Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9849
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9849, 377 aa
1>>>pF1KB9849 377 - 377 aa - 377 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4930+/-0.000792; mu= 16.3177+/- 0.048
mean_var=97.5807+/-24.723, 0's: 0 Z-trim(108.9): 232 B-trim: 1162 in 2/49
Lambda= 0.129835
statistics sampled from 10222 (10513) to 10222 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.323), width: 16
Scan time: 2.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 2518 482.1 3.5e-136
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 1251 244.7 9.5e-65
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 772 155.0 9e-38
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 758 152.4 6.1e-37
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 641 130.4 2.2e-30
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 636 129.5 4.3e-30
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 599 122.6 5.6e-28
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 592 121.3 1.3e-27
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 582 119.4 5.1e-27
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 536 110.8 1.9e-24
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 527 109.2 7.1e-24
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 521 108.0 1.3e-23
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 520 107.8 1.6e-23
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 518 107.4 2e-23
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 518 107.4 2e-23
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 507 105.4 9.2e-23
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 506 105.2 1e-22
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 506 105.3 1.2e-22
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 503 104.7 1.5e-22
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 502 104.4 1.5e-22
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 499 103.9 2.6e-22
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 498 103.7 2.9e-22
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 497 103.5 3.1e-22
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 497 103.5 3.3e-22
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 497 103.5 3.3e-22
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 497 103.6 3.4e-22
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 497 103.6 3.4e-22
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 497 103.6 3.6e-22
CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX ( 339) 495 103.1 3.8e-22
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 495 103.1 4.1e-22
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 493 102.7 5.2e-22
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 481 100.6 2.7e-21
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 480 100.3 3e-21
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 479 100.2 3.4e-21
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 466 97.7 1.7e-20
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 466 97.7 1.8e-20
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 464 97.3 2.3e-20
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 462 97.0 3e-20
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 459 96.4 4.4e-20
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 ( 342) 457 96.0 5.4e-20
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 454 95.4 8.2e-20
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 ( 363) 453 95.3 9.4e-20
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 451 94.9 1.2e-19
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 449 94.5 1.4e-19
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 450 94.7 1.5e-19
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 446 93.9 2e-19
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 445 93.8 2.7e-19
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 440 92.8 4.8e-19
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 438 92.5 6.7e-19
CCDS5299.1 GPR31 gene_id:2853|Hs108|chr6 ( 319) 437 92.2 6.9e-19
>>CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 (377 aa)
initn: 2518 init1: 2518 opt: 2518 Z-score: 2558.3 bits: 482.1 E(32554): 3.5e-136
