Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0058
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0058, 759 aa
1>>>pF1KE0058 759 - 759 aa - 759 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.4610+/-0.00129; mu= -13.8636+/- 0.078
mean_var=599.7963+/-123.443, 0's: 0 Z-trim(114.6): 55 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.052369
statistics sampled from 15145 (15193) to 15145 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.755), E-opt: 0.2 (0.467), width: 16
Scan time: 5.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2221.2 FIGN gene_id:55137|Hs108|chr2 ( 759) 5095 400.3 5.9e-111
CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 ( 674) 1303 113.8 9.4e-25
CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 584) 869 80.9 6.3e-15
CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 616) 807 76.3 1.7e-13
>>CCDS2221.2 FIGN gene_id:55137|Hs108|chr2 (759 aa)
initn: 5095 init1: 5095 opt: 5095 Z-score: 2105.5 bits: 400.3 E(32554): 5.9e-111
Smith-Waterman score: 5095; 100.0% identity (100.0% similar) in 759 aa overlap (1-759:1-759)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MISSTSVYGLKMQWTPEHAQWPEQHFDITSTTRSPAHKVEAYRGHLQRTYQYAWANDDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MISSTSVYGLKMQWTPEHAQWPEQHFDITSTTRSPAHKVEAYRGHLQRTYQYAWANDDIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ALTASNLLKKYAEKYSGILEGPVDRPVLSNYSDTPSGLVNGRKNESEPWQPSLNSEAVYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 ALTASNLLKKYAEKYSGILEGPVDRPVLSNYSDTPSGLVNGRKNESEPWQPSLNSEAVYP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 MNCVPDVITASKAGVSSALPPADVSASIGSSPGVASNLTEPSYSSSTCGSHTVPSLHAGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MNCVPDVITASKAGVSSALPPADVSASIGSSPGVASNLTEPSYSSSTCGSHTVPSLHAGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PSQEYAPGYNGSYLHSTYSSQPAPALPSPHPSPLHSSGLLQPPPPPPPPPALVPGYNGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 PSQEYAPGYNGSYLHSTYSSQPAPALPSPHPSPLHSSGLLQPPPPPPPPPALVPGYNGTS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NLSSYSYPSASYPPQTAVGSGYSPGGAPPPPSAYLPSGIPAPTPLPPTTVPGYTYQGHGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 NLSSYSYPSASYPPQTAVGSGYSPGGAPPPPSAYLPSGIPAPTPLPPTTVPGYTYQGHGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TPIAPSALTNSSASSLKRKAFYMAGQGDMDSSYGNYSYGQQRSTQSPMYRMPDNSISNTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 TPIAPSALTNSSASSLKRKAFYMAGQGDMDSSYGNYSYGQQRSTQSPMYRMPDNSISNTN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 RGNGFDRSAETSSLAFKPTKQLMSSEQQRKFSSQSSRALTPPSYSTAKNSLGSRSSESFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 RGNGFDRSAETSSLAFKPTKQLMSSEQQRKFSSQSSRALTPPSYSTAKNSLGSRSSESFG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 KYTSPVMSEHGDEHRQLLSHPMQGPGLRAATSSNHSVDEQLKNTDTHLIDLVTNEIITQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 KYTSPVMSEHGDEHRQLLSHPMQGPGLRAATSSNHSVDEQLKNTDTHLIDLVTNEIITQG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 