Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9962
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9962, 692 aa
1>>>pF1KB9962 692 - 692 aa - 692 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6501+/-0.000971; mu= 12.9434+/- 0.058
mean_var=88.9621+/-17.437, 0's: 0 Z-trim(106.4): 14 B-trim: 134 in 2/47
Lambda= 0.135979
statistics sampled from 8951 (8959) to 8951 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 2.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31149.1 DCLRE1C gene_id:64421|Hs108|chr10 ( 692) 4644 921.5 0
CCDS31150.1 DCLRE1C gene_id:64421|Hs108|chr10 ( 572) 3843 764.4 0
CCDS7105.1 DCLRE1C gene_id:64421|Hs108|chr10 ( 577) 3836 763.0 0
CCDS7584.1 DCLRE1A gene_id:9937|Hs108|chr10 (1040) 312 71.8 5.9e-12
CCDS866.1 DCLRE1B gene_id:64858|Hs108|chr1 ( 532) 293 67.9 4.2e-11
>>CCDS31149.1 DCLRE1C gene_id:64421|Hs108|chr10 (692 aa)
initn: 4644 init1: 4644 opt: 4644 Z-score: 4923.9 bits: 921.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4644; 100.0% identity (100.0% similar) in 692 aa overlap (1-692:1-692)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSSFEGQMAEYPTISIDRFDRENLRARAYFLSHCHKDHMKGLRAPTLKRRLECSLKVYLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSSFEGQMAEYPTISIDRFDRENLRARAYFLSHCHKDHMKGLRAPTLKRRLECSLKVYLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 CSPVTKELLLTSPKYRFWKKRIISIEIETPTQISLVDEASGEKEEIVVTLLPAGHCPGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSPVTKELLLTSPKYRFWKKRIISIEIETPTQISLVDEASGEKEEIVVTLLPAGHCPGSV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 MFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELLHSGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELLHSGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYGYEYLFTNLSEELGVQVHVNKLDMFRNMPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYGYEYLFTNLSEELGVQVHVNKLDMFRNMPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ILHHLTTDRNTQIHACRHPKAEEYFQWSKLPCGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFGERSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ILHHLTTDRNTQIHACRHPKAEEYFQWSKLPCGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFGERSRK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 TNVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLSYLCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TNVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLSYLCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 SSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDDYLFDDPLPIPLRHKVPYPETFHPEVFSMTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDDYLFDDPLPIPLRHKVPYPETFHPEVFSMTA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 VSEKQPEKLRQTPGCCRAECMQSSRFTNFVDCEESNSESEEEVGIPASLQGDLGSVLHLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VSEKQPEKLRQTPGCCRAECMQSSRFTNFVDCEESNSESEEEVGIPASLQGDLGSVLHLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KADGDVPQWEVFFKRNDEITDESLENFPSSTVAGGSQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KADGDVPQWEVFFKRNDEITDESLENFPSSTVAGGSQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 THITEQGSQGWDSQSDTVLLSSQERNSGDITSLDKADYRPTIKENIPASLMEQNVICPKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 THITEQGSQGWDSQSDTVLLSSQERNSGDITSLDKADYRPTIKENIPASLMEQNVICPKD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 TYSDLKSRDKDVTIVPSTGEPTTLSSETHIPEEKSLLNLSTNADSQSSSDFEVPSTPEAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TYSDLKSRDKDVTIVPSTGEPTTLSSETHIPEEKSLLNLSTNADSQSSSDFEVPSTPEAE
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KB9 LPKREHLQYLYEKLATGESIAVKKRKCSLLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LPKREHLQYLYEKLATGESIAVKKRKCSLLDT
670 680 690
>>CCDS31150.1 DCLRE1C gene_id:64421|Hs108|chr10 (572 aa)
initn: 3843 init1: 3843 opt: 3843 Z-score: 4076.0 bits: 764.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3843; 100.0% identity (100.0% similar) in 572 aa overlap (121-692:1-572)
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 TQISLVDEASGEKEEIVVTLLPAGHCPGSVMFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELL
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 HSGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSREECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HSGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSREECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAY
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 GYEYLFTNLSEELGVQVHVNKLDMFRNMPEILHHLTTDRNTQIHACRHPKAEEYFQWSKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GYEYLFTNLSEELGVQVHVNKLDMFRNMPEILHHLTTDRNTQIHACRHPKAEEYFQWSKL
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 PCGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFGERSRKTNVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PCGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFGERSRKTNVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLS
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 YLCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YLCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDD
