FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9772, 549 aa
1>>>pF1KB9772 549 - 549 aa - 549 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9195+/-0.00193; mu= 12.3755+/- 0.114
mean_var=248.2506+/-48.988, 0's: 0 Z-trim(103.4): 965 B-trim: 5 in 1/49
Lambda= 0.081401
statistics sampled from 6384 (7413) to 6384 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.542), E-opt: 0.2 (0.228), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12213.1 ZNF266 gene_id:10781|Hs108|chr19 ( 549) 3874 469.5 4.4e-132
CCDS74279.1 ZNF426 gene_id:79088|Hs108|chr19 ( 516) 2060 256.5 5.8e-68
CCDS12215.1 ZNF426 gene_id:79088|Hs108|chr19 ( 554) 2060 256.5 6e-68
CCDS73928.1 ZNF778 gene_id:197320|Hs108|chr16 ( 757) 2020 252.0 1.9e-66
CCDS12214.1 ZNF560 gene_id:147741|Hs108|chr19 ( 790) 1934 241.9 2.1e-63
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CCDS32902.1 ZNF121 gene_id:7675|Hs108|chr19 ( 390) 1720 216.4 5.1e-56
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1724 217.5 6.6e-56
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1712 215.8 1.4e-55
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1711 215.7 1.5e-55
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 1710 215.5 1.5e-55
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1703 214.7 2.7e-55
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1703 214.7 2.8e-55
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1703 214.7 2.8e-55
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CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1699 214.4 4.4e-55
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1691 213.1 6.2e-55
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1683 212.5 1.5e-54
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1683 212.5 1.6e-54
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1681 212.2 1.8e-54
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1681 212.2 1.9e-54
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CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1676 211.4 2.2e-54
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1676 211.6 2.5e-54
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CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1656 209.2 1.3e-53
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1644 207.7 3.1e-53
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 1645 207.9 3.2e-53
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1644 207.8 3.3e-53
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1647 208.4 3.4e-53
CCDS77240.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 638) 1643 207.6 3.6e-53
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1647 208.5 3.6e-53
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1647 208.5 3.7e-53
CCDS45983.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 673) 1643 207.7 3.7e-53
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1642 207.5 3.9e-53
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1642 207.5 3.9e-53
CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 1643 207.8 4.2e-53
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1635 206.5 5.7e-53
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1637 207.0 6e-53
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 1636 206.9 6.6e-53
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1633 206.4 7.3e-53
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1634 206.7 8.5e-53
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1634 206.7 8.7e-53
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1635 207.0 9.1e-53
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1626 205.7 1.6e-52
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1621 205.0 2.1e-52
