Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0082
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0082, 662 aa
1>>>pF1KE0082 662 - 662 aa - 662 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7141+/-0.00265; mu= 14.7122+/- 0.159
mean_var=342.9142+/-61.433, 0's: 0 Z-trim(102.8): 949 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.069260
statistics sampled from 6067 (7092) to 6067 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.525), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 2.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 4783 493.9 3.1e-139
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CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 2191 234.9 2.8e-61
CCDS46209.1 ZNF548 gene_id:147694|Hs108|chr19 ( 533) 2150 230.6 4.4e-60
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 2147 230.8 7.4e-60
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 2147 230.9 7.5e-60
CCDS54324.1 ZNF548 gene_id:147694|Hs108|chr19 ( 545) 2132 228.8 1.5e-59
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2123 228.2 3.3e-59
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2115 227.4 5.9e-59
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 2115 227.4 6e-59
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2094 225.4 2.6e-58
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 2094 225.4 2.6e-58
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 2091 224.9 2.9e-58
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 2089 224.7 3.3e-58
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2083 224.1 5.1e-58
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 2076 223.3 7.9e-58
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 2077 223.6 8.1e-58
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 2073 223.2 1.1e-57
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 2073 223.3 1.1e-57
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 2073 223.3 1.1e-57
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 2071 223.0 1.2e-57
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 2069 222.7 1.3e-57
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 2068 222.9 1.7e-57
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 2064 222.5 2.3e-57
CCDS46166.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 661) 2057 221.5 3e-57
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 2053 221.2 4.3e-57
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 2039 219.5 9.5e-57
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 2039 219.7 1.1e-56
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 2037 219.6 1.3e-56
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 2033 219.1 1.6e-56
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 2028 218.6 2.3e-56
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 2027 218.4 2.3e-56
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 2027 218.5 2.4e-56
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 2027 218.7 2.7e-56
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 2013 217.0 6e-56
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 2013 217.1 6.3e-56
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 2011 216.9 7.4e-56
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 2010 216.7 7.5e-56
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 2010 216.8 7.9e-56
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 2010 216.8 8e-56
CCDS12506.1 ZNF540 gene_id:163255|Hs108|chr19 ( 660) 2008 216.6 9e-56
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 2007 216.5 9.5e-56
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 2007 216.5 9.7e-56
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 1995 215.4 2.4e-55
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 1995 215.5 2.6e-55
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1990 214.8 3.3e-55
CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 1992 215.3 3.4e-55
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1981 214.0 6.4e-55
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1981 214.1 6.5e-55
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1980 214.0 7.1e-55
>>CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 (662 aa)
initn: 4783 init1: 4783 opt: 4783 Z-score: 2613.3 bits: 493.9 E(32554): 3.1e-139
