Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9876
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9876, 542 aa
1>>>pF1KB9876 542 - 542 aa - 542 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9267+/-0.00125; mu= -8.0002+/- 0.072
mean_var=469.8822+/-123.123, 0's: 0 Z-trim(111.1): 227 B-trim: 585 in 1/50
Lambda= 0.059167
statistics sampled from 11890 (12129) to 11890 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 2.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13800.1 ZNF280A gene_id:129025|Hs108|chr22 ( 542) 3697 330.8 2.5e-90
CCDS13799.1 ZNF280B gene_id:140883|Hs108|chr22 ( 543) 1913 178.5 1.7e-44
CCDS42041.1 ZNF280D gene_id:54816|Hs108|chr15 ( 966) 1300 126.5 1.4e-28
CCDS32245.1 ZNF280D gene_id:54816|Hs108|chr15 ( 979) 1300 126.5 1.4e-28
CCDS14622.1 ZNF280C gene_id:55609|Hs108|chrX ( 737) 1204 118.2 3.5e-26
CCDS44222.2 POGZ gene_id:23126|Hs108|chr1 (1315) 943 96.2 2.6e-19
CCDS998.1 POGZ gene_id:23126|Hs108|chr1 (1357) 943 96.2 2.6e-19
CCDS997.1 POGZ gene_id:23126|Hs108|chr1 (1410) 943 96.2 2.7e-19
CCDS53365.1 POGZ gene_id:23126|Hs108|chr1 (1348) 932 95.3 5e-19
CCDS53366.1 POGZ gene_id:23126|Hs108|chr1 (1401) 932 95.3 5.2e-19
>>CCDS13800.1 ZNF280A gene_id:129025|Hs108|chr22 (542 aa)
initn: 3697 init1: 3697 opt: 3697 Z-score: 1735.2 bits: 330.8 E(32554): 2.5e-90
Smith-Waterman score: 3697; 99.6% identity (99.8% similar) in 542 aa overlap (1-542:1-542)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGDIFLCKKVESPKKNLRESKQREEDDEDPDLIYVGVEHVHRDAEVLFVGMISNSKPVVS
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CCDS13 MGDIFLCKKVESPKKNLRESKQREEDDEDPDLIYVGVEHVHRDAEVLFVGMISNSKPVVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 NILNRVTPGSNSRRKKGHFRQYPAHVSQPANHVTSMAKAIMPVSLSEGRSTDSPVTMKSS
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CCDS13 NILNRVTPGSNSRRKKGHFRQYPAHVSQPANHVTSMAKAIMPVSLSEGRSTDSPVTMKSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SEPGYKMSSPQVVSPSSSDSLPPGTQCLVGAMVSGGGRNESSPDSKRLSTSDINSRDSKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SEPGYKMSSPQVVSPSSSDSLPPGTQCLVGAMVSGGGRNESSPDSKRLSTSDINSRDSKR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VKLRDGIPGVPSLAVVPSDMSSTISTNTPSQGICNSSNHVQNGVTFPWPDANGKAHFNLT
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CCDS13 VKLRDGIPGVPSLAVVPSDMSSTISTNTPSQGICNSSNHVQNGVTFPWPDANGKAHFNLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 DPERASESALAMTDISSLASQNKTFDPKKENPIVLLSDFYYGQHKGDGQPEQKTHTTFKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DPERASESALAMTDISSLASQNKTFDPKKENPIVLLSDFYYGQHKGDGQPEQKTHTTFKC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LSCVKVLKNIKFMNHMKHHLEFEKQRNDSWEDHTTCQHCHRQFPTPFQLQCHIDSVHIAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LSCVKVLKNIKFMNHMKHHLEFEKQRNDSWEDHTTCQHCHRQFPTPFQLQCHIDSVHIAM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 GPSAVCKICELSFETDQVLLQHMKDHHKPGEMPYVCQVCHYRSSVFADVETHFRTCHENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GPSAVCKICELSFETDQVLLQHMKDHHKPGEMPYVCQVCHYRSSVFADVETHFRTCHENT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 KNLLCLFCLKLFKTAIPYMNHCWRHSRRRVLQCSKCRLQFLTLKEEIEHKTKDHQTFKKP
