Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9642
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9642, 593 aa
1>>>pF1KB9642 593 - 593 aa - 593 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3386+/-0.000964; mu= 14.5620+/- 0.057
mean_var=171.1545+/-34.683, 0's: 0 Z-trim(111.0): 215 B-trim: 5 in 2/52
Lambda= 0.098035
statistics sampled from 11746 (12030) to 11746 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.718), E-opt: 0.2 (0.37), width: 16
Scan time: 3.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30855.1 LINGO4 gene_id:339398|Hs108|chr1 ( 593) 4009 579.9 3.1e-165
CCDS45905.1 LINGO3 gene_id:645191|Hs108|chr19 ( 592) 1524 228.5 1.9e-59
CCDS73766.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 ( 614) 1491 223.8 5e-58
CCDS45313.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 ( 620) 1491 223.8 5.1e-58
CCDS6524.1 LINGO2 gene_id:158038|Hs108|chr9 ( 606) 1463 219.8 7.8e-57
CCDS46071.1 LRFN1 gene_id:57622|Hs108|chr19 ( 771) 520 86.6 1.3e-16
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 581) 468 79.1 1.7e-14
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 587) 468 79.1 1.8e-14
CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 605) 467 79.0 2e-14
CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 643) 467 79.0 2e-14
CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7 ( 653) 451 76.7 9.9e-14
CCDS3307.1 GP5 gene_id:2814|Hs108|chr3 ( 560) 438 74.8 3.2e-13
CCDS46715.1 CHADL gene_id:150356|Hs108|chr22 ( 762) 439 75.1 3.5e-13
CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19 ( 713) 438 75.0 3.8e-13
CCDS31464.1 LRRC4C gene_id:57689|Hs108|chr11 ( 640) 435 74.5 4.7e-13
CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 967) 427 73.6 1.3e-12
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 416 72.0 3.9e-12
CCDS34969.1 LRRC24 gene_id:441381|Hs108|chr8 ( 513) 407 70.4 6.4e-12
CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1119) 407 70.8 1e-11
CCDS55602.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 642) 383 67.1 7.7e-11
CCDS573.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 661) 383 67.1 7.9e-11
>>CCDS30855.1 LINGO4 gene_id:339398|Hs108|chr1 (593 aa)
initn: 4009 init1: 4009 opt: 4009 Z-score: 3080.1 bits: 579.9 E(32554): 3.1e-165
Smith-Waterman score: 4009; 100.0% identity (100.0% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLLLPGGSGGSCPAVCDCTSQPQAVLCGHRQLEAVPGGLPL
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CCDS30 MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLLLPGGSGGSCPAVCDCTSQPQAVLCGHRQLEAVPGGLPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 DTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQSLLTLRLQGNRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQSLLTLRLQGNRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLVFVAPGAFAGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLVFVAPGAFAGLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQLKELEIHLWPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQLKELEIHLWPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LEALDPGSLVGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPISAIPARRLSPLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LEALDPGSLVGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPISAIPARRLSPLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 RLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDKLVTLRLSGNPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDKLVTLRLSGNPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 TCDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFTCKPALIRKSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TCDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFTCKPALIRKSGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 RWVIAEEGGHAVFSCSGDGDPAPTVSWMRPHGAWLGRAGRVRVLEDGTLEIRSVQLRDRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RWVIAEEGGHAVFSCSGDGDPAPTVSWMRPHGAWLGRAGRVRVLEDGTLEIRSVQLRDRG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 AYVCVVSNVAGNDSLRTWLEVIQVEPPNGTLSDPNITVPGIPGPFFLDSRGVAMVLAVGF
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CCDS30 AYVCVVSNVAGNDSLRTWLEVIQVEPPNGTLSDPNITVPGIPGPFFLDSRGVAMVLAVGF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB9 LPFLTSVTLCFGLIALWSKGKGRVKHHMTFDFVAPRPSGDKNSGGNRVTAKLF
