Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0060
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0060, 575 aa
1>>>pF1KE0060 575 - 575 aa - 575 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5752+/-0.00101; mu= 3.7622+/- 0.060
mean_var=162.8664+/-33.248, 0's: 0 Z-trim(109.4): 22 B-trim: 121 in 1/49
Lambda= 0.100498
statistics sampled from 10824 (10833) to 10824 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.333), width: 16
Scan time: 3.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43726.1 EBF2 gene_id:64641|Hs108|chr8 ( 575) 3852 570.8 1.6e-162
CCDS31314.1 EBF3 gene_id:253738|Hs108|chr10 ( 551) 2997 446.8 3.2e-125
CCDS4343.1 EBF1 gene_id:1879|Hs108|chr5 ( 591) 2912 434.5 1.7e-121
CCDS46573.1 EBF4 gene_id:57593|Hs108|chr20 ( 598) 2681 401.0 2.1e-111
CCDS78081.1 EBF1 gene_id:1879|Hs108|chr5 ( 560) 2125 320.4 3.7e-87
>>CCDS43726.1 EBF2 gene_id:64641|Hs108|chr8 (575 aa)
initn: 3852 init1: 3852 opt: 3852 Z-score: 3031.3 bits: 570.8 E(32554): 1.6e-162
Smith-Waterman score: 3852; 100.0% identity (100.0% similar) in 575 aa overlap (1-575:1-575)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFGIQDTLGRGPTLKEKSLGAEMDSVRSWVRNVGVVDANVAAQSGVALSRAHFEKQPPSN
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CCDS43 MFGIQDTLGRGPTLKEKSLGAEMDSVRSWVRNVGVVDANVAAQSGVALSRAHFEKQPPSN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVDFVENDKEQGNEKTNNGTHYKLQLLYSNGVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVDFVENDKEQGNEKTNNGTHYKLQLLYSNGVR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 TEQDLYVRLIDSVTKQPIAYEGQNKNPEMCRVLLTHEVMCSRCCEKKSCGNRNETPSDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TEQDLYVRLIDSVTKQPIAYEGQNKNPEMCRVLLTHEVMCSRCCEKKSCGNRNETPSDPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IIDRFFLKFFLKCNQNCLKTAGNPRDMRRFQVVLSTTVNVDGHVLAVSDNMFVHNNSKHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IIDRFFLKFFLKCNQNCLKTAGNPRDMRRFQVVLSTTVNVDGHVLAVSDNMFVHNNSKHG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RRARRLDPSEATPCIKAISPSEGWTTGGAMVIIIGDNFFDGLQVVFGTMLVWSELITPHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RRARRLDPSEATPCIKAISPSEGWTTGGAMVIIIGDNFFDGLQVVFGTMLVWSELITPHA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 IRVQTPPRHIPGVVEVTLSYKSKQFCKGAPGRFIYTALNEPTIDYGFQRLQKVIPRHPGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IRVQTPPRHIPGVVEVTLSYKSKQFCKGAPGRFIYTALNEPTIDYGFQRLQKVIPRHPGD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 PERLAKEMLLKRAADLVEALYGTPHNNQDIILKRAADIAEALYSVPRNPSQLPALSSSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PERLAKEMLLKRAADLVEALYGTPHNNQDIILKRAADIAEALYSVPRNPSQLPALSSSPA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 HSGMMGINSYGSQLGVSISESTQGNNQGYIRNTSSISPRGYSSSSTPQQSNYSTSSNSMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HSGMMGINSYGSQLGVSISESTQGNNQGYIRNTSSISPRGYSSSSTPQQSNYSTSSNSMN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 GYSNVPMANLGVPGSPGFLNGSPTGSPYGIMSSSPTVGSSSTSSILPFSSSVFPAVKQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GYSNVPMANLGVPGSPGFLNGSPTGSPYGIMSSSPTVGSSSTSSILPFSSSVFPAVKQKS
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KE0 AFAPVIRPQGSPSPACSSGNGNGFRAMTGLVVPPM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AFAPVIRPQGSPSPACSSGNGNGFRAMTGLVVPPM
