Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0255
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0255, 422 aa
1>>>pF1KE0255 422 - 422 aa - 422 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9603+/-0.00082; mu= 14.0371+/- 0.050
mean_var=71.2417+/-14.041, 0's: 0 Z-trim(108.1): 49 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.151952
statistics sampled from 9969 (10018) to 9969 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16
Scan time: 2.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 2797 622.2 3e-178
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 435) 1157 262.6 5.2e-70
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 1154 262.0 8e-70
CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX ( 415) 1114 253.2 3.4e-67
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 1056 240.5 2.3e-63
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 ( 423) 1052 239.6 4.3e-63
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 1040 237.0 2.6e-62
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 967 221.0 1.7e-57
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 925 211.8 1e-54
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 806 185.6 5.1e-47
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 722 167.2 2.1e-41
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 602 141.0 2e-33
CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 376) 598 140.1 3.5e-33
CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 380) 598 140.1 3.5e-33
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 598 140.1 3.7e-33
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 594 139.2 6.7e-33
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 ( 376) 583 136.8 3.4e-32
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 576 135.3 1.2e-31
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 575 135.1 1.3e-31
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 569 133.7 3.1e-31
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 569 133.7 3.1e-31
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 562 132.2 1.1e-30
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 558 131.3 1.5e-30
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 550 129.6 5.4e-30
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 527 124.5 1.9e-28
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 521 123.2 4.4e-28
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 521 123.2 4.5e-28
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 472 112.5 7e-25
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 466 111.1 1.9e-24
CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3 ( 410) 449 107.4 2.6e-23
CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18 ( 375) 421 101.3 1.7e-21
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 415 100.0 4.5e-21
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 413 99.5 6e-21
CCDS11988.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 380) 408 98.4 1.2e-20
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 ( 379) 397 96.0 6.5e-20
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 382 92.7 6.9e-19
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 370 90.1 4.4e-18
CCDS11989.1 SERPINB2 gene_id:5055|Hs108|chr18 ( 415) 364 88.8 1.1e-17
CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 491) 361 88.2 2e-17
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 352 86.2 6.3e-17
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 340 83.5 4.2e-16
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 330 81.3 1.1e-15
CCDS77196.1 SERPINB11 gene_id:89778|Hs108|chr18 ( 305) 327 80.6 2.2e-15
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 312 77.4 3.4e-14
CCDS11984.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 405) 305 75.9 8.1e-14
CCDS77194.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 425) 305 75.9 8.5e-14
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 289 72.2 4.7e-13
CCDS1585.1 AGT gene_id:183|Hs108|chr1 ( 485) 289 72.4 1.1e-12
>>CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 (422 aa)
initn: 2797 init1: 2797 opt: 2797 Z-score: 3313.7 bits: 622.2 E(32554): 3e-178
Smith-Waterman score: 2797; 100.0% identity (100.0% similar) in 422 aa overlap (1-422:1-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGPAWLWLLGTGILASVHCQPLLAHGDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MGPAWLWLLGTGILASVHCQPLLAHGDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFALR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LYKELAADAPGNIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQGFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LYKELAADAPGNIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQGFR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTGRQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTGRQI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDERTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDERTSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTLRKWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTLRKWG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 QLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVSHKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVSHKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 MVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHAHFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVVNPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHAHFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVVNPV
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 AG
::
CCDS32 AG
>>CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 (435 aa)
initn: 1086 init1: 1086 opt: 1157 Z-score: 1370.4 bits: 262.6 E(32554): 5.2e-70
Smith-Waterman score: 1157; 44.6% identity (76.0% similar) in 413 aa overlap (8-419:27-432)
10 20 30 40
pF1KE0 MGPAWLWLLGTGILASVHCQPLLAHGDKSLQGPQPPRHQLS
:...:. : ..: .. .. :.: . :
CCDS41 MQGQGRRRGTCKDIFCSKMASYLYGVLFAVGLCAPIYC---VSPANAPSAYPRPSSTK-S
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 EPAPAYHRITPTITNFALRLYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALIL
:: . .. :.::.:::..:. ..:. ::::::::.::.::.:::::.. :.. ::
CCDS41 TPASQVYSLN---TDFAFRLYRRLVLETPSQNIFFSPVSVSTSLAMLSLGAHSVTKTQIL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 EGLGFNLTETPEADIHQGFRSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKEL
.:::::::.:::. :::::. :.:.:..:: : ::.:..::. :.:. . ..: ..:.:
CCDS41 QGLGFNLTHTPESAIHQGFQHLVHSLTVPSKDLTLKMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 YGAFAFSANFTDSVTTGRQINDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHP
: : .::..:.. . .::......: :.::: . .. : :::.:.:::::::..:
CCDS41 YEAEVFSTDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 FSRYQTQKQESFFVDERTSLQVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPD
: :.:. :.: :.....::::::::. : : .: : :::..:.:.:.:..:::.
