FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9624, 358 aa
1>>>pF1KB9624 358 - 358 aa - 358 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6568+/-0.000757; mu= 13.6827+/- 0.046
mean_var=162.7836+/-33.541, 0's: 0 Z-trim(115.2): 47 B-trim: 986 in 2/50
Lambda= 0.100524
statistics sampled from 15695 (15743) to 15695 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.797), E-opt: 0.2 (0.484), width: 16
Scan time: 3.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46132.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 ( 358) 2357 353.0 2.3e-97
CCDS74406.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 ( 375) 1384 211.9 7e-55
CCDS33064.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 ( 421) 979 153.2 3.6e-37
CCDS45220.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 306) 969 151.6 8e-37
CCDS42014.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 381) 969 151.7 9.3e-37
CCDS45218.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 394) 969 151.8 9.5e-37
CCDS46309.1 MEIS1 gene_id:4211|Hs108|chr2 ( 390) 953 149.4 4.7e-36
CCDS10045.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 470) 910 143.3 4e-34
CCDS45219.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 388) 882 139.1 5.9e-33
CCDS45217.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 401) 882 139.2 6e-33
CCDS10044.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 477) 882 139.2 6.8e-33
>>CCDS46132.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 (358 aa)
initn: 2357 init1: 2357 opt: 2357 Z-score: 1861.6 bits: 353.0 E(32554): 2.3e-97
Smith-Waterman score: 2357; 94.1% identity (97.8% similar) in 358 aa overlap (1-358:1-358)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MARRYDELPHYPSIADGPAALAGFPEAVPAAPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKRDKDEI
::::::::::::.:.:::::::.:::.:::.::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS46 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGDVCSSDSFNEDNTAFAKQVRSER
:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::: .::::::::::
CCDS46 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 PFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKGKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCLSLP
:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS46 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKGKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 DQNNIWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGVGLDTSVASPSSGGEDEDLD
::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS46 DQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 QEPRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLWHPYPSEEQKKQLVQDTGLTILQVNNWFINAR
:: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS46 QERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINAR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB9 RRMVQPMIDQSNRIGQGAAFSPEGQPIGGYTETEPHVAFRPPASVGMSLNLEGEWHYL
::.:::::::::: :::::::::::::::::::.:::: :::.:::::::::::::::
CCDS46 RRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPGSVGMSLNLEGEWHYL
310 320 330 340 350
>>CCDS74406.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 (375 aa)
initn: 1384 init1: 1384 opt: 1384 Z-score: 1098.8 bits: 211.9 E(32554): 7e-55
Smith-Waterman score: 2313; 89.9% identity (93.3% similar) in 375 aa overlap (1-358:1-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MARRYDELPHYPSIADGPAALAGFPEAVPAAPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKRDKDEI
::::::::::::.:.:::::::.:::.:::.::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS74 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGDVCSSDSFNEDNTAFAKQVRSER
:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::: .::::::::::
CCDS74 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160
pF1KB9 PFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-----------------GKMPIDLVIEDRDG
:.::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS74 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHDLCDNFCHRYITCLKGKMPIDLVIEDRDG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 GCREDFEDYPASCLSLPDQNNIWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGVGL
::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS74 GCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 DTSVASPSSGGEDEDLDQEPRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLWHPYPSEEQKKQLVQ
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::.:
CCDS74 DTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQ
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 DTGLTILQVNNWFINARRRMVQPMIDQSNRIGQGAAFSPEGQPIGGYTETEPHVAFRPPA
:::::::::::::::::::.:::::::::: :::::::::::::::::::.:::: :::.
