Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9776
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9776, 716 aa
1>>>pF1KB9776 716 - 716 aa - 716 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6570+/-0.00107; mu= -1.9000+/- 0.065
mean_var=362.5115+/-72.016, 0's: 0 Z-trim(115.3): 17 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.067362
statistics sampled from 15897 (15905) to 15897 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.782), E-opt: 0.2 (0.489), width: 16
Scan time: 4.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3253.1 DVL3 gene_id:1857|Hs108|chr3 ( 716) 4903 490.7 3.2e-138
CCDS11091.1 DVL2 gene_id:1856|Hs108|chr17 ( 736) 3228 327.9 3.3e-89
CCDS81252.1 DVL1 gene_id:1855|Hs108|chr1 ( 695) 2869 293.0 1e-78
CCDS22.1 DVL1 gene_id:1855|Hs108|chr1 ( 670) 1868 195.7 1.9e-49
>>CCDS3253.1 DVL3 gene_id:1857|Hs108|chr3 (716 aa)
initn: 4903 init1: 4903 opt: 4903 Z-score: 2594.9 bits: 490.7 E(32554): 3.2e-138
Smith-Waterman score: 4903; 100.0% identity (100.0% similar) in 716 aa overlap (1-716:1-716)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGETKIIYHLDGQETPYLVKLPLPAERVTLADFKGVLQRPSYKFFFKSMDDDFGVVKEEI
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CCDS32 MGETKIIYHLDGQETPYLVKLPLPAERVTLADFKGVLQRPSYKFFFKSMDDDFGVVKEEI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SDDNAKLPCFNGRVVSWLVSAEGSHPDPAPFCADNPSELPPPMERTGGIGDSRPPSFHPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SDDNAKLPCFNGRVVSWLVSAEGSHPDPAPFCADNPSELPPPMERTGGIGDSRPPSFHPH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 AGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHATRLNGTAKGERRREPGGYDSSSTLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHATRLNGTAKGERRREPGGYDSSSTLM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHKRRRRKQKVSRIERSSSFSSITD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHKRRRRKQKVSRIERSSSFSSITD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 STMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 QVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWDPSPRGCFTLPRSEPIRPIDPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWDPSPRGCFTLPRSEPIRPIDPAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 WVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSITSSIPDTERLDDFHLSIHSDMAAIVKAMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSITSSIPDTERLDDFHLSIHSDMAAIVKAMA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 SPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDRREARKYASNLLKAGFIRHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDRREARKYASNLLKAGFIRHT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 VNKITFSEQCYYIFGDLCGNMANLSLHDHDGSSGASDQDTLAPLPHPGAAPWPMAFPYQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VNKITFSEQCYYIFGDLCGNMANLSLHDHDGSSGASDQDTLAPLPHPGAAPWPMAFPYQY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 PPPPHPYNPHPGFPELGYSYGGGSASSQHSEGSRSSGSNRSGSDRRKEKDPKAGDSKSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPPPHPYNPHPGFPELGYSYGGGSASSQHSEGSRSSGSNRSGSDRRKEKDPKAGDSKSGG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 SGSESDHTTRSSLRGPRERAPSERSGPAASEHSHRSHHSLASSLRSHHTHPSYGPPGVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SGSESDHTTRSSLRGPRERAPSERSGPAASEHSHRSHHSLASSLRSHHTHPSYGPPGVPP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB9 LYGPPMLMMPPPPAAMGPPGAPPGRDLASVPPELTASRQSFRMAMGNPSEFFVDVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LYGPPMLMMPPPPAAMGPPGAPPGRDLASVPPELTASRQSFRMAMGNPSEFFVDVM
670 680 690 700 710
>>CCDS11091.1 DVL2 gene_id:1856|Hs108|chr17 (736 aa)
initn: 1746 init1: 1138 opt: 3228 Z-score: 1715.0 bits: 327.9 E(32554): 3.3e-89
Smith-Waterman score: 3228; 69.3% identity (84.2% similar) in 745 aa overlap (1-716:11-736)
10 20 30 40
pF1KB9 MGETKIIYHLDGQETPYLVKLPLPAERVTLADFKGVLQRPS-YKFFFKSM
.::::.::::: .:::::::.:.::::.::.:::.:::::. :.:::::
