Result of FASTA (ccds) for pF1KB9556
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9556, 871 aa
  1>>>pF1KB9556 871 - 871 aa - 871 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.3597+/-0.0013; mu= -20.4105+/- 0.078
 mean_var=475.0779+/-96.359, 0's: 0 Z-trim(113.4): 56  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.058843
 statistics sampled from 14017 (14070) to 14017 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.432), width:  16
 Scan time:  5.680

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS46938.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3      ( 871) 5690 498.1 2.8e-140
CCDS58858.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3      ( 791) 5145 451.8 2.2e-126
CCDS46.2 ARHGEF16 gene_id:27237|Hs108|chr1         ( 709) 1731 162.0 3.5e-39
CCDS2500.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2           ( 710)  822 84.8   6e-16
CCDS46544.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2          ( 618)  819 84.5 6.4e-16
CCDS11139.1 ARHGEF15 gene_id:22899|Hs108|chr17     ( 841)  810 83.8 1.4e-15
CCDS34771.1 ARHGEF5 gene_id:7984|Hs108|chr7        (1597)  708 75.3 9.8e-13
CCDS170.1 ARHGEF19 gene_id:128272|Hs108|chr1       ( 802)  659 71.0 9.8e-12


>>CCDS46938.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3           (871 aa)
 initn: 5690 init1: 5690 opt: 5690  Z-score: 2631.8  bits: 498.1 E(32554): 2.8e-140
Smith-Waterman score: 5690; 99.8% identity (99.9% similar) in 871 aa overlap (1-871:1-871)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDGESEVDFSSNSITPLWRRRSIPQPHQLLGRSKPRPQSYQSPNGLLITDFPVEDGGTLS
       ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS46 MDGESEVDFSSNSITPLWRRRSIPQPHQVLGRSKPRPQSYQSPNGLLITDFPVEDGGTLL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 AAQIPAQVPTASDSRTVHRSPLLLGAQRRAVANGGTASPEYRAASPRLRRPKSPKLPKAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AAQIPAQVPTASDSRTVHRSPLLLGAQRRAVANGGTASPEYRAASPRLRRPKSPKLPKAV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 PGGSPKSPANGAVTLPAPPPPPVLRPPRTPNAPAPCTPEEDLTGLTASPVPSPTANGLAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PGGSPKSPANGAVTLPAPPPPPVLRPPRTPNAPAPCTPEEDLTGLTASPVPSPTANGLAA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 NNDSPGSGSQSGRKAKDPERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLENPSVVLSTNSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NNDSPGSGSQSGRKAKDPERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLENPSVVLSTNSP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 AALKVGKQQIIPKSLASEIKISKSNNQNVEPHKRLLKVRSMVEGLGGPLGHAGEESEVDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AALKVGKQQIIPKSLASEIKISKSNNQNVEPHKRLLKVRSMVEGLGGPLGHAGEESEVDN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 DVDSPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNRMSQPVLKVVMEDKEKFSSLGRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DVDSPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNRMSQPVLKVVMEDKEKFSSLGRI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 KKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDIDSDEESEPKEQKSDEKIVIHHKPLRSTWSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDIDSDEESEPKEQKSDEKIVIHHKPLRSTWSQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 LSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSKELSDTMTKTER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSKELSDTMTKTER
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 HHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPYVKYCTNEVYQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPYVKYCTNEVYQQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 RTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLMDTICQKTPKDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLMDTICQKTPKDS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 PKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEFKIKPFPLVSSSRWLVKRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEFKIKPFPLVSSSRWLVKRG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 ELTAYVEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVLIITKKKSEESYNVNDYSLRDQLLVESCDNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ELTAYVEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVLIITKKKSEESYNVNDYSLRDQLLVESCDNE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 ELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEMLLGAETQSERARWITALGHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEMLLGAETQSERARWITALGHS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB9 SGKPPADRTSLTQVEIVRSFTAKQPDELSLQVADVVLIYQRVSDGWYEGERLRDGERGWF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SGKPPADRTSLTQVEIVRSFTAKQPDELSLQVADVVLIYQRVSDGWYEGERLRDGERGWF
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870 
pF1KB9 PMECAKEITCQATIDKNVERMGRLLGLETNV
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PMECAKEITCQATIDKNVERMGRLLGLETNV
              850       860       870 

