Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0078
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0078, 852 aa
1>>>pF1KE0078 852 - 852 aa - 852 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8391+/-0.00092; mu= 23.9965+/- 0.055
mean_var=78.8433+/-16.363, 0's: 0 Z-trim(107.2): 44 B-trim: 174 in 1/50
Lambda= 0.144441
statistics sampled from 9408 (9450) to 9408 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 4.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30556.1 TAS1R3 gene_id:83756|Hs108|chr1 ( 852) 5852 1229.8 0
CCDS81.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1 ( 841) 1553 333.9 7.2e-91
CCDS187.1 TAS1R2 gene_id:80834|Hs108|chr1 ( 839) 1402 302.4 2.1e-81
CCDS5600.1 GRM3 gene_id:2913|Hs108|chr7 ( 879) 840 185.3 3.9e-46
CCDS2834.1 GRM2 gene_id:2912|Hs108|chr3 ( 872) 754 167.4 9.7e-41
CCDS47696.1 GRM8 gene_id:2918|Hs108|chr7 ( 908) 742 164.9 5.6e-40
CCDS5794.1 GRM8 gene_id:2918|Hs108|chr7 ( 908) 742 164.9 5.6e-40
CCDS69184.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 ( 855) 732 162.8 2.3e-39
CCDS5112.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 ( 926) 732 162.9 2.4e-39
CCDS82.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1 ( 587) 723 160.8 6.5e-39
CCDS3010.1 CASR gene_id:846|Hs108|chr3 (1078) 716 159.6 2.7e-38
CCDS54632.1 CASR gene_id:846|Hs108|chr3 (1088) 716 159.6 2.7e-38
CCDS47497.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 ( 906) 699 156.0 2.8e-37
CCDS64548.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 ( 908) 699 156.0 2.8e-37
CCDS5209.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 (1194) 699 156.1 3.4e-37
CCDS8283.1 GRM5 gene_id:2915|Hs108|chr11 (1180) 686 153.4 2.2e-36
CCDS44694.1 GRM5 gene_id:2915|Hs108|chr11 (1212) 686 153.4 2.3e-36
CCDS69185.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 ( 751) 607 136.7 1.5e-31
CCDS4787.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 912) 596 134.5 8.2e-31
CCDS43042.1 GRM7 gene_id:2917|Hs108|chr3 ( 915) 465 107.2 1.4e-22
CCDS75432.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 865) 419 97.6 1e-19
CCDS59010.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 779) 406 94.8 6.1e-19
CCDS59011.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 743) 392 91.9 4.4e-18
CCDS4442.1 GRM6 gene_id:2916|Hs108|chr5 ( 877) 367 86.8 1.8e-16
>>CCDS30556.1 TAS1R3 gene_id:83756|Hs108|chr1 (852 aa)
initn: 5852 init1: 5852 opt: 5852 Z-score: 6586.4 bits: 1229.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5852; 99.9% identity (99.9% similar) in 852 aa overlap (1-852:1-852)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLGPAVLGLSLWALLHPGTGAPLCLSQQLRMKGDYVLGGLFPLGEAEEAGLRSRTRPSSP
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CCDS30 MLGPAVLGLSLWALLHPGTGAPLCLSQQLRMKGDYVLGGLFPLGEAEEAGLRSRTRPSSP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VCTRFSSNGLLWALAMKMAVEEINNKSDLLPGLRLGYDLFDTCSEPVVAMKPSLMFLAKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VCTRFSSNGLLWALAMKMAVEEINNKSDLLPGLRLGYDLFDTCSEPVVAMKPSLMFLAKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GSRDIAAYCNYTQYQPRVLAVIGPHSSELAMVTGKFFSFFLMPQVSYGASMELLSARETF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GSRDIAAYCNYTQYQPRVLAVIGPHSSELAMVTGKFFSFFLMPQVSYGASMELLSARETF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PSFFRTVPSDRVQLTAAAELLQEFGWNWVAALGSDDEYGRQGLSIFSALAAARGICIAHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PSFFRTVPSDRVQLTAAAELLQEFGWNWVAALGSDDEYGRQGLSIFSALAAARGICIAHE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GLVPLPRADDSRLGKVQDVLHQVNQSSVQVVLLFASVHAAHALFNYSISSRLSPKVWVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GLVPLPRADDSRLGKVQDVLHQVNQSSVQVVLLFASVHAAHALFNYSISSRLSPKVWVAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EAWLTSDLVMGLPGMAQMGTVLGFLQRGAQLHEFPQYVKTHLALATDPAFCSALGEREQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EAWLTSDLVMGLPGMAQMGTVLGFLQRGAQLHEFPQYVKTHLALATDPAFCSALGEREQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 LEEDVVGQRCPQCDCITLQNVSAGLNHHQTFSVYAAVYSVAQALHNTLQCNASGCPAQDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LEEDVVGQRCPQCDCITLQNVSAGLNHHQTFSVYAAVYSVAQALHNTLQCNASGCPAQDP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 VKPWQLLENMYNLTFHVGGLPLRFDSSGNVDMEYDLKLWVWQGSVPRLHDVGRFNGSLRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VKPWQLLENMYNLTFHVGGLPLRFDSSGNVDMEYDLKLWVWQGSVPRLHDVGRFNGSLRT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 ERLKIRWHTSDNQKPVSRCSRQCQEGQVRRVKGFHSCCYDCVDCEAGSYRQNPDDIACTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ERLKIRWHTSDNQKPVSRCSRQCQEGQVRRVKGFHSCCYDCVDCEAGSYRQNPDDIACTF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 CGQDEWSPERSTRCFRRRSRFLAWGEPAVLLLLLLLSLALGLVLAALGLFVHHRDSPLVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CGQDEWSPERSTRCFRRRSRFLAWGEPAVLLLLLLLSLALGLVLAALGLFVHHRDSPLVQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 ASGGPLACFGLVCLGLVCLSVLLFPGQPSPARCLAQQPLSHLPLTGCLSTLFLQAAEIFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ASGGPLACFGLVCLGLVCLSVLLFPGQPSPARCLAQQPLSHLPLTGCLSTLFLQAAEIFV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 ESELPLSWADRLSGCLRGPWAWLVVLLAMLVEVALCTWYLVAFPPEVVTDWHMLPTEALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ESELPLSWADRLSGCLRGPWAWLVVLLAMLVEVALCTWYLVAFPPEVVTDWHMLPTEALV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 HCRTRSWVSFGLAHATNATLAFLCFLGTFLVRSQPGRYNRARGLTFAMLAYFITWVSFVP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS30 HCRTRSWVSFGLAHATNATLAFLCFLGTFLVRSQPGCYNRARGLTFAMLAYFITWVSFVP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 LLANVQVVLRPAVQMGALLLCVLGILAAFHLPRCYLLMRQPGLNTPEFFLGGGPGDAQGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LLANVQVVLRPAVQMGALLLCVLGILAAFHLPRCYLLMRQPGLNTPEFFLGGGPGDAQGQ
790 800 810 820 830 840
850
pF1KE0 NDGNTGNQGKHE
::::::::::::
CCDS30 NDGNTGNQGKHE
850
>>CCDS81.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1 (841 aa)
initn: 1493 init1: 687 opt: 1553 Z-score: 1744.9 bits: 333.9 E(32554): 7.2e-91
Smith-Waterman score: 1558; 33.0% identity (62.6% similar) in 848 aa overlap (1-829:8-827)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLGPAVLGLSLWALL-HPGTGAPLCLSQQLRMKGDYVLGGLFPLGEAEEAGLR
..: .: ::. : ..: .. . :::.:.::::: . . :.
CCDS81 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSP-----DFTLPGDYLLAGLFPL---HSGCLQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE0 SRTRPSSPVCTR---FSSNGLLWALAMKMAVEEINNKSDLLPGLRLGYDLFDTCSEPVVA
: :: .: : :. .: ::...::::::.. :::.. :::.:.:.::. .
