FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0176, 777 aa
1>>>pF1KE0176 777 - 777 aa - 777 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5257+/-0.00105; mu= 15.9414+/- 0.063
mean_var=133.0678+/-26.758, 0's: 0 Z-trim(107.5): 40 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.111183
statistics sampled from 9593 (9623) to 9593 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16
Scan time: 4.190
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45204.1 MTMR10 gene_id:54893|Hs108|chr15 ( 777) 5264 856.6 0
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CCDS72901.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 ( 640) 974 168.4 3.2e-41
CCDS72902.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 ( 709) 974 168.5 3.5e-41
CCDS77998.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 693) 893 155.5 2.8e-37
CCDS75230.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 637) 675 120.5 8.8e-27
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CCDS78512.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 673) 453 84.9 4.8e-16
CCDS8306.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 ( 571) 449 84.2 6.6e-16
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CCDS8305.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 ( 643) 449 84.2 7.2e-16
CCDS14379.1 MTMR8 gene_id:55613|Hs108|chrX ( 704) 448 84.1 8.6e-16
CCDS14694.1 MTM1 gene_id:4534|Hs108|chrX ( 603) 437 82.3 2.6e-15
CCDS46682.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1161) 441 83.2 2.7e-15
CCDS13871.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1170) 441 83.2 2.7e-15
CCDS13870.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1198) 441 83.2 2.8e-15
CCDS11608.1 MTMR4 gene_id:9110|Hs108|chr17 (1195) 435 82.2 5.4e-15
CCDS14091.2 SBF1 gene_id:6305|Hs108|chr22 (1893) 400 76.8 3.7e-13
CCDS9313.1 MTMR6 gene_id:9107|Hs108|chr13 ( 621) 391 74.9 4.5e-13
CCDS31427.1 SBF2 gene_id:81846|Hs108|chr11 (1849) 376 72.9 5.2e-12
CCDS34851.1 MTMR7 gene_id:9108|Hs108|chr8 ( 660) 356 69.3 2.3e-11
>>CCDS45204.1 MTMR10 gene_id:54893|Hs108|chr15 (777 aa)
initn: 5264 init1: 5264 opt: 5264 Z-score: 4571.3 bits: 856.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5264; 99.7% identity (99.9% similar) in 777 aa overlap (1-777:1-777)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFSLKPPKPTFRSYLLPPPQTDDKINSEPKIKKLEPVLLPGEIVVNEVNFVRKCIATDTS
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CCDS45 MFSLKPPKPTFRSYLLPPPQTDDKINSEPKIKKLEPVLLPGEIVVNEVNFVRKCIATDTS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QYDLWGKLICSNFKISFITDDPMPLQKFHYRNLLLGEHDVPLTCIEQIVTVNDHKRKQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QYDLWGKLICSNFKISFITDDPMPLQKFHYRNLLLGEHDVPLTCIEQIVTVNDHKRKQKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LGPNQKLKFNPTELIIYCKDFRIVRFRFDESGPESAKKVCLAIAHYSQPTDLQLLFAFEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LGPNQKLKFNPTELIIYCKDFRIVRFRFDESGPESAKKVCLAIAHYSQPTDLQLLFAFEY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VGKKYHNSANKINGIPSGDGGGGGGGGNGAGGGSSQKTPLFETYSDWDREIKRTGASGWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VGKKYHNSANKINGIPSGDGGGGGGGGNGAGGGSSQKTPLFETYSDWDREIKRTGASGWR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VCSINEGYMISTCLPEYIVVPSSLADQDLKIFSHSFVGRRMPLWCWSHSNGSALVRMALI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VCSINEGYMISTCLPEYIVVPSSLADQDLKIFSHSFVGRRMPLWCWSHSNGSALVRMALI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 