PPVDWNDIAGLDLVKAVIKEEVLWPVLRSDAFSGLTALPRSILLFGPRGTGKTLLGRCIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 PPVDWNDIAGLDLVKAVIKEEVLWPVLRSDAFSGLTALPRSILLFGPRGTGKTLLGRCIA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 SQLGATFFKIAGSGLVAKWLGEAEKIIHASFLVARCRQPSVIFVSDIDMLLSSQVNEEHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SQLGATFFKIAGSGLVAKWLGEAEKIIHASFLVARCRQPSVIFVSDIDMLLSSQVNEEHS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 PVSRMRTEFLMQLDTVLTSAEDQIVVICATSKPEEIDESLRRYFMKRLLIPLPDSTARHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 PVSRMRTEFLMQLDTVLTSAEDQIVVICATSKPEEIDESLRRYFMKRLLIPLPDSTARHQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 IIVQLLSQHNYCLNDKEFALLVQRTEGFSGLDVAHLCQEAVVGPLHAMPATDLSAIMPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 IIVQLLSQHNYCLNDKEFALLVQRTEGFSGLDVAHLCQEAVVGPLHAMPATDLSAIMPSQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE0 LRPVTYQDFENAFCKIQPSISQKELDMYVEWNKMFGCSQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LRPVTYQDFENAFCKIQPSISQKELDMYVEWNKMFGCSQ
730 740 750
>>CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 (674 aa)
initn: 1481 init1: 1183 opt: 1303 Z-score: 557.8 bits: 113.8 E(32554): 9.4e-25
Smith-Waterman score: 1498; 38.0% identity (66.4% similar) in 744 aa overlap (19-759:12-674)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MISSTSVYGLKMQWTPEHAQWPEQHFDITS-TTRSPAHKVEAYRGHLQRTYQYAWANDDI
..: ...: ::: .: :..:::... : ::::::..:
CCDS55 MQTSSSRSVHLSEWQKNYFAITSGICTGP--KADAYRAQILRI-QYAWANSEI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 SALTASNLLKKYAEKYSGILEGPVDRPVLSNYSDTPSGLVNGRKNESEPWQPSLNSEAVY
: . :..:.::::::::.:... . :.::... :.......:. :: .:. . :.
CCDS55 SQVCATKLFKKYAEKYSAIIDSDNVESGLNNYAENILTLAGSQQTDSDKWQSGLSINNVF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PMNCVPDVITASKAGVSSALPPADVSASIGSSPGVASNLTEPSYSSSTCGSHTVPSLHAG
:. : .. :.: .: : :: .:. : . :. . :..: .:::
CCDS55 KMSSVQKMMQAGKKFKDSLLEPALASVVIHKE---ATVFDLPKFS--VCGS---------
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LPSQEYAPGYNGSYLHSTYSSQPAPALPSPHPSPLHSSGLLQPPPPPPPPPALVPGYNGT
::: :.. :. .: :. . :. ::: :: .: .
CCDS55 --SQESDSLPNSA--HDRDRTQDF-----PESNRLK---LLQNAQPP-----MVTN----
160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SNLSSYSYPSASYPPQTAVGSGYSPGGAPPPPSAYLPSGIPAPTPLPPTTVPGYTYQGHG
.. . :. : : :: . . : : ... . : . .
CCDS55 ---TARTCPTFSAP----VGESATAKFHVTP----LFGNVKKENHSSAKENIGLNVFLSN
200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LTPIAPSALTNSSASSLKRKAFYMAGQGDMDSSYGNYSYGQQRSTQSPMYRMPDNSISNT
. . :.: : .::.:: :.: .:. ..:. :. .
CCDS55 QSCF-PAACENP-----QRKSFY--GSGTIDA------------LSNPIL----NKACSK
250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 NRGNGFDRSAETSSL-AFKPTKQLMSSEQQRKFSSQSSRALTPPSYSTAKNSLG-SRSSE
.. :: : ::: .:: .:. . .::.:. : .:: . ::. .:.::: :::
CCDS55 TEDNG---PKEDSSLPTFKTAKEQLWVDQQKKYH-QPQRA-SGSSYGGVKKSLGASRSRG
290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 SFGKYTSPVMSEHGDEHRQLLSHPMQGPGLRAATSSNHSVDEQLKNTDTHLIDLVTNEII
.::.. :. .. : :. .. : : : : :::.::: . ..:.:. :::.