CCDS81 VRHRPEVTLCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSA-N
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 MKPSLMFLAKAGSRDIAAYCNYTQYQPRVLAVIGPHSSELAMVTGKFFSFFLMPQVSYGA
. .: :. :.. : . .:.: ::::::: :.. : .:. ..: ::.:..::.:
CCDS81 VYATLRVLSLPGQHHIELQGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPMISYAA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SMELLSARETFPSFFRTVPSDRVQLTAAAELLQEFGWNWVAALGSDDEYGRQGLSIFSAL
: : ::... .:::.::.:.:. :. . . :::.:::.:.. .::.:.::. :.. .
CCDS81 SSETLSVKRQYPSFLRTIPNDKYQVETMVLLLQKFGWTWISLVGSSDDYGQLGVQALENQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 AAARGICIAHEGLVPLP-RADDSRLGKVQDVLHQVNQSSVQVVLLFASVHAAHALFNYSI
:...::::: . ..:. .. : :. : ..... :... ::..:.: . :...:. .
CCDS81 ATGQGICIAFKDIMPFSAQVGDERM---QCLMRHLAQAGATVVVVFSSRQLARVFFESVV
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 SSRLSPKVWVASEAWLTSDLVMGLPGMAQMGTVLGF-LQRGA--QLHEFPQYVKTHLALA
. :. ::::::::: : . :.::. ..: ::: .:. : :. : . :
CCDS81 LTNLTGKVWVASEAWALSRHITGVPGIQRIGMVLGVAIQKRAVPGLKAFEEAYARADKKA
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KE0 TDP----AFCSALGEREQGLEEDVVGQRCPQCDCI---TLQNVSAGLNHHQTFSVYAAVY
: ..::. .: : .:. . :. ...: .. .....: :::
CCDS81 PRPCHKGSWCSS-------------NQLCRECQAFMAHTMPKLKA-FSMSSAYNAYRAVY
350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 SVAQALHNTLQCNASGCPAQDPVKPWQLLENMYNLTFHVGGLPLRFDSSGNVDMEYDLKL
.::..::. : : ::: .. : ::::::..... : . . :... . :..
CCDS81 AVAHGLHQLLGC-ASGACSRGRVYPWQLLEQIHKVHFLLHKDTVAFNDNRDPLSSYNIIA
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 WVWQGSVPRLHDVGRFNGS---LRTERLKIRWHTSDNQKPVSRCSRQCQEGQVRRVKGFH
: :.: . .: . : : .. ::.:: .::: : : :: .: ::. : : :::
CCDS81 WDWNGPKWTFTVLGSSTWSPVQLNINETKIQWHGKDNQVPKSVCSSDCLEGHQRVVTGFH
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 SCCYDCVDCEAGSYRQNPDDIACTFCGQDEWSPERSTRCFRRRSRFLAWGEPAVLLLLLL
::..:: : ::.. .. : : ::..::.:: : :: : ::: : . .::
CCDS81 HCCFECVPCGAGTFLNKSDLYRCQPCGKEEWAPEGSQTCFPRTVVFLALREHTSWVLLAA
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 LSLALGLVLAALGLFVHHRDSPLVQASGGPLACFGLV-CLGLVCLSVLLFPGQPSPARCL
.: : :.:.. :::. : :.:.:...:: : :: .. :. :. : :.:. ::
CCDS81 NTLLLLLLLGTAGLFAWHLDTPVVRSAGGRL-CFLMLGSLAAGSGSLYGFFGEPTRPACL
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 AQQPLSHLPLTGCLSTLFLQAAEIFVESELPLSWADRLSGCLRGPWAWLVVLLAMLVEVA
.: : : .: :: : ... .... .. . . ... : : :... ...
CCDS81 LRQALFALGFTIFLSCLTVRSFQLIIIFKFSTKVPTFYHAWVQNHGAGLFVMISSAAQLL
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KE0 LCTWYLVAFPPEVVTDWHMLPTEALVHCRTRSWVSFGLAHATNATLAFLCFLGTFLVRSQ
.: .::.. : . ... .: ....: . ..: :: :. :.. : ..: ..
