Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0045
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0045, 661 aa
1>>>pF1KE0045 661 - 661 aa - 661 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3922+/-0.000857; mu= 19.6444+/- 0.052
mean_var=82.9477+/-16.428, 0's: 0 Z-trim(107.7): 79 B-trim: 126 in 1/52
Lambda= 0.140823
statistics sampled from 9667 (9761) to 9667 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16
Scan time: 3.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1388.1 F13B gene_id:2165|Hs108|chr1 ( 661) 4704 965.9 0
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CCDS1386.1 CFHR1 gene_id:3078|Hs108|chr1 ( 330) 634 138.8 1.2e-32
CCDS30958.1 CFHR3 gene_id:10878|Hs108|chr1 ( 330) 598 131.5 1.9e-30
CCDS41451.1 CFHR4 gene_id:10877|Hs108|chr1 ( 331) 562 124.1 3e-28
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CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3538) 509 114.2 3.2e-24
CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3667) 509 114.2 3.3e-24
CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3707) 509 114.2 3.3e-24
CCDS380.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3487) 505 113.4 5.6e-24
CCDS60082.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3631) 505 113.4 5.7e-24
CCDS53453.1 CFHR3 gene_id:10878|Hs108|chr1 ( 269) 481 107.6 2.3e-23
CCDS1477.1 C4BPA gene_id:722|Hs108|chr1 ( 597) 462 104.0 6.2e-22
CCDS30959.1 CFHR2 gene_id:3080|Hs108|chr1 ( 270) 448 100.9 2.4e-21
CCDS1283.1 SELE gene_id:6401|Hs108|chr1 ( 610) 407 92.9 1.5e-18
CCDS44310.1 CR1L gene_id:1379|Hs108|chr1 ( 569) 403 92.0 2.4e-18
CCDS44309.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1 (2039) 408 93.5 3.2e-18
CCDS44308.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1 (2489) 408 93.6 3.7e-18
CCDS11663.1 APOH gene_id:350|Hs108|chr17 ( 345) 373 85.8 1.1e-16
CCDS1282.1 SELP gene_id:6403|Hs108|chr1 ( 830) 349 81.2 6.5e-15
CCDS1479.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 349) 338 78.7 1.6e-14
CCDS31009.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 362) 338 78.7 1.6e-14
CCDS1481.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 369) 338 78.7 1.7e-14
CCDS1485.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 392) 322 75.4 1.6e-13
CCDS1482.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 399) 322 75.4 1.7e-13
CCDS1484.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 355) 320 75.0 2e-13
CCDS31008.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 377) 320 75.0 2.1e-13
CCDS1480.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 384) 320 75.0 2.1e-13
CCDS31006.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1 ( 381) 315 74.0 4.3e-13
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CCDS73022.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1 ( 444) 315 74.1 4.8e-13
CCDS1478.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1033) 316 74.6 8e-13
CCDS31007.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1092) 316 74.6 8.3e-13
CCDS54509.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1013) 300 71.3 7.5e-12
CCDS53452.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 ( 449) 295 70.0 8.2e-12
CCDS74837.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1011) 298 70.9 9.9e-12
CCDS54508.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1023) 298 70.9 1e-11
CCDS13833.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1024) 298 70.9 1e-11
>>CCDS1388.1 F13B gene_id:2165|Hs108|chr1 (661 aa)
