Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0243
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0243, 388 aa
1>>>pF1KE0243 388 - 388 aa - 388 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8107+/-0.00104; mu= 14.0614+/- 0.062
mean_var=69.0600+/-14.057, 0's: 0 Z-trim(103.9): 34 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.154334
statistics sampled from 7607 (7632) to 7607 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.609), E-opt: 0.2 (0.234), width: 16
Scan time: 2.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31575.1 PGA4 gene_id:643847|Hs108|chr11 ( 388) 2585 584.8 4.3e-167
CCDS31574.1 PGA3 gene_id:643834|Hs108|chr11 ( 388) 2580 583.7 9.3e-167
CCDS8001.1 PGA5 gene_id:5222|Hs108|chr11 ( 388) 2571 581.7 3.7e-166
CCDS73013.1 CTSE gene_id:1510|Hs108|chr1 ( 396) 1381 316.8 2.2e-86
CCDS4859.1 PGC gene_id:5225|Hs108|chr6 ( 388) 1311 301.2 1.1e-81
CCDS12794.1 NAPSA gene_id:9476|Hs108|chr19 ( 420) 986 228.8 6.9e-60
CCDS30981.1 REN gene_id:5972|Hs108|chr1 ( 406) 900 209.7 3.9e-54
CCDS73012.1 CTSE gene_id:1510|Hs108|chr1 ( 363) 898 209.2 4.8e-54
CCDS7725.1 CTSD gene_id:1509|Hs108|chr11 ( 412) 758 178.1 1.3e-44
CCDS55000.1 PGC gene_id:5225|Hs108|chr6 ( 315) 728 171.3 1e-42
>>CCDS31575.1 PGA4 gene_id:643847|Hs108|chr11 (388 aa)
initn: 2585 init1: 2585 opt: 2585 Z-score: 3113.3 bits: 584.8 E(32554): 4.3e-167
Smith-Waterman score: 2585; 100.0% identity (100.0% similar) in 388 aa overlap (1-388:1-388)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKWLLLLGLVALSECIMYKVPLIRKKSLRRTLSERGLLKDFLKKHNLNPARKYFPQWEAP
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CCDS31 MKWLLLLGLVALSECIMYKVPLIRKKSLRRTLSERGLLKDFLKKHNLNPARKYFPQWEAP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TLVDEQPLENYLDMEYFGTIGIGTPAQDFTVVFDTGSSNLWVPSVYCSSLACTNHNRFNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TLVDEQPLENYLDMEYFGTIGIGTPAQDFTVVFDTGSSNLWVPSVYCSSLACTNHNRFNP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EDSSTYQSTSETVSITYGTGSMTGILGYDTVQVGGISDTNQIFGLSETEPGSFLYYAPFD
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CCDS31 EDSSTYQSTSETVSITYGTGSMTGILGYDTVQVGGISDTNQIFGLSETEPGSFLYYAPFD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GILGLAYPSISSSGATPVFDNIWNQGLVSQDLFSVYLSADDQSGSVVIFGGIDSSYYTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GILGLAYPSISSSGATPVFDNIWNQGLVSQDLFSVYLSADDQSGSVVIFGGIDSSYYTGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LNWVPVTVEGYWQITVDSITMNGEAIACAEGCQAIVDTGTSLLTGPTSPIANIQSDIGAS
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CCDS31 LNWVPVTVEGYWQITVDSITMNGEAIACAEGCQAIVDTGTSLLTGPTSPIANIQSDIGAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ENSDGDMVVSCSAISSLPDIVFTINGVQYPVPPSAYILQSEGSCISGFQGMNLPTESGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ENSDGDMVVSCSAISSLPDIVFTINGVQYPVPPSAYILQSEGSCISGFQGMNLPTESGEL
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE0 WILGDVFIRQYFTVFDRANNQVGLAPVA
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WILGDVFIRQYFTVFDRANNQVGLAPVA
370 380
>>CCDS31574.1 PGA3 gene_id:643834|Hs108|chr11 (388 aa)
initn: 2580 init1: 2580 opt: 2580 Z-score: 3107.3 bits: 583.7 E(32554): 9.3e-167
