Result of FASTA (ccds) for pF1KE0002
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0002, 579 aa
  1>>>pF1KE0002 579 - 579 aa - 579 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1418+/-0.000694; mu= 12.6905+/- 0.042
 mean_var=141.6075+/-28.522, 0's: 0 Z-trim(115.0): 11  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.107778
 statistics sampled from 15592 (15600) to 15592 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.781), E-opt: 0.2 (0.479), width:  16
 Scan time:  3.690

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5689.1 GPC2 gene_id:221914|Hs108|chr7          ( 579) 3944 624.5 1.1e-178
CCDS9469.1 GPC6 gene_id:10082|Hs108|chr13          ( 555) 1566 254.7 2.2e-67
CCDS14637.1 GPC4 gene_id:2239|Hs108|chrX           ( 556) 1388 227.0 4.8e-59
CCDS2534.1 GPC1 gene_id:2817|Hs108|chr2            ( 558) 1005 167.5 4.1e-41
CCDS9468.1 GPC5 gene_id:2262|Hs108|chr13           ( 572)  514 91.1   4e-18
CCDS14638.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX           ( 580)  459 82.6 1.5e-15
CCDS55496.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX           ( 603)  409 74.8 3.4e-13
CCDS55495.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX           ( 526)  360 67.2   6e-11


>>CCDS5689.1 GPC2 gene_id:221914|Hs108|chr7               (579 aa)
 initn: 3944 init1: 3944 opt: 3944  Z-score: 3321.2  bits: 624.5 E(32554): 1.1e-178
Smith-Waterman score: 3944; 99.8% identity (100.0% similar) in 579 aa overlap (1-579:1-579)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPALISGEHLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPALISGEHLR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 VCPQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEMLSVAQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VCPQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEMLSVAQH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 SLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLLERVFPLLHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLLERVFPLLHP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 QYSFPPDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQGLETGRNVVSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QYSFPPDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQGLETGRNVVSE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 ALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRGLEPDWSNYLDGL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS56 ALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRGLEPDWGNYLDGL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 LILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGPPDPVPARNRRAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGPPDPVPARNRRAP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 PPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARLSLTVCGDSRMAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARLSLTVCGDSRMAA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 DASLEAAPCWTGAGRGRYLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRLQLRAATAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DASLEAAPCWTGAGRGRYLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRLQLRAATAR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 MKTAALGHDLDGQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGKGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MKTAALGHDLDGQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGKGG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570         
pF1KE0 GGSARYNQGRSRSGGASIGFHTQTILILSLSALALLGPR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GGSARYNQGRSRSGGASIGFHTQTILILSLSALALLGPR
              550       560       570         

>>CCDS9469.1 GPC6 gene_id:10082|Hs108|chr13               (555 aa)
 initn: 1067 init1: 593 opt: 1566  Z-score: 1323.1  bits: 254.7 E(32554): 2.2e-67
Smith-Waterman score: 1566; 45.5% identity (77.0% similar) in 508 aa overlap (6-511:11-504)

                    10        20        30        40        50     
pF1KE0      MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPALIS
                 ::: ::: :     :. :...:. :::.:.::. ::.:.::  ::   :.
CCDS94 MPSWIGAVILPLLGLLLSL-----PA-GADVKA-RSCGEVRQAYGAKGFSLADIPYQEIA
               10             20          30        40        50   

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE0 GEHLRVCPQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEML
       :::::.::::::::..: :..: ....  :..:::... :.  :...::.:::::: :.:
CCDS94 GEHLRICPQEYTCCTTEMEDKLSQQSKLEFENLVEETSHFVRTTFVSRHKKFDEFFRELL
            60        70        80        90       100       110   

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE0 SVAQHSLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLLERVF
         :..::...: ..:: :: :.. .:. ::..:. .:  .. .:.. : ::::.::::.:
CCDS94 ENAEKSLNDMFVRTYGMLYMQNSEVFQDLFTELKRYYTGGNVNLEEMLNDFWARLLERMF
           120       130       140       150       160       170   

