Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9621
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9621, 684 aa
1>>>pF1KB9621 684 - 684 aa - 684 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0204+/-0.00091; mu= 15.4549+/- 0.054
mean_var=71.3147+/-14.585, 0's: 0 Z-trim(106.2): 140 B-trim: 491 in 1/49
Lambda= 0.151874
statistics sampled from 8686 (8839) to 8686 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16
Scan time: 2.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9377.1 KBTBD7 gene_id:84078|Hs108|chr13 ( 684) 4630 1024.0 0
CCDS9376.1 KBTBD6 gene_id:89890|Hs108|chr13 ( 674) 4153 919.5 0
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7 ( 623) 546 129.2 1.8e-29
CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3 ( 601) 521 123.7 7.8e-28
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 470 112.5 1.8e-24
CCDS2234.1 KLHL41 gene_id:10324|Hs108|chr2 ( 606) 465 111.4 3.9e-24
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 462 110.8 6.1e-24
CCDS33848.2 KBTBD12 gene_id:166348|Hs108|chr3 ( 623) 460 110.3 8.5e-24
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 434 104.6 4.5e-22
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 431 104.0 6.5e-22
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 431 104.0 6.6e-22
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 418 101.1 4.6e-21
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 400 97.2 7.3e-20
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 400 97.2 7.7e-20
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 397 96.5 1.2e-19
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 392 95.4 2.3e-19
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 391 95.2 2.9e-19
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 386 94.1 6.4e-19
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 382 93.2 1.1e-18
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 378 92.4 2e-18
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 378 92.4 2.1e-18
CCDS2236.1 KLHL23 gene_id:151230|Hs108|chr2 ( 558) 376 91.9 2.7e-18
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 366 89.7 1.3e-17
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 362 88.9 2.4e-17
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 362 88.9 2.4e-17
CCDS8334.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11 ( 612) 362 88.9 2.4e-17
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 362 88.9 2.5e-17
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 353 86.9 8.9e-17
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 352 86.6 9.9e-17
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 353 86.9 1.1e-16
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 353 86.9 1.2e-16
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 350 86.2 1.5e-16
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 346 85.3 2.6e-16
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 344 84.9 3.7e-16
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 343 84.7 4.4e-16
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 335 82.9 1.5e-15
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 620) 332 82.3 2.3e-15
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 329 81.6 3.5e-15
CCDS11411.1 KLHL11 gene_id:55175|Hs108|chr17 ( 708) 329 81.6 4.2e-15
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 329 81.6 4.2e-15
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 329 81.6 4.2e-15
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 328 81.4 4.3e-15
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 328 81.4 4.4e-15
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 328 81.4 4.5e-15
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 328 81.4 4.5e-15
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 328 81.4 4.8e-15
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 326 81.0 6.9e-15
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 322 80.1 1.5e-14
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 315 78.5 2.6e-14
CCDS2703.1 KLHL40 gene_id:131377|Hs108|chr3 ( 621) 316 78.8 2.7e-14
>>CCDS9377.1 KBTBD7 gene_id:84078|Hs108|chr13 (684 aa)
