Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9593
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9593, 330 aa
1>>>pF1KB9593 330 - 330 aa - 330 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7167+/-0.000785; mu= 3.2582+/- 0.047
mean_var=242.0542+/-48.415, 0's: 0 Z-trim(117.2): 71 B-trim: 169 in 1/54
Lambda= 0.082436
statistics sampled from 17812 (17883) to 17812 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.828), E-opt: 0.2 (0.549), width: 16
Scan time: 3.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13192.1 FOXS1 gene_id:2307|Hs108|chr20 ( 330) 2373 294.3 9.4e-80
CCDS4473.1 FOXC1 gene_id:2296|Hs108|chr6 ( 553) 655 90.1 4.4e-18
CCDS10958.1 FOXC2 gene_id:2303|Hs108|chr16 ( 501) 623 86.3 5.7e-17
CCDS30708.1 FOXD2 gene_id:2306|Hs108|chr1 ( 495) 584 81.7 1.4e-15
CCDS32255.1 FOXB1 gene_id:27023|Hs108|chr15 ( 325) 571 79.9 3e-15
CCDS550.1 FOXE3 gene_id:2301|Hs108|chr1 ( 319) 565 79.2 4.9e-15
CCDS10959.1 FOXL1 gene_id:2300|Hs108|chr16 ( 345) 556 78.2 1.1e-14
CCDS3105.1 FOXL2 gene_id:668|Hs108|chr3 ( 376) 556 78.2 1.2e-14
CCDS75259.1 FOXD1 gene_id:2297|Hs108|chr5 ( 465) 557 78.4 1.2e-14
CCDS35078.1 FOXE1 gene_id:2304|Hs108|chr9 ( 373) 555 78.1 1.2e-14
CCDS2117.1 FOXD4L1 gene_id:200350|Hs108|chr2 ( 408) 552 77.8 1.7e-14
CCDS7655.2 FOXI2 gene_id:399823|Hs108|chr10 ( 318) 524 74.3 1.4e-13
CCDS47977.1 FOXD4L5 gene_id:653427|Hs108|chr9 ( 416) 520 74.0 2.4e-13
CCDS75845.1 FOXD4L4 gene_id:349334|Hs108|chr9 ( 416) 519 73.8 2.6e-13
CCDS43826.1 FOXD4L6 gene_id:653404|Hs108|chr9 ( 417) 518 73.7 2.9e-13
CCDS43833.1 FOXD4L3 gene_id:286380|Hs108|chr9 ( 417) 517 73.6 3.1e-13
CCDS34975.1 FOXD4 gene_id:2298|Hs108|chr9 ( 439) 514 73.3 4.1e-13
CCDS624.1 FOXD3 gene_id:27022|Hs108|chr1 ( 478) 514 73.3 4.4e-13
CCDS4472.1 FOXF2 gene_id:2295|Hs108|chr6 ( 444) 507 72.4 7.4e-13
CCDS4372.1 FOXI1 gene_id:2299|Hs108|chr5 ( 378) 505 72.1 7.8e-13
CCDS77433.1 FOXI3 gene_id:344167|Hs108|chr2 ( 420) 503 72.0 9.9e-13
CCDS12677.1 FOXA3 gene_id:3171|Hs108|chr19 ( 350) 494 70.8 1.8e-12
CCDS9665.1 FOXA1 gene_id:3169|Hs108|chr14 ( 472) 491 70.6 2.9e-12
CCDS10957.2 FOXF1 gene_id:2294|Hs108|chr16 ( 379) 487 70.0 3.4e-12
CCDS35045.1 FOXB2 gene_id:442425|Hs108|chr9 ( 432) 486 69.9 4.1e-12
CCDS13147.1 FOXA2 gene_id:3170|Hs108|chr20 ( 457) 473 68.4 1.2e-11
CCDS46585.1 FOXA2 gene_id:3170|Hs108|chr20 ( 463) 473 68.4 1.3e-11
CCDS4471.1 FOXQ1 gene_id:94234|Hs108|chr6 ( 403) 471 68.1 1.3e-11
CCDS9636.1 FOXG1 gene_id:2290|Hs108|chr14 ( 489) 465 67.5 2.5e-11
>>CCDS13192.1 FOXS1 gene_id:2307|Hs108|chr20 (330 aa)
initn: 2373 init1: 2373 opt: 2373 Z-score: 1545.3 bits: 294.3 E(32554): 9.4e-80