CCDS55 ILGKFVPPIPKQDGGEQNGGMQCKPYGAG---PTEPAHPVDERLKNLEPKMIELIMNEIM
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 TQGPPVDWNDIAGLDLVKAVIKEEVLWPVLRSDAFSGLTALPRSILLFGPRGTGKTLLGR
.::::.:.::::....::.::: :.::.:: : :.:: . :..:::::: ::::::.:.
CCDS55 DHGPPVNWEDIAGVEFAKATIKEIVVWPMLRPDIFTGLRGPPKGILLFGPPGTGKTLIGK
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 CIASQLGATFFKIAGSGLVAKWLGEAEKIIHASFLVARCRQPSVIFVSDIDMLLSSQVNE
::::: :::::.:..:.:..::.::.::...: : ::::.::.:::...:: :::.. .
CCDS55 CIASQSGATFFSISASSLTSKWVGEGEKMVRALFAVARCQQPAVIFIDEIDSLLSQRGDG
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 EHSPVSRMRTEFLMQLDTVLTSAEDQIVVICATSKPEEIDESLRRYFMKRLLIPLPDSTA
:: :..::::.::: . ::.::.:.:. ::..:.::::. :: ..::: ::::...:
CCDS55 EHESSRRIKTEFLVQLDGATTSSEDRILVVGATNRPQEIDEAARRRLVKRLYIPLPEASA
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 RHQIIVQLLSQHNYCLNDKEFALLVQRTEGFSGLDVAHLCQEAVVGPLHAMPATDLSAIM
:.::...:.:... ::...:. .::....::: :...::.:: .::.... ..:...:
CCDS55 RKQIVINLMSKEQCCLSEEEIEQIVQQSDAFSGADMTQLCREASLGPIRSLQTADIATIT
580 590 600 610 620 630
720 730 740 750
pF1KE0 PSQLRPVTYQDFENAFCKIQPSISQKELDMYVEWNKMFGCSQ
:.:.::..: :::::: ..::.: :.:..: .::: :::..
CCDS55 PDQVRPIAYIDFENAFRTVRPSVSPKDLELYENWNKTFGCGK
640 650 660 670
>>CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 (584 aa)
initn: 907 init1: 805 opt: 869 Z-score: 381.4 bits: 80.9 E(32554): 6.3e-15
Smith-Waterman score: 870; 29.2% identity (62.4% similar) in 590 aa overlap (186-756:3-580)
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 SNLTEPSYSSSTCGSHTVPSLHAGLPSQEYAPGYNGSYLHSTYSSQPAPALPSPHPSPLH
.:: :. : .:.:.: : : : :
CCDS17 MNSPGGRGKKKGSGGASNPVP--PRPPPPCLA
10 20 30
220 230 240 250 260
pF1KE0 SSGLLQPPPPPPPPPAL-------VPGYNGTSNLSSYSYPSA-------SYPPQTAVGSG
. : ::: : : . : . : .. . . .. ...
CCDS17 PAPPAAGPAPPPESPHKRNLYYFSYPLFVGFALLRLVAFHLGLLFVWLCQRFSRALMAAK
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 YSPGGAPPPPSAYLPSGIPAPTPLPPTTVPGYTYQGHGLTPIAPSALTNSSASSLKRKA-
: :.:: : :: :. .:. : . :. :: . .:.. :..:
CCDS17 RSSGAAPAPASASAPAPVPGGE---AERVRVFHKQAFEYISIALRIDEDEKAGQ-KEQAV
100 110 120 130 140
330 340 350 360 370
pF1KE0 -FYMAGQGDMDSSYGNYSYGQQRSTQSPMYRMPDNSISNTNRGNGFDRSAETSSLAFK--
.: : ..... . :: .. . :. . ..: .. . :.... .