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE0 PLLHPQYSFPPDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQGLETGR
        :..::: :  ::: :.:.    :: .:.:::: ::.:..:.::...:::.::::: .::
CCDS94 QLINPQYHFSEDYLECVSKY---TD-QLKPFGDVPRKLKIQVTRAFIAARTFVQGLTVGR
           180       190           200       210       220         

         240       250       260       270       280        290    
pF1KE0 NVVSEALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRG-LEPDWS
       .:.... ::  . :: .:::... :: :::.:.. ::...::::..:::.... :. .:.
CCDS94 EVANRVSKVSPTPGCIRALMKMLYCPYCRGLPTVRPCNNYCLNVMKGCLANQADLDTEWN
     230       240       250       260       270       280         

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE0 NYLDGLLILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGPPDPVPA
        ..:..:..:..:.:::..: . . : :::::..: .:::: .:::.::: :: : :.::
CCDS94 LFIDAMLLVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISEAIMNMQENSMQVSAKVFQGCGQPKPAPA
     290       300       310       320       330       340         

           360       370       380       390       400       410   
pF1KE0 -RNRRAPPPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARLSLTVC
        :. :. :  :. .  .   . ::::::::::.: ::: ...:.:   .  :. :  :.:
CCDS94 LRSARSAP--ENFNTRFRPYNPEERPTTAAGTSLDRLVTDIKEKLKLSKKVWSALPYTIC
     350         360       370       380       390       400       

           420       430       440       450       460       470   
pF1KE0 GDSRMAADASLEAAPCWTGAGRGRYLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRLQ
        :  ..: .: :   ::.: ...:::: ... . ..:.::::. :: . ::.  :.. . 
CCDS94 KDESVTAGTSNEEE-CWNGHSKARYLPEIMNDGLTNQINNPEVDVDITRPDTFIRQQIMA
       410       420        430       440       450       460      

           480       490       500       510       520       530   
pF1KE0 LRAATARMKTAALGHDLDGQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRD
       ::. : ..:.:  :.:.. ::.....::::.:.   ::                      
CCDS94 LRVMTNKLKNAYNGNDVNFQDTSDESSGSGSGSGCMDDVCPTEFEFVTTEAPAVDPDRRE
        470       480       490       500       510       520      

           540       550       560       570         
pF1KE0 GSGGKGGGGSARYNQGRSRSGGASIGFHTQTILILSLSALALLGPR
                                                     
CCDS94 VDSSAAQRGHSLLSWSLTCIVLALQRLCR                 
        530       540       550                      

>>CCDS14637.1 GPC4 gene_id:2239|Hs108|chrX                (556 aa)
 initn: 1250 init1: 474 opt: 1388  Z-score: 1173.5  bits: 227.0 E(32554): 4.8e-59
Smith-Waterman score: 1388; 42.6% identity (74.7% similar) in 479 aa overlap (29-505:27-499)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPALISGEHLR
                                   ..::.:.:..  ..:.. :  :   :.:.::.
CCDS14   MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLK
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 VCPQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEMLSVAQH
       .:::  ::::.: :..   ...  :...: .. . :  ..:.:..:::::: :.:  :..
CCDS14 ICPQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEK
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 SLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLLERVFPLLHP
       ::...: ..::.:: :.. .:. :: .:. .:  .. .:.. : ::::.::::.: :.. 
CCDS14 SLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLVNS
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 QYSFPPDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQGLETGRNVVSE
       :: :  .:: :.:. . .    :.:::: ::.:.::.::..::::.:.::: .. .:::.
CCDS14 QYHFTDEYLECVSKYTEQ----LKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSK
      180       190           200       210       220       230    

              250       260       270       280        290         
pF1KE0 ALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRG-LEPDWSNYLDG
       .  :  .  :..::...: :  :::. .. :: ..: :..::::...: :. .:.:..:.
CCDS14 VSVVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDA
          240       250       260       270       280       290    

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE0 LLILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGPPDPVPA-RNRR
       .:..:..:.:::..: . . : ::::...: .:.::..:: .::: :::: :.:: :  :
CCDS14 MLMVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISR
          300       310       320       330       340       350    

