Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9569
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9569, 741 aa
1>>>pF1KB9569 741 - 741 aa - 741 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6413+/-0.00127; mu= -7.8270+/- 0.077
mean_var=389.9750+/-78.998, 0's: 0 Z-trim(111.8): 62 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.064947
statistics sampled from 12585 (12634) to 12585 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.696), E-opt: 0.2 (0.388), width: 16
Scan time: 4.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS55656.1 POU2F1 gene_id:5451|Hs108|chr1 ( 755) 4458 432.5 1.2e-120
CCDS1259.2 POU2F1 gene_id:5451|Hs108|chr1 ( 766) 4458 432.5 1.2e-120
CCDS55655.1 POU2F1 gene_id:5451|Hs108|chr1 ( 703) 3584 350.6 4.9e-96
CCDS56095.1 POU2F2 gene_id:5452|Hs108|chr19 ( 479) 1240 130.8 4.8e-30
CCDS56094.1 POU2F2 gene_id:5452|Hs108|chr19 ( 467) 1232 130.1 7.9e-30
CCDS33035.1 POU2F2 gene_id:5452|Hs108|chr19 ( 463) 1079 115.7 1.6e-25
CCDS58665.1 POU2F2 gene_id:5452|Hs108|chr19 ( 400) 1020 110.1 6.7e-24
CCDS8431.1 POU2F3 gene_id:25833|Hs108|chr11 ( 436) 1000 108.3 2.6e-23
CCDS58190.1 POU2F3 gene_id:25833|Hs108|chr11 ( 438) 1000 108.3 2.6e-23
CCDS14450.1 POU3F4 gene_id:5456|Hs108|chrX ( 361) 692 79.4 1.1e-14
CCDS5040.1 POU3F2 gene_id:5454|Hs108|chr6 ( 443) 685 78.8 2e-14
CCDS33265.1 POU3F3 gene_id:5455|Hs108|chr2 ( 500) 684 78.7 2.4e-14
CCDS30679.1 POU3F1 gene_id:5453|Hs108|chr1 ( 451) 672 77.6 4.8e-14
CCDS34391.1 POU5F1 gene_id:5460|Hs108|chr6 ( 360) 570 67.9 3.1e-11
CCDS55274.1 POU5F1B gene_id:5462|Hs108|chr8 ( 359) 553 66.4 9.2e-11
>>CCDS55656.1 POU2F1 gene_id:5451|Hs108|chr1 (755 aa)
initn: 4458 init1: 4458 opt: 4458 Z-score: 2279.7 bits: 432.5 E(32554): 1.2e-120
Smith-Waterman score: 4458; 100.0% identity (100.0% similar) in 723 aa overlap (19-741:33-755)
10 20 30 40
pF1KB9 MKTRMKIFVMIHFHLMNSTQTNGLDFQKQPVPVGGAISTAQAQAFLGH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DCSDYVLDSRMNNPSETSKPSMESGDGNTGTQTNGLDFQKQPVPVGGAISTAQAQAFLGH
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LHQVQLAGTSLQAAAQSLNVQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAIPQTQLMLAGGQIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LHQVQLAGTSLQAAAQSLNVQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAIPQTQLMLAGGQIT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 GLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQHSASQQHSAAGATISASAATPMTQIPLSQPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQHSASQQHSAAGATISASAATPMTQIPLSQPI
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 QIAQDLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQPAQFIISQTPQGQQGLLQAQNLLTQLPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QIAQDLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQPAQFIISQTPQGQQGLLQAQNLLTQLPQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 QSQANLLQSQPSITLTSQPATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRIDTPSLEEPSDLEELEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QSQANLLQSQPSITLTSQPATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRIDTPSLEEPSDLEELEQ
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 FAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWL
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 NDAENLSSDSSLSSPSALNSPGIEGLSRRRKKRTSIETNIRVALEKSFLENQKPTSEEIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NDAENLSSDSSLSSPSALNSPGIEGLSRRRKKRTSIETNIRVALEKSFLENQKPTSEEIT
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 MIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSLVATTPSLVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSLVATTPSLVTS
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 SAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLSVTGTSDTTSNNTATVISTAPPASSAVTSPSLSPSPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLSVTGTSDTTSNNTATVISTAPPASSAVTSPSLSPSPSA
