Result of FASTA (ccds) for pF1KB9871
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9871, 490 aa
  1>>>pF1KB9871 490 - 490 aa - 490 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2645+/-0.00098; mu= -2.7553+/- 0.058
 mean_var=408.5914+/-90.387, 0's: 0 Z-trim(116.6): 698  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.063450
 statistics sampled from 16385 (17203) to 16385 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.805), E-opt: 0.2 (0.528), width:  16
 Scan time:  3.740

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5372.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7           ( 490) 3389 324.3 1.9e-88
CCDS43555.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7          ( 508) 3389 324.3 1.9e-88
CCDS46453.1 SP9 gene_id:100131390|Hs108|chr2       ( 484) 1512 152.5 9.8e-37
CCDS73475.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12         ( 413)  808 87.9 2.2e-17
CCDS44897.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12         ( 431)  808 88.0 2.3e-17
CCDS11520.1 SP6 gene_id:80320|Hs108|chr17          ( 376)  757 83.2 5.3e-16
CCDS44898.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12           ( 778)  682 76.7   1e-13
CCDS8857.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12            ( 785)  682 76.7   1e-13
CCDS5373.1 SP4 gene_id:6671|Hs108|chr7             ( 784)  663 75.0 3.3e-13
CCDS33322.1 SP5 gene_id:389058|Hs108|chr2          ( 398)  653 73.7 4.1e-13
CCDS46452.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2            ( 713)  657 74.4 4.6e-13
CCDS2254.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2             ( 781)  657 74.4 4.9e-13
CCDS10025.1 KLF13 gene_id:51621|Hs108|chr15        ( 288)  581 67.0 3.2e-11


>>CCDS5372.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7                (490 aa)
 initn: 3389 init1: 3389 opt: 3389  Z-score: 1701.5  bits: 324.3 E(32554): 1.9e-88
Smith-Waterman score: 3389; 100.0% identity (100.0% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MLAATCNKIGSPSPSPSSLSDSSSSFGKGFHPWKRSSSSSSASCNVVGSSLSSFGVSGAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MLAATCNKIGSPSPSPSSLSDSSSSFGKGFHPWKRSSSSSSASCNVVGSSLSSFGVSGAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RNGGSSSAAAAAAAAAAAAAALVSDSFSCGGSPGSSAFSLTSSSAAAAAAAAAAAASSSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RNGGSSSAAAAAAAAAAAAAALVSDSFSCGGSPGSSAFSLTSSSAAAAAAAAAAAASSSP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 FANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGGSSAHSQDGSHQPVFISKVHTSVDGLQGIYPRVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGGSSAHSQDGSHQPVFISKVHTSVDGLQGIYPRVG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 MAHPYESWFKPSHPGLGAAGEVGSAGASSWWDVGAGWIDVQNPNSAAALPGSLHPAAGGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAHPYESWFKPSHPGLGAAGEVGSAGASSWWDVGAGWIDVQNPNSAAALPGSLHPAAGGL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 QTSLHSPLGGYNSDYSGLSHSAFSSGASSHLLSPAGQHLMDGFKPVLPGSYPDSAPSPLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QTSLHSPLGGYNSDYSGLSHSAFSSGASSHLLSPAGQHLMDGFKPVLPGSYPDSAPSPLA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 GAGGSMLSAGPSAPLGGSPRSSARRYSGRATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GAGGSMLSAGPSAPLGGSPRSSARRYSGRATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 PGCGKVYGKTSHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PGCGKVYGKTSHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 CNKRFMRSDHLSKHVKTHSGGGGGGGSAGSGSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CNKRFMRSDHLSKHVKTHSGGGGGGGSAGSGSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQP
              430       440       450       460       470       480

              490
pF1KB9 PEPGHRNGLE
       ::::::::::
CCDS53 PEPGHRNGLE
              490

>>CCDS43555.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7               (508 aa)
 initn: 3389 init1: 3389 opt: 3389  Z-score: 1701.3  bits: 324.3 E(32554): 1.9e-88
Smith-Waterman score: 3389; 100.0% identity (100.0% similar) in 490 aa overlap (1-490:19-508)

