Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9556
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9556, 871 aa
1>>>pF1KB9556 871 - 871 aa - 871 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.3597+/-0.0013; mu= -20.4105+/- 0.078
mean_var=475.0779+/-96.359, 0's: 0 Z-trim(113.4): 56 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.058843
statistics sampled from 14017 (14070) to 14017 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.432), width: 16
Scan time: 5.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46938.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 ( 871) 5690 498.1 2.8e-140
CCDS58858.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 ( 791) 5145 451.8 2.2e-126
CCDS46.2 ARHGEF16 gene_id:27237|Hs108|chr1 ( 709) 1731 162.0 3.5e-39
CCDS2500.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 ( 710) 822 84.8 6e-16
CCDS46544.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 ( 618) 819 84.5 6.4e-16
CCDS11139.1 ARHGEF15 gene_id:22899|Hs108|chr17 ( 841) 810 83.8 1.4e-15
CCDS34771.1 ARHGEF5 gene_id:7984|Hs108|chr7 (1597) 708 75.3 9.8e-13
CCDS170.1 ARHGEF19 gene_id:128272|Hs108|chr1 ( 802) 659 71.0 9.8e-12
>>CCDS46938.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 (871 aa)
initn: 5690 init1: 5690 opt: 5690 Z-score: 2631.8 bits: 498.1 E(32554): 2.8e-140
Smith-Waterman score: 5690; 99.8% identity (99.9% similar) in 871 aa overlap (1-871:1-871)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MDGESEVDFSSNSITPLWRRRSIPQPHQLLGRSKPRPQSYQSPNGLLITDFPVEDGGTLS
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CCDS46 MDGESEVDFSSNSITPLWRRRSIPQPHQVLGRSKPRPQSYQSPNGLLITDFPVEDGGTLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AAQIPAQVPTASDSRTVHRSPLLLGAQRRAVANGGTASPEYRAASPRLRRPKSPKLPKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AAQIPAQVPTASDSRTVHRSPLLLGAQRRAVANGGTASPEYRAASPRLRRPKSPKLPKAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 PGGSPKSPANGAVTLPAPPPPPVLRPPRTPNAPAPCTPEEDLTGLTASPVPSPTANGLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PGGSPKSPANGAVTLPAPPPPPVLRPPRTPNAPAPCTPEEDLTGLTASPVPSPTANGLAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NNDSPGSGSQSGRKAKDPERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLENPSVVLSTNSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NNDSPGSGSQSGRKAKDPERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLENPSVVLSTNSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 AALKVGKQQIIPKSLASEIKISKSNNQNVEPHKRLLKVRSMVEGLGGPLGHAGEESEVDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AALKVGKQQIIPKSLASEIKISKSNNQNVEPHKRLLKVRSMVEGLGGPLGHAGEESEVDN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DVDSPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNRMSQPVLKVVMEDKEKFSSLGRI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 KKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDIDSDEESEPKEQKSDEKIVIHHKPLRSTWSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDIDSDEESEPKEQKSDEKIVIHHKPLRSTWSQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSKELSDTMTKTER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSKELSDTMTKTER
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 HHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPYVKYCTNEVYQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPYVKYCTNEVYQQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 RTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLMDTICQKTPKDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLMDTICQKTPKDS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 PKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEFKIKPFPLVSSSRWLVKRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEFKIKPFPLVSSSRWLVKRG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 ELTAYVEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVLIITKKKSEESYNVNDYSLRDQLLVESCDNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ELTAYVEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVLIITKKKSEESYNVNDYSLRDQLLVESCDNE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 ELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEMLLGAETQSERARWITALGHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEMLLGAETQSERARWITALGHS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 SGKPPADRTSLTQVEIVRSFTAKQPDELSLQVADVVLIYQRVSDGWYEGERLRDGERGWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SGKPPADRTSLTQVEIVRSFTAKQPDELSLQVADVVLIYQRVSDGWYEGERLRDGERGWF
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KB9 PMECAKEITCQATIDKNVERMGRLLGLETNV
