FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0002, 579 aa 1>>>pF1KE0002 579 - 579 aa - 579 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1418+/-0.000694; mu= 12.6905+/- 0.042 mean_var=141.6075+/-28.522, 0's: 0 Z-trim(115.0): 11 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.107778 statistics sampled from 15592 (15600) to 15592 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.781), E-opt: 0.2 (0.479), width: 16 Scan time: 3.690 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5689.1 GPC2 gene_id:221914|Hs108|chr7 ( 579) 3944 624.5 1.1e-178 CCDS9469.1 GPC6 gene_id:10082|Hs108|chr13 ( 555) 1566 254.7 2.2e-67 CCDS14637.1 GPC4 gene_id:2239|Hs108|chrX ( 556) 1388 227.0 4.8e-59 CCDS2534.1 GPC1 gene_id:2817|Hs108|chr2 ( 558) 1005 167.5 4.1e-41 CCDS9468.1 GPC5 gene_id:2262|Hs108|chr13 ( 572) 514 91.1 4e-18 CCDS14638.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX ( 580) 459 82.6 1.5e-15 CCDS55496.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX ( 603) 409 74.8 3.4e-13 CCDS55495.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX ( 526) 360 67.2 6e-11 >>CCDS5689.1 GPC2 gene_id:221914|Hs108|chr7 (579 aa) initn: 3944 init1: 3944 opt: 3944 Z-score: 3321.2 bits: 624.5 E(32554): 1.1e-178 Smith-Waterman score: 3944; 99.8% identity (100.0% similar) in 579 aa overlap (1-579:1-579) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPALISGEHLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPALISGEHLR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VCPQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEMLSVAQH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 VCPQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEMLSVAQH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 SLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLLERVFPLLHP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 SLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLLERVFPLLHP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 QYSFPPDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQGLETGRNVVSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 QYSFPPDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQGLETGRNVVSE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 ALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRGLEPDWSNYLDGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: CCDS56 ALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRGLEPDWGNYLDGL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 LILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGPPDPVPARNRRAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 LILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGPPDPVPARNRRAP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 PPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARLSLTVCGDSRMAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 PPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARLSLTVCGDSRMAA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 DASLEAAPCWTGAGRGRYLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRLQLRAATAR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 DASLEAAPCWTGAGRGRYLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRLQLRAATAR 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE0 MKTAALGHDLDGQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGKGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 MKTAALGHDLDGQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGKGG 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE0 GGSARYNQGRSRSGGASIGFHTQTILILSLSALALLGPR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 GGSARYNQGRSRSGGASIGFHTQTILILSLSALALLGPR 550 560 570 >>CCDS9469.1 GPC6 gene_id:10082|Hs108|chr13 (555 aa) initn: 1067 init1: 593 opt: 1566 Z-score: 1323.1 bits: 254.7 E(32554): 2.2e-67 Smith-Waterman score: 1566; 45.5% identity (77.0% similar) in 508 aa overlap (6-511:11-504) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPALIS ::: ::: : :. :...:. :::.:.::. ::.:.:: :: :. CCDS94 