initn: 4704 init1: 4704 opt: 4704 Z-score: 5164.3 bits: 965.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4704; 100.0% identity (100.0% similar) in 661 aa overlap (1-661:1-661)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRLKNLTFIIILIISGELYAEEKPCGFPHVENGRIAQYYYTFKSFYFPMSIDKKLSFFCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MRLKNLTFIIILIISGELYAEEKPCGFPHVENGRIAQYYYTFKSFYFPMSIDKKLSFFCL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 AGYTTESGRQEEQTTCTTEGWSPEPRCFKKCTKPDLSNGYISDVKLLYKIQENMRYGCAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AGYTTESGRQEEQTTCTTEGWSPEPRCFKKCTKPDLSNGYISDVKLLYKIQENMRYGCAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GYKTTGGKDEEVVQCLSDGWSSQPTCRKEHETCLAPELYNGNYSTTQKTFKVKDKVQYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GYKTTGGKDEEVVQCLSDGWSSQPTCRKEHETCLAPELYNGNYSTTQKTFKVKDKVQYEC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ATGYYTAGGKKTEEVECLTYGWSLTPKCTKLKCSSLRLIENGYFHPVKQTYEEGDVVQFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ATGYYTAGGKKTEEVECLTYGWSLTPKCTKLKCSSLRLIENGYFHPVKQTYEEGDVVQFF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CHENYYLSGSDLIQCYNFGWYPESPVCEGRRNRCPPPPLPINSKIQTHSTTYRHGEIVHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CHENYYLSGSDLIQCYNFGWYPESPVCEGRRNRCPPPPLPINSKIQTHSTTYRHGEIVHI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ECELNFEIHGSAEIRCEDGKWTEPPKCIEGQEKVACEEPPFIENGAANLHSKIYYNGDKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ECELNFEIHGSAEIRCEDGKWTEPPKCIEGQEKVACEEPPFIENGAANLHSKIYYNGDKV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 TYACKSGYLLHGSNEITCNRGKWTLPPECVENNENCKHPPVVMNGAVADGILASYATGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TYACKSGYLLHGSNEITCNRGKWTLPPECVENNENCKHPPVVMNGAVADGILASYATGSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 VEYRCNEYYLLRGSKISRCEQGKWSSPPVCLEPCTVNVDYMNRNNIEMKWKYEGKVLHGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VEYRCNEYYLLRGSKISRCEQGKWSSPPVCLEPCTVNVDYMNRNNIEMKWKYEGKVLHGD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 LIDFVCKQGYDLSPLTPLSELSVQCNRGEVKYPLCTRKESKGMCTSPPLIKHGVIISSTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LIDFVCKQGYDLSPLTPLSELSVQCNRGEVKYPLCTRKESKGMCTSPPLIKHGVIISSTV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 DTYENGSSVEYRCFDHHFLEGSREAYCLDGMWTTPPLCLEPCTLSFTEMEKNNLLLKWDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DTYENGSSVEYRCFDHHFLEGSREAYCLDGMWTTPPLCLEPCTLSFTEMEKNNLLLKWDF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 DNRPHILHGEYIEFICRGDTYPAELYITGSILRMQCDRGQLKYPRCIPRQSTLSYQEPLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DNRPHILHGEYIEFICRGDTYPAELYITGSILRMQCDRGQLKYPRCIPRQSTLSYQEPLR
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 T
:
CCDS13 T
>>CCDS1387.1 CFHR5 gene_id:81494|Hs108|chr1 (569 aa)
initn: 861 init1: 456 opt: 924 Z-score: 1014.8 bits: 197.9 E(32554): 3.3e-50
Smith-Waterman score: 1040; 31.5% identity (55.8% similar) in 572 aa overlap (91-646:23-568)
70 80 90 100 110
pF1KE0 AGYTTESGRQEEQTTCTTEGWSPEPRCFKKCTKPDLSNGYISDVKLLYKIQ-----ENMR
: : . .:.. : . .. : .
CCDS13 MLLLFSVILISWVSTVGGEGTLCDFPKIHHGFLYDEEDYNPFSQVPTGEVFY
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YGCASGYKTTGGKDEEVVQCLSDGWSSQPTCRKEHETCLAPELYNGNYSTTQKTFKVKDK
:.: .. . . . . : .::: : : . : : . ::. .. :
CCDS13 YSCEYNFVSPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLR---MCSFPFVKNGHSESSGLIHLEGDT
60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VQYECATGYYTAGGKKTEEVECLTYGWSLTPKC--TKLKCSSLRLIENGYFHPVKQTYEE
:: : ::: ...:. . :. ::: : : :: .: : : .: :..:.
CCDS13 VQIICNTGYSLQNNEKN--ISCVERGWSTPPICSFTKGECHVPILEANVDAQPKKESYKV
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GDVVQFFCHENYYLSGSDLIQCYNFGWYPESPVCEGRRNRCPPPPLPINSKIQT-HSTTY
:::..: :..: ::: .:::.::: :. :.:.:. : ::: :.... .. :
CCDS13 GDVLKFSCRKNLIRVGSDSVQCYQFGWSPNFPTCKGQVRSCGPPPQLSNGEVKEIRKEEY
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RHGEIVHIECELNFEIHGSAEIRCEDGKWTEPPKCIEGQEKVACEEPPFIENGAANLHSK
:.:.:. .:. :: :.: .:.: ::.:: : :.: : :. : : .: : ..