>>CCDS58858.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3           (791 aa)
 initn: 5145 init1: 5145 opt: 5145  Z-score: 2382.4  bits: 451.8 E(32554): 2.2e-126
Smith-Waterman score: 5145; 99.7% identity (99.9% similar) in 789 aa overlap (1-789:1-789)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDGESEVDFSSNSITPLWRRRSIPQPHQLLGRSKPRPQSYQSPNGLLITDFPVEDGGTLS
       ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS58 MDGESEVDFSSNSITPLWRRRSIPQPHQVLGRSKPRPQSYQSPNGLLITDFPVEDGGTLL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 AAQIPAQVPTASDSRTVHRSPLLLGAQRRAVANGGTASPEYRAASPRLRRPKSPKLPKAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AAQIPAQVPTASDSRTVHRSPLLLGAQRRAVANGGTASPEYRAASPRLRRPKSPKLPKAV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 PGGSPKSPANGAVTLPAPPPPPVLRPPRTPNAPAPCTPEEDLTGLTASPVPSPTANGLAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PGGSPKSPANGAVTLPAPPPPPVLRPPRTPNAPAPCTPEEDLTGLTASPVPSPTANGLAA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 NNDSPGSGSQSGRKAKDPERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLENPSVVLSTNSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NNDSPGSGSQSGRKAKDPERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLENPSVVLSTNSP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 AALKVGKQQIIPKSLASEIKISKSNNQNVEPHKRLLKVRSMVEGLGGPLGHAGEESEVDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AALKVGKQQIIPKSLASEIKISKSNNQNVEPHKRLLKVRSMVEGLGGPLGHAGEESEVDN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 DVDSPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNRMSQPVLKVVMEDKEKFSSLGRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DVDSPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNRMSQPVLKVVMEDKEKFSSLGRI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 KKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDIDSDEESEPKEQKSDEKIVIHHKPLRSTWSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDIDSDEESEPKEQKSDEKIVIHHKPLRSTWSQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 LSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSKELSDTMTKTER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSKELSDTMTKTER
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 HHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPYVKYCTNEVYQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPYVKYCTNEVYQQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 RTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLMDTICQKTPKDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLMDTICQKTPKDS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 PKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEFKIKPFPLVSSSRWLVKRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEFKIKPFPLVSSSRWLVKRG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 ELTAYVEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVLIITKKKSEESYNVNDYSLRDQLLVESCDNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELTAYVEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVLIITKKKSEESYNVNDYSLRDQLLVESCDNE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 ELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEMLLGAETQSERARWITALGHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEMLLGAETQSERARWITALGHS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB9 SGKPPADRTSLTQVEIVRSFTAKQPDELSLQVADVVLIYQRVSDGWYEGERLRDGERGWF
       :::::::::                                                   
CCDS58 SGKPPADRTCG                                                 
              790                                                  

>>CCDS46.2 ARHGEF16 gene_id:27237|Hs108|chr1              (709 aa)
 initn: 1524 init1: 1072 opt: 1731  Z-score: 816.8  bits: 162.0 E(32554): 3.5e-39
Smith-Waterman score: 1755; 46.4% identity (70.4% similar) in 675 aa overlap (216-871:58-709)

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB9 GSGSQSGRKAKDPERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLENPSVVLSTNSPAALKV
                                     :  : :..:    :   .::::.::::::.
CCDS46 GGNPASGLPMVRGSPRVRDDAAFQPQVPAPPQPRPPGHE----EPWPIVLSTESPAALKL
        30        40        50        60            70        80   