CCDS41 FHPEYTRKNFPFLVGEQVTVHVPMMHQKEQFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 PGKMKQVEAALQPQTLRKWGQLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEA
:::.:.: ::. .:::::.. : ... .::::::..:::: :::..:. :... .:
CCDS41 KGKMRQLEQALSARTLRKWSHSLQKRWIEVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 DFSGVTGQLNKTISKVSHKAMVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHAHFNRPFLL
::::.. . . .::..:::..:.::.:::: ::. : . : . ::: ::.
CCDS41 DFSGIAKRDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLM
360 370 380 390 400 410
410 420
pF1KE0 LLWEVTTQSLLFLGKVVNPVAG
.. . .:...:::::: ::
CCDS41 MITNKATDGILFLGKVENPTKS
420 430
>>CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 (427 aa)
initn: 1023 init1: 701 opt: 1154 Z-score: 1367.0 bits: 262.0 E(32554): 8e-70
Smith-Waterman score: 1154; 44.0% identity (76.4% similar) in 423 aa overlap (5-419:6-424)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGPAWLWLLGTGILASVHCQPLLAH-GDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFA
.: :: .:.:: : : . : :.. .. . . .: .:. .:.:. ..::
CCDS99 MHLIDYLLLLLVGLLALSHGQLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSL-KIAPANADFA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LRLYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQ
.:.: .:...:: ::::::.:::.. :.::::: ... . ::::::::::: :.:.:.
CCDS99 FRFYYLIASETPGKNIFFSPLSISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GFRSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTG
::. ::::: ::. :: .::..:::.. :: ..:.. .: : : .:: :.: :
CCDS99 GFQHLLHTLNLPGHGLETRVGSALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 RQINDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDER
. :::.....: :..:: . :...:..:::.:::.::: :..:: .: .. :.:::
CCDS99 QLINDHVKKETRGKIVDLVSELKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKD-FYVDEN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TSLQVPMMHQ-KEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTL
:...:::: : .: : .:.:. : :.::...:.:.: ....::. :::...: .: :. :
CCDS99 TTVRVPMMLQDQEHHWYLHDRYLPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPEML
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RKWGQLL----LPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKT
.:..:: . . :.::::.:::::.: :..:::..:.:.... ::.::.: : .
CCDS99 MRWNNLLRKRNFYKKLELHLPKFSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ISKVSHKAMVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHA-HFNRPFLLLLWEVTTQSLL
:: ::: .:..: ::::.::... . ...... : .::::::.... ..:::.:
CCDS99 ASKSFHKATLDVDEAGTEAAAATSFAIK--FFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVL
360 370 380 390 400 410
420
pF1KE0 FLGKVVNPVAG
::::::.:
CCDS99 FLGKVVDPTKP
420
>>CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX (415 aa)
initn: 1070 init1: 1034 opt: 1114 Z-score: 1319.8 bits: 253.2 E(32554): 3.4e-67
Smith-Waterman score: 1114; 43.1% identity (75.8% similar) in 422 aa overlap (1-419:1-412)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGP-AWLWLLGTGILASVHCQPLLAHGDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFAL
:.: .: :: :. :..:: : .: :. :.: . .... ..::.
CCDS14 MSPFLYLVLLVLGLHATIHCA--------SPEGKVTACHS-SQPNATLYKMSSINADFAF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 RLYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQG
::.......: ::::::::::..:..::.:: .:.. :.: ::::::.:: ..:..:
CCDS14 NLYRRFTVETPDKNIFFSPVSISAALVMLSFGACCSTQTEIVETLGFNLTDTPMVEIQHG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 FRSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTGR
:. :. .: .:. .:::..::.::. :.::: ..:...: :: . .::..:.. .. .