                                 10        20        30        40  
pF1KB9                   MLAATCNKIGSPSPSPSSLSDSSSSFGKGFHPWKRSSSSSSA
                         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MATSLLGEEPRLGSTPLAMLAATCNKIGSPSPSPSSLSDSSSSFGKGFHPWKRSSSSSSA
               10        20        30        40        50        60

             50        60        70        80        90       100  
pF1KB9 SCNVVGSSLSSFGVSGASRNGGSSSAAAAAAAAAAAAAALVSDSFSCGGSPGSSAFSLTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SCNVVGSSLSSFGVSGASRNGGSSSAAAAAAAAAAAAAALVSDSFSCGGSPGSSAFSLTS
               70        80        90       100       110       120

            110       120       130       140       150       160  
pF1KB9 SSAAAAAAAAAAAASSSPFANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGGSSAHSQDGSHQPVFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSAAAAAAAAAAAASSSPFANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGGSSAHSQDGSHQPVFI
              130       140       150       160       170       180

            170       180       190       200       210       220  
pF1KB9 SKVHTSVDGLQGIYPRVGMAHPYESWFKPSHPGLGAAGEVGSAGASSWWDVGAGWIDVQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SKVHTSVDGLQGIYPRVGMAHPYESWFKPSHPGLGAAGEVGSAGASSWWDVGAGWIDVQN
              190       200       210       220       230       240

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB9 PNSAAALPGSLHPAAGGLQTSLHSPLGGYNSDYSGLSHSAFSSGASSHLLSPAGQHLMDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PNSAAALPGSLHPAAGGLQTSLHSPLGGYNSDYSGLSHSAFSSGASSHLLSPAGQHLMDG
              250       260       270       280       290       300

            290       300       310       320       330       340  
pF1KB9 FKPVLPGSYPDSAPSPLAGAGGSMLSAGPSAPLGGSPRSSARRYSGRATCDCPNCQEAER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FKPVLPGSYPDSAPSPLAGAGGSMLSAGPSAPLGGSPRSSARRYSGRATCDCPNCQEAER
              310       320       330       340       350       360

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB9 LGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDE
              370       380       390       400       410       420

            410       420       430       440       450       460  
pF1KB9 LQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHVKTHSGGGGGGGSAGSGSGGKKGSDTDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHVKTHSGGGGGGGSAGSGSGGKKGSDTDS
              430       440       450       460       470       480

            470       480       490
pF1KB9 EHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE
              490       500        

>>CCDS46453.1 SP9 gene_id:100131390|Hs108|chr2            (484 aa)
 initn: 1415 init1: 1000 opt: 1512  Z-score: 773.0  bits: 152.5 E(32554): 9.8e-37
Smith-Waterman score: 1678; 58.7% identity (74.1% similar) in 491 aa overlap (1-478:19-444)

                                 10        20         30        40 
pF1KB9                   MLAATCNKIGSPSPSPSSLSDSSSSFGKG-FHPWKRSSSSSS
                         ::::::::::. ::  ..: .::. :.:: ::::::::::  
CCDS46 MATSILGEEPRFGTTPLAMLAATCNKIGNTSPL-TTLPESSA-FAKGGFHPWKRSSSS--
               10        20        30         40         50        

              50        60        70        80        90       100 
pF1KB9 ASCNVVGSSLSSFGVSGASRNGGSSSAAAAAAAAAAAAAALVSDSFSCGGSPGSSAFSLT
         ::. :::::.:.:.    .:: .:.. :....:: .:  ....     :: :::::  
CCDS46 --CNL-GSSLSGFAVA----TGGRGSGGLAGGSGAANSAFCLAST-----SPTSSAFSSD
            60            70        80        90            100    

             110       120       130       140       150       160 
pF1KB9 SSSAAAAAAAAAAAASSSPFANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGGSSAHSQDGSHQPVF
        ..  . .:::::::.              :::   .::                 : .:
CCDS46 YGGLFSNSAAAAAAAA--------------GVSPQEAGG-----------------QSAF
          110       120                                      130   