MPSWIGAVILPLLGLLLSL-----PA-GADVKA-RSCGEVRQAYGAKGFSLADIPYQEIA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 GEHLRVCPQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEML :::::.::::::::..: :..: .... :..:::... :. :...::.:::::: :.: CCDS94 GEHLRICPQEYTCCTTEMEDKLSQQSKLEFENLVEETSHFVRTTFVSRHKKFDEFFRELL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 SVAQHSLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLLERVF :..::...: ..:: :: :.. .:. ::..:. .: .. .:.. : ::::.::::.: CCDS94 ENAEKSLNDMFVRTYGMLYMQNSEVFQDLFTELKRYYTGGNVNLEEMLNDFWARLLERMF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 PLLHPQYSFPPDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQGLETGR :..::: : ::: :.:. :: .:.:::: ::.:..:.::...:::.::::: .:: CCDS94 QLINPQYHFSEDYLECVSKY---TD-QLKPFGDVPRKLKIQVTRAFIAARTFVQGLTVGR 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 NVVSEALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRG-LEPDWS .:.... :: . :: .:::... :: :::.:.. ::...::::..:::.... :. .:. CCDS94 EVANRVSKVSPTPGCIRALMKMLYCPYCRGLPTVRPCNNYCLNVMKGCLANQADLDTEWN 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 NYLDGLLILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGPPDPVPA ..:..:..:..:.:::..: . . : :::::..: .:::: .:::.::: :: : :.:: CCDS94 LFIDAMLLVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISEAIMNMQENSMQVSAKVFQGCGQPKPAPA 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 -RNRRAPPPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARLSLTVC :. :. : :. . . . ::::::::::.: ::: ...:.: . :. : :.: CCDS94 LRSARSAP--ENFNTRFRPYNPEERPTTAAGTSLDRLVTDIKEKLKLSKKVWSALPYTIC 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 GDSRMAADASLEAAPCWTGAGRGRYLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRLQ : ..: .: : ::.: ...:::: ... . ..:.::::. :: . ::. :.. . CCDS94 KDESVTAGTSNEEE-CWNGHSKARYLPEIMNDGLTNQINNPEVDVDITRPDTFIRQQIMA 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE0 LRAATARMKTAALGHDLDGQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRD ::. : ..:.: :.:.. ::.....::::.:. :: CCDS94 LRVMTNKLKNAYNGNDVNFQDTSDESSGSGSGSGCMDDVCPTEFEFVTTEAPAVDPDRRE 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 pF1KE0 GSGGKGGGGSARYNQGRSRSGGASIGFHTQTILILSLSALALLGPR CCDS94 VDSSAAQRGHSLLSWSLTCIVLALQRLCR 530 540 550 >>CCDS14637.1 GPC4 gene_id:2239|Hs108|chrX (556 aa) initn: 1250 init1: 474 opt: 1388 Z-score: 1173.5 bits: 227.0 E(32554): 4.8e-59 Smith-Waterman score: 1388; 42.6% identity (74.7% similar) in 479 aa overlap (29-505:27-499) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPALISGEHLR ..::.:.:.. ..:.. : : :.:.::. CCDS14 MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VCPQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEMLSVAQH .::: ::::.: :.. ... :...: .. . : ..:.:..:::::: :.: :.. CCDS14 ICPQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 SLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLLERVFPLLHP ::...: ..::.:: :.. .:. :: .:. .: .. .:.. : ::::.::::.: :.. CCDS14 SLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLVNS 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 QYSFPPDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQGLETGRNVVSE :: : .:: :.:. . . :.:::: ::.:.::.::..::::.:.::: .. .:::. CCDS14 QYHFTDEYLECVSKYTEQ----LKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSK 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE0 ALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRG-LEPDWSNYLDG . : . :..::...: : :::. .. :: ..: :..::::...: :. .:.:..:. CCDS14 VSVVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 LLILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGPPDPVPA-RNRR .:..:..:.:::..: . . : ::::...: .:.::..:: .::: :::: :.:: : : CCDS14 MLMVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 APPPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARLSLTVCGDSRM . ..:. ::::::::::.: ::: ...:.: . . ::. : .::.: :: CCDS14 SISESAFSARFRPH-HPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERM 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 AADASLEAAPCWTGAGRGRYLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRLQLRAAT :: . : ::.: :..::: :.:.. :.: ::::..::.: ::. :. . ::. : CCDS14 AAGNGNED-DCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMT 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE0 ARMKTAALGHDLDGQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGK ..::.: :.:.: : ....:: :.: CCDS14 SKMKNAYNGNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEKADSAGV 480 490 500 510 520 530 >>CCDS2534.1 GPC1 gene_id:2817|Hs108|chr2 (558 aa) initn: 1281 init1: 544 opt: 1005 Z-score: 851.7 bits: 167.5 E(32554): 4.1e-41 Smith-Waterman score: 1340; 41.1% identity (70.6% similar) in 506 aa overlap (23-527:23-513) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPALISGEHLR :. :. .:::.:.::. ::.:.::. .: : ::::::: CCDS25 MELRARGWWLLCAAAALVACARGDPASKSRSCGEVRQIYGAKGFSLSDVPQAEISGEHLR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VCPQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEMLSVAQH .::: ::::.:: :. : ...: .. ..::. : ::.. :.::. : ..:. ... CCDS25 ICPQGYTCCTSEMEENLANRSHAELETALRDSSRVLQAMLATQLRSFDDHFQHLLNDSER 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 SLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLLERVFPLLHP .: : ..:.::.:.: : :.:.:: .: .. :..:::.:::.::::.: ::: CCDS25 TLQATFPGAFGELYTQNARAFRDLYSELRLYYRGANLHLEETLAEFWARLLERLFKQLHP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 QYSFPPDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQGLETGRNVVSE : .: ::: ::.. : . :.:::..::.:::. ::..::::.::::: .. .:: . CCDS25 QLLLPDDYLDCLGKQAEA----LRPFGEAPRELRLRATRAFVAARSFVQGLGVASDVVRK 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE0 ALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRG-LEPDWSNYLDG . .::.. ::.:.:.:. : : :::. :: .: ::..:::.... :. .: : ::. CCDS25 VAQVPLGPECSRAVMKLVYCAHCLGVPGARPCPDYCRNVLKGCLANQADLDAEWRNLLDS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 LLILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGPPDPVPARNRRA .....::. : . : . :. . ..:.. ::.: ..:.:.: :: : : .. CCDS25 MVLITDKFWGTSGVESVIGSVHTWLAEAINALQDNRDTLTAKVIQGCGNPKVNP----QG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 PPPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARLSLTVCGDSRMA : :.:. : . .. .::: . :: :..:: : . .: .. :: : :.:... CCDS25 PGPEEKRRR--GKLAPRERPPS--GT-LEKLVSEAKAQLRDVQDFWISLPGTLCSEKMAL 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 ADASLEAAPCWTGAGRGRYLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRLQLRAATA . :: . ::.: .:::::: :.: . :.:.::::..:: . ::. :.. .::. : CCDS25 STASDDR--CWNGMARGRYLPEVMGDGLANQINNPEVEVDITKPDMTIRQQIMQLKIMTN 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE0 RMKTAALGHDLDGQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGKG :...: :.:.: :::..:.::::.:. :: . :. . : : CCDS25 RLRSAYNGNDVDFQDASDDGSGSGSGDGCLDDLCSRKVSRKSSSSRTPLTHALPGLSEQE 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 pF1KE0 GGGSARYNQGRSRSGGASIGFHTQTILILSLSALALLGPR CCDS25 GQKTSAASCPQPPTFLLPLLLFLALTVARPRWR 530 540 550 >>CCDS9468.1 GPC5 gene_id:2262|Hs108|chr13 (572 aa) initn: 335 init1: 264 opt: 514 Z-score: 438.9 bits: 91.1 E(32554): 4e-18 Smith-Waterman score: 569; 25.9% identity (56.3% similar) in 533 aa overlap (9-513:13-522) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGY-SLNLIPPALIS :::: : : . . : ...: :.:... : .. .: . . CCDS94 MDAQTWPVGFRCLLLLALV-GSARSEG-----VQTCEEVRKLFQWRLLGAVRGLPDSPRA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 GEHLRVC-PQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEM : :.:: .. :::. . :.: .. .. ... :.: : .. :.: . . CCDS94 GPDLQVCISKKPTCCTRKMEERYQIAARQDMQQFLQTSSSTLKFLISRNAAAFQETLETL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 LSVAQHSLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGE---GLDDTLADFWAQLL .. :.. . :: .: . . : . ...:. . : : : . .: ... CCDS94 IKQAENYTSILFCSTYRNMALEAA-------ASVQEFFTDVGLYLFGADVNPEEFVNRFF 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KE0 ERVFPLLHPQYSFP--PDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQ . .:::.. . : : : :. . ...:::. :.:. :. :.:. .:.:.: CCDS94 DSLFPLVYNHLINPGVTDSSLEYSECIRMARRDVSPFGNIPQRVMGQMGRSLLPSRTFLQ 