Result of FASTA (omim) for
pF1KB9868
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9868, 450 aa
1>>>pF1KB9868 450 - 450 aa - 450 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5012+/-0.000445; mu= 1.9842+/- 0.028
mean_var=395.7349+/-83.764, 0's: 0 Z-trim(121.4): 367 B-trim: 1891 in 1/55
Lambda= 0.064472
statistics sampled from 37551 (37982) to 37551 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.445), width: 16
Scan time: 10.720
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 3081 300.6 5.6e-81
NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 1303 135.3 3.4e-31
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 1000 107.1 1e-22
XP_016872785 (OMIM: 126450,159900) PREDICTED: D(2) ( 443) 756 84.4 6.9e-16
NP_000786 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 443) 756 84.4 6.9e-16
XP_011543044 (OMIM: 118510) PREDICTED: muscarinic ( 460) 595 69.4 2.3e-11
NP_000729 (OMIM: 118510) muscarinic acetylcholine ( 460) 595 69.4 2.3e-11
NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamin ( 422) 550 65.2 3.9e-10
XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 328) 539 64.0 6.8e-10
XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 331) 539 64.0 6.9e-10
XP_005265875 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 366) 539 64.1 7.3e-10
NP_000855 (OMIM: 182133) 5-hydroxytryptamine recep ( 377) 539 64.1 7.4e-10
XP_011532740 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 389) 539 64.1 7.6e-10
XP_011532739 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 402) 539 64.1 7.7e-10
NP_000854 (OMIM: 182131) 5-hydroxytryptamine recep ( 390) 537 63.9 8.6e-10
NP_000670 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic recep ( 520) 539 64.3 9e-10
XP_011532737 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 556) 539 64.3 9.4e-10
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 520 62.2 2.2e-09
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 520 62.2 2.3e-09
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 520 62.2 2.3e-09
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 520 62.3 2.4e-09
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 520 62.3 2.5e-09
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 520 62.3 2.5e-09
XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 520 62.4 2.7e-09
NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 520 62.4 2.7e-09
NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455) 520 62.4 2.8e-09
NP_000671 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 466) 520 62.4 2.9e-09
NP_150646 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 475) 520 62.4 2.9e-09
XP_006716355 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 520 62.4 2.9e-09
XP_016868584 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 520 62.4 2.9e-09
XP_016868583 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 520 62.4 2.9e-09
NP_000856 (OMIM: 182132) 5-hydroxytryptamine recep ( 365) 514 61.7 3.6e-09
XP_011534091 (OMIM: 182132) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 365) 514 61.7 3.6e-09
NP_000669 (OMIM: 104219) alpha-1D adrenergic recep ( 572) 508 61.4 7.1e-09
NP_057658 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 414) 498 60.3 1.1e-08
NP_000675 (OMIM: 109630,607276) beta-1 adrenergic ( 477) 492 59.8 1.8e-08
NP_000785 (OMIM: 126449) D(1A) dopamine receptor [ ( 446) 491 59.7 1.8e-08
NP_387512 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dopami ( 367) 468 57.5 7.1e-08
NP_000787 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dopami ( 400) 468 57.5 7.5e-08
XP_016861318 (OMIM: 126451,181500,190300) PREDICTE ( 400) 468 57.5 7.5e-08
NP_001277738 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dop ( 400) 468 57.5 7.5e-08
NP_001269492 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dop ( 400) 468 57.5 7.5e-08
XP_005264808 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 366) 466 57.3 8.1e-08
XP_011531966 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 366) 466 57.3 8.1e-08
NP_001309139 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366) 466 57.3 8.1e-08
NP_000857 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine recep ( 366) 466 57.3 8.1e-08
NP_001309138 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366) 466 57.3 8.1e-08
NP_001309137 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366) 466 57.3 8.1e-08
NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432) 460 56.8 1.3e-07
NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445) 460 56.8 1.3e-07
>>NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic receptor (465 aa)
initn: 3081 init1: 3081 opt: 3081 Z-score: 1574.8 bits: 300.6 E(85289): 5.6e-81
Smith-Waterman score: 3081; 100.0% identity (100.0% similar) in 450 aa overlap (1-450:16-465)
10 20 30 40
pF1KB9 MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLML
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MFRQEQPLAEGSFAPMGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLML
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LTVFGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LTVFGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAW
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 CEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVIS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 FPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 RTRVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEPAPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RTRVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEPAPAGP
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 RDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLPRRGPGATGIGTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLPRRGPGATGIGTP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 AAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTYTLTAVGCSVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTYTLTAVGCSVPR
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450
pF1KB9 TLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDRKRIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDRKRIV
430 440 450 460
>>NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic receptor (462 aa)
initn: 1463 init1: 768 opt: 1303 Z-score: 681.0 bits: 135.3 E(85289): 3.4e-31
Smith-Waterman score: 1511; 54.9% identity (73.9% similar) in 459 aa overlap (8-447:16-458)
10 20 30 40
pF1KB9 MGSLQPDAG-NASWNGTEAPGGGARAT-----P----YSLQVTLTLVCLAGL
:: ::: : .. :: : :. : :: .. :. ..:.