         250       260       270         280       290       300   
pF1KB9 GKQQIIPKSLASEIKISKSNNQNVEPHKRLLK--VRSMVEGLGGPLGHAGEESEVDNDVD
       : ::.::::::   : .    ..      : .  .:   . : .:   .   ...: : :
CCDS46 GTQQLIPKSLAVASKAKTPARHQSFGAAVLSREAARRDPKLLPAP---SFSLDDMDVDKD
            90       100       110       120          130       140

           310       320       330       340       350       360   
pF1KB9 SPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNRMSQPVLKVVMEDKEKFSSLGRIKKK
         : :::.::. ::: :...:.   .: ..    ..: : :... :.  .  . .  :.:
CCDS46 PGGMLRRNLRNQSYR-AAMKGL--GKPGGQGDAIQLS-PKLQALAEEPSQPHTRSPAKNK
              150        160         170        180       190      

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pF1KB9 MLKG-----QGTFDGEENAVLYQNYKEKALDIDS-------DEESEPK-EQKSDEKIVIH
          :     .:.:  ...  :::. .:..:. ..       :: : :.  :: :  ::..
CCDS46 KTLGRKRGHKGSF--KDDPQLYQEIQERGLNTSQESDDDILDESSSPEGTQKVDATIVVK
        200         210       220       230       240       250    

               420       430       440       450       460         
pF1KB9 -HKPLRSTWSQLSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSK
        ..: . :::::  : . :. . .: ::::::::.::...:: ::  :: ::.. : .::
CCDS46 SYRPAQVTWSQLPEVVELGILDQLSTEERKRQEAMFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSK
          260       270       280       290       300       310    

     470       480       490       500       510       520         
pF1KB9 ELSDTMTKTERHHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPY
       ::  :.:. :.::::::: ::  ::..:: .:: ::. .....:::::.:.:. . : ::
CCDS46 ELRATVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKHFHPY
          320       330       340       350       360       370    

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pF1KB9 VKYCTNEVYQQRTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLM
       . ::.::::::::::::...: .:.:.: .:: .  : .:::.:::::::::::::::::
CCDS46 IAYCSNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLM
          380       390       400       410       420       430    

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pF1KB9 DTICQKTPKDSPKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEF-KIKPFP
       ::.: ::   : .:.. .:::: .::::: :::::..::: :.:::...::.: :.: .:
CCDS46 DTLCLKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLP
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pF1KB9 LVSSSRWLVKRGELTAYVEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVLIITKKKSEESYNVNDYSL
       :.:.::::.:::::   ::.: :: . .:.   :.:::::::..::::::::: :.::. 
CCDS46 LISASRWLLKRGELF-LVEETGLFRKIASRPTCYLFLFNDVLVVTKKKSEESYMVQDYAQ
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pF1KB9 RDQLLVESCDNEELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEMLLGAETQS
        ... ::. .  ::    : :       :.::. : : .:.: :  ... ..::.... :
CCDS46 MNHIQVEKIEPSELPLPGGGN-------RSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSAS
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pF1KB9 ERARWITALGHSSGKPP--ADRTSLTQVEIVRSFTAKQPDELSLQVADVVLIYQRVSDGW
       .:::::.:: ::  .    ... .: ::::...: ::: ::..:: :::::. :.  :::
CCDS46 DRARWIVALTHSERQWQGLSSKGDLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQ-EDGW
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        830       840       850       860       870 
pF1KB9 YEGERLRDGERGWFPMECAKEITCQATIDKNVERMGRLLGLETNV
         :::::::: :::: . :. :: ..... ::.:: ::  .::.:
CCDS46 LYGERLRDGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLR-VETDV
         670       680       690       700          

>>CCDS2500.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2                (710 aa)
 initn: 1017 init1: 709 opt: 822  Z-score: 399.8  bits: 84.8 E(32554): 6e-16
Smith-Waterman score: 1067; 31.8% identity (61.6% similar) in 698 aa overlap (198-864:32-687)