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CCDS30 LPFLTSVTLCFGLIALWSKGKGRVKHHMTFDFVAPRPSGDKNSGGNRVTAKLF
550 560 570 580 590
>>CCDS45905.1 LINGO3 gene_id:645191|Hs108|chr19 (592 aa)
initn: 1855 init1: 1276 opt: 1524 Z-score: 1180.6 bits: 228.5 E(32554): 1.9e-59
Smith-Waterman score: 1524; 44.8% identity (70.1% similar) in 581 aa overlap (16-587:11-585)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLLLPGGSGGSCPAVCDCTSQPQAVLCGHRQLEAVPGGLPL
:::.: : .:: ::: :.:: : .:: : .:.: ::: :.:
CCDS45 MTCWLCVLSLPLLLLPAAPPPAGG-CPARCECTVQTRAVACTRRRLTAVPDGIPA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 DTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQSLLTLRLQGNRL
.:.::.:: ::. :. : :. : :.::::: : .. .::::: .: : .:::.::.:
CCDS45 ETRLLELSRNRIRCLNPGDLAALPALEELDLSENAIAHVEPGAFANLPRLRVLRLRGNQL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLVFVAPGAFAGLA
... ::::. :. :::::: :..:..:: .: .: ::..:::::: ::::. :::::
CCDS45 KLIPPGVFTRLDNLTLLDLSENKLVILLDYTFQDLHSLRRLEVGDNDLVFVSRRAFAGLL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQLKELEIHLWPS
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CCDS45 ALEELTLERCNLTALSGESLGHLRSLGALRLRHLAIASLEDQNFRRLPGLLHLEIDNWPL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LEALDPGSLVGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPISAIPARRLSPLV
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CCDS45 LEEVAAGSLRGLNLTSLSVTHTNITAVPAAALRHQAHLTCLNLSHNPISTVPRGSFRDLV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 RLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDKLVTLRLSGNPL
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CCDS45 RLRELHLAGALLAVVEPQAFLGLRQIRLLNLSNNLLSTLEESTFHSVNTLETLRVDGNPL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 TCDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFTCKPALIRKSGP
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CCDS45 ACDCRLLWIVQRRKTLNFDGRLPACATPAEVRGDALRNLPDSVLFEYFVCRKPKIRERRL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KB9 RWVIAEEGGHAVFSCSGDGDPAPTVSWMRPHGAWLG--RAGRVRVLEDGTLEIRSVQLRD
. : : : . : : ..:.:::::.:. :. . :::.::: :::::.... .:
CCDS45 QRVTATAGEDVRFLCRAEGEPAPTVAWVTPQHRPVTATSAGRARVLPGGTLEIQDARPQD
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 RGAYVCVVSNVAGNDSLRTWLEVIQVEPPNGTLSDP----NITVPGIPGPFFLDSRGVAM
:.:.::.::..::: :.. .. :.: .. : : :. .. .: :: . .
CCDS45 SGTYTCVASNAGGND---TYFATLTVRPEPAANRTPGEAHNETLAALRAP--LDLTTILV
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 VLAVGFLPFLTSVTLCFGLIALWSKGKGRVKHHMTFDFVAPR---PSGDKNSGGNRVTAK
:.: . :: : .:: :. .::.:.:. :.... .. . :.. ..:: :
CCDS45 STAMGCITFLGVVLFCFVLLFVWSRGRGQHKNNFSVEYSFRKVDGPAAAAGQGGARKFNM
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 LF
CCDS45 KMI
590
>>CCDS73766.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 (614 aa)
initn: 1608 init1: 1326 opt: 1491 Z-score: 1155.2 bits: 223.8 E(32554): 5e-58
Smith-Waterman score: 1621; 43.8% identity (72.1% similar) in 592 aa overlap (5-578:8-596)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLL--LPGGSGGSCPAVCDCTSQPQAVLCGHRQLEAVP
. :. : :.:.:.: . .::. .:: :.:..: .:::: .... :::
CCDS73 MLAGGVRSMPSPLLACWQPILLLVLGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVLCHRKRFVAVP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 GGLPLDTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQSLLTLRL
:.: .:.::::. ::. :.: .. . :.::.:. : .:..:::::..: .: :: :
CCDS73 EGIPTETRLLDLGKNRIKTLNQDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFNNLFNLRTLGL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 QGNRLRIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLVFVAPGA
..:::... :::.::: :: ::. :.::..:: : .: .:..:::::: ::... :
CCDS73 RSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGDNDLVYISHRA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 FAGLAKLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQLKELEI
:.:: .: ::::.:::...: ::..: .:..::::.:.:. . ... : .:: :::
CCDS73 FSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSFKRLYRLKVLEI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 HLWPSLEALDPGSLVGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPISAIPARR
:: :... :. : ::::.::.::.:::..::. :. :: .:: :.:: ::::.: .
