Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0051
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0051, 1001 aa
1>>>pF1KE0051 1001 - 1001 aa - 1001 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6356+/-0.00105; mu= 19.3002+/- 0.063
mean_var=63.8805+/-12.821, 0's: 0 Z-trim(102.1): 72 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.160469
statistics sampled from 6733 (6807) to 6733 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 3.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10643.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 (1001) 6553 1526.6 0
CCDS42139.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 ( 994) 6495 1513.2 0
CCDS66997.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 ( 869) 5697 1328.4 0
CCDS9143.1 ATP2A2 gene_id:488|Hs108|chr12 ( 997) 5599 1305.8 0
CCDS9144.1 ATP2A2 gene_id:488|Hs108|chr12 (1042) 5599 1305.8 0
CCDS45579.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 ( 999) 5140 1199.5 0
CCDS45580.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 ( 998) 5138 1199.0 0
CCDS42234.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 (1029) 5136 1198.6 0
CCDS11041.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 (1043) 5136 1198.6 0
CCDS11042.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 (1052) 5136 1198.6 0
CCDS46913.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 888) 696 170.7 1.2e-41
CCDS56281.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 903) 696 170.7 1.2e-41
CCDS46914.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 919) 696 170.7 1.3e-41
CCDS56280.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 923) 696 170.7 1.3e-41
CCDS46912.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 939) 696 170.7 1.3e-41
CCDS56279.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 944) 696 170.7 1.3e-41
CCDS33856.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 949) 696 170.7 1.3e-41
CCDS75006.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 953) 696 170.7 1.3e-41
CCDS56278.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 973) 696 170.7 1.3e-41
CCDS42207.1 ATP2C2 gene_id:9914|Hs108|chr16 ( 946) 693 170.0 2.1e-41
CCDS1197.1 ATP1A4 gene_id:480|Hs108|chr1 (1029) 540 134.6 1e-30
CCDS12467.1 ATP4A gene_id:495|Hs108|chr19 (1035) 530 132.2 5.2e-30
CCDS31948.1 ATP12A gene_id:479|Hs108|chr13 (1039) 512 128.1 9.4e-29
CCDS53858.1 ATP12A gene_id:479|Hs108|chr13 (1045) 512 128.1 9.5e-29
CCDS1196.1 ATP1A2 gene_id:477|Hs108|chr1 (1020) 495 124.1 1.4e-27
CCDS53352.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 ( 992) 488 122.5 4.2e-27
CCDS887.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 (1023) 488 122.5 4.4e-27
CCDS53351.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 (1023) 488 122.5 4.4e-27
CCDS12594.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1013) 479 120.4 1.8e-26
CCDS58663.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1024) 479 120.4 1.9e-26
CCDS58664.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1026) 479 120.4 1.9e-26
CCDS30977.1 ATP2B4 gene_id:493|Hs108|chr1 (1170) 453 114.4 1.4e-24
CCDS1440.1 ATP2B4 gene_id:493|Hs108|chr1 (1205) 453 114.4 1.4e-24
CCDS82733.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3 (1154) 427 108.4 8.7e-23
CCDS2601.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3 (1198) 427 108.4 9e-23
CCDS33701.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3 (1243) 427 108.4 9.3e-23
CCDS41817.1 ATP2B1 gene_id:490|Hs108|chr12 (1176) 418 106.3 3.7e-22
CCDS9035.1 ATP2B1 gene_id:490|Hs108|chr12 (1220) 418 106.3 3.9e-22
CCDS14722.1 ATP2B3 gene_id:492|Hs108|chrX (1173) 410 104.5 1.3e-21
CCDS35440.1 ATP2B3 gene_id:492|Hs108|chrX (1220) 410 104.5 1.4e-21
CCDS67088.1 ATP2C2 gene_id:9914|Hs108|chr16 ( 975) 333 86.6 2.7e-16
>>CCDS10643.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 (1001 aa)
initn: 6553 init1: 6553 opt: 6553 Z-score: 8188.2 bits: 1526.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6553; 100.0% identity (100.0% similar) in 1001 aa overlap (1-1001:1-1001)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEAAHAKTTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRNLEKYGLNELPAEEGKTLWELVIEQFEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MEAAHAKTTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRNLEKYGLNELPAEEGKTLWELVIEQFEDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EYEPEMGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EYEPEMGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TGESVSVIKHTEPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TGESVSVIKHTEPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ATEQDKTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ATEQDKTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 MSVCKMFIIDKVDGDICLLNEFSITGSTYAPEGEVLKNDKPVRPGQYDGLVELATICALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSVCKMFIIDKVDGDICLLNEFSITGSTYAPEGEVLKNDKPVRPGQYDGLVELATICALC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 NDSSLDFNEAKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVFNTDVRSLSKVERANACNSVIRQLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NDSSLDFNEAKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVFNTDVRSLSKVERANACNSVIRQLMK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 KEFTLEFSRDRKSMSVYCSPAKSSRAAVGNKMFVKGAPEGVIDRCNYVRVGTTRVPLTGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KEFTLEFSRDRKSMSVYCSPAKSSRAAVGNKMFVKGAPEGVIDRCNYVRVGTTRVPLTGP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 VKEKIMAVIKEWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSARFLEYETDLTFVGVVGML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VKEKIMAVIKEWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSARFLEYETDLTFVGVVGML
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 DPPRKEVTGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFGENEEVADRAYTGREFDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DPPRKEVTGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFGENEEVADRAYTGREFDD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 LPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 GGYVGAATVGAAAWWFLYAEDGPHVNYSQLTHFMQCTEDNTHFEGIDCEVFEAPEPMTMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GGYVGAATVGAAAWWFLYAEDGPHVNYSQLTHFMQCTEDNTHFEGIDCEVFEAPEPMTMA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 LSVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYVDPLPMIFKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LSVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYVDPLPMIFKLR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KE0 ALDLTQWLMVLKISLPVIGLDEILKFVARNYLEDPEDERRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALDLTQWLMVLKISLPVIGLDEILKFVARNYLEDPEDERRK
970 980 990 1000
>>CCDS42139.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 (994 aa)
initn: 6495 init1: 6495 opt: 6495 Z-score: 8115.7 bits: 1513.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6495; 100.0% identity (100.0% similar) in 993 aa overlap (1-993:1-993)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEAAHAKTTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRNLEKYGLNELPAEEGKTLWELVIEQFEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MEAAHAKTTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRNLEKYGLNELPAEEGKTLWELVIEQFEDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EYEPEMGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EYEPEMGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TGESVSVIKHTEPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TGESVSVIKHTEPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ATEQDKTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ATEQDKTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 MSVCKMFIIDKVDGDICLLNEFSITGSTYAPEGEVLKNDKPVRPGQYDGLVELATICALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSVCKMFIIDKVDGDICLLNEFSITGSTYAPEGEVLKNDKPVRPGQYDGLVELATICALC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 NDSSLDFNEAKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVFNTDVRSLSKVERANACNSVIRQLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NDSSLDFNEAKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVFNTDVRSLSKVERANACNSVIRQLMK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 KEFTLEFSRDRKSMSVYCSPAKSSRAAVGNKMFVKGAPEGVIDRCNYVRVGTTRVPLTGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KEFTLEFSRDRKSMSVYCSPAKSSRAAVGNKMFVKGAPEGVIDRCNYVRVGTTRVPLTGP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 VKEKIMAVIKEWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSARFLEYETDLTFVGVVGML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VKEKIMAVIKEWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSARFLEYETDLTFVGVVGML
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 DPPRKEVTGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFGENEEVADRAYTGREFDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DPPRKEVTGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFGENEEVADRAYTGREFDD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 LPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 GGYVGAATVGAAAWWFLYAEDGPHVNYSQLTHFMQCTEDNTHFEGIDCEVFEAPEPMTMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GGYVGAATVGAAAWWFLYAEDGPHVNYSQLTHFMQCTEDNTHFEGIDCEVFEAPEPMTMA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 LSVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYVDPLPMIFKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYVDPLPMIFKLR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KE0 ALDLTQWLMVLKISLPVIGLDEILKFVARNYLEDPEDERRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALDLTQWLMVLKISLPVIGLDEILKFVARNYLEG
970 980 990
>>CCDS66997.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 (869 aa)
initn: 5697 init1: 5697 opt: 5697 Z-score: 7118.2 bits: 1328.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5697; 100.0% identity (100.0% similar) in 868 aa overlap (126-993:1-868)
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 LILIANAIVGVWQERNAENAIEALKEYEPEMGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAV
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 GDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTEPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTEPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIA
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 AGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMAATEQDKTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICVAVWLIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMAATEQDKTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICVAVWLIN
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 IGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRS
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 LPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCKMFIIDKVDGDICLLNEFSITGSTYAPEGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCKMFIIDKVDGDICLLNEFSITGSTYAPEGEV
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 LKNDKPVRPGQYDGLVELATICALCNDSSLDFNEAKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
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CCDS91 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
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CCDS11 LSPEQQRQACRTARCFARVEPAHKSRIVENLQSFNEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAM
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