Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9560
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9560, 1136 aa
1>>>pF1KB9560 1136 - 1136 aa - 1136 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5849+/-0.00131; mu= 20.8734+/- 0.078
mean_var=78.0811+/-15.220, 0's: 0 Z-trim(99.9): 72 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.145145
statistics sampled from 5821 (5892) to 5821 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.512), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46477.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1136) 7456 1572.3 0
CCDS82546.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1107) 5425 1147.0 0
CCDS2311.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1078) 5270 1114.5 0
CCDS8929.1 MYO1A gene_id:4640|Hs108|chr12 (1043) 3415 726.1 1e-208
CCDS11003.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1028) 2478 529.9 1.2e-149
CCDS45562.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1044) 2478 529.9 1.2e-149
CCDS42226.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1063) 2478 529.9 1.2e-149
CCDS76991.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 961) 2366 506.4 1.3e-142
CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (1006) 2366 506.4 1.3e-142
CCDS53826.1 MYO1H gene_id:283446|Hs108|chr12 (1022) 2357 504.5 5e-142
CCDS42436.1 MYO5B gene_id:4645|Hs108|chr18 (1848) 1666 360.0 2.9e-98
CCDS42036.1 MYO5C gene_id:55930|Hs108|chr15 (1742) 1622 350.8 1.7e-95
CCDS11144.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1976) 1601 346.4 3.9e-94
CCDS13927.1 MYH9 gene_id:4627|Hs108|chr22 (1960) 1563 338.4 9.5e-92
CCDS10566.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1938) 1556 337.0 2.6e-91
CCDS10565.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1972) 1556 337.0 2.6e-91
CCDS59411.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (1995) 1519 329.2 5.7e-89
CCDS32254.1 MYO1E gene_id:4643|Hs108|chr15 (1108) 1478 320.5 1.4e-86
CCDS42494.1 MYO1F gene_id:4542|Hs108|chr19 (1098) 1468 318.4 5.8e-86
CCDS9601.1 MYH7 gene_id:4625|Hs108|chr14 (1935) 1470 319.0 6.9e-86
CCDS42271.1 MYO15A gene_id:51168|Hs108|chr17 (3530) 1468 318.7 1.5e-85
CCDS76992.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 436) 1448 313.9 5e-85
CCDS11157.1 MYH3 gene_id:4621|Hs108|chr17 (1940) 1453 315.4 8.1e-85
CCDS43127.1 MYH15 gene_id:22989|Hs108|chr3 (1946) 1379 299.9 3.8e-80
CCDS11153.1 MYH8 gene_id:4626|Hs108|chr17 (1937) 1374 298.9 7.7e-80
CCDS34629.1 MYO1G gene_id:64005|Hs108|chr7 (1018) 1350 293.7 1.5e-78
CCDS45262.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1828) 1327 289.0 6.8e-77
CCDS42037.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1855) 1327 289.0 6.9e-77
CCDS73984.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1985) 1272 277.5 2.1e-73
CCDS46405.1 MYO7B gene_id:4648|Hs108|chr2 (2116) 1262 275.4 9.6e-73
CCDS53685.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (1178) 1254 273.6 1.9e-72
CCDS53684.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2175) 1254 273.8 3.1e-72
CCDS53683.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2215) 1254 273.8 3.2e-72
CCDS45424.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1945) 1226 267.9 1.7e-70
CCDS45423.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1979) 1226 267.9 1.7e-70
CCDS46151.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2003) 1201 262.6 6.4e-69
CCDS54112.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 970) 1185 259.1 3.6e-68
CCDS9600.1 MYH6 gene_id:4624|Hs108|chr14 (1939) 1164 254.9 1.3e-66
CCDS46446.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1314) 1160 253.9 1.7e-66