KDVLQQRKIDQRICNAITKSHPQRSDVYKSDLDKTLPNIQEIQAAFVKLKQLCVNEPFEE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS45 KDVLQQRKIDQRICNAITKSHPQRSDVYKSDLDKTLPNIQEVQAAFVKLKQLCVNEPFEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 TEEKWLSSLENTRWLEYVRAFLKHSAELVYMLESKHLSVVLQEEEGRDLSCCVASLVQVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TEEKWLSSLENTRWLEYVRAFLKHSAELVYMLESKHLSVVLQEEEGRDLSCCVASLVQVM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 LDPYFRTITGFQSLIQKEWVMAGYQFLDRCNHLKRSEKESPLFLLFLDATWQLLEQYPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LDPYFRTITGFQSLIQKEWVMAGYQFLDRCNHLKRSEKESPLFLLFLDATWQLLEQYPAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 FEFSETYLAVLYDSTRISLFGTFLFNSPHQRVKQSTEFAISKNIQLGDEKGLKFPSVWDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FEFSETYLAVLYDSTRISLFGTFLFNSPHQRVKQSTEFAISKNIQLGDEKGLKFPSVWDW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 SLQFTAKDRTLFHNPFYIGKSTPCIQNGSVKSFKRTKKSYSSTLRGMPSALKNGIISDQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SLQFTAKDRTLFHNPFYIGKSTPCIQNGSVKSFKRTKKSYSSTLRGMPSALKNGIISDQE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 LLPRRNSLILKPKPDPAQQTDSQNSDTEQYFREWFSKPANLHGVILPRVSGTHIKLWKLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLPRRNSLILKPKPDPAQQTDSQNSDTEQYFREWFSKPANLHGVILPRVSGTHIKLWKLC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 YFRWVPEAQISLGGSITAFHKLSLLADEVDVLSRMLRQQRSGPLEACYGGLGQSRMYFNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS45 YFRWVPEAQISLGGSITAFHKLSLLADEVDVLSRMLRQQRSGPLEACYGELGQSRMYFNA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KE0 SGPHHTDTSGTPEFLSSSFPFSPVGNLCRRSILGTPLSKFLSGAKIWLSTETLANED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SGPHHTDTSGTPEFLSSSFPFSPVGNLCRRSILGTPLSKFLSGAKIWLSTETLANED
730 740 750 760 770
>>CCDS34138.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 (747 aa)
initn: 1026 init1: 401 opt: 1200 Z-score: 1048.5 bits: 204.7 E(32554): 4.4e-52
Smith-Waterman score: 1539; 36.2% identity (65.6% similar) in 768 aa overlap (5-755:14-722)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFSLKPPKPTFRSYLLPPP-QTDDKINSEPKIKKLEPVLLPGEIVVNEVNF
: :::.: ::. : .:..: .: :.. ::::: .. :..
CCDS34 MLGKGVVGGGGGTKAPKPSFVSYVRPEEIHTNEKEVTE---KEVTLHLLPGEQLLCEAST
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE0 VRKCIATDTSQYDLWGKLICSNFKISFITDDPMPLQ--KFHYRNLLLGEHDVPLTCIEQI
: : . :. :. ..:.:.:..:::.:. :: :. . ...: ..::.:. : :..::
CCDS34 VLKYVQEDSCQHGVYGRLVCTDFKIAFLGDDESALDNDETQFKNKVIGENDITLHCVDQI
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 VTVNDHKRKQKVLGPNQKLKFNPTELIIYCKDFRIVRFRFDESGPESAKKVCLAIAHYSQ
: :.:.: ..: .:: : .:::.:::.:. .: . . : .:.. .: :..:
CCDS34 YGVFDEKKKT-LFG---QLKKYPEKLIIHCKDLRVFQFCLRYTKEEEVKRIVSGIIHHTQ
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 -PTDLQLLFAFEYVGKKYHNSANKINGIPSGDGGGGGGGGNGAGGGSSQKTPLFETYSDW
: :. :: : :. .:... : ...: .:.: .::
CCDS34 APKLLKRLFLFSYATAAQNNTVTD----P------------------KNHTVMFDTLKDW
180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 DREIKRT-GASGWRVCSINEGYMISTCLPEYIVVPSSLADQDLKIFSHSFVGRRMPLWCW
:..:: : ... :.:::: . :: :.:::. : ..... :. :. .:.:::
CCDS34 CWELERTKGNMKYKAVSVNEGYKVCERLPAYFVVPTPLPEENVQRFQ----GHGIPIWCW
220 230 240 250 260
290 300 310 320 330
pF1KE0 SHSNGSALVRM-ALIKD----VLQQRKIDQRICNAITKS-HPQRSDVYKS-DLDKTLPNI
: :::::..: :: :. .:: :.. . ..: :. : .. :. ::.... ..