       170       180       190       200       210            220  
pF1KB9 SPVPSPTANGLAANNDSPGSGSQSGRKAKDPERGLFPGPQKSSS-----EQKLPLQRLPS
                                     ::  :.:  ...:.     ..: :  ..: 
CCDS25 ETRESEDLEKTRRKSASDQWNTDNEPAKVKPE--LLPEKEETSQADQDIQDKEPHCHIPI
              10        20        30          40        50         

            230       240       250       260       270            
pF1KB9 QENELLENPSVVLSTNSPAALKVGKQQIIPKSLASEIKISKSNNQNVE-------PHKRL
       ..: .. : :.    .: :     : .  :.  :: .  :..:...:.       : .:.
CCDS25 KRNSIF-NRSI--RRKSKA-----KARDNPERNASCLADSQDNGKSVNEPLTLNIPWSRM
      60           70             80        90       100       110 

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pF1KB9 LKVRS----------MVEGLGGPLGHAGEESEVDNDVDSPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGF
          :.          : :. . : :...   :    .::: .: ..::       ..  .
CCDS25 PPCRTAMQTDPGAQEMSESSSTP-GNGATPEEWPALADSPTTLTEALR-------MIHPI
             120       130        140       150              160   

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pF1KB9 DFDSPTSSKKKNRMSQPVLKVVMEDKEKFSSLGRIKKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKE
         ::      .: . :  : . .: ..: :.: .:. .  .     :. ...   ..  :
CCDS25 PADS-----WRNLIEQIGL-LYQEYRDK-STLQEIETRRQQDAEIEDNTNGSPASEDTPE
                170        180        190       200       210      

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pF1KB9 KALDIDSDEE-SEPKEQKSDEKIVIHHKPLR--STWSQLSAVKRKGLSQTVSQEERKRQE
       .  . . .:: . : :.:.  .: .  .:    . :..:  .. .:. . .. :: : ::
CCDS25 EEEEEEEEEEPASPPERKTLPQICLLSNPHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQE
        220       230       240       250       260       270      

            450       460       470       480       490       500  
pF1KB9 AIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSKELSDTMTKTERHHLFSNITDVCEASKKFFIELE
       :.::...:: ::  ::..:.  : .....   .  .: : ::::. ::  .:..:..:::
CCDS25 AMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELE
        280       290       300       310       320       330      

            510       520       530       540       550       560  
pF1KB9 ARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPYVKYCTNEVYQQRTLQKLLATNPSFKEVLSRIES
        : ..:: :.:. ::: ...:. :. :. : .:..::.:: ..::  . .:.:.....: 
CCDS25 HRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVSNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLEL
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pF1KB9 HEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLMDTICQKTPKDSPKYEVCKRALKEVSKLVRLCNE
          ::.::. ::::::.::.::: ::...: ... . : .  .   : ::.  .:. :::
CCDS25 DPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILKRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNE
        400       410       420       430       440       450      

            630       640       650       660       670         680
pF1KB9 GARKMERTEMMYTINSQLEFKIKPFPLVSSSRWLVKRGELTAYVEDTVLFSRRTSK--QQ
       :.::: :::.: .:....:::::  :..: ::::.:.:::  .    .  . ::.:  ..
CCDS25 GVRKMSRTEQMISIQKKMEFKIKSVPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHE
        460       470       480       490       500       510      

              690       700       710       720       730       740
pF1KB9 VYFFLFNDVLIITKKKSEESYNVNDYSLRDQLLVESCDNEELNSSPGKNSSTMLYSRQSS
       .:.:::::.:.: ..   ..:.: : . :  : ::  ...      :.           .
CCDS25 IYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLRVEELEDQ------GQ-----------T
        520       530       540       550                          

              750       760       770       780       790          
pF1KB9 ASHLFTLTVLSNHANEKVEMLLGAETQSERARWITALGHSSGKPPADRTS----LTQVEI
        ...: : .: :  .... ..: : .:::  ::.:.:. .     .. ::      ::. 
CCDS25 LANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQC
     560       570       580       590       600       610         