CCDS13 GHNEVVEYDCNPNFIINGPKKIQCVDGEWTTLPTCVE-QVKT-CGYIPELEYGYVQPSVP
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400
pF1KE0 IYYNGDKVTYACKSGYLLHGSNEITCNRGKWTLPPECVENNE--NCKHPPVVMNGAVA-D
: .: .: :.. : . :.: ::: : :: : :: ... :: : .. . .
CCDS13 PYQHGVSVEVNCRNEYAMIGNNMITCINGIWTELPMCVATHQLKRCKIAGVNIKTLLKLS
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 GILASYATGSSVEYRCNEYYLLRGSKISRCEQGKWSSPPVCLEP----CTVNVDYMNRNN
: . .: ..:::.. . : : : .:::. : : : . : .:
CCDS13 G--KEFNHNSRIRYRCSDIFRYRHS---VCINGKWNPEVDCTEKREQFCPPPPQIPNAQN
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 IEMKWKYEGKVLHGDLIDFVCKQGYDLSPLTPLSELSVQCNRGEVK-YPLCTRKESKGMC
. .:. :. . .::..: : : .. . :. :. . : :. :: ..:
CCDS13 MTTTVNYQD----GEKVAVLCKENY----LLPEAK-EIVCKDGRWQSLPRCV--ESTAYC
410 420 430 440
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pF1KE0 TSPPLIKHGVIISSTVDTYENGSSVEYRCFDHHFLEGSREAYCLDGMWTTPPLCLEPCTL
:: :..: : ...: ::.: ::: . . :.:: . : . .:. :: ::.::..
CCDS13 GPPPSINNGDTTSFPLSVYPPGSTVTYRCQSFYKLQGSVTVTCRNKQWSEPPRCLDPCVV
450 460 470 480 490 500
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pF1KE0 SFTEMEKNNLLLKWDFDNRPHILHGEYIEFICRGDTYPAELYITGSILRMQCDRGQLKYP
: .:.:::. ::: :.. . :. .:: :. .: . .:.. .: :..:...::
CCDS13 SEENMNKNNIQLKWRNDGKLYAKTGDAVEFQCK---FPHKAMISSPPFRAICQEGKFEYP
510 520 530 540 550 560
650 660
pF1KE0 RCIPRQSTLSYQEPLRT
:
CCDS13 ICE
>>CCDS55671.1 CFHR4 gene_id:10877|Hs108|chr1 (577 aa)
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Smith-Waterman score: 925; 28.1% identity (53.0% similar) in 627 aa overlap (38-646:34-576)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 FIIILIISGELYAEEKPCGFPHVENGRIAQYYYTFKSFYFPMSIDKKLSFFCLAGYTTES
:: ... .::: . .. :..: ...: :
CCDS55 LINVILTLWVSCANGQVKPCDFPEIQHGGLYYKSLRRLYFPAAAGQSYSYYCDQNFVTPS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 GRQEEQTTCTTEGWSPEPRCFKKCTKPD--LSNGYISDVKLLYKIQENMRYGCASGYKTT
: . :: .:::: :.. :.: : . ::.::. . .: ..:. .:.: :: :.
CCDS55 GSYWDYIHCTQDGWSPTVPCLRTCSKSDVEIENGFISESSSIYILNEETQYNCKPGYATA
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 GGKDEEVVQCLSDGWSSQPTCRKEHETCLAPELYNGNYSTTQKTFKVKDKVQYECATGYY
:.. . ::..:::.:: : : : : . :. ... ::..: ..::: ::
CCDS55 EGNSSGSITCLQNGWSTQPICIK---FCDMPVFENSRAKSNGMWFKLHDTLDYECYDGYE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TAGGKKTEEVECLTYGWSLTPKCTKLKCSSLRLIENGYFHPVKQTYEEGDVVQFFCHENY
.. :. :. . : ::: : :
CCDS55 SSYGNTTDSIVCGEDGWSHLPTC-------------------------------------
190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 YLSGSDLIQCYNFGWYPESPVCEGRRNRCPPPPLPINSKIQTHSTTYRHGEIVHIECELN
: : : : ::::. .. . . .: :. .:.
