Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0006
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0006, 521 aa
1>>>pF1KE0006 521 - 521 aa - 521 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3227+/-0.00101; mu= 18.0159+/- 0.061
mean_var=61.1225+/-11.964, 0's: 0 Z-trim(102.9): 22 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.164049
statistics sampled from 7128 (7142) to 7128 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 2.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4301.1 TIGD6 gene_id:81789|Hs108|chr5 ( 521) 3466 829.2 0
CCDS34079.1 TIGD4 gene_id:201798|Hs108|chr4 ( 512) 989 243.0 6.2e-64
CCDS10500.1 TIGD7 gene_id:91151|Hs108|chr16 ( 549) 520 132.0 1.7e-30
CCDS75797.1 JRK gene_id:8629|Hs108|chr8 ( 556) 455 116.6 7.4e-26
CCDS75796.1 JRK gene_id:8629|Hs108|chr8 ( 568) 455 116.6 7.5e-26
CCDS8308.1 JRKL gene_id:8690|Hs108|chr11 ( 524) 448 115.0 2.2e-25
CCDS3633.1 TIGD2 gene_id:166815|Hs108|chr4 ( 525) 433 111.4 2.6e-24
CCDS2495.1 TIGD1 gene_id:200765|Hs108|chr2 ( 591) 403 104.3 3.9e-22
CCDS13064.1 CENPB gene_id:1059|Hs108|chr20 ( 599) 348 91.3 3.3e-18
CCDS6406.2 TIGD5 gene_id:84948|Hs108|chr8 ( 642) 284 76.2 1.3e-13
CCDS8101.1 TIGD3 gene_id:220359|Hs108|chr11 ( 471) 262 70.9 3.6e-12
CCDS1254.1 POGK gene_id:57645|Hs108|chr1 ( 609) 246 67.2 6.2e-11
>>CCDS4301.1 TIGD6 gene_id:81789|Hs108|chr5 (521 aa)
initn: 3466 init1: 3466 opt: 3466 Z-score: 4429.5 bits: 829.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3466; 99.8% identity (100.0% similar) in 521 aa overlap (1-521:1-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MANKGNKKRRQFSLEEKMKVVGAVDSGKRKGDVAKEFGITPSTLSTFLKDRTKFEEKVRE
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CCDS43 MANKGNKKRRQFSLEEKMKVVGAVDSGKRKGDVAKEFGITPSTLSTFLKDRTKFEEKVRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ASVGPQRKRMRSALYDDIDKAVFAWFQEIHAKNILVTGSVIRKKALNLANMLGYDNFQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ASVGPQRKRMRSALYDDIDKAVFAWFQEIHAKNILVTGSVIRKKALNLANMLGYDNFQAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VGWLNRFRDRHGIALKAVCREDSDRLMNGLGIDKINEWHAGEIIKLIADYSPDDIFNADE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VGWLNRFRDRHGIALKAVCREDSDRLMNGLGIDKINEWHAGEIIKLIADYSPDDIFNADE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TGVFFQLLPQHTLAAKGDHCRGGKKAKQRLTALFCCNASGTEKMRPLIVGRSASPHCLKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TGVFFQLLPQHTLAAKGDHCRGGKKAKQRLTALFCCNASGTEKMRPLIVGRSASPHCLKN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IHSFPCDYRANQWAWMTRDLFNEWLMQVDARMKRAERRILLLIDNCSAHNMLPHLERIQV
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IHSLPCDYRANQWAWMTRDLFNEWLMQVDARMKRAERRILLLIDNCSAHNMLPHLERIQV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 GYLPSNCTAVLQPLNLGIIHTMKVLYQSHLLKQILLKLNSSEDQEEVDIKQAIDMIAAAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GYLPSNCTAVLQPLNLGIIHTMKVLYQSHLLKQILLKLNSSEDQEEVDIKQAIDMIAAAW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 WSVKPSTVVKCWQKAGIVPMEFAECDTESAASEPDIAIEKLWHTVAIATCVPNEVNFQDF
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CCDS43 WSVKPSTVVKCWQKAGIVPMEFAECDTESAASEPDIAIEKLWHTVAIATCVPNEVNFQDF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 VTADDDLIISQDTDIIQDMVAGENTSEAGSEDEGEVSLPEQPKVTITEAISSVQKLRQFL
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CCDS43 VTADDDLIISQDTDIIQDMVAGENTSEAGSEDEGEVSLPEQPKVTITEAISSVQKLRQFL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE0 STCVDIPDAIFGQLNGIDEYLMKRVTQTLIDSKITDFLQTK
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CCDS43 STCVDIPDAIFGQLNGIDEYLMKRVTQTLIDSKITDFLQTK
490 500 510 520
>>CCDS34079.1 TIGD4 gene_id:201798|Hs108|chr4 (512 aa)
initn: 852 init1: 411 opt: 989 Z-score: 1261.3 bits: 243.0 E(32554): 6.2e-64
Smith-Waterman score: 989; 30.1% identity (69.7% similar) in 501 aa overlap (7-501:16-506)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MANKGNKKRRQFSLEEKMKVVGAVDSGKRKGDVAKEFGITPSTLSTFLKDR
::....:.:::. ...::.:::.:...: :.:: ..::...:..