CCDS14 FQHLICSLNFPKKELELQIGNALFIGKHLKPLAKFLNDVKTLYETEVFSTDFSNISAAKQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 QINDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDERT
.::.... :: :.:: . ... .:.:::.::: :::.: .::. .:. . ::..:. :
CCDS14 EINSHVEMQTKGKVVGLIQDLKPNTIMVLVNYIHFKAQWANPFDPSKTEDSSSFLIDKTT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SLQVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTLRK
..::::::: :.. : :..: :::::..: :::::.::: :.:..::::.. .::.:
CCDS14 TVQVPMMHQMEQYYHLVDMELNCTVLQMDYSKNALALFVLPKEGQMESVEAAMSSKTLKK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 WGQLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVSH
:..:: . .:: .:.::::.::.: : ..:. . . .:::::.: . . .:...:
CCDS14 WNRLLQKGWVDLFVPKFSISATYDLGATLLKMGIQHAYSENADFSGLTEDNGLKLSNAAH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 KAMVDMSEKGTEAGAASGL-LSQPPSLNTMSDPHAHFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVV
::.. ..::::::.:. . ::. : ::. : ...: :.::. : .:.:.:::::::
CCDS14 KAVLHIGEKGTEAAAVPEVELSDQPE-NTFLHPIIQIDRSFMLLILERSTRSILFLGKVV
360 370 380 390 400 410
420
pF1KE0 NPVAG
::
CCDS14 NPTEA
>>CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 (418 aa)
initn: 1031 init1: 536 opt: 1056 Z-score: 1251.1 bits: 240.5 E(32554): 2.3e-63
Smith-Waterman score: 1056; 42.5% identity (75.0% similar) in 416 aa overlap (7-419:7-415)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGPAWLWLLGTGILASVHCQ-PL-LAHGDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFA
: : .::.. : :. ::. .. . . . .. :....:::....::
CCDS99 MPSSVSW--GILLLAGLCCLVPVSLAEDPQGDAAQKTDTSHHDQDHPTFNKITPNLAEFA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LRLYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQ
. ::..:: .. . :::::::::.:..:.::::..:.: :::::.::::: :::.::.
CCDS99 FSLYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEAQIHE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GFRSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTG
::. ::.:: :. .:.: .::.:::.. :: ...:...:.:: . ::..:: :. .
CCDS99 GFQELLRTLNQPDSQLQLTTGNGLFLSEGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAFTVNFGDTEEAK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 RQINDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDER
.:::::... : :..:: . :...:: ..:.::::::.::..:: .:. .:.: ::.
CCDS99 KQINDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDTE-EEDFHVDQV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TSLQVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTLR
:...::::.. : . . . :. :: ..: ::: :.. ::: ::....: : . .
CCDS99 TTVKVPMMKRLGMFNIQHCKKLSSWVLLMKYLGNATAIFFLPDEGKLQHLENELTHDIIT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 KWGQLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVS
:. . .::::..::.:::.:...: :.:.:.... ::.:::: . .::.
CCDS99 KFLENEDRRSASLHLPKLSITGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSGVTEEAPLKLSKAV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 HKAMVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHAHFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVV
:::.. ..::::::..: : . : :. :...::.::..:. : .:.: ::.::::
CCDS99 HKAVLTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSI----PPEVKFNKPFVFLMIEQNTKSPLFMGKVV
360 370 380 390 400 410
420
pF1KE0 NPVAG
::
CCDS99 NPTQK
>>CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 (423 aa)
initn: 979 init1: 648 opt: 1052 Z-score: 1246.2 bits: 239.6 E(32554): 4.3e-63
Smith-Waterman score: 1052; 41.5% identity (75.5% similar) in 417 aa overlap (6-419:5-420)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGPAWLWLLGTGILASVHCQPLLAHGDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFALR
: ::. :.::. : .: : .. :. . ... .. . . .. . ..::.