CCDS81 ICLTWLVVWTPLPAREYQRFPHLVMLECTETNSLGFILAFLYNGLLSISAFACSYLGKDL
700 710 720 730 740 750
760 770 780 790 800 810
pF1KE0 PGRYNRARGLTFAMLAYFITWVSFVPLLANVQVVLRPAVQMGALLLCVLGILAAFHLPRC
: ::.:. .::..: :..:..: . . ::..: : : . . .... ::.:
CCDS81 PENYNEAKCVTFSLLFNFVSWIAFFTTASVYDGKYLPAANMMAGLSSLSSGFGGYFLPKC
760 770 780 790 800 810
820 830 840 850
pF1KE0 YLLMRQPGLNTPEFFLGGGPGDAQGQNDGNTGNQGKHE
:... .: ::. : :
CCDS81 YVILCRPDLNSTEHFQASIQDYTRRCGST
820 830 840
>>CCDS187.1 TAS1R2 gene_id:80834|Hs108|chr1 (839 aa)
initn: 1078 init1: 314 opt: 1402 Z-score: 1574.9 bits: 302.4 E(32554): 2.1e-81
Smith-Waterman score: 1402; 30.0% identity (61.5% similar) in 847 aa overlap (2-829:1-827)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLGPAVLGLS-----LWALLHPGTGAPLCLSQQLRMKGDYVLGGLFPLGEAEEAGLRSRT
.:: . .: ::.: .:. .... . :::.::::: : .:. :. .
CCDS18 MGPRAKTISSLFFLLWVLAEPAE------NSDFYLPGDYLLGGLFSL-HANMKGIVHLN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 RPSSPVCTRFSSNGLLWAL--AMKMAVEEINNKSDLLPGLRLGYDLFDTCSEPVVAMKPS
. :.: .. . . . : ::..::::::: :.::::. :::.. :.: ..:
CCDS18 FLQVPMCKEYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISN-NVQPV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LMFLAKAGSRDIAAYCNYTQYQPRVLAVIGPHSSELAMVTGKFFSFFLMPQVSYGASMEL
:.:::. . . .:..: ::.::::: .:: .:....:.:.::.::..:.: .
CCDS18 LYFLAHEDNL-LPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LSARETFPSFFRTVPSDRVQLTAAAELLQEFGWNWVAALGSDDEYGRQGLSIFSALAAAR
: . ::...::.:: .. : ..:. .: :::. .: :.: :::.. .... .: :
CCDS18 LRDKVRFPALLRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE0 GICIAHEGLVPLPRADDSRLG----KVQDVLHQVNQSSVQVVLLFASVHAAHALFNYSIS
:::: . .: . ... . .. .. ...::...::..:. . . .:: .
CCDS18 DICIAFQETLPTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 SRLSPKVWVASEAWLTSDLVMGLPGMAQMGTVLGFLQRGAQLHEFPQYVKTHLALATDPA
. .. ::.:::.: . .. .: . ..:: ::. ... . : .. . . :
CCDS18 QNFTGAVWIASESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQAGPPP-
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 FCSALGEREQGLEEDVVGQRCPQCDCITLQ-NVSAGLNHHQT-FSVYAAVYSVAQALHNT
:.. :. . .:.: .: ::. :. :. ... .:::.:::.::.:::.
CCDS18 ----LSRTSQSY---TCNQECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSL
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 LQCNASGCPAQDPVKPWQLLENMYNLTFHVGGLPLRFDSSGNVDMEYDLKLWVWQGSVPR
: :. : : .. : ::::::......: . . :: .:.: .. .. : :. :
CCDS18 LGCDKSTC-TKRVVYPWQLLEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNP
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 LHDVGRFNGSLRTER--LKIRWHTSDNQKPVSRCSRQCQEGQVRRVKGFHSCCYDCVDCE
...:. . : . : ::: .: :.: ::..:: :: .. :.: ::..:.::
CCDS18 FQSVASYYPLQRQLKNIQDISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCL
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 AGSY-RQNPDDIACTFCGQDEWSPERSTRCFRRRSRFLAWGEPAVLLLLLLLSLALGLVL
:.. .. :. : : ..::: . : ::.:. :: : : .. . :: .:.. .:
CCDS18 PGTFLNHTEDEYECQACPNNEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTL
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 AALGLFVHHRDSPLVQASGGPLACFGLVCLGLVCLSVL-LFPGQPSPARCLAQQPLSHLP
: : .: .: ..:.:...:::. :: .. : :: :. .. : :. . :: .: : :
CCDS18 AILVIFWRHFQTPIVRSAGGPM-CFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLC
590 600 610 620 630 640
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pF1KE0 LTGCLSTLFLQAAEIFVESELPLSWADRLSGCLR--GPWAWLVVLLAMLVEVALCTWYLV
.: :.: . ... .: .. . : .: ::.. .. . .. . ... .