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE0 APPPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARLSLTVCGDSRM
       .      ..:.      ::::::::::.: ::: ...:.: . . ::. :  .::.: ::
CCDS14 SISESAFSARFRPH-HPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERM
          360        370       380       390       400       410   

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE0 AADASLEAAPCWTGAGRGRYLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRLQLRAAT
       ::  . :   ::.: :..:::  :.:.. :.: ::::..::.: ::.   :. . ::. :
CCDS14 AAGNGNED-DCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMT
           420        430       440       450       460       470  

      480       490       500       510       520       530        
pF1KE0 ARMKTAALGHDLDGQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGK
       ..::.:  :.:.:  : ....:: :.:                                 
CCDS14 SKMKNAYNGNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEKADSAGV
            480       490       500       510       520       530  

>>CCDS2534.1 GPC1 gene_id:2817|Hs108|chr2                 (558 aa)
 initn: 1281 init1: 544 opt: 1005  Z-score: 851.7  bits: 167.5 E(32554): 4.1e-41
Smith-Waterman score: 1340; 41.1% identity (70.6% similar) in 506 aa overlap (23-527:23-513)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPALISGEHLR
                             :. :. .:::.:.::. ::.:.::. .: : :::::::
CCDS25 MELRARGWWLLCAAAALVACARGDPASKSRSCGEVRQIYGAKGFSLSDVPQAEISGEHLR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 VCPQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEMLSVAQH
       .::: ::::.:: :. :  ...: ..  ..::.  :   ::.. :.::. : ..:. ...
CCDS25 ICPQGYTCCTSEMEENLANRSHAELETALRDSSRVLQAMLATQLRSFDDHFQHLLNDSER
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 SLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLLERVFPLLHP
       .:   :  ..:.::.:.:  :  :.:.:: .:  ..  :..:::.:::.::::.:  :::
CCDS25 TLQATFPGAFGELYTQNARAFRDLYSELRLYYRGANLHLEETLAEFWARLLERLFKQLHP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 QYSFPPDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQGLETGRNVVSE
       :  .: ::: ::.. : .    :.:::..::.:::. ::..::::.::::: .. .:: .
CCDS25 QLLLPDDYLDCLGKQAEA----LRPFGEAPRELRLRATRAFVAARSFVQGLGVASDVVRK
              190           200       210       220       230      

              250       260       270       280        290         
pF1KE0 ALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRG-LEPDWSNYLDG
       . .::..  ::.:.:.:. :  : :::.  ::  .: ::..:::.... :. .: : ::.
CCDS25 VAQVPLGPECSRAVMKLVYCAHCLGVPGARPCPDYCRNVLKGCLANQADLDAEWRNLLDS
        240       250       260       270       280       290      

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE0 LLILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGPPDPVPARNRRA
       .....::. :  . : .  :. . ..:..  ::.:   ..:.:.: :: :   :    ..
CCDS25 MVLITDKFWGTSGVESVIGSVHTWLAEAINALQDNRDTLTAKVIQGCGNPKVNP----QG
        300       310       320       330       340       350      

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE0 PPPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARLSLTVCGDSRMA
       : :.:.  :  . .. .::: .  :: :..:: : . .:  .. ::  :  :.:...   
CCDS25 PGPEEKRRR--GKLAPRERPPS--GT-LEKLVSEAKAQLRDVQDFWISLPGTLCSEKMAL
            360         370          380       390       400       

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE0 ADASLEAAPCWTGAGRGRYLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRLQLRAATA
       . :: .   ::.: .:::::: :.: . :.:.::::..:: . ::.  :.. .::.  : 
CCDS25 STASDDR--CWNGMARGRYLPEVMGDGLANQINNPEVEVDITKPDMTIRQQIMQLKIMTN
       410         420       430       440       450       460     

