FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0038, 702 aa
1>>>pF1KE0038 702 - 702 aa - 702 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7061+/-0.000534; mu= 23.9128+/- 0.033
mean_var=76.4644+/-15.539, 0's: 0 Z-trim(106.3): 96 B-trim: 77 in 1/52
Lambda= 0.146671
statistics sampled from 14297 (14393) to 14297 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.487), E-opt: 0.2 (0.169), width: 16
Scan time: 10.400
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_062818 (OMIM: 237450,605495) solute carrier org ( 702) 4628 990.0 0
NP_006437 (OMIM: 237450,604843) solute carrier org ( 691) 3735 801.0 0
NP_059131 (OMIM: 613389) solute carrier organic an ( 712) 2140 463.6 1.2e-129
XP_005253451 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 712) 2140 463.6 1.2e-129
XP_011519006 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 711) 2128 461.0 7.1e-129
NP_001139418 (OMIM: 613389) solute carrier organic ( 730) 2068 448.3 4.8e-125
XP_011519005 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 729) 2056 445.8 2.8e-124
XP_016874975 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 594) 1758 382.6 2.3e-105
XP_016874976 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 594) 1758 382.6 2.3e-105
XP_016874973 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 1686 367.4 9.1e-101
XP_016874974 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 1686 367.4 9.1e-101
XP_005253453 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 1686 367.4 9.1e-101
NP_001139416 (OMIM: 613389) solute carrier organic ( 612) 1686 367.4 9.1e-101
XP_011519011 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 1686 367.4 9.1e-101
XP_016874977 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 564) 1574 343.7 1.2e-93
XP_011519013 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 564) 1574 343.7 1.2e-93
XP_016874978 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 545) 1554 339.4 2.1e-92
XP_016874979 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 545) 1554 339.4 2.1e-92
NP_001139417 (OMIM: 613389) solute carrier organic ( 663) 1417 310.5 1.3e-83
XP_005253534 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 650) 1410 309.0 3.6e-83
XP_011519122 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 668) 1410 309.1 3.7e-83
NP_066580 (OMIM: 602883) solute carrier organic an ( 670) 1410 309.1 3.7e-83
XP_011519120 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 1410 309.1 3.7e-83
XP_011519121 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 1410 309.1 3.7e-83
NP_602307 (OMIM: 602883) solute carrier organic an ( 670) 1410 309.1 3.7e-83
XP_005253531 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 1410 309.1 3.7e-83
NP_037404 (OMIM: 612435) solute carrier organic an ( 710) 1399 306.8 1.9e-82
NP_001138516 (OMIM: 612435) solute carrier organic ( 692) 1395 305.9 3.4e-82
XP_005254946 (OMIM: 612435) PREDICTED: solute carr ( 697) 1395 305.9 3.4e-82
XP_011519758 (OMIM: 612435) PREDICTED: solute carr ( 652) 1370 300.6 1.3e-80
XP_016875339 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 578) 1350 296.3 2.2e-79
XP_016875338 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 598) 1350 296.3 2.3e-79
XP_005254948 (OMIM: 612435) PREDICTED: solute carr ( 595) 1165 257.2 1.4e-67
XP_016869372 (OMIM: 613543) PREDICTED: solute carr ( 687) 959 213.6 2e-54
NP_001139480 (OMIM: 613543) solute carrier organic ( 687) 959 213.6 2e-54
NP_112220 (OMIM: 613543) solute carrier organic an ( 848) 959 213.7 2.3e-54
XP_011519123 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 362) 889 198.5 3.7e-50
XP_011541674 (OMIM: 609013) PREDICTED: solute carr ( 586) 708 160.5 1.7e-38
XP_011541672 (OMIM: 609013) PREDICTED: solute carr ( 636) 708 160.5 1.9e-38
NP_851322 (OMIM: 609013) solute carrier organic an ( 724) 708 160.6 2e-38
NP_001138683 (OMIM: 604988) solute carrier organic ( 687) 695 157.8 1.3e-37
NP_009187 (OMIM: 604988) solute carrier organic an ( 709) 695 157.8 1.3e-37