Smith-Waterman score: 2518; 99.5% identity (99.5% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAADLGPWNDTINGTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVLGLCLNAVALYIFLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS82 MAADLGPWNDTINGTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVPGLCLNAVALYIFLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLFYTNLYCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLFYTNLYCS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 ILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLRWGRARYARRVAGAVWVLVLACQAPVLYFVTTSARGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLRWGRARYARRVAGAVWVLVLACQAPVLYFVTTSARGGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VTCHDTSAPELFSRFVAYSSVMLGLLFAVPFAVILVCYVLMARRLLKPAYGTSGGLPRAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VTCHDTSAPELFSRFVAYSSVMLGLLFAVPFAVILVCYVLMARRLLKPAYGTSGGLPRAK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RKSVRTIAVVLAVFALCFLPFHVTRTLYYSFRSLDLSCHTLNAINMAYKVTRPLASANSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RKSVRTIAVVLAVFALCFLPFHVTRTLYYSFRSLDLSCHTLNAINMAYKVTRPLASANSC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LDPVLYFLAGQRLVRFARDAKPPTGPSPATPARCRLGLRRSDRTDMQRIEDVLGSSEDSR
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LDPVLYFLAGQRLVRFARDAKPPTGPSPATPARRRLGLRRSDRTDMQRIEDVLGSSEDSR
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB9 RTESTPAGSENTKDIRL
:::::::::::::::::
CCDS82 RTESTPAGSENTKDIRL
370
>>CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX (365 aa)
initn: 1226 init1: 884 opt: 1251 Z-score: 1275.9 bits: 244.7 E(32554): 9.5e-65
Smith-Waterman score: 1251; 59.1% identity (79.9% similar) in 313 aa overlap (20-332:22-332)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAADLGPWNDTINGTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVLGLCLNAVALYIF
:. : :.::::..::::::.:: :::: ::: .:..:
CCDS14 MASTESSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLWLF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LCRLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLFYTNLY
. ::. :.:..:::::::.::.::. ::: :.:::: .::::.: .::.:::::: :::
CCDS14 IFRLRPWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWNLY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 CSILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLRWGRARYARRVAGAVWVLVLACQAPVLYFVTTSARG
::.:::::::::: ::. .:::.::::: : : . :::..: .: .: :.::::: .:
CCDS14 CSVLFLTCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLLCLAVWLVVAGCLVPNLFFVTTSNKG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 GRVTCHDTSAPELFSRFVAYSSVMLGLLFAVPFAVILVCYVLMARRLLKPAYGTSGGLPR
: ::::. :: :...: .::...::::.:: : :::: :::::: .: :.. . :
CCDS14 TTVLCHDTTRPEEFDHYVHFSSAVMGLLFGVPCLVTLVCYGLMARRLYQPLPGSAQSSSR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 AKRKSVRTIAVVLAVFALCFLPFHVTRTLYYSFRSLDLSCHTLNAINMAYKVTRPLASAN
. :.:::::::.:::.::.:::.:::.:: : :. .:..:: .:..:::::::::::
CCDS14 LR--SLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLEADCRVLNIVNVVYKVTRPLASAN
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 SCLDPVLYFLAGQRLVRFARDAKPPTGPSPATPARCRLGLRRSDRTDMQRIEDVLGSSED
::::::::.:.:.. : :. :.: : :
CCDS14 SCLDPVLYLLTGDKYRRQLRQLCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQDSSCS
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB9 SRRTESTPAGSENTKDIRL
CCDS14 TPRADRL
360
>>CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 (328 aa)
initn: 643 init1: 385 opt: 772 Z-score: 791.6 bits: 155.0 E(32554): 9e-38
Smith-Waterman score: 772; 42.6% identity (68.1% similar) in 310 aa overlap (16-315:3-310)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAADLGPWNDTINGTWD---GDELGY---RCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVLGLCLNAVA
:: :. :: : . :.:: .::: :..: . :: :: .
CCDS82 MEWDNGTGQALGLPPTTCVYRENFKQLLLPPVYSAVLAAGLPLNICV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LYIFLCRLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLFY
. . .. . ...: ..::..: ::: :::::.: ::.::::::. :.:::::::
CCDS82 ITQICTSRRALTRTAVYTLNLALADLLYACSLPLLIYNYAQGDHWPFGDFACRLVRFLFY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 TNLYCSILFLTCISVHRCLGVLRPLRSL--RWGRARYARRVAGAVWVLVLACQAPVLYFV
.::. ::::::::: .: ::. .:: : :: : : : :::. : . :. :.
