Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0053
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0053, 1568 aa
1>>>pF1KE0053 1568 - 1568 aa - 1568 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9538+/-0.000981; mu= 21.4616+/- 0.059
mean_var=88.4452+/-17.184, 0's: 0 Z-trim(106.6): 48 B-trim: 13 in 1/50
Lambda= 0.136376
statistics sampled from 9048 (9093) to 9048 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 5.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12 (1568) 10446 2066.3 0
CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3 (1925) 1561 318.2 1.6e-85
CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22 (1838) 1126 232.6 8.7e-60
CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3 (1896) 739 156.5 7.4e-37
CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1 (1894) 733 155.3 1.7e-36
CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 (1894) 729 154.5 2.9e-36
CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX (1871) 709 150.6 4.4e-35
CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3 (2135) 696 148.1 2.9e-34
CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1909) 593 127.8 3.3e-28
CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1932) 593 127.8 3.4e-28
>>CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12 (1568 aa)
initn: 10446 init1: 10446 opt: 10446 Z-score: 11098.0 bits: 2066.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10446; 100.0% identity (100.0% similar) in 1568 aa overlap (1-1568:1-1568)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
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CCDS90 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
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CCDS90 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
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CCDS90 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE0 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE0 VKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNW
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE0 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
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CCDS90 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE0 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE0 QMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIKVFKKIANFTSDVEYSDDHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 QMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIKVFKKIANFTSDVEYSDDHC
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE0 HLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKVKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 HLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKVKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRA
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE0 PFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 PFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDG
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE0 CLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 CLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEM
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE0 EEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVKVLFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 EEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVKVLFD
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE0 EKKKCKWM
::::::::
CCDS90 EKKKCKWM
>>CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3 (1925 aa)
initn: 2050 init1: 820 opt: 1561 Z-score: 1649.1 bits: 318.2 E(32554): 1.6e-85
Smith-Waterman score: 1936; 30.2% identity (54.8% similar) in 1615 aa overlap (278-1565:340-1921)
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 YYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSS--SLVEALDV
: .:.:. : :: : : :. : .
CCDS33 KESQARSLLARICLPHGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAGGA--GRGDLYSRLVSVFPARER
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350
pF1KE0 WAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQA--RAKRVS------WDFKTAESHCKEG
.:: : : .:. ::: ::.....: :: :.. : .. . .:
CCDS33 LFAVFERPQGSPAARAAPA--ALCAFRFADVRAAIRAARTACFVEPAPDVVAVLDSVVQG
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390
pF1KE0 D------------QPERV--------------QPIASSTLIHSD-LTSVYGTVVMNRTVL
:::.. ::. .. .... :::: . : : :..
CCDS33 TGPACERKLNIQLQPEQLDCGAAHLQHPLSILQPLKATPVFRAPGLTSVAVASVNNYTAV
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 FLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIKEETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRI
:::: .:.:::. :.:.. .:. . :: . . ::. . :.:: ..... :.
CCDS33 FLGTVNGRLLKINLNESMQVVSRRVV-TVAYGEPVHHVMQFDPADSGYLYLMTSHQMARV
490 500 510 520 530 540
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 RVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQRCTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQ
.:: :: :..:..:. :.: .:::: :::.: ::..: . . : . : : ..:: .
CCDS33 KVAACNVHSTCGDCVGAADAYCGWCALETRCTLQQDCTNSSQQHFWTSASEGPSRCPAMT
550 560 570 580 590 600
520 530 540 550 560
pF1KE0 I------IRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVDSSRELCQNKSQP---NRTCTCSIP
. .:. . . ::. . :. . .. . : .. :..
CCDS33 VLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSLSGMEMACDYGNNIRTVARVPGPAFGHQIAYCNLL
610 620 630 640 650 660
570 580 590 600
pF1KE0 TRATY------KDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFT--NCSSLKE------CPACVETG--
: . .: .:.. .. :. . ::: .:: . : .:. .
CCDS33 PRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVNGRNIV-KANFTIYDCSRTAQVYPHTACTSCLSAQWP
670 680 690 700 710 720
610 620 630 640 650
pF1KE0 CAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKT-----SGGGR----PKEN----KG
: ::.. . :. . :. : . ..:: .. . .::.. : : .:
CCDS33 CFWCSQQHSCVSNQSRCEASPNPTSPQDCPRTLLSPLAPVPTGGSQNILVPLANTAFFQG
730 740 750 760 770 780
660 670
pF1KE0 N----------------------RTNQAL-------QVF------------YIKSIEPQK
: .:.. ::: .. : ::.
CCDS33 AALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPEPMT
790 800 810 820 830 840
680
pF1KE0 V-------------STLGKSNV--------------------------------------
: . ::. ..
