Result of FASTA (omim) for
pF1KE0066
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0066, 893 aa
1>>>pF1KE0066 893 - 893 aa - 893 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0609+/-0.000434; mu= 9.9885+/- 0.027
mean_var=174.4352+/-35.491, 0's: 0 Z-trim(117.6): 353 B-trim: 920 in 2/53
Lambda= 0.097108
statistics sampled from 29425 (29793) to 29425 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.349), width: 16
Scan time: 13.400
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065779 (OMIM: 616691) extended synaptotagmin-2 ( 893) 5918 842.0 0
NP_056107 (OMIM: 616670) extended synaptotagmin-1 (1104) 2031 297.5 2.4e-79
NP_001171725 (OMIM: 616670) extended synaptotagmin (1114) 2017 295.5 9.2e-79
NP_001309763 (OMIM: 616692) extended synaptotagmin ( 874) 1766 260.3 2.9e-68
NP_114119 (OMIM: 616692) extended synaptotagmin-3 ( 886) 1766 260.3 3e-68
NP_001309760 (OMIM: 616692) extended synaptotagmin ( 886) 1766 260.3 3e-68
XP_016862796 (OMIM: 616692) PREDICTED: extended sy ( 753) 1438 214.3 1.8e-54
NP_001129976 (OMIM: 600104,616040) synaptotagmin-2 ( 419) 266 49.9 3e-05
NP_796376 (OMIM: 600104,616040) synaptotagmin-2 [H ( 419) 266 49.9 3e-05
XP_016855802 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 419) 266 49.9 3e-05
XP_016855800 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 422) 266 49.9 3e-05
XP_011507494 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 422) 266 49.9 3e-05
XP_016855801 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 422) 266 49.9 3e-05
XP_016855799 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 476) 266 50.0 3.3e-05
XP_016855798 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 479) 266 50.0 3.3e-05
XP_016879267 (OMIM: 604567) PREDICTED: double C2-l ( 282) 258 48.7 4.8e-05
NP_001268992 (OMIM: 604567) double C2-like domain- ( 400) 258 48.8 6.3e-05
NP_003577 (OMIM: 604567) double C2-like domain-con ( 400) 258 48.8 6.3e-05
XP_016879266 (OMIM: 604567) PREDICTED: double C2-l ( 400) 258 48.8 6.3e-05
XP_016879265 (OMIM: 604567) PREDICTED: double C2-l ( 400) 258 48.8 6.3e-05
NP_001268991 (OMIM: 604567) double C2-like domain- ( 400) 258 48.8 6.3e-05
NP_001268997 (OMIM: 604567) double C2-like domain- ( 400) 258 48.8 6.3e-05
XP_011544277 (OMIM: 604567) PREDICTED: double C2-l ( 400) 258 48.8 6.3e-05
XP_016867496 (OMIM: 604918,608027) PREDICTED: prot (2561) 270 51.0 8.4e-05
NP_001278830 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 419) 252 48.0 0.00012
XP_006719639 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 419) 252 48.0 0.00012
XP_005269170 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 419) 252 48.0 0.00012
XP_016875398 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 422) 252 48.0 0.00012
NP_001129277 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 422) 252 48.0 0.00012
NP_005630 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isoform 1 ( 422) 252 48.0 0.00012
NP_001129278 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 422) 252 48.0 0.00012
XP_011537012 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 422) 252 48.0 0.00012
XP_006723404 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 383) 251 47.8 0.00012
XP_006723402 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 251 47.8 0.00012
NP_003171 (OMIM: 600782) synaptotagmin-5 isoform 1 ( 386) 251 47.8 0.00012
