Result of FASTA (omim) for
pF1KB9609
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9609, 241 aa
1>>>pF1KB9609 241 - 241 aa - 241 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4825+/-0.000674; mu= 11.6705+/- 0.041
mean_var=311.2435+/-65.534, 0's: 0 Z-trim(112.5): 2025 B-trim: 92 in 1/56
Lambda= 0.072698
statistics sampled from 19155 (21404) to 19155 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 5.620
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001273627 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 364) 1108 130.2 4.7e-30
NP_001273625 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1108 130.4 5.3e-30
XP_006717342 (OMIM: 194552) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1108 130.4 5.3e-30
NP_001273626 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1108 130.4 5.3e-30
NP_001309189 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1108 130.4 5.3e-30
NP_009066 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 is ( 498) 1108 130.5 5.5e-30
XP_016881831 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 434) 1096 129.1 1.2e-29
XP_016881832 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 434) 1096 129.1 1.2e-29
NP_689690 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [ ( 499) 1096 129.2 1.3e-29
XP_016881830 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1096 129.2 1.3e-29
XP_011524814 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1096 129.2 1.3e-29
NP_001035939 (OMIM: 614275) zinc finger protein 56 ( 499) 1096 129.2 1.3e-29
XP_011524816 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1096 129.2 1.3e-29
XP_016882740 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1085 127.8 2.5e-29
XP_016882742 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1085 127.8 2.5e-29
XP_016882739 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1085 127.8 2.5e-29
NP_001275690 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1085 127.8 2.5e-29
XP_016882743 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1085 127.8 2.5e-29
NP_001275689 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1085 127.8 2.5e-29
XP_016882741 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1085 127.8 2.5e-29
NP_001275691 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1085 127.8 2.5e-29
XP_016882744 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1085 127.8 2.5e-29
XP_016882745 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1085 127.8 2.5e-29
NP_001278562 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 1085 128.3 3.3e-29
NP_001265438 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 1085 128.3 3.3e-29
NP_001265437 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 667) 1085 128.3 3.3e-29
NP_001275688 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 691) 1085 128.3 3.4e-29
NP_037388 (OMIM: 606740) zinc finger protein 180 i ( 692) 1085 128.3 3.4e-29
XP_011525582 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 734) 1085 128.3 3.5e-29
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1083 128.0 3.7e-29
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1083 128.0 3.7e-29
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1083 128.0 3.7e-29
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1083 128.1 3.8e-29
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1083 128.1 3.8e-29
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1083 128.1 3.9e-29
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1083 128.1 3.9e-29
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1083 128.1 3.9e-29
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1083 128.1 3.9e-29
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1083 128.1 3.9e-29
NP_001166303 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 568) 1079 127.5 4.8e-29
NP_443092 (OMIM: 612429) zinc finger protein 300 i ( 604) 1079 127.6 4.9e-29
XP_011536004 (OMIM: 612429) PREDICTED: zinc finger ( 609) 1079 127.6 4.9e-29
XP_011540503 (OMIM: 611703) PREDICTED: zinc finger ( 452) 1077 127.1 5e-29
NP_001166302 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 620) 1079 127.6 5e-29
NP_001070663 (OMIM: 611703) zinc finger protein 43 ( 470) 1077 127.2 5.1e-29
NP_085137 (OMIM: 611703) zinc finger protein 436 [ ( 470) 1077 127.2 5.1e-29
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 1074 127.1 7.5e-29
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 1074 127.1 7.5e-29
NP_653291 (OMIM: 615600) zinc finger protein 582 i ( 517) 1072 126.7 7.6e-29
NP_001307300 (OMIM: 615600) zinc finger protein 58 ( 548) 1072 126.8 7.8e-29
>>NP_001273627 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 iso (364 aa)
initn: 3797 init1: 1107 opt: 1108 Z-score: 660.5 bits: 130.2 E(85289): 4.7e-30
Smith-Waterman score: 1108; 60.6% identity (83.1% similar) in 236 aa overlap (3-238:129-364)
10 20 30
pF1KB9 MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSAL
.::.:: ::: :: ..:::: :::: :::
NP_001 SSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSAL
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 IDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHW
..:::::.:::::::..::.:: .::.: ::.::.:::::.::.: :.: . ...:.:
NP_001 VQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQ
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 RIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHS
:::::::::.: : :.: . ..: :.: :::::::.:.::::.:: ..:. :..::.
NP_001 RIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHT
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 GEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEKP
:::::::.:::: :: :.:. :. :.::::: :. :::::: ::.: ::.::::: ::
NP_001 GEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKP
280 290 300 310 320 330
220 230 240
pF1KB9 FQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
..::.:::.: ::: ..:: :. :.