CCDS33 VMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSDGCRLRGPLQPMAGTCPAPEIHAIEPLSGPL
850 860 870 880 890 900
690 700 710
pF1KE0 ------IVTGANF-TRASNITM-ILKGTSTCD---------KDVIQV-------------
. : :. : :... . : .:. .... :
CCDS33 DGGTLLTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGPLSGVVT
910 920 930 940 950 960
720
pF1KE0 -------------SHVL-----------------------NDTHMKFSL--------PSS
:.:: :: :. : : .
CCDS33 VNASKEGKSRDRFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTDPCT
970 980 990 1000 1010 1020
730 740 750 760
pF1KE0 RKEMKD-----------------VCIQFDGGNCSSVGSLS--YIALPHCSLIFPATTWIS
. : ::..:. .: :.:. :. : . : : . .:
CCDS33 ELMRTDTSIACTMPEGALPAPVPVCVRFERRGCVH-GNLTFWYMQNPVITAISPRRSPVS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
770 780 790 800 810 820
pF1KE0 GGQNITMMGRNFDVIDNLIIS-HELKGNINVSEYCVATYCGFLAP-SLKSSKVRTNVTVK
::..::. :. : ...:. .. :.. . .. . .: .: .:..... .. ..
CCDS33 GGRTITVAGERFHMVQNVSMAVHHIGREPTLCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFFIN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
830 840 850 860
pF1KE0 LR-------VQDTYLDC-----GT---LQYREDPRFTGYRVESEVDTE----LEVKIQKE
: : . :: :. :.: .:.:. . :. . . : . :.::
CCDS33 GRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFRLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIHKE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
870 880 890 900 910 920
pF1KE0 NDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQDLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVR
.:........ .. . ::..:... .. : : :... : : .. .
CCDS33 QDSLGLQSHEYRVKI-----GQVSCDIQIVS---D-RIIHCSVNESLGA---AVGQLPIT
1210 1220 1230 1240 1250
930 940 950 960 970 980
pF1KE0 VKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVL---LVIVIFAAVGVTRHKSKELSR---KQSQQ
...::.. . .. .. .:: :. :... .:. : ::.. : : :
CCDS33 IQVGNFNQTIATLQLGGSETAIIVSIVICSVLLLLSVVALFVFCTKSRRAERYWQKTLLQ
1260 1270 1280 1290 1300 1310
990 1000 1010 1020 1030
pF1KE0 LELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGT---VPFLDYKHFALRTFFPESGGF---T
.: .::..:.::: :::::: : :.. .. .:::.::::. :::::. ...
CCDS33 MEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSSLYEER
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1040 1050 1060 1070
pF1KE0 HIFTEDMHNRDANDK---------------------NESLTALDALICNKSFLVTVIHTL
... . : ..... .:... ...:. :: ::.. .:.:
CCDS33 YVLPSQTLNSQGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHAL
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE0 EKQKNFSVKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVV
:.::.:.:.::: .::.:::::. :: : :::.. : ::.. . .::::::::::::
CCDS33 EQQKDFAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVV
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE0 EKLLTNWMSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQV
::.::::::.:. . :::::::::.::. ...:.:::: .:.:: :: :::.:.::: .
CCDS33 EKMLTNWMSICMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLSEEWLLREN
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE0 PEFSTVALNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGL--
: . ::: :. . . : ..:: ..: ::. :.::::..:: :: ::.
CCDS33 IEAKPRNLNVSFQ----GCGMD---SLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAF-CKN-VPYSQWP
1560 1570 1580 1590 1600
1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE0 QLNEIGLELQMGTRQKELL-DIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTI--KVFKKIAN
. ... :: .. :. .: :.:..::. ::: ::::..::.: .:... ... : :
CCDS33 RAEDVDLEWFASSTQSYILRDLDDTSVV-EDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLIDKKDN
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE0 FTSDVEYSDD--HCHLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKV-KEMYLTKLLSTKVAIHSVL
. :. : . ::.:: .: . : :: .:. :: :.:::.::::: .... :
CCDS33 TLGRVKDLDTEKYFHLVLPTDELAE--PKKSHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFL
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pF1KE0 EKLFRSIWSLPNSRAPFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKN
. ::..: :. ... :.:.:::::::. :::.. :.:::..:::::::::::::::::::
CCDS33 DDLFKAILSIREDKPPLAVKYFFDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKN
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pF1KE0 PQFVFDIKKTPHIDGCLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSY
::::::: :: :::.:::::::::.:: :... ::::..:::::::::.:: :.. :. :
CCDS33 PQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRY
1780 1790 1800 1810 1820 1830
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pF1KE0 YKAIRDLPPLSSSEMEEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLE-----
:: :.:. ::: .::. :..::.:..:::: .::..::::: .: .:. ::
CCDS33 YKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTA
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CCDS33 RRTQLQHKFEQV--VALMEDNIYECYSEA
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. ...... . : .: . .. . . :. . . :. :
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::.:.. :.:: .... . :...: :: : .. . : ...