CCDS34 MAEASVDASTLPVTVKKKKSLSIEEKIDIINAVESGKKKAEIAAEYGIKKNSLSSIMKNK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TKFEEKVREASVGPQRKRMRSALYDDIDKAVFAWFQEIHAKNILVTGSVIRKKALNLANM
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CCDS34 DKVLEAFESLRFDPKRKRLRTAFYTDLEEALMRWYRIAQCLNVPVNGPMLRLKANDFAQK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LGYDNFQASVGWLNRFRDRHGIALKAVCREDSDRLMNGLGIDKINEWHAGEIIKLIADYS
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CCDS34 LGHNDFKCSNGWLDRFKSRYGLVFRAQPVEAT-----GVPVDPSTVWYQNVLPYYLNDYH
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PDDIFNADETGVFFQLLPQHTLAAKGDHCRGGKKAKQRLTALFCCNASGTEKMRPLIVGR
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CCDS34 PKNVFNIKETGLLYRMLPTNTFAFKGETCSVGKLCKDRITLVVGTNMDGSEKLPLLVIGK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SASPHCLKNIHSFPCDYRANQWAWMTRDLFNEWLMQVDARMKRAERRILLLIDNCSAHNM
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CCDS34 KRTPHCFKGLKSLPVCYEANRMAWMTSDVFEQWMRKLDEEFQAQQRRVVIFVESFPAHPE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LPHLERIQVGYLPSNCTAVLQPLNLGIIHTMKVLYQSHLLKQILLKLNSSEDQEEVDIKQ
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CCDS34 VKNLKSIELAFFPSCLSSKCIAMKQGVIKSLKIKYRHCLIKKFLSSVEGSKE-FTFSLLD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 AIDMIAAAWWSVKPSTVVKCWQKAGIVPMEFAECDTESAASEPDIAIEKLWHTVAIATCV
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CCDS34 AVDTLHLCWRAVTPETIVKSYEEAGFKSQK-GESDITNA--EKDTGLDLVADALGAGVEF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE0 PNEVNFQDFVTADDDLIISQDTDIIQDMVAGENTS-EAG---SEDEGEVSLP--EQPKVT
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CCDS34 PEGLSIEEYAALDDDLETCEAAPNGDSICTKESKSDETGFYTSDEEDDDGSPGTELPLPS
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 ITEAISSVQKLRQFLSTCVDIPDAIFGQLNGIDEYLMKRVTQTLIDSKITDFLQTK
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CCDS34 KSEAITALDTLKKFLRSQ-DMNDGLQNSLADLENFINSLSPK
480 490 500 510
>>CCDS10500.1 TIGD7 gene_id:91151|Hs108|chr16 (549 aa)
initn: 490 init1: 195 opt: 520 Z-score: 661.0 bits: 132.0 E(32554): 1.7e-30
Smith-Waterman score: 666; 31.9% identity (61.9% similar) in 407 aa overlap (1-373:1-400)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MANKGNKKRRQFSLEEKMKVVGAVDSGKRKGDVAKEFGITPSTLSTFLKDRT---KFEEK
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CCDS10 MNKRG--KYTTLNLEEKMKVLSRIEAGRSLKSVMDEFGISKSTFYDIKKNKKLILDFVLK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VREASVGPQ-RKRMRSALYDDIDKAVFAWFQEIHAKNILVTGSVIRKKALNLANMLGYDN
:: . ::: .: : :.: ::. :.:. .. .. : : .. : .: .: .
