Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0204
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0204, 207 aa
1>>>pF1KE0204 207 - 207 aa - 207 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1138+/-0.00077; mu= 14.9583+/- 0.046
mean_var=68.0801+/-13.526, 0's: 0 Z-trim(108.0): 34 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.155440
statistics sampled from 9916 (9949) to 9916 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 2.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4378.1 FGF18 gene_id:8817|Hs108|chr5 ( 207) 1400 322.4 1.2e-88
CCDS7515.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 215) 767 180.5 6.8e-46
CCDS6019.1 FGF17 gene_id:8822|Hs108|chr8 ( 216) 740 174.4 4.5e-44
CCDS78310.1 FGF17 gene_id:8822|Hs108|chr8 ( 205) 712 168.1 3.4e-42
CCDS7516.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 244) 689 163.0 1.4e-40
CCDS7518.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 204) 682 161.4 3.6e-40
CCDS7517.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 233) 679 160.8 6.3e-40
CCDS73185.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 140) 527 126.5 7.7e-30
CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15 ( 194) 257 66.1 1.7e-11
>>CCDS4378.1 FGF18 gene_id:8817|Hs108|chr5 (207 aa)
initn: 1400 init1: 1400 opt: 1400 Z-score: 1704.8 bits: 322.4 E(32554): 1.2e-88
Smith-Waterman score: 1400; 100.0% identity (100.0% similar) in 207 aa overlap (1-207:1-207)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQVLVAEENVDFRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYSR
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CCDS43 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQVLVAEENVDFRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYSR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TSGKHIQVLGRRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TSGKHIQVLGRRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGKP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYPK
130 140 150 160 170 180
190 200
pF1KE0 GQPELQKPFKYTTVTKRSRRIRPTHPA
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GQPELQKPFKYTTVTKRSRRIRPTHPA
190 200
>>CCDS7515.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 (215 aa)
initn: 735 init1: 579 opt: 767 Z-score: 937.4 bits: 180.5 E(32554): 6.8e-46
Smith-Waterman score: 767; 54.3% identity (80.8% similar) in 208 aa overlap (1-205:1-207)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQVLVAEENVDFRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYSR
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CCDS75 MGSPRSALSCLLLHLLVLCLQAQVTV-QSSPNFTQHVREQSLVTDQLSRRLIRTYQLYSR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 TSGKHIQVLG-RRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGK
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CCDS75 TSGKHVQVLANKRINAMAEDGDPFAKLIVETDTFGSRVRVRGAETGLYICMNKKGKLIAK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYP
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CCDS75 SNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYMAFTRKGRPRKGSKTRQHQREVHFMKRLP
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KE0 KGQPELQKP--FKYTTVTKRSRRIRPTHPA
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CCDS75 RGHHTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWAPEPR
180 190 200 210
>>CCDS6019.1 FGF17 gene_id:8822|Hs108|chr8 (216 aa)
initn: 730 init1: 654 opt: 740 Z-score: 904.7 bits: 174.4 E(32554): 4.5e-44
Smith-Waterman score: 740; 53.4% identity (80.9% similar) in 204 aa overlap (11-206:12-214)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQVLVAEENVDFRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYS
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CCDS60 MGAARLLPNLTLCLQLLILCCQTQGE-NHPSPNFNQYVRDQGAMTDQLSRRQIREYQLYS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 RTSGKHIQVLGRRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGK
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CCDS60 RTSGKHVQVTGRRISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKGAESEKYICMNKRGKLIGK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYP
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CCDS60 PSGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNARHEGWFMAFTRQGRPRQASRSRQNQREAHFIKRLY
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KE0 KGQ-P-----ELQKPFKY--TTVTKRSRRIRPTHPA
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CCDS60 QGQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRTKRTRRPQPLT
180 190 200 210
>>CCDS78310.1 FGF17 gene_id:8822|Hs108|chr8 (205 aa)
initn: 730 init1: 654 opt: 712 Z-score: 871.0 bits: 168.1 E(32554): 3.4e-42
Smith-Waterman score: 723; 52.9% identity (78.9% similar) in 204 aa overlap (11-206:12-203)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQVLVAEENVDFRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYS
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CCDS78 MGAARLLPNLTLCLQLLILCCQTQ------------YVRDQGAMTDQLSRRQIREYQLYS
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 RTSGKHIQVLGRRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGK
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CCDS78 RTSGKHVQVTGRRISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKGAESEKYICMNKRGKLIGK
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYP
:.: ::.::: : ::::::::...:.. ::...::..::::.. ..:.::...::.::
CCDS78 PSGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNARHEGWFMAFTRQGRPRQASRSRQNQREAHFIKRLY
110 120 130 140 150 160
180 190 200
pF1KE0 KGQ-P-----ELQKPFKY--TTVTKRSRRIRPTHPA
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CCDS78 QGQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRTKRTRRPQPLT
170 180 190 200
>>CCDS7516.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 (244 aa)
initn: 741 init1: 541 opt: 689 Z-score: 842.1 bits: 163.0 E(32554): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 702; 47.0% identity (71.6% similar) in 236 aa overlap (1-205:1-236)
10 20 30
pF1KE0 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQV----------------------------LVAEENVD
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CCDS75 MGSPRSALSCLLLHLLVLCLQAQEGPGRGPALGRELASLFRAGREPQGVSQQVTVQSSPN
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 FRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYSRTSGKHIQVLG-RRISARGEDGDKYAQLLVETD
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CCDS75 FTQHVREQSLVTDQLSRRLIRTYQLYSRTSGKHVQVLANKRINAMAEDGDPFAKLIVETD
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGKPDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYV
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CCDS75 TFGSRVRVRGAETGLYICMNKKGKLIAKSNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYM
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KE0 GFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYPKGQPELQKP--FKYTTVTKRSRRIRPTHPA
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CCDS75 AFTRKGRPRKGSKTRQHQREVHFMKRLPRGHHTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWA
190 200 210 220 230 240
CCDS75 PEPR
>>CCDS7518.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 (204 aa)
initn: 741 init1: 541 opt: 682 Z-score: 834.7 bits: 161.4 E(32554): 3.6e-40
Smith-Waterman score: 731; 52.9% identity (77.9% similar) in 208 aa overlap (1-205:1-196)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQVLVAEENVDFRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYSR
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CCDS75 MGSPRSALSCLLLHLLVLCLQAQ------------HVREQSLVTDQLSRRLIRTYQLYSR
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 TSGKHIQVLG-RRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGK
:::::.:::. .::.: .:::: .:.:.::::::::.::..: :: .:.:::.::::..:
CCDS75 TSGKHVQVLANKRINAMAEDGDPFAKLIVETDTFGSRVRVRGAETGLYICMNKKGKLIAK
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYP
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CCDS75 SNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYMAFTRKGRPRKGSKTRQHQREVHFMKRLP
110 120 130 140 150 160
180 190 200
pF1KE0 KGQPELQKP--FKYTTVTKRSRRIRPTHPA
.:. .. :.. . .: .: ..