Smith-Waterman score: 2580; 99.7% identity (100.0% similar) in 388 aa overlap (1-388:1-388)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKWLLLLGLVALSECIMYKVPLIRKKSLRRTLSERGLLKDFLKKHNLNPARKYFPQWEAP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS31 MKWLLLLGLVALSECIMYKVPLIRKKSLRRTLSERGLLKDFLKKHNLNPARKYFPQWKAP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TLVDEQPLENYLDMEYFGTIGIGTPAQDFTVVFDTGSSNLWVPSVYCSSLACTNHNRFNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TLVDEQPLENYLDMEYFGTIGIGTPAQDFTVVFDTGSSNLWVPSVYCSSLACTNHNRFNP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EDSSTYQSTSETVSITYGTGSMTGILGYDTVQVGGISDTNQIFGLSETEPGSFLYYAPFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EDSSTYQSTSETVSITYGTGSMTGILGYDTVQVGGISDTNQIFGLSETEPGSFLYYAPFD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GILGLAYPSISSSGATPVFDNIWNQGLVSQDLFSVYLSADDQSGSVVIFGGIDSSYYTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GILGLAYPSISSSGATPVFDNIWNQGLVSQDLFSVYLSADDQSGSVVIFGGIDSSYYTGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LNWVPVTVEGYWQITVDSITMNGEAIACAEGCQAIVDTGTSLLTGPTSPIANIQSDIGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LNWVPVTVEGYWQITVDSITMNGEAIACAEGCQAIVDTGTSLLTGPTSPIANIQSDIGAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ENSDGDMVVSCSAISSLPDIVFTINGVQYPVPPSAYILQSEGSCISGFQGMNLPTESGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ENSDGDMVVSCSAISSLPDIVFTINGVQYPVPPSAYILQSEGSCISGFQGMNLPTESGEL
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE0 WILGDVFIRQYFTVFDRANNQVGLAPVA
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WILGDVFIRQYFTVFDRANNQVGLAPVA
370 380
>>CCDS8001.1 PGA5 gene_id:5222|Hs108|chr11 (388 aa)
initn: 2571 init1: 2571 opt: 2571 Z-score: 3096.5 bits: 581.7 E(32554): 3.7e-166
Smith-Waterman score: 2571; 99.2% identity (100.0% similar) in 388 aa overlap (1-388:1-388)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKWLLLLGLVALSECIMYKVPLIRKKSLRRTLSERGLLKDFLKKHNLNPARKYFPQWEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 MKWLLLLGLVALSECIMYKVPLIRKKSLRRTLSERGLLKDFLKKHNLNPARKYFPQWEAP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TLVDEQPLENYLDMEYFGTIGIGTPAQDFTVVFDTGSSNLWVPSVYCSSLACTNHNRFNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 TLVDEQPLENYLDMEYFGTIGIGTPAQDFTVVFDTGSSNLWVPSVYCSSLACTNHNRFNP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EDSSTYQSTSETVSITYGTGSMTGILGYDTVQVGGISDTNQIFGLSETEPGSFLYYAPFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 EDSSTYQSTSETVSITYGTGSMTGILGYDTVQVGGISDTNQIFGLSETEPGSFLYYAPFD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GILGLAYPSISSSGATPVFDNIWNQGLVSQDLFSVYLSADDQSGSVVIFGGIDSSYYTGS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS80 GILGLAYPSISSSGATPVFDNIWNQGLVSQDLFSVYLSADDKSGSVVIFGGIDSSYYTGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LNWVPVTVEGYWQITVDSITMNGEAIACAEGCQAIVDTGTSLLTGPTSPIANIQSDIGAS
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LNWVPVTVEGYWQITVDSITMNGETIACAEGCQAIVDTGTSLLTGPTSPIANIQSDIGAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ENSDGDMVVSCSAISSLPDIVFTINGVQYPVPPSAYILQSEGSCISGFQGMNLPTESGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS80 ENSDGDMVVSCSAISSLPDIVFTINGVQYPVPPSAYILQSEGSCISGFQGMNVPTESGEL
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE0 WILGDVFIRQYFTVFDRANNQVGLAPVA
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 WILGDVFIRQYFTVFDRANNQVGLAPVA
370 380
>>CCDS73013.1 CTSE gene_id:1510|Hs108|chr1 (396 aa)
initn: 1426 init1: 657 opt: 1381 Z-score: 1664.4 bits: 316.8 E(32554): 2.2e-86
Smith-Waterman score: 1381; 53.3% identity (78.3% similar) in 396 aa overlap (1-386:1-393)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MKWLLLLGLVAL----SECIMYKVPLIRKKSLRRTLSERGLLKDFLKKHNLNPARKYFPQ
:: :::: :: : .. ...::: :. ::.. : :. :..: :.:::. . : .