CCDS42773.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1341) 1160 253.9 1.8e-66
CCDS46010.1 MYO9B gene_id:4650|Hs108|chr19 (2022) 1147 251.3 1.6e-65
CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 1142 250.2 2.8e-65
CCDS54834.1 MYO10 gene_id:4651|Hs108|chr5 (2058) 1100 241.5 1.5e-62
CCDS11154.1 MYH4 gene_id:4622|Hs108|chr17 (1939) 1093 240.0 4e-62
CCDS42869.1 MYH7B gene_id:57644|Hs108|chr20 (1983) 1088 239.0 8.4e-62
CCDS45613.1 MYH13 gene_id:8735|Hs108|chr17 (1938) 1082 237.7 2e-61
CCDS11155.1 MYH1 gene_id:4619|Hs108|chr17 (1939) 1081 237.5 2.3e-61
CCDS11156.1 MYH2 gene_id:4620|Hs108|chr17 (1941) 1057 232.5 7.4e-60
CCDS58515.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (2007) 1001 220.8 2.6e-56
CCDS54295.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2036) 938 207.6 2.5e-52
>>CCDS46477.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1136 aa)
initn: 7456 init1: 7456 opt: 7456 Z-score: 8433.1 bits: 1572.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7456; 100.0% identity (100.0% similar) in 1136 aa overlap (1-1136:1-1136)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAKMEVKTSLLDNMIGVGDMVLLEPLNEETFINNLKKRFDHSEIYTYIGSVVISVNPYRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAKMEVKTSLLDNMIGVGDMVLLEPLNEETFINNLKKRFDHSEIYTYIGSVVISVNPYRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LPIYSPEKVEEYRNRNFYELSPHIFALSDEAYRSLRDQDKDQCILITGESGAGKTEASKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LPIYSPEKVEEYRNRNFYELSPHIFALSDEAYRSLRDQDKDQCILITGESGAGKTEASKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 VMSYVAAVCGKGAEVNQVKEQLLQSNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKYMDIEFDFKGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VMSYVAAVCGKGAEVNQVKEQLLQSNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKYMDIEFDFKGDP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LGGVISNYLLEKSRVVKQPRGERNFHVFYQLLSGASEELLNKLKLERDFSRYNYLSLDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LGGVISNYLLEKSRVVKQPRGERNFHVFYQLLSGASEELLNKLKLERDFSRYNYLSLDSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 KVNGVDDAANFRTVRNAMQIVGFMDHEAESVLAVVAAVLKLGNIEFKPESRVNGLDESKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KVNGVDDAANFRTVRNAMQIVGFMDHEAESVLAVVAAVLKLGNIEFKPESRVNGLDESKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KDKNELKEICELTGIDQSVLERAFSFRTVEAKQEKVSTTLNVAQAYYARDALAKNLYSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KDKNELKEICELTGIDQSVLERAFSFRTVEAKQEKVSTTLNVAQAYYARDALAKNLYSRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 FSWLVNRINESIKAQTKVRKKVMGVLDIYGFEIFEDNSFEQFIINYCNEKLQQIFIELTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FSWLVNRINESIKAQTKVRKKVMGVLDIYGFEIFEDNSFEQFIINYCNEKLQQIFIELTL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 KEEQEEYIREDIEWTHIDYFNNAIICDLIENNTNGILAMLDEECLRPGTVTDETFLEKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KEEQEEYIREDIEWTHIDYFNNAIICDLIENNTNGILAMLDEECLRPGTVTDETFLEKLN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 QVCATHQHFESRMSKCSRFLNDTSLPHSCFRIQHYAGKVLYQVEGFVDKNNDLLYRDLSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QVCATHQHFESRMSKCSRFLNDTSLPHSCFRIQHYAGKVLYQVEGFVDKNNDLLYRDLSQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 AMWKASHALIKSLFPEGNPAKINLKRPPTAGSQFKASVATLMKNLQTKNPNYIRCIKPND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AMWKASHALIKSLFPEGNPAKINLKRPPTAGSQFKASVATLMKNLQTKNPNYIRCIKPND