CCDS18 FTICISCIAVRSFQIVCAFKMASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLAT
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KE0 AFPPEVVTDWHMLPTEALVHCRTRSWVSFGLAHATNATLAFLCFLGTFLVRSQPGRYNRA
.. : . :: : ..: : :. . . . :. . : ... . : ::.:
CCDS18 GLSPTTRTDPDD-PKITIVSCNPNYRNSLLFNTSLDLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEA
710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KE0 RGLTFAMLAYFITWVSFVPLLANVQVVLRPAVQMGALLLCVLGILAAFHLPRCYLLMRQP
. .:..: :: . ::. ... . :: :.. . .: .:.: .. :.::... :
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CCDS18 ERNTPAYFNSMIQGYTMRRD
820 830
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... :: . . : :::: : : : ::.:. :.:..:....:. .::. :. :
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: :.:::: : : . ....:.. : ..::.:: .. :. .
CCDS56 QEARLRNICIATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQKPN---ARVVVLFMRSDDSRELI--A
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.:: . . .::::..: ... .. . .:.. :. ..: ...: .: ..
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. .: : . .. : .. ..: :: . : .. . . : :::..:.:
CCDS56 NHRNPWFRDFWEQKFQCSLQNKRNHR-RVCDKHLAIDSSNYEQESKIMFVVNAVYAMAHA
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::. :: :.. : :. . .: .. . ...: . : ..::. :.
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.:.. . :. ::.. .: . .:.: : :. :.:.:: : .... .
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. ::. :. :: :. :...: ::. .: : :. .. : . ..
CCDS56 QPGDVCCWICIPCEP--YEYLADEFTCMDCGSGQWPTADLTGCYDLPEDYIRWEDAWAIG
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. . :.. . .. .:..: ..:::.::: : :. :. .:: :.. ..: ..::
CCDS56 PVTIACLGFMCTCMVVTVFIKHNNTPLVKASGREL-CYILLFGVGLSYCMT-FFFIAKPS
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pF1KE0 PARCLAQQPLSHLPLTGCLSTLFLQAAEIFVESELPLSWADRLSGCLRGPWAWLVVLLAM
:. : .. .. : :.:. .. : . . :.: . . .: . . . :..
CCDS56 PVICALRRLGLGSSFAICYSALLTKTNCIARIFDGVKNGAQRPK--FISPSSQVFICLGL
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pF1KE0 -LVEVALCTWYLVAFPPEVVTDWHMLPTEALV-HCRTRSWVSFGLAHATNATLAFLCFLG
::.... . .:. : . :... .: ... :. .. . .. :..:: .
CCDS56 ILVQIVMVSVWLILEAPGTRRYTLAEKRETVILKCNVKD-SSMLISLTYDVILVILCTVY
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pF1KE0 TFLVRSQPGRYNRARGLTFAMLAYFITWVSFVPLLANVQVVLRPAVQMGALLLCV----L
.: .:. : .:.:. . :.: . : :..:.:.. .. : :: .. . : .
CCDS56 AFKTRKCPENFNEAKFIGFTMYTTCIIWLAFLPIFYVTSSDYR--VQTTTMCISVSLSGF
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.:. . :. .... :: : : .. :. .: : . .:....:
CCDS56 VVLGCLFAPKVHIILFQPQKNVVTHRLHLNRFSVSGTGTTYSQSSASTYVPTVCNGREVL
820 830 840 850 860 870
CCDS56 DSTTSSL
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CCDS28 -----PVNEH---RGIQRLEAMLFALDRINRDPHLLPGVRLGAHILDSCSKDTHALEQAL
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CCDS28 SYASTSAKLSDKSRYDYFARTVPPDFFQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEA
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: : ::.::.: : . . : :. .:.. :..:..::. . :. :.
