFRGPEQTMQKNAIHHGNWEHREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FTNPKVREWYSSLFAFPVYQGSTDILFLWNDMNEPSVFRGPEQTMQKNAIHHGNWEHREL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 HNIYGFYHQMATAEGLIKRSKGKERPFVLTRSFFAGSQKYGAVWTGDNTAEWSNLKISIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HNIYGFYHQMATAEGLIKRSKGKERPFVLTRSFFAGSQKYGAVWTGDNTAEWSNLKISIP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 MLLTLSITGISFCGADIGGFIGNPETELLVRWYQAGAYQPFFRGHATMNTKRREPWLFGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MLLTLSITGISFCGADIGGFIGNPETELLVRWYQAGAYQPFFRGHATMNTKRREPWLFGE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 EHTRLIREAIRERYGLLPYWYSLFYHAHVASQPVMRPLWVEFPDELKTFDMEDEYMLGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EHTRLIREAIRERYGLLPYWYSLFYHAHVASQPVMRPLWVEFPDELKTFDMEDEYMLGSA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 LLVHPVTEPKATTVDVFLPGSNEVWYDYKTFAHWEGGCTVKIPVALDTIPVFQRGGSVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLVHPVTEPKATTVDVFLPGSNEVWYDYKTFAHWEGGCTVKIPVALDTIPVFQRGGSVIP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 IKTTVGKSTGWMTESSYGLRVALSTKGSSVGELYLDDGHSFQYLHQKQFLHRKFSFCSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IKTTVGKSTGWMTESSYGLRVALSTKGSSVGELYLDDGHSFQYLHQKQFLHRKFSFCSSV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 LINSFADQRGHYPSKCVVEKILVLGFRKEPSSVTTHSSDGKDQPVAFTYCAKTSILSLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LINSFADQRGHYPSKCVVEKILVLGFRKEPSSVTTHSSDGKDQPVAFTYCAKTSILSLEK
850 860 870 880 890 900
910
pF1KE0 LSLNIATDWEVRII
::::::::::::::
CCDS10 LSLNIATDWEVRII
910
>>CCDS60818.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 (852 aa)
initn: 2884 init1: 2780 opt: 2902 Z-score: 3703.2 bits: 696.4 E(32554): 6e-200
Smith-Waterman score: 2958; 50.7% identity (76.5% similar) in 841 aa overlap (110-913:12-851)
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 NIFRLKINEETPLKPRFEVPDVLTSKPSTVRLISCSG-DTGSLILADGKGDLKCHITANP
: .: :: : .:. :. ..: : .:: :
CCDS60 MAAVAAVAARRRRLSVSGRDENSVELTMAEGPYKIILTARP
10 20 30 40
140 150 160 170
pF1KE0 FKVDLVSEEEVVISINSLGQLYFEH----------------------LQILHKQRAAKE-
:..::. .. ...:.:. : : ::: .. : .....:.
CCDS60 FRLDLLEDRSLLLSVNARGLLEFEHQRAPRVSFSDKVNLTLGSIWDKIKNLFSRQGSKDP
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220
pF1KE0 ------NEEETSVDTSQ--ENQ-----EDLGLWEEKFGKFVDIKANGPSSIGLDFSLHGF
. ::: : .. :.: .. : ::: : : : :: :.:::::: :.
CCDS60 AEGDGAQPEETPRDGDKPEETQGKAEKDEPGAWEETFKTHSDSKPYGPMSVGLDFSLPGM
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 EHLYGIPQHAESHQLKNTGDGDAYRLYNLDVYGYQIYDKMGIYGSVPYLLAHKLGRTIGI
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CCDS60 EHVYGIPEHADNLRLKVTEGGEPYRLYNLDVFQYELYNPMALYGSVPVLLAHNPHRDLGI
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 FWLNASETLVEINTEPAVEYTLTQMGPVAAKQKVRSRTHVHWMSESGIIDVFLLTGPTPS
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CCDS60 FWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGKMMDYLQGSGETPQTDVRWMSETGIIDVFLLLGPSIS
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 DVFKQYSHLTGTQAMPPLFSLGYHQCRWNYEDEQDVKAVDAGFDEHDIPYDAMWLDIEHT
:::.::. ::::::.:::::::::: ::::.:: :: :: :::.:..: :..::::::.