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CCDS13 KNLLCLFCLKLFKTAIPYMNHCWRHSRRRVLQCSKCRLQFLTLKEEIEHKTKDHQTFKKP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 EQLQGFPRETKVIIQTSVQPGSSGMASVIVSNTDPQSSPVKTKKKTAMNTRDSRLPCSKD
:::::.: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EQLQGLPSETKVIIQTSVQPGSSGMASVIVSNTDPQSSPVKTKKKTAMNTRDSRLPCSKD
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 SS
::
CCDS13 SS
>>CCDS13799.1 ZNF280B gene_id:140883|Hs108|chr22 (543 aa)
initn: 2061 init1: 1590 opt: 1913 Z-score: 912.2 bits: 178.5 E(32554): 1.7e-44
Smith-Waterman score: 2218; 65.4% identity (80.7% similar) in 535 aa overlap (8-525:8-537)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGDIFLCKKVESPKKNLRESKQREEDDEDPDLIYVGVEHVHRDAEVLFVGMISNSKPVVS
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CCDS13 MEQSCEEEKEPEPQKNIQETKQV--DDEDAELIFVGVEHVNEDAELIFVGVTSNSKPVVS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB9 NILNRVTPGSNSRRKK-GHFRQYPAHVSQPANH--VTSMAKAIMPVSLSEGRSTDSPVTM
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CCDS13 NILNRVTPGSWSRRKKYDHLRKDTARKLQPKSHETVTSEAVTVLPASQLESRSTDSPIII
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 KSSSEPGYKMSSPQVVSPSSSDSLPPG----TQCL---VGAMVSGGGRNESSPDSKRLST
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CCDS13 EPLSKPDYRNSSPQVV-PNNSSELPSPLITFTDSLHHPVSTALSVGGINESPRVSKQLST
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB9 SDINSRDSKRVKLRDGIPGVPSLAVVPSDMSSTIST--NTPSQGICNSSNHVQNGVTFPW
..:: . ::.:::::: : : ::: :..: .:::... .: .:::::. ::
CCDS13 FEVNSINPKRAKLRDGIIEGNSSASFPSDTFHTMNTQQSTPSNNVHTSLSHVQNGAPFPA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 PDANGKAHFNL--TDPERASESALAMTDISSLASQNKTFDPKKENPIVLLSDFYYGQHKG
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CCDS13 AFPKDNIHFKPINTNLDRANE--LAKTDILSLTSQNKTFDPKKENPIVLLSDFYYGQHKG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 DGQPEQKTHTTFKCLSCVKVLKNIKFMNHMKHHLEFEKQRNDSWEDHTTCQHCHRQFPTP
.::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS13 EGQPEQKTHTTFKCLSCVKVLKNVKFMNHVKHHLEFEKQRNDSWENHTTCQHCHRQFPTP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 FQLQCHIDSVHIAMGPSAVCKICELSFETDQVLLQHMKDHHKPGEMPYVCQVCHYRSSVF
:::::::..:: :. ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FQLQCHIENVHTAQEPSTVCKICELSFETDQVLLQHMKDHHKPGEMPYVCQVCHYRSSVF
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 ADVETHFRTCHENTKNLLCLFCLKLFKTAIPYMNHCWRHSRRRVLQCSKCRLQFLTLKEE
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CCDS13 ADVETHFRTCHENTKNLLCPFCLKIFKTATPYMCHYRGHWGKSAHQCSKCRLQFLTFKEK
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 IEHKTKDHQTFKKPEQLQGFPRETKVIIQTSV---QPGSSGMASVIVSNTDPQSSPVKTK
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CCDS13 MEHKTQCHQMFKKPKQLEGLPPETKVTIQVSLEPLQPGSVDVASITVSTSDSEPSLPRSK
480 490 500 510 520 530
530 540
pF1KB9 KKTAMNTRDSRLPCSKDSS
.:
CCDS13 SKISKKSH
540
>>CCDS42041.1 ZNF280D gene_id:54816|Hs108|chr15 (966 aa)
initn: 1316 init1: 1020 opt: 1300 Z-score: 626.5 bits: 126.5 E(32554): 1.4e-28
Smith-Waterman score: 1643; 48.9% identity (70.7% similar) in 564 aa overlap (1-533:1-547)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGDIFL-CKKVE-SPKKNLRESKQREEDDEDPDLIYVGVEHVHRDAEVLFVGMISNSKPV
:...:. :.. : : . .. :. :.::.: : .::: ::.:::.
