Result of FASTA (omim) for
pF1KB9974
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9974, 707 aa
1>>>pF1KB9974 707 - 707 aa - 707 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7164+/-0.000477; mu= -8.7601+/- 0.030
mean_var=397.5731+/-79.687, 0's: 0 Z-trim(121.0): 108 B-trim: 0 in 0/60
Lambda= 0.064323
statistics sampled from 36982 (37091) to 36982 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.736), E-opt: 0.2 (0.435), width: 16
Scan time: 12.990
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004985 (OMIM: 120361,613073) matrix metalloprot ( 707) 4999 478.5 3.7e-134
NP_004521 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV col ( 660) 1899 190.8 1.4e-47
NP_001121363 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 610) 1839 185.2 6.3e-46
NP_001289439 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 1838 185.1 6.5e-46
NP_001289437 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 1838 185.1 6.5e-46
NP_001289438 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 1838 185.1 6.5e-46
NP_002413 (OMIM: 185250,614466) stromelysin-1 prep ( 477) 611 71.2 1.1e-11
NP_002418 (OMIM: 250400,600108,602111) collagenase ( 471) 606 70.7 1.4e-11
NP_002416 (OMIM: 185260) stromelysin-2 preproprote ( 476) 603 70.5 1.8e-11
NP_002412 (OMIM: 120353,226600,606963) interstitia ( 469) 580 68.3 7.7e-11
NP_001139410 (OMIM: 120353,226600,606963) intersti ( 403) 536 64.2 1.2e-09
NP_004762 (OMIM: 604629,612529) matrix metalloprot ( 483) 521 62.9 3.5e-09
NP_002417 (OMIM: 601046) macrophage metalloelastas ( 470) 520 62.8 3.6e-09
NP_002414 (OMIM: 178990) matrilysin preproprotein ( 267) 487 59.5 2e-08
NP_002415 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase is ( 467) 480 59.0 4.8e-08
XP_011541138 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 377) 477 58.7 4.9e-08
XP_011541137 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 444) 477 58.7 5.5e-08
NP_001291371 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase ( 444) 477 58.7 5.5e-08
NP_001291370 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase ( 444) 477 58.7 5.5e-08
XP_016873260 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 444) 477 58.7 5.5e-08
XP_011541136 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 476) 477 58.8 5.8e-08
XP_016874796 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 434) 384 50.1 2.2e-05
NP_068573 (OMIM: 605470) matrix metalloproteinase- ( 261) 375 49.1 2.6e-05
NP_057239 (OMIM: 602285) matrix metalloproteinase- ( 603) 384 50.2 2.8e-05
XP_011518521 (OMIM: 605470) PREDICTED: matrix meta ( 191) 367 48.2 3.5e-05
XP_011536658 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519) 376 49.4 4.1e-05
XP_011536657 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519) 376 49.4 4.1e-05
XP_011536659 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519) 376 49.4 4.1e-05
NP_002420 (OMIM: 601807,611543) matrix metalloprot ( 508) 366 48.5 7.7e-05
NP_005932 (OMIM: 602262) matrix metalloproteinase- ( 607) 354 47.4 0.00019
NP_004986 (OMIM: 277950,600754) matrix metalloprot ( 582) 349 47.0 0.00026
NP_005931 (OMIM: 185261) stromelysin-3 preproprote ( 488) 345 46.5 0.00029
XP_011526802 (OMIM: 604871) PREDICTED: matrix meta ( 556) 333 45.5 0.00069
XP_016883086 (OMIM: 604871) PREDICTED: matrix meta ( 591) 333 45.5 0.00072
XP_016883087 (OMIM: 604871) PREDICTED: matrix meta ( 614) 333 45.5 0.00075
NP_006681 (OMIM: 604871) matrix metalloproteinase- ( 645) 333 45.5 0.00077
NP_002419 (OMIM: 602261) matrix metalloproteinase- ( 669) 326 44.9 0.0012
>>NP_004985 (OMIM: 120361,613073) matrix metalloproteina (707 aa)
initn: 4999 init1: 4999 opt: 4999 Z-score: 2529.4 bits: 478.5 E(85289): 3.7e-134
Smith-Waterman score: 4999; 99.7% identity (99.9% similar) in 707 aa overlap (1-707:1-707)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 ITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 FDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 YSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQFPFIFQGQSYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_004 YSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTQDGNADGKPCQFPFIFQGQSYS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 ACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 CTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 PMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSER
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 PTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLYLFKDGKYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLYLFKDGKYW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 RFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFFSGRQVWVYTGASVLGPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEERLSKKLFFFSGRQVWVYTGASVLGPRR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 LDKLGLGADVAQVTGALRSGRGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASEVDRMFPGVPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LDKLGLGADVAQVTGALRSGRGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASEVDRMFPGVPLD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB9 THDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 THDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPED
670 680 690 700
>>NP_004521 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV collage (660 aa)
initn: 2055 init1: 1226 opt: 1899 Z-score: 975.1 bits: 190.8 E(85289): 1.4e-47
Smith-Waterman score: 2132; 46.9% identity (68.3% similar) in 715 aa overlap (2-704:9-660)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYR-Y
.: :: .: .::: .. : .. ::::. . ::..:: .:: :
NP_004 MEALMARGALTGPLR-ALCLLGCLLSHAAAAPSPIIKFPGDVAPK-TDKELAVQYLNTFY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB9 GYTRVAEMRGESKSL---GPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQT
: . :: .: .: .:: ..::.::.::. :...:: :::: ::.. ..