CCDS34 SCHNGSALLKMSALPKEQDDGILQ---IQKSFLDGIYKTIHRPPYEIVKTEDLSSNFLSL
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 QEIQAAFVKLKQLCV---NEPFEETEEKWLSSLENTRWLEYVRAFLKHSAELVYMLESKH
::::.:. :.::: . . : .:. ::.: ::.. ::. .: ::.. :.. .:...
CCDS34 QEIQTAYSKFKQLFLIDNSTEFWDTDIKWFSLLESSSWLDIIRRCLKKAIEITECMEAQN
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 LSVVLQEEEGRDLSCCVASLVQVMLDPYFRTITGFQSLIQKEWVMAGYQFLDRCNHLKRS
..:.: ::.. :: : ..::::.:.::. :: ::::::::::::.:. ::::::::...
CCDS34 MNVLLLEENASDLCCLISSLVQLMMDPHCRTRIGFQSLIQKEWVMGGHCFLDRCNHLRQN
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 EKES-PLFLLFLDATWQLLEQYPAAFEFSETYLAVLYDSTRISLFGTFLFNSPHQRVKQS
.:: :.:::::: .:::..:.: ::::.::::.:: :: : .:.::.::::::.
CCDS34 DKEEVPVFLLFLDCVWQLVHQHPPAFEFTETYLTVLSDSLYIPIFSTFFFNSPHQK----
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 TEFAISKNIQLGDEKGLKFPSVWDWSLQFTAKDRTLFHNPFYIGKSTPCIQNGSVKSFK-
. .... : . : :.. .:::::.:: : .::..::.:. : : ...:. :...
CCDS34 -DTNMGREGQDTQSKPLNLLTVWDWSVQFEPKAQTLLKNPLYVEK--PKLDKGQRKGMRF
510 520 530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 RTKKSYSSTLRGMPSALKNGIISDQELLPRRNSLILKPKPDPAQQTDSQNSDTEQYFREW
. ... : : :. : :.. .. .: :. : ...: ... .... :
CCDS34 KHQRQLSLPLTQSKSSPKRGFFREETDHLIKN-LLGKRISKLINSSDELQDNFREFYDSW
560 570 580 590 600 610
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 FSKPANLHGVILPRVSGTHIKLWKLCYFRWVPEAQISLGGSITAFHKLSLLADEVDVLSR
:: .. ::..::.. : .::.: :.::.::::: ::..... :: . .::. :..
CCDS34 HSKSTDYHGLLLPHIEGPEIKVWAQRYLRWIPEAQILGGGQVATLSKLLEMMEEVQSLQE
620 630 640 650 660 670
700 710 720 730 740 750
pF1KE0 MLRQQRSGPLEACYGGLGQSRMYFNASGPHHTDTSGTPEFLSSSFPFSPVGNLCRRSILG
. ... .:.. .: .: .:. ::: :::. . . .:
CCDS34 KIDERH------------HSQQAPQAEAPCLLRNSAR---LSSLFPFALLQRHSSKPVLP
680 690 700 710 720
760 770
pF1KE0 TPLSKFLSGAKIWLSTETLANED
:
CCDS34 TSGWKALGDEDDLAKREDEFVDLGDV
730 740
>>CCDS72901.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 (640 aa)
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Smith-Waterman score: 1055; 34.1% identity (60.7% similar) in 624 aa overlap (94-698:20-599)
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LWGKLICSNFKISFITDDPMPLQKFHYRNLLLGEHDVPLTCIEQIVTVNDHKRKQKVLGP
: .:.: :. : .. .:. .: : .: :
CCDS72 MPPRVTFQPCGWQWNQDTPLNSEYDFALVNIGRLEAVSGLSRVQ-LLRP
10 20 30 40
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 NQKLKFNPTELIIYCKDFRIVRFRFDESGPE-SAKKVCLAIAHYSQPTDLQLLFAFEYVG
.. :: : :..:. .:::..: :. .: : .: .: .::.. .
