FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9948, 673 aa
1>>>pF1KB9948 673 - 673 aa - 673 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6083+/-0.00121; mu= -7.5330+/- 0.070
mean_var=366.9989+/-83.220, 0's: 0 Z-trim(110.4): 709 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.066949
statistics sampled from 10724 (11548) to 10724 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.355), width: 16
Scan time: 2.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10619.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 673) 4690 468.2 1.7e-131
CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 671) 4479 447.8 2.4e-125
CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17 ( 672) 3849 386.9 4.9e-107
CCDS12867.1 PRKCG gene_id:5582|Hs108|chr19 ( 697) 1864 195.2 2.6e-49
CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2 ( 737) 1526 162.6 1.8e-39
CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14 ( 683) 1345 145.1 3.2e-34
CCDS60482.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 581) 1275 138.3 3.1e-32
CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 706) 1275 138.3 3.5e-32
CCDS2870.1 PRKCD gene_id:5580|Hs108|chr3 ( 676) 1265 137.4 6.6e-32
CCDS42513.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 942) 1113 122.8 2.2e-27
CCDS42514.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 948) 1113 122.8 2.2e-27
CCDS81350.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 936) 1106 122.1 3.5e-27
CCDS714.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 984) 1106 122.2 3.6e-27
CCDS41229.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 409) 1094 120.6 4.4e-27
CCDS55563.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 488) 1094 120.7 4.9e-27
CCDS37.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 592) 1094 120.8 5.7e-27
CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 479) 1071 118.5 2.3e-26
CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14 ( 480) 1068 118.2 2.8e-26
CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19 ( 481) 1068 118.2 2.8e-26
CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 465) 1067 118.1 2.9e-26
CCDS6908.1 PKN3 gene_id:29941|Hs108|chr9 ( 889) 1041 115.8 2.6e-25
CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 431) 964 108.1 2.7e-23
CCDS47478.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 445) 964 108.1 2.8e-23
CCDS47477.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 459) 964 108.1 2.8e-23
CCDS47476.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 526) 964 108.2 3.1e-23
CCDS13320.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 427) 933 105.1 2.2e-22
CCDS13321.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 367) 922 104.0 4e-22
CCDS6195.1 SGK3 gene_id:23678|Hs108|chr8 ( 496) 912 103.1 9.8e-22
CCDS83148.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 758) 914 103.5 1.2e-21
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 451) 907 102.6 1.3e-21
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 472) 906 102.5 1.4e-21
CCDS11621.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 525) 907 102.7 1.4e-21
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 733) 908 102.9 1.7e-21
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 735) 897 101.8 3.5e-21
CCDS34570.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 741) 896 101.8 3.8e-21
CCDS41677.1 RPS6KB2 gene_id:6199|Hs108|chr11 ( 482) 891 101.1 3.9e-21
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 719) 894 101.5 4.2e-21
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 894 101.6 4.3e-21
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 744) 894 101.6 4.4e-21
CCDS3212.2 PRKCI gene_id:5584|Hs108|chr3 ( 596) 854 97.6 5.4e-20
CCDS45149.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 549) 849 97.1 7.1e-20
CCDS73313.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11 ( 765) 850 97.3 8.4e-20
CCDS8073.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11 ( 772) 850 97.3 8.5e-20
CCDS9893.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 802) 849 97.2 9.3e-20
CCDS83480.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 842 96.5 1.4e-19
CCDS14451.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 842 96.5 1.4e-19
CCDS62272.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 502) 812 93.5 8e-19
CCDS691.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 351) 799 92.1 1.5e-18
CCDS72813.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 339) 795 91.7 1.9e-18
CCDS55610.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 355) 795 91.7 1.9e-18
>>CCDS10619.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 (673 aa)
initn: 4690 init1: 4690 opt: 4690 Z-score: 2474.1 bits: 468.2 E(32554): 1.7e-131
Smith-Waterman score: 4690; 100.0% identity (100.0% similar) in 673 aa overlap (1-673:1-673)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 RKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 EYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 FEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 RYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGFS
610 620 630 640 650 660
670
pF1KB9 FVNSEFLKPEVKS
:::::::::::::
CCDS10 FVNSEFLKPEVKS
670
>>CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 (671 aa)
initn: 4474 init1: 4328 opt: 4479 Z-score: 2364.0 bits: 447.8 E(32554): 2.4e-125
Smith-Waterman score: 4479; 96.6% identity (98.1% similar) in 668 aa overlap (1-667:1-668)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 RKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 EYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 FEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KB9 RYIDWEKLERKEIQPPYKPKACG-RNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGF
::::::::::::::::::::: :.. :::. :::.: ::: :. : :.::.:: ::
CCDS10 RYIDWEKLERKEIQPPYKPKARDKRDTSNFDKEFTRQPVELTPTDKLFIMNLDQNEFAGF
610 620 630 640 650 660
660 670
pF1KB9 SFVNSEFLKPEVKS
:..: ::.