CCDS55 ---------------YNSSENC-G-----PPPPISNGDTTSFPQKVYLPWSRVEYQCQSY
210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FEIHGSAEIRCEDGKWTEPPKCIEGQEKVACEEPPFIENGAANLHS--KIYY---NGDKV
.:..:: . : .: :.:::.:: . :: : :..: .. . :. .:..
CCDS55 YELQGSKYVTCSNGDWSEPPRCISMKP---CEFPE-IQHGHLYYENTRRPYFPVATGQSY
250 260 270 280 290
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pF1KE0 TYACKSGYLL-HGS--NEITCNRGKWTLPPECVENNENCKHPPV-VMNGAVADGILASYA
.: : .... :: . : :.. : :. ..:.. . . :: .... . :
CCDS55 SYYCDQNFVTPSGSYWDYIHCTQDGWLPTVPCL---RTCSKSDIEIENGFISESS-SIYI
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 TGSSVEYRCNEYYLLRGSKIS---RCEQGKWSSPPVCLEPCTVNVDYMNRNNIE-MKWKY
.. ..:.:. : .. : : :. ::. :.:.. : . : .: . . :..:
CCDS55 LNKEIQYKCKPGYATADGNSSGSITCLQNGWSAQPICIKFCDMPVFENSRAKSNGMRFK-
360 370 380 390 400 410
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 EGKVLHGDLIDFVCKQGYDLSPLTPLSELSVQCNR-GEVKYPLCTRKESKGMCTSPPLIK
:: : .:. : .::..: . . :. :.. : ..: : . : : :: :.
CCDS55 ----LH-DTLDYECYDGYEISYGNTTG--SIVCGEDGWSHFPTCYNSSEK--CGPPPPIS
420 430 440 450 460
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 HGVIISSTVDTYENGSSVEYRCFDHHFLEGSREAYCLDGMWTTPPLCLEPCTLSFTEMEK
.: : . .: : :::.: ... :.:: . : .: :. :: :..:: .. .:.:
CCDS55 NGDTTSFLLKVYVPQSRVEYQCQSYYELQGSNYVTCSNGEWSEPPRCIHPCIITEENMNK
470 480 490 500 510 520
600 610 620 630 640
pF1KE0 NNLLLKWDFDNRPHILHGEYIEFICRGDTYPAELYITGSILRMQ--CDRGQLKYPRCIPR
::. :: : . . :. :::.:. : :. :.: .: : .: ..::::
CCDS55 NNIQLKGKSDIKYYAKTGDTIEFMCKLG-YNANT----SVLSFQAVCREGIVEYPRCE
530 540 550 560 570
650 660
pF1KE0 QSTLSYQEPLRT
>>CCDS1385.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 (1231 aa)
initn: 1161 init1: 314 opt: 757 Z-score: 826.9 bits: 164.2 E(32554): 9.8e-40
Smith-Waterman score: 1006; 28.1% identity (48.7% similar) in 752 aa overlap (23-646:507-1228)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MRLKNLTFIIILIISGELYAEEKPCGFPHVENGRIAQYYYTFKSFYFPMSID
: : .: :.: . . :: ..
CCDS13 CKLGYVTADGETSGSITCGKDGWSAQPTCIKSCDIPVFMNARTKNDFTWFK-------LN
480 490 500 510 520
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 KKLSFFCLAGYTTESGRQEEQTTCTTEGWSPEPRCFKK-CTKPDLSNGYISDVKL-LYKI
:.. : :: ...: . .: .::: : :... : : .. . : : ::.
CCDS13 DTLDYECHDGYESNTGSTTGSIVCGYNGWSDLPICYERECELPKIDVHLVPDRKKDQYKV
530 540 550 560 570 580
120 130 140 150 160
pF1KE0 QENMRYGCASGYKTTGGKDEEVVQCLSDGWSSQ-PTCRKEHETCLAP-ELYNGNYST-TQ
: ....: :. .: .. ::: : : . : :... ..: : :: ::: . :.
CCDS13 GEVLKFSCKPGFTIVGPNS---VQCYHFGLSPDLPICKEQVQSCGPPPELLNGNVKEKTK
590 600 610 620 630 640
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 KTFKVKDKVQYECATGYYTAGGKKTEEVECLTYGWSLTPKCT--KLKCSSLRLIENGYFH
. . .. :.: : . : .: ..:. :. : : . :... .:.:. .