NP_001 YECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE
340 350 360
>--
initn: 364 init1: 364 opt: 409 Z-score: 264.3 bits: 56.9 E(85289): 5.5e-08
Smith-Waterman score: 409; 44.9% identity (69.3% similar) in 127 aa overlap (97-223:4-125)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 HSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHWRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGE
:.. . .: .:.: .. ..:. .
NP_001 MPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEA
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYT
.: .:. .::. : :. ::: :.::::::: ::: :...:.:::::
NP_001 RPRKCETHTESFKNSEILKPHR-----AKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYE
40 50 60 70 80
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEKPFQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
: :::::. ::.: ::.::::::::..::.::..::
NP_001 CSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSEC
90 100 110 120 130 140
NP_001 EKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAF
150 160 170 180 190 200
>>NP_001273625 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 iso (474 aa)
initn: 3797 init1: 1107 opt: 1108 Z-score: 659.6 bits: 130.4 E(85289): 5.3e-30
Smith-Waterman score: 1108; 60.6% identity (83.1% similar) in 236 aa overlap (3-238:239-474)
10 20 30
pF1KB9 MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSAL
.::.:: ::: :: ..:::: :::: :::
NP_001 SSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSAL
210 220 230 240 250 260
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 IDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHW
..:::::.:::::::..::.:: .::.: ::.::.:::::.::.: :.: . ...:.:
NP_001 VQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQ
270 280 290 300 310 320
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 RIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHS
:::::::::.: : :.: . ..: :.: :::::::.:.::::.:: ..:. :..::.
NP_001 RIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHT
330 340 350 360 370 380
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 GEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEKP
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NP_001 GEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKP
390 400 410 420 430 440
220 230 240
pF1KB9 FQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
..::.:::.: ::: ..:: :. :.
NP_001 YECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE
450 460 470
>--
initn: 364 init1: 364 opt: 409 Z-score: 263.4 bits: 57.1 E(85289): 6.3e-08
Smith-Waterman score: 409; 44.9% identity (69.3% similar) in 127 aa overlap (97-223:114-235)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 HSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHWRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGE
:.. . .: .:.: .. ..:. .
NP_001 SPGWKIISGSPPEQALSEASFQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEA
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYT
.: .:. .::. : :. ::: :.::::::: ::: :...:.:::::
NP_001 RPRKCETHTESFKNSEILKPHR-----AKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYE
150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEKPFQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
: :::::. ::.: ::.::::::::..::.::..::
NP_001 CSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSEC
200 210 220 230 240 250
NP_001 EKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAF
260 270 280 290 300 310
>>XP_006717342 (OMIM: 194552) PREDICTED: zinc finger pro (474 aa)
initn: 3797 init1: 1107 opt: 1108 Z-score: 659.6 bits: 130.4 E(85289): 5.3e-30
Smith-Waterman score: 1108; 60.6% identity (83.1% similar) in 236 aa overlap (3-238:239-474)
10 20 30
pF1KB9 MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSAL
.::.:: ::: :: ..:::: :::: :::
XP_006 SSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSAL
210 220 230 240 250 260
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 IDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHW
..:::::.:::::::..::.:: .::.: ::.::.:::::.::.: :.: . ...:.:
XP_006 VQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQ
270 280 290 300 310 320
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 RIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHS
:::::::::.: : :.: . ..: :.: :::::::.:.::::.:: ..:. :..::.
XP_006 RIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHT
330 340 350 360 370 380
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 GEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEKP
:::::::.:::: :: :.:. :. :.::::: :. :::::: ::.: ::.::::: ::
XP_006 GEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKP
390 400 410 420 430 440
220 230 240
pF1KB9 FQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
..::.:::.: ::: ..:: :. :.
XP_006 YECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE
450 460 470
>--
initn: 364 init1: 364 opt: 409 Z-score: 263.4 bits: 57.1 E(85289): 6.3e-08
Smith-Waterman score: 409; 44.9% identity (69.3% similar) in 127 aa overlap (97-223:114-235)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 HSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHWRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGE
:.. . .: .:.: .. ..:. .