CCDS60 DVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRDEADVLEVDQGFDDHNLPCDVIWLDIEHA
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 EGKRYFTWDKNRFPNPKRMQELLRSKKRKLVVISDPHIKIDPDYSVYVKAKDQGFFVKNQ
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CCDS60 DGKRYFTWDPSRFPQPRTMLERLASKRRKLVAIVDPHIKVDSGYRVHEELRNLGLYVKTR
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 EGEDFEGVCWPGLSSYLDFTNPKVREWYSSLFAFPVYQGSTDILFLWNDMNEPSVFRGPE
.: :.:: :::: ..: ::::: .: :....:.. :.::. ::.:::::::::: :::
CCDS60 DGSDYEGWCWPGSAGYPDFTNPTMRAWWANMFSYDNYEGSAPNLFVWNDMNEPSVFNGPE
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 QTMQKNAIHHGNWEHRELHNIYGFYHQMATAEGLIKRSKGKERPFVLTRSFFAGSQKYGA
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CCDS60 VTMLKDAQHYGGWEHRDVHNIYGLYVHMATADGLRQRSGGMERPFVLARAFFAGSQRFGA
470 480 490 500 510 520
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 VWTGDNTAEWSNLKISIPMLLTLSITGISFCGADIGGFIGNPETELLVRWYQAGAYQPFF
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CCDS60 VWTGDNTAEWDHLKISIPMCLSLGLVGLSFCGADVGGFFKNPEPELLVRWYQMGAYQPFF
530 540 550 560 570 580
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 RGHATMNTKRREPWLFGEEHTRLIREAIRERYGLLPYWYSLFYHAHVASQPVMRPLWVEF
:.:: ..: ::::::. .:. .::.:. .::.:::.::.:.:.:: . ::::::::..
CCDS60 RAHAHLDTGRREPWLLPSQHNDIIRDALGQRYSLLPFWYTLLYQAHREGIPVMRPLWVQY
590 600 610 620 630 640
710 720 730 740 750 760
pF1KE0 PDELKTFDMEDEYMLGSALLVHPVTEPKATTVDVFLPGSNEVWYDYKTFAHWEGGCTVKI
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CCDS60 PQDVTTFNIDDQYLLGDALLVHPVSDSGAHGVQVYLPGQGEVWYDIQSYQKHHGPQTLYL
650 660 670 680 690 700
770 780 790 800 810 820
pF1KE0 PVALDTIPVFQRGGSVIPIKTTVGKSTGWMTESSYGLRVALSTKGSSVGELYLDDGHSFQ
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CCDS60 PVTLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVRRSSECMKDDPITLFVALSPQGTAQGELFLDDGHTFN
710 720 730 740 750 760
830 840 850 860 870 880
pF1KE0 YLHQKQFLHRKFSFCSSVLINSFADQRGHYPSKCVVEKILVLGFRKEPSSVTTHSSDGKD
: ...:: :.::: ...:..: :: .::. . .:.....: : :..:. ... . .
CCDS60 YQTRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSADPEGHFETPIWIERVVIIGAGK-PAAVVLQTKGSPE
770 780 790 800 810 820
890 900 910
pF1KE0 QPVAFTYCAKTSILSLEKLSLNIATDWEVRII
. ..: . .::.: :.: ..:.:.:: ...
