Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9614
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9614, 502 aa
1>>>pF1KB9614 502 - 502 aa - 502 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1593+/-0.00153; mu= 10.2582+/- 0.091
mean_var=224.3134+/-47.008, 0's: 0 Z-trim(104.8): 949 B-trim: 72 in 1/48
Lambda= 0.085634
statistics sampled from 7054 (8077) to 7054 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16
Scan time: 2.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 3557 453.5 2.6e-127
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1818 238.8 1.5e-62
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1791 235.4 1.3e-61
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1791 235.4 1.4e-61
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1782 234.3 3e-61
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1782 234.3 3.1e-61
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1782 234.3 3.1e-61
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1782 234.3 3.2e-61
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1781 234.2 3.5e-61
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1781 234.3 3.7e-61
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1773 233.0 5.6e-61
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1759 231.7 3e-60
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1759 231.8 3e-60
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1745 229.8 7.8e-60
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1738 228.7 1.1e-59
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1740 229.2 1.2e-59
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1738 228.8 1.2e-59
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1739 229.1 1.4e-59
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1739 229.1 1.4e-59
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1731 228.1 2.7e-59
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1720 226.7 6.6e-59
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1718 226.5 8e-59
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1715 226.1 1.1e-58
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1715 226.2 1.1e-58
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1710 225.3 1.3e-58
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1710 225.5 1.5e-58
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1706 225.2 2.8e-58
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1698 223.8 3.6e-58
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1691 223.2 8.6e-58
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1691 223.2 8.8e-58
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1691 223.2 8.8e-58
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1687 222.7 1.2e-57
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1686 222.7 1.4e-57
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 1682 221.9 1.5e-57
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 1682 221.9 1.5e-57
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1683 222.1 1.6e-57
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1683 222.2 1.6e-57
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1681 221.9 1.8e-57
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1681 221.9 1.8e-57
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1681 221.9 1.8e-57
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1680 221.7 1.9e-57
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1679 221.7 2.3e-57
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 1676 221.2 2.7e-57
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 1676 221.2 2.7e-57
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 1673 220.8 3.4e-57
CCDS47931.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 496) 1671 220.5 3.5e-57
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 1673 220.9 3.5e-57
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 1673 220.9 3.7e-57
CCDS34957.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 536) 1671 220.5 3.7e-57
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1671 220.6 4.3e-57
>>CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 (502 aa)
initn: 3557 init1: 3557 opt: 3557 Z-score: 2399.3 bits: 453.5 E(32554): 2.6e-127
Smith-Waterman score: 3557; 100.0% identity (100.0% similar) in 502 aa overlap (1-502:1-502)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGTENKEVIPKEEISEESEPHGSLLEKFPKVVYQGHEFGAGCEEDMLEGHSRESMEEVIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGTENKEVIPKEEISEESEPHGSLLEKFPKVVYQGHEFGAGCEEDMLEGHSRESMEEVIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 QMSPQERDFPSGLMIFKKSPSSEKDRENNESERGCSPSPNLVTHQGDTTEGVSAFATSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QMSPQERDFPSGLMIFKKSPSSEKDRENNESERGCSPSPNLVTHQGDTTEGVSAFATSGQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 NFLEILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFNQNSHLIQHMRVHSGEKPFECKECGKTFGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NFLEILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFNQNSHLIQHMRVHSGEKPFECKECGKTFGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NSSLRRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSHLIHHHRIHTGERPYKCEECGKAFSQNSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NSSLRRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSHLIHHHRIHTGERPYKCEECGKAFSQNSAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ILHQRIHTGEKPYECNECGKTFRVSSQLIQHQRIHTEERYHECNECGKAFKHSSGLIRHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ILHQRIHTGEKPYECNECGKTFRVSSQLIQHQRIHTEERYHECNECGKAFKHSSGLIRHQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KIHTGEKPYLCNECGKGFGQSSELIRHQRIHTGDKPYECNECGKTFGQNSEIIRHIRIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KIHTGEKPYLCNECGKGFGQSSELIRHQRIHTGDKPYECNECGKTFGQNSEIIRHIRIHT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 GEKPYVCKECGKAFRGNSELLRHERIHTGEKPYECFECGKAFRRTSHLIVHQRIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GEKPYVCKECGKAFRGNSELLRHERIHTGEKPYECFECGKAFRRTSHLIVHQRIHTGEKP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 HQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYECSECEKTFSQHSQLIIHQRIHTGEKPYECQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYECSECEKTFSQHSQLIIHQRIHTGEKPYECQ
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KB9 ECQKTFSRSSHLLRHQSVHCME
::::::::::::::::::::::
CCDS11 ECQKTFSRSSHLLRHQSVHCME
490 500
>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 (688 aa)
initn: 13766 init1: 1789 opt: 1818 Z-score: 1236.6 bits: 238.8 E(32554): 1.5e-62
Smith-Waterman score: 1818; 58.7% identity (79.0% similar) in 433 aa overlap (71-502:208-640)
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 GCEEDMLEGHSRESMEEVIEQMSPQERDFPSGLMIFKKSPSSEKDRENNESERGCSPSPN
: :.. .. ..:: . .: .. : .