CCDS10 QDMPLVGAEKRKRTTGAKYGDVDDAVYMWYQQKRSAGVPVRGVELQAAAERFARCFGRTD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 FQASVGWLNRFRDRHGIALKAVCREDSDRLMNGLGIDKINEWHA--GEIIKLIADYSPDD
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CCDS10 FKASTGWLFRFRNRHAIGNRKGCGE---QVLSSVS-ENVEPFRQKLSMIIKE-EKLCLAQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IFNADETGVFFQLLPQHTLAAKGDHCRGGKKA-KQRLTALFCCNASGTEKMRPLIVGRSA
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CCDS10 LYSGDETDLFWKSMPENSQASRKDICLPGKKINKERLSAFLCANADGTHKLKSIIIGKSK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE0 SPHCLK-NIHSFPCDYRANQWAWMTRDLFNEWLMQ--VDA---------RMKRAERRILL
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CCDS10 LPKSVKEDTSTLPVIYKPSKDVWFTRELFSEWFFQNFVPEVRHFQLNVLRFHDEDVRALL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE0 LIDNCSAHNMLPHLE----RIQVGYLPSNCTAVLQPLNLGIIHTMKVLYQSHLLKQILLK
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CCDS10 LLDSCPAHPSSESLTSEDGRIKCMFFPHNTSTLIQPMNQGVILSCKRLYRWKQLEESLVI
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KE0 LNSSEDQEE-----------VDIKQAIDMIAAAWWSVKPSTVVKCWQKAGIVPMEFAECD
.. :.:..: .::.:: : .: :: :... :.
CCDS10 FEESDDEQEKGDKGVSKIKIYNIKSAIFNWAKSWEEVKQITIANAWENLLYKKEPEYDFQ
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 TESAASEPDIAIEKLWHTVAIATCVPNEVNFQDFVTADDDLIISQDTDIIQDMVAGENTS
CCDS10 GLEHGDYREILEKCGELETKLDDDRVWLNGDEEKGCLLKTKGGITKEVVQKGGEAEKQTA
420 430 440 450 460 470
>>CCDS75797.1 JRK gene_id:8629|Hs108|chr8 (556 aa)
initn: 432 init1: 193 opt: 455 Z-score: 577.7 bits: 116.6 E(32554): 7.4e-26
Smith-Waterman score: 476; 25.6% identity (60.5% similar) in 418 aa overlap (3-399:10-404)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MANKGNKKRRQ-FSLEEKMKVVGAVDSGKRKGDVAKEFGITPSTLSTFLKDRT
..:.:..: ..:.::. . ...:. . . .:... ::: . ..
CCDS75 MASKPAAGKSRGEKRKRVVLTLKEKIDICTRLEKGESRKALMQEYNVGMSTLYDIRAHKA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE0 ---KFEEKVREASVGPQRKRMRSALYDDIDKAVFAWFQEIHAKNILVTGSVIRKKALNLA
.: . .. ::. ... . .:.... :: ..... :.: .. .:: ..
CCDS75 QLLRFFASSDSNKALEQRRTLHTPKLEHLDRVLYEWFLGKRSEGVPVSGPMLIEKAKDFY
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 NMLGYDNFQA-SVGWLNRFRDRHGIA-LKAVCREDSDRLMNGLGIDKINEWHAGEIIKLI
... . . : ::: ::. :::: : : ...: . . : . . .:
CCDS75 EQMQLTEPCVFSGGWLWRFKARHGIKKLDASSEKQS-------ADHQAAEQFCAFFRSLA
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ADY--SPDDIFNADETGVFFQLLPQHTLAAKGDHCRGGKKAKQRLTALFCCNASGTEKMR
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CCDS75 AEHGLSAEQVYNADETGLFWRCLPNPT--PEGGAVPGPKQGKDRLTVLMCANATGSHRLK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 PLIVGRSASPHCLKNIHSFPCDYRANQWAWMTRDLFNEWLMQVDARMKRAERRIL-----
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CCDS75 PLAIGKCSGPRAFKGIQHLPVAYKAQGNAWVDKEIFSDWFHHIFVPSVREHFRTIGLPED
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE0 ----LLIDNCSAHNMLPHLERIQVG--YLPSNCTAVLQPLNLGIIHTMKVLYQSHLLKQI
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CCDS75 SKAVLLLDSSRAHPQEAELVSSNVFTIFLPASVASLVQPMEQGI---RRDFMRNFINPPV
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 LLKLNSSEDQEEVDIKQAIDMIAAAWWSVKPSTVVK-CWQKAGIVP-MEFAECDTESAAS
:. . . ....:: .: :: .: :: : . :.: . : . ::: ...:
CCDS75 PLQ----GPHARYNMNDAIFSVACAWNAV-PSHVFRRAWRK--LWPSVAFAE----GSSS
350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 EPDIAIEKLWHTVAIATCVPNEVNFQDFVTADDDLIISQDTDIIQDMVAGENTSEAGSED
: .. :
CCDS75 EEELEAECFPVKPHNKSFAHILELVKEGSSCPGQLRQRQAASWGVAGREAEGGRPPAATS
400 410 420 430 440 450
>>CCDS75796.1 JRK gene_id:8629|Hs108|chr8 (568 aa)
initn: 432 init1: 193 opt: 455 Z-score: 577.6 bits: 116.6 E(32554): 7.5e-26
Smith-Waterman score: 476; 25.6% identity (60.5% similar) in 418 aa overlap (3-399:10-404)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MANKGNKKRRQ-FSLEEKMKVVGAVDSGKRKGDVAKEFGITPSTLSTFLKDRT
..:.:..: ..:.::. . ...:. . . .:... ::: . ..