550 560 570
>>CCDS31314.1 EBF3 gene_id:253738|Hs108|chr10 (551 aa)
initn: 3072 init1: 2642 opt: 2997 Z-score: 2361.6 bits: 446.8 E(32554): 3.2e-125
Smith-Waterman score: 3158; 81.1% identity (91.7% similar) in 577 aa overlap (1-575:1-551)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFGIQDTLGRG-PTLKEKSLGAEMDSVRSWVRNVGVVDANVAAQSGVALSRAHFEKQPPS
:::::... :: :.::. ::. :. ::::....::::::.::::::.:.::::::::::
CCDS31 MFGIQENIPRGGTTMKEEPLGSGMNPVRSWMHTAGVVDANTAAQSGVGLARAHFEKQPPS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NLRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVDFVENDKEQGNEKTNNGTHYKLQLLYSNGV
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CCDS31 NLRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVDFVEKEKEPNNEKTNNGIHYKLQLLYSNGV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RTEQDLYVRLIDSVTKQPIAYEGQNKNPEMCRVLLTHEVMCSRCCEKKSCGNRNETPSDP
:::::::::::::.::: :.::::.:::::::::::::.::::::.::::::::::::::
CCDS31 RTEQDLYVRLIDSMTKQAIVYEGQDKNPEMCRVLLTHEIMCSRCCDKKSCGNRNETPSDP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VIIDRFFLKFFLKCNQNCLKTAGNPRDMRRFQVVLSTTVNVDGHVLAVSDNMFVHNNSKH
::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VIIDRFFLKFFLKCNQNCLKNAGNPRDMRRFQVVVSTTVNVDGHVLAVSDNMFVHNNSKH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GRRARRLDPSEATPCIKAISPSEGWTTGGAMVIIIGDNFFDGLQVVFGTMLVWSELITPH
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CCDS31 GRRARRLDPSEATPCIKAISPSEGWTTGGATVIIIGDNFFDGLQVVFGTMLVWSELITPH
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 AIRVQTPPRHIPGVVEVTLSYKSKQFCKGAPGRFIYTALNEPTIDYGFQRLQKVIPRHPG
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CCDS31 AIRVQTPPRHIPGVVEVTLSYKSKQFCKGAPGRFVYTALNEPTIDYGFQRLQKVIPRHPG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 DPERLAKEMLLKRAADLVEALYGTPHNNQDIILKRAADIAEALYSVPRNPSQLPALSSSP
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CCDS31 DPERLPKEVLLKRAADLVEALYGMPHNNQEIILKRAADIAEALYSVPRNHNQIPTLGNNP
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 AHSGMMGINSYGSQLGVSISESTQGNNQ-GYIRNTSSISPRGYSSSSTPQQSNYSTSSNS
::.::::.::..:::.:..::..:.:.: :: :::::.::::: :::::::::.: :.:
CCDS31 AHTGMMGVNSFSSQLAVNVSETSQANDQVGYSRNTSSVSPRGYVPSSTPQQSNYNTVSTS
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 MNGYSNVPMANLGVPGSPGFLNGSPTGSPYGIMSSSPTVGSSSTSSILPFSSSVFPAVKQ
::::.. ::.::::::::::::: ..::::. ::
CCDS31 MNGYGSGAMASLGVPGSPGFLNGSSANSPYGM--------------------------KQ
490 500 510
540 550 560 570
pF1KE0 KSAFAPVIRPQGSPSPACSSGNGNGFRAMTGLVVPPM
:::::::.:::.:: :.:.:.::::..::.:::::::
CCDS31 KSAFAPVVRPQASPPPSCTSANGNGLQAMSGLVVPPM
520 530 540 550
>>CCDS4343.1 EBF1 gene_id:1879|Hs108|chr5 (591 aa)
initn: 1798 init1: 1445 opt: 2912 Z-score: 2294.5 bits: 434.5 E(32554): 1.7e-121
Smith-Waterman score: 3111; 76.9% identity (92.1% similar) in 593 aa overlap (1-575:1-591)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFGIQDTLGR-GPTLKEKSLGAEMDSVRSWVRNVGVVDANVAAQSGVALSRAHFEKQPPS
:::::... : : ..::. ::. :..::.:....::.:::.::::::.:.::::::::::
CCDS43 MFGIQESIQRSGSSMKEEPLGSGMNAVRTWMQGAGVLDANTAAQSGVGLARAHFEKQPPS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NLRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVDFVENDKEQGNEKTNNGTHYKLQLLYSNGV
:::::::::::::::::::::::::::::: :::..:: ..:::::: ::.::::::::.
