FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0075, 1447 aa
1>>>pF1KE0075 1447 - 1447 aa - 1447 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3381+/-0.00108; mu= 5.9438+/- 0.065
mean_var=233.6026+/-46.568, 0's: 0 Z-trim(111.6): 33 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.083914
statistics sampled from 12489 (12507) to 12489 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.384), width: 16
Scan time: 4.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6714.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1447) 9793 1199.8 0
CCDS47995.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1446) 9327 1143.4 0
CCDS47996.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1381) 9321 1142.7 0
CCDS43851.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1296) 8768 1075.7 0
CCDS53312.1 PTCH2 gene_id:8643|Hs108|chr1 (1146) 2010 257.5 1.6e-67
CCDS516.1 PTCH2 gene_id:8643|Hs108|chr1 (1203) 2010 257.5 1.7e-67
>>CCDS6714.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1447 aa)
initn: 9793 init1: 9793 opt: 9793 Z-score: 6416.4 bits: 1199.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9793; 100.0% identity (100.0% similar) in 1447 aa overlap (1-1447:1-1447)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MASAGNAAEPQDRGGGGSGCIGAPGRPAGGGRRRRTGGLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MASAGNAAEPQDRGGGGSGCIGAPGRPAGGGRRRRTGGLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAAF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ALEQISKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQKNCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 ALEQISKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQKNCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAAN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 SALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDSWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDSWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 DPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 QTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 QTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 SFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 SFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 VAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGEC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 YRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNTRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 YRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNTRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 TVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTLSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 TVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTLSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 HCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 HCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 VPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQHLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQHLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 PKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 PKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDIS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 QLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 QLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 LRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE0 YIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIVMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 YIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIVMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE0 VPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVLALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVLALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLML
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE0 AGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSFFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 AGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSFFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE0 PPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 PPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE0 NPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGRQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 NPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGRQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRR
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE0 DAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAMGSSVPGYCQPITTVTASASVTVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAMGSSVPGYCQPITTVTASASVTVA
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE0 VHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFHVRCERRDSKVEVIELQDVECEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFHVRCERRDSKVEVIELQDVECEER
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE0 PRGSSSN
:::::::
CCDS67 PRGSSSN
>>CCDS47995.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1446 aa)
initn: 9327 init1: 9327 opt: 9327 Z-score: 6111.5 bits: 1143.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9327; 100.0% identity (100.0% similar) in 1381 aa overlap (67-1447:66-1446)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GGLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAAFALEQISKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FCKDGGGGEEEEENGGEEKDDRGDKETRSDKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQK
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 NCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQ
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYM
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 DQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVD
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 SWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMH
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 WQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 WQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAIL
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 EAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLT
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 MLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVF
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 LLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQ
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 AAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDN
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 TRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDT
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KE0 LSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLHCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLHCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFL
700 710 720 730 740 750
760 770 780 790 800 810
pF1KE0 FLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQ
760 770 780 790 800 810
820 830 840 850 860 870
pF1KE0 HLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLPKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLPKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNG
820 830 840 850 860 870
880 890 900 910 920 930
pF1KE0 SDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAA
880 890 900 910 920 930
940 950 960 970 980 990
pF1KE0 SQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRT
940 950 960 970 980 990
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE0 ICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGII
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE0 VMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAVPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAVPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAV
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE0 LALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLAGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLAGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLS
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE0 FFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPPPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPPPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSE
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE0 ELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATENPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATENPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE0 RQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRDAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRDAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTA
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE0 MGSSVPGYCQPITTVTASASVTVAVHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGSSVPGYCQPITTVTASASVTVAVHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPF
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1420 1430 1440
pF1KE0 HVRCERRDSKVEVIELQDVECEERPRGSSSN
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HVRCERRDSKVEVIELQDVECEERPRGSSSN
1420 1430 1440
>>CCDS47996.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1381 aa)
initn: 9321 init1: 9321 opt: 9321 Z-score: 6107.9 bits: 1142.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9321; 100.0% identity (100.0% similar) in 1380 aa overlap (68-1447:2-1381)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAAFALEQISKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQKN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQKN
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 CGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQL
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 MIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMD
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 QIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 WEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHW
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340 350 360 370 380 390
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLHCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQH
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CCDS47 QANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTI
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CCDS47 CSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIV
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CCDS47 ALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLAGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPPPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQ
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CCDS43 TMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECL
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CCDS43 KRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS43 CLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS43 KMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVLALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATEN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGRQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAMGSSVPGYCQPITTVTASASVTVAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFHVRCERRDSKVEVIELQDVECEERP
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pF1KE0 RGSSSN
::::::
CCDS43 RGSSSN
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pF1KE0 APGRPAGGGRRRRTGGLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAA-FALEQISKGKATGRKAPLWLRA
::: : : :: :. ::::::::
CCDS53 MTRSPPLRELPPSYTPPARTAAPQILAGSL---KAPLWLRA
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:: :::.::: ::..::: : .::: :::.:.::. : .:::.:.::::::.:::.::.