XP_016882664 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 251 47.8 0.00012
XP_016882665 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 251 47.8 0.00012
XP_011533665 (OMIM: 604568) PREDICTED: double C2-l ( 387) 243 46.7 0.00026
XP_011518209 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagm ( 349) 242 46.5 0.00027
XP_011518208 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagm ( 351) 242 46.5 0.00027
NP_003576 (OMIM: 604568) double C2-like domain-con ( 412) 243 46.7 0.00028
NP_001284703 (OMIM: 600782) synaptotagmin-5 isofor ( 382) 240 46.2 0.00035
XP_006723403 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 385) 240 46.2 0.00035
XP_016873429 (OMIM: 612880) PREDICTED: synaptotagm ( 429) 238 46.0 0.00047
XP_016873428 (OMIM: 612880) PREDICTED: synaptotagm ( 445) 238 46.0 0.00048
XP_016856964 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1070) 244 47.1 0.00053
NP_542775 (OMIM: 300723) synaptotagmin-like protei ( 671) 240 46.4 0.00054
NP_001123368 (OMIM: 300723) synaptotagmin-like pro ( 671) 240 46.4 0.00054
XP_011529370 (OMIM: 300723) PREDICTED: synaptotagm ( 671) 240 46.4 0.00054
XP_016885460 (OMIM: 300723) PREDICTED: synaptotagm ( 671) 240 46.4 0.00054
>>NP_065779 (OMIM: 616691) extended synaptotagmin-2 [Hom (893 aa)
initn: 5918 init1: 5918 opt: 5918 Z-score: 4490.0 bits: 842.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5918; 100.0% identity (100.0% similar) in 893 aa overlap (1-893:1-893)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTPPSRAEAGVRRSRVPSEGRWRGAEPPGISASTQPASAGRAARHCGAMSGARGEGPEAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MTPPSRAEAGVRRSRVPSEGRWRGAEPPGISASTQPASAGRAARHCGAMSGARGEGPEAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 AGGAGGRAAPENPGGVLSVELPGLLAQLARSFALLLPVYALGYLGLSFSWVLLALALLAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AGGAGGRAAPENPGGVLSVELPGLLAQLARSFALLLPVYALGYLGLSFSWVLLALALLAW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 CRRSRGLKALRLCRALALLEDEERVVRLGVRACDLPAWVHFPDTERAEWLNKTVKHMWPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 CRRSRGLKALRLCRALALLEDEERVVRLGVRACDLPAWVHFPDTERAEWLNKTVKHMWPF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ICQFIEKLFRETIEPAVRGANTHLSTFSFTKVDVGQQPLRINGVKVYTENVDKRQIILDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ICQFIEKLFRETIEPAVRGANTHLSTFSFTKVDVGQQPLRINGVKVYTENVDKRQIILDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QISFVGNCEIDLEIKRYFCRAGVKSIQIHGTMRVILEPLIGDMPLVGALSIFFLRKPLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QISFVGNCEIDLEIKRYFCRAGVKSIQIHGTMRVILEPLIGDMPLVGALSIFFLRKPLLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 INWTGLTNLLDVPGLNGLSDTIILDIISNYLVLPNRITVPLVSEVQIAQLRFPVPKGVLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 INWTGLTNLLDVPGLNGLSDTIILDIISNYLVLPNRITVPLVSEVQIAQLRFPVPKGVLR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 IHFIEAQDLQGKDTYLKGLVKGKSDPYGIIRVGNQIFQSRVIKENLSPKWNEVYEALVYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IHFIEAQDLQGKDTYLKGLVKGKSDPYGIIRVGNQIFQSRVIKENLSPKWNEVYEALVYE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 HPGQELEIELFDEDPDKDDFLGSLMIDLIEVEKERLLDEWFTLDEVPKGKLHLRLEWLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 HPGQELEIELFDEDPDKDDFLGSLMIDLIEVEKERLLDEWFTLDEVPKGKLHLRLEWLTL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 MPNASNLDKVLTDIKADKDQANDGLSSALLILYLDSARNLPSGKKISSNPNPVVQMSVGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MPNASNLDKVLTDIKADKDQANDGLSSALLILYLDSARNLPSGKKISSNPNPVVQMSVGH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 KAQESKIRYKTNEPVWEENFTFFIHNPKRQDLEVEVRDEQHQCSLGNLKVPLSQLLTSED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KAQESKIRYKTNEPVWEENFTFFIHNPKRQDLEVEVRDEQHQCSLGNLKVPLSQLLTSED