CCDS13 EEYGHSEVVEYYCNPRFLMKGPNK---IQCVDGEWTTLPVCIVEESTCGDIPELEHGWAQ
650 660 670 680 690 700
230 240 250
pF1KE0 PVKQTYEEGDVVQFFCHENYYLSG----------------------------SDLIQ---
. : :: :.: : :.. . : :.::
CCDS13 LSSPPYYYGDSVEFNCSESFTMIGHRSITCIHGVWTQLPQCVAIDKLKKCKSSNLIILEE
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pF1KE0 ----------------------------CYNFGWYPESPVCEGRRNRCPPPPLPINSKIQ
: : : :: .. . ::::: ::. .
CCDS13 HLKNKKEFDHNSNIRYRCRGKEGWIHTVCINGRWDPEVNCSMAQIQLCPPPPQIPNSHNM
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pF1KE0 THSTTYRHGEIVHIECELNFEIHGSAEIRCEDGKWTEPPKCIEGQEKVACEEPPFIENGA
: . .:: :: : . :. :. :. . :: :.::.: : :.: :. : .:: ::.:.
CCDS13 TTTLNYRDGEKVSVLCQENYLIQEGEEITCKDGRWQSIPLCVE---KIPCSQPPQIEHGT
830 840 850 860 870 880
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pF1KE0 ANLH---SKIYYNGDKVTYACKSGYLLHGSNEITCNRGKWTLPPECVENNENCKHPPVVM
: .. : .: :..:.:..:. . :: :: :::. ::.: .. :: :: .
CCDS13 INSSRSSQESYAHGTKLSYTCEGGFRISEENETTCYMGKWSSPPQC--EGLPCKSPPEIS
890 900 910 920 930
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pF1KE0 NGAVADGILASYATGSSVEYRCNEYYLLRGSKISRCEQGKWSSPPVCLE------PCTVN
.:.:: . :: : : :.: : . . : :..: ::: :: :.. : :
CCDS13 HGVVAH-MSDSYQYGEEVTYKCFEGFGIDGPAIAKCLGEKWSHPPSCIKTDCLSLPSFEN
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pF1KE0 ----------------VDYM-----------NRNNIEMKW--------------------
: : : . :. .:
CCDS13 AIPMGEKKDVYKAGEQVTYTCATYYKMDGASNVTCINSRWTGRPTCRDTSCVNPPTVQNA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KE0 ----KYEGKVLHGDLIDFVCKQGYDLSPLTPLSELSVQCNRGE-VKYPLCTRKESKGMCT
. .: :. . . :.. :.. ... :.: :. .. : : :.: : :
CCDS13 YIVSRQMSKYPSGERVRYQCRSPYEM-----FGDEEVMCLNGNWTEPPQC--KDSTGKCG
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pF1KE0 SPPLIKHGVIISSTVDTYENGSSVEYRCFDHHFLEGSREAYCLDGMWTTPPLCLEPCTLS
:: : .: : : ...: .:::::.: . . :::... : .:.:. :: ::.::..:
CCDS13 PPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQCQNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVIS
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pF1KE0 FTEMEKNNLLLKWDFDNRPHILHGEYIEFIC-RGDTYPAELYITGSILRMQCDRGQLKYP
::. :. :.: .. . :: .::.: :: : .: . :: : :.:.::
CCDS13 REIMENYNIALRWTAKQKLYSRTGESVEFVCKRG--Y--RLSSRSHTLRTTCWDGKLEYP
1180 1190 1200 1210 1220
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pF1KE0 RCIPRQSTLSYQEPLRT
:
CCDS13 TCAKR
1230
>--
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MRLKNLTFIIILIISGELYAEEKPCGFPHVENGRIAQYYYTFKSFYFPMSID
::: .: ...: . :. ... :::...
CCDS13 QCRNGFYPATRGNTAKCTSTGWIPAPRCTLKPCDYPDIKHGGL--YHENMRRPYFPVAVG
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pF1KE0 KKLSFFCLAGYTTESGRQEEQTTCTTEGWSPEPRCFKKCTKPDLSNGYISDVKLLYKIQE
: :..: . : :: .. :: .:::: :..:: : : ::: .. . .
CCDS13 KYYSYYCDEHFETPSGSYWDHIHCTQDGWSPAVPCLRKCYFPYLENGYNQNHGRKFVQGK
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pF1KE0 NMRYGCASGYKTTGGKDEEVVQCLSDGWSSQPTCRKEHETCLAP--ELYNGNYSTTQKTF
.. .: :: : . .: :. .::: : : . .:: .. :: : .: :.