>>CCDS12213.1 ZNF266 gene_id:10781|Hs108|chr19 (549 aa)
initn: 3874 init1: 3874 opt: 3874 Z-score: 2484.7 bits: 469.5 E(32554): 4.4e-132
Smith-Waterman score: 3874; 100.0% identity (100.0% similar) in 549 aa overlap (1-549:1-549)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MLENYKNLATVGYQLFKPSLISWLEQEESRTVQRGDFQASEWKVQLKTKELALQQDVLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLENYKNLATVGYQLFKPSLISWLEQEESRTVQRGDFQASEWKVQLKTKELALQQDVLGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PTSSGIQMIGSHNGGEVSDVKQCGDVSSEHSCLKTHVRTQNSENTFECYLYGVDFLTLHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PTSSGIQMIGSHNGGEVSDVKQCGDVSSEHSCLKTHVRTQNSENTFECYLYGVDFLTLHK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KTSTGEQRSVFSQCGKAFSLNPDVVCQRTCTGEKAFDCSDSGKSFINHSHLQGHLRTHNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KTSTGEQRSVFSQCGKAFSLNPDVVCQRTCTGEKAFDCSDSGKSFINHSHLQGHLRTHNG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ESLHEWKECGRGFIHSTDLAVRIQTHRSEKPYKCKECGKGFRYSAYLNIHMGTHTGDNPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ESLHEWKECGRGFIHSTDLAVRIQTHRSEKPYKCKECGKGFRYSAYLNIHMGTHTGDNPY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ECKECGKAFTRSCQLTQHRKTHTGEKPYKCKDCGRAFTVSSCLSQHMKIHVGEKPYECKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ECKECGKAFTRSCQLTQHRKTHTGEKPYKCKDCGRAFTVSSCLSQHMKIHVGEKPYECKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 CGIAFTRSSQLTEHLKTHTAKDPFECKICGKSFRNSSCLSDHFRIHTGIKPYKCKDCGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CGIAFTRSSQLTEHLKTHTAKDPFECKICGKSFRNSSCLSDHFRIHTGIKPYKCKDCGKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 FTQNSDLTKHARTHSGERPYECKECGKAFARSSRLSEHTRTHTGEKPFECVKCGKAFAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FTQNSDLTKHARTHSGERPYECKECGKAFARSSRLSEHTRTHTGEKPFECVKCGKAFAIS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 SNLSGHLRIHTGEKPFECLECGKAFTHSSSLNNHMRTHSAKKPFTCMECGKAFKFPTCVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SNLSGHLRIHTGEKPFECLECGKAFTHSSSLNNHMRTHSAKKPFTCMECGKAFKFPTCVN
430 440 450 460 470 480
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pF1KB9 LHMRIHTGEKPYKCKQCGKSFSYSNSFQLHERTHTGEKPYECKECGKAFSSSSSFRNHER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LHMRIHTGEKPYKCKQCGKSFSYSNSFQLHERTHTGEKPYECKECGKAFSSSSSFRNHER
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 RHADERLSA
:::::::::
CCDS12 RHADERLSA
>>CCDS74279.1 ZNF426 gene_id:79088|Hs108|chr19 (516 aa)
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Smith-Waterman score: 2060; 61.1% identity (79.4% similar) in 486 aa overlap (1-486:33-516)
10 20 30
pF1KB9 MLENYKNLATVGYQLFKPSLISWLEQEESR
:::::::::::: :..::::::::::::::
CCDS74 SVTFDDVAVDFTQEEWTLLDSTQRSLYSDVMLENYKNLATVGGQIIKPSLISWLEQEESR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 TVQRGDFQASEWKVQLKTKELALQQDVLGEPTSSGIQMIGSHNGGEVSDVKQCGDVSSEH
::: : .:. :...:.:. :::: : :: :::. :.::: :. : .:::.: :::
CCDS74 TVQGGVLQG--WEMRLETQWSILQQDFLRGQTSIGIQLEGKHNGRELCDCEQCGEVFSEH
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 SCLKTHVRTQNSENTFECYLYGVDFLTLHKKTSTGEQRSVFSQCGKAFSLNPDVVCQRTC
::::::::::.. :: .: :: ::::: .::::::. : :.: : :::.:..: :::
CCDS74 SCLKTHVRTQSTGNTHDCNQYGKDFLTLCEKTSTGEKLSEFNQSEKIFSLTPNIVYQRTS
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160 170 180 190 200 210
pF1KB9 TGEKAFDCSDSGKSFINHSHLQGHLRTHNGESLHEWKECGRGFIHSTDLAVRIQTHRSEK
: ::.:.:: ::::::.:.::.:.::::::.:.::.. : ::: ::.:.: :.: ..:
CCDS74 TQEKSFECSHCGKSFINESYLQAHMRTHNGEKLYEWRNYGPGFIDSTSLSVLIETLNAKK
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220 230 240 250 260 270
pF1KB9 PYKCKECGKGFRYSAYLNIHMGTHTGDNPYECKECGKAFTRSCQLTQHRKTHTGEKPYKC
::::::::::.:: :::.::: ::::..:::::::::::. : .. : .:::::::: :
