Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9848
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9848, 376 aa
1>>>pF1KB9848 376 - 376 aa - 376 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7591+/-0.000872; mu= 2.7820+/- 0.052
mean_var=318.5511+/-71.487, 0's: 0 Z-trim(116.6): 705 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.071860
statistics sampled from 16408 (17274) to 16408 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.828), E-opt: 0.2 (0.531), width: 16
Scan time: 3.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11520.1 SP6 gene_id:80320|Hs108|chr17 ( 376) 2728 296.0 3.6e-80
CCDS73475.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12 ( 413) 813 97.5 2.2e-20
CCDS44897.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12 ( 431) 813 97.5 2.3e-20
CCDS5372.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7 ( 490) 757 91.8 1.4e-18
CCDS43555.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7 ( 508) 757 91.8 1.4e-18
CCDS46453.1 SP9 gene_id:100131390|Hs108|chr2 ( 484) 740 90.0 4.7e-18
CCDS33322.1 SP5 gene_id:389058|Hs108|chr2 ( 398) 649 80.5 2.9e-15
CCDS46452.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2 ( 713) 596 75.3 1.9e-13
CCDS2254.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2 ( 781) 596 75.4 2e-13
CCDS44898.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12 ( 778) 584 74.1 4.7e-13
CCDS8857.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12 ( 785) 584 74.1 4.7e-13
CCDS5373.1 SP4 gene_id:6671|Hs108|chr7 ( 784) 582 73.9 5.4e-13
CCDS11521.2 SP2 gene_id:6668|Hs108|chr17 ( 613) 528 68.2 2.2e-11
>>CCDS11520.1 SP6 gene_id:80320|Hs108|chr17 (376 aa)
initn: 2728 init1: 2728 opt: 2728 Z-score: 1552.7 bits: 296.0 E(32554): 3.6e-80
Smith-Waterman score: 2728; 100.0% identity (100.0% similar) in 376 aa overlap (1-376:1-376)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MLTAVCGSLGSQHTEAPHASPPRLDLQPLQTYQGHTSPEAGDYPSPLQPGELQSLPLGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MLTAVCGSLGSQHTEAPHASPPRLDLQPLQTYQGHTSPEAGDYPSPLQPGELQSLPLGPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 VDFSQGYELPGASSRVTCEDLESDSPLAPGPFSKLLQPDMSHHYESWFRPTHPGAEDGSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VDFSQGYELPGASSRVTCEDLESDSPLAPGPFSKLLQPDMSHHYESWFRPTHPGAEDGSW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 WDLHPGTSWMDLPHTQGALTSPGHPGALQAGLGGYVGDHQLCAPPPHPHAHHLLPAAGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WDLHPGTSWMDLPHTQGALTSPGHPGALQAGLGGYVGDHQLCAPPPHPHAHHLLPAAGGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 HLLGPPDGAKALEVAAPESQGLDSSLDGAARPKGSRRSVPRSSGQTVCRCPNCLEAERLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HLLGPPDGAKALEVAAPESQGLDSSLDGAARPKGSRRSVPRSSGQTVCRCPNCLEAERLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 APCGPDGGKKKHLHNCHIPGCGKAYAKTSHLKAHLRWHSGDRPFVCNWLFCGKRFTRSDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 APCGPDGGKKKHLHNCHIPGCGKAYAKTSHLKAHLRWHSGDRPFVCNWLFCGKRFTRSDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LQRHLQTHTGTKKFPCAVCSRVFMRSDHLAKHMKTHEGAKEEAAGAASGEGKAGGAVEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LQRHLQTHTGTKKFPCAVCSRVFMRSDHLAKHMKTHEGAKEEAAGAASGEGKAGGAVEPP
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB9 GGKGKREAEGSVAPSN
::::::::::::::::
CCDS11 GGKGKREAEGSVAPSN
370
>>CCDS73475.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12 (413 aa)
initn: 700 init1: 526 opt: 813 Z-score: 479.3 bits: 97.5 E(32554): 2.2e-20
Smith-Waterman score: 857; 40.7% identity (59.0% similar) in 398 aa overlap (8-376:41-409)
10 20 30
pF1KB9 MLTAVCGSLGSQHTEAPHASPPRLDLQPLQTYQGHTS
..:. . :: .: : :.: . . ::
CCDS73 GSSPLRDSTTLGKAGTKKPYSVGSDLSASKTMGDAYP-APFTSTNGL-LSPAGSPPAPTS
20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 PEAGDYPSPLQPGELQSLPLGPEVDFSQGYELPGASSRVTCEDLESDSPLAPGPFSKLLQ
:.::: :.. .:.: :: . : .: . : : :. ...:
CCDS73 GYANDYP-PFS----HSFP-GPTGTQDPGLLVPKGHSSSDC---------LPSVYTSL--
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KB9 PDMSHHYESWFRP-TH------PGAEDGSWWDLHPGTSWMDLPH-----TQGAL-TSPGH
::.: : ::.. : :: :::.::: .:. . ::.: :.:..
