Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0033
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0033, 564 aa
1>>>pF1KE0033 564 - 564 aa - 564 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9426+/-0.00083; mu= 16.1341+/- 0.050
mean_var=77.3511+/-15.478, 0's: 0 Z-trim(107.8): 61 B-trim: 88 in 2/50
Lambda= 0.145828
statistics sampled from 9748 (9809) to 9748 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16
Scan time: 3.190
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12 ( 564) 3764 801.4 0
CCDS2574.2 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 ( 553) 2929 625.7 4.4e-179
CCDS77695.1 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 ( 503) 2638 564.5 1.1e-160
CCDS4825.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 ( 593) 2430 520.8 1.9e-147
CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16 ( 548) 1841 396.8 3.5e-110
CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8 ( 537) 1839 396.4 4.6e-110
CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 ( 542) 1795 387.2 2.8e-107
CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 ( 537) 1794 386.9 3.2e-107
CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 ( 557) 1767 381.3 1.7e-105
CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 ( 575) 1767 381.3 1.8e-105
CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 ( 558) 1712 369.7 5.2e-102
CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 ( 557) 1671 361.1 2.1e-99
CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 ( 612) 1671 361.1 2.2e-99
CCDS83078.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 ( 301) 1548 335.1 7.5e-92
CCDS10980.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 ( 633) 1412 306.6 5.8e-83
>>CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12 (564 aa)
initn: 3764 init1: 3764 opt: 3764 Z-score: 4277.9 bits: 801.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3764; 99.8% identity (99.8% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
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CCDS87 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GEIVGSQGSRLEKPIVGIPGKKCGTIILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKSDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GEIVGSQGSRLEKPIVGIPGKKCGTIILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKSDP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 FLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNVYEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEVSFLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 SHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNVYEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEVSFLD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 YIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSDKMF
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 YIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSLHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSDKMF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 PALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFAPVIN
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CCDS87 PALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFAPVIN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 HVARYASSVKDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNASKLPMSIIIVGVGPAEFDAMV
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CCDS87 HVARYASSVKDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNASKLPMSIIIVGVGPAEFDAMV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 ELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSMARLAKDVLAEIPEQFLSYMR
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CCDS87 ELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSMARLAKDVLAEIPEQFLSYMR
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE0 ARGIKPSPAPPPYTPPTHVLQTQI
::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ARGIKPSPAPPPYTPPTHVLQTQI
550 560
>>CCDS2574.2 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 (553 aa)
initn: 2941 init1: 2917 opt: 2929 Z-score: 3328.7 bits: 625.7 E(32554): 4.4e-179
Smith-Waterman score: 2929; 78.2% identity (94.4% similar) in 537 aa overlap (20-555:10-544)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
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CCDS25 MSLGGASERSVPATKIEITVSCRNLLDLDTFSKSDPMVVLYTQSRASQEW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSK-HDFLGQVFCT
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CCDS25 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFVLDYFFEEKQNLRFDVYNVDSKT-NISKPKDFLGQAFLA
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LGEIVGSQGSRLEKPIVGIPGKKCGTIILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKSD
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CCDS25 LGEVIGGQGSRVERTLTGVPGKKCGTILLTAEELSNCRDIATMQLCANKLDKKDFFGKSD