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 SASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPLGTSQVMVTASGLQTAAAAALQGAAQLPANASLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPLGTSQVMVTASGLQTAAAAALQGAAQLPANASLA
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 AMAAAAGLNPSLMAPSQFAAGGALLSLNPGTLSGALSPALMSNSTLATIQALASGGSLPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AMAAAAGLNPSLMAPSQFAAGGALLSLNPGTLSGALSPALMSNSTLATIQALASGGSLPI
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 TSLDATGNLVFANAGGAPNIVTAPLFLNPQNLSLLTSNPVSLVSAAAASAGNSAPVASLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TSLDATGNLVFANAGGAPNIVTAPLFLNPQNLSLLTSNPVSLVSAAAASAGNSAPVASLH
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740
pF1KB9 ATSTSAESIQNSLFTVASASGAASTTTTASKAQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ATSTSAESIQNSLFTVASASGAASTTTTASKAQ
730 740 750
>>CCDS1259.2 POU2F1 gene_id:5451|Hs108|chr1 (766 aa)
initn: 4458 init1: 4458 opt: 4458 Z-score: 2279.7 bits: 432.5 E(32554): 1.2e-120
Smith-Waterman score: 4458; 100.0% identity (100.0% similar) in 723 aa overlap (19-741:44-766)
10 20 30 40
pF1KB9 MKTRMKIFVMIHFHLMNSTQTNGLDFQKQPVPVGGAISTAQAQAFLGH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AAAAAAADSRMNNPSETSKPSMESGDGNTGTQTNGLDFQKQPVPVGGAISTAQAQAFLGH
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LHQVQLAGTSLQAAAQSLNVQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAIPQTQLMLAGGQIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LHQVQLAGTSLQAAAQSLNVQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAIPQTQLMLAGGQIT
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 GLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQHSASQQHSAAGATISASAATPMTQIPLSQPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQHSASQQHSAAGATISASAATPMTQIPLSQPI
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 QIAQDLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQPAQFIISQTPQGQQGLLQAQNLLTQLPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QIAQDLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQPAQFIISQTPQGQQGLLQAQNLLTQLPQ
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 QSQANLLQSQPSITLTSQPATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRIDTPSLEEPSDLEELEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QSQANLLQSQPSITLTSQPATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRIDTPSLEEPSDLEELEQ
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 FAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWL
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 NDAENLSSDSSLSSPSALNSPGIEGLSRRRKKRTSIETNIRVALEKSFLENQKPTSEEIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NDAENLSSDSSLSSPSALNSPGIEGLSRRRKKRTSIETNIRVALEKSFLENQKPTSEEIT
380 390 400 410 420 430
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 MIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSLVATTPSLVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSLVATTPSLVTS
440 450 460 470 480 490
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 SAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLSVTGTSDTTSNNTATVISTAPPASSAVTSPSLSPSPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLSVTGTSDTTSNNTATVISTAPPASSAVTSPSLSPSPSA
500 510 520 530 540 550
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 SASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPLGTSQVMVTASGLQTAAAAALQGAAQLPANASLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPLGTSQVMVTASGLQTAAAAALQGAAQLPANASLA
560 570 580 590 600 610
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 AMAAAAGLNPSLMAPSQFAAGGALLSLNPGTLSGALSPALMSNSTLATIQALASGGSLPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AMAAAAGLNPSLMAPSQFAAGGALLSLNPGTLSGALSPALMSNSTLATIQALASGGSLPI
620 630 640 650 660 670
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 TSLDATGNLVFANAGGAPNIVTAPLFLNPQNLSLLTSNPVSLVSAAAASAGNSAPVASLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TSLDATGNLVFANAGGAPNIVTAPLFLNPQNLSLLTSNPVSLVSAAAASAGNSAPVASLH
680 690 700 710 720 730
710 720 730 740
