Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9743
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9743, 524 aa
1>>>pF1KB9743 524 - 524 aa - 524 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2460+/-0.000923; mu= -1.9081+/- 0.055
mean_var=387.8791+/-81.893, 0's: 0 Z-trim(117.4): 746 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.065122
statistics sampled from 17277 (18158) to 17277 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.83), E-opt: 0.2 (0.558), width: 16
Scan time: 3.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10511.1 GLIS2 gene_id:84662|Hs108|chr16 ( 524) 3697 361.2 1.6e-99
CCDS582.1 GLIS1 gene_id:148979|Hs108|chr1 ( 620) 750 84.4 4e-16
CCDS6451.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 ( 775) 747 84.3 5.7e-16
CCDS43784.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 ( 930) 747 84.4 6.4e-16
CCDS53806.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1065) 696 79.6 2e-14
CCDS8940.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1106) 696 79.6 2e-14
CCDS5465.1 GLI3 gene_id:2737|Hs108|chr7 (1580) 696 79.8 2.5e-14
CCDS53807.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 ( 978) 691 79.1 2.6e-14
CCDS33283.1 GLI2 gene_id:2736|Hs108|chr2 (1586) 695 79.7 2.7e-14
CCDS9495.1 ZIC2 gene_id:7546|Hs108|chr13 ( 532) 660 75.9 1.3e-13
CCDS3136.1 ZIC1 gene_id:7545|Hs108|chr3 ( 447) 624 72.4 1.2e-12
CCDS54653.1 ZIC4 gene_id:84107|Hs108|chr3 ( 372) 621 72.1 1.3e-12
CCDS9494.2 ZIC5 gene_id:85416|Hs108|chr13 ( 663) 623 72.5 1.6e-12
CCDS54652.1 ZIC4 gene_id:84107|Hs108|chr3 ( 384) 617 71.7 1.7e-12
CCDS43160.1 ZIC4 gene_id:84107|Hs108|chr3 ( 334) 615 71.5 1.8e-12
>>CCDS10511.1 GLIS2 gene_id:84662|Hs108|chr16 (524 aa)
initn: 3697 init1: 3697 opt: 3697 Z-score: 1900.1 bits: 361.2 E(32554): 1.6e-99
Smith-Waterman score: 3697; 100.0% identity (100.0% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MHSLDEPLDLKLSITKLRAAREKRERTLGVVRPRALHRELGLVDDSPTPGSPGSPPSGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MHSLDEPLDLKLSITKLRAAREKRERTLGVVRPRALHRELGLVDDSPTPGSPGSPPSGFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LNSKFPEKVEGRFSAAPLVDLSLSPPSGLDSPNGSSSLSPERQGNGDLPPVPSASDFQPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LNSKFPEKVEGRFSAAPLVDLSLSPPSGLDSPNGSSSLSPERQGNGDLPPVPSASDFQPL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RYLDGVPSSFQFFLPLGSGGALHLPASSFLTPPKDKCLSPDLPLPKQLVCRWAKCNQLFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RYLDGVPSSFQFFLPLGSGGALHLPASSFLTPPKDKCLSPDLPLPKQLVCRWAKCNQLFE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LLQDLVDHVNDYHVKPEKDAGYCCHWEGCARHGRGFNARYKMLIHIRTHTNEKPHRCPTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLQDLVDHVNDYHVKPEKDAGYCCHWEGCARHGRGFNARYKMLIHIRTHTNEKPHRCPTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SKSFSRLENLKIHNRSHTGEKPYVCPYEGCNKRYSNSSDRFKHTRTHYVDKPYYCKMPGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SKSFSRLENLKIHNRSHTGEKPYVCPYEGCNKRYSNSSDRFKHTRTHYVDKPYYCKMPGC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 HKRYTDPSSLRKHIKAHGHFVSHEQQELLQLRPPPKPPLPAPDGGPYVSGAQIIIPNPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HKRYTDPSSLRKHIKAHGHFVSHEQQELLQLRPPPKPPLPAPDGGPYVSGAQIIIPNPAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 LFGGPGLPGLPLPLAPGPLDLSALACGNGGGSGGGGGMGPGLPGPVLPLNLAKNPLLPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LFGGPGLPGLPLPLAPGPLDLSALACGNGGGSGGGGGMGPGLPGPVLPLNLAKNPLLPSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 FGAGGLGLPVVSLLAGAAGGKAEGEKGRGSVPTRALGMEGHKTPLERTESSCSRPSPDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FGAGGLGLPVVSLLAGAAGGKAEGEKGRGSVPTRALGMEGHKTPLERTESSCSRPSPDGL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB9 PLLPGTVLDLSTGVNSAASSPEALAPGWVVIPPGSVLLKPAVVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PLLPGTVLDLSTGVNSAASSPEALAPGWVVIPPGSVLLKPAVVN
490 500 510 520
>>CCDS582.1 GLIS1 gene_id:148979|Hs108|chr1 (620 aa)
initn: 841 init1: 434 opt: 750 Z-score: 402.9 bits: 84.4 E(32554): 4e-16
Smith-Waterman score: 764; 36.7% identity (58.1% similar) in 439 aa overlap (40-431:68-491)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 LKLSITKLRAAREKRERTLGVVRPRALHRELGLVDDSPTPGSP--GSPPSGFLLNSK--F
::: ::. .:: .: .... .:. .