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE0 RMKTAALGHDLDGQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGKG
       :...:  :.:.: :::..:.::::.:.   ::  .  :.  .   : :            
CCDS25 RLRSAYNGNDVDFQDASDDGSGSGSGDGCLDDLCSRKVSRKSSSSRTPLTHALPGLSEQE
         470       480       490       500       510       520     

     540       550       560       570         
pF1KE0 GGGSARYNQGRSRSGGASIGFHTQTILILSLSALALLGPR
                                               
CCDS25 GQKTSAASCPQPPTFLLPLLLFLALTVARPRWR       
         530       540       550               

>>CCDS9468.1 GPC5 gene_id:2262|Hs108|chr13                (572 aa)
 initn: 335 init1: 264 opt: 514  Z-score: 438.9  bits: 91.1 E(32554): 4e-18
Smith-Waterman score: 569; 25.9% identity (56.3% similar) in 533 aa overlap (9-513:13-522)

                   10        20        30        40         50     
pF1KE0     MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGY-SLNLIPPALIS
                   :::: :  : . . :     ...: :.:...  :   ..  .: .  .
CCDS94 MDAQTWPVGFRCLLLLALV-GSARSEG-----VQTCEEVRKLFQWRLLGAVRGLPDSPRA
               10         20             30        40        50    

          60         70        80        90       100       110    
pF1KE0 GEHLRVC-PQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEM
       :  :.::  .. :::. . :.:    ..  .. ... :.: :   ..     :.: .  .
CCDS94 GPDLQVCISKKPTCCTRKMEERYQIAARQDMQQFLQTSSSTLKFLISRNAAAFQETLETL
           60        70        80        90       100       110    

          120       130       140       150          160       170 
pF1KE0 LSVAQHSLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGE---GLDDTLADFWAQLL
       .. :..  . ::  .:  .  . :       . ...:. . :    : : .  .:  ...
CCDS94 IKQAENYTSILFCSTYRNMALEAA-------ASVQEFFTDVGLYLFGADVNPEEFVNRFF
          120       130              140       150       160       

             180         190       200       210       220         
pF1KE0 ERVFPLLHPQYSFP--PDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQ
       . .:::.. .   :   :  :  :.    .  ...:::. :.:.  :. :.:. .:.:.:
CCDS94 DSLFPLVYNHLINPGVTDSSLEYSECIRMARRDVSPFGNIPQRVMGQMGRSLLPSRTFLQ
       170       180       190       200       210       220       

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE0 GLETGRNVVSEALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRG-
       .:. : .:.. .  .  :. ::.::...  :: :.:.    ::.:.::::.::::.  . 
CCDS94 ALNLGIEVINTTDYLHFSKECSRALLKMQYCPHCQGLALTKPCMGYCLNVMRGCLAHMAE
       230       240       250       260       270       280       

      290       300       310       320       330       340        
pF1KE0 LEPDWSNYLDGLLILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGP
       :.: :  :. .:  :.: ..: ...  .  .. . ......  . :. :.  :: . :: 
CCDS94 LNPHWHAYIRSLEELSDAMHGTYDIGHVLLNFHLLVNDAVLQAHLNGQKLLEQVNRICGR
       290       300       310       320       330       340       

      350       360       370       380       390       400        
pF1KE0 PDPVPARNRRAPPPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARL
       :  .:... :    . .  .  . .:.. . : :   : ..   :. . :  .:.:.. :
CCDS94 PVRTPTQSPRCSFDQSKEKHGMKTTTRNSEETLA---NRRK---EFINSLRLYRSFYGGL
       350       360       370       380             390       400 

      410       420       430        440       450       460       
pF1KE0 SLTVCGDSRMAADASLEAAPCWTGAGRGR-YLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGP---D
       .  .:..   :::    . :::.:    . :   :::..   : .:::.:: .  :   .
CCDS94 ADQLCANELAAAD----GLPCWNGEDIVKSYTQRVVGNGIKAQSGNPEVKVKGIDPVINQ
             410           420       430       440       450       