CCDS60 SRLSFQHDPETSVLVLRKPGINVASDWSIHLR
830 840 850
>>CCDS41656.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 (966 aa)
initn: 3136 init1: 2780 opt: 2902 Z-score: 3702.3 bits: 696.4 E(32554): 6.8e-200
Smith-Waterman score: 3204; 49.7% identity (75.9% similar) in 936 aa overlap (15-913:32-965)
10 20 30 40
pF1KE0 MEAAVKEEISVEDEAVDKNIFRDCNKIAFYRRQKQWLSKKSTYR
:::.. :. :.. .: .::.. : ::
CCDS41 AAVAAVAARRRRSWASLVLAFLGVCLGITLAVDRSNFKTCEESSFCKRQRSIRPGLSPYR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 ALLDSVTTDEDSTRFQIINEASKVPLLAEIYGIEGNIFRLKINEETPLKPRFEVPDVLTS
:::::. :: ..:.:..:: :. :. :.. :. :..:.: : .::..:::::..
CCDS41 ALLDSLQLGPDSLTVHLIHEVTKVLLVLELQGLQKNMTRFRIDELEPRRPRYRVPDVLVA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 KPSTVRLISCSG-DTGSLILADGKGDLKCHITANPFKVDLVSEEEVVISINSLGQLYFEH
: .:: : :: : .:. :. ..: : .:: ::..::. .. ...:.:. : : :::
CCDS41 DPPIARL-SVSGRDENSVELTMAEGPYKIILTARPFRLDLLEDRSLLLSVNARGLLEFEH
130 140 150 160 170 180
170 180
pF1KE0 ----------------------LQILHKQRAAKE-------NEEETSVDTSQ--ENQ---
.. : .....:. . ::: : .. :.:
CCDS41 QRAPRVSFSDKVNLTLGSIWDKIKNLFSRQGSKDPAEGDGAQPEETPRDGDKPEETQGKA
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 --EDLGLWEEKFGKFVDIKANGPSSIGLDFSLHGFEHLYGIPQHAESHQLKNTGDGDAYR
.. : ::: : : : :: :.:::::: :.::.::::.::.. .:: : :. ::
CCDS41 EKDEPGAWEETFKTHSDSKPYGPMSVGLDFSLPGMEHVYGIPEHADNLRLKVTEGGEPYR
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LYNLDVYGYQIYDKMGIYGSVPYLLAHKLGRTIGIFWLNASETLVEINTEPAVEYTLTQM
::::::. :..:. :..::::: ::::. : .:::::::.:: :.:... : . . .:
CCDS41 LYNLDVFQYELYNPMALYGSVPVLLAHNPHRDLGIFWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGKM
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 GPVAAKQKVRSRTHVHWMSESGIIDVFLLTGPTPSDVFKQYSHLTGTQAMPPLFSLGYHQ
. .: :.::::.:::::::: ::. ::::.::. ::::::.::::::::::
CCDS41 MDYLQGSGETPQTDVRWMSETGIIDVFLLLGPSISDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQ
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 CRWNYEDEQDVKAVDAGFDEHDIPYDAMWLDIEHTEGKRYFTWDKNRFPNPKRMQELLRS
::::.:: :: :: :::.:..: :..::::::..:::::::: .:::.:. : : : :
CCDS41 SRWNYRDEADVLEVDQGFDDHNLPCDVIWLDIEHADGKRYFTWDPSRFPQPRTMLERLAS
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 KKRKLVVISDPHIKIDPDYSVYVKAKDQGFFVKNQEGEDFEGVCWPGLSSYLDFTNPKVR
:.::::.: :::::.: : :. . .. :..::...: :.:: :::: ..: ::::: .:
CCDS41 KRRKLVAIVDPHIKVDSGYRVHEELRNLGLYVKTRDGSDYEGWCWPGSAGYPDFTNPTMR
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 EWYSSLFAFPVYQGSTDILFLWNDMNEPSVFRGPEQTMQKNAIHHGNWEHRELHNIYGFY
:....:.. :.::. ::.:::::::::: ::: :: :.: :.:.::::..:::::.:
CCDS41 AWWANMFSYDNYEGSAPNLFVWNDMNEPSVFNGPEVTMLKDAQHYGGWEHRDVHNIYGLY
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 HQMATAEGLIKRSKGKERPFVLTRSFFAGSQKYGAVWTGDNTAEWSNLKISIPMLLTLSI
.::::.:: .:: : ::::::.:.::::::..::::::::::::..::::::: :.:..