CCDS73 SHWPYLDTMTPNCLYGLNLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLSYNPISTIEGSM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 LSPLVRLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDKLVTLRL
: :.::::..: :. :. . .::.::. ...:.:. : : ::::..: : .: :: :
CCDS73 LHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVFHSVGNLETLIL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 SGNPLTCDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFTCKPALI
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CCDS73 DSNPLACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQQPTCATPEFVQGKEFKDFPDVLLPNYFTCRRARI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 RKSGPRWVIAEEGGHAVFSCSGDGDPAPTVSWMRP--HGAWLGRAGRVRVLEDGTLEIRS
: . :...:: . : : .:::: :.. :. : : . ::. :. :::::.:
CCDS73 RDRKAQQVFVDEGHTVQFVCRADGDPPPAILWLSPRKHLVSAKSNGRLTVFPDGTLEVRY
430 440 450 460 470 480
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pF1KB9 VQLRDRGAYVCVVSNVAGNDSLRTWLEVIQVEP-----PNGTLS---------DPNITVP
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CCDS73 AQVQDNGTYLCIAANAGGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFAFISNQPGEGEANSTRA
490 500 510 520 530 540
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pF1KB9 GIPGPFFLDSRGVAMVLAVGFLPFLTSVTLCFGLIALWSKGKGRVKHHMTFDFVAPRPSG
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CCDS73 TVPFPF--DIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNTKHNIEIEYV-PRKSD
550 560 570 580 590
580 590
pF1KB9 DKNSGGNRVTAKLF
CCDS73 AGISSADAPRKFNMKMI
600 610
>>CCDS45313.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 (620 aa)
initn: 1608 init1: 1326 opt: 1491 Z-score: 1155.2 bits: 223.8 E(32554): 5.1e-58
Smith-Waterman score: 1621; 43.8% identity (72.1% similar) in 592 aa overlap (5-578:14-602)
10 20 30 40
pF1KB9 MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLL--LPGGSGGSCPAVCDCTSQPQAVLCGHR
. :. : :.:.:.: . .::. .:: :.:..: .:::: ..
CCDS45 MQVSKRMLAGGVRSMPSPLLACWQPILLLVLGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVLCHRK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 QLEAVPGGLPLDTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQS
.. ::: :.: .:.::::. ::. :.: .. . :.::.:. : .:..:::::..: .
CCDS45 RFVAVPEGIPTETRLLDLGKNRIKTLNQDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFNNLFN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 LLTLRLQGNRLRIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLV
: :: :..:::... :::.::: :: ::. :.::..:: : .: .:..:::::: ::
CCDS45 LRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGDNDLV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 FVAPGAFAGLAKLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQ
... ::.:: .: ::::.:::...: ::..: .:..::::.:.:. . ... : .
CCDS45 YISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSFKRLYR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 LKELEIHLWPSLEALDPGSLVGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPIS
:: ::: :: :... :. : ::::.::.::.:::..::. :. :: .:: :.:: ::::
CCDS45 LKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGLNLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLSYNPIS
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 AIPARRLSPLVRLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDK
.: . : :.::::..: :. :. . .::.::. ...:.:. : : ::::..: : .