          470            480             490        500            
pF1KE0 VPTRRRR----LQLRAATA-RMKTAALG------HDLDGQDADEDA-SGSGGGQ----QY
       .  . ..    :: :.    . .   ::      ....:.  :::. .:::.:.      
CCDS94 IIDKLKHVVQLLQGRSPKPDKWELLQLGSGGGMVEQVSGDCDDEDGCGGSGSGEVKRTLK
       460       470       480       490       500       510       

      510       520       530       540       550       560        
pF1KE0 ADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGKGGGGSARYNQGRSRSGGASIGFHTQTILIL
         :::                                                       
CCDS94 ITDWMPDDMNFSDVKQIHQTDTGSTLDTTGAGCAVATESMTFTLISVVMLLPGIW     
       520       530       540       550       560       570       

>>CCDS14638.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX                (580 aa)
 initn: 103 init1:  71 opt: 459  Z-score: 392.6  bits: 82.6 E(32554): 1.5e-15
Smith-Waterman score: 492; 24.5% identity (54.4% similar) in 518 aa overlap (7-505:15-512)

                       10        20        30        40        50  
pF1KE0         MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPA
                     :: : .:    : : : .      .: ..:. .     .:. .: .
CCDS14 MAGTVRTACLVVAMLLSLDFPGQAQPPPPPPDA-----TCHQVRSFFQRLQPGLKWVPET
               10        20        30             40        50     

             60         70        80        90       100       110 
pF1KE0 LISGEHLRVC-PQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFF
        . :  :.:: :.  :::: . :..    .. ... :.....  :   .      :.: :
CCDS14 PVPGSDLQVCLPKGPTCCSRKMEEKYQLTARLNMEQLLQSASMELKFLIIQNAAVFQEAF
          60        70        80        90       100       110     

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE0 LEMLSVAQHSLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLL
         ..  :..  . .:...:  :  : :. : : :    ..:     : : .. :.  .:.
CCDS14 EIVVRHAKNYTNAMFKNNYPSLTPQ-AFEFVGEFFTDVSLYIL---GSDINVDDMVNELF
         120       130       140        150          160       170 

             180         190       200       210       220         
pF1KE0 ERVFPLLHPQYSFP--PDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQ
       . .::... :   :  ::  : ...   ..  .:. ::. :. .  :....: ..: :.:
CCDS14 DSLFPVIYTQLMNPGLPDSALDINECLRGARRDLKVFGNFPKLIMTQVSKSLQVTRIFLQ
             180       190       200       210       220       230 

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE0 GLETGRNVVSEALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRGL
       .:. : .:.. . ..  :. :.. : :.  :  :.:.  . :: :.:  :..::...  .
CCDS14 ALNLGIEVINTTDHLKFSKDCGRMLTRMWYCSYCQGLMMVKPCGGYCNVVMQGCMAGV-V
             240       250       260       270       280        290

     290         300       310       320       330       340       
pF1KE0 EPD--WSNYLDGLLILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECG
       : :  : .:. .:  :.. .   ...: .  ..   : ....:.:.:..:... . . :.
CCDS14 EIDKYWREYILSLEELVNGMYRIYDMENVLLGLFSTIHDSIQYVQKNAGKLTTTIGKLCA
              300       310       320       330       340       350

       350       360       370       380       390       400       
pF1KE0 PPDPVPARNRRAPPPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWAR
         .    :.   :       .. ...  :.. :    .. .:   :: ..:  . .:.. 
CCDS14 HSQQRQYRSAYYPEDLFIDKKVLKVAHVEHEETL---SSRRR---ELIQKLKSFISFYSA
              360       370       380             390       400    

       410       420       430        440       450       460      
pF1KE0 LSLTVCGDSRMAADASLEAAPCWTGAGR-GRYLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGPDVP
       :   .:. : .: . .:    ::.:     ::   .. ..  .: :  :::. .  : : 
CCDS14 LPGYICSHSPVAENDTL----CWNGQELVERYSQKAARNGMKNQFNLHELKMKGPEPVVS
          410       420           430       440       450       460