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:. .. :.: . : : : . :.....:. : . :. . .
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::.. : : ..::: :: .: . . :..:... : ... . .: :::: ..
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:.:: : . : .. :. . ...: .. :. .::::.. :::::.:..:
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:.. . :::.::.::. :: : :.:...: .:.:: .:::::::.:.:::..:.
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CCDS43 LEWRPGSTAQILSDLDLTSQ-REGRWKRVNTLMHYNVRDGATL-ILSKVGVSQQPEDSQQ
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CCDS43 DLPGERHALLEEENRVWHLVRPTDEV--D-EGKSKRGSVKEKERTKAITEIYLTRLLSVK
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CCDS43 GTLQQFVDNFFQSVLA-PGHAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRF
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CCDS43 LEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL
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.:.: : :... :.:: . ::: : .: :... .... .: : ..
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. .:: : :: : : ... : : : . : . .. ... . :.
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: : : . ::: .:. : :. .. . : . :.:. . :.. :
CCDS33 TEDPTILRIDPEWSINSGGTLLTVTGTNLATVREPRIRAKY-GGIERENGCLVYNDTTMV
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. . .. :. . :. :.. .....: .::. ..
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CCDS33 FTFLLYKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLT
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CCDS33 EWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQVTDGSSVALVPKQTSAYNISNSSTF
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CCDS33 TKSLSRYESMLRTASSPDSLRSRTPMITPDLESGTKLWHLVKNHDHLDQREGDRGSKMVS
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CCDS33 EIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADKHQIHDADV
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CCDS33 RHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHKLGKDSP
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.::::::::::.:: :. :: : .: .:...: .:...:. : ..:: :: :::
CCDS33 SNKLLYAKDIPNYKSWVERYYADIAKMPAISDQDMSAYLAEQSRLHLSQFNSMSALHEIY
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pF1KE0 KYIVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVKVLFDEKKKCKWM
.::.:: :::: ::.. :.:..: :. :.
CCDS33 SYITKYKDEILAALEKD---EQARRQRLRSKLEQVVDTMALSS
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CCDS31 QYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFECGWCS
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CCDS31 GERRCTLHQHCTSPSS--PWLDWSSHNVKCSNPQI-------TEILTVSGPPEGGTRVTI
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..:. . :. .. . . :: : . : . . ... .:
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: : : . .: :: : : . ....: . :.
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. :..: . : . : .:: . .:.... : :..::. ..:..
CCDS31 ----------VLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYL-GNQTCEFYGRSMSEI
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. : ::: : .. : .. .: .. :: :. . : : . :: .
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:. : :.:::.. : ...: ..:: . .: ::::: .. : .. . : ..
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.. . .: .: .: : . :. . : :: .. . .. :.. : .
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:. :. .: .. : .::. .. ....:: :..:.. . .
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:: : :..:: .::.:::.. .. : ::.: :. :. : :.. :::
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.. : ...::::: : ...... .:.:::. .:.:..:: : : .... .
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.... ..: . :: :: ::.: :.::: :..::..:: ::.. .:: .: :
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:..:. : ::... .. .:::.:::::::.::.::::.. : ::.: .:::...:
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...:...:::.:.:: .: :.:.:: :. : :..:. :: : :.::.. .:
CCDS31 YCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIEYKTLILNCV---NPDNENSP---EI
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:.::.:::: :.::::..: . :: ::. . . ..:. .: . .:. .. ..
CCDS31 PVKVLNCDTITQVKEKILDA-VYKN-VPYSQRPRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTK
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.: .:::. ::..:. :.. . : :. . :. .: : :
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. .: :: :. : .: ...: . : :.:.:::.::.:: .... ..
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::....: . : :.::::.::::: ::. ..: : :: : ::.: ::::::::..:
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::::::::.: :.::::.::.:::. : .:..:::..:.::::::::::.:: :.
CCDS31 NPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVER
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:: : :: .:...:. .:...:. : ::: ::.:::.:. :: .:... ::..
CCDS31 YYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQD--
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CCDS31 -EQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
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CCDS31 GTGAVYVGAINRVYKLTGN----LTIQVAHKTGP--EEDNKSCYPPLIVQPCSEVLTLTN
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. : .. : .::: : . :. . :. ..: . . .: .. :
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410 420 430 440 450 460
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: . :.. .:. .:.. .. . . . :.:. . ..: :. : .:... .:.::
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:.. :. .: .:.: :::. . : .::... : ::: : : :.:.