CCDS12 RDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYKCEECGKAFIRSSQ
180 190 200 210 220 230
110 120 130 140 150
pF1KB9 LVTHQG-DTTEGVSAFATSGQNFLEILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFNQNSHLIQH
:. :: : : :. : . . . :: .::: . :::: :.:.: :.:: :
CCDS12 LTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTGEKLYECKECRKVFTQLSQLILH
240 250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 MRVHSGEKPFECKECGKTFGTNSSLRRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSHLIHHHRIH
:.:.::::.:::::::.: .:.: .: .:: ::::. :.:::.:::..: :..:.:::
CCDS12 KRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYECKECGRAFIRGSLLMQHQRIH
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 TGERPYKCEECGKAFSQNSALILHQRIHTGEKPYECNECGKTFRVSSQLIQHQRIHTEER
:::.::::::::::: ..: : ::::::.::::::.:::: : .::: ::::::: :.
CCDS12 TGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGSQLTQHQRIHTGEK
360 370 380 390 400 410
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 YHECNECGKAFKHSSGLIRHQKIHTGEKPYLCNECGKGFGQSSELIRHQRIHTGDKPYEC
..:.::::::...: : :::.:::::::: :.:::: :...::: .:.:::::.:::::
CCDS12 PYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSELTQHERIHTGEKPYEC
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 NECGKTFGQNSEIIRHIRIHTGEKPYVCKECGKAFRGNSELLRHERIHTGEKPYECFECG
.::::.: ..:.. .: ::::::::: :::: :: .:.: .:.:.::::::: : :::
CCDS12 KECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTGEKPYVCNECG
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 KAFRRTSHLIVHQRIHTGEKPHQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYECSECEKTFS
::: : :: ::::::::::.::.::...: .:.: ::.:: :::::::.:: :.::
CCDS12 KAFARGLLLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFS
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460 470 480 490 500
pF1KB9 QHSQLIIHQRIHTGEKPYECQECQKTFSRSSHLLRHQSVHCME
. ::: .:::::::::::::.::.:.:..:::: ::: .: :
CCDS12 HGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTRGSQ
600 610 620 630 640 650
CCDS12 LTQHQRIHISEKSFEYKECGIDFSHGSQVYM
660 670 680
>>CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 (585 aa)
initn: 3512 init1: 1783 opt: 1791 Z-score: 1219.4 bits: 235.4 E(32554): 1.3e-61
Smith-Waterman score: 1795; 51.1% identity (71.4% similar) in 528 aa overlap (2-502:4-527)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGTENKEVIPKEEISEESE-PHGSLLEKFPKVVYQGHEFGAGCEE--DMLEGHSRESM
: :: ....:.:.. ..::::: .: : : .: . ..: ..
CCDS76 MYEGKENVSFELQRDFSQETDFSEASLLEKQQEV----HSAGNIKKEKSNTIDGTVKDET
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB9 EEVIEQMSPQERDF----------PSGLMIFKKSPSSE----KDRENNESERG--CS---
: : . : . ::: . :: : . : . : :: :
CCDS76 SPVEECFFSQSSNSYQCHTITGEQPSGCTGLGKSISFDTKLVKHEIINSEERPFKCEELV
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 -P---SPNLVTHQ-GDTTEGVSAFATSGQNFLEILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFN
: . .:. :: ..: : . :. : . :: :::: : ::::.:.