Smith-Waterman score: 2373; 100.0% identity (100.0% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MQQQPLPGPGAPTTEPTKPPYSYIALIAMAIQSSPGQRATLSGIYRYIMGRFAFYRHNRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MQQQPLPGPGAPTTEPTKPPYSYIALIAMAIQSSPGQRATLSGIYRYIMGRFAFYRHNRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDRKPGKGSYWTLDPDCHDMFEHGSFLRRRRRFTRQTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDRKPGKGSYWTLDPDCHDMFEHGSFLRRRRRFTRQTGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 EGTRGPAKARRGPLRATSQDPGVPNATTGRQCSFPPELPDPKGLSFGGLVGAMPASMCPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EGTRGPAKARRGPLRATSQDPGVPNATTGRQCSFPPELPDPKGLSFGGLVGAMPASMCPA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 TTDGRPRPPMEPKEISTPKPACPGELPVATSSSSCPAFGFPAGFSEAESFNKAPTPVLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TTDGRPRPPMEPKEISTPKPACPGELPVATSSSSCPAFGFPAGFSEAESFNKAPTPVLSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ESGIGSSYQCRLQALNFCMGADPGLEHLLASAAPSPAPPTPPGSLRAPLPLPTDHKEPWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ESGIGSSYQCRLQALNFCMGADPGLEHLLASAAPSPAPPTPPGSLRAPLPLPTDHKEPWV
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KB9 AGGFPVQGGSGYPLGLTPCLYRTPGMFFFE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AGGFPVQGGSGYPLGLTPCLYRTPGMFFFE
310 320 330
>>CCDS4473.1 FOXC1 gene_id:2296|Hs108|chr6 (553 aa)
initn: 658 init1: 571 opt: 655 Z-score: 438.2 bits: 90.1 E(32554): 4.4e-18
Smith-Waterman score: 684; 44.6% identity (62.2% similar) in 278 aa overlap (8-282:65-301)
10 20 30
pF1KB9 MQQQPLPGPGAPTTEP---TKPPYSYIALIAMAIQSS
:: .: .: .::::::::::.::::..
CCDS44 GGYTAMPAPMSVYSHPAHAEQYPGGMARAYGPYTPQPQPKDMVKPPYSYIALITMAIQNA
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 PGQRATLSGIYRYIMGRFAFYRHNRPGWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDRKPGKGSYWTL
: .. ::.:::..:: :: ::: :. :::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS44 PDKKITLNGIYQFIMDRFPFYRDNKQGWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDKKPGKGSYWTL
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 DPDCHDMFEHGSFLRRRRRFTRQTGAEGTRGPAKARRGPLRATSQDPGVPNATTGRQCSF
::: ..:::.:::::::::: .. . .: .. : ..: : :::
CCDS44 DPDSYNMFENGSFLRRRRRFKKKDA-------VKDKEEKDRLHLKEPPPP----GRQ---
160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 PPELPDPKGLSFGGLVGAMPASMCPATTDGRPRPPMEPKEISTPKPACPGELPVATSSSS
:: : : . :. : .: ::.. ..:.: . .::. : : ..
CCDS44 PP--PAPPEQADGNAPGPQP-------------PPVRIQDIKTENGTCPSP-PQPLSPAA
210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPAFGFPAGFSEAESFNKAPTPVLSPESGIGSSYQCRLQALNFCMGADPGLEHLLASAAP
. : :. . :: ... . . : : :: . : .:. ::: :: :
CCDS44 ALGSGSAAAVPKIESPDSSSSSLSSGSSPPGSLPSARPLSLD---GAD--------SAPP
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 SPAPPTPPGSLRAPLPLPTDHKEPWVAGGFPVQGGSGYPLGLTPCLYRTPGMFFFE
::: .::
CCDS44 PPAPSAPPPHHSQGFSVDNIMTSLRGSPQSAAAELSSGLLASAAASSRAGIAPPLALGAY
300 310 320 330 340 350
>>CCDS10958.1 FOXC2 gene_id:2303|Hs108|chr16 (501 aa)
initn: 622 init1: 570 opt: 623 Z-score: 418.2 bits: 86.3 E(32554): 5.7e-17
Smith-Waterman score: 644; 37.7% identity (60.5% similar) in 342 aa overlap (9-318:64-402)
10 20 30
pF1KB9 MQQQPLPGPGAPTTEPTKPPYSYIALIAMAIQSSPGQR
:.:: . .::::::::::.::::..: ..
