Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9974
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9974, 707 aa
1>>>pF1KB9974 707 - 707 aa - 707 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.3063+/-0.00127; mu= -6.4400+/- 0.077
mean_var=364.1489+/-71.996, 0's: 0 Z-trim(113.4): 50 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.067210
statistics sampled from 13949 (13995) to 13949 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.43), width: 16
Scan time: 4.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13390.1 MMP9 gene_id:4318|Hs108|chr20 ( 707) 4999 499.1 9.1e-141
CCDS10752.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 660) 1899 198.5 2.6e-50
CCDS45487.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 610) 1839 192.7 1.4e-48
CCDS76869.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 584) 1838 192.6 1.4e-48
CCDS8323.1 MMP3 gene_id:4314|Hs108|chr11 ( 477) 611 73.5 8.1e-13
CCDS8324.1 MMP13 gene_id:4322|Hs108|chr11 ( 471) 606 73.0 1.1e-12
CCDS8321.1 MMP10 gene_id:4319|Hs108|chr11 ( 476) 603 72.7 1.4e-12
CCDS8322.1 MMP1 gene_id:4312|Hs108|chr11 ( 469) 580 70.5 6.4e-12
>>CCDS13390.1 MMP9 gene_id:4318|Hs108|chr20 (707 aa)
initn: 4999 init1: 4999 opt: 4999 Z-score: 2640.7 bits: 499.1 E(32554): 9.1e-141
Smith-Waterman score: 4999; 99.7% identity (99.9% similar) in 707 aa overlap (1-707:1-707)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEM
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CCDS13 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 ITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYP
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CCDS13 ITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 FDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 YSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQFPFIFQGQSYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS13 YSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTQDGNADGKPCQFPFIFQGQSYS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 ACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 CTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 PMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSER
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 PTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLYLFKDGKYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLYLFKDGKYW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 RFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFFSGRQVWVYTGASVLGPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEERLSKKLFFFSGRQVWVYTGASVLGPRR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 LDKLGLGADVAQVTGALRSGRGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASEVDRMFPGVPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LDKLGLGADVAQVTGALRSGRGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASEVDRMFPGVPLD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB9 THDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 THDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPED
670 680 690 700
>>CCDS10752.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 (660 aa)
initn: 2055 init1: 1226 opt: 1899 Z-score: 1016.6 bits: 198.5 E(32554): 2.6e-50
Smith-Waterman score: 2132; 46.9% identity (68.3% similar) in 715 aa overlap (2-704:9-660)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYR-Y
.: :: .: .::: .. : .. ::::. . ::..:: .:: :
CCDS10 MEALMARGALTGPLR-ALCLLGCLLSHAAAAPSPIIKFPGDVAPK-TDKELAVQYLNTFY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB9 GYTRVAEMRGESKSL---GPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQT
: . :: .: .: .:: ..::.::.::. :...:: :::: ::.. ..
CCDS10 GCPK------ESCNLFVLKDTLKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPDVANYNF
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 FEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQ
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CCDS10 FPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMIN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 FGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAA
:: ::::::::::::::::::: :: :. ::.::::::::.::.: :: ...:::::
CCDS10 FGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 CHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQ
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CCDS10 CKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 FPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVF
::: ::: ::..:::.::.::::::.:: .::::: .:::: : ::: :::: : :::
CCDS10 FPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTV-GGNSEGAPCVF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 PFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGL
::::::..: .::: ::.::..:::::.:.:.:.:::::::::::::::::::::::.::
CCDS10 PFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 DHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCP
.::. : ::: :.: .:.. : .::..::..::: :. .
CCDS10 EHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDID-----------------LG
420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 TGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNI-FDAIAEIG
::: :: ::. : . :. .: ::.::.:
CCDS10 TGPT-------PTLGPVTP-------------------------EICKQDIVFDGIAQIR
460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 NQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFFSGRQVW
.....::: :: : ..:.::.:.: :: ::.:.:.:.: : .: ::.: . :
CCDS10 GEIFFFKDRFIWRTVTPR-DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYW
490 500 510 520 530 540
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 VYTGASVL--G-PRRLDKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRRLWRFD-VKAQMVD
.:. ::.: : :. : .::: :: .: .:. : : .:.: ..::.. :: .: :
CCDS10 IYS-ASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKM-D
550 560 570 580 590
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 PRSASEVDRMFPGVP--LDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDI
: . . . ..: ::. .: ..:: . .: .. ..: :..: . : . :
CCDS10 PGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQS-LKSV-KFGSIKSDW
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 LQCPED
: :
CCDS10 LGC
660
>>CCDS45487.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 (610 aa)
initn: 2006 init1: 1226 opt: 1839 Z-score: 985.7 bits: 192.7 E(32554): 1.4e-48
Smith-Waterman score: 2072; 48.5% identity (70.0% similar) in 646 aa overlap (67-704:20-610)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 TNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEMRGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRT
: .: .:: ..::.::.::. :...::
CCDS45 MQYLNTFYGCPKESCNLFVLKDTLKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRK
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 PRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTF
:::: ::.. .. : :: ...::: : .:. :: ..:::::::: .:: :::: :
CCDS45 PRCGNPDVANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRF
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 TRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGV
.:... .:::.:.:: ::::::::::::::::::: :: :. ::.::::::::.::.:
CCDS45 SRIHDGEADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQ
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 VVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERL
:: ...::::: :.:::.:.:. :..:: :::::. ::::: :.. : ..:::: : :
CCDS45 VVRVKYGNADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEAL
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 YTRDGNADGKPCQFPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADST
.: :::.:.::.::: ::: ::..:::.::.::::::.:: .::::: .:::: : ::
CCDS45 FTMGGNAEGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMST
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLF
: :::: : :::::::::..: .::: ::.::..:::::.:.:.:.:::::::::::::
CCDS45 V-GGNSEGAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLF
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 LVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTT
::::::::::.::.::. : ::: :.: .:.. : .::..::..::: :. .