CCDS74 PYKCKECGKGYRYPAYLSIHMRTHTGEKPYECKECGKAFNYSNSFQIHGRTHTGEKPYVC
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280 290 300 310 320 330
pF1KB9 KDCGRAFTVSSCLSQHMKIHVGEKPYECKECGIAFTRSSQLTEHLKTHTAKDPFECKICG
:.::.::: : ::.:.. : :.::::::::: .: ::.: .:..:::.. :: : ::
CCDS74 KECGKAFTQYSGLSMHVRSHSGDKPYECKECGKSFLTSSRLIQHIRTHTGEKPFVCVECG
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340 350 360 370 380 390
pF1KB9 KSFRNSSCLSDHFRIHTGIKPYKCKDCGKAFTQNSDLTKHARTHSGERPYECKECGKAFA
:.: :: :: :.: :: : .:: :::.: : :..: ::::...:: ::::::::
CCDS74 KAFAVSSNLSGHLRTHTEEKACECKICGKVFGYPSCLNNHMRTHSAQKPYTCKECGKAFN
370 380 390 400 410 420
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pF1KB9 RSSRLSEHTRTHTGEKPFECVKCGKAFAISSNLSGHLRIHTGEKPFECLECGKAFTHSSS
:..:. : : ::::::.:: .:::::. ::... : : ::::::.:: ::::::: :::
CCDS74 YSTHLKIHMRIHTGEKPYECKQCGKAFSHSSSFQIHERTHTGEKPYECKECGKAFTCSSS
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pF1KB9 LNNHMRTHSAKKPFTCMECGKAFKFPTCVNLHMRIHTGEKPYKCKQCGKSFSYSNSFQLH
. : .::. .::. :..::::.. : . : .::
CCDS74 FRIHEKTHTEEKPYKCQQCGKAYSHPRSLRRHEQIH
490 500 510
520 530 540
pF1KB9 ERTHTGEKPYECKECGKAFSSSSSFRNHERRHADERLSA
>>CCDS12215.1 ZNF426 gene_id:79088|Hs108|chr19 (554 aa)
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Smith-Waterman score: 2060; 61.1% identity (79.4% similar) in 486 aa overlap (1-486:71-554)
10 20 30
pF1KB9 MLENYKNLATVGYQLFKPSLISWLEQEESR
:::::::::::: :..::::::::::::::
CCDS12 SVTFDDVAVDFTQEEWTLLDSTQRSLYSDVMLENYKNLATVGGQIIKPSLISWLEQEESR
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pF1KB9 TVQRGDFQASEWKVQLKTKELALQQDVLGEPTSSGIQMIGSHNGGEVSDVKQCGDVSSEH
::: : .:. :...:.:. :::: : :: :::. :.::: :. : .:::.: :::
CCDS12 TVQGGVLQG--WEMRLETQWSILQQDFLRGQTSIGIQLEGKHNGRELCDCEQCGEVFSEH
110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 SCLKTHVRTQNSENTFECYLYGVDFLTLHKKTSTGEQRSVFSQCGKAFSLNPDVVCQRTC
::::::::::.. :: .: :: ::::: .::::::. : :.: : :::.:..: :::
CCDS12 SCLKTHVRTQSTGNTHDCNQYGKDFLTLCEKTSTGEKLSEFNQSEKIFSLTPNIVYQRTS
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 TGEKAFDCSDSGKSFINHSHLQGHLRTHNGESLHEWKECGRGFIHSTDLAVRIQTHRSEK
: ::.:.:: ::::::.:.::.:.::::::.:.::.. : ::: ::.:.: :.: ..:
CCDS12 TQEKSFECSHCGKSFINESYLQAHMRTHNGEKLYEWRNYGPGFIDSTSLSVLIETLNAKK
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 PYKCKECGKGFRYSAYLNIHMGTHTGDNPYECKECGKAFTRSCQLTQHRKTHTGEKPYKC
::::::::::.:: :::.::: ::::..:::::::::::. : .. : .:::::::: :
CCDS12 PYKCKECGKGYRYPAYLSIHMRTHTGEKPYECKECGKAFNYSNSFQIHGRTHTGEKPYVC
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 KDCGRAFTVSSCLSQHMKIHVGEKPYECKECGIAFTRSSQLTEHLKTHTAKDPFECKICG
:.::.::: : ::.:.. : :.::::::::: .: ::.: .:..:::.. :: : ::
CCDS12 KECGKAFTQYSGLSMHVRSHSGDKPYECKECGKSFLTSSRLIQHIRTHTGEKPFVCVECG
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 KSFRNSSCLSDHFRIHTGIKPYKCKDCGKAFTQNSDLTKHARTHSGERPYECKECGKAFA
:.: :: :: :.: :: : .:: :::.: : :..: ::::...:: ::::::::
CCDS12 KAFAVSSNLSGHLRTHTEEKACECKICGKVFGYPSCLNNHMRTHSAQKPYTCKECGKAFN
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 RSSRLSEHTRTHTGEKPFECVKCGKAFAISSNLSGHLRIHTGEKPFECLECGKAFTHSSS
:..:. : : ::::::.:: .:::::. ::... : : ::::::.:: ::::::: :::
CCDS12 YSTHLKIHMRIHTGEKPYECKQCGKAFSHSSSFQIHERTHTGEKPYECKECGKAFTCSSS
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460 470 480 490 500 510
pF1KB9 LNNHMRTHSAKKPFTCMECGKAFKFPTCVNLHMRIHTGEKPYKCKQCGKSFSYSNSFQLH
. : .::. .::. :..::::.. : . : .::
CCDS12 FRIHEKTHTEEKPYKCQQCGKAYSHPRSLRRHEQIH
520 530 540 550
520 530 540
pF1KB9 ERTHTGEKPYECKECGKAFSSSSSFRNHERRHADERLSA
>>CCDS73928.1 ZNF778 gene_id:197320|Hs108|chr16 (757 aa)
initn: 6123 init1: 1698 opt: 2020 Z-score: 1306.6 bits: 252.0 E(32554): 1.9e-66