CCDS28 FELEARARNICVATSEKVGRAMSRAAFEGVVRALLQK---PSARVAVLFTRSEDARELL-
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. :.::. . .::::..: ..: : : :. :.. : . . .: .: ..
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.:.:::: . : . : :. ::. .: .. . :. : . : .::: :
CCDS28 MAHALHNMHRALCPNTTRLCDAMRPVNGRRLYKDFVLNVKFDAPFRPADTHNEVRFDRFG
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.:. :. . ::. :. :. :: :...:. :: : : ::. .... ::.
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..:: : : .. .. : :.:. .. :.:: .. : .: :.... ::
CCDS28 AKPSTAVCTLRRLGLGTAFSVCYSALLTKTNRIARIFGGAREGAQRPRFISPASQVAICL
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. :....: :: : : .: : :::: ..: :. .: .
CCDS28 ALISGQLLIVVAWLVVEAPGTGKETA-PERREVVT----------LRCNHRDASMLG-SL
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: :. : :: : .: .:. : .:.:. . :.: . : :..:.:.. .. : .
CCDS28 AYNVLLIALCTLYAFKTRKCPENFNEAKFIGFTMYTTCIIWLAFLPIFYVTSSDYRVQTT
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. . . : .:. . :. .... :: :. : .:.. . :... ..:.
CCDS28 TMCVSVSLSGSVVLGCLFAPKLHIILFQPQKNVVSHRAPTSRFGSAAARASSSLGQGSGS
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850
pF1KE0 QGKHE
:
CCDS28 QFVPTVCNGREVVDSTTSSL
860 870
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CCDS47 TFVQALIEKDASDVKCANGDPPIFTKPDKISGVIGAAASSVSIMVANILRLFKIPQISYA
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CCDS47 ISREIGGVCIAQSQKIP----REPRPGEFEKIIKRLLETPNARAVIMFANEDDIRRILEA
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.. . . :.. : . :.: . : :. .. ...: .: ::::.
CCDS47 NRRNVWFAEFWEENFGCKLGSHGKRNSHIKKCTGLERIARDSSYEQEGKVQFVIDAVYSM
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: :::: . : :: .. . .:: . ..:. .: :. :. .:.. .::
CCDS47 AYALHNMHKDLCPGYIGLCPRMSTIDGKELLGYIRAVNFNGSAGTPVTFNENGDAPGRYD
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. . .. . . .:.....:. . ..: .. .:.: :: :. :. .. :::
CCDS47 IFQYQITNKSTEYKVIGHWTNQLHLKVEDMQWAHREHTHPASVCSLPCKPGERKKTVKGV
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::. : ::. .:. :...: .: :. : : : : : ... ..
CCDS47 -PCCWHCERCEGYNYQV--DELSCELCPLDQRPNMNRTGCQLIPIIKLEWHSPWAVVPVF
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. :.. . .. ::.. :.:.:.::: :. . :. ..: :. .:. . :. :
CCDS47 VAILGIIATTFVIVTFVRYNDTPIVRASGRELS-YVLLTGIFLCYSITFLMIAAPDTIIC
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pF1KE0 LAQQPLSHLPLTGCLSTLFLQAAEIFVESELPLSWADRLSGCLRGPWAWLVVLLAML-VE
.. . : : :.: : . .. . . . . . .: . ::. .... :.
CCDS47 SFRRVF--LGLGMCFSYAALLTKTNRIHRIFEQGKKSVTAPKFISPASQLVITFSLISVQ
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pF1KE0 V-ALCTWYLVAFPPEVVTDWH----MLPTEA--LVHCRTRSWVSFGLAHATNATLAFLCF
. .. .:..: ::... :. . : .: ...: : .:. . . . : :
CCDS47 LLGVFVWFVVD-PPHIIIDYGEQRTLDPEKARGVLKCDI-SDLSLICSLGYSILLMVTCT
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pF1KE0 LGTFLVRSQPGRYNRARGLTFAMLAYFITWVSFVPLL-ANVQVVLRPAVQMGALLLCV-L
. .. .:. : .:.:. . :.: . : :..:.:.. ...: . . .: .: . . :
CCDS47 VYAIKTRGVPETFNEAKPIGFTMYTTCIIWLAFIPIFFGTAQSAEKMYIQTTTLTVSMSL
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pF1KE0 GI---LAAFHLPRCYLLMRQPGLNTPEFFLGGGPGDAQGQNDGNTGNQGKHE
. :. ...:. :... .: :
CCDS47 SASVSLGMLYMPKVYIIIFHPEQNVQKRKRSFKAVVTAATMQSKLIQKGNDRPNGEVKSE
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pF1KE0 MLGPAVLGLSLWALLHPGTGAPLCLSQQLRMKGDYVLGGLFPLGEAEEAGLRSRT
....:. :: .::::::. : :.