CCDS11 MAGSSTGGGGVGETKVIYHLDEEETPYLVKIPVPAERITLGDFKSVLQRPAGAKYFFKSM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 DDDFGVVKEEISDDNAKLPCFNGRVVSWLVSAEGSHPDPAPFCADNPSELPPPM------
:.::::::::::::::.::::::::::::::... .:. :: . .:: ::
CCDS11 DQDFGVVKEEISDDNARLPCFNGRVVSWLVSSDNPQPEMAPPVHEPRAELAPPAPPLPPL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KB9 --ERTGGIGDSRPPSFHPHAGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHAT---RL
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CCDS11 PPERTSGIGDSRPPSFHPNVSS-SHENLEPETETESVVSLRRERPRRRDSSEHGAGGHRT
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 NGTAKGERRREPGGYDSSSTLMSSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHK
.: .. ::. .::.::::::.::::.::. ::::.:. :::::::::::::::..::
CCDS11 GGPSRLERHL--AGYESSSTLMTSELESTSLGDSDEEDTMSRFSSSTEQSSASRLLKRH-
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 RRRRKQKVSRIERSSSFSSITDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYI
::::::. :.::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RRRRKQRPPRLERTSSFSSVTDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYI
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWD
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CCDS11 GSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNDMNFENMSNDDAVRVLRDIVHKPGPIVLTVAKCWD
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 PSPRGCFTLPRSEPIRPIDPAAWVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSITSSIPDT
:::.. :::::.:::.::::::::::.::.::::::: : :.::::: ::.::
CCDS11 PSPQAYFTLPRNEPIQPIDPAAWVSHSAALTGTFPAYPGSSSMSTITS-----GSSLPDG
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 ERLDDFHLSIHSDMAAIVKAMASPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGF
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CCDS11 --CEGRGLSVHTDMASVTKAMAAPESGLEVRDRMWLKITIPNAFLGSDVVDWLYHHVEGF
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 TDRREARKYASNLLKAGFIRHTVNKITFSEQCYYIFGDLCGN----MANLSLHDHDGSSG
.:::::::::.:::::.::::::::::::::::.:::: :. ..::::.:.:::::
CCDS11 PERREARKYASGLLKAGLIRHTVNKITFSEQCYYVFGDLSGGCESYLVNLSLNDNDGSSG
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 ASDQDTLAPLPHPGAAPWPM--AFPYQYPPPPHPYNPHPG-FPELG-YSYGGGSASSQHS
::::::::::: ::.:::. .: :::: : :::.:.: . ::. :.:::::::::::
CCDS11 ASDQDTLAPLP--GATPWPLLPTFSYQYPAP-HPYSPQPPPYHELSSYTYGGGSASSQHS
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620
pF1KB9 EGSRSSGSNRS--GSDRRKEKDPKAGDSKSGGSGSESDHTTRS-SLRGPRERAPSERSGP
::::::::.:: :. : . . .: .:::: :::::. ..:. ::: : . . .::
CCDS11 EGSRSSGSTRSDGGAGRTGRPEERAPESKSG-SGSESEPSSRGGSLRRGGEASGTSDGGP
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KB9 AASEHSHRSHHSLASSLRSHH-THPSYGPPGVPPLYGPPML-MMPPPPA----AMGPPGA
: :. . : .::.: :: :::. :.: :. :::::: :. ::::
CCDS11 PPS----RGSTGGAPNLRAHPGLHPYGPPPGMALPYNPMMVVMMPPPPPPVPPAVQPPGA
650 660 670 680 690 700
690 700 710
pF1KB9 PPGRDLASVPPELTASRQSFRMAMGNPSEFFVDVM
:: :::.:::::::::::::.::::::::::::::
CCDS11 PPVRDLGSVPPELTASRQSFHMAMGNPSEFFVDVM
710 720 730
>>CCDS81252.1 DVL1 gene_id:1855|Hs108|chr1 (695 aa)
initn: 1957 init1: 1240 opt: 2869 Z-score: 1526.8 bits: 293.0 E(32554): 1e-78
Smith-Waterman score: 3038; 65.7% identity (83.6% similar) in 726 aa overlap (1-716:1-695)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGETKIIYHLDGQETPYLVKLPLPAERVTLADFKGVLQ-RP--SYKFFFKSMDDDFGVVK
:.:::::::.: .:::::::::. :::::::::.::. :: .:::::::::.::::::
CCDS81 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFKSMDQDFGVVK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 EEISDDNAKLPCFNGRVVSWLVSAEGSHPDPAPFCADNPSELPPPMERTGGIGDSRPPSF
::: :::::::::::::::::: :::.: : . .:. ..::::.::::::::::::::
CCDS81 EEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPLERTGGIGDSRPPSF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 HPHAGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHATRLNGTAKGERRREPG-GYDSS
::.... :....::.: :.:.:: .::: :::. :.:.: :: .:.:::. : ::.