CCDS72 GSLHKFIPEEILIHGRDFRLLRVGFEAGGLEPQAFQVTMAIVQ----------------A
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. :.:.. .:: . .: :.:. . ::.:: ::. : :. .: ::::
CCDS72 RAQSNQAQQYSGITLSKAGQGSGS-------RKPPIPLMETAEDWETERKKQAARGWRVS
100 110 120 130 140
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..:: . ..: ::.:. ::. . :.... :.: :: : : : .:: :.: . .
CCDS72 TVNERFDVATSLPRYFWVPNRILDSEVRRAFGHFHQGRG-PRLSWHHPGGSDLLRCGGFY
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 DVLQQRKIDQRICNAITKSHPQRSDVYKSDLDKTLPNIQEIQAAFVKLKQLCVNEPFEET
. . : : : . . .. .::: : ::.. ..: : ..:. ::. . .
CCDS72 TASDPNKEDIRAVELMLQAG--HSDVVLVDTMDELPSLADVQLAHLRLRALCLPDS-SVA
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 EEKWLSSLENTRWLEYVRAFLKHSAELVYMLESKHLSVVLQEEEGRDLSCCVASLVQVML
:.::::.::.::::.:::: :...... .. :. ::.:::. :::. ..::::..
CCDS72 EDKWLSALEGTRWLDYVRACLRKASDISVLVTSRVRSVILQERGDRDLNGLLSSLVQLLS
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 DPYFRTITGFQSLIQKEWVMAGYQFLDRCNHLKRSEKESPLFLLFLDATWQLLEQYPAAF
: ::. :::::.:.::: ::. :: : . :: :.:.:::::: .::::.:.:: :
CCDS72 APEARTLFGFQSLVQREWVAAGHPFLTRLGGTGASE-EAPVFLLFLDCVWQLLQQFPADF
330 340 350 360 370 380
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pF1KE0 EFSETYLAVLYDSTRISLFGTFLFNSPHQRVKQSTEFAISKNIQL--------GDEKGLK
:::: .: .:.::.:. ::: :.: .: ::: .. .. :. .:.
CCDS72 EFSEFFLLALHDSVRVPDTLTFLRNTPWERGKQSGQLNSYTQVYTPGYSQPPAGNSFNLQ
390 400 410 420 430 440
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pF1KE0 FPSVWDWSLQFTAKDRTLFHNPFYIGKSTPCIQNGSVKSFKRTKKSYSSTLRGMPSAL--
. :::::.:... . :.:: : . : . : . :. . : ::..
CCDS72 L-SVWDWDLRYSNAQILQFQNPGYDPEHCPDSW------LPRPQPSF--MVPGPPSSVWL
450 460 470 480 490
600 610 620 630 640
pF1KE0 -KNGIISD-QELLPRRNS---LILKPK--PDPAQQTDSQNSDTEQYFREWFSKPANLHGV
. : .. ..: : :.: : .. . : :: ...: .. .: . : :.
CCDS72 FSRGALTPLNQLCPWRDSPSLLAVSSRWLPRPAISSESLADQEWGLPSHWGACPLP-PGL
500 510 520 530 540 550
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 ILPRVSGTHIKLWKLCYFRWVPEAQISLGGSITAFHKLSLLADEVDVLSRMLRQQRSGPL
.:: : .:.::. ::.: ::.:..:.. .: : ::.. :...::.
