Result of FASTA (omim) for
pF1KB9764
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9764, 839 aa
1>>>pF1KB9764 839 - 839 aa - 839 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1318+/-0.00121; mu= 14.2102+/- 0.074
mean_var=398.1400+/-83.945, 0's: 0 Z-trim(106.1): 2119 B-trim: 101 in 2/50
Lambda= 0.064277
statistics sampled from 11850 (14203) to 11850 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.446), E-opt: 0.2 (0.167), width: 16
Scan time: 10.740
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2970 292.4 5.2e-78
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2970 292.4 5.2e-78
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2970 292.4 5.2e-78
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2970 292.5 5.3e-78
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2970 292.5 5.3e-78
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2970 292.5 5.3e-78
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2970 292.5 5.3e-78
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2970 292.5 5.3e-78
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2970 292.5 5.3e-78
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2970 292.5 5.3e-78
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2970 292.5 5.3e-78
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2970 292.5 5.3e-78
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 2970 292.5 5.3e-78
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2970 292.5 5.3e-78
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2970 292.5 5.3e-78
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2970 292.5 5.3e-78
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 2970 292.5 5.4e-78
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2819 278.8 1e-73
NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2813 278.0 1.3e-73
NP_001269289 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 820) 2685 266.0 4.8e-70
NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 2676 265.2 8.7e-70
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2578 256.5 5.7e-67
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2559 254.3 1.5e-66
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2559 254.3 1.5e-66
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2559 254.3 1.6e-66
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2559 254.3 1.6e-66
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2559 254.4 1.6e-66
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2554 254.2 2.6e-66
XP_016867772 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2526 251.3 1.3e-65
XP_016867774 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2526 251.3 1.3e-65
XP_016867775 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2526 251.3 1.3e-65
NP_057304 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 i ( 783) 2526 251.3 1.3e-65
XP_016867773 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2526 251.3 1.3e-65
NP_001013768 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 783) 2526 251.3 1.3e-65
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2516 250.6 2.9e-65
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2516 250.6 2.9e-65
>>NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (782 aa)
initn: 8362 init1: 2854 opt: 2970 Z-score: 1521.5 bits: 292.4 E(85289): 5.2e-78
Smith-Waterman score: 3687; 67.7% identity (83.4% similar) in 789 aa overlap (37-821:1-756)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 QVTFRDVAIEFSQEEWTCLDPAQRTLYRDVMLENYRNLASLGISCFDLSIISMLEQGKEP
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NP_001 MLENYWNLVSLGLCHFDMNIISMLEEGKEP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 FTLESQVQIAGNPDGWEWIKAVITALSSEFVMKDLLHKGKSNTGEVFQTVMLERQESQDI
.:..: :.:: .: : .:.:.: . . ..:::: : ::.: ::.::.:::.:: ::
NP_001 WTVKSCVKIARKPRTPECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLERHESPDI
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130 140 150 160 170 180
pF1KB9 EGCSFREVQKNTHGLEYQCRDAEGNYKGVLLTQ-EGNLTHGRDEHDKRDARNKLIKNQLG
: ::.: :::.: .: : :: :::::::..: ::. ::..:.:: .:::..::::
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190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LSLQSHLPELQLFQYEGKIYECNQVEKSFNNNSSVSPPQQMPYNVKTHISKKYLKDFISS
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NP_001 VSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKY-HELNHF
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pF1KB9 LLLTQGQKANNWGSPYKSDGCGMVFPQNSHLASHQRSHTKEKPYKCYECGKAFRTRSNLT
:::: .:::. :: ::::: :::::: ::::
NP_001 SLLTQRRKANS---------CG-------------------KPYKCNECGKAFTQNSNLT
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310 320 330 340 350 360
pF1KB9 THQVIHTGEKRYKCNECGKVFSRNSQLSQHQKIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLVRHRG
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:::::::::::::.:::::::: .::::::::::.::::::: ::.:.::. .:::::::
NP_001 EKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPY
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pF1KB9 KCNECGKAFRAHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLANHQRIHTGVKPYMCNE
::::::::: ::::.:::::::: ::.:::::.:::::::.::::.::::: ::: :::
NP_001 KCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNE
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pF1KB9 CGKAFSVYSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRGIHTGEKPYKCNECGKV
::::::: :::::::.::.::::::: :::: :::.::: :::::.:::::::::::::
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pF1KB9 FRHNSYLSRHQRIHTGEKPYKYNEYGKAFSEHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQN
: ..: :.:: :.:::::::: :. :.:::..:.:: ::.::::::::::.:::::: .:
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pF1KB9 SHLARHRRVHTGGKPYQCNECGKAFSQTSKLARHQRVHTGEKPYECNQCGKAFSVRSSLT
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NP_001 SYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLA
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pF1KB9 THQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRGIHTGEKPYKCNECGKAFSQTSKLARHQR
.:: :::.:::.::::::.:. : :. :..::::.::::::::::.:.:...:: :.:
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NP_001 EKPYK
780
>>NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (782 aa)
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pF1KB9 QVTFRDVAIEFSQEEWTCLDPAQRTLYRDVMLENYRNLASLGISCFDLSIISMLEQGKEP
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pF1KB9 FTLESQVQIAGNPDGWEWIKAVITALSSEFVMKDLLHKGKSNTGEVFQTVMLERQESQDI
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: ::.: :::.: .: : :: :::::::..: ::. ::..:.:: .:::..::::
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pF1KB9 LSLQSHLPELQLFQYEGKIYECNQVEKSFNNNSSVSPPQQMPYNVKTHISKKYLKDFISS
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NP_001 VSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKY-HELNHF
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pF1KB9 LLLTQGQKANNWGSPYKSDGCGMVFPQNSHLASHQRSHTKEKPYKCYECGKAFRTRSNLT
:::: .:::. :: ::::: :::::: ::::
NP_001 SLLTQRRKANS---------CG-------------------KPYKCNECGKAFTQNSNLT
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pF1KB9 THQVIHTGEKRYKCNECGKVFSRNSQLSQHQKIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLVRHRG
.:. ::.::: :::.::::.:. :.:. :: ::::::::::.:::::: .::.:. ::
NP_001 SHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRR
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NP_001 IHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTG
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NP_001 EKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPY
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::::::::: ::::.:::::::: ::.:::::.:::::::.::::.::::: ::: :::
NP_001 KCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNE
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pF1KB9 CGKAFSVYSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRGIHTGEKPYKCNECGKV
::::::: :::::::.::.::::::: :::: :::.::: :::::.:::::::::::::
NP_001 CGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKV
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pF1KB9 SHLARHRRVHTGGKPYQCNECGKAFSQTSKLARHQRVHTGEKPYECNQCGKAFSVRSSLT
:.:: :::.::: :::.:::::::::. :.:. :. .:::::::.::::::.:. : :.
NP_001 SYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLA
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pF1KB9 THQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRGIHTGEKPYKCNECGKAFSQTSKLARHQR
.:: :::.:::.::::::.:. : :. :..::::.::::::::::.:.:...:: :.:
NP_001 NHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRR
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:::::::: :::: : . ::::::..:::: : ::::
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>>NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (782 aa)
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Smith-Waterman score: 3687; 67.7% identity (83.4% similar) in 789 aa overlap (37-821:1-756)
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pF1KB9 QVTFRDVAIEFSQEEWTCLDPAQRTLYRDVMLENYRNLASLGISCFDLSIISMLEQGKEP
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NP_001 WTVKSCVKIARKPRTPECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLERHESPDI
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pF1KB9 EGCSFREVQKNTHGLEYQCRDAEGNYKGVLLTQ-EGNLTHGRDEHDKRDARNKLIKNQLG
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NP_001 EDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGK----RDQRDRRDIENKLMNNQLG
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.:. ::.::: :::.::::.:. :.:. :: ::::::::::.:::::: .::.:. ::
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::::::::: ::::.:::::::: ::.:::::.:::::::.::::.::::: ::: :::
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::::::: :::::::.::.::::::: :::: :::.::: :::::.:::::::::::::
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:: :::::::::: :::::::.::.::::::: :::: :::.::: :::::.:::::::
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pF1KB9 WRIHTGEKPYKCNECGKAFGVRSSLAIHLVIHTGEKPYKCHECGKVFRRNSHLARHQLIH
:::::::::::::::::::.:::::::: .::::::::::.::::::: ::.:.::. .:
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:: :::::::::: :::::::.::.::::::: :::: :::.::: :::::.:::::::
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NP_001 KVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFT
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pF1KB9 QNS
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NP_150 HRMHTGEKPYK
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270 280 290 300 310 320
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NP_001 LATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISH
330 340 350 360 370 380
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NP_001 WRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVH
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NP_001 TGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEK
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NP_001 NECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECG
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NP_001 KVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFT
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