NP_004 GCPK------ESCNLFVLKDTLKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPDVANYNF
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 FEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQ
: :: ...::: : .:. :: ..:::::::: .:: :::: :.:... .:::.:.
NP_004 FPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMIN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 FGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAA
:: ::::::::::::::::::: :: :. ::.::::::::.::.: :: ...:::::
NP_004 FGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 CHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQ
:.:::.:.:. :..:: :::::. ::::: :.. : ..:::: : :.: :::.:.::.
NP_004 CKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 FPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVF
::: ::: ::..:::.::.::::::.:: .::::: .:::: : ::: :::: : :::
NP_004 FPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTV-GGNSEGAPCVF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 PFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGL
::::::..: .::: ::.::..:::::.:.:.:.:::::::::::::::::::::::.::
NP_004 PFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 DHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCP
.::. : ::: :.: .:.. : .::..::..::: :. .
NP_004 EHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDID-----------------LG
420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 TGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNI-FDAIAEIG
::: :: ::. : . :. .: ::.::.:
NP_004 TGPT-------PTLGPVTP-------------------------EICKQDIVFDGIAQIR
460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 NQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFFSGRQVW
.....::: :: : ..:.::.:.: :: ::.:.:.:.: : .: ::.: . :
NP_004 GEIFFFKDRFIWRTVTPR-DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYW
490 500 510 520 530 540
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 VYTGASVL--G-PRRLDKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRRLWRFD-VKAQMVD
.:. ::.: : :. : .::: :: .: .:. : : .:.: ..::.. :: .: :
NP_004 IYS-ASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKM-D
550 560 570 580 590
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 PRSASEVDRMFPGVP--LDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDI
: . . . ..: ::. .: ..:: . .: .. ..: :..: . : . :
NP_004 PGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQS-LKSV-KFGSIKSDW
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 LQCPED
: :
NP_004 LGC
660
>>NP_001121363 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV coll (610 aa)
initn: 2006 init1: 1226 opt: 1839 Z-score: 945.5 bits: 185.2 E(85289): 6.3e-46
Smith-Waterman score: 2072; 48.5% identity (70.0% similar) in 646 aa overlap (67-704:20-610)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 TNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEMRGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRT
: .: .:: ..::.::.::. :...::
NP_001 MQYLNTFYGCPKESCNLFVLKDTLKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRK
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 PRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTF
:::: ::.. .. : :: ...::: : .:. :: ..:::::::: .:: :::: :
NP_001 PRCGNPDVANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRF
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 TRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGV
.:... .:::.:.:: ::::::::::::::::::: :: :. ::.::::::::.::.:
NP_001 SRIHDGEADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQ
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 VVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERL
:: ...::::: :.:::.:.:. :..:: :::::. ::::: :.. : ..:::: : :
NP_001 VVRVKYGNADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEAL
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 YTRDGNADGKPCQFPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADST
.: :::.:.::.::: ::: ::..:::.::.::::::.:: .::::: .:::: : ::
NP_001 FTMGGNAEGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMST
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLF
: :::: : :::::::::..: .::: ::.::..:::::.:.:.:.:::::::::::::
NP_001 V-GGNSEGAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLF
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 LVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTT
::::::::::.::.::. : ::: :.: .:.. : .::..::..::: :. .