             170       180       190       200       210           
pF1KB9 ISKVHTSVDGLQGIYPRVGMAHPYESWFKPSHPGLGAAGEVGSAGASSWWDVGAG---WI
       ::::::..   .:.:::::::::::::.: .  .  ::::: ...::::::: ..   :.
CCDS46 ISKVHTTA--ADGLYPRVGMAHPYESWYKSGFHSTLAAGEVTNGAASSWWDVHSSPGSWL
           140         150       160       170       180       190 

      220       230       240       250       260              270 
pF1KB9 DVQNPNSAAALPGSLHPAAGGLQTSLHSPLGGYNSDYSGLSHSAFSS-------GASSHL
       .::::  :..: .:::  .:. :.:::: :: :: :.:.:.::::::       .:.:::
CCDS46 EVQNP--AGGLQSSLH--SGAPQASLHSQLGTYNPDFSSLTHSAFSSTGLGSSAAAASHL
               200         210       220       230       240       

             280         290       300       310       320         
pF1KB9 LSPAGQHLM--DGFKPVLPGSYPDSAPSPLAGAGGSMLSAGPSAPLGGSPRSSARRYSGR
       :: . :::.  :::::::: :: ::. .  :.:...:.:.. .:  :::   ::::::::
CCDS46 LSTS-QHLLAQDGFKPVLP-SYSDSSAAVAAAAASAMISGAAAAAAGGSSARSARRYSGR
       250        260        270       280       290       300     

     330       340       350       360       370       380         
pF1KB9 ATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLRWHTGERPFVCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLRWHTGERPFVCN
         310       320       330       340       350       360     

     390       400       410       420       430       440         
pF1KB9 WLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHVKTHSGGGGGGGSAG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::     
CCDS46 WLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHIKTHNGGGGG-----
         370       380       390       400       410       420     

     450       460       470       480       490                   
pF1KB9 SGSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE                   
            :::::.:.. :   .:  .::.:.                               
CCDS46 -----KKGSDSDTDASNLETPRSESPDLILHDSGVSAARAAAAAAAAAAAAAAAASAGGK
                   430       440       450       460       470     

>>CCDS73475.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12              (413 aa)
 initn: 758 init1: 702 opt: 808  Z-score: 425.5  bits: 87.9 E(32554): 2.2e-17
Smith-Waterman score: 982; 40.6% identity (64.5% similar) in 431 aa overlap (72-490:4-412)

              50        60        70        80        90       100 
pF1KB9 ASCNVVGSSLSSFGVSGASRNGGSSSAAAAAAAAAAAAAALVSDSFSCGGSPGSSAFSLT
                                     :: .  .... . :: . : .  .. .:. 
CCDS73                            MLTAACSKFGGSSPLRDSTTLGKAGTKKPYSVG
                                          10        20        30   

             110       120       130       140       150           
pF1KB9 SSSAAAAAAAAAAAASSSPFANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGGSSAHS---QDGSHQ
       :. .:. . . :  :   ::..  ... .:. :  .  .: ..     .::     :...
CCDS73 SDLSASKTMGDAYPA---PFTSTNGLL-SPAGSPPAPTSGYANDYPPFSHSFPGPTGTQD
            40           50         60        70        80         

       160       170       180       190        200       210      
pF1KB9 P-VFISKVHTSVDGLQGIYPRVGMAHPYESWFKPS-HPGLGAAGEVGSAGASSWWDV--G
       : ... : :.: : : ..:  . :.::: ::.: . : :. . :  :..  . :::.  :
CCDS73 PGLLVPKGHSSSDCLPSVYTSLDMTHPYGSWYKAGIHAGI-SPGP-GNT-PTPWWDMHPG
      90       100       110       120        130         140      

          220       230       240       250       260       270    
pF1KB9 AGWIDVQNPNSAAALPGSLHPAAGGLQTSLHSPLGGYNSDYSGLSHSAFSSGASSHLLSP
       ..:.   . ... .: :.: :. :  :  :.  :  : ::.. :. . .    . :::.:
CCDS73 GNWLG-GGQGQGDGLQGTL-PT-GPAQPPLNPQLPTYPSDFAPLNPAPY---PAPHLLQP
        150        160         170       180       190          200