CCDS73 -DMTHPYGSWYKAGIHAGISPGPGNTPTPWWDMHPGGNWLGGGQGQGDGLQGTLPTGPAQ
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 PGALQAGLGGYVGDHQLCAPPPHPHAHHLLPAAGGQHLLGPPDGAKALEVAAPESQGLDS
: :. : : .: : :.: : : : : ::.: : : : :. .: :..
CCDS73 P-PLNPQLPTYPSDFAPLNPAPYPAPHLLQP--GPQHVL-PQDVYKPKAVG--NSGQLEG
180 190 200 210 220
210 220 230 240 250
pF1KB9 SLDGAARPKGSRRSVP-----RSSGQTVCRCPNCLEAERLGAPCGPDGGKKKHLHNCHIP
: :: :.:. . ..:.. : :::: : ::::: . : .:: .:.::::
CCDS73 S-GGAKPPRGASTGGSGGYGGSGAGRSSCDCPNCQELERLGAAAA--GLRKKPIHSCHIP
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 GCGKAYAKTSHLKAHLRWHSGDRPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLQTHTGTKKFPCAVC
::::.:.:.::::::::::.:.::::::::::::::::::::.::..::: ::: : .:
CCDS73 GCGKVYGKASHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELERHVRTHTREKKFTCLLC
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360
pF1KB9 SRVFMRSDHLAKHMKTH---------EGAKEEAAGAASGEGKAGGAVEPPGGKGKREAE-
:. : :::::.::..:: : :: . : ..:: .:. . .: .. . :
CCDS73 SKRFTRSDHLSKHQRTHGEPGPGPPPSGPKELGEGRSTGEEEASQTPRPSASPATPEKAP
350 360 370 380 390 400
370
pF1KB9 -GSVAPSN
:: ::
CCDS73 GGSPEQSNLLEI
410
>>CCDS44897.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12 (431 aa)
initn: 700 init1: 526 opt: 813 Z-score: 479.1 bits: 97.5 E(32554): 2.3e-20
Smith-Waterman score: 857; 40.7% identity (59.0% similar) in 398 aa overlap (8-376:59-427)
10 20 30
pF1KB9 MLTAVCGSLGSQHTEAPHASPPRLDLQPLQTYQGHTS
..:. . :: .: : :.: . . ::
CCDS44 GSSPLRDSTTLGKAGTKKPYSVGSDLSASKTMGDAYP-APFTSTNGL-LSPAGSPPAPTS
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 PEAGDYPSPLQPGELQSLPLGPEVDFSQGYELPGASSRVTCEDLESDSPLAPGPFSKLLQ
:.::: :.. .:.: :: . : .: . : : :. ...:
CCDS44 GYANDYP-PFS----HSFP-GPTGTQDPGLLVPKGHSSSDC---------LPSVYTSL--
90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KB9 PDMSHHYESWFRP-TH------PGAEDGSWWDLHPGTSWMDLPH-----TQGAL-TSPGH
::.: : ::.. : :: :::.::: .:. . ::.: :.:..
CCDS44 -DMTHPYGSWYKAGIHAGISPGPGNTPTPWWDMHPGGNWLGGGQGQGDGLQGTLPTGPAQ
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 PGALQAGLGGYVGDHQLCAPPPHPHAHHLLPAAGGQHLLGPPDGAKALEVAAPESQGLDS
: :. : : .: : :.: : : : : ::.: : : : :. .: :..