CCDS45 TIEGSMLHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVFHSVGN
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 LVTLRLSGNPLTCDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFT
: :: :..:::.:::::::..: : .:.:. . :.:: :. :::: .:.: :.: :..::
CCDS45 LETLILDSNPLACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQQPTCATPEFVQGKEFKDFPDVLLPNYFT
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 CKPALIRKSGPRWVIAEEGGHAVFSCSGDGDPAPTVSWMRP--HGAWLGRAGRVRVLEDG
:. : :: . :...:: . : : .:::: :.. :. : : . ::. :. ::
CCDS45 CRRARIRDRKAQQVFVDEGHTVQFVCRADGDPPPAILWLSPRKHLVSAKSNGRLTVFPDG
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510
pF1KB9 TLEIRSVQLRDRGAYVCVVSNVAGNDSLRTWLEVIQVEP-----PNGTLS---------D
:::.: .:..: :.:.:...:..::::. . :.: . : :: :.. .
CCDS45 TLEVRYAQVQDNGTYLCIAANAGGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFAFISNQPGEGE
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 PNITVPGIPGPFFLDSRGVAMVLAVGFLPFLTSVTLCFGLIALWSKGKGRVKHHMTFDFV
: : .: :: : . . .. ..::. :: : .:. :. :::.::: .::.. ...:
CCDS45 ANSTRATVPFPF--DIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNTKHNIEIEYV
550 560 570 580 590
580 590
pF1KB9 APRPSGDKNSGGNRVTAKLF
:: :
CCDS45 -PRKSDAGISSADAPRKFNMKMI
600 610 620
>>CCDS6524.1 LINGO2 gene_id:158038|Hs108|chr9 (606 aa)
initn: 1623 init1: 1304 opt: 1463 Z-score: 1133.9 bits: 219.8 E(32554): 7.8e-57
Smith-Waterman score: 1568; 43.7% identity (71.0% similar) in 586 aa overlap (11-584:9-588)
10 20 30 40 50 60
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: :. : .:.. :.. : ::: :.:..: ..: : .:.: :.: :.:.
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10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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.:..:::: ::: ... . ::.:.::: : ....:::::..: .: .:::.::::
CCDS65 ETKILDLSKNRLKSVNPEEFISYPLLEEIDLSDNIIANVEPGAFNNLFNLRSLRLKGNRL
60 70 80 90 100 110
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... :::.::: :: ::. :.::..:: : .: .:..:::::: ::... ::.::
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120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
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.: ::::.:::..:: ::..: .:..:.:..:.:. .:. :.. : .::.::: ::
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:. . .:: ::::.::..: :::.::: :. :: .: :.:: ::::.: : .: :.
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:::::.. :: : .: :.:.:: ...:.:..: :.::::..: :: : .: ...:::
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.:::::::.:. . :.:: . : :::: .. .:.:.: . .:::: ::..
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. ....:: . . ::.:::: :..::. :. .. ::. :: ::::::: .: .:
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: :::..::.::::.. . : : . : : :. .:. . : ::
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. . . :.: . :: : .:: :. .::.:::. :. . ...: :: ::.:
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590
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CCDS65 GEVAGPRRFNMKMI
600
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:...:..::.::. . . . :. . :: .. :..: .:..:: ::
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CCDS46 RRLVAAELTSNSVLIRWPAQRPVPGIRMYQVQYNSSVDDSLVYRMIPSTSQTFLVNDLAA
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: : : :
CCDS33 LSLHTNALQDLDGNVFRMLANLQNISLQNNRLRQLPGNIFANVNGLMAIQLQNNQLENLP
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Smith-Waterman score: 468; 29.7% identity (60.3% similar) in 350 aa overlap (19-360:12-359)
10 20 30 40 50
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CCDS46 MPLDKAMPLKHYLLLLVGCQAWGAGLAYHGCPSECTCSRASQ-VECTGARIVA
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: .:.:... :.:.::..: : : ::.. . . :.. ..:..:.. ::: ..
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::: :. :. :.: . .:. . .. .: : .::: : . .: :.. :: .:.::
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..:. :.:: : ..:. ..: .: ...: .. : .. . :: . .:
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CCDS53 PHTFTGLSGLRRLFLKDNGLVGIEEQSLWGLAELLELDLTSNQLTHLPHRLFQGLGKLEY
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CCDS53 LLLSRNRLAELPADALGPLQRAFWLDVSHNRLEALPNSLLAPLGRLRYLSLRNNSLRTFT
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593 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]