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 KKAAHIFNEALVCHQIRYLGLLENVRVRRAGYAFRQAYEPCLERYKMLCKQTWPHWKGPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KKAAHIFNEALVCHQIRYLGLLENVRVRRAGYAFRQAYEPCLERYKMLCKQTWPHWKGPA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 RSGVEVLFNELEIPVEEYSFGRSKIFIRNPRTLFKLEDLRKQRLEDLATLIQKIYRGWKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RSGVEVLFNELEIPVEEYSFGRSKIFIRNPRTLFKLEDLRKQRLEDLATLIQKIYRGWKC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 RTHFLLMKKSQIVIAAWYRRYAQQKRYQQTKSSALVIQSYIRGWKARKILRELKHQKRCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RTHFLLMKKSQIVIAAWYRRYAQQKRYQQTKSSALVIQSYIRGWKARKILRELKHQKRCK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 EAVTTIAAYWHGTQARRELRRLKEEARNKHAIAVIWAYWLGSKARRELKRLKEEARRKHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EAVTTIAAYWHGTQARRELRRLKEEARNKHAIAVIWAYWLGSKARRELKRLKEEARRKHA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 VAVIWAYWLGLKVRREYRKFFRANAGKKIYEFTLQRIVQKYFLEMKNKMPSLSPIDKNWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VAVIWAYWLGLKVRREYRKFFRANAGKKIYEFTLQRIVQKYFLEMKNKMPSLSPIDKNWP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 SRPYLFLDSTHKELKRIFHLWRCKKYRDQFTDQQKLIYEEKLEASELFKDKKALYPSSVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SRPYLFLDSTHKELKRIFHLWRCKKYRDQFTDQQKLIYEEKLEASELFKDKKALYPSSVG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 QPFQGAYLEINKNPKYKKLKDAIEEKIIIAEVVNKINRANGKSTSRIFLLTNNNLLLADQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QPFQGAYLEINKNPKYKKLKDAIEEKIIIAEVVNKINRANGKSTSRIFLLTNNNLLLADQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 KSGQIKSEVPLVDVTKVSMSSQNDGFFAVHLKEGSEAASKGDFLFSSDHLIEMATKLYRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KSGQIKSEVPLVDVTKVSMSSQNDGFFAVHLKEGSEAASKGDFLFSSDHLIEMATKLYRT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB9 TLSQTKQKLNIEISDEFLVQFRQDKVCVKFIQGNQKNGSVPTCKRKNNRLLEVAVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLSQTKQKLNIEISDEFLVQFRQDKVCVKFIQGNQKNGSVPTCKRKNNRLLEVAVP
1090 1100 1110 1120 1130
>>CCDS82546.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1107 aa)
initn: 5462 init1: 5424 opt: 5425 Z-score: 6134.8 bits: 1147.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7194; 97.4% identity (97.4% similar) in 1136 aa overlap (1-1136:1-1107)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAKMEVKTSLLDNMIGVGDMVLLEPLNEETFINNLKKRFDHSEIYTYIGSVVISVNPYRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MAKMEVKTSLLDNMIGVGDMVLLEPLNEETFINNLKKRFDHSEIYTYIGSVVISVNPYRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LPIYSPEKVEEYRNRNFYELSPHIFALSDEAYRSLRDQDKDQCILITGESGAGKTEASKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LPIYSPEKVEEYRNRNFYELSPHIFALSDEAYRSLRDQDKDQCILITGESGAGKTEASKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 VMSYVAAVCGKGAEVNQVKEQLLQSNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKYMDIEFDFKGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VMSYVAAVCGKGAEVNQVKEQLLQSNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKYMDIEFDFKGDP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LGGVISNYLLEKSRVVKQPRGERNFHVFYQLLSGASEELLNKLKLERDFSRYNYLSLDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LGGVISNYLLEKSRVVKQPRGERNFHVFYQLLSGASEELLNKLKLERDFSRYNYLSLDSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 KVNGVDDAANFRTVRNAMQIVGFMDHEAESVLAVVAAVLKLGNIEFKPESRVNGLDESKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KVNGVDDAANFRTVRNAMQIVGFMDHEAESVLAVVAAVLKLGNIEFKPESRVNGLDESKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KDKNELKEICELTGIDQSVLERAFSFRTVEAKQEKVSTTLNVAQAYYARDALAKNLYSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KDKNELKEICELTGIDQSVLERAFSFRTVEAKQEKVSTTLNVAQAYYARDALAKNLYSRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 FSWLVNRINESIKAQTKVRKKVMGVLDIYGFEIFEDNSFEQFIINYCNEKLQQIFIELTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FSWLVNRINESIKAQTKVRKKVMGVLDIYGFEIFEDNSFEQFIINYCNEKLQQIFIELTL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 KEEQEEYIREDIEWTHIDYFNNAIICDLIENNTNGILAMLDEECLRPGTVTDETFLEKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KEEQEEYIREDIEWTHIDYFNNAIICDLIENNTNGILAMLDEECLRPGTVTDETFLEKLN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 QVCATHQHFESRMSKCSRFLNDTSLPHSCFRIQHYAGKVLYQVEGFVDKNNDLLYRDLSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QVCATHQHFESRMSKCSRFLNDTSLPHSCFRIQHYAGKVLYQVEGFVDKNNDLLYRDLSQ