CCDS44 P-PLNPQLPTYPSDFAPLNPAPYPAPHLLQP--GPQHVL-PQDVYKPKAVG--NSGQLEG
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250
pF1KB9 SLDGAARPKGSRRSVP-----RSSGQTVCRCPNCLEAERLGAPCGPDGGKKKHLHNCHIP
: :: :.:. . ..:.. : :::: : ::::: . : .:: .:.::::
CCDS44 S-GGAKPPRGASTGGSGGYGGSGAGRSSCDCPNCQELERLGAAAA--GLRKKPIHSCHIP
250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 GCGKAYAKTSHLKAHLRWHSGDRPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLQTHTGTKKFPCAVC
::::.:.:.::::::::::.:.::::::::::::::::::::.::..::: ::: : .:
CCDS44 GCGKVYGKASHLKAHLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELERHVRTHTREKKFTCLLC
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360
pF1KB9 SRVFMRSDHLAKHMKTH---------EGAKEEAAGAASGEGKAGGAVEPPGGKGKREAE-
:. : :::::.::..:: : :: . : ..:: .:. . .: .. . :
CCDS44 SKRFTRSDHLSKHQRTHGEPGPGPPPSGPKELGEGRSTGEEEASQTPRPSASPATPEKAP
360 370 380 390 400 410
370
pF1KB9 -GSVAPSN
:: ::
CCDS44 GGSPEQSNLLEI
420 430
>>CCDS5372.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7 (490 aa)
initn: 920 init1: 571 opt: 757 Z-score: 447.1 bits: 91.8 E(32554): 1.4e-18
Smith-Waterman score: 884; 45.0% identity (64.3% similar) in 353 aa overlap (36-356:118-458)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 CGSLGSQHTEAPHASPPRLDLQPLQTYQGHTSPEAGDYPSPLQPGEL--QSLPLGPEVDF
.:: :.:: :: .. :
CCDS53 SCGGSPGSSAFSLTSSSAAAAAAAAAAAASSSPFANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGG
90 100 110 120 130 140
70 80 90 100 110
pF1KB9 SQGYELPGASSRVTCEDLESDSPLAPGPFSKLLQPDMSHHYESWFRPTHPG----AEDGS
:... :. . : .... : . .. :.: :::::.:.::: .: ::
CCDS53 SSAHSQDGSHQPVFISKVHTSVDGLQGIYPRV---GMAHPYESWFKPSHPGLGAAGEVGS
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160
pF1KB9 -----WWDLHPGTSWMDLPHTQGALTSPG--HP--GALQAGL----GGYVGDHQ---LCA
:::. :..:.:. . ..: . :: :: :.::..: ::: .:.. :
CCDS53 AGASSWWDV--GAGWIDVQNPNSAAALPGSLHPAAGGLQTSLHSPLGGYNSDYSGLSHSA
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210
pF1KB9 PPPHPHAHHLLPAAGGQHLLGPPDGAK-ALEVAAPESQ-----GLDSSL--DGAARPKGS
.: : :: ::::. :: : .: . :.: : .:. : . : :.
CCDS53 FSSGASSHLLSPA--GQHLM---DGFKPVLPGSYPDSAPSPLAGAGGSMLSAGPSAPLGG
270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 --RRSVPRSSGQTVCRCPNCLEAERLGAPCGPDGGKKKHLHNCHIPGCGKAYAKTSHLKA
: :. : ::...: :::: :::::: : : . ..: ::.::::::::.:.:::::::
CCDS53 SPRSSARRYSGRATCDCPNCQEAERLG-PAGASL-RRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKA
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 HLRWHSGDRPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLQTHTGTKKFPCAVCSRVFMRSDHLAKHM
:::::.:.::::::::::::::::::::::::.:::: :.: : ::.. :::::::.::.
CCDS53 HLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHV
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370
pF1KB9 KTHEGAKEEAAGAASGEGKAGGAVEPPGGKGKREAEGSVAPSN
::: :. ...:.:: : :.
CCDS53 KTHSGGGGGGGSAGSGSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE
440 450 460 470 480 490
>>CCDS43555.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7 (508 aa)
initn: 920 init1: 571 opt: 757 Z-score: 446.9 bits: 91.8 E(32554): 1.4e-18
Smith-Waterman score: 884; 45.0% identity (64.3% similar) in 353 aa overlap (36-356:136-476)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 CGSLGSQHTEAPHASPPRLDLQPLQTYQGHTSPEAGDYPSPLQPGEL--QSLPLGPEVDF
.:: :.:: :: .. :
CCDS43 SCGGSPGSSAFSLTSSSAAAAAAAAAAAASSSPFANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGG
110 120 130 140 150 160
70 80 90 100 110
pF1KB9 SQGYELPGASSRVTCEDLESDSPLAPGPFSKLLQPDMSHHYESWFRPTHPG----AEDGS
:... :. . : .... : . .. :.: :::::.:.::: .: ::
CCDS43 SSAHSQDGSHQPVFISKVHTSVDGLQGIYPRV---GMAHPYESWFKPSHPGLGAAGEVGS
170 180 190 200 210 220
120 130 140 150 160
pF1KB9 -----WWDLHPGTSWMDLPHTQGALTSPG--HP--GALQAGL----GGYVGDHQ---LCA
:::. :..:.:. . ..: . :: :: :.::..: ::: .:.. :
CCDS43 AGASSWWDV--GAGWIDVQNPNSAAALPGSLHPAAGGLQTSLHSPLGGYNSDYSGLSHSA
230 240 250 260 270 280
170 180 190 200 210
pF1KB9 PPPHPHAHHLLPAAGGQHLLGPPDGAK-ALEVAAPESQ-----GLDSSL--DGAARPKGS
.: : :: ::::. :: : .: . :.: : .:. : . : :.