CCDS10 SYTNPEFVINV
670
>>CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17 (672 aa)
initn: 4038 init1: 2055 opt: 3849 Z-score: 2035.1 bits: 386.9 E(32554): 4.9e-107
Smith-Waterman score: 3849; 80.1% identity (92.1% similar) in 674 aa overlap (1-673:1-670)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
::: : . ... . :::::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::
CCDS11 MADVFPGNDSTASQDVANRFARKGALRQKNVHEVKDHKFIARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::.::::::::::
CCDS11 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPDTDDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDA
::::::::::::::: :::::.::.::::::: ::::.:::::..:.. . : : ::::
CCDS11 LLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYLKAEVADEKLHVTVRDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRL
:::.:::::::::::::::::::::.:::::::::. .:::.:::.: :.:: :::::::
CCDS11 KNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEE
:::::::: :.:::::::::::.:::.: ..::.:::.::::::.:::.: :.: :
CCDS11 SVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB9 LRQKFERAKISQ-GTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLS
::::::.::.. :.:: . . .. . ..: ::.:::::::::::::::::::::.
CCDS11 LRQKFEKAKLGPAGNKV----ISPSEDRKQPSNNLDRVKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLA
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 ERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFV
.::::.::::.:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::
CCDS11 DRKGTEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPPFLTQLHSCFQTVDRLYFV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 MEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGH
:::::::::::::::::.::::.::::::::.::::::...:::::::::::::::::::
CCDS11 MEYVNGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGIIYRDLKLDNVMLDSEGH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 IKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQA
:::::::::::.. :::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS11 IKIADFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAYGVLLYEMLAGQP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 PFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAF
::.::::::::::::::::.::::.:::::..:::::::::.::::::::::::..::::
CCDS11 PFDGEDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSVCKGLMTKHPAKRLGCGPEGERDVREHAF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 FRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGF
:: ::::::: .:::::.:::.::..:::::.:::: :::::::: :: :::::.::::
CCDS11 FRRIDWEKLENREIQPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRGQPVLTPPDQLVIANIDQSDFEGF
600 610 620 630 640 650
660 670
pF1KB9 SFVNSEFLKPEVKS
:.:: .:..: ..:
CCDS11 SYVNPQFVHPILQSAV
660 670
>>CCDS12867.1 PRKCG gene_id:5582|Hs108|chr19 (697 aa)
initn: 3565 init1: 1536 opt: 1864 Z-score: 998.8 bits: 195.2 E(32554): 2.6e-49
Smith-Waterman score: 3396; 69.5% identity (86.3% similar) in 691 aa overlap (1-673:1-687)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
:: . : ::: . : :::::::: :::::.:::::::::::::::::::::::.
CCDS12 MAGLGPGVGDSEGGPRPL-FCRKGALRQKVVHEVKSHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
::::.::::: ::::.:::::::: :::: ::: .::::.::::..:.::::::::::::
CCDS12 GKQGLQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCGS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB9 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDR-DVLIVLVRD
:::::.::::::. : ::::.::: .::::::.::::::::. .. . : . : : .