490 500 510 520 530 540
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pF1KB9 AMWKASHALIKSLFPEGNPAKINLKRPPTAGSQFKASVATLMKNLQTKNPNYIRCIKPND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AMWKASHALIKSLFPEGNPAKINLKRPPTAGSQFKASVATLMKNLQTKNPNYIRCIKPND
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 KKAAHIFNEALVCHQIRYLGLLENVRVRRAGYAFRQAYEPCLERYKMLCKQTWPHWKGPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KKAAHIFNEALVCHQIRYLGLLENVRVRRAGYAFRQAYEPCLERYKMLCKQTWPHWKGPA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 RSGVEVLFNELEIPVEEYSFGRSKIFIRNPRTLFKLEDLRKQRLEDLATLIQKIYRGWKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RSGVEVLFNELEIPVEEYSFGRSKIFIRNPRTLFKLEDLRKQRLEDLATLIQKIYRGWKC
670 680 690 700 710 720
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pF1KB9 RTHFLLMKKSQIVIAAWYRRYAQQKRYQQTKSSALVIQSYIRGWKARKILRELKHQKRCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RTHFLLMKKSQIVIAAWYRRYAQQKRYQQTKSSALVIQSYIRGWKARKILRELKHQKRCK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 EAVTTIAAYWHGTQARRELRRLKEEARNKHAIAVIWAYWLGSKARRELKRLKEEARRKHA
::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS82 EAVTTIAAYWHGTQARREL-----------------------------KRLKEEARRKHA
790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 VAVIWAYWLGLKVRREYRKFFRANAGKKIYEFTLQRIVQKYFLEMKNKMPSLSPIDKNWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VAVIWAYWLGLKVRREYRKFFRANAGKKIYEFTLQRIVQKYFLEMKNKMPSLSPIDKNWP
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 SRPYLFLDSTHKELKRIFHLWRCKKYRDQFTDQQKLIYEEKLEASELFKDKKALYPSSVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SRPYLFLDSTHKELKRIFHLWRCKKYRDQFTDQQKLIYEEKLEASELFKDKKALYPSSVG
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.: ..:: :..:... .:::. ::.:. .::: :.::: :: :::::::::.::::
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CCDS89 REGVEKVLGELSMSSGELAFGKTKIFIRSPKTLFYLEEQRRLRLQQLATLIQKIYRGWRC
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CCDS89 KKSQAKIVIGLDNVAGVSVTSLKDGLFSLHLSEMSSVGSKGDFLLVSEHVIELLTKMYRA
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CCDS89 VLDATQRQLTVTVTEKFSVRFKENSVAVKVVQGPAGGDNSKLRYKKKGSHCLEVTVQ
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CCDS11 MESALTARDR-VGVQDFVLLENFTSEAAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYR
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.: ::: ...:.::. .:::. ::.::..: .::.:: . .:: ..:.::::::::::.:
CCDS11 DLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATK
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pF1KB9 LVMSYVAAVCGKGAEVNQVKEQLLQSNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKYMDIEFDFKGD
.... : .: . . :...::::::::::::::::.:::::::::::::..:::::
CCDS11 RLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPVLEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGA
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pF1KB9 PLGGVISNYLLEKSRVVKQPRGERNFHVFYQLLSGASEELLNKLKLERDFSRYNYL-SLD
:.:: : .:::::::::.: .::::::.::::: :. :: : .: :::. . : :: . .
CCDS11 PVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQ
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pF1KB9 SAKVNGVDDAANFRTVRNAMQIVGFMDHEAESVLAVVAAVLKLGNIEFKPESRVNGLDES
:::....: .....::.:. .. : . :.:..:..::.::.::::.: . . : .