pF1KB9 ATSTSAESIQNSLFTVASASGAASTTTTASKAQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ATSTSAESIQNSLFTVASASGAASTTTTASKAQ
740 750 760
>>CCDS55655.1 POU2F1 gene_id:5451|Hs108|chr1 (703 aa)
initn: 3507 init1: 3507 opt: 3584 Z-score: 1837.6 bits: 350.6 E(32554): 4.9e-96
Smith-Waterman score: 3940; 91.3% identity (91.3% similar) in 723 aa overlap (19-741:44-703)
10 20 30 40
pF1KB9 MKTRMKIFVMIHFHLMNSTQTNGLDFQKQPVPVGGAISTAQAQAFLGH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AAAAAAADSRMNNPSETSKPSMESGDGNTGTQTNGLDFQKQPVPVGGAISTAQAQAFLGH
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LHQVQLAGTSLQAAAQSLNVQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAIPQTQLMLAGGQIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LHQVQLAGTSLQAAAQSLNVQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAIPQTQLMLAGGQIT
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 GLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQHSASQQHSAAGATISASAATPMTQIPLSQPI
:
CCDS55 G-----------------------------------------------------------
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 QIAQDLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQPAQFIISQTPQGQQGLLQAQNLLTQLPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ----DLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQPAQFIISQTPQGQQGLLQAQNLLTQLPQ
140 150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 QSQANLLQSQPSITLTSQPATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRIDTPSLEEPSDLEELEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QSQANLLQSQPSITLTSQPATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRIDTPSLEEPSDLEELEQ
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 FAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWL
260 270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 NDAENLSSDSSLSSPSALNSPGIEGLSRRRKKRTSIETNIRVALEKSFLENQKPTSEEIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NDAENLSSDSSLSSPSALNSPGIEGLSRRRKKRTSIETNIRVALEKSFLENQKPTSEEIT
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 MIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSLVATTPSLVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSLVATTPSLVTS
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 SAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLSVTGTSDTTSNNTATVISTAPPASSAVTSPSLSPSPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLSVTGTSDTTSNNTATVISTAPPASSAVTSPSLSPSPSA
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 SASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPLGTSQVMVTASGLQTAAAAALQGAAQLPANASLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPLGTSQVMVTASGLQTAAAAALQGAAQLPANASLA
500 510 520 530 540 550
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 AMAAAAGLNPSLMAPSQFAAGGALLSLNPGTLSGALSPALMSNSTLATIQALASGGSLPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AMAAAAGLNPSLMAPSQFAAGGALLSLNPGTLSGALSPALMSNSTLATIQALASGGSLPI
560 570 580 590 600 610
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 TSLDATGNLVFANAGGAPNIVTAPLFLNPQNLSLLTSNPVSLVSAAAASAGNSAPVASLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TSLDATGNLVFANAGGAPNIVTAPLFLNPQNLSLLTSNPVSLVSAAAASAGNSAPVASLH
620 630 640 650 660 670
710 720 730 740
pF1KB9 ATSTSAESIQNSLFTVASASGAASTTTTASKAQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ATSTSAESIQNSLFTVASASGAASTTTTASKAQ
680 690 700
>>CCDS56095.1 POU2F2 gene_id:5452|Hs108|chr19 (479 aa)
initn: 1126 init1: 556 opt: 1240 Z-score: 652.9 bits: 130.8 E(32554): 4.8e-30
Smith-Waterman score: 1243; 49.1% identity (70.4% similar) in 487 aa overlap (78-554:20-468)
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 HLHQVQLAGTSLQAAAQSLNVQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAIPQTQLMLAGGQI
..: ..::.. ... :.:. . ..
CCDS56 MVHSSMGAPEIRMSKPLEAEKQGLDSPSEHTDTERNGPDTNHQNPQNKT
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 TGLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQHSASQQHSAAGATISASAATPMTQIPLSQP
. ....:. . .. . ... :: . .: : :..:. :.
