Result of FASTA (omim) for
pF1KE0033
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0033, 564 aa
1>>>pF1KE0033 564 - 564 aa - 564 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2386+/-0.000351; mu= 14.4657+/- 0.022
mean_var=92.1859+/-18.647, 0's: 0 Z-trim(115.6): 136 B-trim: 256 in 1/51
Lambda= 0.133580
statistics sampled from 25920 (26110) to 25920 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 8.350
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065990 (OMIM: 604209) copine-5 isoform a [Homo ( 593) 2430 478.7 2.2e-134
XP_005249304 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 610) 2424 477.6 5e-134
XP_011513071 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 653) 2153 425.4 2.8e-118
XP_016866628 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 522) 2147 424.2 5.2e-118
XP_011513073 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 632) 2147 424.2 6.1e-118
XP_011513072 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 632) 2147 424.2 6.1e-118
XP_011513070 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 670) 2147 424.2 6.4e-118
XP_011513075 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 473) 2014 398.5 2.5e-110
XP_011513074 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 543) 1891 374.8 3.8e-103
NP_689940 (OMIM: 604206) copine-2 [Homo sapiens] ( 548) 1841 365.2 3.1e-100
XP_016869434 (OMIM: 604207) PREDICTED: copine-3 is ( 537) 1839 364.8 3.9e-100
NP_003900 (OMIM: 604207) copine-3 [Homo sapiens] ( 537) 1839 364.8 3.9e-100
XP_005251150 (OMIM: 604207) PREDICTED: copine-3 is ( 537) 1839 364.8 3.9e-100
NP_003906 (OMIM: 604205) copine-1 isoform b [Homo ( 542) 1795 356.3 1.4e-97
NP_690905 (OMIM: 604205) copine-1 isoform a [Homo ( 537) 1794 356.1 1.6e-97
NP_690902 (OMIM: 604205) copine-1 isoform a [Homo ( 537) 1794 356.1 1.6e-97
NP_690903 (OMIM: 604205) copine-1 isoform a [Homo ( 537) 1794 356.1 1.6e-97
NP_690904 (OMIM: 604205) copine-1 isoform a [Homo ( 537) 1794 356.1 1.6e-97
NP_001185792 (OMIM: 604205) copine-1 isoform c [Ho ( 536) 1786 354.6 4.7e-97
NP_570720 (OMIM: 604208) copine-4 isoform 2 [Homo ( 557) 1767 350.9 6.1e-96
NP_702907 (OMIM: 604208) copine-4 isoform 1 [Homo ( 575) 1767 350.9 6.3e-96
XP_016861182 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 is ( 575) 1767 350.9 6.3e-96
NP_001276041 (OMIM: 604208) copine-4 isoform 1 [Ho ( 575) 1767 350.9 6.3e-96
NP_705900 (OMIM: 605689) copine-7 isoform a [Homo ( 558) 1712 340.3 9.5e-93
NP_006023 (OMIM: 605688) copine-6 isoform 2 [Homo ( 557) 1671 332.4 2.3e-90
XP_005268273 (OMIM: 605688) PREDICTED: copine-6 is ( 557) 1671 332.4 2.3e-90
NP_001267487 (OMIM: 605688) copine-6 isoform 1 [Ho ( 612) 1671 332.5 2.4e-90
XP_011521302 (OMIM: 605689) PREDICTED: copine-7 is ( 595) 1647 327.8 5.9e-89
XP_016878629 (OMIM: 605689) PREDICTED: copine-7 is ( 599) 1629 324.4 6.6e-88
NP_001300947 (OMIM: 604209) copine-5 isoform c [Ho ( 301) 1548 308.6 1.8e-83
XP_011510710 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 is ( 444) 1502 299.8 1.2e-80
XP_011510709 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 is ( 444) 1502 299.8 1.2e-80