CCDS11 CAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLLSIVASVLHLGNIHFAANEESN----A
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pF1KB9 KIKDKNELKEICELTGIDQSVLERAFSFRTVEAKQEKVSTTLNVAQAYYARDALAKNLYS
.. .:.:: . .: ... :.:..:.. : . :: :.. . ::. :: :::::::: .::
CCDS11 QVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYS
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pF1KB9 RLFSWLVNRINES-----IKAQTKVRKKVMGVLDIYGFEIFEDNSFEQFIINYCNEKLQQ
: :.:::..::.: ... . :.:.:::::::.:. :::::: ::::::::::
CCDS11 RTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQ
360 370 380 390 400 410
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pF1KB9 IFIELTLKEEQEEYIREDIEWTHIDYFNNAIICDLIENNTNGILAMLDEECLRPGTVTDE
.::::::: ::::: : : : ..:::: :::::.:.. .::...::::::::: .::
CCDS11 LFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIICDLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDL
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pF1KB9 TFLEKLNQVCATHQHFESRMSKCSRFLNDTSLPHSCFRIQHYAGKVLYQVEGFVDKNNDL
::::::... : :: .. .: . :: .. ::. ::::.: :.: ::.::::::
CCDS11 TFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQR--TRKSLGRGEFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDL
480 490 500 510 520 530
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pF1KB9 LYRDLSQAMWKASHALIKSLFPEGNPAKINLKRPPTAGSQFKASVATLMKNLQTKNPNYI
:.:.:...: .... .... : ... . . ::: :...::: :. :.. ::.:.: :.
CCDS11 LFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELS--DKKRPETVATQFKMSLLQLVEILQSKEPAYV
540 550 560 570 580
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::::::: : :.:.:. ::..:::::::.::::::.:.:. :: :.::: :: .::
CCDS11 RCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETW
590 600 610 620 630 640
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pF1KB9 PHWKGPARSGVEVLFNELEIPVEEYSFGRSKIFIRNPRTLFKLEDLRKQRLEDLATLIQK
: : : ..:: :: .: :::..::.::::: :.::: :: . : ..::: ::
CCDS11 PTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFATEDALEVRRQSLATKIQA
650 660 670 680 690 700
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pF1KB9 IYRGWKCRTHFLLMKKSQIVIAAWYRRYAQQKRYQQTKSSALVIQSYIRGWKARKILREL
.::.. : .:: .:.: : : .:.: ... . : .: .:. :::. .::
CCDS11 AWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQTIRRLIRGF----VLR--
710 720 730 740 750 760
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: :: :
CCDS11 -HAPRCPE----------------------------------------------------
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:: : :... ...:... ..:. .
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.: .::. : . .... .:: .:. :.. .. .:.: ..: :::.::
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:: ::.:: . : .. : .. .:. :. : : : : : .: . : :: .:
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:: : ...... ...:... ...: .:.:: .:..:..:... .. .::: ...:::
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.:: :: :.:: .. ...::
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CCDS45 -QQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDEISPRV--LQALGSEPIQYAVPVVKY
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10 20 30
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CCDS76 DPIGGHINNYLLEKSRVIVQQPGERSFHSFYQLLQGGSEQMLRSLHLQKSLSSYNYIHVG
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CCDS76 AQLKSSINDAAEFRVVADAMKVIGFKPEEIQTVYKILAAILHLGNLKFV----VDG-DTP
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CCDS76 LIENGKVVSIIAELLSTKTDMVEKALLYRTVATGRDIIDKQHTEQEASYGRDAFAKAIYE
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CCDS32 TWPNHDLPSDKEAVKKLIERCGFQ-DDVAYGKTKIFIRTPRTLFTLEELRAQMLIRIVLF
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CCDS53 PVGGHIISYLIEKSRVVYQNEGERNFHIFYQLLAGGEEERLSYLGLERDPQLYKYLSQGH
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CCDS53 PPAEGVERLIKYIGYKPEEYKLGKTKIFIRFPRTLFATEDAFE-----------------
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1020
1136 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Fri Nov 4 17:17:39 2016 done: Fri Nov 4 17:17:40 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]