CCDS43 FSSGASSHLLSPA--GQHLM---DGFKPVLPGSYPDSAPSPLAGAGGSMLSAGPSAPLGG
290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 --RRSVPRSSGQTVCRCPNCLEAERLGAPCGPDGGKKKHLHNCHIPGCGKAYAKTSHLKA
: :. : ::...: :::: :::::: : : . ..: ::.::::::::.:.:::::::
CCDS43 SPRSSARRYSGRATCDCPNCQEAERLG-PAGASL-RRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKA
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 HLRWHSGDRPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLQTHTGTKKFPCAVCSRVFMRSDHLAKHM
:::::.:.::::::::::::::::::::::::.:::: :.: : ::.. :::::::.::.
CCDS43 HLRWHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHV
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370
pF1KB9 KTHEGAKEEAAGAASGEGKAGGAVEPPGGKGKREAEGSVAPSN
::: :. ...:.:: : :.
CCDS43 KTHSGGGGGGGSAGSGSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE
460 470 480 490 500
>>CCDS46453.1 SP9 gene_id:100131390|Hs108|chr2 (484 aa)
initn: 920 init1: 556 opt: 740 Z-score: 437.7 bits: 90.0 E(32554): 4.7e-18
Smith-Waterman score: 811; 49.3% identity (64.9% similar) in 282 aa overlap (100-348:151-426)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PGASSRVTCEDLESDSPLAPGPFSKLLQPDMSHHYESWFRPT-HPGAEDG--------SW
:.: ::::.. : : ::
CCDS46 GVSPQEAGGQSAFISKVHTTAADGLYPRVGMAHPYESWYKSGFHSTLAAGEVTNGAASSW
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160
pF1KB9 WDLH--PGTSWMDLPHTQGALTSPGHPGALQAGL----GGYVGD-----HQLCAPP----
::.: :: ::... . :.: : : :: ::.: : : : :. .
CCDS46 WDVHSSPG-SWLEVQNPAGGLQSSLHSGAPQASLHSQLGTYNPDFSSLTHSAFSSTGLGS
190 200 210 220 230
170 180 190 200 210
pF1KB9 PHPHAHHLLPAAGGQHLLGPPDGAKAL---------EVAAPESQGLDSSLDGAARPKGSR
: ::: .. ::::. :: : . ::: .... :. .:: .:
CCDS46 SAAAASHLLSTS--QHLLAQ-DGFKPVLPSYSDSSAAVAAAAASAMISGAAAAAAGGSSA
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 RSVPRSSGQTVCRCPNCLEAERLGAPCGPDGGKKKHLHNCHIPGCGKAYAKTSHLKAHLR
::. : ::...: :::: :::::: : : . ..: ::.::::::::.:.::::::::::
CCDS46 RSARRYSGRATCDCPNCQEAERLG-PAGASL-RRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLR
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 WHSGDRPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLQTHTGTKKFPCAVCSRVFMRSDHLAKHMKTH
::.:.::::::::::::::::::::::::.:::: :.: : ::.. :::::::.::.:::
CCDS46 WHTGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHIKTH
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370
pF1KB9 EGAKEEAAGAASGEGKAGGAVEPPGGKGKREAEGSVAPSN
.:. :. :
CCDS46 NGGGGGKKGSDSDTDASNLETPRSESPDLILHDSGVSAARAAAAAAAAAAAAAAAASAGG
420 430 440 450 460 470
>>CCDS33322.1 SP5 gene_id:389058|Hs108|chr2 (398 aa)
initn: 872 init1: 546 opt: 649 Z-score: 387.6 bits: 80.5 E(32554): 2.9e-15
Smith-Waterman score: 722; 39.8% identity (55.6% similar) in 392 aa overlap (1-346:35-388)
10
pF1KB9 MLTAVCGSLGSQHTEAPH-----------A
.:.:.:. .:. . :: .