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRD
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CCDS25 PFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVVKNTLNPVWQPFSIPVRALCNGDYDRTVKIDVYDWDRD
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNVYEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEVSFL
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CCDS25 GSHDFIGEFTTSYRELSKAQNQFTVYEVLNPRKKCKKKKYVNSGTVTLLSFSVDSEFTFV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 DYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSDKM
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CCDS25 DYIKGGTQLNFTVAIDFTASNGNPLQPTSLHYMSPYQLSAYAMALKAVGEIIQDYDSDKL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 FPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFAPVI
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CCDS25 FPAYGFGAKLPPEGRISHQFPLNNNDEDPNCAGIEGVLESYFQSLRTVQLYGPTYFAPVI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 NHVARYASSVKDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNASKLPMSIIIVGVGPAEFDAM
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CCDS25 NQVARAAAKISDGSQYYVLLIITDGVISDMTQTKEAIVSASSLPMSIIIVGVGPAMFEAM
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 VELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSMARLAKDVLAEIPEQFLSYM
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CCDS25 EELDGDDVRVSSRGRYAERDIVQFVPFRDYVDRSGNQVLSMARLAKDVLAEIPEQLLSYM
470 480 490 500 510 520
540 550 560
pF1KE0 RARGIKPSPAPPPYTPPTHVLQTQI
:.: :.: : ::: .:
CCDS25 RTRDIQPRP-PPPANPSPIPAPEQP
530 540 550
>>CCDS77695.1 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 (503 aa)
initn: 2633 init1: 2633 opt: 2638 Z-score: 2998.4 bits: 564.5 E(32554): 1.1e-160
Smith-Waterman score: 2638; 78.1% identity (94.6% similar) in 484 aa overlap (20-502:10-492)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
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CCDS77 MSLGGASERSVPATKIEITVSCRNLLDLDTFSKSDPMVVLYTQSRASQEW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSK-HDFLGQVFCT
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CCDS77 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFVLDYFFEEKQNLRFDVYNVDSKT-NISKPKDFLGQAFLA
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LGEIVGSQGSRLEKPIVGIPGKKCGTIILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKSD
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CCDS77 LGEVIGGQGSRVERTLTGVPGKKCGTILLTAEELSNCRDIATMQLCANKLDKKDFFGKSD
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRD
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CCDS77 PFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVVKNTLNPVWQPFSIPVRALCNGDYDRTVKIDVYDWDRD
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNVYEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEVSFL
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CCDS77 GSHDFIGEFTTSYRELSKAQNQFTVYEVLNPRKKCKKKKYVNSGTVTLLSFSVDSEFTFV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 DYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSDKM
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CCDS77 DYIKGGTQLNFTVAIDFTASNGNPLQPTSLHYMSPYQLSAYAMALKAVGEIIQDYDSDKL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 FPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFAPVI
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CCDS77 FPAYGFGAKLPPEGRISHQFPLNNNDEDPNCAGIEGVLESYFQSLRTVQLYGPTYFAPVI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 NHVARYASSVKDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNASKLPMSIIIVGVGPAEFDAM
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CCDS77 NQVARAAAKISDGSQYYVLLIITDGVISDMTQTKEAIVSASSLPMSIIIVGVGPAMFEAM
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 VELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSMARLAKDVLAEIPEQFLSYM
:::::::::::::.::::::::
CCDS77 EELDGDDVRVSSRGRYAERDIVQEGCCSLGTSVV
470 480 490 500
>>CCDS4825.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 (593 aa)
initn: 3105 init1: 2403 opt: 2430 Z-score: 2760.8 bits: 520.8 E(32554): 1.9e-147
Smith-Waterman score: 3097; 77.5% identity (90.3% similar) in 586 aa overlap (9-564:8-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
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CCDS48 MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
::::::::::::::::::::::.::::::..::::::::::::::.:::::::::.::::
CCDS48 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE0 GEIVGSQGSRLEKPIV--------------------GIPGKKCGTIILTAEELNCCRDAV
:::::: :::::::.. :.::::::::::.::::. :::..
CCDS48 GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRAL
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:.: ::::
CCDS48 TMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRAL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNVYEVVNPKKKGKKKKYT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::: :::::.