CCDS76 EPFRCDSQLIQHQENNTEEKPYQCSECGKAFSINEKLIWHQRLHSGEKPFKCVECGKSFS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 QNSHLIQHMRVHSGEKPFECKECGKTFGTNSSLRRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSH
.:: : :. .::::::..:: :::.:..:.:: :: :::.::::. :.:::..: ::
CCDS76 YSSHYITHQTIHSGEKPYQCKMCGKAFSVNGSLSRHQRIHTGEKPYQCKECGNGFSCSSA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 LIHHHRIHTGERPYKCEECGKAFSQNSALILHQRIHTGEKPYECNECGKTFRVSSQLIQH
: :.:.::::.::.:..:::::. :. :: :::::::::::::::::: :: :::: ::
CCDS76 YITHQRVHTGEKPYECNDCGKAFNVNAKLIQHQRIHTGEKPYECNECGKGFRCSSQLRQH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 QRIHTEERYHECNECGKAFKHSSGLIRHQKIHTGEKPYLCNECGKGFGQSSELIRHQRIH
: ::: :. ..:.::::.:.... ::.::.:::::::: :.::::.:. ...::.:::::
CCDS76 QSIHTGEKPYQCKECGKGFNNNTKLIQHQRIHTGEKPYECTECGKAFSVKGKLIQHQRIH
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 TGDKPYECNECGKTFGQNSEIIRHIRIHTGEKPYVCKECGKAFRGNSELLRHERIHTGEK
::.::::::::::.: ::.. .:.::::::::: :.:::::: :..:.::.:::::::
CCDS76 TGEKPYECNECGKAFRCNSQFRQHLRIHTGEKPYECNECGKAFSVNGKLMRHQRIHTGEK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 PYECFECGKAFRRTSHLIVHQRIHTGEKPHQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYEC
:.:: :::. : .:. :.::::::::.::.::...: :..: ::.:: ::::..:
CCDS76 PFECNECGRCFTSKRNLLDHHRIHTGEKPYQCKECGKAFSINAKLTRHQRIHTGEKPFKC
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KB9 SECEKTFSQHSQLIIHQRIHTGEKPYECQECQKTFSRSSHLLRHQSVHCME
::::.:: :. :.::::::::::..:.:: :.: ..::.::: : :
CCDS76 MECEKAFSCSSNYIVHQRIHTGEKPFQCKECGKAFHVNAHLIRHQRSHTGEKPFRCVECG
480 490 500 510 520 530
CCDS76 KGFSFSSDYIIHQTVHTWKKPYMCSVCGKAFRFSFQLSQHQSVHSEGKS
540 550 560 570 580
>>CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 (643 aa)
initn: 3512 init1: 1783 opt: 1791 Z-score: 1218.9 bits: 235.4 E(32554): 1.4e-61
Smith-Waterman score: 1795; 51.1% identity (71.4% similar) in 528 aa overlap (2-502:62-585)
10 20 30
pF1KB9 MGTENKEVIPKEEISEESE-PHGSLLEKFPK
: :: ....:.:.. ..::::: .
CCDS10 GSSPLAAGTGLQGLQTDIQTDNDLTKEMYEGKENVSFELQRDFSQETDFSEASLLEKQQE
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70
pF1KB9 VVYQGHEFGAGCEE--DMLEGHSRESMEEVIEQMSPQERDF----------PSGLMIFKK
: : : .: . ..: .. : : . : . ::: . :
CCDS10 V----HSAGNIKKEKSNTIDGTVKDETSPVEECFFSQSSNSYQCHTITGEQPSGCTGLGK
100 110 120 130 140
80 90 100 110 120
pF1KB9 SPSSE----KDRENNESERG--CS----P---SPNLVTHQ-GDTTEGVSAFATSGQNFLE
: : . : . : :: : : . .:. :: ..: : . :. :
CCDS10 SISFDTKLVKHEIINSEERPFKCEELVEPFRCDSQLIQHQENNTEEKPYQCSECGKAFSI
150 160 170 180 190 200
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 ILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFNQNSHLIQHMRVHSGEKPFECKECGKTFGTNSSL
. :: :::: : ::::.:. .:: : :. .::::::..:: :::.:..:.::
CCDS10 NEKLIWHQRLHSGEKPFKCVECGKSFSYSSHYITHQTIHSGEKPYQCKMCGKAFSVNGSL
210 220 230 240 250 260
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 RRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSHLIHHHRIHTGERPYKCEECGKAFSQNSALILHQ
:: :::.::::. :.:::..: :: : :.:.::::.::.:..:::::. :. :: ::
CCDS10 SRHQRIHTGEKPYQCKECGNGFSCSSAYITHQRVHTGEKPYECNDCGKAFNVNAKLIQHQ
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250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RIHTGEKPYECNECGKTFRVSSQLIQHQRIHTEERYHECNECGKAFKHSSGLIRHQKIHT
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CCDS10 RIHTGEKPYECNECGKGFRCSSQLRQHQSIHTGEKPYQCKECGKGFNNNTKLIQHQRIHT
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310 320 330 340 350 360
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CCDS10 GEKPYECTECGKAFSVKGKLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFRCNSQFRQHLRIHTGEKP
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pF1KB9 ECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYECSECEKTFSQHSQLIIHQRIHTGEKPYECQECQK
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CCDS10 ECGKAFSINAKLTRHQRIHTGEKPFKCMECEKAFSCSSNYIVHQRIHTGEKPFQCKECGK
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490 500
pF1KB9 TFSRSSHLLRHQSVHCME
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CCDS10 AFHVNAHLIRHQRSHTGEKPFRCVECGKGFSFSSDYIIHQTVHTWKKPYMCSVCGKAFRF
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10 20 30
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40 50 60 70 80 90
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160 170 180 190 200 210
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220 230 240 250 260 270
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280 290 300 310 320 330
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10 20 30
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pF1KB9 LIQHMRVHSGEKPFECKECGKTFGTNSSLRRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSHLIHH
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pF1KB9 FECGKAFRRTSHLIVHQRIHTGEKPHQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYECSECE
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CCDS74 HSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSS
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10 20 30
pF1KB9 MGTENKEVIPKEEISEESEPHGSLLEKFPKVVYQG
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. :. . ::: . : : .:... : .. : .: :. ..:. .: .