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PMECAKEITCQATIDKNVERMGRLLGLETNV
850 860 870
>>CCDS58858.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 (791 aa)
initn: 5145 init1: 5145 opt: 5145 Z-score: 2382.4 bits: 451.8 E(32554): 2.2e-126
Smith-Waterman score: 5145; 99.7% identity (99.9% similar) in 789 aa overlap (1-789:1-789)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MDGESEVDFSSNSITPLWRRRSIPQPHQLLGRSKPRPQSYQSPNGLLITDFPVEDGGTLS
::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MDGESEVDFSSNSITPLWRRRSIPQPHQVLGRSKPRPQSYQSPNGLLITDFPVEDGGTLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AAQIPAQVPTASDSRTVHRSPLLLGAQRRAVANGGTASPEYRAASPRLRRPKSPKLPKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AAQIPAQVPTASDSRTVHRSPLLLGAQRRAVANGGTASPEYRAASPRLRRPKSPKLPKAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 PGGSPKSPANGAVTLPAPPPPPVLRPPRTPNAPAPCTPEEDLTGLTASPVPSPTANGLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PGGSPKSPANGAVTLPAPPPPPVLRPPRTPNAPAPCTPEEDLTGLTASPVPSPTANGLAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NNDSPGSGSQSGRKAKDPERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLENPSVVLSTNSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NNDSPGSGSQSGRKAKDPERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLENPSVVLSTNSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 AALKVGKQQIIPKSLASEIKISKSNNQNVEPHKRLLKVRSMVEGLGGPLGHAGEESEVDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AALKVGKQQIIPKSLASEIKISKSNNQNVEPHKRLLKVRSMVEGLGGPLGHAGEESEVDN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 DVDSPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNRMSQPVLKVVMEDKEKFSSLGRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DVDSPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNRMSQPVLKVVMEDKEKFSSLGRI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 KKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDIDSDEESEPKEQKSDEKIVIHHKPLRSTWSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDIDSDEESEPKEQKSDEKIVIHHKPLRSTWSQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSKELSDTMTKTER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSKELSDTMTKTER
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 HHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPYVKYCTNEVYQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPYVKYCTNEVYQQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 RTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLMDTICQKTPKDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLMDTICQKTPKDS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 PKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEFKIKPFPLVSSSRWLVKRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEFKIKPFPLVSSSRWLVKRG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 ELTAYVEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVLIITKKKSEESYNVNDYSLRDQLLVESCDNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELTAYVEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVLIITKKKSEESYNVNDYSLRDQLLVESCDNE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 ELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEMLLGAETQSERARWITALGHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEMLLGAETQSERARWITALGHS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 SGKPPADRTSLTQVEIVRSFTAKQPDELSLQVADVVLIYQRVSDGWYEGERLRDGERGWF
:::::::::
CCDS58 SGKPPADRTCG
790
>>CCDS46.2 ARHGEF16 gene_id:27237|Hs108|chr1 (709 aa)
initn: 1524 init1: 1072 opt: 1731 Z-score: 816.8 bits: 162.0 E(32554): 3.5e-39
Smith-Waterman score: 1755; 46.4% identity (70.4% similar) in 675 aa overlap (216-871:58-709)
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 GSGSQSGRKAKDPERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLENPSVVLSTNSPAALKV
: : :..: : .::::.::::::.
CCDS46 GGNPASGLPMVRGSPRVRDDAAFQPQVPAPPQPRPPGHE----EPWPIVLSTESPAALKL
30 40 50 60 70 80
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 GKQQIIPKSLASEIKISKSNNQNVEPHKRLLK--VRSMVEGLGGPLGHAGEESEVDNDVD
: ::.:::::: : . .. : . .: . : .: . ...: : :
CCDS46 GTQQLIPKSLAVASKAKTPARHQSFGAAVLSREAARRDPKLLPAP---SFSLDDMDVDKD
90 100 110 120 130 140
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 SPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNRMSQPVLKVVMEDKEKFSSLGRIKKK
: :::.::. ::: :...:. .: .. ..: : :... :. . . . :.:
CCDS46 PGGMLRRNLRNQSYR-AAMKGL--GKPGGQGDAIQLS-PKLQALAEEPSQPHTRSPAKNK
150 160 170 180 190
370 380 390 400 410
pF1KB9 MLKG-----QGTFDGEENAVLYQNYKEKALDIDS-------DEESEPK-EQKSDEKIVIH
: .:.: ... :::. .:..:. .. :: : :. :: : ::..