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 MTVSQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVLHLEKRERPPDHQHSAQVKRPSVSKEGRKTSIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MTVSQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVLHLEKRERPPDHQHSAQVKRPSVSKEGRKTSIKS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 HMSGSPGPGGSNTAPSTPVIGGSDKPGMEEKAQPPEAGPQGLHDLGRSSSSLLASPGHIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 HMSGSPGPGGSNTAPSTPVIGGSDKPGMEEKAQPPEAGPQGLHDLGRSSSSLLASPGHIS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 VKEPTPSIASDISLPIATQELRQRLRQLENGTTLGQSPLGQIQLTIRHSSQRNKLIVVVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VKEPTPSIASDISLPIATQELRQRLRQLENGTTLGQSPLGQIQLTIRHSSQRNKLIVVVH
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 ACRNLIAFSEDGSDPYVRMYLLPDKRRSGRRKTHVSKKTLNPVFDQSFDFSVSLPEVQRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ACRNLIAFSEDGSDPYVRMYLLPDKRRSGRRKTHVSKKTLNPVFDQSFDFSVSLPEVQRR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KE0 TLDVAVKNSGGFLSKDKGLLGKVLVALASEELAKGWTQWYDLTEDGTRPQAMT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TLDVAVKNSGGFLSKDKGLLGKVLVALASEELAKGWTQWYDLTEDGTRPQAMT
850 860 870 880 890
>>NP_056107 (OMIM: 616670) extended synaptotagmin-1 isof (1104 aa)
initn: 1809 init1: 709 opt: 2031 Z-score: 1545.6 bits: 297.5 E(85289): 2.4e-79
Smith-Waterman score: 2034; 48.1% identity (76.2% similar) in 655 aa overlap (28-678:5-634)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTPPSRAEAGVRRSRVPSEGRWRGAEPPGISASTQPASAGRAARHCGAMSGARGEGPEAG
:: . : .: . : . : :. :
NP_056 MERSPGEGPSPSPMDQPSAPSDPTDQPPAAHAKPDPG
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE0 AGGAGGRAAPENPGGVLSVELPGLLAQLARSFALLLPVYALGYLGLSFSWVLLALAL-LA
.:: : .::. . : ..:....: . .:.::: : .::: ..::..::: :.
NP_056 SGGQ-----PAGPGA--AGEALAVLTSFGRRLLVLIPVYLAGAVGLSVGFVLFGLALYLG
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 WCRRSRGLKALRLCRALALLEDEERVV--RLGVRACDLPAWVHFPDTERAEWLNKTVKHM
: :: : : : : ::.:::... : . .::::: :::.:.:::::: : ..
NP_056 W-RRVRDEKERSLRAARQLLDDEEQLTAKTLYMSHRELPAWVSFPDVEKAEWLNKIVAQV
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 WPFICQFIEKLFRETIEPAVRGANTHLSTFSFTKVDVGQQPLRINGVKVYTENVDKRQII
:::. :..:::. ::. :::::.: ::.::.::.:..:..:::: ::::. . :.::.
NP_056 WPFLGQYMEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRIIGVKVHP-GQRKEQIL
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LDLQISFVGNCEIDLEIKRYFCRAGVKSIQIHGTMRVILEPLIGDMPLVGALSIFFLRKP
:::.::.::. .::.:.:.:::.::::..:.::..::::::::::.:.:::.:.::.:.:
NP_056 LDLNISYVGDVQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPFVGAVSMFFIRRP
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LLEINWTGLTNLLDVPGLNGLSDTIILDIISNYLVLPNRITVPLVSEVQ-IAQLRFPVPK
:.:::::.:::::.:::..::::.:.: :. .::::::. :::: ..: .:::: :.:.
NP_056 TLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLQDVAQLRSPLPR
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 GVLRIHFIEAQDLQGKDTYLKGLVKGKSDPYGIIRVGNQIFQSRVIKENLSPKWNEVYEA
:..:::.. :. :..:: :.:::..::::::...:.:.: : :::: :.:.:.:.:.::.
NP_056 GIIRIHLLAARGLSSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRLGTQTFCSRVIDEELNPQWGETYEV
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LVYEHPGQELEIELFDEDPDKDDFLGSLMIDLIEVEKERLLDEWFTLDEVPKGKLHLRLE
.:.: ::::.:.:.::.::::::::: . .:. .: . .::.:: : . .:..:::::
NP_056 MVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMKLDVGKVLQASVLDDWFPL-QGGQGQVHLRLE
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 WLTLMPNASNLDKVLTDIKADKDQANDGLSSALLILYLDSARNLPSGKKISSNPNPVVQM
::.:. .: .:..:: . . .. : :.:.:..::: :..:: :: ...:::.::.
NP_056 WLSLLSDAEKLEQVL-QWNWGVSSRPDPPSAAILVVYLDRAQDLPL-KKGNKEPNPMVQL
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 SVGHKAQESKIRYKTNEPVWEENFTFFIHNPKRQDLEVEVRDEQHQCSLGNLKVPLSQLL
:. .:::: :.:: ::::: : ::...:. :.:.:.:.:... .:: : .::..::
NP_056 SIQDVTQESKAVYSTNCPVWEEAFRFFLQDPQSQELDVQVKDDSRALTLGALTLPLARLL
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 TSEDMTVSQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVLHLEKRERPPDHQHSAQVKRPSVSKEGRKT
:. .. ..: ::::.::::: . ::...:.:.:. :... :.:
NP_056 TAPELILDQWFQLSSSGPNSRLYMKLVMRILYLD----------SSEICFPTVPGCPGAW
570 580 590 600 610
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 SIKSHMSGSPGPGGSNTAPSTPVIGGSDKPGMEEKAQPPEAGPQGLHDLGRSSSSLLASP
.. :. .: :.: :: :
NP_056 DVDSE---NPQRGSSVDAPPRPCHTTPDSQFGTEHVLRIHVLEAQDLIAKDRFLGGLVKG
620 630 640 650 660 670
>--
initn: 1163 init1: 559 opt: 770 Z-score: 590.9 bits: 120.8 E(85289): 3.6e-26
Smith-Waterman score: 1071; 36.9% identity (65.3% similar) in 528 aa overlap (358-885:648-1098)
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 SNYLVLPNRITVPLVSEVQIAQLRFPVPKGVLRIHFIEAQDLQGKDTYLKGLVKGKSDPY
::::: .::::: .:: .: ::::::::::
NP_056 DSENPQRGSSVDAPPRPCHTTPDSQFGTEHVLRIHVLEAQDLIAKDRFLGGLVKGKSDPY
620 630 640 650 660 670
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 GIIRVGNQIFQSRVIKENLSPKWNEVYEALVYEHPGQELEIELFDEDPDKDDFLGSLMID
...... :.:.:..:.:.:.::::.:..: ::::::.:.::.: ::::::: .
NP_056 VKLKLAGRSFRSHVVREDLNPRWNEVFEVIVTSVPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVR
680 690 700 710 720 730
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 LIEVEKERLLDEWFTLDEVPKGKLHLRLEWLTLMPNASNLDKVLTDIKADKDQANDGLSS
: : . .::::.::..::.:.:::::: :: :.:..:..:: . . : . :..
NP_056 LTTVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNSLIQTQKSAELAA
740 750 760 770 780 790
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 ALLILYLDSARNLPSGKKISSNPNPVVQMSVGHKAQESKIRYKTNEPVWEENFTFFIHNP
::: .:.. :..:: .: ... .: . ..:: .....: .:. :::.:. .:.:..:
NP_056 ALLSIYMERAEDLPL-RKGTKHLSPYATLTVGDSSHKTKTISQTSAPVWDESASFLIRKP
800 810 820 830 840 850
570 580 590 600 610 620
pF1KE0 KRQDLEVEVRDEQHQCSLGNLKVPLSQLLTSEDMTVSQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVL
. ..::..:: : ::.:..:::.::..... ... : :: :: .... .. : .:
NP_056 HTESLELQVRGEGTGV-LGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLS-SGQGQVL-LRAQLGIL
860 870 880 890 900 910
630 640 650 660 670 680
pF1KE0 HLEKRERPPDHQHSAQVKRPSVSKEGRKTSIKSHMSGSPGPGGSNTAPSTPVIGGSDKPG
. .. :.:: . . :.:.: : ..:.