CCDS58 CYLLGSEPSSGLGLQPETHLPEGSLKRCCVLGLPPTSPASSSPCASSDVTSIIRSSQTSL
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PEKVEGRFSAAPLVDLSLSPPSGLDSPNGSSSLSPERQGNGDLPPVPSASDFQPLRYLDG
:.: . . ::. .:. :: :. .:. : : :. .: .:: .:
CCDS58 VTCVNG-LRSPPLTG-DLGGPSKRARPGPASTDSHE--GSLQLEACRKAS------FLKQ
100 110 120 130 140
130 140 150 160 170
pF1KB9 VPSS-F-QFFLPLGSGGALHLPASSFLTPPKDKCLSPDLPLPKQLV-----CRWAKCNQL
:.. : ..: : .: : :.. :: . . : : ..: :::. :
CCDS58 EPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQL--PPGPSLGGLGLGLAGRVVAGRQACRWVDCCAA
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 FELLQDLVDHVNDYHVKPEKDAGYCCHWEGCARHGRGFNARYKMLIHIRTHTNEKPHRC-
.: ..:: :.. :. .: . : : ::.:. . ::::::.:::.:.:..:::..:
CCDS58 YEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCM
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 -PTCSKSFSRLENLKIHNRSHTGEKPYVCPYEGCNKRYSNSSDRFKHTRTHYVDKPYYCK
:::.:::::::::: :::::::::.: . ::.: .:::::: :: ::: ::: :.
CCDS58 FEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQRTHLDTKPYACQ
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330
pF1KB9 MPGCHKRYTDPSSLRKHIKAHGHFVSHEQQELLQLRPPP------------------KPP
.::: ::::::::::::.:::. ..::: .:. : .
CCDS58 IPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHS---AKEQQVRKKLHAGPDTEADVLTECLVLQQLHTSTQ
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 LPAPDGGPYVSGAQIIIPN--PAALFGGPGL------PGLPLPLAPGPLDLSALACGNGG
: : :: . .: ..:. :... :: :. .: ::: .. . . .
CCDS58 LAASDGKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPPAHDVPSRHHPLDATTSSHHHLS
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440
pF1KB9 ----GSGGGGGMGPGLPGPVL-PLN-LAKNPLLPSP--FGAGGLGLPVVSLLAGAAGGKA
. . :.:::: .:.. ::. :. :: :: . :: .:..
CCDS58 PLPMAESTRDGLGPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQSHSPGGQPFPTLPSKPSYPPFQS
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KB9 EGEKGRGSVPTRALGMEGHKTPLERTESSCSRPSPDGLPLLPGTVLDLSTGVNSAASSPE
CCDS58 PPPPPLPSPQGYQGSFHSIQSCFPYGDCYRMAEPAAGGDGLVGETHGFNPLRPNGYHSLS
510 520 530 540 550 560
>>CCDS6451.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 (775 aa)
initn: 684 init1: 428 opt: 747 Z-score: 400.2 bits: 84.3 E(32554): 5.7e-16
Smith-Waterman score: 750; 37.2% identity (56.0% similar) in 414 aa overlap (88-479:261-647)
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 GFLLNSKFPEKVEGRFSAAPLVDLSLSPPSGLDSPNGSSS--LSPER----QGNG-DLPP
:: .:...:. .. :: :. ::::
CCDS64 EDGALEHERMQQLEHGGLQPGLVNHMVVQHGLPGPDSQSAGLFKTERLEEFPGSTVDLPP
240 250 260 270 280 290
120 130 140 150 160
pF1KB9 VPSASDFQPLRYLDGVPSSFQFFLPLGSGGALHLPASSFLTPPKDKCLSPDLPLPK----
.: . :: : : : . . :: : : : .. :. :
CCDS64 APP---LPPLPPPPGPPP------PYHAHAHLHHPE---LGPHAQQLALPQATLDDDGEM
300 310 320 330
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 -----QLVCRWAKCNQLFELLQDLVDHVNDYHVKPEKDAGYCCHWEGCARHGRGFNARYK
. ::: :. :.. ..:: :.. :. .: . : : :: :. . ::::::
CCDS64 DGIGGKHCCRWIDCSALYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAGCPRRYKPFNARYK
340 350 360 370 380 390
230 240 250 260 270
pF1KB9 MLIHIRTHTNEKPHRCPT--CSKSFSRLENLKIHNRSHTGEKPYVCPYEGCNKRYSNSSD
.:::.:.:..:::..: : :.:::::::::: :::::::::.: . ::.: .:::::
CCDS64 LLIHMRVHSGEKPNKCTFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSD
400 410 420 430 440 450
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 RFKHTRTHYVDKPYYCKMPGCHKRYTDPSSLRKHIKAHGHFVSHEQQELLQLRPPPK-PP
: :: ::: ::: :..::: ::::::::::::.:::. :.::: .:: . :
CCDS64 RAKHQRTHLDTKPYACQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHS---SKEQQARKKLRSSTELHP
460 470 480 490 500 510
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 LPAPDGGPYVSGAQIIIPNPAALFGGPGL-PGLPLPLAPGPLDLSA--LACGNGGGSGGG
: : : :: : : :: ::: :: .. . .. :: .
CCDS64 DLLTDCLTVQSLQPATSPRDAAAEGTVGRSPG------PGPDLYSAPIFSSNYSSRSGTA
520 530 540 550 560
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GGMGPGLPGPVLPLNLAKNPLLPSPFGAGGLGLPVVSLLAGAAGGKAEGEKGRGSVPTRA
.: : : :: . ..: . :: . .. :.... ::: . . . : :
CCDS64 AGAVPP-PHPVSHPSPGHN-VQGSPHNPSSQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPRR-
570 580 590 600 610 620
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 LGMEGHKTPLERTESSCSRPSPDGLPLLPGTVLDLSTGVNSAASSPEALAPGWVVIPPGS
. . .. :.::. .. .:.:
CCDS64 --VPAPSSILQRTQPPYTQ-QPSGSHLKSYQPETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKFCPPHY
630 640 650 660 670 680
>>CCDS43784.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 (930 aa)
initn: 684 init1: 428 opt: 747 Z-score: 399.3 bits: 84.4 E(32554): 6.4e-16
Smith-Waterman score: 750; 37.2% identity (56.0% similar) in 414 aa overlap (88-479:416-802)
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 GFLLNSKFPEKVEGRFSAAPLVDLSLSPPSGLDSPNGSSS--LSPER----QGNG-DLPP
:: .:...:. .. :: :. ::::
CCDS43 EDGALEHERMQQLEHGGLQPGLVNHMVVQHGLPGPDSQSAGLFKTERLEEFPGSTVDLPP
390 400 410 420 430 440
120 130 140 150 160
pF1KB9 VPSASDFQPLRYLDGVPSSFQFFLPLGSGGALHLPASSFLTPPKDKCLSPDLPLPK----
.: . :: : : : . . :: : : : .. :. :
CCDS43 APP---LPPLPPPPGPPP------PYHAHAHLHHPE---LGPHAQQLALPQATLDDDGEM
450 460 470 480 490
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 -----QLVCRWAKCNQLFELLQDLVDHVNDYHVKPEKDAGYCCHWEGCARHGRGFNARYK
. ::: :. :.. ..:: :.. :. .: . : : :: :. . ::::::
CCDS43 DGIGGKHCCRWIDCSALYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAGCPRRYKPFNARYK
500 510 520 530 540 550
230 240 250 260 270
pF1KB9 MLIHIRTHTNEKPHRCPT--CSKSFSRLENLKIHNRSHTGEKPYVCPYEGCNKRYSNSSD
.:::.:.:..:::..: : :.:::::::::: :::::::::.: . ::.: .:::::
CCDS43 LLIHMRVHSGEKPNKCTFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSD
560 570 580 590 600 610
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 RFKHTRTHYVDKPYYCKMPGCHKRYTDPSSLRKHIKAHGHFVSHEQQELLQLRPPPK-PP
: :: ::: ::: :..::: ::::::::::::.:::. :.::: .:: . :
CCDS43 RAKHQRTHLDTKPYACQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHS---SKEQQARKKLRSSTELHP
620 630 640 650 660 670
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 LPAPDGGPYVSGAQIIIPNPAALFGGPGL-PGLPLPLAPGPLDLSA--LACGNGGGSGGG
: : : :: : : :: ::: :: .. . .. :: .