        800       810       820       830       840       850      
pF1KB9 VRSFTAKQPDELSLQVADVVLIYQRVSDGWYEGERLRDGERGWFPMECAKEITCQATIDK
       :. ..:.:::::.:..::.. : ....:::  ::::.: ::::::   ..::      ..
CCDS25 VHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQ
     620       630       640       650       660       670         

        860       870                 
pF1KB9 NVERMGRLLGLETNV                
       :...  :.                       
CCDS25 NLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
     680       690       700       710

>>CCDS46544.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2               (618 aa)
 initn: 1017 init1: 709 opt: 819  Z-score: 399.3  bits: 84.5 E(32554): 6.4e-16
Smith-Waterman score: 1065; 33.8% identity (65.0% similar) in 557 aa overlap (328-864:56-595)

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pF1KB9 VDNDVDSPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNRMSQPV-----------LKV
                                     ::::.  .  :: .:.           . .
CCDS46 RDSAAGHLPGSESSSTPGNGATPEEWPALADSPTTLTEALRMIHPIPADSWRNLIEQIGL
          30        40        50        60        70        80     

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pF1KB9 VMEDKEKFSSLGRIKKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDIDSDEE-SEPKEQKSDE
       .... .  :.: .:. .  .     :. ...   ..  :.  . . .:: . : :.:.  
CCDS46 LYQEYRDKSTLQEIETRRQQDAEIEDNTNGSPASEDTPEEEEEEEEEEEPASPPERKTLP
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         410         420       430       440       450       460   
pF1KB9 KIVIHHKPLR--STWSQLSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIR
       .: .  .:    . :..:  .. .:. . .. :: : :::.::...:: ::  ::..:. 
CCDS46 QICLLSNPHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVS
         150       160       170       180       190       200     

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pF1KB9 MFKNSKELSDTMTKTERHHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTA
        : .....   .  .: : ::::. ::  .:..:..::: : ..:: :.:. ::: ...:
CCDS46 HFMENERIRKILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAA
         210       220       230       240       250       260     

           530       540       550       560       570       580   
pF1KB9 STFDPYVKYCTNEVYQQRTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVT
       . :. :. : .:..::.:: ..::  . .:.:.....:    ::.::. ::::::.::.:
CCDS46 DHFSVYITYVSNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRIT
         270       280       290       300       310       320     

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pF1KB9 RLPLLMDTICQKTPKDSPKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEFK
       :: ::...: ... . : .  .   : ::.  .:. ::::.::: :::.: .:....:::
CCDS46 RLKLLVQNILKRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEFK
         330       340       350       360       370       380     

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pF1KB9 IKPFPLVSSSRWLVKRGELTAYVEDTVLFSRRTSK--QQVYFFLFNDVLIITKKKSEESY
       ::  :..: ::::.:.:::  .    .  . ::.:  ...:.:::::.:.: ..   ..:
CCDS46 IKSVPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKY
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pF1KB9 NVNDYSLRDQLLVESCDNEELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEML
       .: : . :  : ::  ...      :.           . ...: : .: :  .... ..
CCDS46 QVFDSAPRGLLRVEELEDQ------GQ-----------TLANVFILRLLENADDREATYM
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pF1KB9 LGAETQSERARWITALGHSSGKPPADRTS----LTQVEIVRSFTAKQPDELSLQVADVVL
       : : .:::  ::.:.:. .     .. ::      ::. :. ..:.:::::.:..::.. 
CCDS46 LKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILN
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pF1KB9 IYQRVSDGWYEGERLRDGERGWFPMECAKEITCQATIDKNVERMGRLLGLETNV      
       : ....:::  ::::.: ::::::   ..::      ..:...  :.             
CCDS46 ILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKD
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CCDS46 RRKLGSRNRQ
      610        

