Result of FASTA (omim) for
pF1KB9850
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9850, 377 aa
1>>>pF1KB9850 377 - 377 aa - 377 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1542+/-0.000459; mu= 16.9887+/- 0.029
mean_var=99.0093+/-26.727, 0's: 0 Z-trim(109.9): 608 B-trim: 1909 in 2/48
Lambda= 0.128895
statistics sampled from 17296 (18100) to 17296 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 5.840
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000855 (OMIM: 182133) 5-hydroxytryptamine recep ( 377) 2468 470.3 3.3e-132
NP_000854 (OMIM: 182131) 5-hydroxytryptamine recep ( 390) 1561 301.6 2e-81
NP_001309137 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366) 1086 213.3 7.4e-55
NP_000857 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine recep ( 366) 1086 213.3 7.4e-55
NP_001309139 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366) 1086 213.3 7.4e-55
NP_001309138 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366) 1086 213.3 7.4e-55
XP_011531966 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 366) 1086 213.3 7.4e-55
XP_005264808 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 366) 1086 213.3 7.4e-55
NP_000856 (OMIM: 182132) 5-hydroxytryptamine recep ( 365) 1074 211.0 3.5e-54
XP_011534091 (OMIM: 182132) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 365) 1074 211.0 3.5e-54
NP_387512 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dopami ( 367) 666 135.2 2.4e-31
NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamin ( 422) 659 133.9 6.5e-31
NP_000675 (OMIM: 109630,607276) beta-1 adrenergic ( 477) 639 130.3 9.3e-30
NP_001243689 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine re ( 458) 623 127.3 7.1e-29
NP_000859 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine recep ( 458) 623 127.3 7.1e-29
NP_001307687 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine re ( 439) 566 116.7 1.1e-25
XP_006712545 (OMIM: 601122) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 456) 566 116.7 1.1e-25
NP_000858 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine recep ( 481) 566 116.7 1.1e-25
NP_000789 (OMIM: 126453,143465,606798) D(1B) dopam ( 477) 553 114.3 6e-25
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 539 111.7 3.6e-24
NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 535 110.9 6e-24
NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432) 523 108.7 2.7e-23
NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445) 523 108.7 2.8e-23
NP_062873 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 479) 523 108.7 2.9e-23
NP_076917 (OMIM: 601305) 5-hydroxytryptamine recep ( 357) 502 104.7 3.6e-22
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 497 103.8 7.9e-22
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 489 102.2 1.7e-21
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 489 102.2 1.8e-21
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 489 102.2 1.8e-21
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 489 102.2 1.9e-21
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 489 102.3 2e-21
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 489 102.3 2e-21
XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 489 102.3 2.2e-21
NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 489 102.3 2.2e-21
NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455) 489 102.4 2.2e-21
NP_000671 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 466) 489 102.4 2.3e-21
XP_006716355 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 489 102.4 2.3e-21
XP_016868583 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 489 102.4 2.3e-21
NP_150646 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 475) 489 102.4 2.3e-21
XP_016868584 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 489 102.4 2.3e-21
XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 328) 485 101.5 3e-21
XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 331) 485 101.5 3e-21
XP_005265875 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 366) 485 101.5 3.2e-21
XP_011532740 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 389) 485 101.5 3.4e-21
XP_011532739 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 402) 485 101.6 3.5e-21
NP_000670 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic recep ( 520) 485 101.7 4.1e-21
XP_011532737 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 556) 485 101.7 4.3e-21
NP_000669 (OMIM: 104219) alpha-1D adrenergic recep ( 572) 479 100.6 9.5e-21
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 471 99.0 2.1e-20
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 461 97.1 7.8e-20
>>NP_000855 (OMIM: 182133) 5-hydroxytryptamine receptor (377 aa)
initn: 2468 init1: 2468 opt: 2468 Z-score: 2494.6 bits: 470.3 E(85289): 3.3e-132
Smith-Waterman score: 2468; 100.0% identity (100.0% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 TTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDIT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 CCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 AQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 TAHLITGSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADSALERKRISAARERKAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TAHLITGSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADSALERKRISAARERKAT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFN
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB9 EEFRQAFQKIVPFRKAS
:::::::::::::::::
NP_000 EEFRQAFQKIVPFRKAS
370
>>NP_000854 (OMIM: 182131) 5-hydroxytryptamine receptor (390 aa)
initn: 1535 init1: 931 opt: 1561 Z-score: 1582.9 bits: 301.6 E(85289): 2e-81
Smith-Waterman score: 1561; 62.4% identity (83.4% similar) in 380 aa overlap (3-377:12-390)
10 20 30 40
pF1KB9 MSPLNQSAEGLPQE--ASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVIT
: : .:: .: : : . . .. :. :...:..::
NP_000 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LATVLSNAFVLTTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQI
:::.::::::..:. ::::::::::::.:::.::::::::::::: ::.: :..::.