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CCDS43 DQCGKQKLAYKLEQVITLMSLDS
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..:. : :. ..: .:. . :. . . : :. ..
CCDS43 KQINDRIKERLQSCYRGEGTLDLAW-LKVKDIPCSSALLTIDDNFCGLDMNAPLGVSDMV
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370 380 390 400 410 420
pF1KE0 SSTLIHSD----LTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKV-ILGENLTSNCPEVIYEIKEE
. . .. .::: . : :... :.:: .:.: :. . : .. :.. .. .
CCDS43 RGIPVFTEDRDRMTSVIAYVYKNHSLAFVGTKSGKLKKIRVDGPRGNALQYETV-QVVDP
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430 440 450 460 470 480
pF1KE0 TPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQRCT
::. .. . . .:. . ... :. : .:....::.::: . ::::::: . ::
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490 500 510 520 530
pF1KE0 FQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQI----IRSSKEKTTVTMVGSFSPRHS---KCM
. : .:.. . . .: :.: .. . : :. .. ... :. : .:
CCDS43 RKERCERSKEPRRF---ASEMKQCVRLTVHPNNISVSQYNVLLVLETYNVPELSAGVNCT
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540 550 560 570 580 590
pF1KE0 VKNVDSSRELC-QNKSQPNRTCTCSIPTRATYK-DVSVVNVMFS---FGSWNLSDRFNFT
.... : :. : . .: : . : ::..... : : : :
CCDS43 FEDLSEMDGLVVGNQIQCYSPAAKEVPRIITENGDHHVVQLQLKSKETGMTFASTSFVFY
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600 610 620 630 640
pF1KE0 NCSSLKECPACVETG--CAWCKSARRCIHPFTACDPSDYE-RNQEQCPVAVEKTSGGGRP
::: . : .:::. : ::: . : : .:. .. . . :.::
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CCDS43 EVIKPITLKAKNLPQPQSGQRGYECILNIQGSEQRVPALRFNSSSVQCQNTSYSYEGMEI
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. .. :.. . : . . ..:... .: .:. .. : :. .
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.. .:. . . . : . ::...: :.. . ..:... .: :. : :.. :::..
CCDS14 HISAERALTLPAMMGLAAGGGLLLLAITAVLVAYKRKTQDADRTLKRLQLQMDNLESRVA
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CCDS14 LECKEAFAELQTDINELTNHMDEVQIPFLDYRTYAVRVLFP--GIEAHPVLKELDTPPNV
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CCDS14 NCDSITQAKDKLLDTVYK--GIPYSQRPKAEDMDLEWRQGRMTRIILQDEDVTTKIECDW
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CCDS14 KRLNSLAHYQVTDGSLVALVPKQVSAYNMANSFTFTRSLSRYESLLRTASSPDSLRSRAP
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CCDS14 MITPDQETGTKLWHLVKNHDHADHREGDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETV
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CCDS14 FSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADQRQISDPDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVF
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CCDS14 DIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYRDIA
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CCDS14 KMASISDQDMDAYLVEQSRLHASDFSVLSALNELYFYVTKYRQEILTALDRDASCRKHKL
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CCDS14 RQKLEQIISLVSSDS
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.. . : . .... : .: . :..:::.. . : . : : ..
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CCDS27 VPDGATVALVPCLTKHVLRENQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDEP-EPPRPR
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CCDS27 LDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFM
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CCDS27 DACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMNSVLAELSWN
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pF1KE0 HENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVKVLFDEKKKCKWM
. .... .::: :.:::: ::.:.:.. :: : : :::. : ..
CCDS27 YSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALE-EDGT--AQKMQLGYRLQQIAAAVENKVTD
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CCDS27 L
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CCDS14 VKTLTR----THLYCEPPA--HAPQPANGSGLPQFVVQMGNVQLALGPVQYEAEPPLSAF
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CCDS14 PVEAQAGVGMGAAVLIAAVLLLTLMYRHKSKQALRDYQKVLVQLESLETGVGDQCRKEFT
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.:. . :. : :. .:::::. .: :.::: :: . ..:.. . ..:
CCDS14 DLMTEMTDLSSDLEGSGIPFLDYRTYAERAFFPGHGGCPLQPKPEGPGEDGHCATVRQGL
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CCDS14 TQLSNLLNSKLFLLTLIHTLEEQPSFSQRDRCHVASLLSLALHGKLEYLTDIMRTLLGDL
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CCDS14 AAHYVHRNPKLMLRRTETMVEKLLTNWLSICLYAFLREVAGEPLYMLFRAIQYQVDKGPV
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