CCDS43 DLLTDCLTVQSLQPATSPRDAAAEGTVGRSPG------PGPDLYSAPIFSSNYSSRSGTA
680 690 700 710 720
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GGMGPGLPGPVLPLNLAKNPLLPSPFGAGGLGLPVVSLLAGAAGGKAEGEKGRGSVPTRA
.: : : :: . ..: . :: . .. :.... ::: . . . : :
CCDS43 AGAVPP-PHPVSHPSPGHN-VQGSPHNPSSQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPRR-
730 740 750 760 770 780
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 LGMEGHKTPLERTESSCSRPSPDGLPLLPGTVLDLSTGVNSAASSPEALAPGWVVIPPGS
. . .. :.::. .. .:.:
CCDS43 --VPAPSSILQRTQPPYTQ-QPSGSHLKSYQPETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKFCPPHY
790 800 810 820 830
>>CCDS53806.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1065 aa)
initn: 486 init1: 237 opt: 696 Z-score: 372.7 bits: 79.6 E(32554): 2e-14
Smith-Waterman score: 720; 34.1% identity (55.7% similar) in 499 aa overlap (46-506:75-542)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 KLRAAREKRERTLGVVRPRALHRELGLVDDSPTPGSPGSPPSGFLLNS-KFPEKVEGRFS
:: :: : : . : :: ... . .
CCDS53 SPLSDASLDLQTVIRTSPSSLVAFINSRCTSPG-GSYGHLSIGTMSPSLGFPAQMNHQKG
50 60 70 80 90 100
80 90 100 110 120
pF1KB9 AAPLVDLSLSPPSGLDSPNGSSSLSPERQGNGDLPPVPSASDFQPL------RYLDGVPS
.: .....: . :: : .. :. :. : .: :... : . :.: :
CCDS53 PSP--SFGVQPCGPHDSARG--GMIPHPQSRGPFPTCQLKSELDMLVGKCREEPLEGDMS
110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SFQFFLPLGSGGALHLPASSFLTPPKDKCLSPDLPLPKQLV---CRWAKCNQLFELLQDL
: : ..: .. : ..: .: . :... ::: :.: :. ..:
CCDS53 S-----PNSTG--IQDPLLGMLDGRED-LEREEKREPESVYETDCRWDGCSQEFDSQEQL
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VDHVNDYHVKPEKDAGYCCHWEGCARHGRGFNARYKMLIHIRTHTNEKPHRCPT--CSKS
: :.:. :.. :. . ::: ::.:. : :.:.: ...:.: ::.::::.: : ::
CCDS53 VHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCRKS
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 FSRLENLKIHNRSHTGEKPYVCPYEGCNKRYSNSSDRFKH-TRTHYVDKPYYCKMPGCHK
.::::::: : :::::::::.: .:::.: .::.::: :: .::: .::: ::.::: :
CCDS53 YSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPGCTK
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350
pF1KB9 RYTDPSSLRKHIKA-HGHFVSHEQQELLQLRPPPKPPLPA---P----DGGPYVSGAQII
:::::::::::.:. :: .: .. : :. : . : .::: ...