          280         290       300       310       320       330  
pF1KB9 AGQHLM--DGFKPVLPGSYPDSAPSPLAGAGGSMLSAGPSAPLGGSPRSSARRYSGRATC
       . ::..  : .::   :.      . : :.::.    : :.  .:.  .:.   .::..:
CCDS73 GPQHVLPQDVYKPKAVGN-----SGQLEGSGGAKPPRGASTGGSGGYGGSG---AGRSSC
              210            220       230       240          250  

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB9 DCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLRWHTGERPFVCNWLF
       ::::::: :::: :.:.::.: .::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS73 DCPNCQELERLGAAAAGLRKKPIHSCHIPGCGKVYGKASHLKAHLRWHTGERPFVCNWLF
            260       270       280       290       300       310  

            400       410       420       430       440       450  
pF1KB9 CGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHVKTHSGGGGGGGSAGS--
       :::::::::::.::.:::: ::.:.: .:.::: :::::::: .::.  : :   .:   
CCDS73 CGKRFTRSDELERHVRTHTREKKFTCLLCSKRFTRSDHLSKHQRTHGEPGPGPPPSGPKE
            320       330       340       350       360       370  

               460       470       480       490 
pF1KB9 -GSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE 
        : : . : .  :.    .. :  .::      : . : :: 
CCDS73 LGEGRSTGEEEASQTPRPSASPA-TPEKAPGGSPEQSNLLEI
            380       390        400       410   

>>CCDS44897.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12              (431 aa)
 initn: 758 init1: 702 opt: 808  Z-score: 425.3  bits: 88.0 E(32554): 2.3e-17
Smith-Waterman score: 993; 40.5% identity (64.3% similar) in 440 aa overlap (63-490:13-430)

             40        50        60        70        80        90  
pF1KB9 WKRSSSSSSASCNVVGSSLSSFGVSGASRNGGSSSAAAAAAAAAAAAAALVSDSFSCGGS
                                     :.:  :  .:: .  .... . :: . : .
CCDS44                   MASSLLEEEVHYGSSPLAMLTAACSKFGGSSPLRDSTTLGKA
                                 10        20        30        40  

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB9 PGSSAFSLTSSSAAAAAAAAAAAASSSPFANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGGSSAHS
         .. .:. :. .:. . . :  :   ::..  ... .:. :  .  .: ..     .::
CCDS44 GTKKPYSVGSDLSASKTMGDAYPA---PFTSTNGLL-SPAGSPPAPTSGYANDYPPFSHS
             50        60           70         80        90        

                160       170       180       190        200       
pF1KB9 ---QDGSHQP-VFISKVHTSVDGLQGIYPRVGMAHPYESWFKPS-HPGLGAAGEVGSAGA
            :...: ... : :.: : : ..:  . :.::: ::.: . : :. . :  :..  
CCDS44 FPGPTGTQDPGLLVPKGHSSSDCLPSVYTSLDMTHPYGSWYKAGIHAGI-SPGP-GNT-P
      100       110       120       130       140        150       

       210         220       230       240       250       260     
pF1KB9 SSWWDV--GAGWIDVQNPNSAAALPGSLHPAAGGLQTSLHSPLGGYNSDYSGLSHSAFSS
       . :::.  :..:.   . ... .: :.: :. :  :  :.  :  : ::.. :. . . .
CCDS44 TPWWDMHPGGNWLG-GGQGQGDGLQGTL-PT-GPAQPPLNPQLPTYPSDFAPLNPAPYPA
         160        170       180         190       200       210  

         270       280         290       300       310       320   
pF1KB9 GASSHLLSPAGQHLM--DGFKPVLPGSYPDSAPSPLAGAGGSMLSAGPSAPLGGSPRSSA
           :::.:. ::..  : .::   :.      . : :.::.    : :.  .:.  .:.
CCDS44 ---PHLLQPGPQHVLPQDVYKPKAVGN-----SGQLEGSGGAKPPRGASTGGSGGYGGSG
               220       230            240       250       260    