CCDS56 SPFSVSPTGPSTKIKAEDPSGDSAPAAPLPPQPAQPH------------LPQAQLMLTGS
50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 IQIAQDLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQP-AQFIISQTPQGQQGLLQAQNLLTQL
:.: :.::: ::: :.::: : .::: :::.. :. :.: ::: . ::. ::
CCDS56 -QLAGDIQQLLQLQ-------QLVLV-PGHHLQPPAQFLLPQAQQSQPGLLPTPNLF-QL
100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 PQQSQANLLQSQPSITLTSQPATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRIDTPSL-EEPSDLEE
:::.:. :: ::: : .: .: : : . :: :: .. :: ::::::::
CCDS56 PQQTQGALLTSQPRAGLPTQAVT--RPTLPDPHLSHPQP---PKCLEPPSHPEEPSDLEE
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 LEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLE
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LEQFARTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLE
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 KWLNDAENLSSDSSLSSPSALNSP--GIEGL-SRRRKKRTSIETNIRVALEKSFLENQKP
:::::::..: :::: ::. :.:: :..:: .::::::::::::.: ::::::: ::::
CCDS56 KWLNDAETMSVDSSLPSPNQLSSPSLGFDGLPGRRRKKRTSIETNVRFALEKSFLANQKP
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 TSEEITMIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSLVATT
::::: .::.::.:::::::::::::::::::::: :..:. .::: . .. .
CCDS56 TSEEILLIAEQLHMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINP-----CSAAPM---LPSPGKPASYS
330 340 350 360 370
470 480 490 500 510
pF1KB9 PSLVT-SSAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLS-VTGT--SDTTSNNTATVISTAPPASSAVT
: .:: ...: :: .: . :..::.:: ..:: . :... . ..::: .:
CCDS56 PHMVTPQGGAGTLPLSQASSSLSTTVTTLSSAVGTLHPSRTAGGGGGGGGAAPPLNSI--
380 390 400 410 420 430
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 SPSLSPSPSASA-STSEASSASETSTTQTTSTPLSSPLGTSQVMVTASGLQTAAAAALQG
::..: : :.. ::. . ..:... . .: ..:
CCDS56 -PSVTPPPPATTNSTNPSPQGSHSAIGLSGLNPSTGPGLWWNPAPYQP
440 450 460 470
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 AAQLPANASLAAMAAAAGLNPSLMAPSQFAAGGALLSLNPGTLSGALSPALMSNSTLATI
>>CCDS56094.1 POU2F2 gene_id:5452|Hs108|chr19 (467 aa)
initn: 1126 init1: 556 opt: 1232 Z-score: 649.0 bits: 130.1 E(32554): 7.9e-30
Smith-Waterman score: 1235; 50.2% identity (70.9% similar) in 468 aa overlap (78-536:20-449)
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 HLHQVQLAGTSLQAAAQSLNVQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAIPQTQLMLAGGQI
..: ..::.. ... :.:. . ..
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110 120 130 140 150 160
pF1KB9 TGLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQHSASQQHSAAGATISASAATPMTQIPLSQP
. ....:. . .. . ... :: . .: : :..:. :.
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170 180 190 200 210 220
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:.: :.::: :::: .::: : .::: :::.. :. :.: ::: . ::. ::
CCDS56 -QLAGDIQQLLQLQQ-------LVLV-PGHHLQPPAQFLLPQAQQSQPGLLPTPNLF-QL
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:::.:. :: ::: : .: .: : : . :: :: .. :: ::::::::
CCDS56 PQQTQGALLTSQPRAGLPTQAVT--RPTLPDPHLSHPQP---PKCLEPPSHPEEPSDLEE
150 160 170 180 190 200
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:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LEQFARTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLE
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:::::::..: :::: ::. :.:: :..:: .::::::::::::.: ::::::: ::::
CCDS56 KWLNDAETMSVDSSLPSPNQLSSPSLGFDGLPGRRRKKRTSIETNVRFALEKSFLANQKP
270 280 290 300 310 320
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pF1KB9 TSEEITMIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSLVATT
::::: .::.::.:::::::::::::::::::::: :..:. .::: . .. .
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: .:: ...: :: .: . :..::.:: ..:: . :... . ..::: .:
CCDS56 PHMVTPQGGAGTLPLSQASSSLSTTVTTLSSAVGTLHPSRTAGGGGGGGGAAPPLNSI--
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::..: : :...... :
CCDS56 -PSVTPPPPATTNSTNPSPQGSHSAIGLSGLNPSTG
440 450 460
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110 120 130 140 150 160
pF1KB9 TGLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQHSASQQHSAAGATISASAATPMTQIPLSQP
. ....:. . .. . ... :: . .: : :..:. :.