CCDS12 LLYGLVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERRGRLQLEIRAPTADEIHVTVGE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 AKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRR
:.::.::::::::::::::::::::.. .::::.:.: .::: ::::: :.:: .: .::
CCDS12 ARNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVERR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANE
::::.:::: ::::::::..:::.::: :: ::::.:::.::::::.:::: .. :
CCDS12 LSVEVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAPVDGWYKLLNQEEGEYYNVPV---ADADNC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB9 ELRQKFE----------RAKISQGTK-VPEEKTTNTVSKFDNNGNRD-RMKLTDFNFLMV
: :::: :.... ... .: . . : : : :....::.::::
CCDS12 SLLQKFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSPSPSPTDPKRCFFGASPGRLHISDFSFLMV
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 LGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLAL----PG-KPPF
:::::::::::.::.:.:::::.:::::::..:::::.::.:::::::: :: .: :
CCDS12 LGKGSFGKVMLAERRGSDELYAIKILKKDVIVQDDDVDCTLVEKRVLALGGRGPGGRPHF
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 LTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGI
:::::: ::: ::::::::::.::::::::::.:.::::::.:::::::::::::...::
CCDS12 LTQLHSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQQLGKFKEPHAAFYAAEIAIGLFFLHNQGI
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 IYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
:::::::::::::.::::::.::::::::.. :.::.:::::::::::::::::::::::
CCDS12 IYRDLKLDNVMLDAEGHIKITDFGMCKENVFPGTTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 DWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGK
:::.:::::::::::: ::.::::.::::.:::..:.::::.:.::::::::..::::::
CCDS12 DWWSFGVLLYEMLAGQPPFDGEDEEELFQAIMEQTVTYPKSLSREAVAICKGFLTKHPGK
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 RLGCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTP
::: ::.:: :. :.:::.::::.::: :: ::..:. :::..::::.:::: :.:::
CCDS12 RLGSGPDGEPTIRAHGFFRWIDWERLERLEIPPPFRPRPCGRSGENFDKFFTRAAPALTP
600 610 620 630 640 650
650 660 670
pF1KB9 PDQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS
::. :. .:::..:.::..:: .:..:...:
CCDS12 PDRLVLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVM
660 670 680 690
>>CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2 (737 aa)
initn: 2022 init1: 1207 opt: 1526 Z-score: 822.0 bits: 162.6 E(32554): 1.8e-39
Smith-Waterman score: 1959; 47.4% identity (67.9% similar) in 680 aa overlap (5-667:134-736)
10 20
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRF-----ARKGALRQK
..: :...:: . : :.::.:..
CCDS18 ELLQNGSRHFEDWIDLEPEGRVYVIIDLSGSSGEAPKDNEERVFRERMRPRKRQGAVRRR
110 120 130 140 150 160
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 NVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWG-FGKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPG
::.:..::: : ...:::.:::: ::::: .::::.::::: ::::::::.. .: :
CCDS18 -VHQVNGHKFMATYLRQPTYCSHCRDFIWGVIGKQGYQCQVCTCVVHKRCHELIITKCAG
170 180 190 200 210 220
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 ADKGPASDDPRSK-------HKFKIHTYSSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCMMNVHK
: . :. :. ::: ::.:. :::::::::::.::..::..: .: ::::.
CCDS18 LKKQETPDQVGSQRFSVNMPHKFGIHNYKVPTFCDHCGSLLWGLLRQGLQCKVCKMNVHR
230 240 250 260 270 280
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 RCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDAKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLI
:: :: ::.: :: . :.: : .