CCDS46 KTLGRKRGHKGSF--KDDPQLYQEIQERGLNTSQESDDDILDESSSPEGTQKVDATIVVK
200 210 220 230 240 250
420 430 440 450 460
pF1KB9 -HKPLRSTWSQLSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSK
..: . ::::: : . :. . .: ::::::::.::...:: :: :: ::.. : .::
CCDS46 SYRPAQVTWSQLPEVVELGILDQLSTEERKRQEAMFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSK
260 270 280 290 300 310
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 ELSDTMTKTERHHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPY
:: :.:. :.::::::: :: ::..:: .:: ::. .....:::::.:.:. . : ::
CCDS46 ELRATVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKHFHPY
320 330 340 350 360 370
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 VKYCTNEVYQQRTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLM
. ::.::::::::::::...: .:.:.: .:: . : .:::.:::::::::::::::::
CCDS46 IAYCSNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLM
380 390 400 410 420 430
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 DTICQKTPKDSPKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEF-KIKPFP
::.: :: : .:.. .:::: .::::: :::::..::: :.:::...::.: :.: .:
CCDS46 DTLCLKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLP
440 450 460 470 480 490
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 LVSSSRWLVKRGELTAYVEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVLIITKKKSEESYNVNDYSL
:.:.::::.::::: ::.: :: . .:. :.:::::::..::::::::: :.::.
CCDS46 LISASRWLLKRGELF-LVEETGLFRKIASRPTCYLFLFNDVLVVTKKKSEESYMVQDYAQ
500 510 520 530 540 550
710 720 730 740 750 760
pF1KB9 RDQLLVESCDNEELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEMLLGAETQS
... ::. . :: : : :.::. : : .:.: : ... ..::.... :
CCDS46 MNHIQVEKIEPSELPLPGGGN-------RSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSAS
560 570 580 590 600
770 780 790 800 810 820
pF1KB9 ERARWITALGHSSGKPP--ADRTSLTQVEIVRSFTAKQPDELSLQVADVVLIYQRVSDGW
.:::::.:: :: . ... .: ::::...: ::: ::..:: :::::. :. :::
CCDS46 DRARWIVALTHSERQWQGLSSKGDLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQ-EDGW
610 620 630 640 650 660
830 840 850 860 870
pF1KB9 YEGERLRDGERGWFPMECAKEITCQATIDKNVERMGRLLGLETNV
:::::::: :::: . :. :: ..... ::.:: :: .::.:
CCDS46 LYGERLRDGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLR-VETDV
670 680 690 700
>>CCDS2500.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 (710 aa)
initn: 1017 init1: 709 opt: 822 Z-score: 399.8 bits: 84.8 E(32554): 6e-16
Smith-Waterman score: 1067; 31.8% identity (61.6% similar) in 698 aa overlap (198-864:32-687)
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 SPVPSPTANGLAANNDSPGSGSQSGRKAKDPERGLFPGPQKSSS-----EQKLPLQRLPS
:: :.: ...:. ..: : ..:
CCDS25 ETRESEDLEKTRRKSASDQWNTDNEPAKVKPE--LLPEKEETSQADQDIQDKEPHCHIPI
10 20 30 40 50
230 240 250 260 270
pF1KB9 QENELLENPSVVLSTNSPAALKVGKQQIIPKSLASEIKISKSNNQNVE-------PHKRL
..: .. : :. .: : : . :. :: . :..:...:. : .:.
CCDS25 KRNSIF-NRSI--RRKSKA-----KARDNPERNASCLADSQDNGKSVNEPLTLNIPWSRM
60 70 80 90 100 110
280 290 300 310 320
pF1KB9 LKVRS----------MVEGLGGPLGHAGEESEVDNDVDSPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGF
:. : :. . : :... : .::: .: ..:: .. .