CCDS42 MAELFMECEEEELEPWQ--KKVKEVEDDDDD---------------EPIFVGEISSSKPA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VSNILNRVTPGSNSRR-KKGHF-RQYPAHVSQPANHVTSMAKAIMPVS----LSEGRSTD
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CCDS42 ISNILNRVNPSSYSRGLKNGALSRGITAAFKPTSQHYTNPTSNPVPASPINFHPESRSSD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB9 SPVTMKSSSEPGYKMSSPQVVSPSSSDSLPPGTQCLVGAMVSGG------GRNESSPDSK
: : .. :.::: .: .::: .::. : :: . .:: : .::: ::
CCDS42 SSVIVQPFSKPGYITNSSRVVSNKSSELLFDLTQDTGLSHYQGGPTLSMAGMSESSFLSK
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 RLSTSDINSRDSKRVKLRDGIPGVPSLAVVPSDMSSTISTNTP--SQGICNSSNHVQNGV
: :::..:. . :. : ... :. : ::.:: : ..... ..: .:::. .::.
CCDS42 RPSTSEVNNVNPKKPKPSESVSGANSSAVLPSVKSPSVTSSQAMLAKGTNTSSNQSKNGT
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KB9 TFPWPDANGKAHFNLTDPERASES-----------ALAMTDISSLASQNKTFDPKKENPI
:: . . :::: :: . . .:: :..:: ...: :.: .: . :
CCDS42 PFPRACPKCNIHFNLLDPLKNHMKYCCPDMINNFLGLAKTEFSSTVNKNTTIDSEKGKLI
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 VLLSDFYYGQHKGDGQPEQKTHTTFKCLSCVKVLKN-IKFMNHMKHHLEFEKQRNDSWED
.:..:::::.:.:: : ::::::::::.::.:.::: :.::::::::::.::: ..:::.
CCDS42 MLVNDFYYGKHEGDVQEEQKTHTTFKCFSCLKILKNNIRFMNHMKHHLELEKQSSESWEN
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 HTTCQHCHRQFPTPFQLQCHIDSVHIAMGPSAVCKICELSFETDQVLLQHMKDHHKPGEM
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CCDS42 HTTCQHCYRQFPTPFQLQCHIESTHTPHEFSTICKICELSFETEHVLLQHMKDNHKPGEM
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 PYVCQVCHYRSSVFADVETHFRTCHENTKNLLCLFCLKLFKTAIPYMNHCWRHSRRRVLQ
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CCDS42 PYVCQVCNYRSSSFSDVETHFRTSHENTKNLLCPFCLKVIKIATPYMHHYMKHQKKGIHR
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KB9 CSKCRLQFLTLKEEIEHKTKDHQTFKKPEQLQGFPRETKVIIQTSVQP---GSSGMASVI
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CCDS42 CTKCRLQFLTCKEKMDHKTQHHRTFIKPKQLEGLPPGTKVTIRASVGPLQSGASPTPSIS
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540
pF1KB9 VSNTDPQSSPVKTKKKTAMNTRDSRLPCSKDSS
.: . : :: .::. :: : :
CCDS42 ASASTLQLSPPRTKNITAKNPAKSNTSKPNTVKSNASKPNTSKPNGSKSKYKPKISNMQK
530 540 550 560 570 580
>>CCDS32245.1 ZNF280D gene_id:54816|Hs108|chr15 (979 aa)