CCDS18 RCETNVAPNCGVD---ARGIAKV--------------------------LAD----LGVT
290 300
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 PDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSF
:: ..: :. : . . . . . :..:: :. :: :
CCDS18 PDKITNSGQRRKKLIAGAESPQPASGS---SPSEEDRSKSAP------TSPCDQE-----
310 320 330 340 350
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 GISELQKASVDGWFKLLS-QEEGEYFNVPVPPEGSEANEELRQKFERAKISQGTKVPEEK
:.::. .. : :: ...:: . :.: .: . : ... ::
CCDS18 -IKELE----NNIRKALSFDNRGEEHRAASSPDG-----QLMSPGENGEVRQGQA-----
360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 TTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQ
:. : .:::. ::::::::::::.: :: ::.::::.:::::..:
CCDS18 --------------KRLGLDEFNFIKVLGKGSFGKVMLAELKGKDEVYAVKVLKKDVILQ
410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 DDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKE
::::.:::.:::.::: : :.::::. :::: :::.::::::::::::..::. .: :
CCDS18 DDDVDCTMTEKRILALARKHPYLTQLYCCFQTKDRLFFVMEYVNGGDLMFQIQRSRKFDE
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KB9 PHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKT
:.. :::::.. .:.::...:.:::::::::..::.::: :.::::::::.: .:::: :
CCDS18 PRSRFYAAEVTSALMFLHQHGVIYRDLKLDNILLDAEGHCKLADFGMCKEGILNGVTTTT
510 520 530 540 550 560
510 520 530 540 550 560
pF1KB9 FCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAY
::::::::::::. :: ::::::.:::.:::.::: :::...::.::.::.. .: :
CCDS18 FCGTPDYIAPEILQELEYGPSVDWWALGVLMYEMMAGQPPFEADNEDDLFESILHDDVLY
570 580 590 600 610 620
570 580 590 600 610
pF1KB9 PKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGC--GPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYK
: .:::::.: :..:::.: ::::: . .:: ::.: ::. ::: ::.:.:.::.:
CCDS18 PVWLSKEAVSILKAFMTKNPHKRLGCVASQNGEDAIKQHPFFKEIDWVLLEQKKIKPPFK
630 640 650 660 670 680
620 630 640 650 660 670
pF1KB9 PKA-CGRNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS
:. :...:::. :::. :::: :. ....:.: ::.:::. . ...
CCDS18 PRIKTKRDVNNFDQDFTREEPVLTLVDEAIVKQINQEEFKGFSYFGEDLMP
690 700 710 720 730
>>CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14 (683 aa)
initn: 1741 init1: 1126 opt: 1345 Z-score: 728.0 bits: 145.1 E(32554): 3.2e-34
Smith-Waterman score: 1674; 44.5% identity (63.7% similar) in 659 aa overlap (22-669:158-683)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCS
:. :.:.. ::....::: : ...:::.::
CCDS97 GKVFVVITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRRR-VHQINGHKFMATYLRQPTYCS
130 140 150 160 170 180
60 70 80 90 100
pF1KB9 HCTDFIWG-FGKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSK--------H
:: .:::: :::::.::::: :::::::.... .: .. :. .. :
CCDS97 HCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRFGINIPH
190 200 210 220 230 240
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 KFKIHTYSSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRI
::.::.:. :::::::::::.:...::..: : :::: :: :: ::.. .:
CCDS97 KFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAVEL----
250 260 270 280 290 300
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 YIQAHIDRDVLIVLVRDAKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPE
::.:. : ::. .. : : :..
CCDS97 -----------------AKTLAGM---GLQPGNIS----PTSKLVSRS------------
310 320
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 WNETFRFQLKESDKDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEE
:.: : :::.: :
CCDS97 ---TLRRQGKESSK---------------------------------------------E
330
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 GEYFNVPVPPEGSEANEELRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDF
:. ..: :..: :. . .:
CCDS97 GNGIGV-----------------------------------------NSSN--RLGIDNF
340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 NFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPF
.:. ::::::::::::.. : : .:::::.:::::..:::::::::.:::.:.: . ::
CCDS97 EFIRVLGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPF
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 LTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGI
:::: :::: :::.::::.:::::::.:::. :: : .: :::::: .:.::..:::
CCDS97 LTQLFCCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGI
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 IYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
::::::::::.:: ::: :.::::::::.: .:::: :::::::::::::. . :: .:
CCDS97 IYRDLKLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAV
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 DWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGK
::::.:::::::: :.::::.:.::.::..:.. .:.:: . ..:..: :..:::.:
CCDS97 DWWAMGVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTM
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 RLGCGPEG-ERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGR-NAENFDRFFTRHPPVL
::: .: :. : .: ::. ::: .:....:.::..:. .: .. ::: : .. :::
CCDS97 RLGSLTQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVL
600 610 620 630 640 650
650 660 670
pF1KB9 TPPDQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS
:: :. . :.:.::..::.:. : :.:
CCDS97 TPIDEGHLPMINQDEFRNFSYVSPE-LQP
660 670 680
>>CCDS60482.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 (581 aa)
initn: 1803 init1: 1062 opt: 1275 Z-score: 692.3 bits: 138.3 E(32554): 3.1e-32
Smith-Waterman score: 1655; 42.8% identity (65.2% similar) in 650 aa overlap (22-663:20-573)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
:.::..: .::.:: :.::: :: :::::: : .:.::.