CCDS25 PPCRTAMQTDPGAQEMSESSSTP-GNGATPEEWPALADSPTTLTEALR-------MIHPI
120 130 140 150 160
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 DFDSPTSSKKKNRMSQPVLKVVMEDKEKFSSLGRIKKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKE
:: .: . : : . .: ..: :.: .:. . . :. ... .. :
CCDS25 PADS-----WRNLIEQIGL-LYQEYRDK-STLQEIETRRQQDAEIEDNTNGSPASEDTPE
170 180 190 200 210
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 KALDIDSDEE-SEPKEQKSDEKIVIHHKPLR--STWSQLSAVKRKGLSQTVSQEERKRQE
. . . .:: . : :.:. .: . .: . :..: .. .:. . .. :: : ::
CCDS25 EEEEEEEEEEPASPPERKTLPQICLLSNPHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQE
220 230 240 250 260 270
450 460 470 480 490 500
pF1KB9 AIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSKELSDTMTKTERHHLFSNITDVCEASKKFFIELE
:.::...:: :: ::..:. : ..... . .: : ::::. :: .:..:..:::
CCDS25 AMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELE
280 290 300 310 320 330
510 520 530 540 550 560
pF1KB9 ARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPYVKYCTNEVYQQRTLQKLLATNPSFKEVLSRIES
: ..:: :.:. ::: ...:. :. :. : .:..::.:: ..:: . .:.:.....:
CCDS25 HRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVSNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLEL
340 350 360 370 380 390
570 580 590 600 610 620
pF1KB9 HEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLMDTICQKTPKDSPKYEVCKRALKEVSKLVRLCNE
::.::. ::::::.::.::: ::...: ... . : . . : ::. .:. :::
CCDS25 DPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILKRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNE
400 410 420 430 440 450
630 640 650 660 670 680
pF1KB9 GARKMERTEMMYTINSQLEFKIKPFPLVSSSRWLVKRGELTAYVEDTVLFSRRTSK--QQ
:.::: :::.: .:....::::: :..: ::::.:.::: . . . ::.: ..
CCDS25 GVRKMSRTEQMISIQKKMEFKIKSVPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHE
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pF1KB9 VYFFLFNDVLIITKKKSEESYNVNDYSLRDQLLVESCDNEELNSSPGKNSSTMLYSRQSS
.:.:::::.:.: .. ..:.: : . : : :: ... :. .
CCDS25 IYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLRVEELEDQ------GQ-----------T
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750 760 770 780 790
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...: : .: : .... ..: : .::: ::.:.:. . .. :: ::.
CCDS25 LANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQC
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:. ..:.:::::.:..::.. : ....::: ::::.: :::::: ..:: ..
CCDS25 VHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQ
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CCDS25 NLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
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: ..... . .: : ::::. :: .:..:..::: : ..:: :.:. ::: ...:
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. :. :. : .:..::.:: ..:: . .:.:.....: ::.::. ::::::.::.:
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:: ::...: ... . : . . : ::. .:. ::::.::: :::.: .:....:::
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:: :..: ::::.:.::: . . . ::.: ...:.:::::.:.: .. ..:
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.: : . : : :: ... :. . ...: : .: : .... ..
CCDS46 QVFDSAPRGLLRVEELEDQ------GQ-----------TLANVFILRLLENADDREATYM
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: : .::: ::.:.:. . .. :: ::. :. ..:.:::::.:..::..
CCDS46 LKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILN
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: ....::: ::::.: :::::: ..:: ..:... :.
CCDS46 ILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKD
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CCDS46 RRKLGSRNRQ
610
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CCDS11 -----PQELPRNSNDAPTPMCTPIFWEPPAASLKPPALLPPSASRAS--LDSQTSPDSPS
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. . :. :: :.: :: :: . ..:.. :: :::: .
CCDS11 TVRRLAGRFEGGAEGR-AQDADAPEPGL-QARADVNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLAC
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CCDS11 PPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRRASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSY
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CCDS11 RSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPDLDLLSEDGIQTG---DSPDEAPQN--
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. : ...: .:. .: ..:: :. .. :::.:. .:. . :.
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. :. .. . .. . : :.: :..: ::. .:: .:.: .::. ::..:::..:: :
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:: ::..: : :. : ::.: ..: ::::. : .:..:. : .: ... :.:
CCDS11 YLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISD
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. :.:. :... :. :: : :. ::..: ..:. :: :. : :..: :. ::. :
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::.::.::.::: .:...: ..: . : . : ..:: :::... :. . .:..:: .