CCDS82 ANLHGSILFLTCISFQRYLGICHPLAPWHKRGGR-RAAWLVCVAVWLAVTTQCLPTAIFA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 TTSARGGRVTCHDTSAPELFSRFVAYSSVMLGLLFAVPFAVILVCYVLMARRLLKPAYGT
.:. . .:..:.: : : : .... :. .. . : .:::..:.:: :.: :: . :
CCDS82 ATGIQRNRTVCYDLSPPALATHYMPYGMALTVIGFLLPFAALLACYCLLACRLCRQD-GP
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 SGGLPRAKR-KSVRTIAVVLAVFALCFLPFHVTRTLYYSFRSLD-LSCHTLNAINMAYKV
. . . .: :..: .:: :.::. :::::.:.: : . :: . : .:.:. :::
CCDS82 AEPVAQERRGKAARMAVVVAAAFAISFLPFHITKTAYLAVRSTPGVPCTVLEAFAAAYKG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TRPLASANSCLDPVLYFLAGQRLVRFARDAKPPTGPSPATPARCRLGLRRSDRTDMQRIE
:::.::::: :::.:.... ... :
CCDS82 TRPFASANSVLDPILFYFTQKKFRRRPHELLQKLTAKWQRQGR
290 300 310 320
>>CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 (373 aa)
initn: 695 init1: 507 opt: 758 Z-score: 776.7 bits: 152.4 E(32554): 6.1e-37
Smith-Waterman score: 758; 38.1% identity (67.7% similar) in 328 aa overlap (6-320:20-342)
10 20 30 40
pF1KB9 MAADLGP---WNDTINGTWDGDELGYRCRFNED-FKYVLLPVSYGV
:: :... .. . ...: ... :.. ::. : .
CCDS31 MTEVLWPAVPNGTDAAFLAGPGSSWGNSTVASTAAVSSSFKCALTKTGFQFYYLPAVYIL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 VCVLGLCLNAVALYIFLCRLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFS
: ..:. :.::...:. ..: :.. ..:::.::..: ::. .:: :..:: : :.
CCDS31 VFIIGFLGNSVAIWMFVFHMKPWSGISVYMFNLALADFLYVLTLPALIFYYFNKTDWIFG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 TVLCKLVRFLFYTNLYCSILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLRWGRARYARRVAGAVWVLVL
..::: ::.:..::: :::::::::.:: ::. ::.:: . . : .. ::..:.
CCDS31 DAMCKLQRFIFHVNLYGSILFLTCISAHRYSGVVYPLKSLGRLKKKNAICISVLVWLIVV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 ACQAPVLYFVTTSARGGR-VTCHDTSAPELFSRFVAYSSVMLGLLFAVPFAVILVCYVLM
. .:.:.. :..: .. .::.::.. : . . :: .: ::...:: :: :.
CCDS31 VAISPILFYSGTGVRKNKTITCYDTTSDEYLRSYFIYSMCTTVAMFCVPLVLILGCYGLI
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 ARRLLKPAYGTSGGLPRAKRKSVRTIAVVLAVFALCFLPFHVTRTLYYSFRSLDLSCHTL
.: :. : . : .:::. . .::.:::. ..:::: .:. : ::.. ..
CCDS31 VRALI---YKDLDNSP-LRRKSIYLVIIVLTVFAVSYIPFHVMKTMNLRAR-LDFQTPAM
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB9 NAIN----MAYKVTRPLASANSCLDPVLYFLAG----QRLVRFARDAKPPTGPSPATPAR
:.: .:.::: ::: :::.::.:::::: .:: : .: :
CCDS31 CAFNDRVYATYQVTRGLASLNSCVDPILYFLAGDTFRRRLSRATRKASRRSEANLQSKSE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KB9 CRLGLRRSDRTDMQRIEDVLGSSEDSRRTESTPAGSENTKDIRL
CCDS31 DMTLNILPEFKQNGDTSL
360 370
>>CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 (337 aa)
initn: 648 init1: 483 opt: 641 Z-score: 658.8 bits: 130.4 E(32554): 2.2e-30
Smith-Waterman score: 641; 34.1% identity (67.4% similar) in 279 aa overlap (28-306:28-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAADLGPWNDTINGTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVLGLCLNAVALYIFLC
: .:. ::: ::.. ..:. :::.. ..