CCDS13 SIDVACHPGYALP--KAQTTVTCMENGWSPTPRCIRV-KTCSKSSIDIENGFISESQYTY
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pF1KE0 KVKDKVQYECATGYYTAGGKKTEEVECLTYGWSLTPKCTKLKCSSLRLIENGYFHPVKQT
.:.:..:.: :: :: :. . . : ::: : :
CCDS13 ALKEKAKYQCKLGYVTADGETSGSITCGKDGWSAQPTCIKSCDIPVFMNARTKNDFTWFK
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pF1KE0 YEEGDVVQFFCHENYYLSGSDLIQCYNFGWYPESPVCEGRRNRCPPPPLPINSKIQTHST
CCDS13 LNDTLDYECHDGYESNTGSTTGSIVCGYNGWSDLPICYERECELPKIDVHLVPDRKKDQY
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>--
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Smith-Waterman score: 409; 27.5% identity (54.2% similar) in 306 aa overlap (157-450:31-320)
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:. .:..: ..:. .. :.: :: .
CCDS13 MRLLAKIICLMLWAICVAEDCNELPPRRNTEILTGSWS--DQTYPEGTQAIYKCRPGYRS
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:. . : : .:.: :: : :. : : . ...: : . . :.
CCDS13 LGNVI---MVCRKGEWVALNPLRKCQKRPCGHPGDTPFGTFTLTGGNVFEYGVKAVYTCN
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:.: : : . .: . :: . :.:: .: : : :.:: . . :. :.
CCDS13 EGYQLLGEINYRECDTDGWTNDIPICE--VVKCLPVTAPENGKIVSSAMEPDREYHFGQA
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:.. :. ...:.:. :..: .:: :. : :::.: ..:. : : ::. .. ::
CCDS13 VRFVCNSGYKIEGDEEMHCSDDGFWSKEKPKCVE----ISCKSPDVI-NGSPISQKIIYK
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.... : :. :: .. .:... : : : : ..: .: . :: . . ..
CCDS13 ENERFQYKCNMGYEYSERGDAVCTESGWRPLPSCEE--KSCDNP-YIPNGDYSP-LRIKH
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pF1KE0 ATGSSVEYRC-NEYYLLRGSKISRCEQGKWSSPPVCLEPCTVNVDYMNRNNIEMKWKYEG
::. . :.: : .: .. ..: . : : :
CCDS13 RTGDEITYQCRNGFYPATRGNTAKCTSTGWIPAPRCTLKPCDYPDIKHGGLYHENMRRPY
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pF1KE0 KVLHGDLIDFVCKQGYDLSPLTPLSELSVQCNRGEVKYPLCTRKESKGMCTSPPLIKHGV
CCDS13 FPVAVGKYYSYYCDEHFETPSGSYWDHIHCTQDGWSPAVPCLRKCYFPYLENGYNQNHGR
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>>CCDS1386.1 CFHR1 gene_id:3078|Hs108|chr1 (330 aa)
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Smith-Waterman score: 634; 32.0% identity (62.5% similar) in 309 aa overlap (218-518:33-330)
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: .. ..: .:. :.: . :. :.
CCDS13 LLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQV-PTGEVFYYSCEYNFVS
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pF1KE0 SGSDL---IQCYNFGWYPESPVCEGRRNRCPPPPLPINSKIQTHSTTYRHGEIVHIECEL
.... : : . :: : .: : : :. :.. .. . :. .:. :.: :.
CCDS13 PSKSFWTRITCTEEGWSP-TPKCL----RLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNT
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pF1KE0 NFEIHGSAE-IRCEDGKWTEPPKCIEGQEKVACEEPPFIENGAANLHSKI--YYNGDKVT
....... . : : . :. :::: . ..: .:: ..: : : .. : .:..:
CCDS13 GYRLQNNENNISCVERGWSTPPKC--RSTDTSCVNPPTVQN-AHILSRQMSKYPSGERVR
120 130 140 150 160 170
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: :.: : . :..:. : :.:: ::.: ... .: :: . :: ... :. :: .:::
CCDS13 YECRSPYEMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSV
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 EYRCNEYYLLRGSKISRCEQGKWSSPPVCLEPCTVNVDYMNRNNIEMKWKYEGKVL--HG
::.:.. : :.:.: :..:.:: :: ::.::... . :. :: ..: . :. :
CCDS13 EYQCQNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTG
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pF1KE0 DLIDFVCKQGYDLSPLTPLSELSVQCNRGEVKYPLCTRKESKGMCTSPPLIKHGVIISST
. .::::.:: :: . : . : :...:: :...