           330       340       350       360       370       380   
pF1KB9 RRYSGRATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLRWHTGE
          .::..:::::::: :::: :.:.::.: .::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS44 ---AGRSSCDCPNCQELERLGAAAAGLRKKPIHSCHIPGCGKVYGKASHLKAHLRWHTGE
             270       280       290       300       310       320 

           390       400       410       420       430       440   
pF1KB9 RPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHVKTHSGGGG
       ::::::::::::::::::::.::.:::: ::.:.: .:.::: :::::::: .::.  : 
CCDS44 RPFVCNWLFCGKRFTRSDELERHVRTHTREKKFTCLLCSKRFTRSDHLSKHQRTHGEPGP
             330       340       350       360       370       380 

           450          460       470       480       490 
pF1KB9 GGGSAGS---GSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE 
       :   .:    : : . : .  :.    .. :  .::      : . : :: 
CCDS44 GPPPSGPKELGEGRSTGEEEASQTPRPSASPA-TPEKAPGGSPEQSNLLEI
             390       400       410        420       430 

>>CCDS11520.1 SP6 gene_id:80320|Hs108|chr17               (376 aa)
 initn: 920 init1: 571 opt: 757  Z-score: 400.7  bits: 83.2 E(32554): 5.3e-16
Smith-Waterman score: 884; 45.0% identity (64.3% similar) in 353 aa overlap (118-458:36-356)

        90       100       110       120       130       140       
pF1KB9 SCGGSPGSSAFSLTSSSAAAAAAAAAAAASSSPFANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGG
                                     .:: :.::     ::    ..   :     
CCDS11 CGSLGSQHTEAPHASPPRLDLQPLQTYQGHTSPEAGDYPSPLQPGEL--QSLPLGPEVDF
          10        20        30        40        50          60   

       150       160       170          180       190       200    
pF1KB9 SSAHSQDGSHQPVFISKVHTSVDGLQGIYPRV---GMAHPYESWFKPSHPGLGAAGEVGS
       :...   :. . :    ....     : . ..    :.: :::::.:.:::    .: ::
CCDS11 SQGYELPGASSRVTCEDLESDSPLAPGPFSKLLQPDMSHHYESWFRPTHPG----AEDGS
            70        80        90       100       110             

          210         220       230       240       250       260  
pF1KB9 AGASSWWDV--GAGWIDVQNPNSAAALPGSLHPAAGGLQTSLHSPLGGYNSDYSGLSHSA
            :::.  :..:.:. . ..: . ::  ::  :.::..:    ::: .:..     :
CCDS11 -----WWDLHPGTSWMDLPHTQGALTSPG--HP--GALQAGL----GGYVGDHQ---LCA
          120       130       140           150           160      

            270         280          290       300       310       
pF1KB9 FSSGASSHLLSPA--GQHLM---DGFKPVLPGSYPDSAPSPLAGAGGSMLSAGPSAPLGG
             .: : ::  ::::.   :: : .:  . :.:      :  .:.   : . : :.
CCDS11 PPPHPHAHHLLPAAGGQHLLGPPDGAK-ALEVAAPESQ-----GLDSSL--DGAARPKGS
           170       180       190        200              210     

       320       330       340        350        360       370     
pF1KB9 SPRSSARRYSGRATCDCPNCQEAERLG-PAGASL-RRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKA
         : :. : ::...: :::: :::::: : : .  ..: ::.::::::::.:.:::::::
CCDS11 --RRSVPRSSGQTVCRCPNCLEAERLGAPCGPDGGKKKHLHNCHIPGCGKAYAKTSHLKA
           220       230       240       250       260       270   

         380       390       400       410       420       430     
pF1KB9 HLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHV
       :::::.:.::::::::::::::::::::::::.:::: :.: : ::.. :::::::.::.
CCDS11 HLRWHSGDRPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLQTHTGTKKFPCAVCSRVFMRSDHLAKHM
           280       290       300       310       320       330   

         440       450       460       470       480       490
pF1KB9 KTHSGGGGGGGSAGSGSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE
       ::: :.   ...:.:: :   :.                                
CCDS11 KTHEGAKEEAAGAASGEGKAGGAVEPPGGKGKREAEGSVAPSN            
           340       350       360       370                  