CCDS94 MNEPLDYLANASDFPDYAAAFGNCTDENIPLKMHYLPVIYGIIFLVGFPGNAVVISTYIF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLFYTNLYCS
... :..:: :..:: .: :: .:::.:..::: :..: :. .::..:: :. ::: :
CCDS94 KMRPWKSSTIIMLNLACTDLLYLTSLPFLIHYYASGENWIFGDFMCKFIRFSFHFNLYSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 ILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLRWGRARYARRVAGAVWVLVLACQAPVLYFVTTSARGGR
::::::.:. : ...:. . ..: : . ..::.. :. :. ...:.. : .:
CCDS94 ILFLTCFSIFRYCVIIHPMSCFSIHKTRCAVVACAVVWIISLVAVIPMTFLITSTNRTNR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VTCHDTSAPELFSRFVAYSSVMLGLLFAVPFAVILVCYVLMARRLLKPAYGTSGGLPRAK
.: : .. . .. . :. .. . : .:.... .::. . . : . . :.. : :
CCDS94 SACLDLTSSDELNTIKWYNLILTATTFCLPLVIVTLCYTTIIHTLTH-GLQTDSCL---K
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RKSVRTIAVVLAVFALCFLPFHVTRTLYYSFRSLDLSCHTLNAINMAYKVTRPLASANSC
.:. : ..: .: .::::::. :.. : :..:: : :. :: :.::::. :.
CCDS94 QKARRLTILLLLAFYVCFLPFHILRVIRIESRLLSISCSIENQIHEAYIVSRPLAALNTF
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LDPVLYFLAGQRLVRFARDAKPPTGPSPATPARCRLGLRRSDRTDMQRIEDVLGSSEDSR
. .::
CCDS94 GNLLLYVVVSDNFQQAVCSTVRCKVSGNLEQAKKISYSNNP
300 310 320 330
>>CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 (344 aa)
initn: 458 init1: 246 opt: 636 Z-score: 653.7 bits: 129.5 E(32554): 4.3e-30
Smith-Waterman score: 636; 33.4% identity (67.2% similar) in 293 aa overlap (25-313:9-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAADLGPWNDTINGTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVLGLCLNAVALYIFLC
: .:..:::.: ...: :::: : ::.:::.:
CCDS94 MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIFIC
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLFYTNLYCS
::. : .::::..::.:: :.. .::. ..:.. .:::. .:::. .:::::.: :
CCDS94 VLKVRNETTTYMINLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTT-RNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 ILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLRWGRARYARRVAGAVWVLVLACQAPVLYFVTTSARGGR
::::::::: : :... :..: : :. : .::. :.. .::... .: ..:.
CCDS94 ILFLTCISVDRFLAIVYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTHSQGNN
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB9 VT--CHDTSAPELFSRFVAYSSVMLGLL-FAVPFAVILVCYVLMARRLLKPAYGTSGGLP
.. : .. .. ... ... .. : .:. . ..: .. . : ::. . . .
CCDS94 ASEACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLSRSKI-
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 RAKRKSVRTIAVVLAVFALCFLPFHVTRTLYYSFRSLDL-SCHTLNAINMAYKVTRPLAS
: : .. : : : .: .::.:.... :: :. . .: .. :. : .: .:
CCDS94 -NKTKVLKMIFVHLIIFCFCFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLCIAV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 ANSCLDPVLYFLAGQRLVRFARDAKPPTGPSPATPARCRLGLRRSDRTDMQRIEDVLGSS
.: :.::..:..... .
CCDS94 SNCCFDPIVYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIFDNE
290 300 310 320 330 340
>>CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 (367 aa)
initn: 577 init1: 339 opt: 599 Z-score: 615.8 bits: 122.6 E(32554): 5.6e-28
Smith-Waterman score: 599; 34.2% identity (65.4% similar) in 292 aa overlap (24-313:50-332)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAADLGPWNDTINGTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVLGLCLNAV
.: . .. .:. : . .:.: :..