Smith-Waterman score: 4783; 100.0% identity (100.0% similar) in 662 aa overlap (1-662:1-662)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNLTEDYMVFEDVAIHFSQEEWGILNDVQRHLHSDVMLENFALLSSVGCWHGAKDEEAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MNLTEDYMVFEDVAIHFSQEEWGILNDVQRHLHSDVMLENFALLSSVGCWHGAKDEEAPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KQCVSVGVSQVTTLKPALSTQKAQPCETCSSLLKDILHLAEHDGTHPKRTAKLYLHQKEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KQCVSVGVSQVTTLKPALSTQKAQPCETCSSLLKDILHLAEHDGTHPKRTAKLYLHQKEH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LREKLTRSDEGRPSFVNDSVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTHGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LREKLTRSDEGRPSFVNDSVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTHGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 EAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 PYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 CECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 KFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 DSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 HIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLISH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLISH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 ERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQKVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQKVH
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 TR
::
CCDS42 TR
>>CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 (664 aa)
initn: 4760 init1: 4760 opt: 4760 Z-score: 2600.9 bits: 491.6 E(32554): 1.5e-138
Smith-Waterman score: 4760; 99.4% identity (99.7% similar) in 662 aa overlap (1-662:3-664)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNLTEDYMVFEDVAIHFSQEEWGILNDVQRHLHSDVMLENFALLSSVGCWHGAKDEEA
:. .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MLMDAGQDYMVFEDVAIHFSQEEWGILNDVQRHLHSDVMLENFALLSSVGCWHGAKDEEA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 PSKQCVSVGVSQVTTLKPALSTQKAQPCETCSSLLKDILHLAEHDGTHPKRTAKLYLHQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PSKQCVSVGVSQVTTLKPALSTQKAQPCETCSSLLKDILHLAEHDGTHPKRTAKLYLHQK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 EHLREKLTRSDEGRPSFVNDSVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EHLREKLTRSDEGRPSFVNDSVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 GVEAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GVEAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 NHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPF
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 YCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 CGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKF
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 FVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHN
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 SNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLI
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 SHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQK
610 620 630 640 650 660
660
pF1KE0 VHTR
::::
CCDS82 VHTR
>>CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 (659 aa)
initn: 5414 init1: 1910 opt: 2191 Z-score: 1213.6 bits: 234.9 E(32554): 2.8e-61
Smith-Waterman score: 2286; 51.0% identity (72.9% similar) in 645 aa overlap (1-616:7-649)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNLTEDYMVFEDVAIHFSQEEWGILNDVQRHLHSDVMLENFALLSSVGCWHGAK
:. ... ..:::: ..::.::: .:...:: :. :::::::::....: : :
CCDS12 MAAAVLMDRVQSCVTFEDVFVYFSREEWELLEEAQRFLYRDVMLENFALVATLGFWCEA-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE0 DEEAPSKQCVSV-GVSQVTTLKPALSTQKAQPCETCSSLLKDILHLAEHDGTH-------
..::::.: ::: ::::: : . .: :::.::: :. :::::::::::.:.:
CCDS12 EHEAPSEQSVSVEGVSQVRTAESGL-FQKAHPCEMCDPLLKDILHLAEHQGSHLTQKLCT
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE0 ----PKR---TAKLYLHQKEHLREKLTRSDEGRPSFVND-SVHLAKRNLTCMQGGKDFTG
.: .:..: :::.: :. :.:.: :::.. .::. :..:: . : :.
CCDS12 RGLCRRRFSFSANFYQHQKQHNGENCFRGDDGGASFVKSCTVHMLGRSFTCREEGMDLPD
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KE0 DSDL-QQQALHSGWKPHRDTHGVEAFQ------------SGQNNYSCTQCGKDFCHQHTL
.: : :.:. .. .: : :. .:.: .:: .:: . :: : ::
CCDS12 SSGLFQHQTTYNRVSPCRRTECMESFPHSSSLRQHQGDYDGQMLFSCGDEGKAFLDTFTL
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 FEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQ
.. : :.: ::..: ::..:. .: ::.:.. :.:: . :.:::::: ... .::
CCDS12 LDSQMTHAEVRPFRCLPCGNVFKEKSALINHRKIHSGEISHVCKECGKAFIHLHHLKMHQ
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 KIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHT
:.:::.: : :::::::: ::. :.::::.:: : : :::::::. ..::: ::.:::
CCDS12 KFHTGKRHYTCSECGKAFSRKDTLVQHQRVHTGERSYDCSECGKAYSRSSHLVQHQRIHT
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 GERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKP
::::: ::.::: : ...:..::. ::::::. : :::::: .: :: : :.::: .:
CCDS12 GERPYKCNKCGKAFSRKDTLVQHQRFHTGERPYECSECGKFFSQSSHLIEHWRIHTGARP
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 YECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECN
::: :::::: . :.::.:..:::: . : ::.::: : .::. :: .::: .::::.
CCDS12 YECIECGKFFSHNSSLIKHRRVHTGARSYVCSKCGKAFGCKDTLVQHQIIHTGARPYECS
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 KCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGK
.::: : :: .::..:.:::::::.:::::: : .: :::.::: .:.::. :::
CCDS12 ECGKAFSRKDTLVQHQKIHTGERPYECGECGKFFSHSSNLIVHQRIHTGAKPYECNECGK
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 SFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQ
: :.: :::.::: ::: :::::: . .:. ..:.. : : : .::.:::. ::.