XP_016872646 (OMIM: 604988) PREDICTED: solute carr ( 711) 695 157.8 1.3e-37
NP_005621 (OMIM: 601460,614441) solute carrier org ( 643) 672 152.9 3.7e-36
XP_016862565 (OMIM: 601460,614441) PREDICTED: solu ( 597) 658 149.9 2.7e-35
XP_016862564 (OMIM: 601460,614441) PREDICTED: solu ( 653) 658 149.9 2.9e-35
XP_016869373 (OMIM: 613543) PREDICTED: solute carr ( 554) 634 144.8 8.7e-34
XP_016869374 (OMIM: 613543) PREDICTED: solute carr ( 544) 600 137.6 1.3e-31
XP_011541455 (OMIM: 613365) PREDICTED: solute carr ( 445) 563 129.7 2.5e-29
XP_011541452 (OMIM: 613365) PREDICTED: solute carr ( 476) 563 129.7 2.6e-29
>>NP_062818 (OMIM: 237450,605495) solute carrier organic (702 aa)
initn: 4628 init1: 4628 opt: 4628 Z-score: 5293.8 bits: 990.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4628; 100.0% identity (100.0% similar) in 702 aa overlap (1-702:1-702)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDQHQHLNKTAESASSEKKKTRRCNGFKMFLAALSFSYIAKALGGIIMKISITQIERRFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 MDQHQHLNKTAESASSEKKKTRRCNGFKMFLAALSFSYIAKALGGIIMKISITQIERRFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ISSSLAGLIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCLLMGTGSILTSLPHFFMGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 ISSSLAGLIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCLLMGTGSILTSLPHFFMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YRYSKETHINPSENSTSSLSTCLINQTLSFNGTSPEIVEKDCVKESGSHMWIYVFMGNML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 YRYSKETHINPSENSTSSLSTCLINQTLSFNGTSPEIVEKDCVKESGSHMWIYVFMGNML
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RGIGETPIVPLGISYIDDFAKEGHSSLYLGSLNAIGMIGPVIGFALGSLFAKMYVDIGYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 RGIGETPIVPLGISYIDDFAKEGHSSLYLGSLNAIGMIGPVIGFALGSLFAKMYVDIGYV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DLSTIRITPKDSRWVGAWWLGFLVSGLFSIISSIPFFFLPKNPNKPQKERKISLSLHVLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 DLSTIRITPKDSRWVGAWWLGFLVSGLFSIISSIPFFFLPKNPNKPQKERKISLSLHVLK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TNDDRNQTANLTNQGKNVTKNVTGFFQSLKSILTNPLYVIFLLLTLLQVSSFIGSFTYVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 TNDDRNQTANLTNQGKNVTKNVTGFFQSLKSILTNPLYVIFLLLTLLQVSSFIGSFTYVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 KYMEQQYGQSASHANFLLGIITIPTVATGMFLGGFIIKKFKLSLVGIAKFSFLTSMISFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 KYMEQQYGQSASHANFLLGIITIPTVATGMFLGGFIIKKFKLSLVGIAKFSFLTSMISFL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 FQLLYFPLICESKSVAGLTLTYDGNNSVASHVDVPLSYCNSECNCDESQWEPVCGNNGIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 FQLLYFPLICESKSVAGLTLTYDGNNSVASHVDVPLSYCNSECNCDESQWEPVCGNNGIT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 YLSPCLAGCKSSSGIKKHTVFYNCSCVEVTGLQNRNYSAHLGECPRDNTCTRKFFIYVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 YLSPCLAGCKSSSGIKKHTVFYNCSCVEVTGLQNRNYSAHLGECPRDNTCTRKFFIYVAI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 QVINSLFSATGGTTFILLTVKIVQPELKALAMGFQSMVIRTLGGILAPIYFGALIDKTCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 QVINSLFSATGGTTFILLTVKIVQPELKALAMGFQSMVIRTLGGILAPIYFGALIDKTCM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 KWSTNSCGAQGACRIYNSVFFGRVYLGLSIALRFPALVLYIVFIFAMKKKFQGKDTKASD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 KWSTNSCGAQGACRIYNSVFFGRVYLGLSIALRFPALVLYIVFIFAMKKKFQGKDTKASD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE0 NERKVMDEANLEFLNNGEHFVPSAGTDSKTCNLDMQDNAAAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 NERKVMDEANLEFLNNGEHFVPSAGTDSKTCNLDMQDNAAAN
670 680 690 700
>>NP_006437 (OMIM: 237450,604843) solute carrier organic (691 aa)
initn: 3768 init1: 3620 opt: 3735 Z-score: 4272.6 bits: 801.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3735; 79.8% identity (93.6% similar) in 692 aa overlap (1-691:1-691)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDQHQHLNKTAESASSEKKKTRRCNGFKMFLAALSFSYIAKALGGIIMKISITQIERRFD
:::.::::::::. ::.:::: :::.::::::::.:.:::.::.:::: :: .:::::.