initn: 4630 init1: 4630 opt: 4630 Z-score: 5478.0 bits: 1024.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4630; 100.0% identity (100.0% similar) in 684 aa overlap (1-684:1-684)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MQSREDVPRSRRLASPRGGRRPKRISKPSVSAFFTGPEELKDTAHSAALLAQLKSFYDAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MQSREDVPRSRRLASPRGGRRPKRISKPSVSAFFTGPEELKDTAHSAALLAQLKSFYDAR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LLCDVTIEVVTPGSGPGTGRLFSCNRNVLAAACPYFKSMFTGGMYESQQASVTMHDVDAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 LLCDVTIEVVTPGSGPGTGRLFSCNRNVLAAACPYFKSMFTGGMYESQQASVTMHDVDAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SFEVLVDYCYTGRVSLSEANVQRLYAASDMLQLEYVREACASFLARRLDLTNCTAILKFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SFEVLVDYCYTGRVSLSEANVQRLYAASDMLQLEYVREACASFLARRLDLTNCTAILKFA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 DAFDHHKLRSQAQSYIAHNFKQLSRMGSIREETLADLTLAQLLAVLRLDSLDIESERTVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DAFDHHKLRSQAQSYIAHNFKQLSRMGSIREETLADLTLAQLLAVLRLDSLDIESERTVC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 HVAVQWLEAAAKERGPSAAEVFKCVRWMHFTEEDQDYLEGLLTKPIVKKYCLDVIEGALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 HVAVQWLEAAAKERGPSAAEVFKCVRWMHFTEEDQDYLEGLLTKPIVKKYCLDVIEGALQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 MRYGDLLYKSLVPVPNSSSSSSSSNSLVSAAENPPQRLGMCAKEMVIFFGHPRDPFLCYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MRYGDLLYKSLVPVPNSSSSSSSSNSLVSAAENPPQRLGMCAKEMVIFFGHPRDPFLCYD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 PYSGDIYTMPSPLTSFAHTKTVTSSAVCVSPDHDIYLAAQPRKDLWVYKPAQNSWQQLAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 PYSGDIYTMPSPLTSFAHTKTVTSSAVCVSPDHDIYLAAQPRKDLWVYKPAQNSWQQLAD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 RLLCREGMDVAYLNGYIYILGGRDPITGVKLKEVECYSVQRNQWALVAPVPHSFYSFELI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 RLLCREGMDVAYLNGYIYILGGRDPITGVKLKEVECYSVQRNQWALVAPVPHSFYSFELI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 VVQNYLYAVNSKRMLCYDPSHNMWLNCASLKRSDFQEACVFNDEIYCICDIPVMKVYNPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 VVQNYLYAVNSKRMLCYDPSHNMWLNCASLKRSDFQEACVFNDEIYCICDIPVMKVYNPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 RGEWRRISNIPLDSETHNYQIVNHDQKLLLITSTTPQWKKNRVTVYEYDTREDQWINIGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 RGEWRRISNIPLDSETHNYQIVNHDQKLLLITSTTPQWKKNRVTVYEYDTREDQWINIGT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 MLGLLQFDSGFICLCARVYPSCLEPGQSFITEEDDARSESSTEWDLDGFSELDSESGSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MLGLLQFDSGFICLCARVYPSCLEPGQSFITEEDDARSESSTEWDLDGFSELDSESGSSS
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KB9 SFSDDEVWVQVAPQRNAQDQQGSL
::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SFSDDEVWVQVAPQRNAQDQQGSL
670 680
>>CCDS9376.1 KBTBD6 gene_id:89890|Hs108|chr13 (674 aa)
initn: 4153 init1: 4153 opt: 4153 Z-score: 4913.2 bits: 919.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4153; 89.8% identity (96.7% similar) in 674 aa overlap (1-674:1-674)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MQSREDVPRSRRLASPRGGRRPKRISKPSVSAFFTGPEELKDTAHSAALLAQLKSFYDAR
::::::.::::::::::::.:::.: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MQSREDAPRSRRLASPRGGKRPKKIHKPTVSAFFTGPEELKDTAHSAALLAQLKSFYDAR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LLCDVTIEVVTPGSGPGTGRLFSCNRNVLAAACPYFKSMFTGGMYESQQASVTMHDVDAE
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 LLCDVTIEVVTPGSGPGTGRLFPCNRNVLAAACPYFKSMFTGGMYESQQASVTMHDVDAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SFEVLVDYCYTGRVSLSEANVQRLYAASDMLQLEYVREACASFLARRLDLTNCTAILKFA
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SFEVLVDYCYTGRVSLSEANVERLYAASDMLQLEYVREACASFLARRLDLTNCTAILKFA
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190 200 210 220 230 240
pF1KB9 DAFDHHKLRSQAQSYIAHNFKQLSRMGSIREETLADLTLAQLLAVLRLDSLDIESERTVC
::: :.:::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::.:::
CCDS93 DAFGHRKLRSQAQSYIAQNFKQLSHMGSIREETLADLTLAQLLAVLRLDSLDVESEQTVC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 HVAVQWLEAAAKERGPSAAEVFKCVRWMHFTEEDQDYLEGLLTKPIVKKYCLDVIEGALQ
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 HVAVQWLEAAPKERGPSAAEVFKCVRWMHFTEEDQDYLEGLLTKPIVKKYCLDVIEGALQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 MRYGDLLYKSLVPVPNSSSSSSSSNSLVSAAENPPQRLGMCAKEMVIFFGHPRDPFLCYD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS93 MRYGDLLYKSLVPVPNSSSSSSSSNSLVSAAENPPQRLGMCAKEMVIFFGHPRDPFLCCD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 PYSGDIYTMPSPLTSFAHTKTVTSSAVCVSPDHDIYLAAQPRKDLWVYKPAQNSWQQLAD
:::::.: .::::: .:::.:::. :::.::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS93 PYSGDLYKVPSPLTCLAHTRTVTTLAVCISPDHDIYLAAQPRTDLWVYKPAQNSWQQLAD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 RLLCREGMDVAYLNGYIYILGGRDPITGVKLKEVECYSVQRNQWALVAPVPHSFYSFELI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::.:::: ::.:.