CCDS53 RYTDPSSLRKHVKTVHGP-DAHVTKRHRGDGPLPRAPSISTVEPKREREGGPIREESRLT
340 350 360 370 380
360 370 380 390 400
pF1KB9 IPNPAALFGGPGLPGLPLPLAP--GP------LDLSALACGNGGGSG---GGGGMGPGLP
.:. .:. :. :: . .: : .. ::.::: .. :: .
CCDS53 VPE-GAMKPQPS-PGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIA
390 400 410 420 430 440
410 420 430 440 450
pF1KB9 GPVLPL-----NLAKNPLLP-SPFGAGGLGLPVVSLLAGAAGGKAEGEKGRGSVPTRALG
: : :: . : :.:. :: :: .: .:.. .. : : .:
CCDS53 GTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLKLPSLSH-TGTTVSRRVG-------PPVSLE
450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 MEGHKTPLERTESSCSRPSPDGLPLLPGTVLDLSTGVNSAASSPEALAPGWVVIPPGSVL
.. .. . . :: : . :. :: : :.:.: : .: :
CCDS53 RRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASPFPPG-----SPPENGASSLP-GLMPAQHYLLRARYA
500 510 520 530 540 550
520
pF1KB9 LKPAVVN
CCDS53 SARGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRPAPARV
560 570 580 590 600 610
>>CCDS8940.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1106 aa)
initn: 486 init1: 237 opt: 696 Z-score: 372.5 bits: 79.6 E(32554): 2e-14
Smith-Waterman score: 720; 34.1% identity (55.7% similar) in 499 aa overlap (46-506:116-583)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 KLRAAREKRERTLGVVRPRALHRELGLVDDSPTPGSPGSPPSGFLLNS-KFPEKVEGRFS
:: :: : : . : :: ... . .
CCDS89 SPLSDASLDLQTVIRTSPSSLVAFINSRCTSPG-GSYGHLSIGTMSPSLGFPAQMNHQKG
90 100 110 120 130 140
80 90 100 110 120
pF1KB9 AAPLVDLSLSPPSGLDSPNGSSSLSPERQGNGDLPPVPSASDFQPL------RYLDGVPS
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CCDS89 PSP--SFGVQPCGPHDSARG--GMIPHPQSRGPFPTCQLKSELDMLVGKCREEPLEGDMS
150 160 170 180 190 200
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SFQFFLPLGSGGALHLPASSFLTPPKDKCLSPDLPLPKQLV---CRWAKCNQLFELLQDL
: : ..: .. : ..: .: . :... ::: :.: :. ..:
CCDS89 S-----PNSTG--IQDPLLGMLDGRED-LEREEKREPESVYETDCRWDGCSQEFDSQEQL
210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VDHVNDYHVKPEKDAGYCCHWEGCARHGRGFNARYKMLIHIRTHTNEKPHRCPT--CSKS
: :.:. :.. :. . ::: ::.:. : :.:.: ...:.: ::.::::.: : ::
CCDS89 VHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCRKS
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 FSRLENLKIHNRSHTGEKPYVCPYEGCNKRYSNSSDRFKH-TRTHYVDKPYYCKMPGCHK
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CCDS89 YSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPGCTK
320 330 340 350 360 370
310 320 330 340 350
pF1KB9 RYTDPSSLRKHIKA-HGHFVSHEQQELLQLRPPPKPPLPA---P----DGGPYVSGAQII
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CCDS89 RYTDPSSLRKHVKTVHGP-DAHVTKRHRGDGPLPRAPSISTVEPKREREGGPIREESRLT
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360 370 380 390 400
pF1KB9 IPNPAALFGGPGLPGLPLPLAP--GP------LDLSALACGNGGGSG---GGGGMGPGLP
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CCDS89 VPE-GAMKPQPS-PGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIA
440 450 460 470 480
410 420 430 440 450
pF1KB9 GPVLPL-----NLAKNPLLP-SPFGAGGLGLPVVSLLAGAAGGKAEGEKGRGSVPTRALG
: : :: . : :.:. :: :: .: .:.. .. : : .:
CCDS89 GTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLKLPSLSH-TGTTVSRRVG-------PPVSLE
490 500 510 520 530 540
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 MEGHKTPLERTESSCSRPSPDGLPLLPGTVLDLSTGVNSAASSPEALAPGWVVIPPGSVL
.. .. . . :: : . :. :: : :.:.: : .: :
CCDS89 RRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASPFPPG-----SPPENGASSLP-GLMPAQHYLLRARYA
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520
pF1KB9 LKPAVVN
CCDS89 SARGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRPAPARV
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pF1KB9 SLDEPLDLKLSITKLRAAREKRERTLGVVRPRALHRELGLVDDSPTPGSP-GSPPSGFLL
: .:: . ... . . :: : : .
