Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9669
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9669, 489 aa
1>>>pF1KB9669 489 - 489 aa - 489 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0321+/-0.00141; mu= 12.4884+/- 0.084
mean_var=237.8039+/-47.318, 0's: 0 Z-trim(108.4): 950 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.083170
statistics sampled from 9177 (10205) to 9177 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16
Scan time: 3.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 3514 435.3 7.2e-122
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 2231 281.3 1.5e-75
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1839 234.4 2.6e-61
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1839 234.5 2.7e-61
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1839 234.5 2.7e-61
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1839 234.5 2.8e-61
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1771 226.4 7.9e-59
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1756 224.6 2.9e-58
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1752 224.0 3.5e-58
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1752 224.0 3.7e-58
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1752 224.1 4.1e-58
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1740 222.5 9.1e-58
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1740 222.6 1e-57
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1725 220.9 3.8e-57
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1716 219.8 8.2e-57
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1712 219.3 1.1e-56
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1712 219.3 1.1e-56
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1705 218.5 2.1e-56
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1704 218.3 2.1e-56
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1704 218.4 2.3e-56
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1704 218.4 2.3e-56
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1700 217.6 2.4e-56
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1700 217.7 2.7e-56
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1696 217.2 3.6e-56
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1696 217.3 3.8e-56
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1696 217.3 3.8e-56
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1695 217.3 4.7e-56
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1693 216.9 4.9e-56
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1690 216.5 5.7e-56
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1692 217.0 6.5e-56
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1690 216.6 6.7e-56
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1690 216.7 7.4e-56
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1690 216.8 7.6e-56
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1690 216.8 7.6e-56
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1687 216.2 7.6e-56
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1687 216.3 9.2e-56
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1683 215.7 1.1e-55
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1683 215.8 1.2e-55
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1681 215.8 1.8e-55
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1681 215.8 1.9e-55
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1675 214.9 2.5e-55
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1675 214.9 2.6e-55
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1670 214.3 3.6e-55
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1665 213.6 5e-55
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1662 213.2 6.3e-55
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1662 213.2 6.6e-55
CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 659) 1662 213.2 6.7e-55
CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 697) 1662 213.3 6.9e-55
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1662 213.4 7.5e-55
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1662 213.4 7.6e-55
>>CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 (489 aa)
initn: 3514 init1: 3514 opt: 3514 Z-score: 2301.4 bits: 435.3 E(32554): 7.2e-122
Smith-Waterman score: 3514; 100.0% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (1-489:1-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 IPQGNKLLGGSVPACHELKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IPQGNKLLGGSVPACHELKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 PMPCEEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PMPCEEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 TGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 PYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYAC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 KAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 QSAYLIEHQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QSAYLIEHQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTN
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LTRHLRIHT
:::::::::
CCDS12 LTRHLRIHT
>>CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 (461 aa)
initn: 2187 init1: 2187 opt: 2231 Z-score: 1469.7 bits: 281.3 E(32554): 1.5e-75
Smith-Waterman score: 2231; 68.5% identity (84.9% similar) in 451 aa overlap (39-489:15-461)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 DISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLL
:::..: : :. .. .:. . . .
CCDS44 MEREGIWHSTLGETWEPNNWLE---GQQDSHLSQVGVTHKETFT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GGSVPACHELKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKK
: . .:.. ..: .: . . : : .:.. ...:.: : ::
CCDS44 EMRVCGGNEFERCSSQDSIL-DTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKK
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 TYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYAC
:.:..:.:.::.::::.:::::::::::..:..::::::::::::.:::.::::::: :
CCDS44 IYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKC
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 GDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCG
..::::::: :::::::::::::::: : :::::.:.::: :::::::::::: :..::
CCDS44 NECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECG
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 KAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFN
:::.:.:.: :::::::::::: : :::.::::.::: :::.::::::: :..:::::.