CCDS10 MASPMGVYSGHPEQYSAGMGRSYAPYHHHQPAAPK-DLVKPPYSYIALITMAIQNAPEKK
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 ATLSGIYRYIMGRFAFYRHNRPGWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDRKPGKGSYWTLDPDC
::.:::..:: :: :::.:. :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS10 ITLNGIYQFIMDRFPFYRENKQGWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDKKPGKGSYWTLDPDS
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 HDMFEHGSFLRRRRRFTRQTGAEGTRGPAKARRGPLRATSQDPGVPNATTGRQCSFPPEL
..:::.:::::::::: .. .. . :. .. : :.. :..:. . . . . .
CCDS10 YNMFENGSFLRRRRRFKKKDVSKEKEERAHLKEPPPAASKGAPATPHLADAPKEAEKKVV
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200
pF1KB9 PDPKGLSFGGLVGAMPASMCPATT-DGRPRP----PMEPKEISTPK--PACPGELP----
.. : . : . .. : .. .: :: : . : :. : :. ::
CCDS10 IKSEAASPALPVITKVETLSPESALQGSPRSAASTPAGSPDGSLPEHHAAAPNGLPGFSV
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250
pF1KB9 --VATSSSSCPAFGFPAGFSEAE--------SFNKAPTPVLS-P-----ESGIGSSYQCR
. : .: :. . : ..: . :: . . : :.: ...:::
CCDS10 ENIMTLRTSPPGGELSPGAGRAGLVVPPLALPYAAAPPAAYGQPCAQGLEAGAAGGYQCS
280 290 300 310 320 330
260 270 280 290 300
pF1KB9 LQALNFCMGAD-PGLEHLLASAAPSPA---PPTPPGSLRAPLPLPTDHKEPWVAGGFPVQ
..:... ::. :. :. . : . : :. : : . : : . .. .: : :
CCDS10 MRAMSLYTGAERPA--HMCVPPALDEALSDHPSGPTSPLSALNLAAGQEGALAATGHHHQ
340 350 360 370 380 390
310 320 330
pF1KB9 G-GSGYPLGLTPCLYRTPGMFFFE
: .: . :
CCDS10 HHGHHHPQAPPPPPAPQPQPTPQPGAAAAQAASWYLNHSGDLNHLPGHTFAAQQQTFPNV
400 410 420 430 440 450
>>CCDS30708.1 FOXD2 gene_id:2306|Hs108|chr1 (495 aa)
initn: 552 init1: 500 opt: 584 Z-score: 393.2 bits: 81.7 E(32554): 1.4e-15
Smith-Waterman score: 611; 40.2% identity (57.9% similar) in 323 aa overlap (5-318:110-410)
10 20 30
pF1KB9 MQQQPLPGP---GAPTTEP-TKPPYSYIALIAMA
: ::: :: : : .::::::::::.::
CCDS30 GEPRALASRGAAAAAGSPGPGAAAARGAAGPGPGPPSGGAATRSPLVKPPYSYIALITMA
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 IQSSPGQRATLSGIYRYIMGRFAFYRHNRPGWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDRKPGKGS
: .:: .: ::: : ..: ::: .::.. :.::::::::::::.::::.::. .::::.