NP_000 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 LCDIWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICI
.::.::::::::::::::::::::::::::::::.::: .:: .::.:::.::..:: :
NP_000 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 SIPPLFWRQAKAQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRIL
:.::.:::::::.::.:.:.:::..: ::.::: ::::.:..::: :::::: ::.:::
NP_000 SLPPFFWRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 NP-PSLYGKRFTTAHLITGSAGS--SLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADSAL
. :. :::.: :.::: : :: :. :.:: . . :.: :::.. :.::....:. :
NP_000 KQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSES-GSPVYVNQVKVRVSDALL
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 ERKRISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGY
:.:.. ::::::::: :::::::::.::::::..:::.:::.:.::.: :.:::::::::
NP_000 EKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDFFTWLGY
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KB9 LNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS
:::::::::::. ::.:.:::.:.. :. .:
NP_000 LNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
360 370 380 390
>>NP_001309137 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine recept (366 aa)
initn: 1050 init1: 591 opt: 1086 Z-score: 1105.9 bits: 213.3 E(85289): 7.4e-55
Smith-Waterman score: 1086; 50.4% identity (77.4% similar) in 345 aa overlap (38-374:23-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 AEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTR
:: ....:: ..: :. :..:...:..::
NP_001 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 KLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASIL
::: :::::: :::.::.::..::::.::.: . ..: .::..:::::: :::::: :::
NP_001 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSIL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 HLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAKAQEEMSD
:: .:::::: :::::.::...:: ::. ::.::: ::. ::.::::::. .... ..
NP_001 HLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRD-DE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILN-PPSLYGKRFTTAHLIT
:... ..: ::::: :::::: .:..::: .:::::.. . : .:. ......
NP_001 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB9 GSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFN-HVKIKLADSALE------RKRISAARERKA
:. .: :...: .: : : : . : .. : .. :..::..:::::
NP_001 ESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVF
. ::.:::::.:::::::: ::. .: :.: : . .:..:::::::::::.:::.:
NP_001 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVC-DKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIF
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB9 NEEFRQAFQKIVPFRKAS
::.:..::::.: :
NP_001 NEDFKKAFQKLVRCRC
360
>>NP_000857 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine receptor (366 aa)
initn: 1050 init1: 591 opt: 1086 Z-score: 1105.9 bits: 213.3 E(85289): 7.4e-55
Smith-Waterman score: 1086; 50.4% identity (77.4% similar) in 345 aa overlap (38-374:23-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 AEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTR
:: ....:: ..: :. :..:...:..::
NP_000 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 KLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASIL
::: :::::: :::.::.::..::::.::.: . ..: .::..:::::: :::::: :::
NP_000 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSIL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 HLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAKAQEEMSD
:: .:::::: :::::.::...:: ::. ::.::: ::. ::.::::::. .... ..
NP_000 HLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRD-DE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILN-PPSLYGKRFTTAHLIT
:... ..: ::::: :::::: .:..::: .:::::.. . : .:. ......