CCDS93 RLLCREGMDVAYLNGYIYILGGRDPITGVKLKEVECYNVKRNQWALVAPLPHSFLSFDLM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 VVQNYLYAVNSKRMLCYDPSHNMWLNCASLKRSDFQEACVFNDEIYCICDIPVMKVYNPA
:...::::.:::::.::::::::::.:.::::.:::::::::.::::::::::::::::.
CCDS93 VIRDYLYALNSKRMFCYDPSHNMWLKCVSLKRNDFQEACVFNEEIYCICDIPVMKVYNPV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 RGEWRRISNIPLDSETHNYQIVNHDQKLLLITSTTPQWKKNRVTVYEYDTREDQWINIGT
:.:::...:::: :::.::.:..: :::::::: ::::::::::::::: : ::::::::
CCDS93 RAEWRQMNNIPLVSETNNYRIIKHGQKLLLITSRTPQWKKNRVTVYEYDIRGDQWINIGT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 MLGLLQFDSGFICLCARVYPSCLEPGQSFITEEDDARSESSTEWDLDGFSELDSESGSSS
::::::::.:.:: ::::::::::::::.:::.. ::::::::: :::: ::::::::
CCDS93 TLGLLQFDSNFFCLSARVYPSCLEPGQSFLTEEEEIPSESSTEWDLGGFSEPDSESGSSS
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KB9 SFSDDEVWVQVAPQRNAQDQQGSL
:.:::. ::.::::
CCDS93 SLSDDDFWVRVAPQ
670
>>CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7 (623 aa)
initn: 663 init1: 294 opt: 546 Z-score: 642.5 bits: 129.2 E(32554): 1.8e-29
Smith-Waterman score: 752; 26.3% identity (56.3% similar) in 668 aa overlap (35-648:3-615)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 EDVPRSRRLASPRGGRRPKRISKPSVSAFFTGPEELKDTAHSAALLAQLKSFYDARLLCD
: :. .: ....:: ::: ::. .:. :
CCDS34 MSTQDERQINTEYAVSLLEQLKLFYEQQLFTD
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 VTIEVVTPGSGPGTGRLFSCNRNVLAAACPYFKSMFTGGMYESQQASVTMHDVDAESFEV
... : : : :.. :::. ::..:: .:. ::.:. : ...::: ....
CCDS34 IVLIV--------EGTEFPCHKMVLATCSSYFRAMFMSGLSESKQTHVHLRNVDAATLQI
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LVDYCYTGRVSLSEANVQRLYAASDMLQLEYVREACASFLARRLDLTNCTAILKFADAFD
.. : ::: .......:..:: .. .::.: : . : .: .... ::. .:.::: :.
CCDS34 IITYAYTGNLAMNDSTVEQLYETACFLQVEDVLQRCREYLIKKINAENCVRLLSFADLFS
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 HHKLRSQAQSYIAHNFKQLSRMGSIREETLADLTLAQLLAVLRLDSLDIESERTVCHVAV
..:...:. .. :.: . ..... .:. :. .: :.:..:.:.:: ..:.
