Result of FASTA (omim) for
pF1KE0325
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0325, 504 aa
1>>>pF1KE0325 504 - 504 aa - 504 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7652+/-0.000475; mu= 21.3483+/- 0.030
mean_var=67.6186+/-14.159, 0's: 0 Z-trim(109.0): 123 B-trim: 777 in 1/48
Lambda= 0.155970
statistics sampled from 17008 (17151) to 17008 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 8.610
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_006713017 (OMIM: 604437) PREDICTED: sodium-coup ( 504) 3267 744.8 1.4e-214
NP_006832 (OMIM: 604437) sodium-coupled neutral am ( 504) 3267 744.8 1.4e-214
NP_061849 (OMIM: 605180) sodium-coupled neutral am ( 506) 1668 385.0 2.8e-106
NP_001294865 (OMIM: 605180) sodium-coupled neutral ( 406) 1451 336.0 1.2e-91
NP_277053 (OMIM: 300649) sodium-coupled neutral am ( 472) 972 228.3 3.8e-59
XP_016885450 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 472) 972 228.3 3.8e-59
XP_016885449 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 478) 972 228.3 3.8e-59
XP_005272752 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 519) 972 228.4 4e-59
XP_005272755 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 492) 877 207.0 1.1e-52
XP_006724632 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 492) 877 207.0 1.1e-52
XP_005272754 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 498) 877 207.0 1.1e-52
XP_005272751 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 539) 877 207.0 1.1e-52
XP_005269054 (OMIM: 608065) PREDICTED: sodium-coup ( 547) 864 204.1 8.7e-52
NP_001137296 (OMIM: 608065) sodium-coupled neutral ( 547) 864 204.1 8.7e-52
NP_060488 (OMIM: 608065) sodium-coupled neutral am ( 547) 864 204.1 8.7e-52
XP_016875479 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coup ( 456) 746 177.5 7.5e-44
XP_011537089 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coup ( 456) 746 177.5 7.5e-44
XP_011537088 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coup ( 478) 746 177.5 7.8e-44
NP_001265317 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 487) 746 177.5 7.9e-44
NP_001265316 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 487) 746 177.5 7.9e-44
NP_001265318 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 487) 746 177.5 7.9e-44
NP_001070952 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 487) 746 177.5 7.9e-44
NP_109599 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral am ( 487) 746 177.5 7.9e-44
XP_011537086 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coup ( 497) 746 177.5 8e-44
NP_001265319 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 503) 746 177.5 8.1e-44
XP_006720113 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 255) 725 172.5 1.3e-42
NP_722518 (OMIM: 616518) probable sodium-coupled n ( 456) 725 172.7 2e-42
XP_016876516 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 258) 672 160.6 5e-39
XP_016876517 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 258) 672 160.6 5e-39
XP_016876515 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 405) 672 160.8 7.1e-39
XP_016876514 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 405) 672 160.8 7.1e-39
XP_016876512 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 435) 672 160.8 7.4e-39
XP_016876511 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 436) 672 160.8 7.5e-39
XP_016876509 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 459) 672 160.8 7.7e-39
NP_001166173 (OMIM: 616518) probable sodium-couple ( 521) 672 160.8 8.5e-39
XP_006720112 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 309) 660 158.0 3.7e-38
XP_011534771 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 348) 660 158.0 4.1e-38