CCDS30 ILQSPKKRLTLSEICEFISGRFPYYREKFPAWQNSIRHNLSLNDCFVKIPREPGNPGKGN
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 YWTLDPDCHDMFEHGSFLRRRRRFTRQTGAEGTRGPAKARRGPLRATSQDPGVPNATTGR
::::::. :::..:::::::.:: :: : . ::. . : :.:
CCDS30 YWTLDPESADMFDNGSFLRRRKRFKRQPLPPPHPHPHPHPELLLRGGAAAAGDPGA----
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200
pF1KB9 QCSFPPELPDPKGLSFG-GLVGAMPASMCPATTDGRPRPPMEPKEIS--TPKPACPGELP
: : . . ..: :: :.:: : . :.: .:. .. . : : .:
CCDS30 ---FLPGFAAYGAYGYGYGL--ALPAYGAPPPGPA-PHPHPHPHAFAFAAAAAAAPCQLS
260 270 280 290 300
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 VATSSSSCPAFGFPAG--FSEAESFNKAPTPVLSPESGIGSSYQCRLQALNFCMGADPGL
: . .. : : :.. :. : : ::.: .: :: : . .: .::. :
CCDS30 VPPGRAAAPPPGPPTASVFAGAGS---APAP--APASGSGPGPGP--AGLPAFLGAELGC
310 320 330 340 350 360
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 EHLLASAAPSPAPPTPPGSLRAPLPLPTDHKEPWVAGGFPVQGGSGYPLGLTPCLYRTPG
. : : : .::. . : : . . ..:: ::.: : :
CCDS30 AK--AFYAASLSPPAAGTAAGLPTALLRQGLKTDAGGG---AGGGGAGAGQRPSFSIDHI
370 380 390 400 410
330
pF1KB9 MFFFE
CCDS30 MGHGGGGAAPPGAGEGSPGPPFAAAAGPGGQAQVLAMLTAPALAPVAGHIRLSHPGDALL
420 430 440 450 460 470
>>CCDS32255.1 FOXB1 gene_id:27023|Hs108|chr15 (325 aa)
initn: 555 init1: 502 opt: 571 Z-score: 387.2 bits: 79.9 E(32554): 3e-15
Smith-Waterman score: 571; 38.4% identity (60.9% similar) in 302 aa overlap (6-298:1-289)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MQQQPLPGPGAPTTEPTKPPYSYIALIAMAIQSSPGQRATLSGIYRYIMGRFAFYRHNRP
.: :: : :::::::.: :::::::: . :: ::..:: :: .::.:
CCDS32 MPRPGRNTYSDQKPPYSYISLTAMAIQSSPEKMLPLSEIYKFIMDRFPYYRENTQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB9 GWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDRKPGKGSYWTLDPDCHDMFEHGSFLRRRRRF-TRQTG
::::.:::::.:.::.:.:: .:::::.:.: :.: ::::.:::::::.:: . ..
CCDS32 RWQNSLRHNLSFNDCFIKIPRRPDQPGKGSFWALHPSCGDMFENGSFLRRRKRFKVLKSD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 AEGTRGPAKARRGPLRATSQDPGVPNATTGRQCSFPPELPDPKGLSFGGLVGAMPASMC-
. :: : . :. .. :..: . :..: . ..::. :.:...
CCDS32 HLAPSKPADAAQY-LQQQAKLRLSALAASGTHL---PQMP-AAAYNLGGV--AQPSGFKH
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 P-ATTDGRPRPPMEPKEI--STPKPACPGELPVA---TSSSSCPAFGFPAGFSEAESFNK
: : . : : . :. .:. :. :. :. .: . :.: .. : ...
CCDS32 PFAIENIIAREYKMPGGLAFSAMQPV-PAAYPLPNQLTTMGSSLGTGWPHVYGSAGMIDS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 APTPVLSPESGIGSSYQCRLQALNFCMGADPGLEHLLASAAPSPAP-PTPPGSLRAPLPL
: ::. : :: :.: :. : : .: : . . :.:: :. : .: ::.:
CCDS32 A-TPI-SMASGDYSAYGVPLKPL--CHAAGQTLPAIPVPIKPTPAAVPALP-ALPAPIPT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KB9 PTDHKEPWVAGGFPVQGGSGYPLGLTPCLYRTPGMFFFE
... :
CCDS32 LLSNSPPSLSPTSSQTATSQSSPATPSETLTSPASALHSVAVH
290 300 310 320
>>CCDS550.1 FOXE3 gene_id:2301|Hs108|chr1 (319 aa)
initn: 523 init1: 492 opt: 565 Z-score: 383.4 bits: 79.2 E(32554): 4.9e-15
Smith-Waterman score: 573; 39.5% identity (55.7% similar) in 291 aa overlap (5-288:55-309)
10 20 30
pF1KB9 MQQQPLPGPGAPTTEPT---KPPYSYIALIAMAI
: :::: .: :::::::::::::.
