FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9611, 589 aa
1>>>pF1KB9611 589 - 589 aa - 589 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6392+/-0.00105; mu= 17.0927+/- 0.063
mean_var=78.7221+/-15.573, 0's: 0 Z-trim(103.7): 168 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.144553
statistics sampled from 7342 (7520) to 7342 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 3.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 3989 842.2 0
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 3090 654.7 9.4e-188
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 516) 2742 582.1 5.9e-166
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 985 215.7 1.4e-55
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 965 211.5 2.3e-54
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 928 203.8 4.8e-52
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 928 203.8 5e-52
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 910 200.1 6.5e-51
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 897 197.4 4.4e-50
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 897 197.4 4.5e-50
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 881 194.0 4.8e-49
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 858 189.3 1.7e-47
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 838 185.0 2.2e-46
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 838 185.0 2.2e-46
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 826 182.5 1.2e-45
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 822 181.7 2e-45
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 808 178.8 1.8e-44
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 794 175.9 1.3e-43
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 794 175.9 1.5e-43
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 794 175.9 1.6e-43
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 781 173.1 7.5e-43
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 733 163.1 8.6e-40
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 733 163.1 8.7e-40
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 732 163.0 1.2e-39
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 731 162.8 1.4e-39
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 728 162.1 1.9e-39
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 717 159.8 8.7e-39
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 716 159.6 8.8e-39
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 711 158.6 2.4e-38
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 702 156.7 7.8e-38
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 666 149.2 1.7e-35
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 657 147.3 5.2e-35
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 609 137.3 5.5e-32
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 607 136.9 8e-32
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 427) 589 133.0 7.4e-31
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 589 133.1 9.5e-31
CCDS8334.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11 ( 612) 584 132.1 2e-30
CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3 ( 601) 565 128.1 3.1e-29
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 563 127.7 4.3e-29
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7 ( 623) 562 127.5 5e-29
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 544) 559 126.8 6.8e-29
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 556 126.2 1.2e-28
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 552 125.4 1.9e-28
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 524 119.6 1.2e-26
CCDS14199.1 KLHL34 gene_id:257240|Hs108|chrX ( 644) 518 118.3 2.9e-26
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 620) 491 112.7 1.4e-24
CCDS2236.1 KLHL23 gene_id:151230|Hs108|chr2 ( 558) 478 110.0 8.5e-24
CCDS81621.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11 ( 533) 466 107.4 4.6e-23
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 465 107.3 5.9e-23
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 553) 457 105.6 1.8e-22
>>CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 (589 aa)
initn: 3989 init1: 3989 opt: 3989 Z-score: 4497.5 bits: 842.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3989; 100.0% identity (100.0% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 YDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNKL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB9 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
550 560 570 580
>>CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 (589 aa)
initn: 3249 init1: 3090 opt: 3090 Z-score: 3484.3 bits: 654.7 E(32554): 9.4e-188
Smith-Waterman score: 3090; 74.7% identity (91.2% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
:::::::.::::.:.::.:. ::::.:. : ::.::: ::.. .:::: : ::.:.::::
CCDS40 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
:::::: ::::::::: ::.::.:. :::....::::::::::.:::::. :::::::::
CCDS40 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
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CCDS40 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
..::: .: .: ...:.::.::::::::.:.:. ..:...::. : .:::::..:::::
CCDS40 KNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
::. :.: :. : :. ....: :..::.::: .:::::::::: ::::::.::.:..:
CCDS40 LPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
:::::::::.: ::.::::::::::.::::::::: :::::::.::::::::::::::::
CCDS40 GGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 YDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPG
:::.:::::::::::.::::::::::..:::::::::. .: .::::::::::::.:::
CCDS40 YDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEHYDPT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
::: ::::::.:::::::::::::::.:::::. .: . :::::: :::::. : :::
CCDS40 INKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTVPATCPQ
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pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNKL
:::::::::::.:::::::::::.: :::.:. :: :::..::.:::::::::.::::::
CCDS40 PWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKL
490 500 510 520 530 540
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pF1KB9 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
:::::::: :::::::::::: :.:: :::::::::::::::::::::.
CCDS40 YVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
550 560 570 580
>>CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 (516 aa)
initn: 2904 init1: 2742 opt: 2742 Z-score: 3092.9 bits: 582.1 E(32554): 5.9e-166
Smith-Waterman score: 2742; 75.2% identity (91.5% similar) in 516 aa overlap (74-589:1-516)
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 MFTDVTLWAGDRAFPCHRAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLD
::: ::.::.:. :::....::::::::::
CCDS58 MFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLD
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 FAYSSRIAINEENAESLLEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRR
.:::::. ::::::::::::::::.:.:.::: :::::::: :.:::::.:::::::: .
CCDS58 YAYSSRVIINEENAESLLEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTK
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 LYEFSWRMCLVHFETVRQSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLE
:::.:::::: .:.:.:..::: .: .: ...:.::.::::::::.:.:. ..:...::.
CCDS58 LYELSWRMCLSNFQTIRKNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLK
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 PRKVHLPELLRSVRLALLPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVV
: .:::::..:::::::. :.: :. : :. ....: :..::.::: .::::::::
CCDS58 KRYCYLPELLQTVRLALLPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVV
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 TSPCARPRKAGHTLLILGGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVY
:: ::::::.::.:..::::::::::.: ::.::::::::::.::::::::: :::::::
CCDS58 TSLCARPRKTGHALFLLGGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVY
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 VTGGRGSENGVSKDVWVYDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVF
.:::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::..:::::::::. .: .
CCDS58 ITGGRGSENGVSKDVWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCL
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 PASPSVSLKQVEKYDPGANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQ
::::::::::::.::: ::: ::::::.:::::::::::::::.:::::. .: . :::
CCDS58 PASPSVSLKQVEHYDPTINKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQ
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 CYDPSENRWTIKAECPQPWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGD
::: :::::. : ::::::::::::::.:::::::::::.: :::.:. :: :::..::
CCDS58 CYDQCENRWTVPATCPQPWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGD
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 MTAKRMSCHALASGNKLYVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVST
.:::::::::.:::::::::::::: :::::::::::: :.:: ::::::::::::::::
CCDS58 VTAKRMSCHAVASGNKLYVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVST
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 WKHLPA
:::::.
CCDS58 WKHLPS
>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 (609 aa)
initn: 891 init1: 470 opt: 985 Z-score: 1111.6 bits: 215.7 E(32554): 1.4e-55
Smith-Waterman score: 985; 34.7% identity (65.5% similar) in 550 aa overlap (28-565:50-581)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAF
:: .: .: :::: . ::.: .: . .
CCDS13 DVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKI
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 PCHRAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENA
::..:.: : ::.:::. : :::. : ..: . ...:::.::::.:.:...: :.
CCDS13 YAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRD-IDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNV
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 ESLLEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFE
..:: :. .::. ....: :::...: ::::::. ..:.:.::.: ... .. .:.
CCDS13 QTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQ
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 TVRQSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVR
: .::.: : . :.:.::::::....:. ::.:.. :::.... :. .::..:. ::
CCDS13 EVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVR
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LALLPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRIL--QNDGVVTSPCARPRKA--
: :: : .:.:. :. .::. . ..::: :. .: :. .. .: .::::
CCDS13 LPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEA---KNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIR
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340
pF1KB9 -GHTLLILGGQTFMC--DKIYQV---DHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGG
:..:. .:: : : : .: : ...: :.. . : ..:.. .:..::
CCDS13 CGEVLFAVGGW---CSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGG
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350 360 370 380 390 400
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. . . ... : :: ..::. .:: : . : : : . ::.:::. ...
CCDS13 HDGSSYLNS-VERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVS------
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410 420 430 440 450 460
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:. ::.::: ::: :: . ..::. :.. ::.. . .. :. :.
CCDS13 ---CLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSD-GTSPLNTVERYN
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470 480 490 500 510 520
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:.:::: : .. . :: ..:. .:: . : .:: :.. .::::. . ::
CCDS13 PQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMT
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..: . . ...:..:::. :: ::.. .:: ..::
CCDS13 SRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKM
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. ... ....:::... ..:.. : : : : . . .. : ::.. .
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.::: ::. . .: .:. .: . : . ..:::: . .:: :: .
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. ..:.:: : : .: . :: . ::. .:..::: .: .. : .: : :
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CCDS43 RNSW-FKMETRMIKNVCAPAVVLGERIVIVGGYTRRILA----YDPQSNKFVKCADMKDR
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:: : . ::::::.:: : :. ..::::: .:::. .:..:. : ..
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CCDS43 LQCIPRTSGLP
580
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CCDS41 ACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKD-VDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAAS
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CCDS41 LSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLPRDY
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: ..: :::. .. : .. ::.. . :.. .. .: ..:: ......::
CCDS41 LVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKVMIVVGG
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CCDS41 QAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRV-RTVDVY
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: :...:.. : : : :.: :.. ::.::: . .: : .:: :. .
CCDS41 DGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTG---------LASVEAYSYKT
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CCDS41 NEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMST
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pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGG-DTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNK
....::..:.. :: : .. :. .: :: : ...::. : . . : ..
CCDS41 RRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGL
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CCDS41 LYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
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CCDS14 RIVLAACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQ-GLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQEL
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CCDS14 LPAACLLQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFPEVV
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CCDS14 QHEEFILLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPNLLQYVRMPL
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CCDS14 LTPRYITDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRP-ELRSQMQGPRTRARLGANEVLLV
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CCDS14 VGGFGSQQSPIDVVEKYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLHDRIYVIGGYDGRSRLSS
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: : . .: : ..::: . : :.. : . .:: :: : .: . .
CCDS14 -VECLDYTADEDGVWYSVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGG-------FDGSRRHT--S
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.:.:::. ..: :.. .. . .:..: :. .. .:: . .....:. ::: ..::
CCDS14 MERYDPNIDQWSMLGDMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYD-GLNILNSVEKYDPHTGHWT
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:. . ..: :.:...:...:: : .:. .. .:..:: . .::. :
CCDS14 --NVTPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMTTPRCY
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pF1KB9 CHALASGNKLYVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
: . ..::...:: :.. ....:::: :.:. .:..
CCDS14 VGATVLRGRLYAIAGYDGNSLLSSIECYDPIIDSWEVVTSMGTQRCDAGVCVLREK
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CCDS34 QKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTIVAEDMEISAHRVVLA
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CCDS34 ACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKE-VDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQVLLPAAG
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pF1KB9 MLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVRQSEDF
.::..::. . ::::..: : ::::. ..: : : : . . . :: : ::.:
CCDS34 LLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEF
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pF1KB9 NSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLALLPSDC
.:. . . .:::::.: .:. ::::.. ::.:: . :. . .:.. ::: ::: .
CCDS34 LNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREY
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
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