NP_000 MASPALAAALAVAAAAGPNASGAGERGSGGVANASGASWGPPRGQYSAGAVAGLAAVVGF
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LMLLTVFGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFG
:...:: :::::.:::.:::::.:::::::::::::::::::::.:::::::.:.:::::
NP_000 LIVFTVVGNVLVVIAVLTSRALRAPQNLFLVSLASADILVATLVMPFSLANELMAYWYFG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 KAWCEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISA
..:: .::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::.:: :..::.:::
NP_000 QVWCGVYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSVTQAVEYNLKRTPRRVKATIVAVWLISA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 VISFPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQI
:::::::.:. .. :. : :.: .::. ::..:::::::::::::: :::.:::..
NP_000 VISFPPLVSLYRQPDGA----AYPQCGLNDETWYILSSCIGSFFAPCLIMGLVYARIYRV
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 AKRRTRVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEPAP
:: :::. .:.: ..: :.. :::: .:: .: : : :.... : : .
NP_000 AKLRTRTLSEKRAP---VGPDGASPTTENGLGAAAGAGENGHCAPP-PADVE--PDESSA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 AGPRDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLPRRGPGATGI
:. : :.... .: : . : :.: : . .. : :.:: :
NP_000 AAERRRRRGALRRGG-----RRRAGAEGGAGGADGQG-AGPGAAESGALTASRSPGPGGR
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KB9 GTPAAGPGEE----RVGAAKAS--RWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTYTL
. :.. . : : :..: : . : ::::::::::::.::::.:::::::.:.:
NP_000 LSRASSRSVEFFLSRRRRARSSVCRRKVAQAREKRFTFVLAVVMGVFVLCWFPFFFSYSL
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 TAV---GCSVPRTLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDRKRIV
.. .:.:: :::::::.:::::::::::::.::.::::.::.:: : :.
NP_000 YGICREACQVPGPLFKFFFWIGYCNSSLNPVIYTVFNQDFRRSFKHILFRRRRRGFRQ
410 420 430 440 450 460
>>NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergic re (450 aa)
initn: 1240 init1: 739 opt: 1000 Z-score: 528.8 bits: 107.1 E(85289): 1e-22
Smith-Waterman score: 1431; 54.1% identity (71.6% similar) in 451 aa overlap (27-443:6-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTVFGNVLVIIAVFT
:::.:.: ... .:.:.:.:::.:::.::.:
NP_000 MDHQDPYSVQATAAIAAAITFLILFTIFGNALVILAVLT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEIYLALDVLFCTSS
::.:.:::::::::::.::::::::.::::::::..::::: ..:::.::::::::::::
NP_000 SRSLRAPQNLFLVSLAAADILVATLIIPFSLANELLGYWYFRRTWCEVYLALDVLFCTSS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 IVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVISFPPLISIEKKGGGGG
:::::::::::::....:.::: :::::::: ::.:::.:.::::.:::: : :
NP_000 IVHLCAISLDRYWAVSRALEYNSKRTPRRIKCIILTVWLIAAVISLPPLIY----KGDQG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KB9 PQP-AEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRTRVPPSRRGPDAV
::: ..:.:..:.. ::...: :::::::::::::::.::: :::: .:::: :
NP_000 PQPRGRPQCKLNQEAWYILASSIGSFFAPCLIMILVYLRIYLIAKRS-----NRRGPRAK
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 AAPPGGTER--RPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNG---APGEPAPA-GPRDTDALDL
..: : . ::. : :: . . ..:: . :: . :.:: . :
NP_000 GGPGQGESKQPRPDHGGALASAKLPALASVASAREVNGHSKSTGEKEEGETPEDTGTRAL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330
pF1KB9 EES------------------SSSDHAERPPGPRRPERG--PRGKGKARASQVKPGDSLP
: : :.::. .. :. :.. . :: .: . :
NP_000 PPSWAALPNSGQGQKEGVCGASPEDEAEEEEEEEEEEEECEPQAVPVSPASACSPPLQQP
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380
pF1KB9 RRGPG--ATGIGTPAAGPGEERVGAAKASRWRGRQN--REKRFTFVLAVVIGVFVVCWFP
. : :: : : : ::: .. :: : . :::::::::::::::::.::::
NP_000 Q-GSRVLATLRGQVLLGRG---VGAIGGQWWRRRAQLTREKRFTFVLAVVIGVFVLCWFP
340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 FFFTYTLTAV---GCSVPRTLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDR
:::.:.: :. :.::. ::.::::.::::::::::::::::.::::::..::::