CCDS48 CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 NSGTVTLLSFLVETEVSFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMNPYQLNAY
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CCDS48 NSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 GMALKAVGEIVQDYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAY
..:: :::::.: :::::::::::::::::::::.:::: :::: .:: : ::.:..:::
CCDS48 ALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAY
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 YRSLKSVQLYGPTNFAPVINHVARYASSVKDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNAS
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CCDS48 HRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 KLPMSIIIVGVGPAEFDAMVELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSM
:::::::::::: :::::::::::::::.::::: ::::::::::::::.::.:::.:::
CCDS48 KLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSM
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560
pF1KE0 ARLAKDVLAEIPEQFLSYMRARGIKPSPAP----------PPYTPPTHVLQTQI
::::.:::::::.:..:::.:.::.: : : : :::. :.:.:
CCDS48 ARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
540 550 560 570 580 590
>>CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16 (548 aa)
initn: 1491 init1: 828 opt: 1841 Z-score: 2091.6 bits: 396.8 E(32554): 3.5e-110
Smith-Waterman score: 1841; 51.5% identity (77.9% similar) in 534 aa overlap (25-551:25-547)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
.::.::: .::::::. :::::.:::.... : .:
CCDS10 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTENNG--RW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
:. :::. :.::: : .::.::: ::: ..:.: :.: :..: :..:::::: :.:
CCDS10 IEYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSCSL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE0 GEIVGSQGSRLEKPIVGIPGKKCGT--IILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKS
: ::.:. .. .:.. . : : : ..:.::. : .. ... . .:::::.::::
CCDS10 GTIVSSK--KITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSDNR-VITLSLAGRRLDKKDLFGKS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDR
:::: ::. ..::.. . :.:::.: ::.:::. : . . .::.::... :.: ::.:
CCDS10 DPFLEFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNV-YEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEVS
::.::::::: :: .. ..... . .: .::::. :::.: ::: . : : .. . :
CCDS10 DGGHDFIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDYS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 FLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSD
::::: :: :. :::.:::::::::: .:.: ::.::. : : :. :::.:.::::::
CCDS10 FLDYILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 KMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFAP
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CCDS10 KMFPALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFSP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 VINHVARYASSV---KDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNASKLPMSIIIVGVGPA
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CCDS10 IVNHVARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGNA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 EFDAMVELDGDDVRVSSR-GKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSMARLAKDVLAEIPE
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CCDS10 DFAAMEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREF--RNA----AKETLAKAVLAELPQ
480 490 500 510 520
540 550 560
pF1KE0 QFLSYMRARGIKPSPAPPPYTPPTHVLQTQI
: ..:.. ... :. . :
CCDS10 QVVQYFKHKNLPPTNSEPA
530 540
>>CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8 (537 aa)
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10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
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CCDS62 YEVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTL
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130 140 150 160 170
pF1KE0 GEIVGSQGSRLEKPIV---GIPGKKCGTIILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGK
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CCDS62 GQIVSSK--KLTRPLVMKTGRPAGK-GSITISAEEIKDNR-VVLFEMEARKLDNKDLFGK
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:::.: :.... ::.. . :.::::::.:::::. ::::. .:: ::.:.::::: ::.:
CCDS62 SDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYD
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pF1KE0 RDGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNV-YEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEV
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CCDS62 NDGSHDLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVEC
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pF1KE0 SFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDS
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CCDS62 TFLDYIMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDA
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pF1KE0 DKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFA
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CCDS62 DKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFS
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pF1KE0 PVINHVARYASSV---KDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNASKLPMSIIIVGVGP
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CCDS62 PIINHVARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGG
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pF1KE0 AEFDAMVELDGDDVRVSSR-GKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSMARLAKDVLAEIP
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CCDS62 ADFSAMEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEA------LAQCVLAEIP
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540 550 560
pF1KE0 EQFLSYMRARGIKPSPAPPPYTPPTHVLQTQI
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CCDS62 QQVVGYFNTYKLLPPKNPATKQQKQ
520 530
>>CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 (542 aa)
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Smith-Waterman score: 1795; 50.1% identity (75.9% similar) in 555 aa overlap (14-561:1-541)
10 20 30 40 50 60
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.... : .: :..:.:: .:.:.: :::::.::: .: ::. :
CCDS46 MKMMHMAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVL-LQDVGGGSW
10 20 30 40
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pF1KE0 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
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CCDS46 AELGRTERVRNCSSPEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSL
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130 140 150 160 170
pF1KE0 GEIVGSQGSRLEKPIVGIPGKKCG--TIILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKS
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CCDS46 GQIVSSQ--VLTLPLMLKPGKPAGRGTITVSAQELKDNR-VVTMEVEARNLDKKDFLGKS
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:::: :.:.. ::.. . ...::.::.:::.:. :.. :. .:.:. . :.:. :.:
CCDS46 DPFLEFFRQG-DGKWHLVYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDS
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CCDS46 DGSHDLIGTFHTSLAQLQAVPAEF---ECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSF
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pF1KE0 LDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSDK
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CCDS46 LDYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDK
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pF1KE0 MFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFAPV
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CCDS46 LFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPI
340 350 360 370 380 390
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pF1KE0 INHVARYAS-SVKDG--SQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNASKLPMSIIIVGVGPAE
::::::.:. ....: ::::.::..:::...:. :.:..: ::.::::.:::::: :.