NP_006 MDQNQHLNKTAEAQPSENKKTRYCNGLKMFLAALSLSFIAKTLGAIIMKSSIIHIERRFE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ISSSLAGLIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCLLMGTGSILTSLPHFFMGY
:::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::..:: :..::.::::::::
NP_006 ISSSLVGFIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCFIMGIGGVLTALPHFFMGY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 YRYSKETHINPSENSTSSLSTCLINQTLSFNGTSPEIVEKDCVKESGSHMWIYVFMGNML
:::::::.:: ::::::.:::::::: ::.: .::::: : :.:::::.:::::::::::
NP_006 YRYSKETNINSSENSTSTLSTCLINQILSLNRASPEIVGKGCLKESGSYMWIYVFMGNML
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RGIGETPIVPLGISYIDDFAKEGHSSLYLGSLNAIGMIGPVIGFALGSLFAKMYVDIGYV
::::::::::::.::::::::::::::::: ::::.::::.:::.:::::.:::::::::
NP_006 RGIGETPIVPLGLSYIDDFAKEGHSSLYLGILNAIAMIGPIIGFTLGSLFSKMYVDIGYV
190 200 210 220 230 240
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pF1KE0 DLSTIRITPKDSRWVGAWWLGFLVSGLFSIISSIPFFFLPKNPNKPQKERKISLSLHVLK
::::::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::..::::::::: :::::::.
NP_006 DLSTIRITPTDSRWVGAWWLNFLVSGLFSIISSIPFFFLPQTPNKPQKERKASLSLHVLE
250 260 270 280 290 300
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pF1KE0 TNDDRNQTANLTNQGKNVTKNVTGFFQSLKSILTNPLYVIFLLLTLLQVSSFIGSFTYVF
:::...:::::::::::.::::::::::.::::::::::.:.:::::::::.::.:::::
NP_006 TNDEKDQTANLTNQGKNITKNVTGFFQSFKSILTNPLYVMFVLLTLLQVSSYIGAFTYVF
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pF1KE0 KYMEQQYGQSASHANFLLGIITIPTVATGMFLGGFIIKKFKLSLVGIAKFSFLTSMISFL
::.:::::: .:.::.:::.:::: :.::::::.:::::::. ::::::: .:...:.
NP_006 KYVEQQYGQPSSKANILLGVITIPIFASGMFLGGYIIKKFKLNTVGIAKFSCFTAVMSLS
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pF1KE0 FQLLYFPLICESKSVAGLTLTYDGNNSVASHVDVPLSYCNSECNCDESQWEPVCGNNGIT
: :::: ..::.:::::::.:::::: :.:: :::::::::.::::::::::::::::::
NP_006 FYLLYFFILCENKSVAGLTMTYDGNNPVTSHRDVPLSYCNSDCNCDESQWEPVCGNNGIT
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pF1KE0 YLSPCLAGCKSSSGIKKHTVFYNCSCVEVTGLQNRNYSAHLGECPRDNTCTRKFFIYVAI
:.:::::::::::: :: :::::::.::::::::::::::::::::..:::::...:::
NP_006 YISPCLAGCKSSSGNKKPIVFYNCSCLEVTGLQNRNYSAHLGECPRDDACTRKFYFFVAI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 QVINSLFSATGGTTFILLTVKIVQPELKALAMGFQSMVIRTLGGILAPIYFGALIDKTCM
::.: .::: :::. ..: :::::::::.::.::.:::::.::::::::::::::: ::.