CCDS41 VHMATADGLRQRSGGMERPFVLARAFFAGSQRFGAVWTGDNTAEWDHLKISIPMCLSLGL
610 620 630 640 650 660
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 TGISFCGADIGGFIGNPETELLVRWYQAGAYQPFFRGHATMNTKRREPWLFGEEHTRLIR
.:.::::::.:::. ::: :::::::: ::::::::.:: ..: ::::::. .:. .::
CCDS41 VGLSFCGADVGGFFKNPEPELLVRWYQMGAYQPFFRAHAHLDTGRREPWLLPSQHNDIIR
670 680 690 700 710 720
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 EAIRERYGLLPYWYSLFYHAHVASQPVMRPLWVEFPDELKTFDMEDEYMLGSALLVHPVT
.:. .::.:::.::.:.:.:: . ::::::::..:... ::...:.:.::.:::::::.
CCDS41 DALGQRYSLLPFWYTLLYQAHREGIPVMRPLWVQYPQDVTTFNIDDQYLLGDALLVHPVS
730 740 750 760 770 780
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 EPKATTVDVFLPGSNEVWYDYKTFAHWEGGCTVKIPVALDTIPVFQRGGSVIPIKTTVGK
. : :.:.:::..::::: ... . .: :. .::.:..::::::::...: : .
CCDS41 DSGAHGVQVYLPGQGEVWYDIQSYQKHHGPQTLYLPVTLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVRR
790 800 810 820 830 840
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 STGWMTESSYGLRVALSTKGSSVGELYLDDGHSFQYLHQKQFLHRKFSFCSSVLINSFAD
:. : .. : :::: .:.. :::.:::::.:.: ...:: :.::: ...:..: ::
CCDS41 SSECMKDDPITLFVALSPQGTAQGELFLDDGHTFNYQTRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSAD
850 860 870 880 890 900
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 QRGHYPSKCVVEKILVLGFRKEPSSVTTHSSDGKDQPVAFTYCAKTSILSLEKLSLNIAT
.::. . .:.....: : :..:. ... . .. ..: . .::.: :.: ..:.:.
CCDS41 PEGHFETPIWIERVVIIGAGK-PAAVVLQTKGSPESRLSFQHDPETSVLVLRKPGINVAS
910 920 930 940 950
910
pF1KE0 DWEVRII
:: ...
CCDS41 DWSIHLR
960
>>CCDS60817.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 (847 aa)
initn: 2980 init1: 2780 opt: 2901 Z-score: 3701.9 bits: 696.1 E(32554): 7e-200
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60 70 80 90 100 110
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:..:.: : .::..:::::.. : .::
CCDS60 MTRFRIDELEPRRPRYRVPDVLVADPPIARL-
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120 130 140 150 160 170
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: :: : .:. :. ..: : .:: ::..::. .. ...:.:. : : ::: . . ..
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..:. . ::: : .. :.: .. : ::: : : : :: :.::::
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:: :.::.::::.::.. .:: : :. ::::::::. :..:. :..::::: ::::.
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160 170 180 190 200 210
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: .:::::::.:: :.:... : . . .: . .: :.::::.::::::::
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220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
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::. ::::.::. ::::::.:::::::::: ::::.:: :: :: :::.:..: :..::
CCDS60 GPSISDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRDEADVLEVDQGFDDHNLPCDVIWL
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pF1KE0 DIEHTEGKRYFTWDKNRFPNPKRMQELLRSKKRKLVVISDPHIKIDPDYSVYVKAKDQGF
::::..:::::::: .:::.:. : : : ::.::::.: :::::.: : :. . .. :.