CCDS12 CFSHNSSLILHQRVHTGARPYVCSECGKAYISSSHLVQHKKVHTGARPYECSECGKFFSR
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
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:: :: ::.::: :. : ::.::: . :: :. :...::::. .::. :
CCDS12 NSGLILHQRVHTGEKPYVCSECGKAYSRSSHLVRHQKAHTGERAHECNSFGGPLAASLKL
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630 640 650 660
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CCDS12 V
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CCDS46 QQGFSVGVSEVTASKPCLSSQKVHPSETCGPPLKDILCLVEHNGIHPEQHIYICEAELFQ
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: :... :.:.:.:. ::: : ::.:.. .:::.: ::. . : : :.:. .: :::
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CCDS46 YRDTEDREAFQTGQNDYKCSECGKTFTCSYSFVEHQKIHTGERSYECNKCGKFFKYSANF
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::::. : ::..: . .:. : : ::::.::.:.:::: :::. :::::.:::::.:
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CCDS46 YECSECGKFFRYNSNLIKHWRNHTGERPYECRECGKAFSHKHILVEHQKIHSGERPYECS
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:: : :. . : ::..:. :: . ::. :.:. .. . . : : :. :
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CCDS74 QLTRHQRIHDLT
1050
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CCDS59 GSELTQQQETHTGEKLYKCKECGKAFHHFSYLVKHQRIHTGEKPCACKEYGKAFISGSHL
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CCDS59 IQHQKMYTDERPHECQESVKAFRPSAHLIQHWRIHTGDKPYECKECGKSFTSGSTLNQHQ
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CCDS59 GEKLYDCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECGKSFTLRSALIQHRPVHTGEKR
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CCDS59 KRYSCKECGKSFTSRSTLIEHQRIHTGEKPYHCKECGKSFAFRSAIIQHRRIHTGEKPYD
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pF1KE0 CNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNEC
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CCDS59 CKECGKAFRRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHHSIHTGEKPYECKTC
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CCDS59 GKSFRQRTHLTLHQRIHTGDRPYECKECGKSFTCGSELIRHQRTHTGEKPYDCKECGKAF
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pF1KE0 RYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRS
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CCDS59 RCPSQLSQHKRIHTGEKTYQCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTGEKPYECKTCGKAFKQLT
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pF1KE0 TLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIR
: :::::
CCDS59 QLTRHQRIHDLT
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CCDS54 MNLTEGPLAMAEMDPTQGRVVFEDVAIYFSQEEWGHLDEAQRLLYRDVMLENLALLSSLG
10 20 30 40 50 60
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CCDS54 SWHGAEDEEAPSQQGFSVGVSEVTASKPCLSSQKVHPSETCGPPLKDILCLVEHNGIHPE
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pF1KE0 R-----TAKLYLHQKEHLREKLTRSDEGRPSF-VNDSVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDL
. :.:. : :... :.:.:.:. ::: : ::.:.. .:::.: ::. . : :
CCDS54 QHIYICEAELFQHPKQQIGENLSRGDDWIPSFGKNHRVHMAEEIFTCMEGWKDLPATSCL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 -QQQALHSGWKPHRDTHGVEAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECS
:.:. .: :::.:::. ::::.:::.:.:..::: : .... ::::::: :: :::.
CCDS54 LQHQGPQSEWKPYRDTEDREAFQTGQNDYKCSECGKTFTCSYSFVEHQKIHTGERSYECN
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 ECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGK
.:::.:.:.....::: ::.:: :.: ::::.: .: ...:...:::::::::. :::
CCDS54 KCGKFFKYSANFMKHQTVHTSERTYECRECGKSFMYNYRLMRHKRVHTGERPYECNTCGK
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 AFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMY
: .: ...:::.:: ::: : :::: :. .. :. ::..::::::: ::.:::.: :
CCDS54 FFRYSSTFVRHQRVHTGERPYECRECGKFFMDSSTLIKHQRVHTGERPYKCNDCGKFFRY
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 SSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTL
:.:::::..::::::. : ::..: . .:. : : ::::.::.:.:::: :::. :
CCDS54 ISTLIRHQRIHTGERPYECSVCGELFRYNSSLVKHWRNHTGERPYKCSECGKSFRYHCRL
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 IRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQ
::::.:::::.::::::::::: .:.:: : : ::::.:::: .::: : . : .::
CCDS54 IRHQRVHTGERPYECSECGKFFRYNSNLIKHWRNHTGERPYECRECGKAFSHKHILVEHQ
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 RVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSI-CGKSFRCRSTLDTHQRIH
..:::::::::::: : :. . : ::..:. :: . ::. :.:. .. . . :
CCDS54 KIHSGERPYECSECQKAFIRKSHLVHHQKIHSEER-LVCSMNVGNSL-AKTPTSLNIRDF
490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 TGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRER
: :. :
CCDS54 TMEKVYH
540
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CCDS31 VFDNFFLHSKPEDTDTWLKYYDCDKYKESYKKSQIIIYHRNRLGEKLYECSECRKRFSKK
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pF1KE0 PSFV-NDSVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTHGVEAFQSGQNNYS
::.. ..: :. . : . :: : : : : :: :: .:.. :.