CCDS17 EWYKKGIEELEKGIAVIVTGQGEQCERA-RRLQAKMMTNLVMAKDRLQLLESGAVPKRKD
150 160 170 180 190 200
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 PTKQLMSSEQQRKFSSQSSRA-LTPPSYSTAKNSLGSRSSESFGKYTSPVMSEHGDEHRQ
: . .: . : ... : :. . . ..:. :. . :. .:. ...: . .
CCDS17 PLTHTSNSLPRSKTVMKTGSAGLSGHHRAPSYSGLSMVSGVKQGSGPAPT-THKGTPKTN
210 220 230 240 250 260
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 LLSHPMQGPGLRAATSSNHSVDEQLKNTDTHLIDLVTNEIITQGPPVDWNDIAGLDLVKA
..: . : .:: ..... ....:.:..: .:. :::. .: : ..:::: ::.:
CCDS17 RTNKP-STP--TTATRKKKDL-KNFRNVDSNLANLIMNEIVDNGTAVKFDDIAGQDLAKQ
270 280 290 300 310 320
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 VIKEEVLWPVLRSDAFSGLTALPRSILLFGPRGTGKTLLGRCIASQLGATFFKIAGSGLV
...: :. : :: . :.:: : :..::::: :.:::.:.. .:.. .::::.:....:.
CCDS17 ALQEIVILPSLRPELFTGLRAPARGLLLFGPPGNGKTMLAKAVAAESNATFFNISAASLT
330 340 350 360 370 380
560 570 580 590 600 610
pF1KE0 AKWLGEAEKIIHASFLVARCRQPSVIFVSDIDMLLSSQVNEEHSPVSRMRTEFLMQLDTV
.:..::.::...: : ::: :::.::....: :: . . ::. :..::::...: :
CCDS17 SKYVGEGEKLVRALFAVARELQPSIIFIDEVDSLLCERREGEHDASRRLKTEFLIEFDGV
390 400 410 420 430 440
620 630 640 650 660 670
pF1KE0 LTSAEDQIVVICATSKPEEIDESLRRYFMKRLLIPLPDSTARHQIIVQLLSQHNYCLNDK
....:...:. ::..:.:.::.. : :.::. . ::. .: .. .:: ... :..:
CCDS17 QSAGDDRVLVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLLKNLLCKQGSPLTQK
450 460 470 480 490 500
680 690 700 710 720 730
pF1KE0 EFALLVQRTEGFSGLDVAHLCQEAVVGPLHAMPATDLSAIMPSQLRPVTYQDFENAFCKI
:.: :.. :.:.:: :.. : ..:..::.. . ... . :..: . .:: ... ::
CCDS17 ELAQLARMTDGYSGSDLTALAKDAALGPIRELKPEQVKNMSASEMRNIRLSDFTESLKKI
510 520 530 540 550 560
740 750
pF1KE0 QPSISQKELDMYVEWNKMFGCSQ
. :.: . :. :..::: ::
CCDS17 KRSVSPQTLEAYIRWNKDFGDTTV
570 580
>>CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 (616 aa)
initn: 907 init1: 805 opt: 807 Z-score: 355.8 bits: 76.3 E(32554): 1.7e-13
Smith-Waterman score: 836; 27.9% identity (60.1% similar) in 616 aa overlap (186-756:3-612)
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 SNLTEPSYSSSTCGSHTVPSLHAGLPSQEYAPGYNGSYLHSTYSSQPAPALPSPHPSPLH
.:: :. : .:.:.: : : : :
CCDS17 MNSPGGRGKKKGSGGASNPVP--PRPPPPCLA
10 20 30
220 230 240 250 260
pF1KE0 SSGLLQPPPPPPPPPAL-------VPGYNGTSNLSSYSYPSA-------SYPPQTAVGSG
. : ::: : : . : . : .. . . .. ...