CCDS81 HPNVAS-SRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNR-EEAARTNGHPRGDRRRDVGLPPDSA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 STLMSSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHKRRRRKQKVSRIERSSSFS
:: .:::::..:: ::::: ::::.:::::::..:::.:.::::::::.. . .:.::::
CCDS81 STALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRKHKRRRRKQRLRQADRASSFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 SITDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPG
:::::::::::.:::::::...:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SITDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 DMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWDPSPRGCFTLPRSEPIRPI
:::::::..:::::::::::::::::: . :::.:::::::::.::. ::.::..:.:::
CCDS81 DMLLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKCWDPTPRSYFTVPRADPVRPI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 DPAAWVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSS-ITSSIPDTERLDDFHLSIHSDMAAI
:::::.:::::.::..: :: :: :..: :::: .:::.: . .:.. :...:::.:.
CCDS81 DPAAWLSHTAALTGALPRYGTSPCSSAVTRTSSSSLTSSVPGAPQLEEAPLTVKSDMSAV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 VKAMASPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDRREARKYASNLLKAG
:..: :.::::.:::::::::: :: ::.::::::: .:::: .:::::::::.::: :
CCDS81 VRVMQLPDSGLEIRDRMWLKITIANAVIGADVVDWLYTHVEGFKERREARKYASSLLKHG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 FIRHTVNKITFSEQCYYIFGDLCGNMANLSLHDHDGSSGASDQDTLAPLPHPGAAPWPMA
:.:::::::::::::::.:::::.:.:.:.:.. ::::.:::::::::::: :::::..
CCDS81 FLRHTVNKITFSEQCYYVFGDLCSNLATLNLNS--GSSGTSDQDTLAPLPHP-AAPWPLG
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 --FPYQYPPPPHPYNPHPGFPELGYSYGGGSASSQHSEGSRSSGSNRSGSDRR---KEKD
.::::: :: : : :.. . :.:::.::..::.::::.::::.:: .:: .::.
CCDS81 QGYPYQYPGPP-PCFP-PAYQDPGFSYGSGSTGSQQSEGSKSSGSTRS--SRRAPGREKE
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 PKAGDSKSGGSGSESDHTTRSSLRGPRERAPSERSGPAASEHSHRSHHSLASSLRSHHTH
.:. .:::::::::: .: . : : ::. . : .:: ::.