XP_011510708 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 is ( 444) 1502 299.8 1.2e-80
NP_055242 (OMIM: 605689) copine-7 isoform b [Homo ( 633) 1412 282.6 2.7e-75
XP_016878628 (OMIM: 605689) PREDICTED: copine-7 is ( 637) 1412 282.6 2.7e-75
XP_016861183 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 is ( 434) 1369 274.2 6.1e-73
XP_011521303 (OMIM: 605689) PREDICTED: copine-7 is ( 527) 1347 270.0 1.3e-71
XP_016878627 (OMIM: 605689) PREDICTED: copine-7 is ( 670) 1347 270.0 1.6e-71
XP_011513077 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 361) 1271 255.2 2.5e-67
XP_005268274 (OMIM: 605688) PREDICTED: copine-6 is ( 382) 1256 252.4 2e-66
NP_001300949 (OMIM: 604209) copine-5 isoform d [Ho ( 243) 1238 248.8 1.5e-65
NP_001300948 (OMIM: 604209) copine-5 isoform d [Ho ( 243) 1238 248.8 1.5e-65
XP_016861184 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 is ( 417) 1169 235.6 2.4e-61
XP_016861185 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 is ( 306) 1061 214.7 3.3e-55
XP_016878630 (OMIM: 605689) PREDICTED: copine-7 is ( 344) 966 196.5 1.2e-49
NP_001300946 (OMIM: 604209) copine-5 isoform b [Ho ( 140) 716 148.1 1.8e-35
NP_002730 (OMIM: 176980,605361) protein kinase C g ( 697) 182 45.5 0.00066
NP_001303258 (OMIM: 176980,605361) protein kinase ( 710) 182 45.5 0.00067
XP_016880330 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kin ( 324) 171 43.2 0.0015
XP_016880329 (OMIM: 176960) PREDICTED: protein kin ( 586) 171 43.4 0.0025
>>NP_065990 (OMIM: 604209) copine-5 isoform a [Homo sapi (593 aa)
initn: 3105 init1: 2403 opt: 2430 Z-score: 2533.6 bits: 478.7 E(85289): 2.2e-134
Smith-Waterman score: 3097; 77.5% identity (90.3% similar) in 586 aa overlap (9-564:8-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
:.......:...::::.::..::::::::.: ::::::.::.:.::. ::.:
NP_065 MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
::::::::::::::::::::::.::::::..::::::::::::::.:::::::::.::::
NP_065 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE0 GEIVGSQGSRLEKPIV--------------------GIPGKKCGTIILTAEELNCCRDAV
:::::: :::::::.. :.::::::::::.::::. :::..
NP_065 GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRAL
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:.: ::::
NP_065 TMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRAL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNVYEVVNPKKKGKKKKYT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::: :::::.
NP_065 CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 NSGTVTLLSFLVETEVSFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMNPYQLNAY
:::::::::: ::.: .::::::::::::::::::::::::::.: :: :::.:::::::
NP_065 NSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 GMALKAVGEIVQDYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAY
..:: :::::.: :::::::::::::::::::::.:::: :::: .:: : ::.:..:::
NP_065 ALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAY
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 YRSLKSVQLYGPTNFAPVINHVARYASSVKDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNAS
.:::..::::::::::::..:::: :..:.::::: ::::.:::::::::::::.::::.