CCDS17 PAPPAAGPAPPPESPHKRNLYYFSYPLFVGFALLRLVAFHLGLLFVWLCQRFSRALMAAK
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 YSPGGAPPPPSAYLPSGIPAPTPLPPTTVPGYTYQGHGLTPIAPSALTNSSASSLKRKA-
: :.:: : :: :. .:. : . :. :: . .:.. :..:
CCDS17 RSSGAAPAPASASAPAPVPGGE---AERVRVFHKQAFEYISIALRIDEDEKAGQ-KEQAV
100 110 120 130 140
330 340 350 360 370
pF1KE0 -FYMAGQGDMDSSYGNYSYGQQRSTQSP---MYRMPDNSISNTNRGNGFDRS------AE
.: : ..... . :: .. . . .: : . .: . ... ..
CCDS17 EWYKKGIEELEKGIAVIVTGQGEQCERARRLQAKMMTNLVMAKDRLQLLEKMQPVLPFSK
150 160 170 180 190 200
380 390 400 410 420
pF1KE0 TSSLAFKPTKQL------MSSEQQRKFSSQSSRALTPPSYSTAKNSLGSRSSESFGKYTS
... ... . .: ..::. . .. . : : .:. . . :. :.. .
CCDS17 SQTDVYNDSTNLACRNGHLQSESGAVPKRKDPLTHTSNSLPRSKTVMKTGSAGLSGHHRA
210 220 230 240 250 260
430 440 450 460 470
pF1KE0 PVMS--------EHGD-----EHRQLLSHPMQGPGLRAATSSNHSVD-EQLKNTDTHLID
: .: ..:. :. . . .:.. .. : ....:.:..: .
CCDS17 PSYSGLSMVSGVKQGSGPAPTTHKGTPKTNRTNKPSTPTTATRKKKDLKNFRNVDSNLAN
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 LVTNEIITQGPPVDWNDIAGLDLVKAVIKEEVLWPVLRSDAFSGLTALPRSILLFGPRGT
:. :::. .: : ..:::: ::.: ...: :. : :: . :.:: : :..::::: :.
CCDS17 LIMNEIVDNGTAVKFDDIAGQDLAKQALQEIVILPSLRPELFTGLRAPARGLLLFGPPGN
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 GKTLLGRCIASQLGATFFKIAGSGLVAKWLGEAEKIIHASFLVARCRQPSVIFVSDIDML
:::.:.. .:.. .::::.:....:..:..::.::...: : ::: :::.::....: :
CCDS17 GKTMLAKAVAAESNATFFNISAASLTSKYVGEGEKLVRALFAVARELQPSIIFIDEVDSL
390 400 410 420 430 440
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 LSSQVNEEHSPVSRMRTEFLMQLDTVLTSAEDQIVVICATSKPEEIDESLRRYFMKRLLI
: . . ::. :..::::...: : ....:...:. ::..:.:.::.. : :.::. .
CCDS17 LCERREGEHDASRRLKTEFLIEFDGVQSAGDDRVLVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYV
450 460 470 480 490 500
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 PLPDSTARHQIIVQLLSQHNYCLNDKEFALLVQRTEGFSGLDVAHLCQEAVVGPLHAMPA
::. .: .. .:: ... :..::.: :.. :.:.:: :.. : ..:..::.. .
CCDS17 SLPNEETRLLLLKNLLCKQGSPLTQKELAQLARMTDGYSGSDLTALAKDAALGPIRELKP
510 520 530 540 550 560
720 730 740 750
pF1KE0 TDLSAIMPSQLRPVTYQDFENAFCKIQPSISQKELDMYVEWNKMFGCSQ
... . :..: . .:: ... ::. :.: . :. :..::: ::
CCDS17 EQVKNMSASEMRNIRLSDFTESLKKIKRSVSPQTLEAYIRWNKDFGDTTV
570 580 590 600 610
759 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:44:27 2016 done: Fri Nov 4 05:44:28 2016
Total Scan time: 5.000 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]