        470           480       490                500       510   
pF1KE0 TRRRRL----QLRAATARMKTAALGHDLD---------GQDADEDASGSGGGQQYADDWM
           .:    ::  . .  :  .: ..::         :.: ::  .::: :        
CCDS14 QIIDKLKHINQLLRTMSMPKGRVLDKNLDEEGFESGDCGDDEDECIGGSGDGMIKVKNQL
              470       480       490       500       510       520

           520       530       540       550       560       570   
pF1KE0 AGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGKGGGGSARYNQGRSRSGGASIGFHTQTILILSLSAL
                                                                   
CCDS14 RFLAELAYDLDVDDAPGNSQQATPKDNEISTFHNLGNVHSPLKLLTSMAISVVCFFFLVH
              530       540       550       560       570       580

>>CCDS55496.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX                (603 aa)
 initn: 103 init1:  71 opt: 409  Z-score: 350.4  bits: 74.8 E(32554): 3.4e-13
Smith-Waterman score: 444; 23.7% identity (52.3% similar) in 541 aa overlap (7-505:15-535)

                       10        20        30        40        50  
pF1KE0         MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPA
                     :: : .:    : : : .      .: ..:. .     .:. .: .
CCDS55 MAGTVRTACLVVAMLLSLDFPGQAQPPPPPPDA-----TCHQVRSFFQRLQPGLKWVPET
               10        20        30             40        50     

             60         70        80        90       100       110 
pF1KE0 LISGEHLRVC-PQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFF
        . :  :.:: :.  :::: . :..    .. ... :.....  :   .      :.: :
CCDS55 PVPGSDLQVCLPKGPTCCSRKMEEKYQLTARLNMEQLLQSASMELKFLIIQNAAVFQEAF
          60        70        80        90       100       110     

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE0 LEMLSVAQHSLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLL
         ..  :..  . .:...:  :  : :. : : :    ..:     : : .. :.  .:.
CCDS55 EIVVRHAKNYTNAMFKNNYPSLTPQ-AFEFVGEFFTDVSLYIL---GSDINVDDMVNELF
         120       130       140        150          160       170 

             180         190       200       210       220         
pF1KE0 ERVFPLLHPQYSFP--PDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQ
       . .::... :   :  ::  : ...   ..  .:. ::. :. .  :....: ..: :.:
CCDS55 DSLFPVIYTQLMNPGLPDSALDINECLRGARRDLKVFGNFPKLIMTQVSKSLQVTRIFLQ
             180       190       200       210       220       230 

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE0 GLETGRNVVSEALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRGL
       .:. : .:.. . ..  :. :.. : :.  :  :.:.  . :: :.:  :..::...  .
CCDS55 ALNLGIEVINTTDHLKFSKDCGRMLTRMWYCSYCQGLMMVKPCGGYCNVVMQGCMAGV-V
             240       250       260       270       280        290

     290         300       310       320       330       340       
pF1KE0 EPD--WSNYLDGLLILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSA-------
       : :  : .:. .:  :.. .   ...: .  ..   : ....:.:.:..:...       
CCDS55 EIDKYWREYILSLEELVNGMYRIYDMENVLLGLFSTIHDSIQYVQKNAGKLTTTETEKKI
              300       310       320       330       340       350

                              350       360       370       380    
pF1KE0 ----------------QVFQECGPPDPVPARNRRAPPPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAG
                       :. . :.  .    :.   :       .. ...  :.. :    
CCDS55 WHFKYPIFFLCIGLDLQIGKLCAHSQQRQYRSAYYPEDLFIDKKVLKVAHVEHEETL---
              360       370       380       390       400          

          390       400       410       420       430        440   
pF1KE0 TNLHRLVWELRERLARMRGFWARLSLTVCGDSRMAADASLEAAPCWTGAGR-GRYLPPVV
       .. .:   :: ..:  . .:.. :   .:. : .: . .:    ::.:     ::   ..
CCDS55 SSRRR---ELIQKLKSFISFYSALPGYICSHSPVAENDTL----CWNGQELVERYSQKAA
       410          420       430       440           450       460