XP_006 SPGWKIISGSPPEQALSEASFQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEA
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYT
.: .:. .::. : :. ::: :.::::::: ::: :...:.:::::
XP_006 RPRKCETHTESFKNSEILKPHR-----AKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYE
150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEKPFQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
: :::::. ::.: ::.::::::::..::.::..::
XP_006 CSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSEC
200 210 220 230 240 250
XP_006 EKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAF
260 270 280 290 300 310
>>NP_001273626 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 iso (474 aa)
initn: 3797 init1: 1107 opt: 1108 Z-score: 659.6 bits: 130.4 E(85289): 5.3e-30
Smith-Waterman score: 1108; 60.6% identity (83.1% similar) in 236 aa overlap (3-238:239-474)
10 20 30
pF1KB9 MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSAL
.::.:: ::: :: ..:::: :::: :::
NP_001 SSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSAL
210 220 230 240 250 260
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 IDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHW
..:::::.:::::::..::.:: .::.: ::.::.:::::.::.: :.: . ...:.:
NP_001 VQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQ
270 280 290 300 310 320
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 RIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHS
:::::::::.: : :.: . ..: :.: :::::::.:.::::.:: ..:. :..::.
NP_001 RIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHT
330 340 350 360 370 380
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 GEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEKP
:::::::.:::: :: :.:. :. :.::::: :. :::::: ::.: ::.::::: ::
NP_001 GEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKP
390 400 410 420 430 440
220 230 240
pF1KB9 FQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
..::.:::.: ::: ..:: :. :.
NP_001 YECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE
450 460 470
>--
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70 80 90 100 110 120
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:.. . .: .:.: .. ..:. .
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130 140 150 160 170 180
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.: .:. .::. : :. ::: :.::::::: ::: :...:.:::::
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: :::::. ::.: ::.::::::::..::.::..::
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10 20 30
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.::.:: ::: :: ..:::: :::: :::
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:::::::::.: : :.: . ..: :.: :::::::.:.::::.:: ..:. :..::.
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:::::::.:::: :: :.:. :. :.::::: :. :::::: ::.: ::.::::: ::
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pF1KB9 FQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
..::.:::.: ::: ..:: :. :.
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450 460 470
>--
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Smith-Waterman score: 409; 44.9% identity (69.3% similar) in 127 aa overlap (97-223:114-235)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 HSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHWRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGE
:.. . .: .:.: .. ..:. .
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pF1KB9 KPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYT
.: .:. .::. : :. ::: :.::::::: ::: :...:.:::::
NP_001 RPRKCETHTESFKNSEILKPHR-----AKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYE
150 160 170 180 190
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: :::::. ::.: ::.::::::::..::.::..::
NP_001 CSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSEC
200 210 220 230 240 250
NP_001 EKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAF
260 270 280 290 300 310
>>NP_009066 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 isofor (498 aa)
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10 20 30
pF1KB9 MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSAL
.::.:: ::: :: ..:::: :::: :::
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NP_009 VQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQ
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pF1KB9 RIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHS
:::::::::.: : :.: . ..: :.: :::::::.:.::::.:: ..:. :..::.
NP_009 RIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHT
360 370 380 390 400 410
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pF1KB9 GEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEKP
:::::::.:::: :: :.:. :. :.::::: :. :::::: ::.: ::.::::: ::
NP_009 GEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKP
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220 230 240
pF1KB9 FQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
..::.:::.: ::: ..:: :. :.
NP_009 YECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE
480 490
>--
initn: 364 init1: 364 opt: 409 Z-score: 263.2 bits: 57.2 E(85289): 6.4e-08
Smith-Waterman score: 409; 44.9% identity (69.3% similar) in 127 aa overlap (97-223:138-259)
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 HSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHWRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGE
:.. . .: .:.: .. ..:. .
NP_009 SPGWKIISGSPPEQALSEASFQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEA
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pF1KB9 KPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYT
.: .:. .::. : :. ::: :.::::::: ::: :...:.:::::
NP_009 RPRKCETHTESFKNSEILKPHR-----AKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYE
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEKPFQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
: :::::. ::.: ::.::::::::..::.::..::
NP_009 CSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSEC
230 240 250 260 270 280
NP_009 EKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAF
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>>XP_016881831 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger pro (434 aa)
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10 20 30
pF1KB9 MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSA
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: ::::::: :::: :.: : :.:.::::::: .:::::::::.: ::.:..:.: :
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.:::::.::::::.: ::: :: :.: ::::::: :. ::::: . : .:.:.:::.