CCDS43 NLRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVGFVEKEKEANSEKTNNGIHYRLQLLYSNGI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RTEQDLYVRLIDSVTKQPIAYEGQNKNPEMCRVLLTHEVMCSRCCEKKSCGNRNETPSDP
:::::.:::::::.::: :.::::.:::::::::::::.::::::.::::::::::::::
CCDS43 RTEQDFYVRLIDSMTKQAIVYEGQDKNPEMCRVLLTHEIMCSRCCDKKSCGNRNETPSDP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VIIDRFFLKFFLKCNQNCLKTAGNPRDMRRFQVVLSTTVNVDGHVLAVSDNMFVHNNSKH
::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VIIDRFFLKFFLKCNQNCLKNAGNPRDMRRFQVVVSTTVNVDGHVLAVSDNMFVHNNSKH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GRRARRLDPSE--------ATPCIKAISPSEGWTTGGAMVIIIGDNFFDGLQVVFGTMLV
::::::::::: ::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::
CCDS43 GRRARRLDPSEGTPSYLEHATPCIKAISPSEGWTTGGATVIIIGDNFFDGLQVIFGTMLV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 WSELITPHAIRVQTPPRHIPGVVEVTLSYKSKQFCKGAPGRFIYTALNEPTIDYGFQRLQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS43 WSELITPHAIRVQTPPRHIPGVVEVTLSYKSKQFCKGTPGRFIYTALNEPTIDYGFQRLQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 KVIPRHPGDPERLAKEMLLKRAADLVEALYGTPHNNQDIILKRAADIAEALYSVPRNPSQ
::::::::::::: ::..::::::::::::: :::::.::::::::::::::::::: .:
CCDS43 KVIPRHPGDPERLPKEVILKRAADLVEALYGMPHNNQEIILKRAADIAEALYSVPRNHNQ
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LPALSSSPAHSGMMGINSYGSQLGVSISESTQGNNQGYIRNTSSISPRGYSSSSTPQQSN
::::... .:.::::.::...::.:..::..:..:::. ::.::.::.:: :.::::.:
CCDS43 LPALANTSVHAGMMGVNSFSGQLAVNVSEASQATNQGFTRNSSSVSPHGYVPSTTPQQTN
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KE0 YSTSSNSMNGYSNVPMANLGVPGSPGFLNGSPTGSPYGIMSSSPTVGSS--------STS
:.. ..:::::... :.::: ::: ::::: ..:::.:. ::::..:: :.:
CCDS43 YNSVTTSMNGYGSAAMSNLG--GSPTFLNGSAANSPYAIVPSSPTMASSTSLPSNCSSSS
490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KE0 SILPFS-SSVFPAVKQKSAFAPVIRPQGSPSPACSSGNGNGFRAMTGLVVPPM
.:. :: ... :::::::::::.::: :: :.:.: :::...:..:..::::
CCDS43 GIFSFSPANMVSAVKQKSAFAPVVRPQTSPPPTCTSTNGNSLQAISGMIVPPM
540 550 560 570 580 590
>>CCDS46573.1 EBF4 gene_id:57593|Hs108|chr20 (598 aa)
initn: 1730 init1: 1389 opt: 2681 Z-score: 2113.5 bits: 401.0 E(32554): 2.1e-111
Smith-Waterman score: 2787; 71.7% identity (88.7% similar) in 573 aa overlap (6-564:2-574)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFGIQDTLGR-GPTLKEKSL-GAEMDSVRSWVRNVGVVDANVAAQSGVALSRAHFEKQPP
:.: : : .:::. : : . :::::....:..::..::::::.:.:::::::::
CCDS46 MDALPRSGLNLKEEPLLPAGLGSVRSWMQGAGILDASTAAQSGVGLARAHFEKQPP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 SNLRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVDFVENDKEQGNEKTNNGTHYKLQLLYSNG
::::::::::::::.:::::::::.:::::.::::.:.: : :::::: ::.:.:.:.::
CCDS46 SNLRKSNFFHFVLAMYDRQGQPVEVERTAFIDFVEKDREPGAEKTNNGIHYRLRLVYNNG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VRTEQDLYVRLIDSVTKQPIAYEGQNKNPEMCRVLLTHEVMCSRCCEKKSCGNRNETPSD
.:::::::::::::..:: : ::::.:::::::::::::.::::::..::::::::::::
CCDS46 LRTEQDLYVRLIDSMSKQAIIYEGQDKNPEMCRVLLTHEIMCSRCCDRKSCGNRNETPSD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PVIIDRFFLKFFLKCNQNCLKTAGNPRDMRRFQVVLSTTVNVDGHVLAVSDNMFVHNNSK
:::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::
CCDS46 PVIIDRFFLKFFLKCNQNCLKNAGNPRDMRRFQVVVSTTVSVDGHVLAVSDNMFVHNNSK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HGRRARRLDPSEA-TPCIKAISPSEGWTTGGAMVIIIGDNFFDGLQVVFGTMLVWSELIT
::::::::::::: :::::::::.:::::::: ::.::::::::::::::..::::::::
CCDS46 HGRRARRLDPSEAATPCIKAISPGEGWTTGGATVIVIGDNFFDGLQVVFGNVLVWSELIT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PHAIRVQTPPRHIPGVVEVTLSYKSKQFCKGAPGRFIYTALNEPTIDYGFQRLQKVIPRH
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS46 PHAIRVQTPPRHIPGVVEVTLSYKSKQFCKGCPGRFVYTALNEPTIDYGFQRLQKVIPRH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 PGDPERLAKEMLLKRAADLVEALYGTPHNNQDIILKRAADIAEALYSVPRNPSQLPALSS
::::::: ::.::::::::.:::::.: .::...::::::.::::::.:: :. : :.
