Result of FASTA (omim) for
pF1KE0176
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0176, 777 aa
1>>>pF1KE0176 777 - 777 aa - 777 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5147+/-0.000418; mu= 15.4757+/- 0.026
mean_var=137.1916+/-27.044, 0's: 0 Z-trim(114.8): 111 B-trim: 0 in 0/56
Lambda= 0.109499
statistics sampled from 24667 (24786) to 24667 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16
Scan time: 10.650
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016865084 (OMIM: 606501) PREDICTED: myotubulari ( 544) 1198 201.6 7.2e-51
XP_016865083 (OMIM: 606501) PREDICTED: myotubulari ( 544) 1198 201.6 7.2e-51
XP_016865082 (OMIM: 606501) PREDICTED: myotubulari ( 544) 1198 201.6 7.2e-51
NP_001035536 (OMIM: 606501) myotubularin-related p ( 747) 1200 202.1 7.3e-51
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XP_016865081 (OMIM: 606501) PREDICTED: myotubulari ( 564) 1001 170.5 1.7e-41
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XP_016865080 (OMIM: 606501) PREDICTED: myotubulari ( 596) 923 158.2 9.2e-38
XP_016865079 (OMIM: 606501) PREDICTED: myotubulari ( 596) 923 158.2 9.2e-38
XP_011512359 (OMIM: 606501) PREDICTED: myotubulari ( 799) 923 158.3 1.1e-37
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NP_001281273 (OMIM: 606501) myotubularin-related p ( 637) 675 119.1 6e-26
XP_016865085 (OMIM: 606501) PREDICTED: myotubulari ( 488) 659 116.4 2.9e-25
XP_016865078 (OMIM: 606501) PREDICTED: myotubulari ( 691) 661 116.9 3e-25
XP_011512362 (OMIM: 606501) PREDICTED: myotubulari ( 669) 595 106.5 4e-22
XP_011512361 (OMIM: 606501) PREDICTED: myotubulari ( 743) 581 104.3 2e-21
XP_016885412 (OMIM: 300171) PREDICTED: myotubulari ( 552) 453 83.9 2e-15
XP_016885410 (OMIM: 300171) PREDICTED: myotubulari ( 571) 453 84.0 2e-15
XP_016885411 (OMIM: 300171) PREDICTED: myotubulari ( 571) 453 84.0 2e-15
XP_011529511 (OMIM: 300171) PREDICTED: myotubulari ( 571) 453 84.0 2e-15
XP_016885409 (OMIM: 300171) PREDICTED: myotubulari ( 602) 453 84.0 2.1e-15
XP_006724918 (OMIM: 300171) PREDICTED: myotubulari ( 665) 453 84.0 2.2e-15
NP_003819 (OMIM: 300171) myotubularin-related prot ( 665) 453 84.0 2.2e-15
NP_001293073 (OMIM: 300171) myotubularin-related p ( 673) 453 84.0 2.3e-15
XP_005274824 (OMIM: 300171) PREDICTED: myotubulari ( 682) 453 84.0 2.3e-15
XP_005274823 (OMIM: 300171) PREDICTED: myotubulari ( 682) 453 84.0 2.3e-15
XP_005274822 (OMIM: 300171) PREDICTED: myotubulari ( 699) 453 84.0 2.3e-15
XP_011542133 (OMIM: 606260) PREDICTED: myotubulari ( 353) 448 83.0 2.5e-15
XP_011542132 (OMIM: 606260) PREDICTED: myotubulari ( 442) 448 83.1 2.9e-15
NP_958438 (OMIM: 601382,603557) myotubularin-relat ( 571) 449 83.3 3.1e-15
XP_006718997 (OMIM: 601382,603557) PREDICTED: myot ( 571) 449 83.3 3.1e-15
XP_016874007 (OMIM: 601382,603557) PREDICTED: myot ( 571) 449 83.3 3.1e-15
XP_006718999 (OMIM: 601382,603557) PREDICTED: myot ( 571) 449 83.3 3.1e-15
NP_958435 (OMIM: 601382,603557) myotubularin-relat ( 571) 449 83.3 3.1e-15
XP_016874006 (OMIM: 601382,603557) PREDICTED: myot ( 571) 449 83.3 3.1e-15
XP_005274432 (OMIM: 601382,603557) PREDICTED: myot ( 571) 449 83.3 3.1e-15
NP_001230500 (OMIM: 601382,603557) myotubularin-re ( 571) 449 83.3 3.1e-15
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XP_006718998 (OMIM: 601382,603557) PREDICTED: myot ( 571) 449 83.3 3.1e-15
XP_011541360 (OMIM: 601382,603557) PREDICTED: myot ( 596) 449 83.3 3.2e-15
XP_011541361 (OMIM: 601382,603557) PREDICTED: myot ( 596) 449 83.3 3.2e-15
NP_056273 (OMIM: 606260) myotubularin-related prot ( 549) 448 83.2 3.4e-15
NP_057240 (OMIM: 601382,603557) myotubularin-relat ( 643) 449 83.4 3.4e-15
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XP_016885039 (OMIM: 300415,310400) PREDICTED: myot ( 566) 437 81.4 1.2e-14
XP_016884522 (OMIM: 603558) PREDICTED: myotubulari (1069) 441 82.3 1.2e-14
XP_016885038 (OMIM: 300415,310400) PREDICTED: myot ( 602) 437 81.5 1.2e-14
XP_005274744 (OMIM: 300415,310400) PREDICTED: myot ( 603) 437 81.5 1.2e-14
XP_011529475 (OMIM: 300415,310400) PREDICTED: myot ( 603) 437 81.5 1.2e-14
NP_000243 (OMIM: 300415,310400) myotubularin [Homo ( 603) 437 81.5 1.2e-14
>>XP_016865084 (OMIM: 606501) PREDICTED: myotubularin-re (544 aa)
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pF1KE0 D
XP_016 LGDV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]