CCDS33 SPFSVSPTGPSTKIKAEDPSGDSAPAAPLPPQPAQPH------------LPQAQLMLTGS
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pF1KB9 IQIAQDLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQP-AQFIISQTPQGQQGLLQAQNLLTQL
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:::.:. :: ::: : .:: :: .. :: ::::::::
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:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LEQFARTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLE
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:::::::..: :::: ::. :.:: :..:: .::::::::::::.: ::::::: ::::
CCDS33 KWLNDAETMSVDSSLPSPNQLSSPSLGFDGLPGRRRKKRTSIETNVRFALEKSFLANQKP
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::::: .::.::.:::::::::::::::::::::: :..:. .::: . .. .
CCDS33 TSEEILLIAEQLHMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINP-----CSAAPM---LPSPGKPASYS
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pF1KB9 PSLVT-SSAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLS-VTGT--SDTTSNNTATVISTAPPASSAVT
: .:: ...: :: .: . :..::.:: ..:: . :... . ..::: .:
CCDS33 PHMVTPQGGAGTLPLSQASSSLSTTVTTLSSAVGTLHPSRTAGGGGGGGGAAPPLNSI--
360 370 380 390 400 410
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pF1KB9 SPSLSPSPSASA-STSEASSASETSTTQTTSTPLSSPLGTSQVMVTASGLQTAAAAALQG
::..: : :.. ::. . ..:... . .: ..:
CCDS33 -PSVTPPPPATTNSTNPSPQGSHSAIGLSGLNPSTGPGLWWNPAPYQP
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pF1KB9 AAQLPANASLAAMAAAAGLNPSLMAPSQFAAGGALLSLNPGTLSGALSPALMSNSTLATI
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pF1KB9 HLHQVQLAGTSLQAAAQSLNVQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAIPQTQLMLAGGQI
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CCDS58 KWLNDAETMSVDSSLPSPNQLSSPSLGFDGLPGRRRKKRTSIETNVRFALEKSFLANQKP
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::::: .::.::.:::::::::::::::::::::: :..: ..::: . .. .
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: .:: ... . .:::..:. :.. :..: . ..:: .:
CCDS58 PHMVTPQGG-----AGTLPLSQASS---SLSTTAQTPALKAATRLSACQA
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.. . .. : ::. .:. : ::.::: : . .::..::: :
CCDS84 GNQMSGLNASP-------CQDMASLHPL-------QQLVLV-PGHLQSVSQFLLSQTQPG
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:::: : : .::: :..:: : . :.:: :. : .. : : .
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::.. . . .:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 PKHLPSSGGADEPSDLEELEKFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRF
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pF1KB9 EALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAENLSSDSSLSSPSALNSPGIEGLSRRRKKRTSIETN
:::::::::::::::::::::::::. :: :.:.::. : . : ..:.::::::::::
CCDS84 EALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAESSPSDPSVSTPSSYPSLS-EVFGRKRKKRTSIETN
240 250 260 270 280 290
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::..::: : .: ::.::::.:::.::.:::::.::::::::::::::: : . .:
CCDS84 IRLTLEKRFQDNPKPSSEEISMIAEQLSMEKEVVRVWFCNRRQKEKRINCPVA-----TP
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pF1KB9 IKAIFPSPTS-LVATTPSLVTSSAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLSVTGTSDTTSNNTATV
:: : .: ::. . :: :.: :: ..::. :... :. . .