CCDS32 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAFS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 LYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQGF
:::.:. :: :..:::.::::.::.:::::. .: . ::.:: :::::: ::.:::.:
CCDS32 LYKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQSF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTGRQ
. ::.:: : .:.:..::..:. ..:. ... .. :.:::. ::...: ::... .
CCDS32 QHLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKKL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 INDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDERTS
::::.. : :...: . .....:.:::.:::::::::. ::. : .: :.....
CCDS32 INDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDP-QDTHQSRFYLSKKKW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LQVPMMHQKEMH-RFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTLRK
..:::: ... .. :..:.:::....: ::: ::..::: ::..::: : :.::..
CCDS32 VMVPMMSLHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLKR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 W-GQLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVS
: .: . . .:.::.:::: :::.::: :.:. . .. .::.::.:: : ..:.:
CCDS32 WRDSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQVV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 HKAMVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHAHFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVV
:::..:. :.::::.::... : . . ..::::::... . ::...:..::.
CCDS32 HKAVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKVT
360 370 380 390 400 410
420
pF1KE0 NPVAG
::
CCDS32 NPKQA
420
>>CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 (406 aa)
initn: 1012 init1: 479 opt: 1040 Z-score: 1232.3 bits: 237.0 E(32554): 2.6e-62
Smith-Waterman score: 1040; 40.5% identity (73.3% similar) in 415 aa overlap (6-419:3-406)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGPAWLWLLGTGILASVHCQPLLAHGDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFALR
:.:: .: : . : : . .. : . ::. .: .:..
CCDS99 MQLFLLLCLVLLSPQGASLHRHHPREMKKRVEDLHVGATVAPSSRR------DFTFD
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 LYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQGF
::. ::. ::. .::::::::: .::.::::: ..:. ::::::.:: .. : ..:.::
CCDS99 LYRALASAAPSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHRGF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTGRQ
..::. : : ..:..::.:: : . .. .....: :: : .: .:: ::. . .:
CCDS99 QQLLQELNQPRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAMKQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 INDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDERTS
::::. .:: :..:: : ...... ....:::::::::. :.. ::.:. :.: .:
CCDS99 INDYVAKQTKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQD-FYVTSETV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LQVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTLRKW
..:::: .......: :..:.: :. . :.::: ::..::. :::.::: .:. .:::::
CCDS99 VRVPMMSREDQYHYLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLRKW
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 GQLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVSHK
... :.:.::.::: :.:.:: .::..:..:... .::.::.... : .:.. ::
CCDS99 LKMFKKRQLELYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQVSEMVHK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 AMVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHAHFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVVNP
:.:...:.::.:.::.: . : ... . ::::::.. .. ...:::::: :
CCDS99 AVVEVDESGTRAAAATGTIFTFRS-ARLNSQRLVFNRPFLMF---IVDNNILFLGKVNRP
360 370 380 390 400
420
pF1KE0 VAG
>>CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 (405 aa)
initn: 934 init1: 449 opt: 967 Z-score: 1145.8 bits: 221.0 E(32554): 1.7e-57
Smith-Waterman score: 967; 40.7% identity (74.2% similar) in 391 aa overlap (39-420:21-405)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LGTGILASVHCQPLLAHGDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAY------HR-ITPTITNFALRL
: .: :: :: .. . ..::. :
CCDS99 MPLLLYTCLLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQGFR
::.:.: .: :::.:::::: .::.::::. ..: : .:.:::::::: :..:::::.
CCDS99 YKHLVALSPKKNIFISPVSISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSETEIHQGFQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTGRQI
: . .: . .::. .::.:::: :. . . .::. : . ... :: : .:..:::
CCDS99 HLHQLFAKSDTSLEMTMGNALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDWATASRQI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDERTSL
:.:.. .: :..:: . ... ...::.::::::. : .::. .: ..:.:.::: : .
CCDS99 NSYVKNKTQGKIVDLFSGLDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLAST-REENFYVDETTVV
180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTLRKWG
.:::: :. .:.:..: : ..:..: ::. ....::: :::. : :::. .:. .:.