initn: 1316 init1: 1020 opt: 1300 Z-score: 626.4 bits: 126.5 E(32554): 1.4e-28
Smith-Waterman score: 1646; 49.5% identity (71.2% similar) in 553 aa overlap (13-533:8-560)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGDIFLCKKVESPKKNLRESK---QREEDDEDPDLIYVGVEHVHRDAEVLFVGMISNSKP
::.: . .. . ::.. .: : . : : .::: ::.:::
CCDS32 MGDNPFQPKSNSKMAELFMECEEEELEPWQKKVKEVEDDDDDEPIFVGEISSSKP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VVSNILNRVTPGSNSRR-KKGHF-RQYPAHVSQPANHVTSMAKAIMPVS----LSEGRST
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CCDS32 AISNILNRVNPSSYSRGLKNGALSRGITAAFKPTSQHYTNPTSNPVPASPINFHPESRSS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB9 DSPVTMKSSSEPGYKMSSPQVVSPSSSDSLPPGTQCLVGAMVSGG------GRNESSPDS
:: : .. :.::: .: .::: .::. : :: . .:: : .::: :
CCDS32 DSSVIVQPFSKPGYITNSSRVVSNKSSELLFDLTQDTGLSHYQGGPTLSMAGMSESSFLS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 KRLSTSDINSRDSKRVKLRDGIPGVPSLAVVPSDMSSTISTNTP--SQGICNSSNHVQNG
:: :::..:. . :. : ... :. : ::.:: : ..... ..: .:::. .::
CCDS32 KRPSTSEVNNVNPKKPKPSESVSGANSSAVLPSVKSPSVTSSQAMLAKGTNTSSNQSKNG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB9 VTFPWPDANGKAHFNLTDPERASES-----------ALAMTDISSLASQNKTFDPKKENP
. :: . . :::: :: . . .:: :..:: ...: :.: .: .
CCDS32 TPFPRACPKCNIHFNLLDPLKNHMKYCCPDMINNFLGLAKTEFSSTVNKNTTIDSEKGKL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 IVLLSDFYYGQHKGDGQPEQKTHTTFKCLSCVKVLKN-IKFMNHMKHHLEFEKQRNDSWE
:.:..:::::.:.:: : ::::::::::.::.:.::: :.::::::::::.::: ..:::
CCDS32 IMLVNDFYYGKHEGDVQEEQKTHTTFKCFSCLKILKNNIRFMNHMKHHLELEKQSSESWE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 DHTTCQHCHRQFPTPFQLQCHIDSVHIAMGPSAVCKICELSFETDQVLLQHMKDHHKPGE
.:::::::.:::::::::::::.:.: :..::::::::::..::::::::.:::::
CCDS32 NHTTCQHCYRQFPTPFQLQCHIESTHTPHEFSTICKICELSFETEHVLLQHMKDNHKPGE
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 MPYVCQVCHYRSSVFADVETHFRTCHENTKNLLCLFCLKLFKTAIPYMNHCWRHSRRRVL
::::::::.:::: :.:::::::: ::::::::: ::::..: : :::.: .:... .
CCDS32 MPYVCQVCNYRSSSFSDVETHFRTSHENTKNLLCPFCLKVIKIATPYMHHYMKHQKKGIH
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KB9 QCSKCRLQFLTLKEEIEHKTKDHQTFKKPEQLQGFPRETKVIIQTSVQP---GSSGMASV
.:.:::::::: ::...:::. :.:: ::.::.:.: ::: :..:: : :.: :.