CCDS53 YFQGLLFSLGCGIQRHCGKVLFLGLLAFGALALGLRMAIIETNLEQLWVEVGSRVSQELH
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pF1KE0 YTRQKIGEEAMFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEH
::..:.:::: .. :..::: ..:: :.:: ::: ::..:: ::.:.: .:...: :..
CCDS53 YTKEKLGEEAAYTSQMLIQTARQEGENILTPEALGLHLQAALTASKVQVSLYGKSWDLNK
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pF1KE0 LCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDP
.::::: . :.:.....:: :.::.:.:::::::::::::.:.::: :.: ..:::.::
CCDS53 ICYKSGVPLIENGMIERMIEKLFPCVILTPLDCFWEGAKLQGGSAYLPGRPDIQWTNLDP
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..:::: . ......:.:.::.::..:. ::::.: : :: .:::..: . ..:
CCDS53 EQLLEELGPFA-SLEGFRELLDKAQVGQAYVGRPCLHPDDLHCPPSAPNHHSRQAPNVAH
220 230 240 250 260 270
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:.:::::.:.:.:::::::..:: ... :.:. :.:::. : ::.:.:.::::.: .:
CCDS53 ELSGGCHGFSHKFMHWQEELLLGGMARDPQGELLRAEALQSTFLLMSPRQLYEHFRG-DY
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pF1KE0 VSH-INWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVI
.: :.:.:..:...:.:::: .:....... .:..:.. .:..:::::::..::.::.
CCDS53 QTHDIGWSEEQASTVLQAWQRRFVQLAQEALPENASQQIHAFSSTTLDDILHAFSEVSAA
340 350 360 370 380 390
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::..::::::::::.:::::::..:::.:::::::::::.::.:::::.:.::.::::::
CCDS53 RVVGGYLLMLAYACVTMLRWDCAQSQGSVGLAGVLLVALAVASGLGLCALLGITFNAATT
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:::::::::.::::::::::::.:. . :...: ::::.:::.::.::::.:..::.
CCDS53 QVLPFLALGIGVDDVFLLAHAFTEALPG--TPLQERMGECLQRTGTSVVLTSINNMAAFL
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::::.:::::::::::::.:: .:. :.:.::::::.:: ::. .:::..:::.::: .
CCDS53 MAALVPIPALRAFSLQAAIVVGCTFVAVMLVFPAILSLDLRRRHCQRLDVLCCFSSPCSA
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pF1KE0 RVIQVEPQAYTDTHDNTRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAE
.:::. :: . :.: : . .:: : .::: :. . .. :
CCDS53 QVIQILPQ---ELGDGTV-----PVG---IAHLT-----ATVQAFTHCEASSQHVVTILP
580 590 600 610
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:.... : .: :. . .::::::.: .. . : ::..:.:. ::.
CCDS53 PQAHLVPPP----SDPLGSELFSPGGSTRDLLGQEEETRQKAACKSLPCARWNLAHFARY
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pF1KE0 HYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYF
..::.::. .::..:. :: .:::.::::.: :.::: :::.::: :.:. :..::..::
CCDS53 QFAPLLLQSHAKAIVLVLFGALLGLSLYGATLVQDGLALTDVVPRGTKEHAFLSAQLRYF
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:.:.. .::: . :: . :. :.:::. ::..: :. : :. ::::.:.::::.:
CCDS53 SLYEVALVTQGGFDYAHSQRALFDLHQRFSSLKAVLPPPATQAPRTWLHYYRNWLQGIQA
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