CCDS11 FLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEEL
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CCDS11 IRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLL
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CCDS11 SNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFP-TPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAK
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. ::. . ... .:: .: : :: . . :.: . ..... ::
CCDS11 TEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLP------GAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRL
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CCDS11 LEAVGSSSGTPNAPPP
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.. . .:::.:.. .:. :.:... : :. .. .: .. .
CCDS34 NS-----SQLLYQEYSDVVLNKEIQSQQRLESLSETPGPSSPRQPRKALVSSESYLQRLS
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CCDS34 MASSGSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHFQLSTS
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CCDS34 LRATLSNQEHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDFRRVYL
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CCDS34 PYVTNQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRLKLLLQ
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CCDS34 NILKRTQPGSSEEAEATK-AHHALEQLIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEFECKIFPL
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CCDS34 ISQSRWLVKSGELTALEFSASPGLRRKLNTRPVHLHLFNDCLLLSRPREGSRFLVFDHAP
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CCDS34 FSSIRGEKCEMK-LHG-PHKN--------------LFRLFLRQNTQGAQAEFLFRTETQS
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CCDS34 EKLRWISALAM-----PREELDLLECYNSPQVQCLRAYKPRENDELALEKADVVMVTQQS
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pF1KB9 SDGWYEGERLRDGERGWFPMECAKEITCQATIDKNVERMGRLLGLETNV
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CCDS34 SDGWLEGVRLSDGERGWFPVQQVEFISNPEVRAQNLKEAHRVKTAKLQLVEQQA
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pF1KB9 DSRTVHRSPLLLGAQRRAVANGGTASPEYRAASPRLRRPKSPKLPKAVPGGSPKSPANGA
: : :. : :: : . . : :.
CCDS17 PPATLQPHLTGPPGTAHHPVAVCQQESLSFAELPALK-PPSPVCLDLFPVAPEELRAPGS
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pF1KB9 V-TLPAPPPPPVLRPPRTPNAPAPCTPEEDLTGLTASPVPS-PTANGLAANNDSPG-SGS
.: .: : :. : .:. : :. : . : : : . :. :
CCDS17 RWSLGTPAP---LQGLLWPLSPGGSDTEITSGGMRPSRAGSWPHCPG----AQPPALEGP
70 80 90 100 110
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pF1KB9 QSGRKAKDPERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLENPSVVLSTNSPAALKVGKQQ
: :... :.: : .:.:. .:. . :..:. : . :. .: ..:
CCDS17 WSPRHTQ-PQRRASHGSEKKSAWRKMRVY----QREEVPGCPEAHAVFLEPG--QVVQEQ
120 130 140 150 160
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pF1KB9 IIPKSLASEIKISKSNNQNVE-PHKRLLKVRSMVEGLGGPLGHAGEESEVDNDVDSPGS-
. .. ....: :. ..: :..: ... .. : . : . :..: . ... :.
CCDS17 AL-STEEPRVELSGSTRVSLEGPERRRFSASELMTRLHSSL-RLGRNSAARALISGSGTG
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pF1KB9 -LRRGLRSTSYRRAV-VSGFDFDSPT-SSKKKNRMSQPVLKVVMEDKEKFSSLGRIKKKM
:.: : :.: .:: . :. ...... :.: : : .. :: ..
CCDS17 AAREGKASGMEARSVEMSGDRVSRPAPGDSREGDWSEPRL-----DTQEEPPLGS-RSTN
230 240 250 260 270 280
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pF1KB9 LKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDIDSDEESEPKEQKSDEKIVIHHKP-----------
. :. : :.::::.:.. : . .... .: .:: .. :
CCDS17 ERRQSRF--LLNSVLYQEYSDVASARELRRQQREEEGPGDEAEGAEEGPGPPRANLSPSS
290 300 310 320 330
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pF1KB9 -LR----------STWSQLSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILI
.: : :... :. .:. :.: .. : ::: ::.:.:: ::. :: . .
CCDS17 SFRAQRSARGSTFSLWQDIPDVRGSGVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAV
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 RMFKNSKELSDTMTKTERHHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHT
: .: :::. . ... :::.. .: .:..:. .:: : . ... .. :.: :
CCDS17 GHFLGSAELSECLGAQDKQWLFSKLPEVKSTSERFLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHC
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