FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9608, 284 aa
1>>>pF1KB9608 284 - 284 aa - 284 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6786+/-0.000985; mu= 10.5385+/- 0.058
mean_var=202.8747+/-41.232, 0's: 0 Z-trim(111.9): 929 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.090045
statistics sampled from 11733 (12750) to 11733 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.392), width: 16
Scan time: 2.590
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 876 126.3 4.2e-29
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CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 872 126.0 7.3e-29
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 872 126.0 7.5e-29
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CCDS42462.1 ZNF554 gene_id:115196|Hs108|chr19 ( 538) 869 125.5 8.4e-29
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 870 125.7 8.6e-29
CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8 ( 529) 866 125.1 1.1e-28
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 859 123.9 1.6e-28
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 861 124.6 2e-28
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 860 124.4 2.2e-28
CCDS10494.2 ZNF205 gene_id:7755|Hs108|chr16 ( 554) 858 124.1 2.3e-28
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 857 124.1 3.1e-28
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 854 123.7 3.8e-28
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 854 123.7 3.9e-28
CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 854 123.7 3.9e-28
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 854 123.8 4.2e-28
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 854 123.8 4.5e-28
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 849 122.8 4.7e-28
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 847 122.5 5.6e-28
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 848 122.8 6.1e-28
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 849 123.1 6.3e-28
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 848 122.9 6.3e-28
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CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 848 122.9 6.4e-28
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 846 122.6 7.7e-28
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 847 122.9 8.2e-28
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 842 122.0 9.9e-28
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 845 122.7 1e-27
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 842 122.0 1e-27
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 842 122.0 1e-27
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 842 122.0 1e-27
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 839 121.5 1.1e-27
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 841 122.0 1.3e-27
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 838 121.5 1.4e-27
CCDS32330.1 ZNF774 gene_id:342132|Hs108|chr15 ( 483) 837 121.3 1.4e-27
CCDS7205.2 ZNF485 gene_id:220992|Hs108|chr10 ( 441) 836 121.1 1.5e-27
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 835 121.1 2e-27
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 836 121.4 2e-27
CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3 ( 864) 837 121.6 2e-27
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 836 121.4 2e-27
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 835 121.2 2.1e-27
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 833 120.8 2.1e-27
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 836 121.4 2.1e-27
>>CCDS476.1 ZNF691 gene_id:51058|Hs108|chr1 (284 aa)
initn: 2058 init1: 2058 opt: 2058 Z-score: 1468.3 bits: 279.6 E(32554): 1.8e-75
Smith-Waterman score: 2058; 100.0% identity (100.0% similar) in 284 aa overlap (1-284:1-284)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGSEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGSEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 VTVRARELGDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTVRARELGDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 FSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KB9 AHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
250 260 270 280
>>CCDS55595.1 ZNF691 gene_id:51058|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 2058 init1: 2058 opt: 2058 Z-score: 1467.8 bits: 279.6 E(32554): 1.9e-75
Smith-Waterman score: 2058; 100.0% identity (100.0% similar) in 284 aa overlap (1-284:32-315)
10 20 30
pF1KB9 MGSEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SLCSPTHSAEMSLFLQGPEEMLPLSSEGSEMGSEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 SWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQKVTVRARELGDPIAHPRHEADEKPFICAQCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQKVTVRARELGDPIAHPRHEADEKPFICAQCG
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 KTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFR
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 RRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSS
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 FGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRH
250 260 270 280 290 300
280
pF1KB9 QKTHLGEQAGKDSS
::::::::::::::
CCDS55 QKTHLGEQAGKDSS
310
>>CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 (614 aa)
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Smith-Waterman score: 898; 54.0% identity (73.6% similar) in 235 aa overlap (50-281:297-531)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 GKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHP-KKPWQKVTVRARELGDP--IAHPR
:. : .::.: . .: ::: :
CCDS10 RHQTTHTGEKPYKCRDCGKSFSRSANLITHQRIHTGEKPFQCAECGKSFSRSPNLIAHQR
270 280 290 300 310 320
80 90 100 110 120 130
pF1KB9 HEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLE
.. :::. : .:::.:.: :.: ::: ::::::::.:.:::.::: .:: :::.:::
CCDS10 THTGEKPYSCPECGKSFGNRSSLNTHQGIHTGEKPYECKECGESFSYNSNLIRHQRIHTG
330 340 350 360 370 380
140 150 160 170 180 190
pF1KB9 EKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPY
:: ::: : . : . : : ::.. : :..::.:. ::::::.:..::.:.:::. ::
CCDS10 EKPYKCTDCGQRFSQSSALITHRRTHTGEKPYQCSECGKSFSRSSNLATHRRTHMVEKPY
390 400 410 420 430 440
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 ICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTV
: ::::::.:::. .:. ::::.:::: ::..:: ::. ::: : :::::.:.
CCDS10 KCGVCGKSFSQSSSLIAHQGMHTGEKPYECLTCGESFSWSSNLLKHQRIHTGEKPYKCSE
450 460 470 480 490 500
260 270 280
pF1KB9 CGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
::: ::. :.:. ::.:: ::. :
CCDS10 CGKCFSQRSQLVVHQRTHTGEKPYKCLMCGKSFSRGSILVMHQRAHLGDKPYRCPECGKG
510 520 530 540 550 560
>>CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 (606 aa)
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Smith-Waterman score: 882; 50.2% identity (72.4% similar) in 243 aa overlap (38-278:310-552)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 SPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQKVTVRARE
: .: : . :..: .. . :.