CCDS44 KAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSS
:::.:::::::::::::: :..:::.::::.:::.:::.: :::::::.:::::::::::
CCDS44 KSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 LTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEH
::::.:::::::::::..: ::::::::: :::..::::::: :.:::::::::::::::
CCDS44 LTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEH
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 QRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIH
::::::::::.: ::::.:::::::::::: :::::::.:.::::.:::.:::::: : :
CCDS44 QRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTH
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 T
:
CCDS44 T
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 1806 init1: 1806 opt: 1839 Z-score: 1214.2 bits: 234.4 E(32554): 2.6e-61
Smith-Waterman score: 1839; 57.5% identity (76.3% similar) in 452 aa overlap (41-489:145-587)
20 30 40 50 60
pF1KB9 SEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEP-LGIPQGNKLLG
: .: : : . .: :.. : :
CCDS74 LEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTW-----GTRGKREKPDLNVLQ--KTCV
120 130 140 150 160
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GSVP-ACHEL-KAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEK
: :.: :::.... .. : . : .: : ..: :.: .
CCDS74 KEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKG--FRNSSALTKHQRIHTGE
170 180 190 200 210 220
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYA
: : :..::..:.. . ::.::: ::::::.::. ::: : :::.. :.:.:::::::
CCDS74 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
230 240 250 260 270 280
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDC
:..::::: : ..:: : : ::::::: : ::::: ..::::.:.::::::::: : .:
CCDS74 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
290 300 310 320 330 340
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 GKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAF
::::.: :: ::::::::::: : :::.::::. ::::.: :::::::.:.::::.:
CCDS74 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
350 360 370 380 390 400
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 NKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNS
..::::. :.:.::::::: :..::::: ::..: ::::.: : ::.::..::::::..:
CCDS74 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
410 420 430 440 450 460
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 SLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIE
:::.::::::::::::: : . :. . :: :: .::::::: :..::.:::::. :::
CCDS74 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
470 480 490 500 510 520
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 HQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRI
:::::: :::: :..::::: ..:::. :.: :::::::.: .:::.: ..:.::.: ::
CCDS74 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 HT
::
CCDS74 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
590 600 610
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
initn: 1806 init1: 1806 opt: 1839 Z-score: 1213.9 bits: 234.5 E(32554): 2.7e-61
Smith-Waterman score: 1839; 57.5% identity (76.3% similar) in 452 aa overlap (41-489:187-629)
20 30 40 50 60
pF1KB9 SEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEP-LGIPQGNKLLG
: .: : : . .: :.. : :
CCDS74 LEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTW-----GTRGKREKPDLNVLQ--KTCV
160 170 180 190 200
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GSVP-ACHEL-KAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEK
: :.: :::.... .. : . : .: : ..: :.: .
CCDS74 KEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKG--FRNSSALTKHQRIHTGE
210 220 230 240 250 260
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYA
: : :..::..:.. . ::.::: ::::::.::. ::: : :::.. :.:.:::::::
CCDS74 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
270 280 290 300 310 320
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDC
:..::::: : ..:: : : ::::::: : ::::: ..::::.:.::::::::: : .:
CCDS74 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
330 340 350 360 370 380
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 GKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAF
::::.: :: ::::::::::: : :::.::::. ::::.: :::::::.:.::::.:
CCDS74 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
390 400 410 420 430 440
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 NKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNS
..::::. :.:.::::::: :..::::: ::..: ::::.: : ::.::..::::::..:
CCDS74 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
450 460 470 480 490 500
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 SLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIE
:::.::::::::::::: : . :. . :: :: .::::::: :..::.:::::. :::
CCDS74 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
510 520 530 540 550 560
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 HQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRI
:::::: :::: :..::::: ..:::. :.: :::::::.: .:::.: ..:.::.: ::
CCDS74 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
570 580 590 600 610 620
pF1KB9 HT
::
CCDS74 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
630 640 650
>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (670 aa)
initn: 1806 init1: 1806 opt: 1839 Z-score: 1213.8 bits: 234.5 E(32554): 2.7e-61
Smith-Waterman score: 1839; 57.5% identity (76.3% similar) in 452 aa overlap (41-489:199-641)
20 30 40 50 60
pF1KB9 SEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEP-LGIPQGNKLLG
: .: : : . .: :.. : :
CCDS12 LEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTW-----GTRGKREKPDLNVLQ--KTCV
170 180 190 200 210 220
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GSVP-ACHEL-KAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEK
: :.: :::.... .. : . : .: : ..: :.: .