NP_065 HRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 KLPMSIIIVGVGPAEFDAMVELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSM
:::::::::::: :::::::::::::::.::::: ::::::::::::::.::.:::.:::
NP_065 KLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSM
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560
pF1KE0 ARLAKDVLAEIPEQFLSYMRARGIKPSPAP----------PPYTPPTHVLQTQI
::::.:::::::.:..:::.:.::.: : : : :::. :.:.:
NP_065 ARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
540 550 560 570 580 590
>>XP_005249304 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 isofor (610 aa)
initn: 3105 init1: 2403 opt: 2424 Z-score: 2527.1 bits: 477.6 E(85289): 5e-134
Smith-Waterman score: 3063; 75.3% identity (87.7% similar) in 603 aa overlap (9-564:8-610)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
:.......:...::::.::..::::::::.: ::::::.::.:.::. ::.:
XP_005 MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
::::::::::::::::::::::.::::::..::::::::::::::.:::::::::.::::
XP_005 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTL
60 70 80 90 100 110
130 140
pF1KE0 GEIVGSQGSRLEKPIV-------------------------------------GIPGKKC
:::::: :::::::.. :.:::::
XP_005 GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGSGLWMESLRTTGLEASGGVPGKKC
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 GTIILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVK
:::::.::::. :::.. ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:
XP_005 GTIILSAEELSNCRDVATMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMK
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 NTLNPVWQAFKISVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFN
::::::::.:.: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
XP_005 NTLNPVWQTFSIPVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFN
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 VYEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEVSFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNP
.::::::::: :::::.:::::::::: ::.: .::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IYEVVNPKKKMKKKKYVNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNP
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 AQPTSPHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNG
.: :: :::.:::::::..:: :::::.: :::::::::::::::::::::.:::: :::
XP_005 SQSTSLHYMSPYQLNAYALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNG
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 NPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFAPVINHVARYASSVKDGSQYFVLLIVTD
: .:: : ::.:..:::.:::..::::::::::::..:::: :..:.::::: ::::.::
XP_005 NQENPSCCGIDGILEAYHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITD
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 GVISDMAQTKESIVNASKLPMSIIIVGVGPAEFDAMVELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQF
:::::::::::.::::.:::::::::::: :::::::::::::::.::::: ::::::::
XP_005 GVISDMAQTKEAIVNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQF
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550
pF1KE0 VPFRDYIDRSGNHILSMARLAKDVLAEIPEQFLSYMRARGIKPSPAP----------PPY
::::::.::.:::.:::::::.:::::::.:..:::.:.::.: : : :
XP_005 VPFRDYVDRTGNHVLSMARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPAR
540 550 560 570 580 590
560
pF1KE0 TPPTHVLQTQI
:::. :.:.:
XP_005 TPPASPLHTHI
600 610
>>XP_011513071 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 isofor (653 aa)
initn: 2818 init1: 2135 opt: 2153 Z-score: 2244.4 bits: 425.4 E(85289): 2.8e-118
Smith-Waterman score: 2813; 79.7% identity (91.7% similar) in 517 aa overlap (9-505:8-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
:.......:...::::.::..::::::::.: ::::::.::.:.::. ::.:
XP_011 MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
::::::::::::::::::::::.::::::..::::::::::::::.:::::::::.::::
XP_011 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE0 GEIVGSQGSRLEKPIV--------------------GIPGKKCGTIILTAEELNCCRDAV
:::::: :::::::.. :.::::::::::.::::. :::..
XP_011 GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRAL
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:.: ::::
XP_011 TMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRAL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNVYEVVNPKKKGKKKKYT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::: :::::.
XP_011 CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 NSGTVTLLSFLVETEVSFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMNPYQLNAY
:::::::::: ::.: .::::::::::::::::::::::::::.: :: :::.:::::::
XP_011 NSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 GMALKAVGEIVQDYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAY
..:: :::::.: :::::::::::::::::::::.:::: :::: .:: : ::.:..:::
XP_011 ALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAY
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 YRSLKSVQLYGPTNFAPVINHVARYASSVKDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNAS
.:::..::::::::::::..:::: :..:.::::: ::::.:::::::::::::.::::.