NP_000 FFFSYSLGAICPKHCKVPHGLFQFFFWIGYCNSSLNPVIYTIFNQDFRRAFRRILCRPWT
390 400 410 420 430 440
450
pF1KB9 KRIV
NP_000 QTAW
450
>>XP_016872785 (OMIM: 126450,159900) PREDICTED: D(2) dop (443 aa)
initn: 730 init1: 360 opt: 756 Z-score: 406.2 bits: 84.4 E(85289): 6.9e-16
Smith-Waterman score: 796; 33.6% identity (60.4% similar) in 455 aa overlap (13-442:22-443)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTVFGN
.::.. : : :. .:: ::. . ::::
XP_016 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSD---GKADRPHYNYYATLLT-----LLIAVIVFGN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEIYLA
::: .:: .::.. : ..:::: ::.::::::.:. . ::.: : :.. :.:...
XP_016 VLVCMAVSREKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVVGEWKFSRIHCDIFVT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 LDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTP-RRIKAIIITVWVISAVISFPPLI
:::..::.::..:::::.::: .... . :: . . ::. ..: :::.: .:: : :.
XP_016 LDVMMCTASILNLCAISIDRYTAVAMPMLYNTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 SIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRTRVP
.... . .: : . .:. : : ::..: .. .:::..:: . .:: .
XP_016 GLNNAD--------QNECIIANPA-FVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRRRRKRV
180 190 200 210 220
240 250 260 270
pF1KB9 PSRRGPDA----VAAPPGGTERRP------------NGLGP-ERSAGPGGAEAEPLPTQL
..:. : . :: :. .: :: : .: .. .:. : ..
XP_016 NTKRSSRAFRAHLRAPLKGNCTHPEDMKLCTVIMKSNGSFPVNRRRVEAARRAQELEMEM
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KB9 NGAPGEP-----APAGPRDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKP
.. . : .: : . : : . : : .: .::.. ..: . . ...
XP_016 LSSTSPPERTRYSPIPP-SHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPKIAKIFE
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 GDSLPRRGPGATGIGTPAAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWF
...: :. :.. :: . :..::. : .::.:.:::..::.
XP_016 IQTMPN---------------GKTRTSLKTMSRRKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWL
350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 PFFFTYTLTA-VGCSVPRTLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKIL-CRGDR
:::.:. :. :..: .:.. : :.:: ::..::.::: :: .::.:: ::: :
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450
pF1KB9 KRIV
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10 20 30 40 50
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.... . .: : . .:. : : ::..: .. .:::..:: . .:: .
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..:. : . :: :. .: :: : .: .. .:. : ..
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.. . : .: : . : : . : : .: .::.. ..: . . ...
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...: :. :.. :: . :..::. : .::.:.:::..::.
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NP_000 PFFITHILNIHCDCNIPPVLYSAFTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC
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450
pF1KB9 KRIV
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...: ::.:::.:.:. . : :::::: .: .:..: :. : .. . :
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.. .. .: .... ...:. : .: .: :::. .. :.: . .: :
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.. ...:: .:.. : :: . :: . : :.. . .. : ..:
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pF1KB9 FWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKIL-CRGDRKRIV
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XP_011 YWLCYVNSTINPMCYALCNKAFRDTFRLLLLCRWDKRRWRKIPKRPGSVHRTPSRQC
410 420 430 440 450 460
>>NP_000729 (OMIM: 118510) muscarinic acetylcholine rece (460 aa)
initn: 384 init1: 384 opt: 595 Z-score: 325.1 bits: 69.4 E(85289): 2.3e-11
Smith-Waterman score: 595; 29.7% identity (59.4% similar) in 441 aa overlap (18-448:17-441)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTVFGNVLVIIAVFT
::: : :. ::.. . .::: : :: ::.::.:. .