CCDS32 RCTKCRLQFLTCKEKMDHKTQHHRTFIKPKQLEGLPPGTKVTIRASVGPLQSGASPTPSI
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540
pF1KB9 IVSNTDPQSSPVKTKKKTAMNTRDSRLPCSKDSS
.: . : :: .::. :: : :
CCDS32 SASASTLQLSPPRTKNITAKNPAKSNTSKPNTVKSNASKPNTSKPNGSKSKYKPKISNMQ
540 550 560 570 580 590
>>CCDS14622.1 ZNF280C gene_id:55609|Hs108|chrX (737 aa)
initn: 1150 init1: 896 opt: 1204 Z-score: 583.5 bits: 118.2 E(32554): 3.5e-26
Smith-Waterman score: 1341; 43.1% identity (66.0% similar) in 547 aa overlap (24-541:23-563)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGDIFLCKKVESPKKNLRESKQREEDDEDPDLIYVGVEHVHRDAEVLFVGMISNSKPVVS
::.. .: : . . : :..::: ::.:::..:
CCDS14 MDDDKPFQPKNISKMAELFMECEEEELEPWQKKVEETQDEDDDELIFVGEISSSKPAIS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB9 NILNRVTPGSNSR--RKKGHFRQYPA---HVSQPANHVTSMAKAIMPVSLSEGRSTDSPV
::::: .:.:. ... : : .:: : : : ..:..: :
CCDS14 NILNRGHSSSSSKGIKSEPHSPGIPEIFRTASQRCRDPPSNPVAASPRFHLVSKSSQSSV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB9 TMKSSSEPGYKMSSPQVVSPSSS--------DSLPPGTQCLVGAMVSGGGRNESSPDSKR
:....:.: . .: :: : .:: .::::. . . :. : .: .: :.
CCDS14 TVENASKPDFTKNS-QVGSDNSSILLFDSTQESLPPSQD--IPAIFREGMKN-TSYVLKH
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 LSTSDINSRDSKRVKLRDGIPGVPSLAVVPSDMSSTISTNTP--SQGICNSSNHVQNGVT
::: .:: :. : . .: . . .: : .... :.: :.:. . :.
CCDS14 PSTSKVNSVTPKKPKTSEDVPQINPSTSLPLIGSPPVTSSQVMLSKGT-NTSSPYDAGAD
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB9 FPWPDANGKAHFNLTDPERASESALAMTDISS----LASQNKTFDPKKENP-----IVLL
. . ...::: :: . . :.. ...... : : . :.:.
CCDS14 YLRACPKCNVQFNLLDPLKYHMKHCCPDMITKFLGVIVKSERPCDEDKTDSETGKLIMLV
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 SDFYYGQHKGDGQPEQKTHTTFKCLSCVKVLKN-IKFMNHMKHHLEFEKQRNDSWEDHTT
..::::.:.: . : ::.:::::.:: ::::: :.::::::::::.::: :.:::.:::
CCDS14 NEFYYGRHEGVTEKEPKTYTTFKCFSCSKVLKNNIRFMNHMKHHLELEKQNNESWENHTT
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 CQHCHRQFPTPFQLQCHIDSVHIAMGPSAVCKICELSFETDQVLLQHMKDHHKPGEMPYV
::::.::.::::::::::.:.: :..::::::::::...::::::: :::::::::
CCDS14 CQHCYRQYPTPFQLQCHIESTHTPHEFSTICKICELSFETEHILLQHMKDTHKPGEMPYV
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 CQVCHYRSSVFADVETHFRTCHENTKNLLCLFCLKLFKTAIPYMNHCWRHSRRRVLQCSK
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520 530 540
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CCDS99 VTEALRGHMCYCCPE--MVEYQKKGKSLDSEPSVPSAAKPPSPEKTAPVASTPSSTPIPA
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CCDS99 KICEWAFESEPLFLQHMKDTHKPGEMPYVCQVCQYRSSLYSEVDVHFRMIHEDTRHLLCP
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CCDS99 YCLKVFKNGNAFQQHYMRHQKRNVYHCNKCRLQFLFAKDKIEHKLQHHKTFRKPKQLEGL
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CCDS99 SIQKRAVRKMSVMGRQTCLECSFEIPDFPNHFPTYVHCSLCRYSTCCSRAYANHMINNHV
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CCDS53 KSLDSEPSVPSAAKPPSPEKTAPVASTPSSTPIPALSPPTKVPEPNENVGDAVQTKLIML
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CCDS53 SSND--TPPSALQEAAPLTSSMDPLPVFLYPPVQRSIQKRAVRKMSVMGRQTCLECSFEI
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542 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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