NP_056 -VSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEE-------------------------PELSGG----
920 930 940
690 700 710 720 730 740
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:: ::. . : :::::: .
NP_056 ------PP----------------------HITSSAP---------------ELRQRLTH
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750 760 770 780 790 800
pF1KE0 LENGTTLGQSPLGQIQLTIRHSSQRNKLIVVVHACRNLIAFSEDGSDPYVRMYLLPDKRR
... .::::..::. . :.. ::. .::.::.: ..: :::: . ::::: :
NP_056 VDSPLEAPAGPLGQVKLTLWYYSEERKLVSIVHGCRSLRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNR
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pF1KE0 SGRRKTHVSKKTLNPVFDQSFDFSVSLPEVQRRTLDVAVKNSGGFLSKDKGLLGKVLVAL
. .:.: .:.::.: :.. :.. . : :.::: :::.::....:.:... ::::: . :
NP_056 GTKRRTSQKKRTLSPEFNERFEWELPLDEAQRRKLDVSVKSNSSFMSRERELLGKVQLDL
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870 880 890
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: .:..: ..:::: ..
NP_056 AETDLSQGVARWYDLMDNKDKGSS
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.:: : .::. . : ..:....: . .:.::: : .::: ..::..::: :.
NP_001 SGGQ-----PAGPGA--AGEALAVLTSFGRRLLVLIPVYLAGAVGLSVGFVLFGLALYLG
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: :: : : : : ::.:::... : . .::::: :::.:.:::::: : ..
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:::. :..:::. ::. :::::.: ::.::.::.:..:..:::: ::::. . :.::.
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:::.::.::. .::.:.:.:::.::::..:.::..::::::::::.:.:::.:.::.:.:
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:.:::::.:::::.:::..::::.:.: :. .::::::. :::: ..: .:::: :.:.
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:..:::.. :. :..:: :.:::..::::::...:.:.: : :::: :.:.:.:.:.::.
NP_001 GIIRIHLLAARGLSSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRLGTQTFCSRVIDEELNPQWGETYEV
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.:.: ::::.:.:.::.::::::::: . .:. .: . .::.:: : . .:..:::::
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::.:. .: .:..:: . . .. : :.:.:..::: :..:: . :: .
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pF1KE0 SNPNPVVQMSVGHKAQESKIRYKTNEPVWEENFTFFIHNPKRQDLEVEVRDEQHQCSLGN
..:::.::.:. .:::: :.:: ::::: : ::...:. :.:.:.:.:... .::
NP_001 KEPNPMVQLSIQDVTQESKAVYSTNCPVWEEAFRFFLQDPQSQELDVQVKDDSRALTLGA
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: .::..:::. .. ..: ::::.::::: . ::...:.:.:. :... :
NP_001 LTLPLARLLTAPELILDQWFQLSSSGPNSRLYMKLVMRILYLD----------SSEICFP
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pF1KE0 SVSKEGRKTSIKSHMSGSPGPGGSNTAPSTPVIGGSDKPGMEEKAQPPEAGPQGLHDLGR
.: .. :. .: :.: :: :
NP_001 TVPGCPGAWDVDSE---NPQRGSSVDAPPRPCHTTPDSQFGTEHVLRIHVLEAQDLIAKD
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pF1KE0 SSSSLLASPGHISVKEPTPSIASDISLPIATQELRQRLRQLENGTTLGQSPLGQIQLTIR
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>--
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NP_001 DSENPQRGSSVDAPPRPCHTTPDSQFGTEHVLRIHVLEAQDLIAKDRFLGGLVKGKSDPY
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pF1KE0 GIIRVGNQIFQSRVIKENLSPKWNEVYEALVYEHPGQELEIELFDEDPDKDDFLGSLMID
...... :.:.:..:.:.:.::::.:..: ::::::.:.::.: ::::::: .