CCDS55 SGPPPSPLAGAEPGREPEEAAAGRGEAAPTPAPGPGRRRRRPLQRGKPPYSYIALIAMAL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 QSSPGQRATLSGIYRYIMGRFAFYRHNRPGWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDRKPGKGSY
.::.: ::..:::.: :::::: . :::::::::.::.:::::::. .::::.:
CCDS55 AHAPGRRLTLAAIYRFITERFAFYRDSPRKWQNSIRHNLTLNDCFVKVPREPGNPGKGNY
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 WTLDPDCHDMFEHGSFLRRRRRFTR-QTGAEGTRGPAKARRGPLRATSQDPGVPNATTGR
::::: :::..:::::::.:: : . :... .:. : . :: : .
CCDS55 WTLDPAAADMFDNGSFLRRRKRFKRAELPAHAAAAPGPPLPFPYAPYAPAPG-PALLVPP
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 QCSFPPELPDPKGLSFGGLVGAMPASMCPATTDGRPRPPMEPKEISTPKPACPGELPVAT
. : : . .: .::. .: . : :.: : : . .:.
CCDS55 PSAGPGPSPPARLFSVDSLVNLQPE----LAGLGAPEP-----------PCCAAPDAAAA
210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 SSSSCPAFGFPAGFSEAESFNKAPTPVLSPESGIGSSYQCRLQALNFCMGADPGLEHLLA
. : : . : .:.. .. :. : : : . :.: :::
CCDS55 AFPPCAAAASPPLYSQVP--DRLVLPATRP--GPGP------------LPAEP----LLA
250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KB9 SAAPSPA-PPTPPGS--LRAPLPLPTDHKEPWVAGGFPVQGGSGYPLGLTPCLYRTPGMF
:.:. : : :: :: :
CCDS55 LAGPAAALGPLSPGEAYLRQPGFASGLERYL
290 300 310
>>CCDS10959.1 FOXL1 gene_id:2300|Hs108|chr16 (345 aa)
initn: 559 init1: 538 opt: 556 Z-score: 377.2 bits: 78.2 E(32554): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 601; 41.0% identity (58.7% similar) in 317 aa overlap (16-324:47-334)
10 20 30 40
pF1KB9 MQQQPLPGPGAPTTEPTKPPYSYIALIAMAIQSSPGQRATLSGIY
: :::::::::::::::..: ::.::.:::
CCDS10 MLYLYGPERPGLPLAFAPAAALAASGRAETPQKPPYSYIALIAMAIQDAPEQRVTLNGIY
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 RYIMGRFAFYRHNRPGWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDRKPGKGSYWTLDPDCHDMFEHG
..:: :: ::. :: :::::::::::::.:::::::. .::::::::::: : ::::.:
CCDS10 QFIMDRFPFYHDNRQGWQNSIRHNLSLNDCFVKVPREKGRPGKGSYWTLDPRCLDMFENG
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 SFLRRRRRFTRQTGAEGTRGPAKARRGPLRATSQDPGVPNATTGRQCSFPPELPDPKGLS
.. ::.:. :: .. : .:. : .: :.: .: : : ..:
CCDS10 NYRRRKRKPKPGPGAPEAKRP-RAETHQRSAEAQ----PEAGSGAGGSGP-------AIS
140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 FGGLVGAMPASMCPATTDGRPRPPMEPKEISTPKPACPGE-LPVATSSSSCPAFGFPAGF
. : ::. : :: : :: : . : : :.: :..... : : :
CCDS10 R---LQAAPAGPSP-LLDG-PSPPA-P--LHWPGTASPNEDAGDAAQGAAAVAVGQAART
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB9 SEAESFNKAPTPVLSPESGIGSSYQCRLQALNFCMGADP-GLEHLLASAAPSPAPP----
... . :. ::.:. :. . : .: : . ..::..: :.:.