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 YLFDDPLPIPLRHKVPYPETFHPEVFSMTAVSEKQPEKLRQTPGCCRAECMQSSRFTNFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YLFDDPLPIPLRHKVPYPETFHPEVFSMTAVSEKQPEKLRQTPGCCRAECMQSSRFTNFV
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 DCEESNSESEEEVGIPASLQGDLGSVLHLQKADGDVPQWEVFFKRNDEITDESLENFPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DCEESNSESEEEVGIPASLQGDLGSVLHLQKADGDVPQWEVFFKRNDEITDESLENFPSS
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 TVAGGSQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHITEQGSQGWDSQSDTVLLSSQERNSGDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TVAGGSQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHITEQGSQGWDSQSDTVLLSSQERNSGDI
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 TSLDKADYRPTIKENIPASLMEQNVICPKDTYSDLKSRDKDVTIVPSTGEPTTLSSETHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TSLDKADYRPTIKENIPASLMEQNVICPKDTYSDLKSRDKDVTIVPSTGEPTTLSSETHI
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 PEEKSLLNLSTNADSQSSSDFEVPSTPEAELPKREHLQYLYEKLATGESIAVKKRKCSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PEEKSLLNLSTNADSQSSSDFEVPSTPEAELPKREHLQYLYEKLATGESIAVKKRKCSLL
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 DT
::
CCDS31 DT
>>CCDS7105.1 DCLRE1C gene_id:64421|Hs108|chr10 (577 aa)
initn: 3836 init1: 3836 opt: 3836 Z-score: 4068.5 bits: 763.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3836; 100.0% identity (100.0% similar) in 571 aa overlap (122-692:7-577)
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 QISLVDEASGEKEEIVVTLLPAGHCPGSVMFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELLH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MKHQERFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELLH
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 SGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSREECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 SGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSREECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYG
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 YEYLFTNLSEELGVQVHVNKLDMFRNMPEILHHLTTDRNTQIHACRHPKAEEYFQWSKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 YEYLFTNLSEELGVQVHVNKLDMFRNMPEILHHLTTDRNTQIHACRHPKAEEYFQWSKLP
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 CGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFGERSRKTNVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 CGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFGERSRKTNVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLSY
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 LCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 LCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDDY
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 LFDDPLPIPLRHKVPYPETFHPEVFSMTAVSEKQPEKLRQTPGCCRAECMQSSRFTNFVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 LFDDPLPIPLRHKVPYPETFHPEVFSMTAVSEKQPEKLRQTPGCCRAECMQSSRFTNFVD
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 CEESNSESEEEVGIPASLQGDLGSVLHLQKADGDVPQWEVFFKRNDEITDESLENFPSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 CEESNSESEEEVGIPASLQGDLGSVLHLQKADGDVPQWEVFFKRNDEITDESLENFPSST
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 VAGGSQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHITEQGSQGWDSQSDTVLLSSQERNSGDIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 VAGGSQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHITEQGSQGWDSQSDTVLLSSQERNSGDIT
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 SLDKADYRPTIKENIPASLMEQNVICPKDTYSDLKSRDKDVTIVPSTGEPTTLSSETHIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 SLDKADYRPTIKENIPASLMEQNVICPKDTYSDLKSRDKDVTIVPSTGEPTTLSSETHIP
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 EEKSLLNLSTNADSQSSSDFEVPSTPEAELPKREHLQYLYEKLATGESIAVKKRKCSLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 EEKSLLNLSTNADSQSSSDFEVPSTPEAELPKREHLQYLYEKLATGESIAVKKRKCSLLD
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 T
:
CCDS71 T
>>CCDS7584.1 DCLRE1A gene_id:9937|Hs108|chr10 (1040 aa)
initn: 191 init1: 101 opt: 312 Z-score: 328.1 bits: 71.8 E(32554): 5.9e-12
Smith-Waterman score: 366; 32.1% identity (56.9% similar) in 346 aa overlap (15-346:713-1020)
10 20 30 40
pF1KB9 MSSFEGQMAEYPTISIDRFDRENLRA-RAYFLSHCHKDHMKGLR
..: :. ... ::::.: :.::. ::
CCDS75 GNKKIPESSNVGGSRKKTCPFYKKIPGTGFTVDAFQYGVVEGCTAYFLTHFHSDHYAGLS
690 700 710 720 730 740
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 APTLKRRLECSLKVYLYCSPVTKELLLTSPKYRFWKKRIISIEIETPTQISLVDEASGEK
. .::: .: .:: . : . .. : . ..: .. : :
CCDS75 K---------HFTFPVYCSEITGNLL--KNKLHVQEQYIHPLPLDTECIVN------GVK
750 760 770 780
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 EEIVVTLLPAGHCPGSVMFLFQGNNGTV-LYTGDFRLAQGEAARMELLHSGGRVKDIQSV
:.:: :.::::.::.:: :::: :.::::: :. : :: . . .. .
CCDS75 ----VVLLDANHCPGAVMILFYLPNGTVILHTGDFR-ADPSMER-SLLAD----QKVHML
790 800 810 820 830
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 YLDTTFCDPRFYQIPSREECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYGYEYLFTNLSEE
:::::.:.:. : .::..: . ... . .: .: :.. . . : : .: ...