CCDS81 RRAAG--AGGSGSESDHT------APSGVGSSWRERPAG-------QLSRGSSPRSQ---
600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 PSYGPPGVPPLYGPPMLMMPPPPAAMGPPGAPPGRDLASVPPELTASRQSFRMAMGNPSE
: ::.:: : .. ::::.:: :.::.::::::.:::::. ::::: :
CCDS81 ASATAPGLPP----PHPTTKAYTVVGGPPGGPPVRELAAVPPELTGSRQSFQKAMGNPCE
640 650 660 670 680
pF1KB9 FFVDVM
::::.:
CCDS81 FFVDIM
690
>>CCDS22.1 DVL1 gene_id:1855|Hs108|chr1 (670 aa)
initn: 2050 init1: 1198 opt: 1868 Z-score: 1001.3 bits: 195.7 E(32554): 1.9e-49
Smith-Waterman score: 2911; 64.0% identity (81.2% similar) in 725 aa overlap (1-716:1-670)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGETKIIYHLDGQETPYLVKLPLPAERVTLADFKGVLQ-RP--SYKFFFKSMDDDFGVVK
:.:::::::.: .:::::::::. :::::::::.::. :: .:::::::::.::::::
CCDS22 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFKSMDQDFGVVK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 EEISDDNAKLPCFNGRVVSWLVSAEGSHPDPAPFCADNPSELPPPMERTGGIGDSRPPSF
::: :::::::::::::::::: :::.: : . .:. ..::::.::::::::::::::
CCDS22 EEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPLERTGGIGDSRPPSF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 HPHAGGGSQENLDNDTETDSLVSAQRERPRRRDGPEHATRLNGTAKGERRREPG-GYDSS
::.... :....::.: :.:.:: .::: :::. :.:.: :: .:.:::. : ::.
CCDS22 HPNVAS-SRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNR-EEAARTNGHPRGDRRRDVGLPPDSA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 STLMSSELETTSFFDSDEDDSTSRFSSSTEQSSASRLMRRHKRRRRKQKVSRIERSSSFS
:: .:::::..:: ::::: ::::.:::::::..:::.:.::::::::.. . .:.::::
CCDS22 STALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRKHKRRRRKQRLRQADRASSFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 SITDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPG
:::::::::::.:::::::...:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SITDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 DMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITLTVAKCWDPSPRGCFTLPRSEPIRPI
:::::::..:::::::::::::::::: . :::.:::::::::.::. ::.::..:.:::
CCDS22 DMLLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKCWDPTPRSYFTVPRADPVRPI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 DPAAWVSHTAAMTGTFPAYGMSPSLSTITSTSSSITSSIPDTERLDDFHLSIHSDMAAIV
:::::.:::::.::..: : .:.. :...:::.:.:
CCDS22 DPAAWLSHTAALTGALPRY------------------------ELEEAPLTVKSDMSAVV
360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 KAMASPESGLEVRDRMWLKITIPNAFIGSDVVDWLYHNVEGFTDRREARKYASNLLKAGF
..: :.::::.:::::::::: :: ::.::::::: .:::: .:::::::::.::: ::
CCDS22 RVMQLPDSGLEIRDRMWLKITIANAVIGADVVDWLYTHVEGFKERREARKYASSLLKHGF
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 IRHTVNKITFSEQCYYIFGDLCGNMANLSLHDHDGSSGASDQDTLAPLPHPGAAPWPMA-
.:::::::::::::::.:::::.:.:.:.:.. ::::.:::::::::::: :::::..
CCDS22 LRHTVNKITFSEQCYYVFGDLCSNLATLNLNS--GSSGTSDQDTLAPLPHP-AAPWPLGQ
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 -FPYQYPPPPHPYNPHPGFPELGYSYGGGSASSQHSEGSRSSGSNRSGSDRR---KEKDP
.::::: :: : : :.. . :.:::.::..::.::::.::::.:: .:: .::.
CCDS22 GYPYQYPGPP-PCFP-PAYQDPGFSYGSGSTGSQQSEGSKSSGSTRS--SRRAPGREKER
520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 KAGDSKSGGSGSESDHTTRSSLRGPRERAPSERSGPAASEHSHRSHHSLASSLRSHHTHP
.:. .:::::::::: .: . : : ::. . : .:: ::.
CCDS22 RAAG--AGGSGSESDHT------APSGVGSSWRERPAG-------QLSRGSSPRSQ---A
570 580 590 600
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 SYGPPGVPPLYGPPMLMMPPPPAAMGPPGAPPGRDLASVPPELTASRQSFRMAMGNPSEF
: ::.:: : .. ::::.:: :.::.::::::.:::::. ::::: ::
CCDS22 SATAPGLPP----PHPTTKAYTVVGGPPGGPPVRELAAVPPELTGSRQSFQKAMGNPCEF
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 FVDVM
:::.:
CCDS22 FVDIM
670
716 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 18:49:27 2016 done: Fri Nov 4 18:49:28 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]