NP_006 QVLNLFFSALGGTSHVMLIVKIVQPELKSLALGFHSMVIRALGGILAPIYFGALIDTTCI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 KWSTNSCGAQGACRIYNSVFFGRVYLGLSIALRFPALVLYIVFIFAMKKKFQGKDTKASD
:::::.::..:.:: :::. :.::::::: :: .:::::..:.:::::.: :: .::.
NP_006 KWSTNNCGTRGSCRTYNSTSFSRVYLGLSSMLRVSSLVLYIILIYAMKKKYQEKDINASE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE0 NERKVMDEANLEFLNNGEHFVPSAGTDSKT-CNLDMQDNAAAN
: .:::::::: ::...:::::::.::.: :
NP_006 NG-SVMDEANLESLNKNKHFVPSAGADSETHC
670 680 690
>>NP_059131 (OMIM: 613389) solute carrier organic anion (712 aa)
initn: 2147 init1: 1081 opt: 2140 Z-score: 2448.5 bits: 463.6 E(85289): 1.2e-129
Smith-Waterman score: 2140; 47.0% identity (77.9% similar) in 662 aa overlap (12-666:28-683)
10 20 30 40
pF1KE0 MDQHQHLNKTAESASSEKKKTRRCNGFKMFLAALSFSYIAKALG
: :::.:. :. .:.:: :::: :.::::.
NP_059 MDTSSKENIQLFCKTSVQPVGRPSFKTEYPSSEEKQPC-CGELKVFLCALSFVYFAKALA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 GIIMKISITQIERRFDISSSLAGLIDGSFEIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCLLM
.: .:::::::::: :::.:.:::::::::::::.::::::.::::::.:: ::..:
NP_059 EGYLKSTITQIERRFDIPSSLVGVIDGSFEIGNLLVITFVSYFGAKLHRPKIIGAGCVIM
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 GTGSILTSLPHFFMGYYRYSKETHINPSENSTSSLSTCLINQT----LSFNGTSPEIVEK
:.:..: ..:.::: :.: . . :: ::: :.: ::.... .: : . .
NP_059 GVGTLLIAMPQFFMEQYKYERYS---PSSNSTLSISPCLLESSSQLPVSVMEKSKSKISN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 DCVKESGSHMWIYVFMGNMLRGIGETPIVPLGISYIDDFAKEGHSSLYLGSLNAIGMIGP
.: ...: ::::::.::.::::::::: ::::.:.::::.: ....:.: ......:::
NP_059 ECEVDTSSSMWIYVFLGNLLRGIGETPIQPLGIAYLDDFASEDNAAFYIGCVQTVAIIGP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 VIGFALGSLFAKMYVDIGYVDLSTIRITPKDSRWVGAWWLGFLVSGLFSIISSIPFFFLP
..:: :::: ::.:::::.:.:. : ::::: .::::::::.:..:..:.....::..::
NP_059 IFGFLLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITPKDPQWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLP
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE0 KN-PNKPQKERKISLSLHVLKTNDDRNQTANLTNQGKN--VTKNVTGFFQSLKSILTNPL
:. : . ..: . : : . :: .: : ::.: . . . :. :::... ::.
NP_059 KSLPRSQSREDSNSSSEKSKFIIDD--HTDYQTPQGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPV
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 YVIFLLLTLLQVSSFIGSFTYVFKYMEQQYGQSASHANFLLGIITIPTVATGMFLGGFII
: ..: . .: .:..: :: ::.:::::::.:.:::..:.:.::.:: :.: ::...
NP_059 YFLYLCTSTVQFNSLFGMVTYKPKYIEQQYGQSSSRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVM
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 KKFKLSLVGIAKFSFLTSMISFLFQLLYFPLICESKSVAGLTLTYDGNNSVASHVDVPLS
:::..:. : ::. . .:....:. : : : ::...:::::..:.:.. :. : . .:
NP_059 KKFRISVCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLFALGCENSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFS
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 YCNSECNCDESQWEPVCGNNGITYLSPCLAGCKSSSGIKKHTVFYNCSCVEVTGLQNRNY
:::.:.:.:..:::.::.:::::.: :::::..:. :. .::::.:: ... .. :
NP_059 DCNSRCKCSETKWEPMCGENGITYVSACLAGCQTSNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]