CCDS60 DIEHADGKRYFTWDPSRFPQPRTMLERLASKRRKLVAIVDPHIKVDSGYRVHEELRNLGL
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.::...: :.:: :::: ..: ::::: .: :....:.. :.::. ::.:::::::::
CCDS60 YVKTRDGSDYEGWCWPGSAGYPDFTNPTMRAWWANMFSYDNYEGSAPNLFVWNDMNEPSV
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: ::: :: :.: :.:.::::..:::::.: .::::.:: .:: : ::::::.:.:::::
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::::::.:: ..: ::::::. .:. .::.:. .::.:::.::.:.:.:: . :::::
CCDS60 YQPFFRAHAHLDTGRREPWLLPSQHNDIIRDALGQRYSLLPFWYTLLYQAHREGIPVMRP
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pF1KE0 LWVEFPDELKTFDMEDEYMLGSALLVHPVTEPKATTVDVFLPGSNEVWYDYKTFAHWEGG
:::..:... ::...:.:.::.:::::::.. : :.:.:::..::::: ... . .:
CCDS60 LWVQYPQDVTTFNIDDQYLLGDALLVHPVSDSGAHGVQVYLPGQGEVWYDIQSYQKHHGP
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pF1KE0 CTVKIPVALDTIPVFQRGGSVIPIKTTVGKSTGWMTESSYGLRVALSTKGSSVGELYLDD
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CCDS60 QTLYLPVTLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVRRSSECMKDDPITLFVALSPQGTAQGELFLDD
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pF1KE0 GHSFQYLHQKQFLHRKFSFCSSVLINSFADQRGHYPSKCVVEKILVLGFRKEPSSVTTHS
::.:.: ...:: :.::: ...:..: :: .::. . .:.....: : :..:. ..
CCDS60 GHTFNYQTRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSADPEGHFETPIWIERVVIIGAGK-PAAVVLQT
760 770 780 790 800 810
880 890 900 910
pF1KE0 SDGKDQPVAFTYCAKTSILSLEKLSLNIATDWEVRII
. . .. ..: . .::.: :.: ..:.:.:: ...
CCDS60 KGSPESRLSFQHDPETSVLVLRKPGINVASDWSIHLR
820 830 840
>>CCDS8026.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 (944 aa)
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10 20 30 40
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:::.. :. :.. .: .::.. : ::
CCDS80 AAVAAVAARRRRSWASLVLAFLGVCLGITLAVDRSNFKTCEESSFCKRQRSIRPGLSPYR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
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:::::. :: ..:.:..:: :. :. :.. :. :..:.: : .::..:::::..
CCDS80 ALLDSLQLGPDSLTVHLIHEVTKVLLVLELQGLQKNMTRFRIDELEPRRPRYRVPDVLVA
70 80 90 100 110 120
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: .:: : :: : .:. :. ..: : .:: ::..::. .. ...:.:. : : :::
CCDS80 DPPIARL-SVSGRDENSVELTMAEGPYKIILTARPFRLDLLEDRSLLLSVNARGLLEFEH
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200
pF1KE0 LQILHKQRAAKE-------NEEETSVDTSQ--ENQ-----EDLGLWEEKFGKFVDIKANG
. . ....:. . ::: : .. :.: .. : ::: : : : :
CCDS80 QRAPRVSQGSKDPAEGDGAQPEETPRDGDKPEETQGKAEKDEPGAWEETFKTHSDSKPYG
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 PSSIGLDFSLHGFEHLYGIPQHAESHQLKNTGDGDAYRLYNLDVYGYQIYDKMGIYGSVP
: :.:::::: :.::.::::.::.. .:: : :. ::::::::. :..:. :..:::::
CCDS80 PMSVGLDFSLPGMEHVYGIPEHADNLRLKVTEGGEPYRLYNLDVFQYELYNPMALYGSVP
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270 280 290 300 310 320
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::::. : .:::::::.:: :.:... : . . .: . .: :.::::.:
CCDS80 VLLAHNPHRDLGIFWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGKMMDYLQGSGETPQTDVRWMSETG
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330 340 350 360 370 380
pF1KE0 IIDVFLLTGPTPSDVFKQYSHLTGTQAMPPLFSLGYHQCRWNYEDEQDVKAVDAGFDEHD
::::::: ::. ::::.::. ::::::.:::::::::: ::::.:: :: :: :::.:.
CCDS80 IIDVFLLLGPSISDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRDEADVLEVDQGFDDHN
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390 400 410 420 430 440
pF1KE0 IPYDAMWLDIEHTEGKRYFTWDKNRFPNPKRMQELLRSKKRKLVVISDPHIKIDPDYSVY
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CCDS80 LPCDVIWLDIEHADGKRYFTWDPSRFPQPRTMLERLASKRRKLVAIVDPHIKVDSGYRVH
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450 460 470 480 490 500
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. .. :..::...: :.:: :::: ..: ::::: .: :....:.. :.::. ::.:
CCDS80 EELRNLGLYVKTRDGSDYEGWCWPGSAGYPDFTNPTMRAWWANMFSYDNYEGSAPNLFVW
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pF1KE0 NDMNEPSVFRGPEQTMQKNAIHHGNWEHRELHNIYGFYHQMATAEGLIKRSKGKERPFVL
::::::::: ::: :: :.: :.:.::::..:::::.: .::::.:: .:: : ::::::
CCDS80 NDMNEPSVFNGPEVTMLKDAQHYGGWEHRDVHNIYGLYVHMATADGLRQRSGGMERPFVL
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570 580 590 600 610 620
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.:.::::::..::::::::::::..::::::: :.:...:.::::::.:::. ::: :::
CCDS80 ARAFFAGSQRFGAVWTGDNTAEWDHLKISIPMCLSLGLVGLSFCGADVGGFFKNPEPELL
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pF1KE0 VRWYQAGAYQPFFRGHATMNTKRREPWLFGEEHTRLIREAIRERYGLLPYWYSLFYHAHV
::::: ::::::::.:: ..: ::::::. .:. .::.:. .::.:::.::.:.:.::
CCDS80 VRWYQMGAYQPFFRAHAHLDTGRREPWLLPSQHNDIIRDALGQRYSLLPFWYTLLYQAHR
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690 700 710 720 730 740
pF1KE0 ASQPVMRPLWVEFPDELKTFDMEDEYMLGSALLVHPVTEPKATTVDVFLPGSNEVWYDYK
. ::::::::..:... ::...:.:.::.:::::::.. : :.:.:::..::::: .
CCDS80 EGIPVMRPLWVQYPQDVTTFNIDDQYLLGDALLVHPVSDSGAHGVQVYLPGQGEVWYDIQ
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750 760 770 780 790 800
pF1KE0 TFAHWEGGCTVKIPVALDTIPVFQRGGSVIPIKTTVGKSTGWMTESSYGLRVALSTKGSS
.. . .: :. .::.:..::::::::...: : .:. : .. : :::: .:..
CCDS80 SYQKHHGPQTLYLPVTLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVRRSSECMKDDPITLFVALSPQGTA
790 800 810 820 830 840
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pF1KE0 VGELYLDDGHSFQYLHQKQFLHRKFSFCSSVLINSFADQRGHYPSKCVVEKILVLGFRKE
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CCDS80 QGELFLDDGHTFNYQTRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSADPEGHFETPIWIERVVIIGAGK-
850 860 870 880 890
870 880 890 900 910
pF1KE0 PSSVTTHSSDGKDQPVAFTYCAKTSILSLEKLSLNIATDWEVRII
:..:. ... . .. ..: . .::.: :.: ..:.:.:: ...