CCDS99 KVPMMLQSSTISYLHDSELPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMNTVIAALSRDTINRWS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 QLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVSHKA
: : .::..:. .:::.:.: :.: ..:...... .:.:: .: . . ::: :::
CCDS99 AGLTSSQVDLYIPKVTISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KE0 MVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHA-HFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVVNP
.....:.:.......:. .:: : : .::.::...... : : :::..:.::
CCDS99 VLQLNEEGVDTAGSTGV-----TLNLTSKPIILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNP
350 360 370 380 390 400
420
pF1KE0 VAG
:
CCDS99 V
>>CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 (414 aa)
initn: 889 init1: 378 opt: 925 Z-score: 1095.9 bits: 211.8 E(32554): 1e-54
Smith-Waterman score: 925; 37.9% identity (74.7% similar) in 367 aa overlap (56-420:54-412)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 GDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFALRLYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTL
.....: :.:: :: :::.::.::::..
CCDS99 SFSPRNYKALSEVQGWKQRMAAKELARQNMDLGFKLLKKLAFYNPGRNIFLSPLSISTAF
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 ALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQGFRSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLD
..: :::: .: : .: ::. . :: :.:.::. ..: :. . :.:..::.::.:
CCDS99 SMLCLGAQDSTLDEIKQG--FNFRKMPEKDLHEGFHYIIHELTQKTQDLKLSIGNTLFID
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 KRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTGRQINDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTF
.::.:....:.. :..:.: .. .:: . . .::::.. ..:.:.. . . ... :
CCDS99 QRLQPQRKFLEDAKNFYSAETILTNFQNLEMAQKQINDFISQKTHGKINNLIENIDPGTV
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 MVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDERTSLQVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVL
:.:::::::.:.::: :. : :.:.::... .:..:::: .. ... ::. :.::.:
CCDS99 MLLANYIFFRARWKHEFDPNVT-KEEDFFLEKNSSVKVPMMFRSGIYQVGYDDKLSCTIL
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 QIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTLRKWGQLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLE
.: :. : :...::: ::.:..: .:: .:. .: :: ..:. .::. ..::..:.
CCDS99 EIPYQKNITAIFILPDEGKLKHLEKGLQVDTFSRWKTLLSRRVVDVSVPRLHMTGTFDLK
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 DILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVSHKAMVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSL
: ::...:.. ..:.. .. . . .... ::: . :.:.:::..:..: . :
CCDS99 KTLSYIGVSKIFEEHGDLTKIAPHRSLKVGEAVHKAELKMDERGTEGAAGTGAQTLP---
330 340 350 360 370
390 400 410 420
pF1KE0 NTMSDPHA-HFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVVNPVAG
: : . ....:.:::.. :.:::::.:::.
CCDS99 --METPLVVKIDKPYLLLIYSEKIPSVLFLGKIVNPIGK
380 390 400 410
>>CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 (286 aa)
initn: 806 init1: 806 opt: 806 Z-score: 957.5 bits: 185.6 E(32554): 5.1e-47
Smith-Waterman score: 806; 43.8% identity (76.3% similar) in 283 aa overlap (137-419:1-283)
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LTETPEADIHQGFRSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAF
.:..::. :.:. . ..: ..:.:: : .:
CCDS61 MGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEVF
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SANFTDSVTTGRQINDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQT
:..:.. . .::......: :.::: . .. : :::.:.:::::::..:: :
CCDS61 STDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYT
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 QKQESFFVDERTSLQVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQ
.:. :.: :.....::::::::. : : .: : :::..:.:.:.:..:::. :::.:
CCDS61 RKNFPFLVGEQVTVHVPMMHQKEQFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKMRQ
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 VEAALQPQTLRKWGQLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVT
.: ::. .:::::.. : ... .::::::..:::: :::..:. :... .:::::..
CCDS61 LEQALSARTLRKWSHSLQKRWIEVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSGIA
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 GQLNKTISKVSHKAMVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHAHFNRPFLLLLWEVT
. . .::..:::..:.::.:::: ::. : . : . ::: ::... . .
CCDS61 KRDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITNKA
220 230 240 250 260 270
410 420
pF1KE0 TQSLLFLGKVVNPVAG
:...:::::: ::
CCDS61 TDGILFLGKVENPTKS
280
422 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 12:00:17 2016 done: Sat Nov 5 12:00:18 2016
Total Scan time: 2.990 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]