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                                     .::: :     :::.       : ..:.. 
CCDS11           MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPG-------PPHNGSS-
                         10        20        30               40   

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            : ..:  : :. :   .:..      ..   .   :    ::  :    ::  :.
CCDS11 -----PQELPRNSNDAPTPMCTPIFWEPPAASLKPPALLPPSASRAS--LDSQTSPDSPS
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       ..:  :: :  ...   : : :  ::  ::  :.. .::::   ..:. :.   : .: :
CCDS11 STPTPSPVSRRSAS---PEPAPRSPV--PPPKPSG-SPCTPLLPMAGVLAQN-GSASAPG
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        .    .   :.  :: :.:   :: ::  .    ..:.. ::    ::::   .     
CCDS11 TVRRLAGRFEGGAEGR-AQDADAPEPGL-QARADVNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLAC
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pF1KB9 ----PSVVLSTNSPAALK---VGKQQIIPK--SLASEIKISKSNNQNV---EPHKRLLKV
           : :  .:     :.   ::  . .:.    :: .. :.:  .     .:   : . 
CCDS11 PPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRRASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSY
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pF1KB9 RSMVEGLGGPLGHAGEESEVDNDVDSPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNR
       :: .:    :: .  . ..: .:.   :.  .   .   . .. .:   :::  . ..  
CCDS11 RSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPDLDLLSEDGIQTG---DSPDEAPQN--
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pF1KB9 MSQPVLKVVMEDKEKFSSLGRIKKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDID---SDEE
        . :   ...: .:.  .:     ..:: :.     ..  :::.:.  .:. .     :.
CCDS11 -TPP---ATVEGREE-EGL-----EVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAVLSEELWGVGED
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pF1KB9 SEPKEQKSDEKIVIHHKPL-RST-WSQLSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHS
       . :.  .. .  .. . :  :.: :..: ::. .:: .:.: .::. ::..:::..:: :
CCDS11 GSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEAS
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pF1KB9 YLLSLEILIRMFKNSKELSDTMTKTERHHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDD
       :: ::..:   :  :. : ::.:  ..: ::::.  :  .:..:.  : .: ...  :.:
CCDS11 YLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISD
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pF1KB9 ISDIVEKHTASTFDPYVKYCTNEVYQQRTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMIS
       . :.:. :... :. :: :  :. ::..: ..:. ::  :.  : :..:   :. ::. :
CCDS11 LCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPS
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pF1KB9 FLILPMQRVTRLPLLMDTICQKTPKDSPKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMM
       ::.::.::.::: .:...: ..: . : . :  ..::  :::... :.  . .:..:: .
CCDS11 FLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEEL
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pF1KB9 YTINSQLEF-KIKPFPLVSSSRWLVKRGELTAY--VEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVL
         ....:.: :.: .:::: :: :  .::::     .  :::. :     . ..::.:.:
CCDS11 IRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLL
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pF1KB9 IITKKKSEESYNVNDYSLRDQLLVESCDNEELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVL
       .::. :: .  .: ::. :.  ::.. .  . .. :                  : :..:
CCDS11 LITQPKSGQRLQVLDYAHRS--LVQAQQVPDPSGPP-----------------TFRLSLL
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pF1KB9 SNHANEKVEMLLGAETQSERARWITALGHSSGKPPADRTSL------TQVEIVRSFTAKQ
       ::: .. .. :: : . :.  ::. :.  . :  : .  ..      .:    .: .  .
CCDS11 SNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFP-TPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAK
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pF1KB9 PDELSLQVADVVLIYQRVSDGWYEGERLRDGERGWFPMECAKEITCQATIDKNVERMGRL
        .  ::.   .    ... .:: .:        : :: . . :.: .    .....  ::
CCDS11 TEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLP------GAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRL
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          870          
pF1KB9 LGLETNV         
       :               
CCDS11 LEAVGSSSGTPNAPPP
         830       840 