CCDS60 MDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFVWGL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB9 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGA---DKGPASDDPRSK----HKFKIHTYSSPT
.:::.::. : ..::.: . : .: :. .. : : :.::...:.:::
CCDS60 NKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAINSRETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYKSPT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 FCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVL
::.:::.::.:: .::.:::.: ::::.:: .: .::: ..
CCDS60 FCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQK-----------------
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 IVLVRDAKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKE
:. .: .. :: :... : . : . ::
CCDS60 --LMAEALAMI----------------------ESTQQAR---CLRDTE--QIFR-----
170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 SDKDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPE
: . .:. :. ..:.. .:.:
CCDS60 ----------------------EGPVEIGLP----CSI--------KNEARPPCLPTP--
190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 GSEANEELRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSF
:.. . . . .... ..:: . .. ... ..:. :: . .::::::
CCDS60 GKREPQGISWESPLDEVDKMCHLPEPELNKERPSLQI-----KLKIEDFILHKMLGKGSF
220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 GKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTM
:::.:.: : :....:.: ::::::..::::::::::::::.: . ::::.. :::
CCDS60 GKVFLAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTK
270 280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 DRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVM
. :.:::::.::::::::::. .: .:.:::::: .:: ::.::::.::::::::..
CCDS60 ENLFFVMEYLNGGDLMYHIQSCHKFDLSRATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNIL
330 340 350 360 370 380
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 LDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYE
::..::::::::::::::. . :.:::::::::::::. : :..:::::.:::::::
CCDS60 LDKDGHIKIADFGMCKENMLGDAKTNTFCGTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYE
390 400 410 420 430 440
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 MLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERD
:: ::.::.:.::.:::.:: : ::. . ::: . :....: :::: .: :
CCDS60 MLIGQSPFHGQDEEELFHSIRMDNPFYPRWLEKEAKDLLVKLFVREPEKRLGV--RG--D
450 460 470 480 490 500
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 IKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGR-NAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNID
:..: .:: :.::.::::::.::..::. . . :::. : . : :. :. .: ..:
CCDS60 IRQHPLFREINWEELERKEIDPPFRPKVKSPFDCSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMD
510 520 530 540 550 560
660 670
pF1KB9 QSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS
:. :..:::.:
CCDS60 QNMFRNFSFMNPGMERLIS
570 580
>>CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 (706 aa)
initn: 1803 init1: 1062 opt: 1275 Z-score: 691.2 bits: 138.3 E(32554): 3.5e-32
Smith-Waterman score: 1655; 42.8% identity (65.2% similar) in 650 aa overlap (22-663:145-698)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCS
:.::..: .::.:: :.::: :: ::::::
CCDS70 MLMNARYFLEMSDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFCS
120 130 140 150 160 170
60 70 80 90 100
pF1KB9 HCTDFIWGFGKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGA---DKGPASDDPRSK----HKF
: .:.::..:::.::. : ..::.: . : .: :. .. : : :.:
CCDS70 VCHEFVWGLNKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAINSRETMFHKERFKIDMPHRF
180 190 200 210 220 230
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 KIHTYSSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYI
:...:.:::::.:::.::.:: .::.:::.: ::::.:: .: .::: ..
CCDS70 KVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQK--------
240 250 260 270 280
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 QAHIDRDVLIVLVRDAKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWN
:. .: .. :: :... : . :
CCDS70 -----------LMAEALAMI----------------------ESTQQAR---CLRDTE--
290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 ETFRFQLKESDKDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGE
. :: : . .:. :. ..:..
CCDS70 QIFR---------------------------EGPVEIGLP----CSI--------KNEAR
310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 YFNVPVPPEGSEANEELRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNF
.:.: :.. . . . .... ..:: . .. ... ..:. :: .