XP_016876510 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 441) 657 157.4 7.8e-38
XP_016876513 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 419) 644 154.5 5.7e-37
XP_016858951 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 395) 278 72.1 3.4e-12
XP_016858950 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 397) 278 72.1 3.4e-12
XP_006712400 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 408) 278 72.1 3.5e-12
XP_016858949 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 408) 278 72.1 3.5e-12
XP_005246407 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 462) 278 72.1 3.8e-12
XP_016858944 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 488) 278 72.2 4e-12
XP_011509044 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 267) 271 70.4 7.5e-12
XP_016858952 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 340) 271 70.5 9e-12
NP_775783 (OMIM: 616526) putative sodium-coupled n ( 384) 271 70.5 9.9e-12
NP_001186077 (OMIM: 616526) putative sodium-couple ( 406) 271 70.5 1e-11
NP_612637 (OMIM: 616525) putative sodium-coupled n ( 780) 266 69.6 3.6e-11
>>XP_006713017 (OMIM: 604437) PREDICTED: sodium-coupled (504 aa)
initn: 3267 init1: 3267 opt: 3267 Z-score: 3973.5 bits: 744.8 E(85289): 1.4e-214
Smith-Waterman score: 3267; 99.8% identity (99.8% similar) in 504 aa overlap (1-504:1-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEAPLQTEMVELVPNGKHSEGLLPVITPMAGNQRVEGPARSCMEGKSFLQKSPSKEPHFT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
XP_006 MEAPLQTEMVELVPNGKHSEGLLPVITPMAGNQRVEDPARSCMEGKSFLQKSPSKEPHFT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 DFEGKTSFGMSVFNLSNAIMGSGILGLAYAMANTGIILFLFLLTAVALLSSYSIHLLLKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DFEGKTSFGMSVFNLSNAIMGSGILGLAYAMANTGIILFLFLLTAVALLSSYSIHLLLKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SGVVGIRAYEQLGYRAFGTPGKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SGVVGIRAYEQLGYRAFGTPGKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 KTSDWYMNGNYLVILVSVTIILPLALMRQLGYLGYSSGFSLSCMVFFLIAVIYKKFHVPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KTSDWYMNGNYLVILVSVTIILPLALMRQLGYLGYSSGFSLSCMVFFLIAVIYKKFHVPC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PLPPNFNNTTGNFSHVEIVKEKVQLQVEPEASAFCTPSYFTLNSQTAYTIPIMAFAFVCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PLPPNFNNTTGNFSHVEIVKEKVQLQVEPEASAFCTPSYFTLNSQTAYTIPIMAFAFVCH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 PEVLPIYTELKDPSKKKMQHISNLSIAVMYIMYFLAALFGYLTFYNGVESELLHTYSKVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PEVLPIYTELKDPSKKKMQHISNLSIAVMYIMYFLAALFGYLTFYNGVESELLHTYSKVD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 PFDVLILCVRVAVLTAVTLTVPIVLFPVRRAIQQMLFPNQEFSWLRHVLIAVGLLTCINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PFDVLILCVRVAVLTAVTLTVPIVLFPVRRAIQQMLFPNQEFSWLRHVLIAVGLLTCINL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 LVIFAPNILGIFGVIGATSAPFLIFIFPAIFYFRIMPTEKEPARSTPKILALCFAMLGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LVIFAPNILGIFGVIGATSAPFLIFIFPAIFYFRIMPTEKEPARSTPKILALCFAMLGFL
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE0 LMTMSLSFIIIDWASGTSRHGGNH
::::::::::::::::::::::::
XP_006 LMTMSLSFIIIDWASGTSRHGGNH
490 500
>>NP_006832 (OMIM: 604437) sodium-coupled neutral amino (504 aa)
initn: 3267 init1: 3267 opt: 3267 Z-score: 3973.5 bits: 744.8 E(85289): 1.4e-214
Smith-Waterman score: 3267; 99.8% identity (99.8% similar) in 504 aa overlap (1-504:1-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEAPLQTEMVELVPNGKHSEGLLPVITPMAGNQRVEGPARSCMEGKSFLQKSPSKEPHFT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