           450       460       470           480       490         
pF1KE0 GGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRL----QLRAATARMKTAALGHDLD--------
        ..  .: :  :::. .  : :     .:    ::  . .  :  .: ..::        
CCDS55 RNGMKNQFNLHELKMKGPEPVVSQIIDKLKHINQLLRTMSMPKGRVLDKNLDEEGFESGD
              470       480       490       500       510       520

              500       510       520       530       540       550
pF1KE0 -GQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGKGGGGSARYNQGR
        :.: ::  .::: :                                             
CCDS55 CGDDEDECIGGSGDGMIKVKNQLRFLAELAYDLDVDDAPGNSQQATPKDNEISTFHNLGN
              530       540       550       560       570       580

>>CCDS55495.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX                (526 aa)
 initn:  71 init1:  71 opt: 360  Z-score: 310.0  bits: 67.2 E(32554): 6e-11
Smith-Waterman score: 393; 24.6% identity (54.7% similar) in 415 aa overlap (109-505:59-458)

       80        90       100       110       120       130        
pF1KE0 RETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEMLSVAQHSLTQLFSHSYGRLYAQHA
                                     : :  ..  :..  . .:...:  :  : :
CCDS55 PPPDATCHQVRSFFQRLQPGLKWVPETPVPEAFEIVVRHAKNYTNAMFKNNYPSLTPQ-A
       30        40        50        60        70        80        

      140       150       160       170       180         190      
pF1KE0 LIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLLERVFPLLHPQYSFP--PDYLLCLSRLA
       . : : :    ..:     : : .. :.  .:.. .::... :   :  ::  : ...  
CCDS55 FEFVGEFFTDVSLYIL---GSDINVDDMVNELFDSLFPVIYTQLMNPGLPDSALDINECL
        90       100          110       120       130       140    

        200       210       220       230       240       250      
pF1KE0 SSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQGLETGRNVVSEALKVPVSEGCSQALMR
        ..  .:. ::. :. .  :....: ..: :.:.:. : .:.. . ..  :. :.. : :
CCDS55 RGARRDLKVFGNFPKLIMTQVSKSLQVTRIFLQALNLGIEVINTTDHLKFSKDCGRMLTR
          150       160       170       180       190       200    

        260       270       280       290         300       310    
pF1KE0 LIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRGLEPD--WSNYLDGLLILADKLQGPFSFE
       .  :  :.:.  . :: :.:  :..::...  .: :  : .:. .:  :.. .   ...:
CCDS55 MWYCSYCQGLMMVKPCGGYCNVVMQGCMAGV-VEIDKYWREYILSLEELVNGMYRIYDME
          210       220       230        240       250       260   

          320       330       340       350       360       370    
pF1KE0 LTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGPPDPVPARNRRAPPPREEAGRLWSMVT
        .  ..   : ....:.:.:..:... . . :.  .    :.   :       .. ... 
CCDS55 NVLLGLFSTIHDSIQYVQKNAGKLTTTIGKLCAHSQQRQYRSAYYPEDLFIDKKVLKVAH
           270       280       290       300       310       320   

          380       390       400       410       420       430    
pF1KE0 EEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARLSLTVCGDSRMAADASLEAAPCWTGAG
        :.. : ..         :: ..:  . .:.. :   .:. : .: . .:    ::.:  
CCDS55 VEHEETLSSRRR------ELIQKLKSFISFYSALPGYICSHSPVAENDTL----CWNGQE
           330             340       350       360           370   

           440       450       460       470           480         
pF1KE0 R-GRYLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRL----QLRAATARMKTAALGHD
          ::   .. ..  .: :  :::. .  : :     .:    ::  . .  :  .: ..
CCDS55 LVERYSQKAARNGMKNQFNLHELKMKGPEPVVSQIIDKLKHINQLLRTMSMPKGRVLDKN
           380       390       400       410       420       430   

     490                500       510       520       530       540
pF1KE0 LD---------GQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGKGG
       ::         :.: ::  .::: :                                   
CCDS55 LDEEGFESGDCGDDEDECIGGSGDGMIKVKNQLRFLAELAYDLDVDDAPGNSQQATPKDN
           440       450       460       470       480       490   




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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