CCDS13 ESAEFVCKRGYRLSSRS--HTLRTTCWDGKLEYPTCAKR
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pF1KE0 VDTYENGSSVEYRCFDHHFLEGSREAYCLDGMWTTPPLCLEPCTLSFTEMEKNNLLLKWD
>>CCDS30958.1 CFHR3 gene_id:10878|Hs108|chr1 (330 aa)
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..: :.. ::: : :.: . :: : : : .: : : :. :... . .:
CCDS30 YYCDEHFETPSGSYWDYIHCTQNGWSPAVP-CL---RKCYFPYLE-NGYNQNYGRKFVQG
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pF1KE0 EIVHIECELNFEI-HGSAEIRCEDGKWTEPPKCIEGQEKVACEEPPF-IENGAANLHSKI
. ... :. .. . .... . : . :. :.::. . .: . . :::: . :.:
CCDS30 NSTEVACHPGYGLPKAQTTVTCTEKGWSPTPRCIRVR---TCSKSDIEIENGFISESSSI
110 120 130 140 150 160
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: . .. : :: :: ..:. ::: .. :. : :....:.: :: . :: ...
CCDS30 YILNKEIQYKCKPGYATADGNSSGSITCLQNGWSAQPICINSSEKCGPPPPISNGDTTSF
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pF1KE0 ILASYATGSSVEYRCNEYYLLRGSKISRCEQGKWSSPPVCLEPCTVNVDYMNRNNIEMKW
.: :. : :::.:. :: :.::. : .:.:: :: :..:: .. . ::.:::..:
CCDS30 LLKVYVPQSRVEYQCQPYYELQGSNYVTCSNGEWSEPPRCIHPCIITEENMNKNNIKLKG
230 240 250 260 270 280
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pF1KE0 KYEGKVLH--GDLIDFVCKQGYDLSPLTPLSELSVQCNRGEVKYPLCTRKESKGMCTSPP
. . : :: :.:.:: ::. . : . ... : .: :.:: :
CCDS30 RSDRKYYAKTGDTIEFMCKLGYNAN--TSILSFQAVCREGIVEYPRCE
290 300 310 320 330
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pF1KE0 LIKHGVIISSTVDTYENGSSVEYRCFDHHFLEGSREAYCLDGMWTTPPLCLEPCTLSFTE
>>CCDS41451.1 CFHR4 gene_id:10877|Hs108|chr1 (331 aa)
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CCDS41 QNFVTPSGSYWDYIHCTQDGWSPTVPCLRTCSKSDIEIENGFISESSSIYILNKEIQYKC
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:: :. :.. . ::..:::.:: : : : : . :. ... ::..: ..:
CCDS41 KPGYATADGNSSGSITCLQNGWSAQPICIK---FCDMPVFENSRAKSNGMRFKLHDTLDY
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 ECATGYYTAGGKKTEEVECLTYGWSLTPKC--TKLKCSSLRLIENGYFHP-VKQTYEEGD
:: :: . :. : . : ::: : : .. ::. : :: . ..: .
CCDS41 ECYDGYEISYGNTTGSIVCGEDGWSHFPTCYNSSEKCGPPPPISNGDTTSFLLKVYVPQS
180 190 200 210 220 230
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:.. :. : :.::. . : : : : : : . : .: ..:: .. .
CCDS41 RVEYQCQSYYELQGSNYVTCSNGEW-SEPPRCI---HPCIITEENMNKNNIQLKGKSDIK
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 Y--RHGEIVHIECELNFEIHGSA---EIRCEDGKWTEPPKCIEGQEKVACEEPPFIENGA
: . :. ... :.:... . :. . :..: .: :.:
CCDS41 YYAKTGDTIEFMCKLGYNANTSVLSFQAVCREGI-VEYPRCE
300 310 320 330
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pF1KE0 ANLHSKIYYNGDKVTYACKSGYLLHGSNEITCNRGKWTLPPECVENNENCKHPPVVMNGA
>>CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9 (3571 aa)
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10 20 30 40
pF1KE0 MRLKNLTFIIILIISGELYAEEKPCGFPH-VENGRIAQYYYTFKSFYFPM
: : :. : :: : ::. :
CCDS48 YSCKPGHILAGSDLRLCLENRKWSGASPRCEAISCKKPNPVMNGSIKGSNYTYLS-----
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: . : ::. .. :. :: . .:. :: :. :..: .: :: . .