CCDS12 KEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKG--FRNSSALTKHQRIHTGE
230 240 250 260 270
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYA
: : :..::..:.. . ::.::: ::::::.::. ::: : :::.. :.:.:::::::
CCDS12 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
280 290 300 310 320 330
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDC
:..::::: : ..:: : : ::::::: : ::::: ..::::.:.::::::::: : .:
CCDS12 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
340 350 360 370 380 390
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 GKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAF
::::.: :: ::::::::::: : :::.::::. ::::.: :::::::.:.::::.:
CCDS12 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
400 410 420 430 440 450
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 NKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNS
..::::. :.:.::::::: :..::::: ::..: ::::.: : ::.::..::::::..:
CCDS12 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
460 470 480 490 500 510
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 SLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIE
:::.::::::::::::: : . :. . :: :: .::::::: :..::.:::::. :::
CCDS12 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
520 530 540 550 560 570
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 HQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRI
:::::: :::: :..::::: ..:::. :.: :::::::.: .:::.: ..:.::.: ::
CCDS12 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 HT
::
CCDS12 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
640 650 660 670
>>CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (682 aa)
initn: 1806 init1: 1806 opt: 1839 Z-score: 1213.7 bits: 234.5 E(32554): 2.8e-61
Smith-Waterman score: 1839; 57.5% identity (76.3% similar) in 452 aa overlap (41-489:211-653)
20 30 40 50 60
pF1KB9 SEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEP-LGIPQGNKLLG
: .: : : . .: :.. : :
CCDS54 LEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTW-----GTRGKREKPDLNVLQ--KTCV
190 200 210 220 230
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GSVP-ACHEL-KAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEK
: :.: :::.... .. : . : .: : ..: :.: .
CCDS54 KEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKG--FRNSSALTKHQRIHTGE
240 250 260 270 280 290
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYA
: : :..::..:.. . ::.::: ::::::.::. ::: : :::.. :.:.:::::::
CCDS54 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
300 310 320 330 340 350
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDC
:..::::: : ..:: : : ::::::: : ::::: ..::::.:.::::::::: : .:
CCDS54 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
360 370 380 390 400 410
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 GKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAF
::::.: :: ::::::::::: : :::.::::. ::::.: :::::::.:.::::.:
CCDS54 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
420 430 440 450 460 470
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 NKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNS
..::::. :.:.::::::: :..::::: ::..: ::::.: : ::.::..::::::..:
CCDS54 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
480 490 500 510 520 530
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 SLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIE
:::.::::::::::::: : . :. . :: :: .::::::: :..::.:::::. :::
CCDS54 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
540 550 560 570 580 590
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 HQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRI
:::::: :::: :..::::: ..:::. :.: :::::::.: .:::.: ..:.::.: ::
CCDS54 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 HT
::
CCDS54 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
660 670 680
>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 (688 aa)
initn: 1744 init1: 1744 opt: 1771 Z-score: 1169.6 bits: 226.4 E(32554): 7.9e-59
Smith-Waterman score: 1771; 58.5% identity (77.0% similar) in 426 aa overlap (66-489:187-610)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 EGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLLGGSVP-ACHEL-KAFANQGCVLVPPRL
.: : : ::.: :::.... ... :.