>>CCDS34771.1 ARHGEF5 gene_id:7984|Hs108|chr7             (1597 aa)
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CCDS34 PSFVSMEDVRIHEPLPPPPPQRRDTHPSVVETDGHARVVVPTLKQHSHPPPLALGSGLHA
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pF1KB9 -RSKPRPQSYQSPNGLLITDFPVEDGGTLSAAQIP-----AQVPTASDSRTVHRSPLLL-
        .. : ::. .   .     .:    ..  :   :       .: . :    :  :.   
CCDS34 PHKGPLPQASDPAVARQHRPLPSTPDSSHHAQATPRWRYNKPLPPTPDLPQPHLPPISAP
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pF1KB9 GAQR--RAVANGGTASP--EYRAASPRLR-RPKSPKLPKAVPGGSPKS-PANGAVTLPAP
       :..:  : .      .:  :     :. : : .: .  .   ::  :. ::    :.: :
CCDS34 GSSRIYRPLPPLPIIDPPTEPPPLPPKSRGRSRSTRGGHMNSGGHAKTRPACQDWTVPLP
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pF1KB9 PPPPVLRPPRTPNAPAPCTPEEDLTGLTASPVPSPTANGLAANN----------DSPGSG
                ::   ::     :..:. . :   : .. :.: .:           .: . 
CCDS34 A-----SAGRTSWPPATARSTESFTSTSRSK--SEVSPGMAFSNMTNFLCPSSPTTPWTP
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pF1KB9 SQSGRKAKDPERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLENPSVVLSTNSPAALKVGKQ
         .:  .:: : :.   :.  . :   ::.:   :..           ...:.   ::. 
CCDS34 ELQGPTSKD-EAGVSEHPEAPARE---PLRRTTPQQG-----------ASGPGRSPVGQA
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pF1KB9 QIIPKSLASEIKISKSNNQNVEPHKRLLKVRSMVEGLGGPLGHAGEESEVDNDVDSPGSL
       .   :   :.... :...    ::.     :.  .  :   :.:   ::  :     :  
CCDS34 RQPEKP--SHLHLEKASSW---PHR-----RDSGRPPGDSSGQAVAPSEGAN--KHKGWS
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pF1KB9 RRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNRMSQPVLKVVMEDKEKFSSLGRIKKKMLKGQ
       :.:::    : ...   . ::   . .:.    :   ::...:.    .: ....  :  
CCDS34 RQGLR----RPSILPEGSSDSRGPAVEKH--PGPSDTVVFREKKPKEVMGGFSRRCSKLI
       1040          1050      1060        1070      1080      1090

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pF1KB9 GTFDGEENAVLYQNYKEKALD--IDSDEESE-------PKEQKSDEKIVIHHKPLR----
       ..     . .:::.:.. .:.  :.:... :       :.  .. .: ..  .       
CCDS34 NS-----SQLLYQEYSDVVLNKEIQSQQRLESLSETPGPSSPRQPRKALVSSESYLQRLS
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pF1KB9 -----STWSQLSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSKE
            : :... .:. . .  ....:..: ::. ::.: :: ::: ::.: .  :. :  
CCDS34 MASSGSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHFQLSTS
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pF1KB9 LSDTMTKTERHHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPYV
       :  :... :.. ::: . :: ..:  :. .::   .::::  .. :.: .:. .    :.
CCDS34 LRATLSNQEHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDFRRVYL
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pF1KB9 KYCTNEVYQQRTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLMD
        : ::..::.::.:.:. .: .:.::: ..::   :. : . ::::::.::.::: ::..
CCDS34 PYVTNQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRLKLLLQ
        1270      1280      1290      1300      1310      1320     

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pF1KB9 TICQKT-PKDSPKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEFKIKPFPL
       .: ..: : .: . :. : : . . .:.: ::.....:.::: .  .....::. : :::
CCDS34 NILKRTQPGSSEEAEATK-AHHALEQLIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEFECKIFPL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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