XP_011 HRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 KLPMSIIIVGVGPAEFDAMVELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSM
:::::::::::: :::::::::::::::.::::: ::::::: :
XP_011 KLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQVKPRPCLPHGKFKSPSSQ
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560
pF1KE0 ARLAKDVLAEIPEQFLSYMRARGIKPSPAPPPYTPPTHVLQTQI
XP_011 ADLTPPLGASLVKGPEGRHWEPQSGPATTEGSRSQSSAMLWSGLGPPLSHLGHTPNIAGA
540 550 560 570 580 590
>>XP_016866628 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 isofor (522 aa)
initn: 2202 init1: 2135 opt: 2147 Z-score: 2239.6 bits: 424.2 E(85289): 5.2e-118
Smith-Waterman score: 2147; 84.8% identity (94.6% similar) in 369 aa overlap (137-505:25-393)
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LSKHDFLGQVFCTLGEIVGSQGSRLEKPIVGIPGKKCGTIILTAEELNCCRDAVLMQFCA
:.::::::::::.::::. :::.. :::::
XP_016 MPAVSNGSGLWMESLRTTGLEASGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVATMQFCA
10 20 30 40 50
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 NKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRALCNGDYD
:::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:.: ::::::::::
XP_016 NKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRALCNGDYD
60 70 80 90 100 110
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 RTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNVYEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVT
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::: :::::.::::::
XP_016 RTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYVNSGTVT
120 130 140 150 160 170
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LLSFLVETEVSFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMNPYQLNAYGMALKA
:::: ::.: .::::::::::::::::::::::::::.: :: :::.:::::::..:: :
XP_016 LLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAYALALTA
180 190 200 210 220 230
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 VGEIVQDYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKS
::::.: :::::::::::::::::::::.:::: :::: .:: : ::.:..:::.:::..
XP_016 VGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAYHRSLRT
240 250 260 270 280 290
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 VQLYGPTNFAPVINHVARYASSVKDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNASKLPMSI
::::::::::::..:::: :..:.::::: ::::.:::::::::::::.::::.::::::
XP_016 VQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAAKLPMSI
300 310 320 330 340 350
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 IIVGVGPAEFDAMVELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSMARLAKD
:::::: :::::::::::::::.::::: ::::::: :
XP_016 IIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQVKPRPCLPHGKFKSPSSQADLTPP
360 370 380 390 400 410
530 540 550 560
pF1KE0 VLAEIPEQFLSYMRARGIKPSPAPPPYTPPTHVLQTQI
XP_016 LGASLVKGPEGRHWEPQSGPATTEGSRSQSSAMLWSGLGPPLSHLGHTPNIAGAQPEART
420 430 440 450 460 470
>>XP_011513073 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 isofor (632 aa)
initn: 2708 init1: 2135 opt: 2147 Z-score: 2238.4 bits: 424.2 E(85289): 6.1e-118
Smith-Waterman score: 2650; 78.7% identity (88.2% similar) in 502 aa overlap (41-505:2-503)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 IGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEWREFGRTEVID
::::::.::.:.::. ::.:::::::::::
XP_011 MFSKSDPLCVMYTQGMENKQWREFGRTEVID
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 NTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTLGEIVGSQGSR
::::::::::::.::::::..::::::::::::::.:::::::::.:::::::::: :::
XP_011 NTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTLGEIVGSPGSR
40 50 60 70 80 90
140 150
pF1KE0 LEKPIV-------------------------------------GIPGKKCGTIILTAEEL
::::.. :.::::::::::.::::
XP_011 LEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGSGLWMESLRTTGLEASGGVPGKKCGTIILSAEEL
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 NCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAF
. :::.. ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:
XP_011 SNCRDVATMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTF
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 KISVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNVYEVVNPKKK
.: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::
XP_011 SIPVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKK
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 GKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEVSFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMN
:::::.:::::::::: ::.: .::::::::::::::::::::::::::.: :: :::.