NP_000 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB9 GSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFN-HVKIKLADSALE------RKRISAARERKA
:. .: :...: .: : : : . : .. : .. :..::..:::::
NP_000 ESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVF
. ::.:::::.:::::::: ::. .: :.: : . .:..:::::::::::.:::.:
NP_000 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVC-DKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIF
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB9 NEEFRQAFQKIVPFRKAS
::.:..::::.: :
NP_000 NEDFKKAFQKLVRCRC
360
>>NP_001309139 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine recept (366 aa)
initn: 1050 init1: 591 opt: 1086 Z-score: 1105.9 bits: 213.3 E(85289): 7.4e-55
Smith-Waterman score: 1086; 50.4% identity (77.4% similar) in 345 aa overlap (38-374:23-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 AEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTR
:: ....:: ..: :. :..:...:..::
NP_001 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 KLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASIL
::: :::::: :::.::.::..::::.::.: . ..: .::..:::::: :::::: :::
NP_001 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSIL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 HLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAKAQEEMSD
:: .:::::: :::::.::...:: ::. ::.::: ::. ::.::::::. .... ..
NP_001 HLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRD-DE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILN-PPSLYGKRFTTAHLIT
:... ..: ::::: :::::: .:..::: .:::::.. . : .:. ......
NP_001 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB9 GSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFN-HVKIKLADSALE------RKRISAARERKA
:. .: :...: .: : : : . : .. : .. :..::..:::::
NP_001 ESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVF
. ::.:::::.:::::::: ::. .: :.: : . .:..:::::::::::.:::.:
NP_001 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVC-DKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIF
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB9 NEEFRQAFQKIVPFRKAS
::.:..::::.: :
NP_001 NEDFKKAFQKLVRCRC
360
>>NP_001309138 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine recept (366 aa)
initn: 1050 init1: 591 opt: 1086 Z-score: 1105.9 bits: 213.3 E(85289): 7.4e-55
Smith-Waterman score: 1086; 50.4% identity (77.4% similar) in 345 aa overlap (38-374:23-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 AEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTR
:: ....:: ..: :. :..:...:..::
NP_001 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 KLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASIL
::: :::::: :::.::.::..::::.::.: . ..: .::..:::::: :::::: :::
NP_001 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSIL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 HLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAKAQEEMSD
:: .:::::: :::::.::...:: ::. ::.::: ::. ::.::::::. .... ..
NP_001 HLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRD-DE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILN-PPSLYGKRFTTAHLIT
:... ..: ::::: :::::: .:..::: .:::::.. . : .:. ......
NP_001 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB9 GSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFN-HVKIKLADSALE------RKRISAARERKA
:. .: :...: .: : : : . : .. : .. :..::..:::::
NP_001 ESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVF
. ::.:::::.:::::::: ::. .: :.: : . .:..:::::::::::.:::.:
NP_001 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVC-DKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIF
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB9 NEEFRQAFQKIVPFRKAS
::.:..::::.: :
NP_001 NEDFKKAFQKLVRCRC
360
>>XP_011531966 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytrypta (366 aa)
initn: 1050 init1: 591 opt: 1086 Z-score: 1105.9 bits: 213.3 E(85289): 7.4e-55
Smith-Waterman score: 1086; 50.4% identity (77.4% similar) in 345 aa overlap (38-374:23-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 AEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTR
:: ....:: ..: :. :..:...:..::
XP_011 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 KLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASIL
::: :::::: :::.::.::..::::.::.: . ..: .::..:::::: :::::: :::
XP_011 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSIL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 HLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAKAQEEMSD
:: .:::::: :::::.::...:: ::. ::.::: ::. ::.::::::. .... ..
XP_011 HLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRD-DE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILN-PPSLYGKRFTTAHLIT
:... ..: ::::: :::::: .:..::: .:::::.. . : .:. ......
XP_011 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB9 GSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFN-HVKIKLADSALE------RKRISAARERKA
:. .: :...: .: : : : . : .. : .. :..::..:::::
XP_011 ESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVF
. ::.:::::.:::::::: ::. .: :.: : . .:..:::::::::::.:::.:
XP_011 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVC-DKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIF
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB9 NEEFRQAFQKIVPFRKAS
::.:..::::.: :
XP_011 NEDFKKAFQKLVRCRC
360
>>XP_005264808 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytrypta (366 aa)
initn: 1050 init1: 591 opt: 1086 Z-score: 1105.9 bits: 213.3 E(85289): 7.4e-55
Smith-Waterman score: 1086; 50.4% identity (77.4% similar) in 345 aa overlap (38-374:23-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 AEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTR
:: ....:: ..: :. :..:...:..::
XP_005 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 KLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASIL
::: :::::: :::.::.::..::::.::.: . ..: .::..:::::: :::::: :::
XP_005 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSIL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 HLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAKAQEEMSD
:: .:::::: :::::.::...:: ::. ::.::: ::. ::.::::::. .... ..