>>CCDS44898.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12                (778 aa)
 initn: 820 init1: 579 opt: 682  Z-score: 359.9  bits: 76.7 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 726; 33.6% identity (60.3% similar) in 473 aa overlap (36-470:266-733)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB9 CNKIGSPSPSPSSLSDSSSSFGKGFHPWKRSSSSSSASCNVVGSSLSSFGVSGASR-NGG
                                     :... . : ..:  : :.   ::..  ..:
CCDS44 NNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVTSG
         240       250       260       270       280       290     

           70        80        90       100           110       120
pF1KB9 SSSAAAAAAAAAAAAAALVSDSFSCGGSPGSSAFSL----TSSSAAAAAAAAAAAASSSP
       .. ..:. ... :..... ... : . .  .: ...    ::.:... . . .    :. 
CCDS44 TTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVSGL
         300       310       320       330       340       350     

              130       140       150         160       170        
pF1KB9 FANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGGSSAHSQDGSH--QPVFISKVHTSVDGLQGIYPR
        ..:   .:   .::::  .:    : .. ..:. .   :: .. .   ....::.  : 
CCDS44 QGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLV-QGGQALQALQAA-PL
         360       370       380       390        400       410    

      180       190                   200       210       220      
pF1KB9 VGMAHPYESWFK-----------P-SHPGLGAAGEVGSAGASSWWDVGAGWIDVQNPNSA
        :..   ..  .           : : : .  .  ::  :  ::  .    ..::::.. 
CCDS44 SGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
           420       430       440       450       460       470   

        230       240          250          260         270        
pF1KB9 AALPGSLHPAAGGLQTSLHS---PLGGYNSDYSG---LSHSAFSS--GASSHLLSPAGQ-
       .   . .. .. :  .: ..   :...  :  .:   .. . .::  : ..  ::  :  
CCDS44 TITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTS
           480       490       500       510       520       530   

           280       290         300       310           320       
pF1KB9 ----HLMDGFKPVLPGSYPDS--APSPLAGAGGSMLSAGPSAPLGG--SP--RSSARRYS
           : ..:. :.  .. : .  :   : ::::. .    ..   :  ::  . .: : .
CCDS44 GIQVHPIQGL-PLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRT
           540        550       560       570       580       590  

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB9 GRATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLRWHTGERPFV
        : .: :: :...:  : .:   ..:  : ::: ::::::::::::.::::::::::::.
CCDS44 RREACTCPYCKDSEGRG-SGDPGKKKQ-HICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFM
            600        610        620       630       640       650

       390       400       410       420       430       440       
pF1KB9 CNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHVKTHSGGGGGGGS
       :.: .:::::::::::::: :::::::.:::: : ::::::::::::.:::..  :: : 
CCDS44 CTWSYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGV
              660       670       680       690       700       710

       450       460       470       480       490                 
pF1KB9 AGSGSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE                 
       : : .     : . :: :....:                                     
CCDS44 ALSVGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQS
              720       730       740       750       760       770

>>CCDS8857.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12                 (785 aa)
 initn: 820 init1: 579 opt: 682  Z-score: 359.9  bits: 76.7 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 726; 33.6% identity (60.3% similar) in 473 aa overlap (36-470:273-740)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB9 CNKIGSPSPSPSSLSDSSSSFGKGFHPWKRSSSSSSASCNVVGSSLSSFGVSGASR-NGG
                                     :... . : ..:  : :.   ::..  ..:
CCDS88 NNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVTSG
            250       260       270       280       290       300  

           70        80        90       100           110       120
pF1KB9 SSSAAAAAAAAAAAAAALVSDSFSCGGSPGSSAFSL----TSSSAAAAAAAAAAAASSSP
       .. ..:. ... :..... ... : . .  .: ...    ::.:... . . .    :. 
CCDS88 TTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVSGL
            310       320       330       340       350       360  

