FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0150, 315 aa
1>>>pF1KE0150 315 - 315 aa - 315 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1263+/-0.000921; mu= 16.0538+/- 0.055
mean_var=59.3436+/-12.039, 0's: 0 Z-trim(103.9): 83 B-trim: 400 in 1/49
Lambda= 0.166490
statistics sampled from 7556 (7641) to 7556 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3733.1 SLC25A31 gene_id:83447|Hs108|chr4 ( 315) 2093 511.3 3.9e-145
CCDS34114.1 SLC25A4 gene_id:291|Hs108|chr4 ( 298) 1456 358.3 4.2e-99
CCDS14114.1 SLC25A6 gene_id:293|Hs108|chrY ( 298) 1441 354.7 5.2e-98
CCDS14114.1 SLC25A6 gene_id:293|Hs108|chrX ( 298) 1441 354.7 5.2e-98
CCDS14578.1 SLC25A5 gene_id:292|Hs108|chrX ( 298) 1426 351.1 6.3e-97
CCDS32966.1 SLC25A42 gene_id:284439|Hs108|chr19 ( 318) 418 109.0 5.1e-24
CCDS14577.1 SLC25A43 gene_id:203427|Hs108|chrX ( 341) 369 97.2 1.9e-20
CCDS76021.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 290) 343 91.0 1.2e-18
CCDS14624.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 322) 343 91.0 1.4e-18
CCDS14623.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 325) 343 91.0 1.4e-18
CCDS7280.1 SLC25A16 gene_id:8034|Hs108|chr10 ( 332) 305 81.9 7.8e-16
CCDS6300.1 SLC25A32 gene_id:81034|Hs108|chr8 ( 315) 299 80.4 2e-15
CCDS31967.1 SLC25A30 gene_id:253512|Hs108|chr13 ( 291) 285 77.0 1.9e-14
CCDS46927.1 SLC25A36 gene_id:55186|Hs108|chr3 ( 311) 270 73.4 2.5e-13
CCDS66539.1 SLC25A30 gene_id:253512|Hs108|chr13 ( 240) 265 72.2 4.6e-13
CCDS11720.1 SLC25A19 gene_id:60386|Hs108|chr17 ( 320) 262 71.5 9.7e-13
CCDS3114.1 SLC25A36 gene_id:55186|Hs108|chr3 ( 310) 256 70.1 2.6e-12
CCDS3753.1 UCP1 gene_id:7350|Hs108|chr4 ( 307) 245 67.4 1.6e-11
CCDS13758.1 SLC25A1 gene_id:6576|Hs108|chr22 ( 311) 242 66.7 2.6e-11
CCDS7715.1 SLC25A22 gene_id:79751|Hs108|chr11 ( 323) 242 66.7 2.7e-11
CCDS9373.1 SLC25A15 gene_id:10166|Hs108|chr13 ( 301) 240 66.2 3.6e-11
CCDS32156.1 SLC25A29 gene_id:123096|Hs108|chr14 ( 303) 240 66.2 3.6e-11
>>CCDS3733.1 SLC25A31 gene_id:83447|Hs108|chr4 (315 aa)
initn: 2093 init1: 2093 opt: 2093 Z-score: 2719.1 bits: 511.3 E(32554): 3.9e-145
Smith-Waterman score: 2093; 100.0% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MHREPAKKKAEKRLFDASSFGKDLLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQASSKQISPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MHREPAKKKAEKRLFDASSFGKDLLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQASSKQISPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ARYKGMVDCLVRIPREQGFFSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFMSGVNKEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ARYKGMVDCLVRIPREQGFFSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFMSGVNKEKQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FWRWFLANLASGGAAGATSLCVVYPLDFARTRLGVDIGKGPEERQFKGLGDCIMKIAKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 FWRWFLANLASGGAAGATSLCVVYPLDFARTRLGVDIGKGPEERQFKGLGDCIMKIAKSD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GIAGLYQGFGVSVQGIIVYRASYFGAYDTVKGLLPKPKKTPFLVSFFIAQVVTTCSGILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GIAGLYQGFGVSVQGIIVYRASYFGAYDTVKGLLPKPKKTPFLVSFFIAQVVTTCSGILS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 YPFDTVRRRMMMQSGEAKRQYKGTLDCFVKIYQHEGISSFFRGAFSNVLRGTGGALVLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 YPFDTVRRRMMMQSGEAKRQYKGTLDCFVKIYQHEGISSFFRGAFSNVLRGTGGALVLVL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 YDKIKEFFHIDIGGR
:::::::::::::::
CCDS37 YDKIKEFFHIDIGGR
310
>>CCDS34114.1 SLC25A4 gene_id:291|Hs108|chr4 (298 aa)
initn: 1449 init1: 1262 opt: 1456 Z-score: 1892.6 bits: 358.3 E(32554): 4.2e-99