CCDS54 SRSSSSASGSYGHLSASAISPALSFTYSSAPVSLHMHQQILSRQQSLGSAFGHSPPLIHP
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:: . : . :.: . ..:. ::. .: .. . : . . ..
CCDS54 APTFPTQ-----RPIPGIPTVLNPVQVSSGPSESSQNKPTSESAVSSTGDPMHNKRSKIK
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CCDS54 PDEDLPS------P-GARGQQEQPEGTTLVKEEGDKDESKQEPEVIYETNCHWEGCAREF
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pF1KB9 ELLQDLVDHVNDYHVKPEKDAGYCCHWEGCARHGRGFNARYKMLIHIRTHTNEKPHRCPT
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CCDS54 DTQEQLVHHINNDHIHGEKKE-FVCRWLDCSREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTF
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pF1KB9 --CSKSFSRLENLKIHNRSHTGEKPYVCPYEGCNKRYSNSSDRFKH-TRTHYVDKPYYCK
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CCDS54 EGCTKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCK
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pF1KB9 MPGCHKRYTDPSSLRKHIKA-HGH--FVSHEQQELLQLRPPPKPPLPAPDGGPYVSGAQI
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CCDS54 IPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPEAHVTKKQRGDIHPRPPPPRDSGSHSQSRSPGRPTQ
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CCDS54 GALGEQQDLSNTTSKREECLQVKTVKAEKPMTSQPSPGGQSSCSSQQSPISNYSNSGLEL
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pF1KB9 ALHRELGLVDDSPTPGSPGSPPSGFLLNSKFPEKVEGRFSAAPLVDLSLSPPSGLDSPNG
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CCDS53 MSPSLGFPAQMNHQKGPSP--SFGVQPCGPHDSARG
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pF1KB9 SSSLSPERQGNGDLPPVPSASDFQPL------RYLDGVPSSFQFFLPLGSGGALHLPASS
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CCDS53 --GMIPHPQSRGPFPTCQLKSELDMLVGKCREEPLEGDMSS-----PNSTG--IQDPLLG
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.: .: . :... ::: :.: :. ..:: :.:. :.. :. . ::
CCDS53 MLDGRED-LEREEKREPESVYETDCRWDGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKE-FVCH
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pF1KB9 WEGCARHGRGFNARYKMLIHIRTHTNEKPHRCPT--CSKSFSRLENLKIHNRSHTGEKPY
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CCDS53 WGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPY
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CCDS53 MCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGP-D
210 220 230 240 250 260
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pF1KB9 SHEQQELLQLRPPPKPPLPA---P----DGGPYVSGAQIIIPNPAALFGGPGLPGLPLPL
.: .. : :. : . : .::: ... .:. .:. :. ::
CCDS53 AHVTKRHRGDGPLPRAPSISTVEPKREREGGPIREESRLTVPE-GAMKPQPS-PGAQSSC
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pF1KB9 AP--GP------LDLSALACGNGGGSG---GGGGMGPGLPGPVLPL-----NLAKNPLLP
. .: : .. ::.::: .. :: . : : :: . :
CCDS53 SSDHSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQ
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pF1KB9 -SPFGAGGLGLPVVSLLAGAAGGKAEGEKGRGSVPTRALGMEGHKTPLERTESSCSRPSP
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CCDS53 LRPIGTRGLKLPSLSH-TGTTVSRRVG-------PPVSLERRSSSSSSISSAYTVSRRSS
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pF1KB9 DGLPLLPGTVLDLSTGVNSAASSPEALAPGWVVIPPGSVLLKPAVVN
. :. :: : :.:.: : .: :
CCDS53 LASPFPPG-----SPPENGASSLP-GLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIGG
440 450 460 470 480