              130       140       150         160       170        
pF1KB9 FANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGGSSAHSQDGSH--QPVFISKVHTSVDGLQGIYPR
        ..:   .:   .::::  .:    : .. ..:. .   :: .. .   ....::.  : 
CCDS88 QGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLV-QGGQALQALQAA-PL
            370       380       390       400        410        420

      180       190                   200       210       220      
pF1KB9 VGMAHPYESWFK-----------P-SHPGLGAAGEVGSAGASSWWDVGAGWIDVQNPNSA
        :..   ..  .           : : : .  .  ::  :  ::  .    ..::::.. 
CCDS88 SGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
              430       440       450       460       470       480

        230       240          250          260         270        
pF1KB9 AALPGSLHPAAGGLQTSLHS---PLGGYNSDYSG---LSHSAFSS--GASSHLLSPAGQ-
       .   . .. .. :  .: ..   :...  :  .:   .. . .::  : ..  ::  :  
CCDS88 TITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTS
              490       500       510       520       530       540

           280       290         300       310           320       
pF1KB9 ----HLMDGFKPVLPGSYPDS--APSPLAGAGGSMLSAGPSAPLGG--SP--RSSARRYS
           : ..:. :.  .. : .  :   : ::::. .    ..   :  ::  . .: : .
CCDS88 GIQVHPIQGL-PLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRT
              550        560       570       580       590         

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB9 GRATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLRWHTGERPFV
        : .: :: :...:  : .:   ..:  : ::: ::::::::::::.::::::::::::.
CCDS88 RREACTCPYCKDSEGRG-SGDPGKKKQ-HICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFM
     600       610        620        630       640       650       

       390       400       410       420       430       440       
pF1KB9 CNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHVKTHSGGGGGGGS
       :.: .:::::::::::::: :::::::.:::: : ::::::::::::.:::..  :: : 
CCDS88 CTWSYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGV
       660       670       680       690       700       710       

       450       460       470       480       490                 
pF1KB9 AGSGSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE                 
       : : .     : . :: :....:                                     
CCDS88 ALSVGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQS
       720       730       740       750       760       770       

>>CCDS5373.1 SP4 gene_id:6671|Hs108|chr7                  (784 aa)
 initn: 689 init1: 599 opt: 663  Z-score: 350.5  bits: 75.0 E(32554): 3.3e-13
Smith-Waterman score: 671; 32.3% identity (57.5% similar) in 492 aa overlap (27-470:281-758)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB9     MLAATCNKIGSPSPSPSSLSDSSSSFGKGFHPWKRSSSSSSASCNVVGSSLSSFGV
                                     :.  .:   ..:..: . ..:..  ..   
CCDS53 AQVVTTLPINIGGVTLALPVINNVAAGGGTGQVGQPAATADSGTSNGNQLVSTPTNTTTS
              260       270       280       290       300       310

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB9 SGASRNGGSSSAAAAAAAAAAAAAALVSDSFSCGGSPGSSAFSLTSSSAAAAAAAAAAAA
       ...  .. :::.. ...:... ..   ::..  ... :. : . .:::  .   . . ::
CCDS53 ASTMPESPSSSTTCTTTASTSLTS---SDTLVSSADTGQYASTSASSSERTIEESQTPAA
              320       330          340       350       360       

        120       130       140          150       160         170 
pF1KB9 SSSPFANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGG---GSSAHSQDGSHQPV--FISKVHTSVDG
       . :  :.. : .:  :.....  ...       :.   .:   .::   .:. .  .   
CCDS53 TESE-AQSSSQLQPNGMQNAQDQSNSLQQVQIVGQPILQQIQIQQPQQQIIQAIPPQSFQ
       370        380       390       400       410       420      

              180        190         200       210           220   
pF1KB9 LQ-GIYPRVGMAHPYES-WFKPSHPG--LGAAGEVGSAGASSWWDVGAGWI----DVQNP
       :: :   .. . .: ..  ..  .:   :  :  .  .:  ::  : .  :    ..:  
CCDS53 LQSGQTIQTIQQQPLQNVQLQAVNPTQVLIRAPTLTPSGQISWQTVQVQNIQSLSNLQVQ
        430       440       450       460       470       480      

