Result of FASTA (omim) for
pF1KE0051
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0051, 1001 aa
1>>>pF1KE0051 1001 - 1001 aa - 1001 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2829+/-0.000458; mu= 21.5966+/- 0.028
mean_var=67.9583+/-13.866, 0's: 0 Z-trim(108.9): 217 B-trim: 66 in 1/51
Lambda= 0.155580
statistics sampled from 16801 (17037) to 16801 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16
Scan time: 9.480
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_775293 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/endop (1001) 6553 1480.9 0
NP_004311 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/endop ( 994) 6495 1467.9 0
NP_001273004 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/en ( 869) 5697 1288.7 0
NP_001672 (OMIM: 101900,108740,124200) sarcoplasmi ( 997) 5599 1266.8 0
XP_011536704 (OMIM: 101900,108740,124200) PREDICTE ( 999) 5599 1266.8 0
XP_005253945 (OMIM: 101900,108740,124200) PREDICTE ( 999) 5599 1266.8 0
NP_733765 (OMIM: 101900,108740,124200) sarcoplasmi (1042) 5599 1266.8 0
NP_005164 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic ( 999) 5140 1163.7 0
NP_777617 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic ( 998) 5138 1163.3 0
XP_011522191 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1024) 5136 1162.9 0
XP_011522190 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1028) 5136 1162.9 0
NP_777618 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1029) 5136 1162.9 0
NP_777616 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1029) 5136 1162.9 0
XP_011522187 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1042) 5136 1162.9 0
NP_777615 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1043) 5136 1162.9 0
NP_777614 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1044) 5136 1162.9 0
NP_777613 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1052) 5136 1162.9 0
XP_016880181 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1062) 5136 1162.9 0
XP_011522186 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1069) 5136 1162.9 0
XP_011522184 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1084) 5136 1162.9 0
XP_011522183 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1114) 5136 1162.9 0
XP_016880182 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1020) 4724 1070.4 0
XP_011522194 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi ( 540) 2694 614.6 4.6e-175
XP_011510988 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 671) 696 166.2 5.4e-40
NP_001186114 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 888) 696 166.2 6.9e-40
NP_001001485 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 888) 696 166.2 6.9e-40
NP_001186113 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 903) 696 166.2 7e-40
NP_055197 (OMIM: 169600,604384) calcium-transporti ( 919) 696 166.2 7.1e-40
NP_001186108 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 919) 696 166.2 7.1e-40
NP_001186112 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 923) 696 166.3 7.1e-40
XP_005247415 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 933) 696 166.3 7.1e-40
XP_016861653 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 939) 696 166.3 7.2e-40
NP_001001487 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 939) 696 166.3 7.2e-40
NP_001186111 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 944) 696 166.3 7.2e-40
NP_001001486 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 949) 696 166.3 7.2e-40
XP_005247412 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 949) 696 166.3 7.2e-40
XP_005247413 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 949) 696 166.3 7.2e-40
NP_001186110 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 953) 696 166.3 7.3e-40
NP_001186109 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 973) 696 166.3 7.4e-40
XP_005247411 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 983) 696 166.3 7.5e-40
NP_001278383 (OMIM: 613082) calcium-transporting A ( 795) 693 165.5 1e-39
NP_055676 (OMIM: 613082) calcium-transporting ATPa ( 946) 693 165.6 1.2e-39
XP_011521789 (OMIM: 613082) PREDICTED: calcium-tra ( 632) 628 150.9 2e-35
XP_011507884 (OMIM: 607321) PREDICTED: sodium/pota ( 970) 540 131.2 2.6e-29
NP_653300 (OMIM: 607321) sodium/potassium-transpor (1029) 540 131.3 2.7e-29
NP_000695 (OMIM: 137216) potassium-transporting AT (1035) 530 129.0 1.3e-28
NP_001667 (OMIM: 182360) potassium-transporting AT (1039) 512 125.0 2.1e-27
NP_001172014 (OMIM: 182360) potassium-transporting (1045) 512 125.0 2.1e-27
NP_000693 (OMIM: 104290,182340,602481) sodium/pota (1020) 495 121.2 2.9e-26
XP_016856849 (OMIM: 182310) PREDICTED: sodium/pota ( 992) 488 119.6 8.5e-26
>>NP_775293 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/endoplasm (1001 aa)
initn: 6553 init1: 6553 opt: 6553 Z-score: 7941.2 bits: 1480.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6553; 100.0% identity (100.0% similar) in 1001 aa overlap (1-1001:1-1001)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEAAHAKTTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRNLEKYGLNELPAEEGKTLWELVIEQFEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 MEAAHAKTTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRNLEKYGLNELPAEEGKTLWELVIEQFEDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EYEPEMGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 EYEPEMGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TGESVSVIKHTEPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 TGESVSVIKHTEPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ATEQDKTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 ATEQDKTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 MSVCKMFIIDKVDGDICLLNEFSITGSTYAPEGEVLKNDKPVRPGQYDGLVELATICALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 MSVCKMFIIDKVDGDICLLNEFSITGSTYAPEGEVLKNDKPVRPGQYDGLVELATICALC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 NDSSLDFNEAKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVFNTDVRSLSKVERANACNSVIRQLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 NDSSLDFNEAKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVFNTDVRSLSKVERANACNSVIRQLMK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 KEFTLEFSRDRKSMSVYCSPAKSSRAAVGNKMFVKGAPEGVIDRCNYVRVGTTRVPLTGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 KEFTLEFSRDRKSMSVYCSPAKSSRAAVGNKMFVKGAPEGVIDRCNYVRVGTTRVPLTGP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 VKEKIMAVIKEWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSARFLEYETDLTFVGVVGML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 VKEKIMAVIKEWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSARFLEYETDLTFVGVVGML
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 DPPRKEVTGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFGENEEVADRAYTGREFDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 DPPRKEVTGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFGENEEVADRAYTGREFDD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 LPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 LPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 GGYVGAATVGAAAWWFLYAEDGPHVNYSQLTHFMQCTEDNTHFEGIDCEVFEAPEPMTMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 GGYVGAATVGAAAWWFLYAEDGPHVNYSQLTHFMQCTEDNTHFEGIDCEVFEAPEPMTMA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 LSVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYVDPLPMIFKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 LSVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYVDPLPMIFKLR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KE0 ALDLTQWLMVLKISLPVIGLDEILKFVARNYLEDPEDERRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 ALDLTQWLMVLKISLPVIGLDEILKFVARNYLEDPEDERRK
970 980 990 1000
>>NP_004311 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/endoplasm (994 aa)
initn: 6495 init1: 6495 opt: 6495 Z-score: 7870.9 bits: 1467.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6495; 100.0% identity (100.0% similar) in 993 aa overlap (1-993:1-993)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEAAHAKTTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRNLEKYGLNELPAEEGKTLWELVIEQFEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MEAAHAKTTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRNLEKYGLNELPAEEGKTLWELVIEQFEDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EYEPEMGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EYEPEMGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TGESVSVIKHTEPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TGESVSVIKHTEPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ATEQDKTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ATEQDKTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
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pF1KE0 MSVCKMFIIDKVDGDICLLNEFSITGSTYAPEGEVLKNDKPVRPGQYDGLVELATICALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MSVCKMFIIDKVDGDICLLNEFSITGSTYAPEGEVLKNDKPVRPGQYDGLVELATICALC
370 380 390 400 410 420
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pF1KE0 NDSSLDFNEAKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVFNTDVRSLSKVERANACNSVIRQLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NDSSLDFNEAKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVFNTDVRSLSKVERANACNSVIRQLMK
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pF1KE0 KEFTLEFSRDRKSMSVYCSPAKSSRAAVGNKMFVKGAPEGVIDRCNYVRVGTTRVPLTGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KEFTLEFSRDRKSMSVYCSPAKSSRAAVGNKMFVKGAPEGVIDRCNYVRVGTTRVPLTGP
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pF1KE0 VKEKIMAVIKEWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSARFLEYETDLTFVGVVGML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VKEKIMAVIKEWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSARFLEYETDLTFVGVVGML
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pF1KE0 DPPRKEVTGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFGENEEVADRAYTGREFDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DPPRKEVTGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFGENEEVADRAYTGREFDD
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pF1KE0 LPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAM
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pF1KE0 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 GGYVGAATVGAAAWWFLYAEDGPHVNYSQLTHFMQCTEDNTHFEGIDCEVFEAPEPMTMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GGYVGAATVGAAAWWFLYAEDGPHVNYSQLTHFMQCTEDNTHFEGIDCEVFEAPEPMTMA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 LSVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYVDPLPMIFKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LSVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYVDPLPMIFKLR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KE0 ALDLTQWLMVLKISLPVIGLDEILKFVARNYLEDPEDERRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ALDLTQWLMVLKISLPVIGLDEILKFVARNYLEG
970 980 990
>>NP_001273004 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/endopl (869 aa)
initn: 5697 init1: 5697 opt: 5697 Z-score: 6903.7 bits: 1288.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5697; 100.0% identity (100.0% similar) in 868 aa overlap (126-993:1-868)
100 110 120 130 140 150
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::::::::::::::::::.: : ::... .:::::::::::::::...:::.:.::.:.
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:::: ::..:..:::.::::::::::::::::.::::::::::..:.:...:.::::::.
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: . ::.:: : :::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
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::.::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.::::::::::::::.::
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:::: ::..:..:::.::::::::::::::::.::::::::::..:.:...:.::::::.
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XP_011 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
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XP_011 PLNVTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEPVLSSEL
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>>XP_005253945 (OMIM: 101900,108740,124200) PREDICTED: s (999 aa)
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XP_005 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
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NP_733 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALK
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NP_005 PLSGRQWVVVLQISLPVILLDEALKYLSRNHMHEEMSQK
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>>NP_777617 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic reti (998 aa)
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NP_777 EYEPEMGKVIRSDRKGVQRIRARDIVPGDIVEVAVGDKVPADLRLIEIKSTTLRVDQSIL
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pF1KE0 TGESVSVIKHTEPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMA
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NP_777 TGESVSVTKHTEAIPDPRAVNQDKKNMLFSGTNITSGKAVGVAVATGLHTELGKIRSQMA
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NP_777 NDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVFDTDLQALSRVERAGACNTVIKQLMR
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