CCDS46 INHVARFAAQAAHQGTASQYFMLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGGAD
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pF1KE0 FDAMVELDGDDVRVSSR-GKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSMARLAKDVLAEIPEQ
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CCDS46 FEAMEQLDADGGPLHTRSGQAAARDIVQFVPYRRFQN------APREALAQTVLAEVPTQ
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pF1KE0 FLSYMRARGIKP-SPAPPPYTPPTHVLQTQI
..::.::.: : .: :: :... :
CCDS46 LVSYFRAQGWAPLKPLPPSAKDPAQAPQA
520 530 540
>>CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 (537 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
: :..:.:: .:.:.: :::::.::: .: ::. :
CCDS13 MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVL-LQDVGGGSW
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
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CCDS13 AELGRTERVRNCSSPEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSL
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pF1KE0 GEIVGSQGSRLEKPIVGIPGKKCG--TIILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKS
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CCDS13 GQIVSSQ--VLTLPLMLKPGKPAGRGTITVSAQELKDNR-VVTMEVEARNLDKKDFLGKS
110 120 130 140 150
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pF1KE0 DPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDR
:::: :.:.. ::.. . ...::.::.:::.:. :.. :. .:.:. . :.:. :.:
CCDS13 DPFLEFFRQG-DGKWHLVYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDS
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNVYEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEVSF
:::::.:: : :: .:. ..: : ..:.:. :::.: ::::. . :::: ::
CCDS13 DGSHDLIGTFHTSLAQLQAVPAEF---ECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSF
220 230 240 250 260 270
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pF1KE0 LDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSDK
:::. :: ::::::..:::.:::.:..: : ::..: .: : ::: .:: .::::::::
CCDS13 LDYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDK
280 290 300 310 320 330
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CCDS13 LFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPI
340 350 360 370 380 390
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pF1KE0 INHVARYAS-SVKDG--SQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNASKLPMSIIIVGVGPAE
::::::.:. ....: ::::.::..:::...:. :.:..: ::.::::.:::::: :.
CCDS13 INHVARFAAQAAHQGTASQYFMLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGGAD
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pF1KE0 FDAMVELDGDDVRVSSR-GKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSMARLAKDVLAEIPEQ
:.:: .::.: . .: :. : ::::::::.: . . ::. ::::.: :
CCDS13 FEAMEQLDADGGPLHTRSGQAAARDIVQFVPYRRFQNA------PREALAQTVLAEVPTQ
460 470 480 490 500
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pF1KE0 FLSYMRARGIKP-SPAPPPYTPPTHVLQTQI
..::.::.: : .: :: :... :
CCDS13 LVSYFRAQGWAPLKPLPPSAKDPAQAPQA
510 520 530
>>CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 (557 aa)
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CCDS30 MKKMSNIYESAANTLGIFN--SPCL--TKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQSHG
10 20 30 40 50
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pF1KE0 NKEWREFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQV
.: : ::::: . .:: . . : .:..::: . :::...:..:. .:.. :::: .