CCDS72 LLPGYLGPQIRLWRRCYLRGRPEVQMGLSAPT-----ISGLQDELSHLQELLRKWTPRIS
560 570 580 590 600
710 720 730 740 750 760
pF1KE0 EACYGGLGQSRMYFNASGPHHTDTSGTPEFLSSSFPFSPVGNLCRRSILGTPLSKFLSGA
CCDS72 PEDHSKKRDPHTILNPTEIAGILKGQSHPFWITRC
610 620 630 640
>>CCDS72902.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 (709 aa)
initn: 967 init1: 319 opt: 974 Z-score: 852.9 bits: 168.5 E(32554): 3.5e-41
Smith-Waterman score: 1122; 32.9% identity (59.6% similar) in 717 aa overlap (12-698:8-671)
10 20 30 40
pF1KE0 MFSLKPPKPTFRSYLLPPPQTDDKINS-------EPKIKKLEPVL----LPGEIVVNEVN
.:. . : . . ...: ::. .. : :::: .. .
CCDS72 MWWGGRGQSFNIAPQKEEPEMGSVQENRMPEPRSRQPSSCLASRCLPGEQILAWAP
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 FVRKCIATDTSQYDLWGKLICSNFKISFITDDPMPLQKFHYRNLLLGEHDVPLTCIEQIV
::: . . : : :::.::...: .: : .. . : .:.: :. : ..
CCDS72 GVRKGLEPELS-----GTLICTNFRVTF---QPCGWQ-WNQDTPLNSEYDFALVNIGRLE
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 TVNDHKRKQKVLGPNQKLKFNPTELIIYCKDFRIVRFRFDESGPE-SAKKVCLAIAHYSQ
.:. .: : .: :.. :: : :..:. .:::..: :. .: : .: .: .::..
CCDS72 AVSGLSRVQ-LLRPGSLHKFIPEEILIHGRDFRLLRVGFEAGGLEPQAFQVTMAIVQ---
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 PTDLQLLFAFEYVGKKYHNSANKINGIPSGDGGGGGGGGNGAGGGSSQKTPLFETYSDWD
.. :.:.. .:: . .: :.:. . ::.:: ::.
CCDS72 -------------ARAQSNQAQQYSGITLSKAGQGSGS-------RKPPIPLMETAEDWE
170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 REIKRTGASGWRVCSINEGYMISTCLPEYIVVPSSLADQDLK-IFSHSFVGRRMPLWCWS
: :. .: :::: ..:: . ..: ::.:. ::. . :.... :.: :: : :
CCDS72 TERKKQAARGWRVSTVNERFDVATSLPRYFWVPNRILDSEVRRAFGHFHQGRG-PRLSWH
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 HSNGSALVRMALIKDVLQQRKIDQRICNAITKSHPQRSDVYKSDLDKTLPNIQEIQAAFV
: .:: :.: . . . . : : : . . .. .::: : ::.. ..: : .
CCDS72 HPGGSDLLRCGGFYTASDPNKEDIRAVELMLQAG--HSDVVLVDTMDELPSLADVQLAHL
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 KLKQLCVNEPFEETEEKWLSSLENTRWLEYVRAFLKHSAELVYMLESKHLSVVLQEEEGR
.:. ::. . .:.::::.::.::::.:::: :...... .. :. ::.:::. :
CCDS72 RLRALCLPDS-SVAEDKWLSALEGTRWLDYVRACLRKASDISVLVTSRVRSVILQERGDR
330 340 350 360 370
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pF1KE0 DLSCCVASLVQVMLDPYFRTITGFQSLIQKEWVMAGYQFLDRCNHLKRSEKESPLFLLFL
::. ..::::.. : ::. :::::.:.::: ::. :: : . :: :.:.:::::
CCDS72 DLNGLLSSLVQLLSAPEARTLFGFQSLVQREWVAAGHPFLTRLGGTGASE-EAPVFLLFL
380 390 400 410 420 430
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pF1KE0 DATWQLLEQYPAAFEFSETYLAVLYDSTRISLFGTFLFNSPHQRVKQSTEFAISKNIQL-
: .::::.:.:: ::::: .: .:.::.:. ::: :.: .: ::: .. ..