CCDS48 ----TLYYECDPGYVLNG---TERRTCQDDKNWDEDEPICIPVDCSSPPVSANGQVRGDE
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: .:....: : :. :.... ::..: :: . : : . : .: .: ::
CCDS48 --YTFQKEIEYTCNEGFLLEGARSRV---CLANGSWSGATPDCVPVR--CATPPQLANG-
2850 2860 2870 2880 2890 2900
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: . .: ..: :: :. : . : . : :. : : ..:. . .
CCDS48 -VTEGLDYGFMKEVTFHCHEGYILHGAPK---LTCQSDGNWDAEIPLCKPVNCGPPEDLA
2910 2920 2930 2940 2950
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.:. : .. .: .:. : .: : :.. .: . : : :: : :: : .
CCDS48 HGF--PNGFSFIHGGHIQYQCFPGYKLHGNSSRRCLSNGSWSGSSPSCLP--CRCSTPVI
2960 2970 2980 2990 3000 3010
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.. ...: . :. ..:.: .:.. : .:: :: ::.:. :.: :...:
CCDS48 EYGT---VNGTDFDCGKAARIQCFKGFKLLGLSEITCEADGQWSSGFPHC----EHTSCG
3020 3030 3040 3050 3060
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:.: :. . :. .. . .::.:.:::...::... :. .: :. : : : . .
CCDS48 SLPMIPNAFISETSS--WKENVITYSCRSGYVIQGSSDLICTEKGVWSQPYPVC--EPLS
3070 3080 3090 3100 3110 3120
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: :: : : ::: : .: : :. :: : : . . :.. :.: ::
CCDS48 CGSPPSVAN-AVATGEAHTYE--SEVKLRCLEGYTMDTDTDTFTCQKDGRWFPERISCSP
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pF1KE0 PVCLEPCTVNVDYMNRNNIEMKWKYEGKVLHGD------LIDFVCKQGYDLSPLTPLSEL
: : :. .. ..::: .. : .:: . .. .
CCDS48 KKC--PLPENITHI--------------LVHGDDFSVNRQVSVSCAEGYTFEGVN----I
3180 3190 3200 3210
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:: : . :. .. : : .: .:: ...: :.: :.. :.: . :::
CCDS48 SVCQLDGTWEPPFSDESCSPVSCGKPESPEHGFVVGSKY-TFE--STIIYQCEPGYELEG
3220 3230 3240 3250 3260 3270
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.:: : .. .:. .: : : : .: : : :..:: : . . : ::
CCDS48 NRERVCQENRQWSGGVAICKE--TRCETPLEFLNG--KADIENRT---TGPNVVYSCNRG
3280 3290 3300 3310 3320
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. :.: . : . . : . : ::... :: .:
CCDS48 YSLEGPSEAHCTENGTWSHPVPLCKPNPCPVPFVIPENALLSEKEFYVDQNVSIKCREGF
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..:.:.. :. : :. : :::: . : .: . :: . : . . : :.. : :
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. . : :. . : :.:.: .. :.: : . .: :..: :: :.
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. . :..:. : . :. : . . .: : :. . : :: :..: . ..
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CCDS48 QGYFEQEDDMMEVPYVTPHPPYHLGAVAKTWENTKESPATHSSNFLYGTMVSYTCNPGYE
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CCDS48 KGYTLAGDKESSCLANSSWSHSPPVC-EPVKCS-SPENINN--GKYILSG-LTYLSTASY
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CCDS48 TFRN--TVTYTCKEGYTLAGLDTIECLADGKWSRSDQQCLAVSCDEPPIVDHASPETAHR
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CCDS48 LFGDIAFYYCSDGYSLADNSQLLCNAQGKWVPPEGQDMPRCIAHFCEKPPSVSYSILESV
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. . .. .::: : :. .: ..: :: : : :.: . : : .: ::
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: . .:. . ... : :.:.: :. :.:.::. : .:.:.. : :
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.:. :.. :.:.:.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]