Smith-Waterman score: 1456; 73.7% identity (91.5% similar) in 293 aa overlap (17-307:5-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MHREPAKKKAEKRLFDASSFGKDLLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQASSKQISPE
: :: ::.::::::::::::::::::::::::::: .::::: :
CCDS34 MGDHAWSFLKDFLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQISAE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ARYKGMVDCLVRIPREQGFFSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFMSGVNKEKQ
.:::..::.::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::..::...::
CCDS34 KQYKGIIDCVVRIPKEQGFLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFLGGVDRHKQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FWRWFLANLASGGAAGATSLCVVYPLDFARTRLGVDIGKGPEERQFKGLGDCIMKIAKSD
:::.: .:::::::::::::: :::::::::::..:.::: .:.:.::::::.:: :::
CCDS34 FWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKGAAQREFHGLGDCIIKIFKSD
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GIAGLYQGFGVSVQGIIVYRASYFGAYDTVKGLLPKPKKTPFLVSFFIAQVVTTCSGILS
:. ::::::.:::::::.:::.:::.:::.::.:: ::.. ..::..::: ::. .:..:
CCDS34 GLRGLYQGFNVSVQGIIIYRAAYFGVYDTAKGMLPDPKNVHIFVSWMIAQSVTAVAGLVS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE0 YPFDTVRRRMMMQSGE--AKRQYKGTLDCFVKIYQHEGISSFFRGAFSNVLRGTGGALVL
:::::::::::::::. : .: ::.::. :: . :: ..::.::.:::::: :::.::
CCDS34 YPFDTVRRRMMMQSGRKGADIMYTGTVDCWRKIAKDEGAKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVL
230 240 250 260 270 280
300 310
pF1KE0 VLYDKIKEFFHIDIGGR
::::.::..
CCDS34 VLYDEIKKYV
290
>>CCDS14114.1 SLC25A6 gene_id:293|Hs108|chrY (298 aa)
initn: 1434 init1: 1252 opt: 1441 Z-score: 1873.1 bits: 354.7 E(32554): 5.2e-98
Smith-Waterman score: 1441; 72.3% identity (92.1% similar) in 292 aa overlap (17-306:5-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MHREPAKKKAEKRLFDASSFGKDLLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQASSKQISPE
: ::.::.::::.:::.:::::::::::::::::: .::::. .
CCDS14 MTEQAISFAKDFLAGGIAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQIAAD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ARYKGMVDCLVRIPREQGFFSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFMSGVNKEKQ
.:::.:::.::::.::: .:::::::::::::::::::::::::::::.:..::.:. :
CCDS14 KQYKGIVDCIVRIPKEQGVLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQIFLGGVDKHTQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FWRWFLANLASGGAAGATSLCVVYPLDFARTRLGVDIGKGPEERQFKGLGDCIMKIAKSD
:::.: .:::::::::::::: :::::::::::..:.::. ::.:.:::::..::.:::
CCDS14 FWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKSGTEREFRGLGDCLVKITKSD
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GIAGLYQGFGVSVQGIIVYRASYFGAYDTVKGLLPKPKKTPFLVSFFIAQVVTTCSGILS
:: ::::::.:::::::.:::.:::.:::.::.:: ::.: ..::..:::.::. .:..:
CCDS14 GIRGLYQGFSVSVQGIIIYRAAYFGVYDTAKGMLPDPKNTHIVVSWMIAQTVTAVAGVVS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE0 YPFDTVRRRMMMQSGE--AKRQYKGTLDCFVKIYQHEGISSFFRGAFSNVLRGTGGALVL
:::::::::::::::. : .: ::.::. ::.. :: ..::.::.:::::: :::.::
CCDS14 YPFDTVRRRMMMQSGRKGADIMYTGTVDCWRKIFRDEGGKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVL
230 240 250 260 270 280
300 310
pF1KE0 VLYDKIKEFFHIDIGGR
::::..:.
CCDS14 VLYDELKKVI
290
>>CCDS14114.1 SLC25A6 gene_id:293|Hs108|chrX (298 aa)
initn: 1434 init1: 1252 opt: 1441 Z-score: 1873.1 bits: 354.7 E(32554): 5.2e-98
Smith-Waterman score: 1441; 72.3% identity (92.1% similar) in 292 aa overlap (17-306:5-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MHREPAKKKAEKRLFDASSFGKDLLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQASSKQISPE
: ::.::.::::.:::.:::::::::::::::::: .::::. .