CCDS10 GDGPGSPLRPASRSSPKSSDKSKSFSIDSILAGKQGQKPPSGDELLGGAKPGPGGRLGAS
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 --TPPGSLRAPLPLPTDHKEPWVAGGFPVQGGSGYPLGLTPCLYRTPGMFFFE
. .::: :. . .: : ::: : ::. : : :
CCDS10 LLAASSSLRPPFN-ASLMLDPHVQGGF-------YQLGI-PFLSYFPLQVPDTVLHFQ
300 310 320 330 340
>>CCDS3105.1 FOXL2 gene_id:668|Hs108|chr3 (376 aa)
initn: 556 init1: 471 opt: 556 Z-score: 376.7 bits: 78.2 E(32554): 1.2e-14
Smith-Waterman score: 560; 36.2% identity (55.3% similar) in 340 aa overlap (5-321:32-360)
10 20
pF1KB9 MQQQPLPGPG-------APTT-EPT-KPPYSYIA
: :: : :: .:. ::::::.:
CCDS31 MASYPEPEDAAGALLAPETGRTVKEPEGPPPSPGKGGGGGGGTAPEKPDPAQKPPYSYVA
10 20 30 40 50 60
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 LIAMAIQSSPGQRATLSGIYRYIMGRFAFYRHNRPGWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDRK
::::::. : .: ::::::.::...: ::..:. ::::::::::::::::.::::.
CCDS31 LIAMAIRESAEKRLTLSGIYQYIIAKFPFYEKNKKGWQNSIRHNLSLNECFIKVPREGGG
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 PGKGSYWTLDPDCHDMFEHGSFLRRRRRFTRQTGAEGTR-GPAKARRGPLRATSQDPGVP
::.:::::: :.::::.:.. :::::. : .. :.:. : :.. ::
CCDS31 ERKGNYWTLDPACEDMFEKGNY-RRRRRMKRPFRPPPAHFQPGKGLFGAGGAAG-GCGVA
130 140 150 160 170
150 160 170 180 190
pF1KB9 NATTGRQCSFPPELPDPKGLSFGGLVGAMPASMCP-----ATTDGRPRPPMEPKEISTPK
.: . . : :: :. : : .. : . : :. . ..
CCDS31 GAGADGYGYLAP----PKYLQSGFLNNSWPLPQPPSPMPYASCQMAAAAAAAAAAAAAAG
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 PACPGELPVATSSSSCPAFGFPAGFSEAESFNKAPTPVLSPESGIGSSYQCRLQALNFCM
:. :: :. . .. :: .. . .....:. : :.. .:.:. .
CCDS31 PGSPGAAAVVKGLAG-PAASY-GPYTRVQSMA-LPPGVVNSYNGLGGPPAAPPPPPH--P
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 GADPGLEHLLASAAPSPAPP------TPPGSLR--APLPLPTDHKEPWVAGGFPVQGGSG
: .:: :.::: :::: :::.: .: : : :. .
CCDS31 HPHPHAHHLHAAAAPPPAPPHHGAAAPPPGQLSPASPATAAPPAPAPTSAPGLQFACARQ
300 310 320 330 340 350
320 330
pF1KB9 YPLGLTPCLYRTPGMFFFE
:.. : :
CCDS31 PELAMMHCSYWDHDSKTGALHSRLDL
360 370
>>CCDS75259.1 FOXD1 gene_id:2297|Hs108|chr5 (465 aa)
initn: 539 init1: 500 opt: 557 Z-score: 376.2 bits: 78.4 E(32554): 1.2e-14
Smith-Waterman score: 570; 39.2% identity (57.3% similar) in 309 aa overlap (10-284:116-405)
10 20 30
pF1KB9 MQQQPLPGPGAPTTEP-TKPPYSYIALIAMAIQSSPGQR
:. . .: .::::::::::.::: .:: .:
CCDS75 SPAPPGPAPAAGAGAGGGGGGGGAGGGGSAGSGAKNPLVKPPYSYIALITMAILQSPKKR
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 ATLSGIYRYIMGRFAFYRHNRPGWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDRKPGKGSYWTLDPDC
::: : ..: ::: .::.. :.::::::::::::.::::.::. .::::.::::::.
CCDS75 LTLSEICEFISGRFPYYREKFPAWQNSIRHNLSLNDCFVKIPREPGNPGKGNYWTLDPES
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140
pF1KB9 HDMFEHGSFLRRRRRFTRQ-----------------TGAEGTRG-PAKARRGPLRATSQD
:::..:::::::.:: :: .:: : : :: : :
CCDS75 ADMFDNGSFLRRRKRFKRQPLLPPNAAAAESLLLRGAGAAGGAGDPAAAAALFPPAPPPP
210 220 230 240 250 260
150 160 170 180 190
pF1KB9 P---GVPNATTGRQCSFPPELPDPKGLSFGGLVGAMPASMCPATTDGRPRPPMEPKEIST
: : : ..:: : :..: .. ..: :.. : . : : :..