CCDS31 PSLIKHQSRHIRDIAFGCGNCGKTFPQKS---QFITH-----HR-TH------TGEKPYN
220 230 240 250 260
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 CTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSEC
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CCDS31 CSQCGKAFSQKSQLTSHQRTHTGEKPYECGECGKAFSRKSHLISHWRTHTGEKPYGCNEC
270 280 290 300 310 320
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 GKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAF
:.::: : :...::.:::::.:.:: :::::: :::.:. :.: :: .:. ::.: :::
CCDS31 GRAFSEKSNLINHQRIHTGEKPFECRECGKAFSRKSQLVTHHRTHTGTKPFGCSDCRKAF
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 LTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSC
. ...:. :: :::::.:: :.:: : : :.:: ::..::::.: : .::: : ..
CCDS31 FEKSELIRHQTIHTGEKPYECSECRKAFRERSSLINHQRTHTGEKPHGCIQCGKAFSQKS
390 400 410 420 430 440
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 TLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLII
:: :: .::::::. :..::: : .: :.:::..:::::::::::::: : . .:
CCDS31 HLISHQMTHTGEKPFICSKCGKAFSRKSQLVRHQRTHTGEKPYECSECGKAFSEKLSLTN
450 460 470 480 490 500
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 HQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRV
:::.::::::: :..::: : : :::.:.::.::::::::: : .. .: .:::.
CCDS31 HQRIHTGEKPYVCSECGKAFCQKSHLISHQRTHTGEKPYECSECGKAFGEKSSLATHQRT
510 520 530 540 550 560
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 HTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGE
::::.:.:: : :.: .: :.:::::::::.::::: : : : ..:. ::: :.: ::
CCDS31 HTGEKPYECRDCEKAFSQKSQLNTHQRIHTGEKPYECSLCRKAFFEKSELIRHLRTHTGE
570 580 590 600 610 620
560 570 580 590 600 610
pF1KE0 RSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEKPYE
. .::.:: ..: ..: :: ::..:: :. ..::.::: : .: :: :.:.:::::::
CCDS31 KPYECNECRKAFREKSSLINHQRIHTGEKPFECSECGKAFSRKSHLIPHQRTHTGEKPYG
630 640 650 660 670 680
620 630 640 650 660
pF1KE0 CSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQKVHTR
:::: :.: .:.:..:.::::::.::.: :::..:.:.:.::.::..::
CCDS31 CSECRKAFSQKSQLVNHQRIHTGEKPYRCIECGKAFSQKSQLINHQRTHTVKKS
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pF1KE0 EHLREKLTRSDEGRPSFVNDSVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTH
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CCDS82 THRSKKYHELNHFSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTS---------HRRIH
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pF1KE0 GVEAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQR
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CCDS82 ------SGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRR
250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
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::::.::::.:::::: . :.. :: :::::.:..:.:::: : ..:::..: ::::
CCDS82 IHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTG
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPF
.:: :.:::::: ... :. :: :::::.:: :::::: : :.: : ::..:::::.:.
CCDS82 EKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPY
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 YCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSE
: :::: : .: :: .::: ::..::::.: : : : :...:::::::.:.:
CCDS82 KCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNE
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 CGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKF
::: : :.: :: .:.:::::.: .::: : : :. .::::.::.:.::::
CCDS82 CGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKV
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 FVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHN
:... : : ::::::.:..:. ::..: ::.: :: :::::.::.: :::: ::::
CCDS82 FAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHN
540 550 560 570 580 590
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 SNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLI
: ::: : ::. ..:.:::..::..:.: :. .:: :. :::..::: : ..: :
CCDS82 SYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLA
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600 610 620 630 640 650
pF1KE0 SHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQK
.:.:.:::::::.:.::::.: ::: :. ::::..::.:.:::.::.::.:: .:..
CCDS82 NHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRR
660 670 680 690 700 710
660
pF1KE0 VHTR
.::
CCDS82 IHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTG
720 730 740 750 760 770
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pF1KE0 EHLREKLTRSDEGRPSFVNDSVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTH
: . :: :: .:.: . :: :
CCDS12 THRSKKYHELNHFSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTS---------HRRIH
230 240 250 260 270
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pF1KE0 GVEAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQR
::.. :.:..::: : . .: :: ::: :.::.: ::::.::.:: : :.:
CCDS12 ------SGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRR
280 290 300 310 320 330
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 NHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTR
::::.::::.:::::: . :.. :: :::::.:..:.:::: : ..:::..: ::::
CCDS12 IHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTG
340 350 360 370 380 390
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPF
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CCDS12 EKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPY
400 410 420 430 440 450
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pF1KE0 YCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSE
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CCDS12 KCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNE
460 470 480 490 500 510
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CCDS12 SYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLA
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pF1KE0 SHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQK
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pF1KE0 VHTR
.::
CCDS12 IHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTG
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662 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 03:54:33 2016 done: Fri Nov 4 03:54:34 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]