Smith-Waterman score: 2036; 52.2% identity (73.0% similar) in 577 aa overlap (1-546:71-643)
10 20
pF1KB9 MLENYKNLATVGYQLFKPSLISWLEQEES-
:::::.:::.::..::.::.: ::::::
CCDS73 AVTFDDVAVDFTQEEWTLLDPSQRDLYRDVMLENYENLASVGHHLFQPSVIYWLEQEEEL
50 60 70 80 90 100
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 RTVQRGDFQASEWKVQLKTKELALQQDVLGEPTSSGIQMIGSHNGGEVSDVKQCGDVSSE
:. .:. .: ::. :::: ::.:: .:. : :::::.. : :::.. ::
CCDS73 RAGRRAVLQ--EWR--LKTKGPALRQDRSWFRASNETQTARSHNGGQLCDRTQCGEAFSE
110 120 130 140 150
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pF1KB9 HSCLKTHVRTQNSENTFECYLYGVDFLTLHKKT--STGEQRSVFSQCGKAFSLNPDVVCQ
:: :.:::::::. .. : ::. .:: . ::: ::..::::::: .:.:: :
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pF1KB9 RTCTGEKAFDCSDSGKSFINHSHLQGHLRTHNGESLHEWKECGRGFIHSTDLAVRIQTHR
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CCDS73 QACTRDRSLDYSSCGEVFLNQSYLQARAGSHNGEETWKWKPCGKALTHSMGCATPVEMHA
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210 220 230 240 250 260
pF1KB9 SEKPYKCKECGKGFRYSAYLNIHMGTHTGDNPYECKECGKAFTRSCQLTQHRKTHTGEKP
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CCDS73 VRNPHVCRECGKAFRYTAYLTGRVQVHPGEKPCELEECGKASPVSSSLTQHVRIHAAEKP
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270 280 290 300 310 320
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CCDS73 CECKECGKAFTGLSGLSKHVQTDPGQKPYECKDCGKACGGFYLLNEHGKTHTREKPFACV
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330 340 350 360 370 380
pF1KB9 ICGKSFRNSSCLSDHFRIHTGIKPYKCKDCGKAFTQNSDLTKHARTHSGERPYECKECGK
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CCDS73 VCGKYFRNSSCLNNHVRIHTGIKPYTCSYCGKAFTVRCGLTRHVRTHTGEKPYTCKDCGK
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pF1KB9 AFARSSRLSEHTRTHTGEKPFECVKCGKAFAISSNLSGHLRIHTGEKPFECLECGKAFTH
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CCDS73 AFCTSSGLTEHVRTHTGEKPYECKDCGKSFTVSSSLTEHARIHTGEKPYECKQCGKAFTG
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450 460 470
pF1KB9 SSSLNNHMRTHSAKKPFTCMECGKA----------------------------FKFPTCV
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CCDS73 RSGLTKHMRTHTGEKPYECKDCGKAYNRVYLLNEHVKTHTEEKPFICTVCRKSFRNSSCL
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CCDS73 NKHIQIHTGIKPYECKDCGKTFTVSSSLTEHIRTHTGEKPYECKVCGKAFTTSSHLIVHI
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pF1KB9 RRHADERLSA
: :. :.
CCDS73 RTHTGEKPYICKECGKAFASSSHLIEHRRTHTGEKPYICNECGKAFRASSHLHKHGRIHT
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CCDS12 LTKHLRRHSGEKPYECKKCGKAFTERSDLTKHLRRHTGDKPYEYKDCGKAFVVSSSLVDH
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CCDS12 TKIKPYKCKDCGKAFTCHSDLTNHVRIHTGEKPYKCKECGKAFRTSSGRIQHLRTHMGEK
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CCDS12 PYKCNACEKAYSRSCVLTQHLKTHAAEKTSECNACGNSFRNSMCFHDRLKTLTKIKPYKC
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CCDS12 KDCGKAFTCHSDLTNHVRIHTGEKPYKCKECGKAFRTSSGRIQHLRTHMGEKPFECDQCG
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CCDS12 KAFASFSARIAHLKTH
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CCDS45 IGEQFSVLGQCGKAFSSTPNVVSQQACTRDRSLDYSSCGEVFLNQSYLQARAGSHNGEET
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CCDS45 CGKSFKNSSCLNHHTQIHTDEKPF
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CCDS12 QHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGSQLTQHQR
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CCDS12 IHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSELTQHERIHTG
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CCDS12 VCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKE
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CCDS42 ECKECGKAFIYHTTFRGHMRMHTGEKPYKCKECGKTFSHPSSFRNHERTHSGEKPYECKQ
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