CCDS80 PAAVVLQTKGSPESRLSFQHDPETSVLVLRKPGINVASDWSIHLR
900 910 920 930 940
>>CCDS76738.1 GANC gene_id:2595|Hs108|chr15 (357 aa)
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CCDS76 MEAAVKEEISLEDEAVDKNIFRDCNKIAFYRRQKQWLSKKSTYQALLDSVTTDEDSTRFQ
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IINEASKVPLLAEIYGIEGNIFRLKINEETPLKPRFEVPDVLTSKPSTVRLISCSGDTGS
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 LILADGKGDLKCHITANPFKVDLVSEEEVVISINSLGQLYFEHLQILHKQRAAKENEEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LILADGKGDLKCHITANPFKVDLVSEEEVVISINSLGQLYFEHLQILHKQRAAKENEEET
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 SVDTSQENQEDLGLWEEKFGKFVDIKANGPSSIGLDFSLHGFEHLYGIPQHAESHQLKNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SVDTSQENQEDLGLWEEKFGKFVDIKANGPSSIGLDFSLHGFEHLYGIPQHAESHQLKNT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GDGDAYRLYNLDVYGYQIYDKMGIYGSVPYLLAHKLGRTIGIFWLNASETLVEINTEPAV
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pF1KE0 EYTLTQMGPVAAKQKVRSRTHVHWMSESGIIDVFLLTGPTPSDVFKQYSHLTGTQAMPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EYTLTQMGPVAAKQKVRSRTHVHWMSESGIIDVFLLTGPTPSDVFKQYSHLTDIGEK
310 320 330 340 350
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pF1KE0 FSLGYHQCRWNYEDEQDVKAVDAGFDEHDIPYDAMWLDIEHTEGKRYFTWDKNRFPNPKR
>>CCDS47727.1 MGAM gene_id:8972|Hs108|chr7 (1857 aa)
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pF1KE0 LWEEKFGKFVDIKANGPSSIGLDFSLHGFEHLYGIPQHAESHQLKNTGDGDAYRLYNLDV
..::. .:.. .: .. . .. ..: :.
CCDS47 SNNRVLFDSSIGPLLFADQFLQLSTRLPSTNVYGLGEHVH-QQYRHDMNWKTWPIFNRDT
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. ..::. ..: . : ..:.: .:.. : .. ::. : .:
CCDS47 TPNG--NGTNLYGAQTFFLCLEDASGLSFGVFLMNSNAMEVVLQPAPAITYR--TIG---
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pF1KE0 AKQKVRSRTHVHWMSESGIIDVFLLTGPTPSDVFKQYSHLTGTQAMPPLFSLGYHQCRWN
::.: ... : :: .: ..: .: : :.: ..::.: :..
CCDS47 -----------------GILDFYVFLGNTPEQVVQEYLELIGRPALPSYWALGFHLSRYE
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: .... : ..:::.. ::.. . .: ::.:. : . :. ..:: ... .
CCDS47 YGTLDNMREVVERNRAAQLPYDVQHADIDYMDERRDFTYDSVDFKGFPEFVNEL-HNNGQ
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pF1KE0 KLVVISDPHIKIDPD----YSVYVKAKDQGFFVKNQEG-EDFEGVCWPGLSSYLDFTNPK
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CCDS47 KLVIIVDPAISNNSSSSKPYGPYDRGSDMKIWVNSSDGVTPLIGEVWPGQTVFPDYTNPN
450 460 470 480 490 500
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pF1KE0 VREWYSSLFAFPVYQGSTDILFLWNDMNEPSVF-------------RGPE----------
:... : ........ .: :::: : : .:
CCDS47 CAVWWTK--EFELFHNQVEFDGIWIDMNEVSNFVDGSVSGCSTNNLNNPPFTPRILDGYL
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pF1KE0 --QTMQKNAIHHGNW-EHRELHNIYGFYHQMATAEGLIKRSKGKERPFVLTRSFFAGSQK
.:. .:..: : .. ..::.::. .::::. : ..: :.:::: :::: :
CCDS47 FCKTLCMDAVQH--WGKQYDIHNLYGYSMAVATAEA-AKTVFPNKRSFILTRSTFAGSGK
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580 590 600 610 620 630
pF1KE0 YGAVWTGDNTAEWSNLKISIPMLLTLSITGISFCGADIGGFIGNPETELLVRWYQAGAYQ
..: : ::::: :..:. ::: .: ... :: . : :: :: . :: ::.: ::.