CCDS12 HQSIHTGEKPYECKQCGKAFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRI
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 DDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHT
. : :: : .:.:.. .: :.:.::::::...:.: :::.::
CCDS12 HTGEKPYKCEEC--GKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHT
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 GEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKP
::: .:: : : : . :.: .:.:.::::::: : .::::: .:. ::. :.::::
CCDS12 GEKLYECKECRKVFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKP
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 YVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCP
: : ::.:: . : : ::.::::::::: : .::::: .. .: ::: ::.:::: :
CCDS12 YECKECGRAFIRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECK
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 ECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGK
:::. ::.. .::.::: ::::::: :::::::::..: :: ::: ::::::: : ::::
CCDS12 ECGKMFSHGSQLTQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGK
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 AFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTG
.::..: : ::.:.: : ::.::.::::.: ..:.:::::::::::::::: :. ::
CCDS12 TFSRGSELTQHERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQ
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 RSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSL
: : :: .:::::::::.::::::... ::.:::::::::::.: .:::.::..:.:
CCDS12 SSHLSQHQRLHTGEKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFIRGSQL
520 530 540 550 560 570
460 470 480
pF1KB9 TVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIHT
: :::::::::::.: ::::.::....:: : ::::
CCDS12 TQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSRHQ
580 590 600 610 620 630
CCDS12 RIHTGEKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECGIDFSHGSQVYM
640 650 660 670 680
>>CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 (738 aa)
initn: 1740 init1: 1740 opt: 1756 Z-score: 1159.5 bits: 224.6 E(32554): 2.9e-58
Smith-Waterman score: 1757; 58.6% identity (77.6% similar) in 425 aa overlap (70-489:259-678)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 EPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLLGGSVP-ACHEL-KAFANQGCVLVPPRL---D
: : : . :::.... . : .
CCDS31 HIRDIAFGCGNCGKTFPQKSQFITHHRTHTGEKPYNCSQCGKAFSQKSQLTSHQRTHTGE
230 240 250 260 270 280
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 DPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTG
: : : : :: :: : : . .: : :.:::.:::..:.::.:::::::
CCDS31 KPYECGEC-----GKAFSRKSHLISHWRTHTGEKPYGCNECGRAFSEKSNLINHQRIHTG
290 300 310 320 330 340
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 EKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPY
:::::: ::: : ..:.:. :.:.::: ::..:.:: ::: .. .: :: :::::::
CCDS31 EKPFECRECGKAFSRKSQLVTHHRTHTGTKPFGCSDCRKAFFEKSELIRHQTIHTGEKPY
350 360 370 380 390 400
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 VCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPE
:. : ::::. ::: .:.: ::::::..: .:::::::. ::: :: :::::::..: .
CCDS31 ECSECRKAFRERSSLINHQRTHTGEKPHGCIQCGKAFSQKSHLISHQMTHTGEKPFICSK
410 420 430 440 450 460
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 CGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKA
::.:::.. .:..::::::::::: :.::::::... ::: ::: :::::::::.:::::
CCDS31 CGKAFSRKSQLVRHQRTHTGEKPYECSECGKAFSEKLSLTNHQRIHTGEKPYVCSECGKA
470 480 490 500 510 520
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 FSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGR
: :.:.::.::: : : ::.:::::::::...:::. ::: ::::::::: :.: :. .
CCDS31 FCQKSHLISHQRTHTGEKPYECSECGKAFGEKSSLATHQRTHTGEKPYECRDCEKAFSQK
530 540 550 560 570 580
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 SSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLT
:.: .:: .::::::: :. : ::: ... ::.: : :::::::.:..: :.: ..:::
CCDS31 SQLNTHQRIHTGEKPYECSLCRKAFFEKSELIRHLRTHTGEKPYECNECRKAFREKSSLI
590 600 610 620 630 640
460 470 480
pF1KB9 VHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIHT
::::::::::..:.::::.:::...: : : ::
CCDS31 NHQRIHTGEKPFECSECGKAFSRKSHLIPHQRTHTGEKPYGCSECRKAFSQKSQLVNHQR
650 660 670 680 690 700
CCDS31 IHTGEKPYRCIECGKAFSQKSQLINHQRTHTVKKS
710 720 730
>>CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 (580 aa)
initn: 1752 init1: 1752 opt: 1752 Z-score: 1158.1 bits: 224.0 E(32554): 3.5e-58
Smith-Waterman score: 1752; 60.7% identity (80.9% similar) in 382 aa overlap (108-489:164-545)
80 90 100 110 120 130
pF1KB9 LKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKKTYDCSECGK
:..:: :: . .: :.:.::::
CCDS56 CVREKQSNEFGKPFYHCASYVVTPFKCNQCGQDFSHKFDLIRHERIHAGEKPYECKECGK
140 150 160 170 180 190
140 150 160 170 180 190
pF1KB9 AFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYACGDCGKAFSQ
::::. .:: ::.:::::::..:. ::: ::. :.: :.:.::::::::: :: :::::
CCDS56 AFSRKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPYACKDCWKAFSQ
200 210 220 230 240 250
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 RMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCGKAFSQNMHL
. :: :.: ::::::: : :::.: . ..: .::.::::::::::..::.:::. .