CCDS70 PPCLPTP--GKREPQGISWESPLDEVDKMCHLPEPELNKERPSLQI-----KLKIEDFIL
330 340 350 360 370 380
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 LMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLT
.:::::::::.:.: : :....:.: ::::::..::::::::::::::.: . ::::
CCDS70 HKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLT
390 400 410 420 430 440
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 QLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIY
.. ::: . :.:::::.::::::::::. .: .:.:::::: .:: ::.::::.:
CCDS70 HMFCTFQTKENLFFVMEYLNGGDLMYHIQSCHKFDLSRATFYAAEIILGLQFLHSKGIVY
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 RDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDW
:::::::..::..::::::::::::::. . :.:::::::::::::. : :..::::
CCDS70 RDLKLDNILLDKDGHIKIADFGMCKENMLGDAKTNTFCGTPDYIAPEILLGQKYNHSVDW
510 520 530 540 550 560
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 WAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRL
:.::::::::: ::.::.:.::.:::.:: : ::. . ::: . :....: :::
CCDS70 WSFGVLLYEMLIGQSPFHGQDEEELFHSIRMDNPFYPRWLEKEAKDLLVKLFVREPEKRL
570 580 590 600 610 620
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 GCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGR-NAENFDRFFTRHPPVLTPP
: .: ::..: .:: :.::.::::::.::..::. . . :::. : . : :.
CCDS70 GV--RG--DIRQHPLFREINWEELERKEIDPPFRPKVKSPFDCSNFDKEFLNEKPRLSFA
630 640 650 660 670
650 660 670
pF1KB9 DQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS
:. .: ..::. :..:::.:
CCDS70 DRALINSMDQNMFRNFSFMNPGMERLIS
680 690 700
>>CCDS2870.1 PRKCD gene_id:5580|Hs108|chr3 (676 aa)
initn: 1929 init1: 1047 opt: 1265 Z-score: 686.3 bits: 137.4 E(32554): 6.6e-32
Smith-Waterman score: 1597; 42.6% identity (60.7% similar) in 667 aa overlap (11-666:133-670)
10 20 30 40
pF1KB9 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFT
:: : . . :.::..: ..: .:::.:
CCDS28 EFWLDLQPQAKVLMSVQYFLEDVDCKQSMRSEDEAKFPTMNRRGAIKQAKIHYIKNHEFI
110 120 130 140 150 160
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 ARFFKQPTFCSHCTDFIWGFGKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRS
: :: :::::: : ::.::..:::..:. : ..::.: . . : :. . . : .
CCDS28 ATFFGQPTFCSVCKDFVWGLNKQGYKCRQCNAAIHKKCIDKIIGRCTGT-AANSRDTIFQ
170 180 190 200 210 220
110 120 130 140 150
pF1KB9 K--------HKFKIHTYSSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCG
: :.::.:.: ::::::::::::.::..::.::. : ::::..: .: .:::
CCDS28 KERFNIDMPHRFKVHNYMSPTFCDHCGSLLWGLVKQGLKCEDCGMNVHHKCREKVANLCG
230 240 250 260 270 280
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 TDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDAKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKT
.. ::. . .. :..
CCDS28 INQ-------------------------------------------KLLAEALNQVTQRA
290
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 KTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISE--LQKAS
. :.: .: :: . .:..
CCDS28 -------------------------------------SRRSDSASSEPVGIYQGFEKKTG
300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 VDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEELRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDN
: : . .... : : .:: .:. :: .
CCDS28 VAG--EDMQDNSGTY----------------------GKIWEGS-----------SKCNI
330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 NGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVE
: .: : ::::::::::.:.: :: : .:.: ::::::. ::::::::::
CCDS28 N---------NFIFHKVLGKGSFGKVLLGELKGRGEYFAIKALKKDVVLIDDDVECTMVE
350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 KRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEI
::::.: .. ::::.: ::: :.:.::::..::::::::::. :::. .:.::::::
CCDS28 KRVLTLAAENPFLTHLICTFQTKDHLFFVMEFLNGGDLMYHIQDKGRFELYRATFYAAEI
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 AIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAP
:: ::.::::::::::::::.:: .:::::::::::::::. ..:::::::::::
CCDS28 MCGLQFLHSKGIIYRDLKLDNVLLDRDGHIKIADFGMCKENIFGESRASTFCGTPDYIAP
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 EIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVA
::. : :::::.::::::::: ::.::.:.::::::.:: . ::. ..::.