CCDS47 FAAHWLGDNTATWDDLRWSIPGVLEFNLFGIPMVGPDICGFALDTPEELCRRWMQLGAFY
630 640 650 660 670 680
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 PFFRGHATMNTKRREPWLFGEEHTRLI--REAIRERYGLLPYWYSLFYHAHVASQPVMRP
:: :.: .. : ..: :: . : :. . :: :::: :.::..:: .. : ::
CCDS47 PFSRNHNGQGYKDQDPASFGADSLLLNSSRHYLNIRYTLLPYLYTLFFRAHSRGDTVARP
690 700 710 720 730 740
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pF1KE0 LWVEFPDELKTFDMEDEYMLGSALLVHPVTEPKATTVDVFLPGSNEVWYDYKTFAH--WE
: :: .. .:.:...... : .::. :: . : : ...: . :::::.: .. :.
CCDS47 LLHEFYEDNSTWDVHQQFLWGPGLLITPVLDEGAEKVMAYVP--DAVWYDYETGSQVRWR
750 760 770 780 790
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pF1KE0 GGCTVKIPVALDTIPVFQRGGSVIPIKTTVGKSTGWMTESSYGLRVALSTKGSSVGELYL
:.. . : : . ::: ..: . . .: .. :: .::. . . :::.
CCDS47 KQ-KVEMELPGDKIGLHLRGGYIFPTQQP-NTTTLASRKNPLGLIIALDENKEAKGELFW
800 810 820 830 840 850
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pF1KE0 DDGHSFQYLHQKQFLHRKFSFCSSVLINSFADQRGHYPSKCVVEKILVLGFRKEPSSVTT
:.:.. . . .: .: .:: .. : ..... . :.. . ..: .:: .:::.::.
CCDS47 DNGETKDTVANKVYLLCEFSVTQNRLEVNISQSTYKDPNNLAFNEIKILG-TEEPSNVTV
860 870 880 890 900 910
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pF1KE0 HSSDGKDQ--P-VAFTYCAKTSILSLEKLSLNIA--TDWEVRII
. . .: : :.. :..:.. : :. : ..: ..:
CCDS47 KHNGVPSQTSPTVTYDSNLKVAIITDIDLLLGEAYTVEWSIKIRDEEKIDCYPDENGASA
920 930 940 950 960 970
CCDS47 ENCTARGCIWEASNSSGVPFCYFVNDLYSVSDVQYNSHGATADISLKSSVYANAFPSTPV
980 990 1000 1010 1020 1030
>--
initn: 872 init1: 492 opt: 673 Z-score: 845.2 bits: 168.7 E(32554): 9.3e-41
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100 110 120 130 140 150
pF1KE0 DVLTSKPSTVRLISCSGDTGSLILADGKGDLKCHITANPFKVDLVSEEEVVISINSLGQL
:: . :: : :. .. .. .. .:
CCDS47 SGVPFCYFVNDLYSVSDVQYNSHGATADISLKSSVYANAFPSTPVNPLRLDVTYHKNEML
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: .: .. : .. ... :.: :. . .. :: ..:. .. ..:
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:: .:. ... . :. .: ..::.::. . : :
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CCDS31 EPIEINWS
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