CCDS73 MKTLLLLLLVLLELGEAQGSLHRVPLRRHPSLKKKLRARSQLSEFWKSHNLDMIQ--FTE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 WEAPTLVDEQPLENYLDMEYFGTIGIGTPAQDFTVVFDTGSSNLWVPSVYCSSLACTNHN
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CCDS73 SCSMDQSAKEPLINYLDMEYFGTISIGSPPQNFTVIFDTGSSNLWVPSVYCTSPACKTHS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RFNPEDSSTYQSTSETVSITYGTGSMTGILGYDTVQVGGISDTNQIFGLSETEPGSFLYY
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CCDS73 RFQPSQSSTYSQPGQSFSIQYGTGSLSGIIGADQVSVEGLTVVGQQFGESVTEPGQTFVD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 APFDGILGLAYPSISSSGATPVFDNIWNQGLVSQDLFSVYLSADDQ--SGSVVIFGGIDS
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CCDS73 AEFDGILGLGYPSLAVGGVTPVFDNMMAQNLVDLPMFSVYMSSNPEGGAGSELIFGGYDH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SYYTGSLNWVPVTVEGYWQITVDSITMNGEAIACAEGCQAIVDTGTSLLTGPTSPIANIQ
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CCDS73 SHFSGSLNWVPVTKQAYWQIALDNIQVGGTVMFCSEGCQAIVDTGTSLITGPSDKIKQLQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 SDIGASENSDGDMVVSCSAISSLPDIVFTINGVQYPVPPSAYILQS--EGS--CISGFQG
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CCDS73 NAIGAAP-VDGEYAVECANLNVMPDVTFTINGVPYTLSPTAYTLLDFVDGMQFCSSGFQG
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KE0 MNLPTESGELWILGDVFIRQYFTVFDRANNQVGLAPVA
... .: :::::::::::...::::.::.:::::
CCDS73 LDIHPPAGPLWILGDVFIRQFYSVFDRGNNRVGLAPAVP
360 370 380 390
>>CCDS4859.1 PGC gene_id:5225|Hs108|chr6 (388 aa)
initn: 1255 init1: 581 opt: 1311 Z-score: 1580.3 bits: 301.2 E(32554): 1.1e-81
Smith-Waterman score: 1311; 50.5% identity (79.7% similar) in 394 aa overlap (1-388:1-388)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MKWLLLLGLVALS--ECIMYKVPLIRKKSLRRTLSERGLLKDFLKKHNLNPARKY-FPQW
:::.... :: :. : . :::: . ::.:.:..:.::: .::. :. .:: :: :
CCDS48 MKWMVVV-LVCLQLLEAAVVKVPLKKFKSIRETMKEKGLLGEFLRTHKYDPAWKYRF---
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 EAPTLVDEQPLENYLDMEYFGTIGIGTPAQDFTVVFDTGSSNLWVPSVYCSSLACTNHNR
. : .:. :.: ::: :.:::: :.: :.:::::::::::::::.: :::.:.:
CCDS48 -GDLSVTYEPMA-YMDAAYFGEISIGTPPQNFLVLFDTGSSNLWVPSVYCQSQACTSHSR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 FNPEDSSTYQSTSETVSITYGTGSMTGILGYDTVQVGGISDTNQIFGLSETEPGSFLYYA
::: .::::.....: :. ::.::.::..::::. : .:. :: :::::.:::. . ::
CCDS48 FNPSESSTYSTNGQTFSLQYGSGSLTGFFGYDTLTVQSIQVPNQEFGLSENEPGTNFVYA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PFDGILGLAYPSISSSGATPVFDNIWNQGLVSQDLFSVYLSADD-QSGSVVIFGGIDSSY
::::.:::::..: . :: ..... ..: ... .:::::: .. .::..:.:::.:::
CCDS48 QFDGIMGLAYPALSVDEATTAMQGMVQEGALTSPVFSVYLSNQQGSSGGAVVFGGVDSSL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 YTGSLNWVPVTVEGYWQITVDSITMNGEAIA-CAEGCQAIVDTGTSLLTGPTSPIANIQS
:::.. :.::: : :::: .. . ..:.: . :.::::::::::::::: : . .. . .
CCDS48 YTGQIYWAPVTQELYWQIGIEEFLIGGQASGWCSEGCQAIVDTGTSLLTVPQQYMSALLQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 DIGASENSDGDMVVSCSAISSLPDIVFTINGVQYPVPPSAYILQSEGSCISGFQGMNLPT
::.:. :...:.:..:..::...: ::::..:.:::.:::...: : : . : .
CCDS48 ATGAQEDEYGQFLVNCNSIQNLPSLTFIINGVEFPLPPSSYILSNNGYCTVGVEPTYLSS
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KE0 ESGE-LWILGDVFIRQYFTVFDRANNQVGLAPVA
..:. ::::::::.:.:..:.: .::.::.: .:
CCDS48 QNGQPLWILGDVFLRSYYSVYDLGNNRVGFATAA
360 370 380
>>CCDS12794.1 NAPSA gene_id:9476|Hs108|chr19 (420 aa)
initn: 923 init1: 292 opt: 986 Z-score: 1188.6 bits: 228.8 E(32554): 6.9e-60
Smith-Waterman score: 991; 41.4% identity (66.9% similar) in 399 aa overlap (4-385:11-399)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MKWLLLLGLVAL--SECIMYKVPLIRKKSLRRTLSERGLLKDFLKKHNLNPAR
:::: :. . : . ..:: : . :: :. ::. . . ::.