CCDS75 YLDTTYCSPE-YTFPSQQEVIRFAINTAFEAVTLNP-HALVVCGTYSIGKEKVFLAIADV
840 850 860 870 880 890
230 240 250 260 270
pF1KB9 LGVQVHVN----KLDMFRNMPEILHHLTTDR-NTQIHACRHPKAEEYFQ--WSKLP-CGI
:: .: .. : . :.::: .::: .. .: : . :. :.: ::
CCDS75 LGSKVGMSQEKYKTLQCLNIPEINSLITTDMCSSLVHLL--PMMQINFKGLQSHLKKCG-
900 910 920 930 940 950
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 TSRNRIPLHIISIKPSTMWF--GERSRKTNVIVRT-GESS-YRACFSFHSSYSEIKDFLS
. :. :....: : : .. .: ..:: .: :. : : .: :::: :.: :..
CCDS75 GKYNQ----ILAFRP-TGWTHSNKFTRIADVIPQTKGNISIYGIPYSEHSSYLEMKRFVQ
960 970 980 990 1000
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 YLCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDD
.: : . :.: :::
CCDS75 WLKPQKIIPTV-NVGTWKSRSTMEKYFREWKLEAGY
1010 1020 1030 1040
>>CCDS866.1 DCLRE1B gene_id:64858|Hs108|chr1 (532 aa)
initn: 348 init1: 182 opt: 293 Z-score: 312.7 bits: 67.9 E(32554): 4.2e-11
Smith-Waterman score: 425; 28.3% identity (51.9% similar) in 520 aa overlap (6-489:3-476)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSSFEGQMAEYPTISIDRFD-RENLRARAYFLSHCHKDHMKGLRAPTLKRRLECSLKVYL
: . . :..: .. :. :: .:::: :.:: :: . : : :
CCDS86 MNGVLIPHTPIAVDFWSLRRAGTARLFFLSHMHSDHTVGLSS-TWARPL--------
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 YCSPVTKELLLTSPKYRFWKKRIISIEIETPTQISLVDEASGEKEEIVVTLLPAGHCPGS
::::.: .:: . . :. : ..:. ... .:: . .: ..:::: :.:::::
CCDS86 YCSPITAHLL--HRHLQVSKQWIQALEV-GESHVLPLDEIG--QETMTVTLLDANHCPGS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VMFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELLHSGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSR
:::::.: ::.::::::: . . . : : :.:...:::.: :.: . .:::
CCDS86 VMFLFEGYFGTILYTGDFRYTPS-MLKEPALTLG---KQIHTLYLDNTNCNPALV-LPSR
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 EECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYGYEYLFTNLSEELGVQVHVN--KLDMFRN
.: ...:.: . : : . .. . : : :. .:. :. . : .. .:.. .
CCDS86 QEAAHQIVQLIR----KHPQHNIKIGLYS-LGKESLLEQLALEFQTWVVLSPRRLELVQL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 MPEILHHLTTDRNTQIHACRHPKA--EEYFQWSKLPCGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFG
. . .. .::: : . ....:.. : :.: :.
CCDS86 LGLADVFTVEEKAGRIHAVDHMEICHSNMLRWNQTH---------PT--IAILPT-----
220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 ERSRKTNVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLSYLCPVNAYPNVI--PVGTTMDKVV-
::: : . . . .: ::::::.. :.. : : .. : : : : .:..
CCDS86 --SRK---IHSSHPDIHVIPYSDHSSYSELRAFVAALKPCQVVPIVSRRPCGGFQDSLSP
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390
pF1KB9 EILKPLC-------RSSQSTEPKYKPL--GKLKRART--VHRDSEEE--DDYLFDDPLPI
.: :: ::.: .:. : .::: :: : .: :: :. :
CCDS86 RISVPLIPDSVQQYMSSSSRKPSLLWLLERRLKRPRTQGVVFESPEESADQSQADRDSKK
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 PLRHKV-PYPETFHPEVFSMTAVSEKQ--PEKLRQTPGCCRAECMQSSRFTNFV------
..:. :.: .. . .:: :. . . : ...: : ..
CCDS86 AKKEKLSPWPADLEKQPSHHPLRIKKQLFPDLYSKEWNKAVPFCESQKRVTMLTAPLGFS
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500
pF1KB9 ------DCEESNSESEEEVGIPASLQGDLGSVLHLQKADGDVPQWEVFFKRNDEITDESL
: : .....::.:. . : .:. .: :. :
CCDS86 VHLRSTDEEFISQKTREEIGLGSPLV-PMGDDDGGPEATGNQSAWMGHGSPLSHSSKGTP
440 450 460 470 480 490
510 520 530 540 550 560
pF1KB9 ENFPSSTVAGGSQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHITEQGSQGWDSQSDTVLLSSQE
CCDS86 LLATEFRGLALKYLLTPVNFFQAGYSSRRFDQQVEKYHKPC
500 510 520 530
692 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 04:43:22 2016 done: Mon Nov 7 04:43:22 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]