CCDS75 RGHHTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWAPEPR
170 180 190 200
>>CCDS7517.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 (233 aa)
initn: 763 init1: 541 opt: 679 Z-score: 830.3 bits: 160.8 E(32554): 6.3e-40
Smith-Waterman score: 720; 50.7% identity (74.2% similar) in 225 aa overlap (1-205:1-225)
10 20 30 40
pF1KE0 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQ-------VLVAEENVDFRI----------HVENQTRA
: : :: .:: ::.:.::.:.: .: : :: ::..:. .
CCDS75 MGSPRSALSCLLLHLLVLCLQAQEGPGRGPALGRELASLFRAGREPQGVSQQHVREQSLV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 RDDVSRKQLRLYQLYSRTSGKHIQVLG-RRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGK
:..::. .: :::::::::::.:::. .::.: .:::: .:.:.::::::::.::..:
CCDS75 TDQLSRRLIRTYQLYSRTSGKHVQVLANKRINAMAEDGDPFAKLIVETDTFGSRVRVRGA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 ETEFYLCMNRKGKLVGKPDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKG
:: .:.:::.::::..: .: .:.::: : :::::::::..::: :::..::.:::::::
CCDS75 ETGLYICMNKKGKLIAKSNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYMAFTRKGRPRKG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200
pF1KE0 PKTRENQQDVHFMKRYPKGQPELQKP--FKYTTVTKRSRRIRPTHPA
:::..:..:::::: :.:. .. :.. . .: .: ..
CCDS75 SKTRQHQREVHFMKRLPRGHHTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWAPEPR
190 200 210 220 230
>>CCDS73185.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 (140 aa)
initn: 525 init1: 525 opt: 527 Z-score: 649.2 bits: 126.5 E(32554): 7.7e-30
Smith-Waterman score: 527; 56.2% identity (82.3% similar) in 130 aa overlap (78-205:3-132)
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 SRKQLRLYQLYSRTSGKHIQVLGRRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEFY
:::: .:.:.::::::::.::..: :: .:
CCDS73 MAEDGDPFAKLIVETDTFGSRVRVRGAETGLY
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LCMNRKGKLVGKPDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRE
.:::.::::..: .: .:.::: : :::::::::..::: :::..::.::::::: :::.
CCDS73 ICMNKKGKLIAKSNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYMAFTRKGRPRKGSKTRQ
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200
pF1KE0 NQQDVHFMKRYPKGQPELQKP--FKYTTVTKRSRRIRPTHPA
.:..:::::: :.:. .. :.. . .: .: ..
CCDS73 HQREVHFMKRLPRGHHTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWAPEPR
100 110 120 130 140
>>CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15 (194 aa)
initn: 232 init1: 93 opt: 257 Z-score: 319.9 bits: 66.1 E(32554): 1.7e-11
Smith-Waterman score: 257; 31.6% identity (62.6% similar) in 171 aa overlap (10-175:23-189)
10 20 30 40
pF1KE0 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQVLVAEENVDFRIHVENQTRARDDV
:: . : : .. ::. : .::. : .
CCDS10 MHKWILTWILPTLLYRSCFHIICLVGTISLACNDMTPEQMATNVNCS-SPERHTRSYDYM
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 SRKQLRLYQLYSRTSGKHIQVLGR-RISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEF
..:. .:. ::. .... : .... : ..: . ..: . : : ::: :.::
CCDS10 EGGDIRVRRLFCRTQW-YLRIDKRGKVKGTQEMKNNYNIMEIRTVAVGI-VAIKGVESEF
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 YLCMNRKGKLVGKPDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSG----WYVGFTKKGRPRKG
:: ::..::: .: . ...: : : .:::.:.. :::.. .:....:: : .:
CCDS10 YLAMNKEGKLYAKKE-CNEDCNFKELILENHYNTYASAKWTHNGGEMFVALNQKGIPVRG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200
pF1KE0 PKTRENQQDVHFMKRYPKGQPELQKPFKYTTVTKRSRRIRPTHPA
::...:. .::.
CCDS10 KKTKKEQKTAHFLPMAIT
180 190
207 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 21:24:54 2016 done: Thu Nov 3 21:24:55 2016
Total Scan time: 2.030 Total Display time: -0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]