NP_001 LVAAHEFGHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDID------
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 TTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDAC
::: :: ::. : . :
NP_001 -----------LGTGPT-------PTLGPVTP-------------------------EIC
410
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 NVNI-FDAIAEIGNQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPL
. .: ::.::.: .....::: :: : ..:.::.:.: :: ::.:.:.:.: :
NP_001 KQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPR-DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQ
420 430 440 450 460 470
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 SKKLFFFSGRQVWVYTGASVL--G-PRRLDKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRR
.: ::.: . :.:. ::.: : :. : .::: :: .: .:. : : .:.: .
NP_001 EEKAVFFAGNEYWIYS-ASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDK
480 490 500 510 520 530
640 650 660 670 680
pF1KB9 LWRFD-VKAQMVDPRSASEVDRMFPGVP--LDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSEL
.::.. :: .: :: . . . ..: ::. .: ..:: . .: .. ..: :
NP_001 FWRYNEVKKKM-DPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQS-L
540 550 560 570 580 590
690 700
pF1KB9 NQVDQVGYVTYDILQCPED
..: . : . : : :
NP_001 KSV-KFGSIKSDWLGC
600 610
>>NP_001289439 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV coll (584 aa)
initn: 2006 init1: 1226 opt: 1838 Z-score: 945.3 bits: 185.1 E(85289): 6.5e-46
Smith-Waterman score: 2071; 48.7% identity (70.3% similar) in 639 aa overlap (74-704:1-584)
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LAEEYLYRYGYTRVAEMRGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPD
.:: ..::.::.::. :...:: :::: ::
NP_001 MQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPD
10 20 30
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:::.::.::. : ::: :.: .:.. : .::..::..::: :. .
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.::.: .....::: :: : ..:.::.:.: :: ::.:.:.:.: : .: ::
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. : : :
NP_001 SIKSDWLGC
580
>>NP_001289438 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV coll (584 aa)
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NP_001 MQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPD
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NP_001 VANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGE
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NP_001 NADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNA
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NP_001 AGNEYWIYS-ASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEV
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pF1KB9 YVTYDILQCPED
. : : :
NP_001 SIKSDWLGC
580
>>NP_002413 (OMIM: 185250,614466) stromelysin-1 prepropr (477 aa)
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:: ::::: ..::::. :::::.::::::::: :.
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:.:
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:: : : . :. . :::.. . ...
NP_002 V--------------PPE--PGTPANCDPALS----------------FDAVSTLRGEIL
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NP_002 IFKDRHFWRKSL-RKLEPEL-HLISSFWPSLPSGVDAAYEVTSKDLVFIFKGNQFWAIRG
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pF1KB9 ASVLG--PRRLDKLGLGADVAQVTGALRSG-RGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASE
: . :: . ::. : .. .:. . ..: .: . :::: : . ..: ..
NP_002 NEVRAGYPRGIHTLGFPPTVRKIDAAISDKEKNKTYFFVEDKYWRFDEKRNSMEPGFPKQ
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. . :::. ::. : ..: ... ::. :..
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pF1KB9 LLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGY-TRVAEMRGES--KSL
: :.::.:: : . : .: . :. .:.
NP_002 VLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYHPTNLAGILKENAASSM
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pF1KB9 GPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHNITYWIQN
: .:. ..: ::.::. :: .:. :::::::.:....: ::: . :.:: : :
NP_002 TERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLTYRIVN
70 80 90 100 110 120
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pF1KB9 YSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYPFDGKDGL
:. :. .. .. :: .:: .:: ::::.:::... :::.:.::. :::: ::::: .::
NP_002 YTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFDGPSGL
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:::::::::. ::::::::: :
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:.:. .::.:::::::::::.::::::. : :::.:.: .:
NP_002 -------TSSS------------KGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGALMFPIYTYT-
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: : :::.::. :::: : :.:. : : : : ::
NP_002 GKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKT--------PDKC-------DPS-----
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:: .:::. . .. ..::: .::.
NP_002 -------------------------LS----------LDAITSLRGETMIFKDRFFWRLH
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. . :: . :: :: ..:...:.: .:.: ::. :. .: ..: : :...
NP_002 PQQVDAEL--FLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNGYDILEGYPKKI
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. :.. :: . . .. : : :.. .: . . .:: :
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:.:..
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:::::.: ::: : .::::::. :::: ::..: .: .: :.:
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:: : . : : . ::::. . .. .
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707 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Sat Nov 5 15:02:53 2016 done: Sat Nov 5 15:02:55 2016
Total Scan time: 12.990 Total Display time: 0.160
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]