CCDS74 DTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPG
310 320 330 340 350 360
350
pF1KB9 SVGMSLNLEGEWHYL
:::::::::::::::
CCDS74 SVGMSLNLEGEWHYL
370
>>CCDS33064.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 (421 aa)
initn: 1577 init1: 979 opt: 979 Z-score: 780.7 bits: 153.2 E(32554): 3.6e-37
Smith-Waterman score: 2017; 79.5% identity (82.3% similar) in 390 aa overlap (1-327:1-390)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MARRYDELPHYPSIADGPAALAGFPEAVPAAPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKRDKDEI
::::::::::::.:.:::::::.:::.:::.::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS33 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGDVCSSDSFNEDNTAFAKQVRSER
:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::: .::::::::::
CCDS33 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160
pF1KB9 PFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-----------------GKMPIDLVIEDRDG
:.::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS33 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHDLCDNFCHRYITCLKGKMPIDLVIEDRDG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 GCREDFEDYPASCLSLPDQNNIWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGVGL
::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS33 GCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260
pF1KB9 DTSVASPSSGGEDEDLDQEPRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHL---------------
::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSRRSEAPVLPDVCLG
250 260 270 280 290 300
270 280 290
pF1KB9 ---------W----------------------HPYPSEEQKKQLVQDTGLTILQVNNWFI
: ::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS33 LGSPSPGPRWARPWGSDCGRPGRQSDSCWWLQHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFI
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 NARRRMVQPMIDQSNRIGQGAAFSPEGQPIGGYTETEPHVAFRPPASVGMSLNLEGEWHY
:::::.:::::::::: :::::::::::::
CCDS33 NARRRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPGSVGMSLNLEGEWHY
370 380 390 400 410 420
>>CCDS45220.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (306 aa)
initn: 793 init1: 638 opt: 969 Z-score: 774.6 bits: 151.6 E(32554): 8e-37
Smith-Waterman score: 1322; 65.9% identity (82.8% similar) in 314 aa overlap (69-358:1-306)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 RPPQPLPPGLDSDGLKRDKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGD
.::::::::::::.::. . : :::
CCDS45 MALVFEKCELATCTPREPGVA------GGD
10 20
100 110 120 130 140
pF1KB9 VCSSDSFNEDNTAFAKQVRSERPFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK---------
:::::::::: ..::::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VCSSDSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFC
30 40 50 60 70 80
150 160 170 180 190
pF1KB9 --------GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCLSLPDQN-NIWIRDHEDSGSVH-LG
:::::::::..:::. . : :. .: .: :.: . : :::.:. :.: :
CCDS45 HRYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAG
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 TPGPSSGGLASQSGDNSSDQGVGLDTSVASPSSGGEDEDLDQEPRRNKKRGIFPKVATNI
:::::::: :::::::::.:: :::.:::::..: .:.: :.. .:.:::::::::::::
CCDS45 TPGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNI
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 MRAWLFQHLWHPYPSEEQKKQLVQDTGLTILQVNNWFINARRRMVQPMIDQSNR-IGQGA
::::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::: ..:::
CCDS45 MRAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGA
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350
pF1KB9 AFSPEGQPIGGYT-ETEPHVAFRP--PAS-VGMSLNLEGEWHYL
:.::::::.:... . . :...:: : : .::.....:.:::.
CCDS45 AYSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
270 280 290 300
>>CCDS42014.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (381 aa)
initn: 953 init1: 638 opt: 969 Z-score: 773.4 bits: 151.7 E(32554): 9.3e-37
Smith-Waterman score: 1481; 62.7% identity (78.3% similar) in 383 aa overlap (18-358:7-381)
10 20 30 40
pF1KB9 MARRYDELPHYPSIADGPAALAGFPEAV-PAAP------GP-------YGPHRP-PQPLP
::.. : :.: : : :: :: : : :. .:
CCDS42 MDGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPNVMP
10 20 30 40
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 PGLDS---DGLKRDKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGDVCSS
.. : :.:::::: ::::::::::::::::::::::.::. . :: ::::::
CCDS42 ASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAG------GDVCSS
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140
pF1KB9 DSFNEDNTAFAKQVRSERPFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-------------
:::::: ..::::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYI
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 ----GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCLSLPDQN-NIWIRDHEDSGSVH-LGTPGP
:::::::::..:::. . : :. .: .: :.: . : :::.:. :.: :::::
CCDS42 SCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGTPGP
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 SSGGLASQSGDNSSDQGVGLDTSVASPSSGGEDEDLDQEPRRNKKRGIFPKVATNIMRAW
:::: :::::::::.:: :::.:::::..: .:.: :.. .:.:::::::::::::::::
CCDS42 SSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAW
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 LFQHLWHPYPSEEQKKQLVQDTGLTILQVNNWFINARRRMVQPMIDQSNR-IGQGAAFSP
::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::: ..::::.::
CCDS42 LFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAAYSP
290 300 310 320 330 340
330 340 350
pF1KB9 EGQPIGGYT-ETEPHVAFRP--PAS-VGMSLNLEGEWHYL
::::.:... . . :...:: : : .::.....:.:::.
CCDS42 EGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
350 360 370 380
>>CCDS45218.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (394 aa)
initn: 1014 init1: 638 opt: 969 Z-score: 773.2 bits: 151.8 E(32554): 9.5e-37
Smith-Waterman score: 1544; 62.5% identity (78.2% similar) in 403 aa overlap (1-358:1-394)
10 20 30 40
pF1KB9 MARRYDELPHYPSIADG---PAALAGFPEAV-PAAP------GP-------YGPHRP-PQ
::.:::::::: .. :: ::.. : :.: : : :: :: : : :.