NP_001 VKLKLAGRSFRSHVVREDLNPRWNEVFEVIVTSVPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVR
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: : . .::::.::..::.:.:::::: :: :.:..:..:: . . : . :..
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. ..::..:: : ::.:..:::.::..... ... : :: :: .... .. : .:
NP_001 HTESLELQVRGEGTGV-LGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLS-SGQGQVL-LRAQLGIL
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pF1KE0 HLEKRERPPDHQHSAQVKRPSVSKEGRKTSIKSHMSGSPGPGGSNTAPSTPVIGGSDKPG
. .. :.:: . . :.:.: : ..:.
NP_001 -VSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEE-------------------------PELSGG----
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690 700 710 720 730 740
pF1KE0 MEEKAQPPEAGPQGLHDLGRSSSSLLASPGHISVKEPTPSIASDISLPIATQELRQRLRQ
:: ::. . : :::::: .
NP_001 ------PP----------------------HITSSAP---------------ELRQRLTH
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pF1KE0 LENGTTLGQSPLGQIQLTIRHSSQRNKLIVVVHACRNLIAFSEDGSDPYVRMYLLPDKRR
... .::::..::. . :.. ::. .::.::.: ..: :::: . ::::: :
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pF1KE0 SGRRKTHVSKKTLNPVFDQSFDFSVSLPEVQRRTLDVAVKNSGGFLSKDKGLLGKVLVAL
. .:.: .:.::.: :.. :.. . : :.::: :::.::....:.:... ::::: . :
NP_001 GTKRRTSQKKRTLSPEFNERFEWELPLDEAQRRKLDVSVKSNSSFMSRERELLGKVQLDL
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870 880 890
pF1KE0 ASEELAKGWTQWYDLTEDGTRPQAMT
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NP_001 AETDLSQGVARWYDLMDNKDKGSS
1100 1110
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NP_001 QLLPELCTFVVRVLFYLGPVYLAGYLGLSITWLLLGALLWMWWRRNRRGKLGRLAAAFEF
30 40 50 60 70 80
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. :: ::.:::. ::. :.::::..:.. ..:.. .:::: ..:.:::..:...
NP_001 EKSIHLRTFTFTKLYFGQKCPRVNGVKAHTNTCNRRRVTVDLQICYIGDCEISVELQKI-
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pF1KE0 CRAGVKSIQIHGTMRVILEPLIGDMPLVGALSIFFLRKPLLEINWTGLTNLLDVPGLNGL
.:::..::..::.:::::::. : :.:::...:::.:: :.:::::::::::.::.: .
NP_001 -QAGVNGIQLQGTLRVILEPLLVDKPFVGAVTVFFLQKPHLQINWTGLTNLLDAPGINDV
210 220 230 240 250 260
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::... :.:...::::::.:::. . .....::::.: ::.:.:..::..: ::..: :
NP_001 SDSLLEDLIATHLVLPNRVTVPVKKGLDLTNLRFPLPCGVIRVHLLEAEQLAQKDNFL-G
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: .::::::. . .: : :.::.: .::.: ::::.: .::: :::.::..:.::: :.:
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::::::.: : .: .:..::::.:... .:.::::::::.:. . ..:::.
NP_001 DFLGSLQICLGDVMTNRVVDEWFVLNDTTSGRLHLRLEWLSLLTD----QEVLTE-----
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pF1KE0 DQANDGLSSALLILYLDSARNLP-------SGK------------KISSNPNPVVQMSVG
:.. :::.:.:...:.:: ::: .:. :.:..:. :..:::
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.:.. :: ....::: . :.::.:: . :...: :....:.:: :.::: :.:
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:.:. :::::..:: .: :.:...:: :..:.:: . .:. : . : .:
NP_001 DLTLEQRFQLDHSGLDSLISMRLVLRFLQVEERELGSPYTGPEALKKGPLLIKKVATNQG
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:.. . . . : :... .:. .: . . .: .: . : ... .