CCDS33 AVLRNDSLQAFLQDRTPSASPDLGKHSPLALLAATCSRIGQPGAAAPPDFLQVPYDPALG
10 20 30 40 50 60
20 30 40 50 60
pF1KB9 SPPRLDLQPLQTYQGHTSPEAGDYPSP----------LQP--GELQSLPLGPEVDFSQGY
:: :: ..: . . :: : : : ::: : . ::: : .: : :
CCDS33 SPSRL-FHPWTADMPAHSPGALPPPHPSLGLTPQKTHLQPSFGAAHELPLTPPADPSYPY
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110
pF1KB9 E------LPG--ASSRVTCED----LESDSPLAPGPFSKLLQPDMSHHYESWFRPT--HP
: ::. :. ..: ... : :: .:.:: : : .:
CCDS33 EFSPVKMLPSSMAALPASCAPAYVPYAAQAALPPG-YSNLLPPPPPPPPPPTCRQLSPNP
130 140 150 160 170 180
120 130 140 150 160
pF1KB9 GAEDGSWWDLHPGTSWMDLPHTQGALTSPGHPGALQAGLGGYVGDHQLCAPPPH-PH---
. .: ::.. :.. :: .:: :. .::.: :: :: :.
CCDS33 APDDLPWWSI---------PQA-GA--GPGASGVPGSGLSGA------CAGAPHAPRFPA
190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 --AHHLLPAAGGQH--LLGPPDGAKAL-EVAAPESQGLDSSLDGAARPKGSRRSVPRSSG
: ::. :. .::: : :. ..:: :... :: . ::
CCDS33 SAAAAAAAAAALQRGLVLGPSDFAQYQSQIAAL----LQTKAPLAATARRCRR-------
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230 240 250 260 270 280
pF1KB9 QTVCRCPNCLEAERLGAPCGPDGGKKKHLHNCHIPGCGKAYAKTSHLKAHLRWHSGDRPF
:::::: : ::: . : ::.:. ::.:::::.:.::::::::::::.:.:::
CCDS33 ---CRCPNCQAAG--GAPEAEPGKKKQHV--CHVPGCGKVYGKTSHLKAHLRWHTGERPF
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290 300 310 320 330 340
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CCDS33 VCNWLFCGKSFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPECGKRFMRSDHLAKHVKTHQNKKLKVA
330 340 350 360 370 380
350 360 370
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:
CCDS33 EAGVKREDARDL
390
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200 210 220 230 240 250
pF1KB9 AAPESQGLDSSLDGAARPKGSRRSVPRSSGQTVCRCPNCLEAERLGAPCGPDGGKKKHLH
...: :::: : :. : . ::::. :
CCDS22 TLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVACTCPNCKE----GGGRGTNLGKKKQ-H
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pF1KB9 NCHIPGCGKAYAKTSHLKAHLRWHSGDRPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLQTHTGTKKF
::::::::.:.:::::.::::::::.:::::::..:::::::::::::: .:::: :::
CCDS22 ICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMYCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKF
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pF1KB9 PCAVCSRVFMRSDHLAKHMKTHEGAKEEAAGAASGEGKAGGAVEPPGGKGKREAEGSVAP
: ::. ::::::::::.:::.. :
CCDS22 VCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTLILANIQ
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10 20 30
pF1KB9 MLTAVCGSLGSQHTEAPHASPPRLDLQPLQTYQG
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CCDS44 TTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVSGLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEG
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40 50 60 70 80
pF1KB9 HTSPEAGDYPSPLQPGELQSLPLGPEVDFSQGYELPG------ASSRVTCEDLESDSPLA
. . .. . .:: .:. : .. :. : : : :. : ..:. ..
CCDS44 EQNQQTQQQQILIQPQLVQG---GQALQALQAAPLSGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPN
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pF1KB9 PGPFSKLLQPDMSHHYE-SW-------FRPTHPGAEDGSWWDLHPGTSWMDLPHTQGALT
::. . : .. . . :: .. .: :. . .. :.: . .. .::
CCDS44 SGPII-IRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQTITLAPMQ-GVSLGQTSSSNTTLT
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pF1KB9 SPGHPGALQAGLGGYVGDHQLCAPPPHPHAHHLLPAAGGQHLLGPPDGAKALEVA-APES
. ... :: :. :: . : . : : : . . : . : .: :: .
CCDS44 PIASAASIPAGTVT-VNAAQLSSMPGLQTIN--LSALGTSGIQVHPIQGLPLAIANAPGD
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pF1KB9 QGLDSSLDGAA------------RPKGSRRSVPRSSGQT---VCRCPNCLEAERLGAPCG
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CCDS44 HGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRTRREACTCPYCKDSE--GRGSG
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CCDS44 -DPGKKKQ-HICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTWSYCGKRFTRSDELQRH
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pF1KB9 KREAEGSVAPSN
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CCDS44 S-EGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINISGNGF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]