CCDS28 EILQGLKYTFSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGDDEDELFESIRVDTPHYPRWITKESKD
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620
pF1KB9 ICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACG-RNAENF
: . :. ..: :::: : .:: : ::. :.: ::.....::..::. . :. ::
CCDS28 ILEKLFEREPTKRLGV--TG--NIKIHPFFKTINWTLLEKRRLEPPFRPKVKSPRDYSNF
580 590 600 610 620 630
630 640 650 660 670
pF1KB9 DRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS
:. : . :. :...: ..::: : :::::: .:
CCDS28 DQEFLNEKARLSYSDKNLIDSMDQSAFAGFSFVNPKFEHLLED
640 650 660 670
>>CCDS42513.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 (942 aa)
initn: 1025 init1: 703 opt: 1113 Z-score: 605.1 bits: 122.8 E(32554): 2.2e-27
Smith-Waterman score: 1113; 39.9% identity (67.8% similar) in 444 aa overlap (230-662:498-938)
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 LIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRLSVEIWDW-----DLTSRND
: : .. :...... : :
CCDS42 GCLVAEVTFRNPVIERIPRLRRQKKIFSKQQGKAFQRARQMNIDVATWVRLLRRLIPNAT
470 480 490 500 510 520
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 FMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEELRQKFERAKISQGT
:..: : : ..: . : ... . . : . :. : . . . :...:
CCDS42 GTGTFSPGASPGSEARTTGDISVEKLNLGT--DSDSSPQKSSRDPPSSPSSLSSPIQEST
530 540 550 560 570 580
320 330 340 350 360 370
pF1KB9 --KVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKI
..: : . . . .. . : ::.:: :::.: ::::.::: . . ::.:.:
CCDS42 APELPSETQETPGPALCSPLRKSPLTLEDFKFLAVLGRGHFGKVLLSEFRPSGELFAIKA
590 600 610 620 630 640
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 LKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLA--LPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMY
::: .. :.:: : :::.:: . :::..: .:::: ... ::::: :::::
CCDS42 LKKGDIVARDEVESLMCEKRILAAVTSAGHPFLVNLFGCFQTPEHVCFVMEYSAGGDLML
650 660 670 680 690 700
440 450 460 470 480 490
pF1KB9 HIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKE
::.. :.::.:.::.: ...:: ::. . :.::::::::..::.::..::::::.:::
CCDS42 HIHS-DVFSEPRAIFYSACVVLGLQFLHEHKIVYRDLKLDNLLLDTEGYVKIADFGLCKE
710 720 730 740 750 760
500 510 520 530 540 550
pF1KB9 NIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELF
.. : :.::::::...:::... : ..::::..::::::::.:..:: :.::.:.:
CCDS42 GMGYGDRTSTFCGTPEFLAPEVLTDTSYTRAVDWWGLGVLLYEMLVGESPFPGDDEEEVF
770 780 790 800 810 820
560 570 580 590 600 610
pF1KB9 QSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLER
.::.. .: ::. .: ::..: . :. ..: .::: . . .:.:.. ::: . :: :
CCDS42 DSIVNDEVRYPRFLSAEAIGIMRRLLRRNPERRLGSSERDAEDVKKQPFFRTLGWEALLA
830 840 850 860 870 880
620 630 640 650 660
pF1KB9 KEIQPPYKPKACGR-NAENFDRFFTRHPPVLTPP-DQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLK
... ::. : :: .. :::. :: . :.:.:: : . . .:. : :.::
CCDS42 RRLPPPFVPTLSGRTDVSNFDEEFTGEAPTLSPPRDARPLTAAEQAAFLDFDFVAGGC
890 900 910 920 930 940
670
pF1KB9 PEVKS
673 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 20:37:53 2016 done: Sat Nov 5 20:37:54 2016
Total Scan time: 2.880 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]