CCDS45 LVAAHEFGHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDID------
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 TTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDAC
::: :: ::. : . :
CCDS45 -----------LGTGPT-------PTLGPVTP-------------------------EIC
410
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 NVNI-FDAIAEIGNQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPL
. .: ::.::.: .....::: :: : ..:.::.:.: :: ::.:.:.:.: :
CCDS45 KQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPR-DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQ
420 430 440 450 460 470
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 SKKLFFFSGRQVWVYTGASVL--G-PRRLDKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRR
.: ::.: . :.:. ::.: : :. : .::: :: .: .:. : : .:.: .
CCDS45 EEKAVFFAGNEYWIYS-ASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDK
480 490 500 510 520 530
640 650 660 670 680
pF1KB9 LWRFD-VKAQMVDPRSASEVDRMFPGVP--LDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSEL
.::.. :: .: :: . . . ..: ::. .: ..:: . .: .. ..: :
CCDS45 FWRYNEVKKKM-DPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQS-L
540 550 560 570 580 590
690 700
pF1KB9 NQVDQVGYVTYDILQCPED
..: . : . : : :
CCDS45 KSV-KFGSIKSDWLGC
600 610
>>CCDS76869.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 (584 aa)
initn: 2006 init1: 1226 opt: 1838 Z-score: 985.4 bits: 192.6 E(32554): 1.4e-48
Smith-Waterman score: 2071; 48.7% identity (70.3% similar) in 639 aa overlap (74-704:1-584)
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LAEEYLYRYGYTRVAEMRGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPD
.:: ..::.::.::. :...:: :::: ::
CCDS76 MQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPD
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 LGRFQTFEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRD
.. .. : :: ...::: : .:. :: ..:::::::: .:: :::: :.:... .
CCDS76 VANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGE
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 ADIVIQFGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFG
:::.:.:: ::::::::::::::::::: :: :. ::.::::::::.::.: :: ...:
CCDS76 ADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYG
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 NADGAACHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNA
:::: :.:::.:.:. :..:: :::::. ::::: :.. : ..:::: : :.: :::
CCDS76 NADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNA
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 DGKPCQFPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSA
.:.::.::: ::: ::..:::.::.::::::.:: .::::: .:::: : ::: ::::
CCDS76 EGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTV-GGNSE
220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 GELCVFPFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEF
: :::::::::..: .::: ::.::..:::::.:.:.:.::::::::::::::::::::
CCDS76 GAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEF
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 GHALGLDHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTA
:::.::.::. : ::: :.: .:.. : .::..::..::: :. .
CCDS76 GHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDID-------------
330 340 350 360 370
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 PPTVCPTGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNI-FD
::: :: ::. : . :. .: ::
CCDS76 ----LGTGPT-------PTLGPVTP-------------------------EICKQDIVFD
380 390 400
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 AIAEIGNQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFF
.::.: .....::: :: : ..:.::.:.: :: ::.:.:.:.: : .: ::
CCDS76 GIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPR-DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFF
410 420 430 440 450
590 600 610 620 630
pF1KB9 SGRQVWVYTGASVL--G-PRRLDKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRRLWRFD-V
.: . :.:. ::.: : :. : .::: :: .: .:. : : .:.: ..::.. :
CCDS76 AGNEYWIYS-ASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEV
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 KAQMVDPRSASEVDRMFPGVP--LDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVG
: .: :: . . . ..: ::. .: ..:: . .: .. ..: :..: . :
CCDS76 KKKM-DPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQS-LKSV-KFG
520 530 540 550 560 570
700
pF1KB9 YVTYDILQCPED
. : : :
CCDS76 SIKSDWLGC
580
>>CCDS8323.1 MMP3 gene_id:4314|Hs108|chr11 (477 aa)
initn: 992 init1: 582 opt: 611 Z-score: 343.6 bits: 73.5 E(32554): 8.1e-13
Smith-Waterman score: 673; 28.3% identity (45.5% similar) in 693 aa overlap (8-689:6-459)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEM
.:.:: .. : : : . : : . :. .:...:: : : ..
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. . :. ::. . .:: :.: ::.::: ::..:: :::::::.:.:.:: : :
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:.. ..:: : ::. :::. ..:.: .:. .: ::::::.:.: .:::.:.:.: ::
CCDS83 WRKTHLTYRIVNYTPDLPKDAVDSAVEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVREH
110 120 130 140 150 160
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:: ::::: ..::::. :::::.::::::::: :.
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:.:
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::::::.:. .:. : .::.:::. :::: :: . : .: . :: :
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:: : : . :. . :::.. . ...
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.::: ..:: : : .:. ::.. ::.:: .:...: . .:.:.: : :. :
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: . :: . ::. : .. .:. . ..: .: . :::: : . ..: ..
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. . :::. ::. : ..: ... ::. :..
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CCDS83 -------TSSS------------KGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGALMFPIYTYT-
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:: .:::. . .. ..::: .::.
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..::: .: ....:.. :: ::::: ..::.: ...: ... :::.
CCDS83 SELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPRLIEEDFPGIGDK
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. :.. :: . . .. : : :.. .: . . .:: :
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CCDS83 NEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRFDENSQSMEQGFPRL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]