CCDS84 IKP--PVYNSRLVSPSGSL------GPLSVPPVHSTMPGTVTSSCSPGNNSRPSSPGSGL
350 360 370 380 390
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pF1KB9 ISTAPPASSAVTSPSLSPSPSASASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPLGTSQVMVTASG
...: ::. .. ... . : ..: :
CCDS84 HASSPTASQNNSKAAVNSASSFNSSGSWYRWNHSTYLH
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pF1KB9 IPQTQLMLAGGQITGLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQH-SASQQHSAAG-ATIS
: ... :. ..:: : : . : : .:
CCDS58 SGDVADSTDARSTLSQVEPGNDRNGLDFNRQIKTEDLSDSLQQTLSHRPCHLSQGPAMMS
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.. . .. : ::. .:. : ::.::: : . .::..::: :
CCDS58 GNQMSGLNASP-------CQDMASLHPL-------QQLVLV-PGHLQSVSQFLLSQTQPG
80 90 100 110 120
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:::: : : .::: :..:: : . :.:: :. : .. : : .
CCDS58 QQGL---QPNLLPFPQQ-QSGLLLPQTGPGLASQAFGHPGLPGSSLE--PHLEASQHLPV
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::.. . . .:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKHLPSSGGADEPSDLEELEKFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRF
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:::::::::::::::::::::::::. :: :.:.::. : . : ..:.::::::::::
CCDS58 EALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAESSPSDPSVSTPSSYPSLS-EVFGRKRKKRTSIETN
240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 IRVALEKSFLENQKPTSEEITMIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSP
::..::: : .: ::.::::.:::.::.:::::.::::::::::::::: : . .:
CCDS58 IRLTLEKRFQDNPKPSSEEISMIAEQLSMEKEVVRVWFCNRRQKEKRINCPVA-----TP
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pF1KB9 IKAIFPSPTS-LVATTPSLVTSSAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLSVTGTSDTTSNNTATV
:: : .: ::. . :: :.: :: ..::. :... :. . .
CCDS58 IKP--PVYNSRLVSPSGSL------GPLSVPPVHSTMPGTVTSSCSPGNNSRPSSPGSGL
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...: ::. .. ... . : ..: :
CCDS58 HASSPTASQNNSKAAVNSASSFNSSGSWYRWNHSTYLH
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pF1KB9 QPSVQAAIPQTQLMLAGGQITGLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQHSASQQHSAA
: :::. :. . : . : .
CCDS14 ASNPYSILSSTSLVHADSAGMQQGSPFRNPQKLLQSDYLQGVPSNGHPLGHHWVTSLSDG
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: :. :..:. : . .: . .::: ..... .. . : :: .: . :
CCDS14 GPWSSTLATSPLDQQDV-KPGR--EDLQLGAIIHHRSPHVAHH---SPHTN-HPNAWGAS
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pF1KB9 QTPQGQ-QGLLQAQNLLTQLPQQSQANLLQSQPSITLTSQPATPTRTIAATPIQTLPQSQ
.:. . . : :. .: : . ...:. :: ::. . . . :. : ..
CCDS14 PAPNPSITSSGQPLNVYSQ-PGFTVSGMLEHGG---LTPPPAAAS-AQSLHPVLREPPDH
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pF1KB9 ST--PKRIDTPSLEEPSDLEELEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTI
. .. . : :: .::::::: ::::::::::::.:::::.: :::: ::::::
CCDS14 GELGSHHCQDHSDEETPTSDELEQFAKQFKQRRIKLGFTQADVGLALGTLYGNVFSQTTI
180 190 200 210 220 230
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pF1KB9 SRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAENLSSDSSLSSPSALNSPGIEGLSRRRKKRTSI
:::::.:::::::::::::.:::..: ::: .::..... . .: :.:::::::
CCDS14 CRFEALQLSFKNMCKLKPLLNKWLEEA-----DSSTGSPTSIDKIAAQG--RKRKKRTSI
240 250 260 270 280
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pF1KB9 ETNIRVALEKSFLENQKPTSEEITMIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTS
:.... .:: ::. ::...::. .::.:..::::.:::::::::::::..::
CCDS14 EVSVKGVLETHFLKCPKPAAQEISSLADSLQLEKEVVRVWFCNRRQKEKRMTPPGDQQPH
290 300 310 320 330 340
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pF1KB9 SSPIKAIFPSPTSLVATTPSLVTSSAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLSVTGTSDTTSNNTA
CCDS14 EVYSHTVKTDTSCHDL
350 360
741 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 17:22:58 2016 done: Fri Nov 4 17:22:59 2016
Total Scan time: 4.860 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]