Result of FASTA (omim) for
pF1KE0053
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0053, 1568 aa
1>>>pF1KE0053 1568 - 1568 aa - 1568 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2315+/-0.000394; mu= 19.5789+/- 0.025
mean_var=90.0119+/-18.342, 0's: 0 Z-trim(113.9): 133 B-trim: 36 in 1/51
Lambda= 0.135184
statistics sampled from 23257 (23397) to 23257 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16
Scan time: 17.040
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005752 (OMIM: 604259) plexin-C1 precursor [Homo (1568) 10446 2048.4 0
XP_016874161 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1315) 8738 1715.3 0
XP_016874160 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1323) 8639 1696.0 0
XP_011536032 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1322) 8632 1694.6 0
XP_006719249 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1555) 6930 1362.7 0
XP_011536033 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1036) 6926 1361.8 0
NP_055918 (OMIM: 604282) plexin-D1 precursor [Homo (1925) 1567 316.8 1.1e-84
XP_011510894 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i ( 981) 1561 315.5 1.4e-84
XP_011510891 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i (1795) 1561 315.6 2.3e-84
XP_011510890 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i (1894) 1543 312.1 2.8e-83
XP_016884192 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1126 230.8 8.1e-59
NP_036533 (OMIM: 604293) plexin-B2 precursor [Homo (1838) 1126 230.8 8.1e-59
XP_005261968 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1126 230.8 8.1e-59
XP_006724476 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1126 230.8 8.1e-59
XP_016884193 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1126 230.8 8.1e-59
XP_005261967 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1126 230.8 8.1e-59
XP_005261966 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1126 230.8 8.1e-59
XP_011528984 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1901) 1126 230.8 8.4e-59
NP_115618 (OMIM: 601055) plexin-A1 precursor [Homo (1896) 739 155.3 4.4e-36
XP_011511210 (OMIM: 601055) PREDICTED: plexin-A1 i (1914) 739 155.3 4.4e-36
XP_011511211 (OMIM: 601055) PREDICTED: plexin-A1 i (1914) 739 155.3 4.4e-36
NP_079455 (OMIM: 601054) plexin-A2 precursor [Homo (1894) 733 154.2 9.9e-36
XP_016868268 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1827) 729 153.4 1.6e-35
XP_005250743 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1894) 729 153.4 1.7e-35
XP_006716234 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1894) 729 153.4 1.7e-35
NP_065962 (OMIM: 604280) plexin-A4 isoform 1 precu (1894) 729 153.4 1.7e-35
XP_005273222 (OMIM: 601054) PREDICTED: plexin-A2 i (1823) 711 149.9 1.9e-34
XP_011529485 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1684) 709 149.5 2.3e-34
XP_005274763 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1789) 709 149.5 2.4e-34
XP_006724892 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1841) 709 149.5 2.5e-34
XP_005274762 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1853) 709 149.5 2.5e-34
NP_059984 (OMIM: 300022) plexin-A3 precursor [Homo (1871) 709 149.5 2.5e-34
NP_001123554 (OMIM: 601053) plexin-B1 precursor [H (2135) 696 147.0 1.6e-33
XP_016862120 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2135) 696 147.0 1.6e-33
NP_002664 (OMIM: 601053) plexin-B1 precursor [Homo (2135) 696 147.0 1.6e-33
XP_011532137 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 696 147.0 1.6e-33
XP_016862119 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 696 147.0 1.6e-33
XP_011532136 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 696 147.0 1.6e-33
XP_011532135 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 696 147.0 1.6e-33
XP_011532138 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 696 147.0 1.6e-33
XP_011532139 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 696 147.0 1.6e-33
XP_005273221 (OMIM: 601054) PREDICTED: plexin-A2 i (1974) 672 142.3 3.9e-32
NP_005384 (OMIM: 300214) plexin-B3 isoform 1 precu (1909) 593 126.9 1.6e-27
NP_001156729 (OMIM: 300214) plexin-B3 isoform 2 [H (1932) 593 126.9 1.7e-27
XP_011510892 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i (1467) 404 89.9 1.6e-16
XP_011514978 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1437) 230 56.0 2.7e-06
NP_001310962 (OMIM: 617029) semaphorin-4B isoform ( 681) 222 54.3 4.2e-06
NP_001310959 (OMIM: 617029) semaphorin-4B isoform ( 681) 222 54.3 4.2e-06
NP_001310958 (OMIM: 617029) semaphorin-4B isoform ( 699) 222 54.3 4.3e-06
NP_064595 (OMIM: 617029) semaphorin-4B isoform 1 p ( 837) 222 54.3 5e-06
>>NP_005752 (OMIM: 604259) plexin-C1 precursor [Homo sap (1568 aa)
initn: 10446 init1: 10446 opt: 10446 Z-score: 11001.4 bits: 2048.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10446; 100.0% identity (100.0% similar) in 1568 aa overlap (1-1568:1-1568)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
730 740 750 760 770 780
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pF1KE0 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
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850 860 870 880 890 900
pF1KE0 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE0 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE0 VKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNW
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pF1KE0 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KE0 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE0 QMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIKVFKKIANFTSDVEYSDDHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIKVFKKIANFTSDVEYSDDHC
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KE0 HLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKVKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKVKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRA
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE0 PFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDG
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE0 CLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEM
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE0 EEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVKVLFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVKVLFD
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE0 EKKKCKWM
::::::::
NP_005 EKKKCKWM
>>XP_016874161 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 isofo (1315 aa)
initn: 8738 init1: 8738 opt: 8738 Z-score: 9202.3 bits: 1715.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8738; 100.0% identity (100.0% similar) in 1311 aa overlap (1-1311:1-1311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
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XP_016 DHS
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XP_011 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
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XP_011 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
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pF1KE0 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
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XP_011 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
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pF1KE0 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
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XP_011 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
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pF1KE0 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
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XP_011 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
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XP_011 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
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XP_011 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
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XP_011 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
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XP_011 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
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pF1KE0 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
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XP_011 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
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pF1KE0 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
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XP_011 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
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XP_011 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
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XP_011 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
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XP_011 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
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XP_011 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
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XP_011 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
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XP_011 HS
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XP_006 CLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEM
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XP_006 EEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVKVLFD
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XP_006 EKKKCKWM
1550
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XP_011 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
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XP_011 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
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XP_011 FALRTFFPEGSEESST
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: .:.:. : :: : : :. : .
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310 320 330 340 350
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.:: : : .:. ::: ::.....: :: :.. : .. . .:
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360 370 380 390
pF1KE0 D------------QPERV--------------QPIASSTLIHSD-LTSVYGTVVMNRTVL
:::.. ::. .. .... :::: . : : :..
NP_055 TGPACERKLNIQLQPEQLDCGAAHLQHPLSILQPLKATPVFRAPGLTSVAVASVNNYTAV
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pF1KE0 FLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIKEETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRI
:::: .:.:::. :.:.. .:. . :: . . ::. . :.:: ..... :.
NP_055 FLGTVNGRLLKINLNESMQVVSRRVV-TVAYGEPVHHVMQFDPADSGYLYLMTSHQMARV
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.:: :: :..:..:. :.: .:::: :::.: ::..: . . : . : : ..:: .
NP_055 KVAACNVHSTCGDCVGAADAYCGWCALETRCTLQQDCTNSSQQHFWTSASEGPSRCPAMT
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. .:. . . ::. . :. . .. . : .. :..
NP_055 VLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSLSGMEMACDYGNNIRTVARVPGPAFGHQIAYCNLL
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: . .: .:.. .. :. . ::: .:: . : .:. .
NP_055 PRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVNGRNIV-KANFTIYDCSRTAQVYPHTACTSCLSAQWP
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pF1KE0 CAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCP------------------------------
: ::.. . :. . :. : . ..::
NP_055 CFWCSQQHSCVSNQSRCEASPNPTSPQDCPRTLLSPLAPVPTGGSQNILVPLANTAFFQG
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pF1KE0 VAVEKTSG-------------------------------------GGRP-----------
.:.: . : :::
NP_055 AALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPEPMT
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pF1KE0 ------------------KENKGN--------RTNQALQVFY-------IKSIEPQKVST
.:. :. : :: . :..::: .
NP_055 VMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSDGCRLRGPLQPMAGTCPAPEIRAIEPLSGPL
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680 690 700 710
pF1KE0 LGKSNVIVTGANF-TRASNITM-ILKGTSTCD---------KDVIQV-------------
: . . . : :. : :... . : .:. .... :
NP_055 DGGTLLTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGPLSGVVT
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720
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:.:: :: :. : : .