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.:..:..:::.:: ::.: .: :. .:
XP_016 RPYECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTGDKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKPYE
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10 20 30 40
pF1KB9 MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSALIDHQRIHSGEK
.: .::.:::::: ::: : :::::. ::
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pF1KB9 PYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHWRIHTGEKPYQC
::::.::: :: .:.:: .::. : : ::::: .: ..:. :.::::.:::::
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>>XP_016881832 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger pro (434 aa)
initn: 5029 init1: 1090 opt: 1096 Z-score: 653.1 bits: 129.1 E(85289): 1.2e-29
Smith-Waterman score: 1096; 61.2% identity (81.9% similar) in 237 aa overlap (2-237:115-350)
10 20 30
pF1KB9 MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSA
.:: ::: :: :: :.::::::::.:
XP_016 HHTSHTVRQSRETGEKLMECHECGKAFSRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSRASH
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:..:::::.:::::.::.::.:: ....:: ::. :.: :::::..: :.: . :.:: :
XP_016 LVQHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRTSELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQLILH
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: ::::::: :::: :.: : :.:.::::::: .:::::::::.: ::.:..:.: :
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pF1KB9 SGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVT-HKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGE
.:::::.::::::.: ::: :: :.: ::::::: :. ::::: . : .:.:.:::.
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.:..:..:::.:: ::.: .: :. .:
XP_016 RPYECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTGDKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKPYE
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>--
initn: 394 init1: 394 opt: 394 Z-score: 255.2 bits: 55.5 E(85289): 1.8e-07
Smith-Waterman score: 394; 63.1% identity (81.0% similar) in 84 aa overlap (14-97:351-434)
10 20 30 40
pF1KB9 MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSALIDHQRIHSGEK
.: .::.:::::: ::: : :::::. ::
XP_016 TGDRPYECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTGDKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEK
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::::.::: :: .:.:: .::. : : ::::: .: ..:. :.::::.:::::
XP_016 PYECRECGMAFIRSSQLTEHQRIHPGIKPYECRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
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pF1KB9 KDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYKCKECG
>>NP_689690 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [Homo (499 aa)
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pF1KB9 MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSA
.:: ::: :: :: :.::::::::.:
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pF1KB9 LIDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEH
:..:::::.:::::.::.::.:: ....:: ::. :.: :::::..: :.: . :.:: :
NP_689 LVQHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRTSELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQLILH
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pF1KB9 WRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTH
: ::::::: :::: :.: : :.:.::::::: .:::::::::.: ::.:..:.: :
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.:::::.::::::.: ::: :: :.: ::::::: :. ::::: . : .:.:.:::.
NP_689 TGEKPYECKECGKGF-IHSSEVTRHQRIHSGEKPYECKECGKAFRQHAQLTRHQRVHTGD
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pF1KB9 KPFQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
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NP_689 RPYECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTGDKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKPYE
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>--
initn: 394 init1: 394 opt: 394 Z-score: 254.7 bits: 55.6 E(85289): 1.9e-07
Smith-Waterman score: 394; 63.1% identity (81.0% similar) in 84 aa overlap (14-97:416-499)
10 20 30 40
pF1KB9 MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSALIDHQRIHSGEK
.: .::.:::::: ::: : :::::. ::
NP_689 TGDRPYECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTGDKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEK
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pF1KB9 PYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHWRIHTGEKPYQC
::::.::: :: .:.:: .::. : : ::::: .: ..:. :.::::.:::::
NP_689 PYECRECGMAFIRSSQLTEHQRIHPGIKPYECRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
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pF1KB9 KDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYKCKECG
>>XP_016881830 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger pro (499 aa)
initn: 5029 init1: 1090 opt: 1096 Z-score: 652.6 bits: 129.2 E(85289): 1.3e-29
Smith-Waterman score: 1096; 61.2% identity (81.9% similar) in 237 aa overlap (2-237:180-415)
10 20 30
pF1KB9 MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSA
.:: ::: :: :: :.::::::::.:
XP_016 HHTSHTVRQSRETGEKLMECHECGKAFSRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSRASH
150 160 170 180 190 200
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 LIDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEH
:..:::::.:::::.::.::.:: ....:: ::. :.: :::::..: :.: . :.:: :
XP_016 LVQHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRTSELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQLILH
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pF1KB9 WRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTH
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pF1KB9 SGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVT-HKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGE
.:::::.::::::.: ::: :: :.: ::::::: :. ::::: . : .:.:.:::.
XP_016 TGEKPYECKECGKGF-IHSSEVTRHQRIHSGEKPYECKECGKAFRQHAQLTRHQRVHTGD
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pF1KB9 KPFQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
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390 400 410 420 430 440
>--
initn: 394 init1: 394 opt: 394 Z-score: 254.7 bits: 55.6 E(85289): 1.9e-07
Smith-Waterman score: 394; 63.1% identity (81.0% similar) in 84 aa overlap (14-97:416-499)
10 20 30 40
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