CCDS57 RSASCPCFFLLTAKFYWILTMMQRTHSQEYAHSIRVDGDIILGGLFPVHAKGERGV----
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 RPSSPVCTRFSSN-GLLWALAMKMAVEEINNKSDLLPGLRLGYDLFDTCSEPVVAMKPSL
: : ..... :. :: .:...::. ::: .. :: ..::::. . :.. ::
CCDS57 -P----CGELKKEKGIHRLEAMLYAIDQINKDPDLLSNITLGVRILDTCSRDTYALEQSL
70 80 90 100 110
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pF1KE0 MFLAKAGSRDIA-AYCNYTQ----YQP-RVLAVIGPHSSELAMVTGKFFSFFLMPQVSYG
:. .: . . : . .: .. .::: .: ......... .: .::.::.
CCDS57 TFVQALIEKDASDVKCANGDPPIFTKPDKISGVIGAAASSVSIMVANILRLFKIPQISYA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ASMELLSARETFPSFFRTVPSDRVQLTAAAELLQEFGWNWVAALGSDDEYGRQGLSIFSA
.. :: . : :.:: : : : .... .:::.:..:.:. .::..:. :.
CCDS57 STAPELSDNTRYDFFSRVVPPDSYQAQAMVDIVTALGWNYVSTLASEGNYGESGVEAFTQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 LA-AARGICIAHEGLVPLPRADDSRLGKVQDVLHQVNQS-SVQVVLLFASVHAAHALFNY
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CCDS57 ISREIGGVCIAQSQKIP----REPRPGEFEKIIKRLLETPNARAVIMFANEDDIRRILEA
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 SISSRLSPK-VWVASEAWLTSDLVMGLPGMAQMGTVLGFLQRGAQLHEFPQYVKTH-LAL
. . : . .:..:..: .. . :.: .: . :.. : .: ... ::
CCDS57 AKKLNQSGHFLWIGSDSWGSKIAPVYQQEEIAEGAVT-ILPKRASIDGFDRYFRSRTLAN
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 ATDPAFCSALGEREQGLEEDVVGQRCPQCD-CITLQNVSAGLNHHQTFSVY---AAVYSV
.. . . :.. : . :.: . : :. .. ...: .: ::::.
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: :::: . : :: .. . .:: . ..:. .: :. :. .:.. .::
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::. : ::. .:. :...: .: :. : : : : : ... ..
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.. . : : :.: : . .. . . . . . .: . ::. .... :.
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. .. .:. : .:.:. . :.: . : :..:.:.. ...: . . .: .: . . :
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CCDS51 TFIPKCYVIICKQEINTKSAFLKMIYSYSSHSVSSIALSPASLDSMSGNVTMTNPSSSGK
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CCDS82 KDLPENYNEAKCVTFSLLFNFVSWIAFFTTASVYDGKYLPAANMMAGLSSLSSGFGGYFL
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CCDS82 PKCYVILCRPDLNSTEHFQASIQDYTRRCGST
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CCDS82 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSP-----DFTLPGDYLLAGLFPL---HSGCLQ
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CCDS82 VRHRPEVTLCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSA-N
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. .: :. :.. : . .:.: ::::::: :.. : .:. ..: ::.:
CCDS82 VYATLRVLSLPGQHHIELQGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPMLLEQI
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CCDS82 HKVHFLLHKDTVAFNDNRDPLSSYNIIAWDWNGPKWTFTVLGSSTWSPVQLNINETKIQW
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]