CCDS21 LSGSDSSQSMNGLEVAPPGLITNFSLATAEQCGQETPLENMLFASFYLLDFILALVGNTL
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 ALYIFLCRLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLF
::..:. :. . ......::::.: . :: . :. :.::::. . :.:. :::
CCDS21 ALWLFIRDHKSGTPANVFLMHLAVADLSCVLVLPTRLVYHFSGNHWPFGEIACRLTGFLF
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 YTNLYCSILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLRWGRARYARRVAGAVWVLVLACQAPVLYFVT
: :.: :: ::::::. : :....:..::. : ::. . . .::.: . .::.:
CCDS21 YLNMYASIYFLTCISADRFLAIVHPVKSLKLRRPLYAHLACAFLWVVVAVAMAPLLVSPQ
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 TSARGGRVTCHDTSAPELFSRFVAYSS-VMLGLLFAVPFAVILVCYVLMARRLLKPAYGT
: . :.: .:. . ... . : :.. :. :: . ..::.:. : : .
CCDS21 TVQTNHTVVCL-----QLYREKASHHALVSLAVAFTFPFITTVTCYLLIIRSLRQGLRVE
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 SGGLPRAKRKSVRTIAVVLAVFALCFLPFHVTRTLYY-SFRSLDLSCHTLNAINMAYKVT
. : : :.:: ::.:::.: .::.:.::.:..: .:: :: : . .: ..:
CCDS21 K----RLKTKAVRMIAIVLAIFLVCFVPYHVNRSVYVLHYRSHGASCATQRILALANRIT
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 RPLASANSCLDPVLYFLAGQRLVRFARDAKPPTGPSPATPARCRLGLRRSDRTDMQRIED
:.: :. :::..::......
CCDS21 SCLTSLNGALDPIMYFFVAEKFRHALCNLLCGKRLKGPPPSFEGKTNESSLSAKSEL
320 330 340 350 360
>>CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 (346 aa)
initn: 462 init1: 281 opt: 592 Z-score: 609.1 bits: 121.3 E(32554): 1.3e-27
Smith-Waterman score: 592; 31.8% identity (66.4% similar) in 324 aa overlap (13-334:20-332)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAADLGPWNDTINGTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVLGLCLNAV
:::..... . : . :.:: ..:. : .. :. :..
CCDS94 MERKFMSLQPSISVSEMEPNGTFSNNN-SRNCTI-ENFKREFFPIVYLIIFFWGVLGNGL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 ALYIFLCRLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLF
..:.:: : .. ...:..::.:: :. ..::. . :: ::..: :. . :... . .
CCDS94 SIYVFLQPYKKSTSVNVFMLNLAISDLLFISTLPFRADYYLRGSNWIFGDLACRIMSYSL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 YTNLYCSILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLRWGRARYARRVAGAVWVLVLACQAPVLYFVT
:.:.: :: ::: .:: : :....:.: :. : : . : .:.:..: . .. . .
CCDS94 YVNMYSSIYFLTVLSVVRFLAMVHPFRLLHVTSIRSAWILCGIIWILIMA--SSIMLLDS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 TSARGGRVT-CHDTSAPELFS-RFVAYSSVMLGLLFAVPFAVILVCYVLMARRLLKPAYG
: ..: :: : . . .. . . . : ....: : .:: .. .::.:. : :::
CCDS94 GSEQNGSVTSCLELNLYKIAKLQTMNYIALVVGCL--LPFFTLSICYLLIIRVLLKVEVP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 TSGGLPRAKRKSVRTIAVVLAVFALCFLPFHVTRTLYYSFRSLDLSCHTLNAINMAYKVT
:: : ..::.. :: ..: .: :::::.:. ::.. . .. : :. . .. : .:
CCDS94 ESG-LRVSHRKALTTIIITLIIFFLCFLPYHTLRTVHLTTWKVGL-CK--DRLHKALVIT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 RPLASANSCLDPVLYFLAGQRLVRFARDAKPPTGPSPATPARCRLGLRRSDRTDMQRIED
::.::.:..:.::..::. . ..: :. : ..:
CCDS94 LALAAANACFNPLLYYFAGENFKDRLKSALRKGHPQKAK-TKCVFPVSVWLRKETRV
300 310 320 330 340
360 370
pF1KB9 VLGSSEDSRRTESTPAGSENTKDIRL
>>CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX (370 aa)
initn: 472 init1: 238 opt: 582 Z-score: 598.6 bits: 119.4 E(32554): 5.1e-27
Smith-Waterman score: 582; 34.4% identity (64.9% similar) in 288 aa overlap (25-308:31-313)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAADLGPWNDTINGTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVLGLCLNAVA
: ...::: : . :.:: .::: :.:.