CCDS75 PHAYGYGPYGCGYGLQLPPYAP-PSALFAAAAAAAAAAAFHPHSPPPPPPPHGAAAELAR
270 280 290 300 310 320
200 210 220 230 240
pF1KB9 ------PKP---ACPGELPVATSSSSCPAFGFPAGFSEAESFNKAPTPVLSPESGIGSSY
:.: : :: ::....... :. : .. ..: .: :: ::.:
CCDS75 TAFGYRPHPLGAALPGPLPASAAKAGGPG---------ASALARSP---FSIESIIGGSL
330 340 350 360 370
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 QCRLQALNFCMGADPGLEHLLASAAPSPAP---PTPPGSLRAPLPLPTDHKEPWVAGGFP
: ..: :.:.:::.: : :::
CCDS75 GPAAAAAAAAQAAAA------AQASPSPSPVAAPPAPGSSGGGCAAQAAVGPAAALTRSL
380 390 400 410 420
310 320 330
pF1KB9 VQGGSGYPLGLTPCLYRTPGMFFFE
CCDS75 VAAAAAAASSVSSSAALGTLHQGTALSSVENFTARISNC
430 440 450 460
>>CCDS35078.1 FOXE1 gene_id:2304|Hs108|chr9 (373 aa)
initn: 524 init1: 489 opt: 555 Z-score: 376.1 bits: 78.1 E(32554): 1.2e-14
Smith-Waterman score: 555; 36.7% identity (57.2% similar) in 313 aa overlap (18-315:53-344)
10 20 30 40
pF1KB9 MQQQPLPGPGAPTTEPTKPPYSYIALIAMAIQSSPGQRATLSGIYRY
:::::::::::::: .: .: ::.:::..
CCDS35 GETAAGAGVPGEATGRGAGGRRRKRPLQRGKPPYSYIALIAMAIAHAPERRLTLGGIYKF
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 IMGRFAFYRHNRPGWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDRKPGKGSYWTLDPDCHDMFEHGSF
: :: ::: : :::::::::.::.::.:.::. .::::.::.:::. .:::: :::
CCDS35 ITERFPFYRDNPKKWQNSIRHNLTLNDCFLKIPREAGRPGKGNYWALDPNAEDMFESGSF
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 LRRRRRFTRQTGAEGTRGPAKARRGPLRATSQDPGVPNATTGRQCSFPPELPDPKGLSFG
::::.:: : .. . :: . . :.. .. :. . : : : ..
CCDS35 LRRRKRFKR---SDLSTYPAYMHDAAAAAAAAAAAAAAAAI-FPGAVPAARPPYPGAVYA
150 160 170 180 190
170 180 190 200 210
pF1KB9 GL----VGAMPASMCPATTDGR-------PRPPMEPKEISTPKPACPGELPVATSSSSCP
: ..: : . ::.. : :. :. : :.. : :. :: : .:.. :
CCDS35 GYAPPSLAAPPPVYYPAASPGPCRVFGLVPERPLSP-ELG-PAPSGPGG-SCAFASAGAP
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 AF--GF-PAGFSEAESFNKAPTPVLSPESGIGSSYQCRLQALNFCMGADPGLEHLLASAA
: :. ::: . :. : :. . .: ..: .:: . ..:.:.
CCDS35 ATTTGYQPAGCTGARPAN--PSAYAAAYAGPDGAYP---------QGAGSA---IFAAAG
260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 PSPAPPTPP-GSLRAPLPLPTDHKEPWVAGGFPVQGGSGYPLGLTPCLYRTPGMFFFE
.: .:: :. . . .: : : . :. : :
CCDS35 RLAGPASPPAGGSSGGVETTVDFYGRTSPGQFGALGACYNPGGQLGGASAGAYHARHAAA
310 320 330 340 350 360
CCDS35 YPGGIDRFVSAM
370
330 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 17:34:15 2016 done: Fri Nov 4 17:34:16 2016
Total Scan time: 3.240 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]