CCDS72 DCVWQLLQQFPADFEFSEFFLLALHDSVRVPDTLTFLRNTPWERGKQSGQLNSYTQVYTP
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CCDS72 GYSQPPAGNSFNLQL-SVWDWDLRYSNAQILQFQNPGYDPEHCP------DSWLPRPQPS
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. . : ::.. . : .. ..: : :.: : .. . : :: ...: ..
CCDS72 F--MVPGPPSSVWLFSRGALTPLNQLCPWRDSPSLLAVSSRWLPRPAISSESLADQEWGL
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pF1KE0 FREWFSKPANLHGVILPRVSGTHIKLWKLCYFRWVPEAQISLGGSITAFHKLSLLADEVD
.: . : :..:: : .:.::. ::.: ::.:..:.. .: : ::..
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:...::.
CCDS72 HLQELLRKWTPRISPEDHSKKRDPHTILNPTEIAGILKGRAEGDLG
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: :::.: ::. : .:..: .: :.. ::::: .. :..
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: : . :. :. ..:.:.:..:::.:. :: :. . ...: ..::.:. : :..::
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:..:: : ... :.:::: . :: :.:::. : ..... :. :. .:.:::
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: :::::..: :: :. .:: :.. . ..: :. : .. :. ::.... ..
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:: .. . . : : :
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:: .. ::..::.. : .::.: :.::.::::: ::..... :: . .::. :..
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CCDS77 SGWKALGDEDDLAKREDEFVDLGDV
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CCDS75 MNVLLLEENASDLCCLISSLVQLMMDPHCRTRIGFQSLIQKEWVMGGHCFLDRCNHLRQN
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CCDS75 DKEE------------------------------------------------HQR-----
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:: :: :. .::.: ..: :
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. .. .:: :: .: : ... ..: ... .... : :
CCDS75 ETDH---------LIKN-------LLGKRISKLIN-------SSDELQDNFREFYDSWHS
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: .. ::..::.. : .::.: :.::.::::: ::..... :: . .::. :.. .
CCDS75 KSTDYHGLLLPHIEGPEIKVWAQRYLRWIPEAQILGGGQVATLSKLLEMMEEVQSLQEKI
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pF1KE0 RQQRSGPLEACYGGLGQSRMYFNASGPHHTDTSGTPEFLSSSFPFSPVGNLCRRSILGTP
... .:.. .: .: .:. ::: :::. . . .: :
CCDS75 DERH------------HSQQAPQAEAPCLLRNSAR---LSSLFPFALLQRHSSKPVLPTS
570 580 590 600 610
760 770
pF1KE0 LSKFLSGAKIWLSTETLANED
CCDS75 GWKALGDEDDLAKREDEFVDLGDV
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CCDS14 FMGAVS----GTLTVTDFKLYFKNVERDP------HF---IL---DVPLGVISRVEKIGA
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120 130 140 150 160 170
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CCDS14 QSHGDNSCG-----------IEIVCKDMRNLRLAYKQE-EQSKLGIFENLNKHAFPLSNG
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CCDS14 QALFAFSY-KEKF-----PING--------------------------WKVY-DPVSEYK
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: : .:.. .:: .: . : ::::.:. :.::. . . :.:. : : .