NP_055 VNASKEGKSRDRFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTDPCT
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. : ::..:. .: :.:. :. : . : : . .:
NP_055 ELMRTDTSIACTMPEGALPAPVPVCVRFERRGCVH-GNLTFWYMQNPVITAISPRRSPVS
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pF1KE0 GGQNITMMGRNFDVIDNLIIS-HELKGNINVSEYCVATYCGFLAP-SLKSSKVRTNVTVK
::..::. :. : ...:. .. :.. . .. . .: .: .:..... .. ..
NP_055 GGRTITVAGERFHMVQNVSMAVHHIGREPTLCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFFIN
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: : . :: :. :.: .:.:. . :. . . : . :.::
NP_055 GRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFRLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIHKE
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.:........ .. . ::..:... .. : : :... : : .. .
NP_055 QDSLGLQSHEYRVKI-----GQVSCDIQIVS---D-RIIHCSVNESLGA---AVGQLPIT
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...::.. . .. .. .:: :. :... .:. : ::.. : : :
NP_055 IQVGNFNQTIATLQLGGSETAIIVSIVICSVLLLLSVVALFVFCTKSRRAERYWQKTLLQ
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.: .::..:.::: :::::: : :.. .. .:::.::::. :::::. ...
NP_055 MEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSSLYEER
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... . : ..... .:... ...:. :: ::.. .:.:
NP_055 YVLPSQTLNSQGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHAL
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pF1KE0 EKQKNFSVKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVV
:.::.:.:.::: .::.:::::. :: : :::.. : ::.. . .::::::::::::
NP_055 EQQKDFAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVV
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::.::::::.:. . :::::::::.::. ...:.:::: .:.:: :: :::::.::: .
NP_055 EKMLTNWMSICMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLNEEWLLREN
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pF1KE0 PEFSTVALNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGL--
: . ::: :. . . : ..:: ..: ::. :.::::..:: :: ::.
NP_055 IEAKPRNLNVSFQ----GCGMD---SLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAF-CKN-VPYSQWP
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pF1KE0 QLNEIGLELQMGTRQKELL-DIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTI--KVFKKIAN
. ... :: .. :. .: :.:..::. ::: ::::..::.: .:... ... : :
NP_055 RAEDVDLEWFASSTQSYILRDLDDTSVV-EDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLIDKKDN
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. :. : . ::.:: .: . : :: .:. :: :.:::.::::: .... :
NP_055 TLGRVKDLDTEKYFHLVLPTDELAE--PKKSHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFL
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pF1KE0 EKLFRSIWSLPNSRAPFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKN
. ::..: :. ... :.:.:::::::. :::.. :.:::..:::::::::::::::::::
NP_055 DDLFKAILSIREDKPPLAVKYFFDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKN
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pF1KE0 PQFVFDIKKTPHIDGCLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSY
::::::: :: :::.:::::::::.:: :... ::::..:::::::::.:: :.. :. :
NP_055 PQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRY
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pF1KE0 YKAIRDLPPLSSSEMEEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLE-----
:: :.:. ::: .::. :..::.:..:::: .::..::::: .: .:. ::
NP_055 YKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTA
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pF1KE0 RERGLEEAQKQLLHVKVLFDEKKKCKWM
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NP_055 RRTQLQHKFEQV--VALMEDNIYECYSEA
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.:... ...:. :: ::.. .:.::.::.:.:.::: .::.:::::. ::
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. ...:.:::: .:.:: :: :::.:.::: . : . ::: :. . . : ..
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XP_011 EA
980
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. : . . ..::. : . .. . . : :: : .. .: : .: .
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::: :::.: ::..: . . : . : : ..:: . .. : : . :.
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XP_011 VCVRFERRGCVH-GNLTFWYMQNPVITAISPRRSPVSGGRTITVAGERFHMVQNVSMAVH
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XP_011 HIGREPTLCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFFINGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRG
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. :.: .:.:. . :. . . : . :.::.:........ .. . ::.
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.:... .. : :... : : .. . ...::.. . .. .. .:
XP_011 SCDIQIVSDR----IIHCSVNESLGA---AVGQLPITIQVGNFNQTIATLQLGGSETAII
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: :. :... .:. : ::.. : : :.: .::..:.::: :::::: :
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