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. .:...: .:. :: : .: : .::..: :: .
NP_001 FCEPIGEKKSPATIFLTVPGPHSPGPIKSPRPMKCPASPFAWPPKRLAPSMSSLNSLASS
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NP_001 CFDLADISLNIEGGD-LRRRQLGEIQLTVRYVCLRRCLSVLINGCRNLTPCTSSGADPYV
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NP_001 KELGKVLIDLSKEDLIKGFSQ
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NP_114 MRAEEPCAPGAPSALG--AQRTPGPELRLSS
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NP_114 QLLPELCTFVVRVLFYLGPVYLAGYLGLSITWLLLGALLWMWWRRNRRGKLGRLAAAFEF
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pF1KE0 LEDEERVVRLGVRACDLPAWVHFPDTERAEWLNKTVKHMWPFICQFIEKLFRETIEPAVR
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NP_114 LDNEREFISRELRGQHLPAWIHFPDVERVEWANKIISQTWPYLSMIMESKFREKLEPKIR
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pF1KE0 GANTHLSTFSFTKVDVGQQPLRINGVKVYTENVDKRQIILDLQISFVGNCEIDLEIKRYF
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NP_114 EKSIHLRTFTFTKLYFGQKCPRVNGVKAHTNTCNRRRVTVDLQICYIGDCEISVELQKI-
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pF1KE0 CRAGVKSIQIHGTMRVILEPLIGDMPLVGALSIFFLRKPLLEINWTGLTNLLDVPGLNGL
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NP_114 -QAGVNGIQLQGTLRVILEPLLVDKPFVGAVTVFFLQKPHLQINWTGLTNLLDAPGINDV
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pF1KE0 SDTIILDIISNYLVLPNRITVPLVSEVQIAQLRFPVPKGVLRIHFIEAQDLQGKDTYLKG
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NP_114 SDSLLEDLIATHLVLPNRVTVPVKKGLDLTNLRFPLPCGVIRVHLLEAEQLAQKDNFL-G
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NP_114 L-RGKSDPYAKVSIGLQHFRSRTIYRNLNPTWNEVFEFMVYEVPGQDLEVDLYDEDTDRD
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NP_114 DFLGSLQICLGDVMTNRVVDEWFVLNDTTSGRLHLRLEWLSLLTD----QEVLTE-----
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pF1KE0 DQANDGLSSALLILYLDSARNLP-------SGK------------KISSNPNPVVQMSVG
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NP_114 DHG--GLSTAILVVFLESACNLPRNPFDYLNGEYRAKKLSRFARNKVSKDPSSYVKLSVG
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NP_114 KKTHTSKTCPHNKDPVWSQVFSFFVHNVATERLHLKVLDDDQECALGMLEVPLCQILPYA
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pF1KE0 DMTVSQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVLHLEKRERPPDHQHSAQVKR-PSVSK-----EG
:.:. :::::..:: .: :.:...:: :..:.:: . .:. : . : .:
NP_114 DLTLEQRFQLDHSGLDSLISMRLVLRFLQVEERELGSPYTGPEALKKGPLLIKKVATNQG
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:.. . . . : :... .:. .: . . .: .: . : ... .
NP_114 PKAQPQEEGPTDLPCPPDPASDTKDVSRSTTTTTSATTVATEPTSQETGPEPKGKDSAKR
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710 720 730
pF1KE0 GLHDLGRSSSS---LLASPGHIS---VKEP-----------------TPSIASDISLPIA
. .:...: .:. :: : .: : .::..: :: .
NP_114 FCEPIGEKKSPATIFLTVPGPHSPGPIKSPRPMKCPASPFAWPPKRLAPSMSSLNSLASS
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.: . ..:.: : . ::.::::.:. : : :....:::: . .:.::::
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:.::::... . :.:: :..:::.:.::..:.: : . ::..:.:::::::: . :. .