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pF1KB9 DGVPSSFQFFLPLGSGGALHLPASSFLTPPKDKCLSPDLPLPKQLVCRWAKCNQLFELLQ
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CCDS33 TQGQVSGHGSCGCALPLSQEQLADLKEDLDRDDCKQEAEVVIYETNCHWEDCTKEYDTQE
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pF1KB9 DLVDHVNDYHVKPEKDAGYCCHWEGCARHGRGFNARYKMLIHIRTHTNEKPHRCPT--CS
.:: :.:. :.. :: . :.:..:.:. . :.:.: ...:.: ::.::::.: ::
CCDS33 QLVHHINNEHIHGEKKE-FVCRWQACTREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCS
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pF1KB9 KSFSRLENLKIHNRSHTGEKPYVCPYEGCNKRYSNSSDRFKH-TRTHYVDKPYYCKMPGC
:..::::::: : ::::::::::: .::::: .::.::: :: .::: .::: ::.:::
CCDS33 KAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYICKIPGC
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pF1KB9 HKRYTDPSSLRKHIKA-HGH--FVSHEQQELLQLRPP-----PKPPLPAPDGGPYVSGA-
::::::::::::.:. :: :...:.. ..:: : . ::: . :
CCDS33 TKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKKQRNDVHLRTPLLKENGDSEAGTEPGGPESTEAS
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pF1KB9 ---QII---IPNPAALFGGPGL----PGLPLPLAPGPLDLSALACGNGGGSGGGGGMGPG
: . . : . :: :: . : :.. ...: : :::
CCDS33 STSQAVEDCLHVRAIKTESSGLCQSSPGAQSSCSSEPSPLGSAPNNDSGVEMPG--TGPG
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pF1KB9 LPGPVLPLNLAKNPLLPSPFGAGGLGLPVVSLLAGAAGGKAEGEKGRGSVPTRALGMEGH
: . :. .: :: .: ::. ..: : . : . : . .
CCDS33 SLGDLTALD-------DTPPGAD------TSALAAPSAG---GLQLRKHMTTMHRFEQLK
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pF1KB9 KTPLERTESSCSR--PSPDG----LPLLPGTVLDLSTGVNSAASSPEALAPGWVVIPPGS
: :. ..::: :.: :: :::. : . .:....: .: :
CCDS33 KEKLKSLKDSCSWAGPTPHTRNTKLPPLPGSGSILENFSGSGGGGPAGLLPNPRLSELSA
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CCDS33 SEVTMLSQLQERRDSSTSTVSSAYTVSRRSSGISPYFSSRRSSEASPLGAGRPHNASSAD
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pF1KB9 SASDFQPLRYLDGVPSSFQFFLPLGSGGALHLPASSFLTPPKDKCLSPDLPL----PKQL
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CCDS94 AQLHNQYGPMNMNMGMNMAAAAAHHHHHHHHHPGA-FFRYMRQQCIKQELICKWIDPEQL
210 220 230 240 250 260
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pF1KB9 VCRWAKCNQLFELLQDLVDHVNDYHVKPEKDAGYCCHWEGCARHGRGFNARYKMLIHIRT
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CCDS94 SNPKKSCNKTFSTMHELVTHVSVEHVGGPEQSNHVCFWEECPREGKPFKAKYKLVNHIRV
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pF1KB9 HTNEKPHRCPT--CSKSFSRLENLKIHNRSHTGEKPYVCPYEGCNKRYSNSSDRFKHTRT
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CCDS94 HTGEKPFPCPFPGCGKVFARSENLKIHKRTHTGEKPFQCEFEGCDRRFANSSDRKKHMHV
330 340 350 360 370 380
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pF1KB9 HYVDKPYYCKMPGCHKRYTDPSSLRKHIKAH-----GHFVSHEQQELLQLRPPPKPPLPA
: :::: ::: : : :: :::::::.:.: : : . . :: : .
CCDS94 HTSDKPYLCKM--CDKSYTHPSSLRKHMKVHESSPQGSESSPAASSGYESSTPPG--LVS
390 400 410 420 430 440
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pF1KB9 PDGGPYVSGAQIIIPNPAALFGGPGLPGLPLPLAPGPLDLSALACGNGGGSG-GGGGMGP
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CCDS94 PSAEPQSSSNLSPAAAAAAAAAAAAAAAVSAVHRGGGSGSGGAGGGSGGGSGSGGGGGGA
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: :
CCDS94 GGGGGGSSGGGSGTAGGHSGLSSNFNEWYV
510 520 530
524 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]