CCDS12 MSPPPLLQPLLLLLPLLNVEPSGATLIRIPLHRVQPGRRILN---LLRGWRE-----PAE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE0 KYFPQWEAPTLVDEQ---PLENYLDMEYFGTIGIGTPAQDFTVVFDTGSSNLWVPSVYCS
.:. ::. :. :: :: :..::: ::.::: :.:::.:::::::::::: :
CCDS12 --LPKLGAPSPGDKPIFVPLSNYRDVQYFGEIGLGTPPQNFTVAFDTGSSNLWVPSRRCH
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 --SLACTNHNRFNPEDSSTYQSTSETVSITYGTGSMTGILGYDTVQVGGISDTNQIFGLS
:. : :.::.:. ::..:... .: :::: . :::. : . .:::. .. ::: .
CCDS12 FFSVPCWLHHRFDPKASSSFQANGTKFAIQYGTGRVDGILSEDKLTIGGIKGASVIFGEA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ETEPGSFLYYAPFDGILGLAYPSISSSGATPVFDNIWNQGLVSQDLFSVYLSADDQ--SG
::. . .: :::::::..: .: :. : .: . .:::... .:: ::. : . .:
CCDS12 LWEPSLVFAFAHFDGILGLGFPILSVEGVRPPMDVLVEQGLLDKPVFSFYLNRDPEEPDG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 SVVIFGGIDSSYYTGSLNWVPVTVEGYWQITVDSITMNGEAIACAEGCQAIVDTGTSLLT
. ...:: : ..: :..::::: .:::: .. . .. ::.:: ::.::::::.:
CCDS12 GELVLGGSDPAHYIPPLTFVPVTVPAYWQIHMERVKVGPGLTLCAKGCAAILDTGTSLIT
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 GPTSPIANIQSDIGASENSDGDMVVSCSAISSLPDIVFTINGVQYPVPPSAYILQSEGS-
::: : ... ::. :.... :: : .:: . : ..:: . . :..:. .
CCDS12 GPTEEIRALHAAIGGIPLLAGEYIILCSEIPKLPAVSFLLGGVWFNLTAHDYVIQTTRNG
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380
pF1KE0 ---CISGFQGMNLPTESGELWILGDVFIRQYFTVFDRANNQ----VGLAPVA
:.::::....: .: .:::::::. : .::::.. . ::::
CCDS12 VRLCLSGFQALDVPPPAGPFWILGDVFLGTYVAVFDRGDMKSSARVGLARARTRGADLGW
360 370 380 390 400 410
CCDS12 GETAQAQFPG
420
>>CCDS30981.1 REN gene_id:5972|Hs108|chr1 (406 aa)
initn: 801 init1: 213 opt: 900 Z-score: 1085.4 bits: 209.7 E(32554): 3.9e-54
Smith-Waterman score: 900; 36.4% identity (66.1% similar) in 401 aa overlap (2-385:9-403)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MKWLLLLGLVALSECIMYKVPLIRKKSLRRTLSERGLLKDFLKKHNLNPARKY
.: ::: : . : . .: : :.. ... ::..... ::
CCDS30 MDGWRRMPRWGLLLLL--WGSCT-FGLPTDTTTFKRIFLKRMPSIRESLKERGVDMAR-L
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE0 FPQWEAP----TLVDEQP---LENYLDMEYFGTIGIGTPAQDFTVVFDTGSSNLWVPSVY
:.: : :: . : ::.: .:.: :::::: : : :::::::::.::::
CCDS30 GPEWSQPMKRLTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSK
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 CSSL--ACTNHNRFNPEDSSTYQSTSETVSITYGTGSMTGILGYDTVQVGGISDTNQIFG
:: : ::. :. :. :::.:. .. ... :.::...:.:. : . ::::. : :.::
CCDS30 CSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVT-QMFG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LSETEPGSFLYYAPFDGILGLAYPSISSSGATPVFDNIWNQGLVSQDLFSVYLSADDQS-
:. .. : :::..:... . . .::.:::: .::....:.:: : . :...
CCDS30 EVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 ---GSVVIFGGIDSSYYTGSLNWVPVTVEGYWQITVDSITMNGEAIACAEGCQAIVDTGT
:. ...:: : ..: :..... . : ::: . ...... .. : .:: :.::::.
CCDS30 QSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]