CCDS14 RQGLPNESWKISKINSNYEFCDTYPAIIVVPTSVKDDDLSKVAAFRAKGRVPVLSWIHPE
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CCDS14 SQATITRCSQPLVGPNDKRCKEDEKYLQTIMDANAQSHKLIIFDARQNSVADTNKTKGGG
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. ... :: . ::. : :::.. : ..:. .:::....:.::::.:
CCDS14 YESESAYPNAELVFLEIHNIHVMRESLRKLKEI-VYPSIDEA--RWLSNVDGTHWLEYIR
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pF1KE0 AFLKHSAELVYMLESKHLSVVLQEEEGRDLSCCVASLVQVMLDPYFRTITGFQSLIQKEW
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CCDS14 MLLAGAVRIADKIESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDSYYRTIKGFETLVEKEW
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. :..: : .: . .. . ::.:: :.: .::. .:.:.::::.: .: .. :
CCDS14 ISFGHRFALRVGHGNDNHADADRSPIFLQFVDCVWQMTRQFPSAFEFNELFLITILDHLY
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CCDS14 SCLFGTFLCNCEQQRFKEDV---YTKTISL-------------WSYINSQLDE--FSNPF
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pF1KE0 YIGKSTPCIQNGSVKSFKRTKKSYSSTLRGMPSALKNGIISDQELLPRRNSLILKPKPDP
..
CCDS14 FVNYENHVLYPVASLSHLELWVNYYVRWNPRMRPQMPIHQNLKELLAVRAELQKRVEGLQ
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>>CCDS78512.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX (673 aa)
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pF1KE0 MFSLKPPKPTFRSYLLPPPQTDDKINSEPKIKKLEPV-LLPGE---IVVNEVNFVRKCI
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CCDS78 QISGSVTSENVSRDYKVFRRPDLRALRDGNKLAQMEEAPLFPGESIKAIVKDVMYI--CP
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pF1KE0 ATDTSQYDLWGKLICSNFKISF--ITDDPMPLQKFHYRNLLLGEHDVPLTCIEQIVTVND
. . : : ..::. : . :: :. .: :::: : .. ..
CCDS78 FMGAVS----GTLTVTDFKLYFKNVERDP------HF---IL---DVPLGVISRVEKIGA
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pF1KE0 HKRKQKVLGPNQKLKFNPTELIIYCKDFRIVRFRFDESGPESAKKVCLAIAHYSQP-TDL
... .. : . : :::.: .:. . . .: . . ... : ..
CCDS78 QSHGDNSCG-----------IEIVCKDMRNLRLAYKQE-EQSKLGIFENLNKHAFPLSNG
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180 190 200 210 220 230
pF1KE0 QLLFAFEYVGKKYHNSANKINGIPSGDGGGGGGGGNGAGGGSSQKTPLFETYSDWDREIK
: :::: : .:. ::: ...: : : :
CCDS78 QALFAFSY-KEKF-----PING--------------------------WKVY-DPVSEYK
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RTG--ASGWRVCSINEGYMISTCLPEYIVVPSSLADQDLKIFSHSFVGRRMPLWCWSHSN
: : .:.. .:: .: . : ::::.:. :.::. . . :.:. : : .
CCDS78 RQGLPNESWKISKINSNYEFCDTYPAIIVVPTSVKDDDLSKVAAFRAKGRVPVLSWIHPE
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..: . . :. : ...: : : .: ..:: : : :. :.
CCDS78 SQATITRCSQPLVGPNDKRCKEDEKYLQTIMDANAQSHKLIIFDARQNSVADTNKTKGGG
310 320 330 340 350 360
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. ... :: . ::. : :::.. : ..:. .:::....:.::::.:
CCDS78 YESESAYPNAELVFLEIHNIHVMRESLRKLKEI-VYPSIDEA--RWLSNVDGTHWLEYIR
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 AFLKHSAELVYMLESKHLSVVLQEEEGRDLSCCVASLVQVMLDPYFRTITGFQSLIQKEW
.: ..... .:: . :::.. .: : . ..::...::: :.::: ::..:..:::
CCDS78 MLLAGAVRIADKIESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDSYYRTIKGFETLVEKEW
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pF1KE0 VMAGYQFLDRCNHLKRSEKE---SPLFLLFLDATWQLLEQYPAAFEFSETYLAVLYDSTR
. :..: : .: . .. . ::.:: :.: .::. .:.:.::::.: .: .. :
CCDS78 ISFGHRFALRVGHGNDNHADADRSPIFLQFVDCVWQMTRQFPSAFEFNELFLITILDHLY
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..
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