XP_005 HLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRD-DE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILN-PPSLYGKRFTTAHLIT
:... ..: ::::: :::::: .:..::: .:::::.. . : .:. ......
XP_005 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB9 GSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFN-HVKIKLADSALE------RKRISAARERKA
:. .: :...: .: : : : . : .. : .. :..::..:::::
XP_005 ESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVF
. ::.:::::.:::::::: ::. .: :.: : . .:..:::::::::::.:::.:
XP_005 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVC-DKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIF
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB9 NEEFRQAFQKIVPFRKAS
::.:..::::.: :
XP_005 NEDFKKAFQKLVRCRC
360
>>NP_000856 (OMIM: 182132) 5-hydroxytryptamine receptor (365 aa)
initn: 1056 init1: 591 opt: 1074 Z-score: 1093.8 bits: 211.0 E(85289): 3.5e-54
Smith-Waterman score: 1074; 49.0% identity (72.8% similar) in 367 aa overlap (23-375:8-363)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVL
::.: : :.:. :. . ..: ::: :.: : :.
NP_000 MNITNCTTEASMAIRPKTITE-KMLICMTLVVITTLTTLLNLAVI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 TTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDIT
.: :.::: :::::: :::.:::::..::::.:: : . :..: .::..::: :.:
NP_000 MAIGTTKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMT
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB9 CCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWR-QA
::: :::::::::::::::::.:.::...::: .:: :: ::.::: ::.:::::: .
NP_000 CCTCSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 KAQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRF
. . :.: .. ... :::::: :::::: .:..::: :::.::. ::: ::
NP_000 RLSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAK-------SLYQKRG
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB9 TTAHLITGSAGS----SLCSLNSSLHEGHSHSAGSPL-----FFNHVKIKLADSAL----
.. :: . :. : . :.:.... . . :...: : ..: :. :
NP_000 SSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQTFCVS-DFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 ERKRISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGY
::..::..:::::..:::.::::::. :::::. :.. . . . . ::.:::::
NP_000 ERQQISSTRERKAARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGLSIYT--VSSEVADFLTWLGY
280 290 300 310 320 330
350 360 370
pF1KB9 LNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS
.::::::..:: :::.:. ::.:.. :.
NP_000 VNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT
340 350 360
>>XP_011534091 (OMIM: 182132) PREDICTED: 5-hydroxytrypta (365 aa)
initn: 1056 init1: 591 opt: 1074 Z-score: 1093.8 bits: 211.0 E(85289): 3.5e-54
Smith-Waterman score: 1074; 49.0% identity (72.8% similar) in 367 aa overlap (23-375:8-363)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVL
::.: : :.:. :. . ..: ::: :.: : :.
XP_011 MNITNCTTEASMAIRPKTITE-KMLICMTLVVITTLTTLLNLAVI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 TTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDIT
.: :.::: :::::: :::.:::::..::::.:: : . :..: .::..::: :.:
XP_011 MAIGTTKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMT
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB9 CCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWR-QA
::: :::::::::::::::::.:.::...::: .:: :: ::.::: ::.:::::: .
XP_011 CCTCSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 KAQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRF
. . :.: .. ... :::::: :::::: .:..::: :::.::. ::: ::
XP_011 RLSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAK-------SLYQKRG
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB9 TTAHLITGSAGS----SLCSLNSSLHEGHSHSAGSPL-----FFNHVKIKLADSAL----
.. :: . :. : . :.:.... . . :...: : ..: :. :
XP_011 SSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQTFCVS-DFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 ERKRISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGY
::..::..:::::..:::.::::::. :::::. :.. . . . . ::.:::::
XP_011 ERQQISSTRERKAARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGLSIYT--VSSEVADFLTWLGY
280 290 300 310 320 330
350 360 370
pF1KB9 LNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS
.::::::..:: :::.:. ::.:.. :.
XP_011 VNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT
340 350 360
377 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 19:45:39 2016 done: Fri Nov 4 19:45:40 2016
Total Scan time: 5.840 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]