CCDS34 CEELKQSAKRMVEHKFTAV-----YHQDAFMQLSHDLLIDILSSDNLNVEKEETVREAAM
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 QWLEAAAKERGPSAAEVFKCVRWMHFTEEDQD-YLEGLLTKPIVKKYCLDVIEGALQMRY
::: .. :. . :.. .: ..: : ...:: : :. :..:
CCDS34 LWLEYNTESRSQYLSSVLSQIRIDALSEVTQRAWFQGL--PPNDKSV---VVQG------
200 210 220 230 240
310 320 330 340 350
pF1KB9 GDLLYKSLVPVPNSSSSSSSSNSLVSAAENPPQRLGMCAKEMVIFF-GHPRDPF-----L
::::. :. . : :::: .::.::. . ..: .
CCDS34 ---LYKSM---PKFFK---------------P-RLGMTKEEMMIFIEASSENPCSLYSSV
250 260 270 280
360 370 380 390 400
pF1KB9 CYDPYSGDIYTMPSPLTSFAHTKTVTSSAVCVSPDHDIYLAAQ--PRKDL----------
::.: . .: . :: ... .. :: :.::.:::.:. : :.
CCDS34 CYSPQAEKVYKLCSPPADLHKVGTV------VTPDNDIYIAGGQVPLKNTKTNHSKTSKL
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450
pF1KB9 -----------WVYKPAQNSWQQLADRLLCREGMDVAYLNGYIYILGGRDPITG-VKLKE
: . ::.: . :. : ... .:::: .:: : . : .. .
CCDS34 QTAFRTVNCFYW-FDAQQNTWFPKTPMLFVRIKPSLVCCEGYIYAIGG-DSVGGELNRRT
350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 VECYSVQRNQWALVAPVPHSFYSFELIVVQNYLYAVNSKRMLCYDPSHNMWLNCASLKRS
:: :......:..:.:.: .. .::.. .:... . : :: : . :.. : . :
CCDS34 VERYDTEKDEWTMVSPLPCAWQWSAAVVVHDCIYVMTLNLMYCYFPRSDSWVEMAMRQTS
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550
pF1KB9 -DFQEACVFNDEIYCICDIPV-------------------MKVYNPARGEWRRISNIPLD
.: : .:.:.:. : . . ...:. ..::. .:::
CCDS34 RSFASAAAFGDKIFYIGGLHIATNSGIRLPSGTVDGSSVTVEIYDVNKNEWKMAANIPAK
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KB9 SETHN-YQIVNHDQKLLLITSTTPQWKKNRVTVYEYDTREDQWINIGTMLGLLQFDSG--
. . : ...: .. : .. . ..:.:: . :.: . . .: :
CCDS34 RYSDPCVRAVVISNSLCVFMRETHLNERAKYVTYQYDLELDRWSLRQHISERVLWDLGRD
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620 630 640 650 660 670
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CCDS13 RQTLEVINLLRKHRELCDVVLVV-------GAKKIYA-HRVILSACSPYFRAMFTGELAE
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CCDS13 SRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKR
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CCDS13 QLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEV-----MESEEFMLLPANQLIDII
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CCDS13 SSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPK---FLVGTVGSDP
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CCDS13 VER-----YDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNI--VERYD
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CCDS13 PKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMG
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CCDS13 TRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPV--VAMTSRRSGVGLAVV
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CCDS13 NGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDA--NTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW
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CCDS33 MECKIEGKEKYQHSLNLLNKIQNMKELAEMIDV---VLT---
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CCDS33 --AEGEKFPCHRLVLAAFSPYFKAMFTCGLLECNQREVILYDITAESVSVLLNYMYNAAL
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CCDS33 EINNANVQTVAMAAYFMQMEEVFSVCQKYMMDHMDASNCLGIYYFAKQIGAEDLSDRSKK
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CCDS33 YLYQHFAEVS----LHEEIL-EIEVHQFLTLIKSDDLNISREESILDLVLRWVNHNKELR
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