CCDS14 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LYIFLCRLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYY-YARGDHWPFSTVLCKLVRFLF
:..: :.: . .. .. .::::: :.. .::. ..: . : ::::. .:::. :
CCDS14 LFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFNR--HWPFGDTLCKISGTAF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 YTNLYCSILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLRWGRARYARRVAGA-VWVLVLACQAPVLYFV
::.: :.:::::::: : :... :.:: : :.: .. : ::.:::. . :
CCDS14 LTNIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRS-RTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 TTSARGGRVTCHDTSAPELFSRFVAYSSVMLGLL-FAVPFAVILVCYVLMARRLLKPAYG
::.. .. .:: . . .... ... .... .. : .:. . . : .. : : :::
CCDS14 TTNVNNATTTCFEGFSKRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRKPA--
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 TSGGLPRAKRKSVRTIAVVLAVFALCFLPFHVTRTLYYSFRSLDLS-CHTLNAINMAYKV
: . . :.: .. :.: .:::..::.:.. . :: :: .. : .. : .
CCDS14 TLSQIGTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYALVRSQAITNCFLERFAKIMYPI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TRPLASANSCLDPVLYFLAGQRLVRFARDAKPPTGPSPATPARCRLGLRRSDRTDMQRIE
: ::. : :.:: .:..
CCDS14 TLCLATLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEEVSD
300 310 320 330 340 350
>>CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX (337 aa)
initn: 457 init1: 321 opt: 536 Z-score: 552.5 bits: 110.8 E(32554): 1.9e-24
Smith-Waterman score: 536; 29.9% identity (62.8% similar) in 298 aa overlap (29-318:19-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAADLGPWNDTINGTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVLGLCLNAVALYIFLC
.::. . . :... :.:. :. .::...
CCDS14 MDETGNLTVSSATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGFVLYVLIK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLFYTNLYCS
. .: .::..:::.: : . .::: : ::.. : :. ::.: . .:.:::::
CCDS14 TYHKKSAFQVYMINLAVADLLCVCTLPLRVVYYVHKGIWLFGDFLCRLSTYALYVNLYCS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 ILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLRWGRARYARRVAGAVWVLVLACQAPVLYFVTTSARGGR
:.:.: .: ::.... :.... . :: : ..:..:. ..: :. . . .
CCDS14 IFFMTAMSFFRCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSPFLMAKPQKDEKNN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB9 VTCHDTSAPELFSRFVA---YSSVMLGLLFAVPFAVILVCYVLMARRLLKPAYGTSGGLP
. : . . . : : :...: : .::..:.:::... ::: .. . .
CCDS14 TKCFEPPQDNQTKNHVLVLHYVSLFVG--FIIPFVIIIVCYTMIILTLLKKSMKKNLS--
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 RAKRKSVRTIAVVLAVFALCFLPFHVTRTLYYSFRSLDLS-CHTLNAINMAYKVTRPLAS
...:.. : :: :.: . :.:.:. ::.. : . . : .. .. . .: ::.
CCDS14 -SHKKAIGMIMVVTAAFLVSFMPYHIQRTIHLHFLHNETKPCDSVLRMQKSVVITLSLAA
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 ANSCLDPVLYFLAG----QRLVRFARDAKPPTGPSPATPARCRLGLRRSDRTDMQRIEDV
.: :.::.:::..: .:: : .
CCDS14 SNCCFDPLLYFFSGGNFRKRLSTFRKHSLSSVTYVPRKKASLPEKGEEICKV
290 300 310 320 330
377 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 19:45:04 2016 done: Fri Nov 4 19:45:04 2016
Total Scan time: 2.790 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]