CCDS46 PGDPERLPKEVLLKRAADLAEALYGVPGSNQELLLKRAADVAEALYSTPRAPGPLAPLAP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 SPAHSGMMGINSYGSQLGVSISESTQGNNQGYIRNTSSISPRGYSSSSTPQQSNYSTS-S
: : ...:::...: :.......: : . :: :. :: ::::.. : :::.:. . .
CCDS46 SHPHPAVVGINAFSSPLAIAVGDATPGPEPGYARSCSSASPRGFAPSPGSQQSGYGGGLG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KE0 NSMNGYSNVPMANLGVPGSPGFLNGSPTGSPYGIMSSSPTVGSSS---------TSSILP
...::. .:.:::::::.::::: . ::..:: ::: ....: :.:..
CCDS46 AGLGGYGAPGVAGLGVPGSPSFLNGSTATSPFAIMPSSPPLAAASSMSLPAAAPTTSVFS
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KE0 FSS-SVFPAVKQKSAFAPVIRPQGSPSPACSSGNGNGFRAMTGLVVPPM
:: ... ::::.::::::.:: .:: :: ..:.:.
CCDS46 FSPVNMISAVKQRSAFAPVLRPPSSPPQACPRAHGEGLPDQSFEDSDKFHSPARGLQGLA
540 550 560 570 580 590
CCDS46 YS
>>CCDS78081.1 EBF1 gene_id:1879|Hs108|chr5 (560 aa)
initn: 2051 init1: 1814 opt: 2125 Z-score: 1678.2 bits: 320.4 E(32554): 3.7e-87
Smith-Waterman score: 2915; 74.2% identity (89.4% similar) in 585 aa overlap (1-575:1-560)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFGIQDTLGR-GPTLKEKSLGAEMDSVRSWVRNVGVVDANVAAQSGVALSRAHFEKQPPS
:::::... : : ..::. ::. :..::.:....::.:::.::::::.:.::::::::::
CCDS78 MFGIQESIQRSGSSMKEEPLGSGMNAVRTWMQGAGVLDANTAAQSGVGLARAHFEKQPPS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NLRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVDFVENDKEQGNEKTNNGTHYKLQLLYSNGV
:::::::::::::::::::::::::::::: :::..:: ..:::::: ::.::::::::.
CCDS78 NLRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVGFVEKEKEANSEKTNNGIHYRLQLLYSNGI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RTEQDLYVRLIDSVTKQPIAYEGQNKNPEMCRVLLTHEVMCSRCCEKKSCGNRNETPSDP
:::::.:::::::.::: :.::::.:::::::::::::.::
CCDS78 RTEQDFYVRLIDSMTKQAIVYEGQDKNPEMCRVLLTHEIMC-------------------
130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VIIDRFFLKFFLKCNQNCLKTAGNPRDMRRFQVVLSTTVNVDGHVLAVSDNMFVHNNSKH
::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ----RFFLKFFLKCNQNCLKNAGNPRDMRRFQVVVSTTVNVDGHVLAVSDNMFVHNNSKH
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GRRARRLDPSEATPCIKAISPSEGWTTGGAMVIIIGDNFFDGLQVVFGTMLVWSELITPH
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS78 GRRARRLDPSEATPCIKAISPSEGWTTGGATVIIIGDNFFDGLQVIFGTMLVWSELITPH
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 AIRVQTPPRHIPGVVEVTLSYKSKQFCKGAPGRFIYTALNEPTIDYGFQRLQKVIPRHPG
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AIRVQTPPRHIPGVVEVTLSYKSKQFCKGTPGRFIYTALNEPTIDYGFQRLQKVIPRHPG
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 DPERLAKEMLLKRAADLVEALYGTPHNNQDIILKRAADIAEALYSVPRNPSQLPALSSSP
::::: ::..::::::::::::: :::::.::::::::::::::::::: .:::::...
CCDS78 DPERLPKEVILKRAADLVEALYGMPHNNQEIILKRAADIAEALYSVPRNHNQLPALANTS
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 AHSGMMGINSYGSQLGVSISESTQGNNQGYIRNTSSISPRGYSSSSTPQQSNYSTSSNSM
.:.::::.::...::.:..::..:..:::. ::.::.::.:: :.::::.::.. ..::
CCDS78 VHAGMMGVNSFSGQLAVNVSEASQATNQGFTRNSSSVSPHGYVPSTTPQQTNYNSVTTSM
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 NGYSNVPMANLGVPGSPGFLNGSPTGSPYGIMSSSPTVGSS--------STSSILPFS-S
:::... :.::: ::: ::::: ..:::.:. ::::..:: :.:.:. :: .
CCDS78 NGYGSAAMSNLG--GSPTFLNGSAANSPYAIVPSSPTMASSTSLPSNCSSSSGIFSFSPA
460 470 480 490 500 510
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