CCDS31 VDGNFHQSSGVHFHQRVHIGEVPYSCNACGKSFSQISSLHNHQRVHTEEKFYKIECDKDL
280 290 300 310 320 330
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LGDPI--AHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKSFSRSS
. . : : . :::: : ::::.:: .: :..:::.:::::::::.::::.::.::
CCDS31 SRNSLLHIHQRLHIGEKPFKCNQCGKSFNRSSVLHVHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSQSS
340 350 360 370 380 390
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 NRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAV
: :. .: :: ::: : ..: .::.: ::. : :..::.:: :::.::.:. : .
CCDS31 NLRIHQLVHTGEKSYKCEDCGKGFTQRSNLQIHQRVHTGEKPYKCDDCGKDFSHSSDLRI
400 410 420 430 440 450
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 HHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRT
:.:.: :: : ::::.::.::.. .:.:.::::.::.: :::. ::. :.. :::.
CCDS31 HQRVHTGEKPYTCPECGKGFSKSSKLHTHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSQRSHLLIHQRV
460 470 480 490 500 510
250 260 270 280
pF1KB9 HRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
: :::::.: ::: ::.:::: ::..: ::.
CCDS31 HTGEKPYKCHDCGKGFSHSSNLHIHQRVHTGEKPYQCAKCGKGFSHSSALRIHQRVHAGE
520 530 540 550 560 570
CCDS31 KPYKCREYYKGFDHNSHLHNNHRRGNL
580 590 600
>>CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 (364 aa)
initn: 2509 init1: 859 opt: 876 Z-score: 637.3 bits: 126.2 E(32554): 3.5e-29
Smith-Waterman score: 892; 47.9% identity (71.3% similar) in 261 aa overlap (33-283:1-258)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 SEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQKVT
.:::...:: .: .. .: :.:
CCDS75 MPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVP
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KB9 VRAREL----------GDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPY
:.:: .. : .: :.: ::. : .:::.:. :.: ::. :::::::
CCDS75 VEARPRKCETHTESFKNSEILKP-HRA--KPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPY
40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 KCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDI
.::::::.::.::. :.:.::: :: ::: .: ..: . ..:: ::. : :..::::.
CCDS75 ECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSE
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 CGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRT
: :.::. ..:. :.: : :: : .:::.: .:... :.::::::.::.:.:::..
CCDS75 CEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKA
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280
pF1KB9 FSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
:: . : ::: : :::::::..::: ::.:.:: ::.:: ::. : :
CCDS75 FSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQS
210 220 230 240 250 260
CCDS75 TNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLS
270 280 290 300 310 320
>--
initn: 447 init1: 447 opt: 447 Z-score: 336.1 bits: 70.4 E(32554): 2.1e-12
Smith-Waterman score: 447; 55.2% identity (77.1% similar) in 105 aa overlap (173-277:260-364)
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 PKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECG
:::.::::..: .:..:: :: : :::
CCDS75 AACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECG
230 240 250 260 270 280
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 KSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFS
: ::.::.. :: ::::.::::.:::..:.. :... ::: : : :::.:. ::: :
CCDS75 KFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFR
290 300 310 320 330 340
270 280
pF1KB9 RSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
:: ..:::. : ::
CCDS75 CSSAFVRHQRLHAGE
350 360
>>CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 (474 aa)
initn: 2509 init1: 859 opt: 876 Z-score: 636.0 bits: 126.3 E(32554): 4.2e-29
Smith-Waterman score: 892; 47.9% identity (71.3% similar) in 261 aa overlap (33-283:111-368)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 SEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQKVT
.:::...:: .: .. .: :.:
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120 130 140 150 160 170
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240 250 260 270 280
pF1KB9 FSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
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CCDS69 CSSAFVRHQRLHAGE
460 470
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pF1KB9 SEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQKVT
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pF1KB9 VRAREL----------GDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPY
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CCDS68 ECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSE
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pF1KB9 CGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRT
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CCDS68 CEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKA
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pF1KB9 FSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
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CCDS68 FSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQS
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CCDS68 TNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLS
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pF1KB9 KSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFS
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pF1KB9 RSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
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CCDS68 CSSAFVRHQRLHAGE
490
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280
pF1KB9 EQAGKDSS
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pF1KB9 EKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPY
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pF1KB9 CGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
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CCDS62 CGKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN
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10 20 30 40
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pF1KB9 ---QESLSDELQETHPKKPWQ--KVTVRARELGDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNT
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pF1KB9 EQAGKDSS
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pF1KB9 CGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
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CCDS62 CGKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN
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pF1KB9 MGSEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHG---
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pF1KB9 ---QESLSDELQETHPKKPWQ--KVTVRARELGDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNT
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CCDS12 TSHSSSLTQNMRNNSEEKPFECNQCGKSFSWSSHLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRS
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160 170 180 190 200 210
pF1KB9 THQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHR
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CCDS12 AHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQR
460 470 480 490 500 510
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pF1KB9 THTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLG
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pF1KB9 EQAGKDSS
:.
CCDS12 EKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPF
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CCDS12 EKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPY
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pF1KB9 ICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTV
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CCDS12 ECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFTCIQ
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pF1KB9 CGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
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CCDS12 CGKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN
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284 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]