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pF1KB9 SRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEIYLALDVLFCTSS
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NP_000 NTELKTVNNYFLLSLACADLIIGTFSMNLYTTYLLMGHWALGTLACDLWLALDYVASNAS
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pF1KB9 IVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVISFPPLISIEKKGGGGG
...: ::.:::.:.:. . : :::::: .: .:..: :. : .. . :
NP_000 VMNLLLISFDRYFSVTRPLSYRAKRTPRRAALMIGLAWLVSFVLWAPAILFWQYLVGERT
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pF1KB9 PQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRTRVPPSRRG---PD
.. .. .: .... ...:. : .: .: :::. .. :.: . .: :
NP_000 VLAGQCYIQFLSQPIITFGTAMAAFYLPVTVMCTLYWRIYRETENRARELAALQGSETPG
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.. ...:: .:.. : :: . :: . : :.. . .. : ..:
NP_000 KGGGSSSSSERSQPGAEGSPE--TPPGRCCRCCRAPRLLQAYSWKEE----EEEDEGSME
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pF1KB9 ESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLPRRGPGATGIGTPAAGPGEERV
.::. : :: . . : .:.: .: : : : : :: :..
NP_000 SLTSSEGEE--PGSEVVIKMPMVDPEAQAPTKQPPRSSPNTVKRPTKKGRDRAGKGQKPR
290 300 310 320 330 340
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pF1KB9 GAAK-ASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTYTLTAVGCS--VPRTLFKFF
: . :.: .::. . .:.... .:.. : :. . ..:... :. ::.::...
NP_000 GKEQLAKRKTFSLVKEKKAARTLSAILLAFILTWTPYNI-MVLVSTFCKDCVPETLWELG
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pF1KB9 FWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKIL-CRGDRKRIV
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NP_000 YWLCYVNSTINPMCYALCNKAFRDTFRLLLLCRWDKRRWRKIPKRPGSVHRTPSRQC
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>>NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamine re (422 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB9 MGSLQPDAGNASWNGTEAP---GG---GARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTVFGNVLV
: :.: :: . .. :: :: : . : :: .: : : :.. .:.::. :
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: :::::.:::::.:::::.::. :.: :::::: :.: .:.:. .::.::... .
NP_000 LCCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRT
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pF1KB9 KGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRTRVPPSRR
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NP_000 PEDRSDPDA----CTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIR------
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pF1KB9 ESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDS---LPRRGPGATGIGTPAAGPGE
:.. : : : .: : . . :.: :: :. .: :: : .
NP_000 --SKAGGALCANGAVR--QGDDGAALEVIEVHRVGNSKEHLPL--PSEAG-PTPCAPASF
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pF1KB9 ERVGAAKA-SRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFF---FTYTLTAVGCSVPRTL
:: . .: .. . ::.. . .:....:.:..::.::: .. . .: .: :
NP_000 ERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLL
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pF1KB9 FKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKIL-CRGDRKRIV
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NP_000 GAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ
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>>XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B adrene (328 aa)
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.
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>>XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B adrene (331 aa)
initn: 601 init1: 400 opt: 539 Z-score: 298.5 bits: 64.0 E(85289): 6.9e-10
Smith-Waterman score: 539; 36.4% identity (70.0% similar) in 220 aa overlap (10-228:22-235)
10 20 30 40
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pF1KB9 FGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEI
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. :.::: ::.::. :::::.::: .. ...: : :. ...:::.:.:::. :
XP_006 WAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVISIGP
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 LISIEKKGGGGGPQPAEPR-CEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRT
:. : : : . . : .... .:.. : .:::. : .....: :.: .::: :
XP_006 LL------GWKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTT
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pF1KB9 RVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEPAPAGPRD
.
XP_006 KNLEAGVMKEMSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAK
240 250 260 270 280 290
450 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 19:52:56 2016 done: Fri Nov 4 19:52:57 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]