CCDS75 MASKPAAGKSRGEKRKRVVLTLKEKIDICTRLEKGESRKALMQEYNVGMSTLYDIRAHKA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE0 ---KFEEKVREASVGPQRKRMRSALYDDIDKAVFAWFQEIHAKNILVTGSVIRKKALNLA
.: . .. ::. ... . .:.... :: ..... :.: .. .:: ..
CCDS75 QLLRFFASSDSNKALEQRRTLHTPKLEHLDRVLYEWFLGKRSEGVPVSGPMLIEKAKDFY
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 NMLGYDNFQA-SVGWLNRFRDRHGIA-LKAVCREDSDRLMNGLGIDKINEWHAGEIIKLI
... . . : ::: ::. :::: : : ...: . . : . . .:
CCDS75 EQMQLTEPCVFSGGWLWRFKARHGIKKLDASSEKQS-------ADHQAAEQFCAFFRSLA
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ADY--SPDDIFNADETGVFFQLLPQHTLAAKGDHCRGGKKAKQRLTALFCCNASGTEKMR
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CCDS75 AEHGLSAEQVYNADETGLFWRCLPNPT--PEGGAVPGPKQGKDRLTVLMCANATGSHRLK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 PLIVGRSASPHCLKNIHSFPCDYRANQWAWMTRDLFNEWLMQVDARMKRAERRIL-----
:: .:. ..:. .:.:. .: :.:. ::. ...:..:. .. . : . : .
CCDS75 PLAIGKCSGPRAFKGIQHLPVAYKAQGNAWVDKEIFSDWFHHIFVPSVREHFRTIGLPED
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE0 ----LLIDNCSAHNMLPHLERIQVG--YLPSNCTAVLQPLNLGIIHTMKVLYQSHLLKQI
::.:. :: . .: .: .::.. ....::.. :: . .... . .
CCDS75 SKAVLLLDSSRAHPQEAELVSSNVFTIFLPASVASLVQPMEQGI---RRDFMRNFINPPV
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 LLKLNSSEDQEEVDIKQAIDMIAAAWWSVKPSTVVK-CWQKAGIVP-MEFAECDTESAAS
:. . . ....:: .: :: .: :: : . :.: . : . ::: ...:
CCDS75 PLQ----GPHARYNMNDAIFSVACAWNAV-PSHVFRRAWRK--LWPSVAFAE----GSSS
350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 EPDIAIEKLWHTVAIATCVPNEVNFQDFVTADDDLIISQDTDIIQDMVAGENTSEAGSED
: .. :
CCDS75 EEELEAECFPVKPHNKSFAHILELVKEGSSCPGQLRQRQAASWGVAGREAEGGRPPAATS
400 410 420 430 440 450
>>CCDS8308.1 JRKL gene_id:8690|Hs108|chr11 (524 aa)
initn: 421 init1: 124 opt: 448 Z-score: 569.2 bits: 115.0 E(32554): 2.2e-25
Smith-Waterman score: 642; 28.2% identity (61.4% similar) in 515 aa overlap (5-488:3-502)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MANKGNKKRRQFSLEEKMKVVGAVDSGKRKGDVAKEFGITPSTLSTFLKDRTK---FEEK
:..:: .....:. .. ...: . ..: .:: .:. . :.. : . .
CCDS83 MSGKRKRVVLTIKDKLDIIKKLEDGGSSKQLAVIYGIGETTVRDIRKNKEKIITYASS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VREASVGPQRKRMRSALYDDIDKAVFAWFQEIHAKNILVTGSVIRKKALNLANMLGYD-N
.:. .:: :. ..:...:.:.. ::.. .::. ..: . :.: . ::.: .
CCDS83 SDSTSLLAKRKSMKPSMYEELDRAMLEWFNQQRAKGNPISGPICAKRAEFFFYALGMDGD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 FQASVGWLNRFRDRHGIALKAVCREDSDRLMNGLGIDKINEWHAGEIIKLIA--DYSPDD
:. :.:::.::..::.: :: . : : . : ... .: . .:..
CCDS83 FNPSAGWLTRFKQRHSI------REINIRNERLNGDETAVEDFCNNFRDFIERENLQPEQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IFNADETGVFFQLLPQHTLAAKGDHCR--GGKKAKQRLTALFCCNASGTEKMRPLIVGRS
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CCDS83 Q
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start: Fri Nov 4 08:36:08 2016 done: Fri Nov 4 08:36:08 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]