CCDS56 KSNLIEHERIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNECGRAFSRMSSV
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 IVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFNKSSSLTLHQ
.:.:.::::::: : .::.:::: . :.:.:::::::.:.::::::..:::::.:.
CCDS56 TLHMRSHTGEKPYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAFSQSSSLTVHM
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KB9 RNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSSLTQHQRIHT
::::.:::: : :::::::.. :: ::..: : ::.::::::::: . :.: .::::::
CCDS56 RNHTAEKPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQMSNLIRHQRIHT
380 390 400 410 420 430
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 GEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKP
::::: : .: : :. .:.: :. .::::::: :..::::::: :.::..:::::::
CCDS56 GEKPYACTVCGKAFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLLEHEKIHTGEKP
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470 480
pF1KB9 YRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIHT
..:..:::.: . ::::.: : :::::::.:..:::.::. . : :.: ::
CCDS56 FKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQCSLLIIHMRSHTGEKPFECN
500 510 520 530 540 550
CCDS56 ECGKAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY
560 570 580
>>CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 (644 aa)
initn: 1752 init1: 1752 opt: 1752 Z-score: 1157.6 bits: 224.0 E(32554): 3.7e-58
Smith-Waterman score: 1752; 60.7% identity (80.9% similar) in 382 aa overlap (108-489:228-609)
80 90 100 110 120 130
pF1KB9 LKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKKTYDCSECGK
:..:: :: . .: :.:.::::
CCDS42 CVREKQSNEFGKPFYHCASYVVTPFKCNQCGQDFSHKFDLIRHERIHAGEKPYECKECGK
200 210 220 230 240 250
140 150 160 170 180 190
pF1KB9 AFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYACGDCGKAFSQ
::::. .:: ::.:::::::..:. ::: ::. :.: :.:.::::::::: :: :::::
CCDS42 AFSRKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPYACKDCWKAFSQ
260 270 280 290 300 310
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 RMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCGKAFSQNMHL
. :: :.: ::::::: : :::.: . ..: .::.::::::::::..::.:::. .
CCDS42 KSNLIEHERIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNECGRAFSRMSSV
320 330 340 350 360 370
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 IVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFNKSSSLTLHQ
.:.:.::::::: : .::.:::: . :.:.:::::::.:.::::::..:::::.:.
CCDS42 TLHMRSHTGEKPYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAFSQSSSLTVHM
380 390 400 410 420 430
320 330 340 350 360 370
pF1KB9 RNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSSLTQHQRIHT
::::.:::: : :::::::.. :: ::..: : ::.::::::::: . :.: .::::::
CCDS42 RNHTAEKPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQMSNLIRHQRIHT
440 450 460 470 480 490
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 GEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKP
::::: : .: : :. .:.: :. .::::::: :..::::::: :.::..:::::::
CCDS42 GEKPYACTVCGKAFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLLEHEKIHTGEKP
500 510 520 530 540 550
440 450 460 470 480
pF1KB9 YRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIHT
..:..:::.: . ::::.: : :::::::.:..:::.::. . : :.: ::
CCDS42 FKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQCSLLIIHMRSHTGEKPFECN
560 570 580 590 600 610
CCDS42 ECGKAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY
620 630 640
489 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 08:26:51 2016 done: Sat Nov 5 08:26:52 2016
Total Scan time: 3.110 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]