CCDS14 MTEQAISFAKDFLAGGIAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQIAAD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ARYKGMVDCLVRIPREQGFFSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFMSGVNKEKQ
.:::.:::.::::.::: .:::::::::::::::::::::::::::::.:..::.:. :
CCDS14 KQYKGIVDCIVRIPKEQGVLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQIFLGGVDKHTQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FWRWFLANLASGGAAGATSLCVVYPLDFARTRLGVDIGKGPEERQFKGLGDCIMKIAKSD
:::.: .:::::::::::::: :::::::::::..:.::. ::.:.:::::..::.:::
CCDS14 FWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKSGTEREFRGLGDCLVKITKSD
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GIAGLYQGFGVSVQGIIVYRASYFGAYDTVKGLLPKPKKTPFLVSFFIAQVVTTCSGILS
:: ::::::.:::::::.:::.:::.:::.::.:: ::.: ..::..:::.::. .:..:
CCDS14 GIRGLYQGFSVSVQGIIIYRAAYFGVYDTAKGMLPDPKNTHIVVSWMIAQTVTAVAGVVS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE0 YPFDTVRRRMMMQSGE--AKRQYKGTLDCFVKIYQHEGISSFFRGAFSNVLRGTGGALVL
:::::::::::::::. : .: ::.::. ::.. :: ..::.::.:::::: :::.::
CCDS14 YPFDTVRRRMMMQSGRKGADIMYTGTVDCWRKIFRDEGGKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVL
230 240 250 260 270 280
300 310
pF1KE0 VLYDKIKEFFHIDIGGR
::::..:.
CCDS14 VLYDELKKVI
290
>>CCDS14578.1 SLC25A5 gene_id:292|Hs108|chrX (298 aa)
initn: 1423 init1: 1236 opt: 1426 Z-score: 1853.7 bits: 351.1 E(32554): 6.3e-97
Smith-Waterman score: 1426; 71.7% identity (90.1% similar) in 293 aa overlap (17-307:5-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MHREPAKKKAEKRLFDASSFGKDLLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQASSKQISPE
: ::.::.::::::::.:::::::::::::::::: .::::. .
CCDS14 MTDAAVSFAKDFLAGGVAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQITAD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ARYKGMVDCLVRIPREQGFFSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFMSGVNKEKQ
.:::..::.::::.::: .:::::::::::::::::::::::::::::.:..::.:. :
CCDS14 KQYKGIIDCVVRIPKEQGVLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQIFLGGVDKRTQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FWRWFLANLASGGAAGATSLCVVYPLDFARTRLGVDIGKGPEERQFKGLGDCIMKIAKSD
:: .: .:::::::::::::: :::::::::::..:.::. ::.:.:::::..:: :::
CCDS14 FWLYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKAGAEREFRGLGDCLVKIYKSD
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GIAGLYQGFGVSVQGIIVYRASYFGAYDTVKGLLPKPKKTPFLVSFFIAQVVTTCSGILS
:: ::::::.:::::::.:::.::: :::.::.:: ::.: ...:..:::.::. .:. :
CCDS14 GIKGLYQGFNVSVQGIIIYRAAYFGIYDTAKGMLPDPKNTHIVISWMIAQTVTAVAGLTS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE0 YPFDTVRRRMMMQSGEAKRQ--YKGTLDCFVKIYQHEGISSFFRGAFSNVLRGTGGALVL
:::::::::::::::. . : :::::. :: . :: ..::.::.:::::: :::.::
CCDS14 YPFDTVRRRMMMQSGRKGTDIMYTGTLDCWRKIARDEGGKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVL
230 240 250 260 270 280
300 310
pF1KE0 VLYDKIKEFFHIDIGGR
::::.::..
CCDS14 VLYDEIKKYT
290
>>CCDS32966.1 SLC25A42 gene_id:284439|Hs108|chr19 (318 aa)
initn: 359 init1: 115 opt: 418 Z-score: 544.7 bits: 109.0 E(32554): 5.1e-24
Smith-Waterman score: 418; 31.3% identity (65.5% similar) in 278 aa overlap (24-291:37-295)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MHREPAKKKAEKRLFDASSFGKDLLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQAS
::.:..:.:..::::::..:.:...:: :
CCDS32 EGPVRLHEDAEAVLSSSVSSKRDHRQVLSSLLSGALAGALAKTAVAPLDRTKIIFQV--S
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 SKQISPEARYKGMVDCLVRIPREQGFFSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFMS
::..: . .. : ..::.:.:::: :...: : :..:. ...::... :
CCDS32 SKRFSAKEAFR----VLYYTYLNEGFLSLWRGNSATMVRVVPYAAIQFSAHEEYKRILGS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GVN-KEKQFWRWFLANLASGGAAGATSLCVVYPLDFARTRLGVDIGKGPEERQFKGLGDC
. . . . : : .:. ::.:. ..::::..:.:..: :.: .....