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:::::. :..:.: ::..:::
NP_114 KELGKVLIDLSKEDLIKGFSQWYELTPNGQPRS
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:.: : : :: .: : : ..:: : .
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:..:.. . .:. ::::.::::.::.:: :: ... ::.. ...:. ::: .:: .:
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. :: ::.:::. ::. :.::::..:.. ..:.. .:::: ..:.:::..:...
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.:::..::..::.:::::::. : :.:::...:::.:: :.:::::::::::.::.: .
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::... :.:...::::::.:::. . .....::::.: ::.:.:..::..: ::..: :
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: .::::::. . .: : :.::.: .::.: ::::.: .::: :::.::..:.::: :.:
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::::::.: : .: .:..::::.:... .:.::::::::.:. . ..:::.
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:.. :::.:.:...:.:: ::: .:. :.:..:. :..:::
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.:.. :: ....::: . :.::.:: . :...: :....:.:: :.::: :.:
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pF1KE0 DMTVSQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVLHLEKRERPPDHQHSAQVKR-PSVSK-----EG
:.:. :::::..:: .: :.:...:: :..:.:: . .:. : . : .:
NP_001 DLTLEQRFQLDHSGLDSLISMRLVLRFLQVEERELGSPYTGPEALKKGPLLIKKVATNQG
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:.. . . . : :... .:. .: . . .: .: . : ... .
NP_001 PKAQPQEEGPTDLPCPPDPASDTKDVSRSTTTTTSATTVATEPTSQETGPEPKGKDSAKR
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pF1KE0 GLHDLGRSSSS---LLASPGHIS---VKEP-----------------TPSIASDISLPIA
. .:...: .:. :: : .: : .::..: :: .
NP_001 FCEPIGEKKSPATIFLTVPGPHSPGPIKSPRPMKCPASPFAWPPKRLAPSMSSLNSLASS
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NP_001 CFDLADISLNIEGGD-LRRRQLGEIQLTVRYVCLRRCLSVLINGCRNLTPCTSSGADPYV
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NP_001 KELGKVLIDLSKEDLIKGFSQWYELTPNGQPRS
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: :... .:. .: . . .: .: . : ... . . .: .: ....
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::: :. .: .::..: :: . .: . ..:.:
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:..:::.:.::..:.: : . ::..:.:::::::: . :. . :::::. :..:.:
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::..:
XP_016 KGFSQWYELTPNGQPRS
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pF1KE0 KGWTQWYDLTEDGTRPQAMT
.: :. . :: :
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: .....:. : .: : . :.:..:
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NP_796 EPEKLGDICTSLRYVPTAGKLTVCILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKT
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pF1KE0 KGWTQWYDLTEDGTRPQAMT
.: :. . :: :
NP_796 TELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPEEEVDALLGKNK
390 400 410
>>XP_016855802 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: synaptot (419 aa)
initn: 167 init1: 167 opt: 266 Z-score: 215.2 bits: 49.9 E(85289): 3e-05
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XP_016 TFTFKVPYQELGGKTLVMAIYDFDRFSKHDIIGEVKVPMNTVDLGQPIEEWRDLQGGEKE
210 220 230 240 250 260
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pF1KE0 GQSPLGQIQLTIRHSSQRNKLIVVVHACRNLIAFSEDG-SDPYVRMYLLPDKRRSGRRKT
::.: ..:. .:: : . .:: .. : :::::...:. . .: ..::
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XP_016 TVKKKTLNPYFNESFSFEIPFEQIQKVQVVVTVLDYDK-LGKNEAI-GKIFV--GSNATG
330 340 350 360 370 380
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pF1KE0 KGWTQWYDLTEDGTRPQAMT
.: :. . :: :
XP_016 TELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPEEEVDALLGKNK
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893 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:11:58 2016 done: Fri Nov 4 05:12:00 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]