CCDS12 LWY---CRGEDTEGHWEWSCES-LESLA-----VPVAFTPVK-TPVLEQWQRNGFGE-NI
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pF1KB9 SPSPNLVTHQGDTTEGVSAFATSGQNFLEILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFNQNSH
: .:.: :: : : : . . .. : . : :.. : :::. :.::::::...:
CCDS12 SLNPDL-PHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSA
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160 170 180 190 200 210
pF1KB9 LIQHMRVHSGEKPFECKECGKTFGTNSSLRRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSHLIHH
::.: :.:.::.:.::.:: : : ..:.: .: :::.::::. :..::..: : . ::.:
CCDS12 LIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQH
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220 230 240 250 260 270
pF1KB9 HRIHTGERPYKCEECGKAFSQNSALILHQRIHTGEKPYECNECGKTFRVSSQLIQHQRIH
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CCDS12 QRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIH
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pF1KB9 TEERYHECNECGKAFKHSSGLIRHQKIHTGEKPYLCNECGKGFGQSSELIRHQRIHTGDK
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CCDS12 TGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEK
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CCDS12 PYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYEC
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pF1KB9 FECGKAFRRTSHLIVHQRIHTGEKPHQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYECSECE
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CCDS54 LWY---CRGEDTEGHWEWSCES-LESLA-----VPVAFTPVK-TPVLEQWQRNGFGE-NI
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pF1KB9 SPSPNLVTHQGDTTEGVSAFATSGQNFLEILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFNQNSH
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CCDS54 SLNPDL-PHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSA
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160 170 180 190 200 210
pF1KB9 LIQHMRVHSGEKPFECKECGKTFGTNSSLRRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSHLIHH
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CCDS54 LIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQH
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pF1KB9 HRIHTGERPYKCEECGKAFSQNSALILHQRIHTGEKPYECNECGKTFRVSSQLIQHQRIH
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CCDS54 QRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIH
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pF1KB9 TEERYHECNECGKAFKHSSGLIRHQKIHTGEKPYLCNECGKGFGQSSELIRHQRIHTGDK
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CCDS54 TGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEK
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pF1KB9 PYECNECGKTFGQNSEIIRHIRIHTGEKPYVCKECGKAFRGNSELLRHERIHTGEKPYEC
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CCDS54 PYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYEC
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pF1KB9 FECGKAFRRTSHLIVHQRIHTGEKPHQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYECSECE
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CCDS54 SQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCG
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pF1KB9 KTFSQHSQLIIHQRIHTGEKPYECQECQKTFSRSSHLLRHQSVHCME
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CCDS54 RAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFS
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CCDS54 HSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSS
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pF1KB9 EGHSRESMEEVIEQMSPQERDFPSGLMIFKKSPSSEKDRENNESERGCSPSPNLVTHQGD
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CCDS64 RQIVHTGEASFMCDDCGKTFSQNSVLKNRHRSHMSEKAYQCSECGKAFRGHSDFSRHQSH
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pF1KB9 -TTEGVSAFATSGQNFLEILESNKTQRSSVGEKPHTCKECGKAFNQNSHLIQHMRVHSGE
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CCDS64 HSSERPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGE
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pF1KB9 KPFECKECGKTFGTNSSLRRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSHLIHHHRIHTGERPYK
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CCDS64 KPYVCSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYE
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pF1KB9 CEECGKAFSQNSALILHQRIHTGEKPYECNECGKTFRVSSQLIQHQRIHTEERYHECNEC
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CCDS64 CNDCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRIHTGEKPHVCNVC
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CCDS64 GKAFSYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSSALIQHQGVHTGDKPYACHECGKTF
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CCDS64 GRSSNLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQRIHNGLKPHECNQCGKAFNRSS
530 540 550 560 570 580
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pF1KB9 HLIVHQRIHTGEKPHQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYECSECEKTFSQHSQLII
.:: ::..::::::. : ::.. : ..:.:. :: :: ::.::.:::: :.:::.: ::
CCDS64 NLIHHQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHTGERPYKCSECGKAFSQRSVLIQ
590 600 610 620 630 640
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pF1KB9 HQRIHTGEKPYECQECQKTFSRSSHLLRHQSVHCME
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CCDS64 HQRIHTGVKPYDCAACGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE
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10 20 30
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]