CCDS32 YYGFRGEALPPW--PRLFAGALAGTTAASLTYPLDLVRARMAVT----PKE-MYSNIFHV
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IMKIAKSDGIAGLYQGFGVSVQGIIVYRASYFGAYDTVKGLLPK--PKKTPFLVSFFIAQ
...:.. .:. ::.:: .: :.: : . : .:.:.:.: . .. :. : .
CCDS32 FIRISREEGLKTLYHGFMPTVLGVIPYAGLSFFTYETLKSLHREYSGRRQPYP---FERM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE0 VVTTCSGIL----SYPFDTVRRRMMMQ--SGEAKRQYKGTLDCFVKIYQHEG-ISSFFRG
. .:.:.. :::.:.:::::. .: . . :: .:. .:: . ....:
CCDS32 IFGACAGLIGQSASYPLDVVRRRMQTAGVTGYPRASIARTLRTIVR---EEGAVRGLYKG
240 250 260 270 280
290 300 310
pF1KE0 AFSNVLRGTGGALVLVLYDKIKEFFHIDIGGR
: ..:
CCDS32 LSMNWVKGPIAVGISFTTFDLMQILLRHLQS
290 300 310
>>CCDS14577.1 SLC25A43 gene_id:203427|Hs108|chrX (341 aa)
initn: 239 init1: 103 opt: 369 Z-score: 480.7 bits: 97.2 E(32554): 1.9e-20
Smith-Waterman score: 369; 28.2% identity (62.1% similar) in 277 aa overlap (21-290:13-275)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MHREPAKKKAEKRLFDASSFGKDLLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQASSKQISPE
:. :: .:.:...: . .::.: . .: :: . . .
CCDS14 MATWRRDGRLTGGQRLLCAGLAGTLSLSLTAPLELATVLAQVGV----VRGH
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ARYKGMVDCLVRIPREQGFFSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFMSGVNKEKQ
:: : :. : .:. ..:.:: . .: :: .:...: :. :: . ... .:
CCDS14 AR--GPWATGHRVWRAEGLRALWKGNAVACLRLFPCSAVQLAAYRKFVVLFTDDLGHISQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FWRWFLANLASGGAAGATSLCVVYPLDFARTRLGVDIGKGPEERQFKGLGDCIMKIAKSD
: ... .:. :: .: :.:: :. .::: : .. : ...:: . : ...
CCDS14 ---W--SSIMAGSLAGMVSTIVTYPTDLIKTRL---IMQNILEPSYRGLLHAFSTIYQQE
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KE0 GIAGLYQGFGVSVQGIIVYRASYFGAYDTVKGLLPKPKKTPFLVSFFI-AQVVTTCSGIL
:. .::.: ...: : . . :. . .: ... . :. : . : . .... . :
CCDS14 GFLALYRGVSLTVVGALPFSAGSLLVYMNLEKIWNGPRDQFSLPQNFANVCLAAAVTQTL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SYPFDTVRRRMMMQS------GEAKRQYKGTLDCFVKIYQHEGISSFFRGAFSNVLRGTG
:.::.::.:.:. :: : . ...:..::: .: . .:. ... : .:.:.
CCDS14 SFPFETVKRKMQAQSPYLPHSGGVDVHFSGAVDCFRQIVKAQGVLGLWNGLTANLLKIVP
220 230 240 250 260 270
300 310
pF1KE0 GALVLVLYDKIKEFFHIDIGGR
CCDS14 YFGIMFSTFEFCKRICLYQNGYILSPLSYKLTPGVDQSLQPQELRELKKFFKTRKPKPKK
280 290 300 310 320 330
>>CCDS76021.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX (290 aa)
initn: 174 init1: 97 opt: 343 Z-score: 448.0 bits: 91.0 E(32554): 1.2e-18
Smith-Waterman score: 343; 26.3% identity (59.4% similar) in 293 aa overlap (22-307:7-288)
10 20 30 40 50
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.: :. : ..:. : .. : : . :. . .: :.: . .. : .
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..: ::..: ..: . . . .:: : : :. . ... :... . .:
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10 20 30 40 50
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60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 GDCIMKIAKSDGIAGLYQGFGVSVQGIIVYRASYFGAYD-TVKGLLPKPKKTPFLVSFFI
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]