           230         240       250       260                     
pF1KB9 NSAAALPGSLHP--AAGGLQTSLHSPLGGYNSDYSGLSHSAFSS----------------
       :.. .   .. :  ..::   .  .:..  ..  . :. . ..:                
CCDS53 NAGLSQQLTITPVSSSGGTTLAQIAPVAVAGAPIT-LNTAQLASVPNLQTVSVANLGAAG
        490       500       510       520        530       540     

             270        280       290       300       310          
pF1KB9 ----GASSHLLSPAGQHL-MDGFKPVLPGSYPDSAPSPLAGAGGSMLSAGPSAP------
           :.   . : :::.  .:: : :  ..    ::  .: .: .  . :  .:      
CCDS53 VQVQGVPVTITSVAGQQQGQDGVK-VQQATI---APVTVAVGGIANATIGAVSPDQLTQV
         550       560        570          580       590       600 

            320           330       340       350       360        
pF1KB9 --LGGSPRSSARRYSG----RATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYG
           :.  :. .   :    :..:.::::.:.:  : ..    .:  : ::: :::::::
CCDS53 HLQQGQQTSDQEVQPGKRLRRVACSCPNCREGE--GRGSNEPGKKKQHICHIEGCGKVYG
             610       620       630         640       650         

      370       380       390       400       410       420        
pF1KB9 KTSHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRS
       :::::.::::::::::::.:::.::::::::::::::: ::::::::: :: :.::::::
CCDS53 KTSHLRAHLRWHTGERPFICNWMFCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKRFECPECSKRFMRS
     660       670       680       690       700       710         

      430       440       450       460       470       480        
pF1KB9 DHLSKHVKTHSGGGGGGGSAGSGSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNG
       ::::::::::..  ::: . .  ..:.  :   :   . :::                  
CCDS53 DHLSKHVKTHQNKKGGGTALAIVTSGELDS---SVTEVLGSPRIVTVAAISQDSNPATPN
     720       730       740          750       760       770      

      490      
pF1KB9 LE      
               
CCDS53 VSTNMEEF
        780    

>>CCDS33322.1 SP5 gene_id:389058|Hs108|chr2               (398 aa)
 initn: 651 init1: 597 opt: 653  Z-score: 349.0  bits: 73.7 E(32554): 4.1e-13
Smith-Waterman score: 669; 53.2% identity (65.1% similar) in 218 aa overlap (222-438:179-378)

             200       210       220        230       240       250
pF1KB9 SHPGLGAAGEVGSAGASSWWDVGAGWIDVQNPNSAAA-LPGSLHPAAGGLQTSLHSPLGG
                                     .:: :   ::    : ::.   .   : .:
CCDS33 YAAQAALPPGYSNLLPPPPPPPPPPTCRQLSPNPAPDDLPWWSIPQAGAGPGASGVPGSG
      150       160       170       180       190       200        

              260       270       280       290       300       310
pF1KB9 YNSDYSGLSHSAFSSGASSHLLSPAGQHLMDGFKPVLPGSYPDSAPSPLAGAGGSMLSAG
        ..  .:  : :    ::.   . :.  :. :.  ::  :   .  : .:    ..:.. 
CCDS33 LSGACAGAPH-APRFPASAAAAAAAAAALQRGL--VLGPSDFAQYQSQIA----ALLQT-
      210        220       230       240         250           260 

              320       330       340       350       360       370
pF1KB9 PSAPLGGSPRSSARRYSGRATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKT
        .:::... :   :       : ::::: :   :   :   .:  : ::.::::::::::
CCDS33 -KAPLAATARRCRR-------CRCPNCQAAG--GAPEAEPGKKKQHVCHVPGCGKVYGKT
               270              280         290       300       310

              380       390       400       410       420       430
pF1KB9 SHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDH
       ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::: :.::::::::
CCDS33 SHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKSFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPECGKRFMRSDH
              320       330       340       350       360       370

              440       450       460       470       480       490
pF1KB9 LSKHVKTHSGGGGGGGSAGSGSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE
       :.::::::                                                    
CCDS33 LAKHVKTHQNKKLKVAEAGVKREDARDL                                
              380       390                                        




490 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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