CCDS30 --QWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGM
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pF1KE0 FCTLGEIVGSQGSRLEKPIV---GIPGKKCGTIILTAEELNCCRDAVLMQFCANKLDKKD
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CCDS30 ECTLGQIVSQR--KLSKSLLKHGNTAGKSSITVI--AEELSGNDDYVELAFNARKLDDKD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FFGKSDPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRALCNGDYDRTIKVEV
::.:::::: ..: :.:.. . :.:::: :.:.:.:..::.:: .::.:: :: .: :
CCDS30 FFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 YDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSRG--QSQFNVYEVVNPKKKGKKKKYTNSGTVTLLSFL
.::: .:.::::::::....:. :: ... .: .::: :.:::.: ::::: :
CCDS30 WDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEM-RGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCK
240 250 260 270 280
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pF1KE0 VETEVSFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMNPYQLNAYGMALKAVGEIV
.. :::::: :: ::.::::::::::::.: . : ::..::: : : :: :::::
CCDS30 IHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEIC
290 300 310 320 330 340
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pF1KE0 QDYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAYYRSLKSVQLYG
:::::::::::.::::..::. .::.::.: : .:: : ::.::.::: : ..::::
CCDS30 QDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYG
350 360 370 380 390 400
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pF1KE0 PTNFAPVINHVARYAS---SVKDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNASKLPMSIII
:::.::.:..::. :: ..:..::::.:::.:::::.:::.:.:.::.::.::::.::
CCDS30 PTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVII
410 420 430 440 450 460
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pF1KE0 VGVGPAEFDAMVELDGDD-VRVSSRGKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSMARLAKDV
:::: :.:. : ::::: . : .:. . ::::::::::.. .: : : :::.:
CCDS30 VGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNF-----KHA-SPAALAKSV
470 480 490 500 510 520
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pF1KE0 LAEIPEQFLSYMRARGIKPSPAPPPYTPPTHVLQTQI
:::.:.: ..:. ..::::
CCDS30 LAEVPNQVVDYYNGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP
530 540 550
>>CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 (575 aa)
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Smith-Waterman score: 1767; 51.8% identity (76.3% similar) in 556 aa overlap (1-546:22-560)
10 20 30
pF1KE0 MDSRYNSTAG-IGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDR
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CCDS75 MAVEPSSSESIKRRAGRRMKKMSNIYESAANTLGIFN--SPCL--TKVELRVACKGISDR
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 DTFSKSDPICVLYVQGVGNKEWREFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLY
:..:: :: .: .:. : .: : ::::: . .:: . . : .:..::: . :::...
CCDS75 DALSKPDPCVILKMQSHG--QWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVH
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 DVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTLGEIVGSQGSRLEKPIV---GIPGKKCGTIILTAEELNC
:..:. .:.. :::: . ::::.::... .: : .. . ::. :.: ::::.
CCDS75 DISSNHNGLKEADFLGGMECTLGQIVSQR--KLSKSLLKHGNTAGKSSITVI--AEELSG
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 CRDAVLMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKI
: : . : : ::: ::::.:::::: ..: :.:.. . :.:::: :.:.:.:..::.
CCDS75 NDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKV
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 SVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSRG--QSQFNVYEVVNPKKK
:: .::.:: :: .: :.::: .:.::::::::....:. :: ... .: .::: :
CCDS75 SVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEM-RGAMEGKQVQWECINPKYK
240 250 260 270 280
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pF1KE0 GKKKKYTNSGTVTLLSFLVETEVSFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSPHYMN
.:::.: ::::: : .. :::::: :: ::.::::::::::::.: . : ::..
CCDS75 AKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIH
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 PYQLNAYGMALKAVGEIVQDYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGI
::: : : :: ::::: :::::::::::.::::..::. .::.::.: : .:: : ::
CCDS75 PYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGI
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 EGVMEAYYRSLKSVQLYGPTNFAPVINHVARYAS---SVKDGSQYFVLLIVTDGVISDMA
.::.::: : ..:::::::.::.:..::. :: ..:..::::.:::.:::::.:::
CCDS75 QGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMA
410 420 430 440 450 460
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pF1KE0 QTKESIVNASKLPMSIIIVGVGPAEFDAMVELDGDD-VRVSSRGKYAERDIVQFVPFRDY
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CCDS75 DTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNF
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