NP_006 MEAPLQTEMVELVPNGKHSEGLLPVITPMAGNQRVEDPARSCMEGKSFLQKSPSKEPHFT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 DFEGKTSFGMSVFNLSNAIMGSGILGLAYAMANTGIILFLFLLTAVALLSSYSIHLLLKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DFEGKTSFGMSVFNLSNAIMGSGILGLAYAMANTGIILFLFLLTAVALLSSYSIHLLLKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SGVVGIRAYEQLGYRAFGTPGKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SGVVGIRAYEQLGYRAFGTPGKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 KTSDWYMNGNYLVILVSVTIILPLALMRQLGYLGYSSGFSLSCMVFFLIAVIYKKFHVPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KTSDWYMNGNYLVILVSVTIILPLALMRQLGYLGYSSGFSLSCMVFFLIAVIYKKFHVPC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PLPPNFNNTTGNFSHVEIVKEKVQLQVEPEASAFCTPSYFTLNSQTAYTIPIMAFAFVCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PLPPNFNNTTGNFSHVEIVKEKVQLQVEPEASAFCTPSYFTLNSQTAYTIPIMAFAFVCH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 PEVLPIYTELKDPSKKKMQHISNLSIAVMYIMYFLAALFGYLTFYNGVESELLHTYSKVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PEVLPIYTELKDPSKKKMQHISNLSIAVMYIMYFLAALFGYLTFYNGVESELLHTYSKVD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 PFDVLILCVRVAVLTAVTLTVPIVLFPVRRAIQQMLFPNQEFSWLRHVLIAVGLLTCINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PFDVLILCVRVAVLTAVTLTVPIVLFPVRRAIQQMLFPNQEFSWLRHVLIAVGLLTCINL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 LVIFAPNILGIFGVIGATSAPFLIFIFPAIFYFRIMPTEKEPARSTPKILALCFAMLGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LVIFAPNILGIFGVIGATSAPFLIFIFPAIFYFRIMPTEKEPARSTPKILALCFAMLGFL
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE0 LMTMSLSFIIIDWASGTSRHGGNH
::::::::::::::::::::::::
NP_006 LMTMSLSFIIIDWASGTSRHGGNH
490 500
>>NP_061849 (OMIM: 605180) sodium-coupled neutral amino (506 aa)
initn: 1555 init1: 826 opt: 1668 Z-score: 2028.9 bits: 385.0 E(85289): 2.8e-106
Smith-Waterman score: 1668; 56.7% identity (81.7% similar) in 464 aa overlap (44-504:47-506)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 PNGKHSEGLLPVITPMAGNQRVEGPARSCMEGKSFLQKSP-SKEPHFTDFE-GKTSFGMS
:...:: .: .:. . :.:. : ::::::
NP_061 SSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGKKKYETEFHPGTTSFGMS
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 VFNLSNAIMGSGILGLAYAMANTGIILFLFLLTAVALLSSYSIHLLLKSSGVVGIRAYEQ
::::::::.:::::::.:::::::: ::..::: :...: ::.:::::... : :::
NP_061 VFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVHLLLKTANEGGSLLYEQ
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 LGYRAFGTPGKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEEKTSDWYMNGNY
:::.::: :::::. .::.::::::::::.:.: :::::::.. :.:.::. ::.::::
NP_061 LGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIEDKTGLWYLNGNY
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 LVILVSVTIILPLALMRQLGYLGYSSGFSLSCMVFFLIAVIYKKFHVPCPLPPNFN-NTT
::.:::...::::.:.:.::::::.::.:: :::::::.:: :::.::::. . : :
NP_061 LVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVPCPVEAALIINET
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 GNFSHVEIVKEKVQLQVEPEASAFCTPSYFTLNSQTAYTIPIMAFAFVCHPEVLPIYTEL
: . .. . :. . . : : :: .::::.:..::. :.::::: ::::: ::
NP_061 INTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYEEL
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 KDPSKKKMQHISNLSIAVMYIMYFLAALFGYLTFYNGVESELLHTYSKVDPFDVLILCVR
:: :...:...:..:. .:..::.:::::::::::. ::::::::::.. :.:.: ::
NP_061 KDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLIVR
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 VAVLTAVTLTVPIVLFPVRRAIQQMLFPNQEFSWLRHVLIAVGLLTCINLLVIFAPNILG
.::: :::::::.:.::.: .. ..: ...::: :: ::.:..:. ::::::.:.:
NP_061 LAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTIRD
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 IFGVIGATSAPFLIFIFPAIFYFRIMPTEKEPARSTPKILALCFAMLGFLLMTMSLSFII
::: :::..: .::::.:. ::.... .::: .:. :: :: : . : :.:: :...:.