CCDS45 MAQRYDELPHYGGM-DGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPN
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KB9 PLPPGLDS---DGLKRDKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGDV
.: .. : :.:::::: ::::::::::::::::::::::.::. . :: :::
CCDS45 VMPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAG------GDV
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KB9 CSSDSFNEDNTAFAKQVRSERPFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK----------
::::::::: ..::::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CSSDSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCH
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 -------GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCLSLPDQN-NIWIRDHEDSGSVH-LGT
:::::::::..:::. . : :. .: .: :.: . : :::.:. :.: ::
CCDS45 RYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGT
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 PGPSSGGLASQSGDNSSDQGVGLDTSVASPSSGGEDEDLDQEPRRNKKRGIFPKVATNIM
::::::: :::::::::.:: :::.:::::..: .:.: :.. .:.::::::::::::::
CCDS45 PGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIM
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310
pF1KB9 RAWLFQHLWHPYPSEEQKKQLVQDTGLTILQVNNWFINARRRMVQPMIDQSNR-IGQGAA
:::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::: ..::::
CCDS45 RAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAA
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350
pF1KB9 FSPEGQPIGGYT-ETEPHVAFRP--PAS-VGMSLNLEGEWHYL
.::::::.:... . . :...:: : : .::.....:.:::.
CCDS45 YSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
360 370 380 390
>>CCDS46309.1 MEIS1 gene_id:4211|Hs108|chr2 (390 aa)
initn: 1238 init1: 489 opt: 953 Z-score: 760.8 bits: 149.4 E(32554): 4.7e-36
Smith-Waterman score: 1490; 59.8% identity (78.2% similar) in 400 aa overlap (1-358:1-390)
10 20 30 40
pF1KB9 MARRYDELPHYPSIADG---PAALAGFPEAV----PAAPGPYGP----HRPPQP-----L
::.:::.:::: .. :: :... : :.:. :. .:: :. :. .
CCDS46 MAQRYDDLPHYGGM-DGVGIPSTMYGDPHAARSMQPVHHLNHGPPLHSHQYPHTAHTNAM
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 PPGLDS---DGLKRDKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGDVCS
:.. : :.:::::: ::::::::::::.:::::::::.::. . :: :::::
CCDS46 APSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAG------GDVCS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140
pF1KB9 SDSFNEDNTAFAKQVRSERPFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK------------
:.::::: ..::::.:.:.:.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SESFNEDIAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRY
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 -----GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCLSLPDQNNIWIRDHEDSGSVHLG-TPGP
:::::::::.::.:: . : :: : .: :: . : :::.:..:.. : ::::
CCDS46 ISCLKGKMPIDLVIDDREGGSKSDSEDITRSA-NLTDQPS-WNRDHDDTASTRSGGTPGP
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 SSGGLASQSGDNSSDQGVGLDTSVASPSSGGEDEDLDQEPRRNKKRGIFPKVATNIMRAW
:::: .:.::::::.:: :::.::::::.: .:.: :.. .:.:::::::::::::::::
CCDS46 SSGGHTSHSGDNSSEQGDGLDNSVASPSTG-DDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAW
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 LFQHLWHPYPSEEQKKQLVQDTGLTILQVNNWFINARRRMVQPMIDQSNR-IGQGAAFSP
::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::: ..::. ..:
CCDS46 LFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGTPYNP
300 310 320 330 340 350
330 340 350
pF1KB9 EGQPIGGYT-ETEPHVAFRPP---ASVGMSLNLEGEWHYL
.:::.::.. . . :...: : ...::....::.:::.
CCDS46 DGQPMGGFVMDGQQHMGIRAPGPMSGMGMNMGMEGQWHYM
360 370 380 390
>>CCDS10045.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (470 aa)
initn: 940 init1: 638 opt: 910 Z-score: 726.1 bits: 143.3 E(32554): 4e-34
Smith-Waterman score: 1485; 63.7% identity (78.1% similar) in 383 aa overlap (1-341:1-374)
10 20 30 40
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::.:::::::: .. :: ::.. : :.: : : :: :: : : :.
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10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
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.: .. : :.:::::: ::::::::::::::::::::::.::. . : ::::
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100 110 120 130 140
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::::::::: ..::::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::
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120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
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:::::::::..:::. . : :. .: .: :.: . : :::.:. :.: ::
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210 220 230 240 250 260
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::::::: :::::::::.:: :::.:::::..: .:.: :.. .:.::::::::::::::
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270 280 290 300 310
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:::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::: ..::::
CCDS10 RAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAA
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320 330 340 350
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.::::::.:... . . :...::
CCDS10 YSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGLQSMPGDYVSQGGPMGMSMAQPSYTPPQMTPHPTQ
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::.. : :.: : : :: :: : : :. .:
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.. : :.:::::: ::::::::::::::::::::::.::. . :: ::::::
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:::::::::..:::. . : :. .: .: :.: . : :::.:. :.: :::::
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210 220 230 240 250 260
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:::: :::::::::.:: :::.:::::..: .:.: :.. .:.:::::::::::::::::
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270 280 290 300 310
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::::.::::::.:... . . :...:: : : .::.....:.:::.
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>>CCDS45217.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (401 aa)
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10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
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.: .. : :.:::::: ::::::::::::::::::::::.::. . :: :::
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60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KB9 CSSDSFNEDNTAFAKQVRSERPFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK----------
::::::::: ..::::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CSSDSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCH
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 -------GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCLSLPDQN-NIWIRDHEDSGSVH-LGT
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CCDS45 RYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGT
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
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270 280 290 300 310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]