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE0 GLETGRNVVSEALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRG- .:. : .:.. . . :. ::.::... :: :.:. ::.:.::::.::::. . CCDS94 ALNLGIEVINTTDYLHFSKECSRALLKMQYCPHCQGLALTKPCMGYCLNVMRGCLAHMAE 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE0 LEPDWSNYLDGLLILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGP :.: : :. .: :.: ..: ... . .. . ...... . :. :. :: . :: CCDS94 LNPHWHAYIRSLEELSDAMHGTYDIGHVLLNFHLLVNDAVLQAHLNGQKLLEQVNRICGR 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE0 PDPVPARNRRAPPPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARL : .:... : . . . . .:.. . : : : .. :. . : .:.:.. : CCDS94 PVRTPTQSPRCSFDQSKEKHGMKTTTRNSEETLA---NRRK---EFINSLRLYRSFYGGL 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE0 SLTVCGDSRMAADASLEAAPCWTGAGRGR-YLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGP---D . .:.. ::: . :::.: . : :::.. : .:::.:: . : . CCDS94 ADQLCANELAAAD----GLPCWNGEDIVKSYTQRVVGNGIKAQSGNPEVKVKGIDPVINQ 410 420 430 440 450 470 480 490 500 pF1KE0 VPTRRRR----LQLRAATA-RMKTAALG------HDLDGQDADEDA-SGSGGGQ----QY . . .. :: :. . . :: ....:. :::. .:::.:. CCDS94 IIDKLKHVVQLLQGRSPKPDKWELLQLGSGGGMVEQVSGDCDDEDGCGGSGSGEVKRTLK 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 560 pF1KE0 ADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGKGGGGSARYNQGRSRSGGASIGFHTQTILIL ::: CCDS94 ITDWMPDDMNFSDVKQIHQTDTGSTLDTTGAGCAVATESMTFTLISVVMLLPGIW 520 530 540 550 560 570 >>CCDS14638.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX (580 aa) initn: 103 init1: 71 opt: 459 Z-score: 392.6 bits: 82.6 E(32554): 1.5e-15 Smith-Waterman score: 492; 24.5% identity (54.4% similar) in 518 aa overlap (7-505:15-512) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPA :: : .: : : : . .: ..:. . .:. .: . CCDS14 MAGTVRTACLVVAMLLSLDFPGQAQPPPPPPDA-----TCHQVRSFFQRLQPGLKWVPET 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 LISGEHLRVC-PQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFF . : :.:: :. :::: . :.. .. ... :..... : . :.: : CCDS14 PVPGSDLQVCLPKGPTCCSRKMEEKYQLTARLNMEQLLQSASMELKFLIIQNAAVFQEAF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 LEMLSVAQHSLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLL .. :.. . .:...: : : :. : : : ..: : : .. :. .:. CCDS14 EIVVRHAKNYTNAMFKNNYPSLTPQ-AFEFVGEFFTDVSLYIL---GSDINVDDMVNELF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE0 ERVFPLLHPQYSFP--PDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQ . .::... : : :: : ... .. .:. ::. :. . :....: ..: :.: CCDS14 DSLFPVIYTQLMNPGLPDSALDINECLRGARRDLKVFGNFPKLIMTQVSKSLQVTRIFLQ 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE0 GLETGRNVVSEALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRGL .:. : .:.. . .. :. :.. : :. : :.:. . :: :.: :..::... . 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CCDS55 SSRRR---ELIQKLKSFISFYSALPGYICSHSPVAENDTL----CWNGQELVERYSQKAA 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 pF1KE0 GGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRL----QLRAATARMKTAALGHDLD-------- .. .: : :::. . : : .: :: . . : .: ..:: CCDS55 RNGMKNQFNLHELKMKGPEPVVSQIIDKLKHINQLLRTMSMPKGRVLDKNLDEEGFESGD 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KE0 -GQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGKGGGGSARYNQGR :.: :: .::: : CCDS55 CGDDEDECIGGSGDGMIKVKNQLRFLAELAYDLDVDDAPGNSQQATPKDNEISTFHNLGN 530 540 550 560 570 580 >>CCDS55495.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX (526 aa) initn: 71 init1: 71 opt: 360 Z-score: 310.0 bits: 67.2 E(32554): 6e-11 Smith-Waterman score: 393; 24.6% identity (54.7% similar) in 415 aa overlap (109-505:59-458) 80 90 100 110 120 130 pF1KE0 RETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEMLSVAQHSLTQLFSHSYGRLYAQHA : : .. :.. . .:...: : : : CCDS55 PPPDATCHQVRSFFQRLQPGLKWVPETPVPEAFEIVVRHAKNYTNAMFKNNYPSLTPQ-A 30 40 50 60 70 80 140 150 160 170 180 190 pF1KE0 LIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLLERVFPLLHPQYSFP--PDYLLCLSRLA . : : : ..: : : .. :. .:.. .::... : : :: : ... 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