NP_061 IFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLV--KKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIV
440 450 460 470 480 490
500
pF1KE0 IDWASGTSRHGGNH
.::. .. ::.:
NP_061 LDWVHNAP--GGGH
500
>>NP_001294865 (OMIM: 605180) sodium-coupled neutral ami (406 aa)
initn: 1358 init1: 719 opt: 1451 Z-score: 1766.3 bits: 336.0 E(85289): 1.2e-91
Smith-Waterman score: 1451; 55.4% identity (81.0% similar) in 406 aa overlap (100-504:5-406)
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MSVFNLSNAIMGSGILGLAYAMANTGIILFLFLLTAVALLSSYSIHLLLKSSGVVGIRAY
:.::: :...: ::.:::::... : :
NP_001 MKQNLILLTFVSIFSLYSVHLLLKTANEGGSLLY
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EQLGYRAFGTPGKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEEKTSDWYMNG
:::::.::: :::::. .::.::::::::::.:.: :::::::.. :.:.::. ::.::
NP_001 EQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIEDKTGLWYLNG
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NYLVILVSVTIILPLALMRQLGYLGYSSGFSLSCMVFFLIAVIYKKFHVPCPLPPNFN-N
::::.:::...::::.:.:.::::::.::.:: :::::::.:: :::.::::. . :
NP_001 NYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVPCPVEAALIIN
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TTGNFSHVEIVKEKVQLQVEPEASAFCTPSYFTLNSQTAYTIPIMAFAFVCHPEVLPIYT
: : . .. . :. . . : : :: .::::.:..::. :.::::: :::::
NP_001 ETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYE
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ELKDPSKKKMQHISNLSIAVMYIMYFLAALFGYLTFYNGVESELLHTYSKVDPFDVLILC
:::: :...:...:..:. .:..::.:::::::::::. ::::::::::.. :.:.:
NP_001 ELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLI
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 VRVAVLTAVTLTVPIVLFPVRRAIQQMLFPNQEFSWLRHVLIAVGLLTCINLLVIFAPNI
::.::: :::::::.:.::.: .. ..: ...::: :: ::.:..:. ::::::.:.:
NP_001 VRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTI
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 LGIFGVIGATSAPFLIFIFPAIFYFRIMPTEKEPARSTPKILALCFAMLGFLLMTMSLSF
::: :::..: .::::.:. ::.... .::: .:. :: :: : . : :.:: :...
NP_001 RDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLV--KKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMAL
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: .:.
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: .:.
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pF1KE0 GKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEEKTSDWYMNGNYLVILVSVTI
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XP_016 GKVVVATVICLHNVGAMSSYLFIIKSELPLVIGTFLYMDPE-GDWFLKGNLLIIIVSVLI
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pF1KE0 ILPLALMRQLGYLGYSSGFSLSCMVFFLIAVIYKKFHVPCPLPPNFNNTTGNFSHVEIVK
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XP_016 ILPLALMKHLGYLGYTSGLSLTCMLFFLVSVIYKKFQLGCAI-----------GHNETAM
190 200 210 220 230
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XP_016 SAPSLIFILPSIFYLRIVPSEVEPFLSWPKIQALCFGVLGVLFMAVSLGFMFANWATGQS
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XP_005 LQDPKMNGALPSDAVGYRQEREGFLPSRGPAPGSKPVQFMDFEGKTSFGMSVFNLSNAIM
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pF1KE0 GKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEEKTSDWYMNGNYLVILVSVTI
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XP_005 GKVVVATVICLHNVGAMSSYLFIIKSELPLVIGTFLYMDPE-GDWFLKGNLLIIIVSVLI
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pF1KE0 ILPLALMRQLGYLGYSSGFSLSCMVFFLIAVIYKKFHVPCPLPPNFNNTTGNFSHVEIVK
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XP_005 ILPLALMKHLGYLGYTSGLSLTCMLFFLVSVIYKKFQLGCAI-----------GHNETAM
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270 280 290 300 310