XP_011 MKKKKYVNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMS
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 PYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGI
:::::::..:: :::::.: :::::::::::::::::::::.:::: :::: .:: : ::
XP_011 PYQLNAYALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGI
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 EGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFAPVINHVARYASSVKDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTK
.:..:::.:::..::::::::::::..:::: :..:.::::: ::::.::::::::::::
XP_011 DGILEAYHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTK
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 ESIVNASKLPMSIIIVGVGPAEFDAMVELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQFVPFRDYIDRS
:.::::.:::::::::::: :::::::::::::::.::::: ::::::: :
XP_011 EAIVNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQVKPRPCLPHGK
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560
pF1KE0 GNHILSMARLAKDVLAEIPEQFLSYMRARGIKPSPAPPPYTPPTHVLQTQI
XP_011 FKSPSSQADLTPPLGASLVKGPEGRHWEPQSGPATTEGSRSQSSAMLWSGLGPPLSHLGH
520 530 540 550 560 570
>>XP_011513072 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 isofor (632 aa)
initn: 2708 init1: 2135 opt: 2147 Z-score: 2238.4 bits: 424.2 E(85289): 6.1e-118
Smith-Waterman score: 2650; 78.7% identity (88.2% similar) in 502 aa overlap (41-505:2-503)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 IGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEWREFGRTEVID
::::::.::.:.::. ::.:::::::::::
XP_011 MFSKSDPLCVMYTQGMENKQWREFGRTEVID
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 NTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTLGEIVGSQGSR
::::::::::::.::::::..::::::::::::::.:::::::::.:::::::::: :::
XP_011 NTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTLGEIVGSPGSR
40 50 60 70 80 90
140 150
pF1KE0 LEKPIV-------------------------------------GIPGKKCGTIILTAEEL
::::.. :.::::::::::.::::
XP_011 LEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGSGLWMESLRTTGLEASGGVPGKKCGTIILSAEEL
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 NCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAF
. :::.. ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:
XP_011 SNCRDVATMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTF
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 KISVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNVYEVVNPKKK
.: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::
XP_011 SIPVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKK
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 GKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEVSFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMN
:::::.:::::::::: ::.: .::::::::::::::::::::::::::.: :: :::.
XP_011 MKKKKYVNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMS
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 PYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGI
:::::::..:: :::::.: :::::::::::::::::::::.:::: :::: .:: : ::
XP_011 PYQLNAYALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGI
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 EGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFAPVINHVARYASSVKDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTK
.:..:::.:::..::::::::::::..:::: :..:.::::: ::::.::::::::::::
XP_011 DGILEAYHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTK
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 ESIVNASKLPMSIIIVGVGPAEFDAMVELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQFVPFRDYIDRS
:.::::.:::::::::::: :::::::::::::::.::::: ::::::: :
XP_011 EAIVNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQVKPRPCLPHGK
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560
pF1KE0 GNHILSMARLAKDVLAEIPEQFLSYMRARGIKPSPAPPPYTPPTHVLQTQI
XP_011 FKSPSSQADLTPPLGASLVKGPEGRHWEPQSGPATTEGSRSQSSAMLWSGLGPPLSHLGH
520 530 540 550 560 570
>>XP_011513070 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 isofor (670 aa)
initn: 2837 init1: 2135 opt: 2147 Z-score: 2238.0 bits: 424.2 E(85289): 6.4e-118
Smith-Waterman score: 2779; 77.2% identity (88.8% similar) in 534 aa overlap (9-505:8-541)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
:.......:...::::.::..::::::::.: ::::::.::.:.::. ::.:
XP_011 MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
::::::::::::::::::::::.::::::..::::::::::::::.:::::::::.::::
XP_011 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTL
60 70 80 90 100 110
130 140
pF1KE0 GEIVGSQGSRLEKPIV-------------------------------------GIPGKKC
:::::: :::::::.. :.:::::
XP_011 GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGSGLWMESLRTTGLEASGGVPGKKC
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 GTIILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVK
:::::.::::. :::.. ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:
XP_011 GTIILSAEELSNCRDVATMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMK
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 NTLNPVWQAFKISVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFN
::::::::.:.: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
XP_011 NTLNPVWQTFSIPVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFN
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 VYEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEVSFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNP
.::::::::: :::::.:::::::::: ::.: .::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IYEVVNPKKKMKKKKYVNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNP
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 AQPTSPHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNG
.: :: :::.:::::::..:: :::::.: :::::::::::::::::::::.:::: :::
XP_011 SQSTSLHYMSPYQLNAYALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNG
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 NPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFAPVINHVARYASSVKDGSQYFVLLIVTD
: .:: : ::.:..:::.:::..::::::::::::..:::: :..:.::::: ::::.::
XP_011 NQENPSCCGIDGILEAYHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITD
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 GVISDMAQTKESIVNASKLPMSIIIVGVGPAEFDAMVELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQF
:::::::::::.::::.:::::::::::: :::::::::::::::.::::: :::::::
XP_011 GVISDMAQTKEAIVNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQV
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 VPFRDYIDRSGNHILSMARLAKDVLAEIPEQFLSYMRARGIKPSPAPPPYTPPTHVLQTQ
:
XP_011 KPRPCLPHGKFKSPSSQADLTPPLGASLVKGPEGRHWEPQSGPATTEGSRSQSSAMLWSG
540 550 560 570 580 590
>>XP_011513075 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 isofor (473 aa)
initn: 2081 init1: 2014 opt: 2014 Z-score: 2101.8 bits: 398.5 E(85289): 2.5e-110
Smith-Waterman score: 2014; 85.8% identity (94.8% similar) in 344 aa overlap (162-505:1-344)
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 EKPIVGIPGKKCGTIILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDG
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDG
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 SFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTS
.:::::::::.:::::::::.:.: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTS
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 YRELSRGQSQFNVYEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEVSFLDYIKGGTQINFT
::::.:::::::.::::::::: :::::.:::::::::: ::.: .::::::::::::::
XP_011 YRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYVNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFT
100 110 120 130 140 150
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 VAIDFTASNGNPAQPTSPHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSDKMFPALGFGAKLPP
::::::::::::.: :: :::.:::::::..:: :::::.: ::::::::::::::::::
XP_011 VAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAYALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPP
160 170 180 190 200 210
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 DGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFAPVINHVARYASSVKD
:::.:::: :::: .:: : ::.:..:::.:::..::::::::::::..:::: :..:.:
XP_011 DGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAYHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQD
220 230 240 250 260 270
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 GSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNASKLPMSIIIVGVGPAEFDAMVELDGDDVRVSS
:::: ::::.:::::::::::::.::::.:::::::::::: :::::::::::::::.::
XP_011 GSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISS
280 290 300 310 320 330
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 RGKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSMARLAKDVLAEIPEQFLSYMRARGIKPSPAPP
::: ::::::: :
XP_011 RGKLAERDIVQVKPRPCLPHGKFKSPSSQADLTPPLGASLVKGPEGRHWEPQSGPATTEG
340 350 360 370 380 390
>>XP_011513074 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 isofor (543 aa)
initn: 2593 init1: 1891 opt: 1891 Z-score: 1972.8 bits: 374.8 E(85289): 3.8e-103
Smith-Waterman score: 2523; 76.2% identity (88.5% similar) in 488 aa overlap (9-459:8-495)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
:.......:...::::.::..::::::::.: ::::::.::.:.::. ::.:
XP_011 MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
::::::::::::::::::::::.::::::..::::::::::::::.:::::::::.::::
XP_011 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTL
60 70 80 90 100 110
130 140
pF1KE0 GEIVGSQGSRLEKPIV-------------------------------------GIPGKKC
:::::: :::::::.. :.:::::
XP_011 GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGSGLWMESLRTTGLEASGGVPGKKC
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 GTIILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVK
:::::.::::. :::.. ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:
XP_011 GTIILSAEELSNCRDVATMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMK
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 NTLNPVWQAFKISVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFN
::::::::.:.: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
XP_011 NTLNPVWQTFSIPVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFN
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 VYEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEVSFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNP
.::::::::: :::::.:::::::::: ::.: .::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IYEVVNPKKKMKKKKYVNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNP
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 AQPTSPHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNG
.: :: :::.:::::::..:: :::::.: :::::::::::::::::::::.:::: :::
XP_011 SQSTSLHYMSPYQLNAYALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNG
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 NPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFAPVINHVARYASSVKDGSQYFVLLIVTD
: .:: : ::.:..:::.:::..::::::::::::..:::: :..:.::::: ::::.::
XP_011 NQENPSCCGIDGILEAYHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITD
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 GVISDMAQTKESIVNASKLPMSIIIVGVGPAEFDAMVELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQF
:::::::::::.::::
XP_011 GVISDMAQTKEAIVNAQPGFLCSLSLSALPLPTPFSVFLCLSMFTLPFLSCPPLPVLPLI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]