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XP_005 LQDPKMNGALPSDAVGYRQEREGFLPSRGPAPGSKPVQFMDFEGKTSFGMSVFNLSNAIM
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pF1KE0 GSGILGLAYAMANTGIILFLFLLTAVALLSSYSIHLLLKSSGVVGIRAYEQLGYRAFGTP
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XP_005 GSGILGLAYAMAHTGVIFFLALLLCIALLSSYSIHLLLTCAGIAGIRAYEQLGQRAFGPA
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pF1KE0 GKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEEKTSDWYMNGNYLVILVSVTI
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XP_005 GKVVVATVICLHNVGAMSSYLFIIKSELPLVIGTFLYMDPE-GDWFLKGNLLIIIVSVLI
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XP_005 ILPLALMKHLGYLGYTSGLSLTCMLFFLVSVIYKKFQLGCAI-----------GHNETAM
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pF1KE0 EKVQLQVEPEA--SAFCTPSYFTLNSQTAYTIPIMAFAFVCHPEVLPIYTELKDPSKKKM
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XP_005 ESEALVGLPSQGLNSSCEAQMFTVDSQMSYTVPIMAFAFVCHPEVLPIYTELCRPSKRRM
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pF1KE0 QHISNLSIAVMYIMYFLAALFGYLTFYNGVESELLHTYSKVDPFDVLILCVRVAVLTAVT
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XP_005 QAVANVSIGAMFCMYGLTATFGYLTFYSSVKAEMLHMYSQKDP---LILCVRLAVLLAVT
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pF1KE0 LTVPIVLFPVRRAIQQMLFPNQEFSWLRHVLIAVGLLTCINLLVIFAPNILGIFGVIGAT
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XP_005 LTVPVVLFPIRRALQQLLFPGKAFSWPRHVAIALILLVLVNVLVICVPTIRDIFGVIGST
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XP_005 SAPSLIFILPSIFYLRIVPSEVEPFLSWPKIQG-CQAWIMALIPTPTPWEEEEEEEEEEE
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pF1KE0 RHGGNH
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initn: 1049 init1: 590 opt: 877 Z-score: 1067.1 bits: 207.0 E(85289): 1.1e-52
Smith-Waterman score: 1692; 61.8% identity (81.8% similar) in 435 aa overlap (52-483:33-451)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 LLPVITPMAGNQRVEGPARSCMEGKSFLQKSPSKEP-HFTDFEGKTSFGMSVFNLSNAIM
.:...: .: ::::::::::::::::::::
XP_006 LQDPKMNGALPSDAVGYRQEREGFLPSRGPAPGSKPVQFMDFEGKTSFGMSVFNLSNAIM
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 GSGILGLAYAMANTGIILFLFLLTAVALLSSYSIHLLLKSSGVVGIRAYEQLGYRAFGTP
::::::::::::.::.:.:: :: .:::::::::::: .:..::::::::: ::::
XP_006 GSGILGLAYAMAHTGVIFFLALLLCIALLSSYSIHLLLTCAGIAGIRAYEQLGQRAFGPA
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 GKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEEKTSDWYMNGNYLVILVSVTI
::...: .: :.:.:::::::.:::::::::: ::: .. . .::...:: :.:.::: :
XP_006 GKVVVATVICLHNVGAMSSYLFIIKSELPLVIGTFLYMDPE-GDWFLKGNLLIIIVSVLI
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 ILPLALMRQLGYLGYSSGFSLSCMVFFLIAVIYKKFHVPCPLPPNFNNTTGNFSHVEIVK
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XP_006 ILPLALMKHLGYLGYTSGLSLTCMLFFLVSVIYKKFQLGCAI-----------GHNETAM
190 200 210 220 230
270 280 290 300 310
pF1KE0 EKVQLQVEPEA--SAFCTPSYFTLNSQTAYTIPIMAFAFVCHPEVLPIYTELKDPSKKKM
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XP_006 ESEALVGLPSQGLNSSCEAQMFTVDSQMSYTVPIMAFAFVCHPEVLPIYTELCRPSKRRM
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pF1KE0 QHISNLSIAVMYIMYFLAALFGYLTFYNGVESELLHTYSKVDPFDVLILCVRVAVLTAVT
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XP_006 QAVANVSIGAMFCMYGLTATFGYLTFYSSVKAEMLHMYSQKDP---LILCVRLAVLLAVT
300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 LTVPIVLFPVRRAIQQMLFPNQEFSWLRHVLIAVGLLTCINLLVIFAPNILGIFGVIGAT
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XP_006 LTVPVVLFPIRRALQQLLFPGKAFSWPRHVAIALILLVLVNVLVICVPTIRDIFGVIGST
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